Yes (42278)
No (1241)
Number of found documents:
43519
Published from
to
Structural and functional characterization of the E3 ligase BIRC6
GRATZL, Sascha
2023 - English
The aim of the thesis was to characterize the ubiquitin ligase BIRC6 in several contexts. The goal was to expand the knowledge on the selectivity of E1-E2 recognition, to increase the known substrate range of BIRC6, and to elucidate the molecular interactions fulfilled by BIRC6 during autophagy via interaction with GABARAP. In addition, it was aimed to gain a better understanding on the general ubiquitination mechanism in E2/E3 hybrid enzymes, to identify the ubiquitination sites of known apoptotic and autophagic substrates and to enlighten substrate recognition by BIRC6. The aim of the thesis was to characterize the ubiquitin ligase BIRC6 in several contexts. The goal was to expand the knowledge on the selectivity of E1-E2 recognition, to increase the known substrate range of BIRC6, and to elucidate the molecular interactions fulfilled by BIRC6 during autophagy via interaction with GABARAP. In addition, it was aimed to gain a better understanding on the general ubiquitination mechanism in E2/E3 hybrid enzymes, to identify the ubiquitination sites of known apoptotic and autophagic substrates and to enlighten substrate recognition by BIRC6.
Keywords:
structural biology; cryo-EM; x-ray crystallography; autophagy; apoptosis; inhibitor of apoptosis proteins; AlphaFold2; ATG8; ubiquitin; E3 ligase
Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Structural and functional characterization of the E3 ligase BIRC6
The aim of the thesis was to characterize the ubiquitin ligase BIRC6 in several contexts. The goal was to expand the knowledge on the selectivity of E1-E2 recognition, to increase the known substrate ...
Metabolic setup of Drosophila macrophages during the immune response
KREJČOVÁ, Gabriela
2023 - English
Adjustment of cellular metabolism is a key function that allows macrophages to fulfill their roles in the body. While the pro-inflammatory polarization of macrophages has been extensively studied in mammalian models, it has not yet been satisfactorily investigated in insects. The study presented in this thesis therefore attempts to elucidate the metabolic setup of macrophages during the immune response in Drosophila melanogaster. Adjustment of cellular metabolism is a key function that allows macrophages to fulfill their roles in the body. While the pro-inflammatory polarization of macrophages has been extensively studied in mammalian models, it has not yet been satisfactorily investigated in insects. The study presented in this thesis therefore attempts to elucidate the metabolic setup of macrophages during the immune response in Drosophila melanogaster.
Keywords:
makrofág; polarizace; metabolismus; infekce; octomilka; plazmatocyt; imunitní odpověď
Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Metabolic setup of Drosophila macrophages during the immune response
Adjustment of cellular metabolism is a key function that allows macrophages to fulfill their roles in the body. While the pro-inflammatory polarization of macrophages has been extensively studied in ...
Red-backed shrike (Lanius collurio) versus common cuckoo (Cuculus canorus): An example of ineffective cuckoo-hawk mimicry
KRAUSOVÁ, Ladislava
2023 - English
V této práci jsem testovala reakci ťuhýka obecného (Lanius collurio) na hnízdního parazita, kukačku obecnou (Cuculus canorus) (šedá forma), predátora, krahujce obecného (Accipiter nisus) a neškodnou kontrolu, hrdličku divokou (Streptoptelia turtur). Prokázala jsem, že ťuhýci od sebe dokážou rozlišit jednotlivé atrapy a adekvátně na ně reagovat. Navíc jsem prokázala, že imitace krahujce kukačkou je u ťuhýků neúspěšná. In this work, I tested the reaction of the red-backed shrike (Lanius collurio) against a nest parasite, the common cuckoo (Common cuckoo) (grey form), predator, Eurasian sparrowhawk (Accipiter nisus) and harmless intruder, turtle dove (Streptopelia turtur). I proved that shrikes can differ between presented stimuli and adequately respond to them. Moreover, I proved that the cuckoo-hawk mimicry is not successful against shrikes.
Keywords:
ťuhýk obecný; cuckoo-hawk mimicry; hnízdní parazitismus; obrana hnízda
Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Red-backed shrike (Lanius collurio) versus common cuckoo (Cuculus canorus): An example of ineffective cuckoo-hawk mimicry
V této práci jsem testovala reakci ťuhýka obecného (Lanius collurio) na hnízdního parazita, kukačku obecnou (Cuculus canorus) (šedá forma), predátora, krahujce obecného (Accipiter nisus) a neškodnou ...
Styly řešení konfliktů u učitelů v kontextu rysové úzkostnosti a sebehodnocení
ĎURICOVÁ, Jana
2023 - Czech
Bakalářská práce se zabývá problematikou stylů řešení konfliktů v kontextu rysové úzkostnosti a sebehodnocení u učitelů. Styly řešení konfliktů lze označit za reakce na určité situace nebo specifické vzorce chování v konfliktních situacích. Rysová úzkostnost se v literatuře definuje jako rys osobnosti s tendencí k pocitům obav a tísně a větší tendencí k úzkostným reakcím. Na sebehodnocení většina autorů nahlíží jako na představu emočního vztahu k sobě. Teoretická část práce se věnuje obsahům zmíněných konstruktů. Praktická část popisuje styly řešení konfliktů u učitelů směrem k žákům, rodičům žáků a kolegům. Dále zjišťuje, zda má pohlaví, délka praxe, rysová úzkostnost a sebehodnocení vliv na výběr stylů řešení konfliktů. Výzkumu se účastnilo 147 učitelů, vybraných prostým náhodným výběrem, kterým byla v online podobě administrována baterie sebeposuzujících dotazníků ROCI-II, STAI X-2 a RSES. Výsledky výzkumu ukazují, že učitelé volí nejčastěji integrující a kompromisní styl při řešení konfliktů se žáky, rodiči žáků a kolegy. Nejméně užívají vyhýbavý a dominantní styl. Pohlaví, ani délka praxe nemají vliv na výběr stylů řešení konfliktů. Mezi rysovou úzkostností a vyhýbavým stylem při řešení konfliktů je pozitivní vztah r = 0,280. Kombinace nízkého sebehodnocení a vysoké úzkostnosti zvyšuje pravděpodobnost preference vyhýbavého stylu při řešení konfliktů. Statisticky významně se jeví právě sebehodnocení, nikoli však samotná úzkostnost, při predikci vyhýbavého stylu v konfliktních situacích. The bachelor thesis focuses on the issue of conflict resolution styles in the context of trait anxiety and self-eteem in teachers. Conflict resolution styles can be described as reactions to certain situations or specific patterns of behaviour in conflict situations. Trait anxiety is defined in the literature as a personality trait with a tendency toward feelings of worry and distress and a greater tendency toward anxious reactions. Self-esteem is viewed by most authors as a representation of the emotional relationship with oneself. The theoretical part of the thesis is devoted to the contents of the mentioned constructs. The practical part describes teachers' conflict resolution styles towards pupils, parents of pupils and colleagues. It also investigates whether gender, length of experience, trait anxiety, and self-esteem influence the choice of conflict resolution styles. The research involved 147 teachers, selected by simple random sampling, who were administered a battery of self-assessment questionnaires, the ROCI-II, STAI X-2 and RSES, in an online format. The results of the research show teachers most often choose an integrative and compromising style when dealing with conflicts with pupils, parents of pupils and colleagues. They use the avoidant and dominating style the least. Neither gender nor length of experience has an effect on the choice of conflict resolution styles. There is a positive relationship between trait anxiety and avoidance conflict resolution style r = 0.280. The combination of low self-esteem and high anxiety increases the probability of preferring an avoidant style in conflict resolution. It is self-esteem, but not anxiety alone, that appears statistically significant in predicting avoidant style in conflict situations.
Keywords:
Styly řešení konfliktů; rysová úzkostnost; sebehodnocení; učitelé; Conflict resolution styles; trait anxiety; self-esteem; teachers
Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Styly řešení konfliktů u učitelů v kontextu rysové úzkostnosti a sebehodnocení
Bakalářská práce se zabývá problematikou stylů řešení konfliktů v kontextu rysové úzkostnosti a sebehodnocení u učitelů. Styly řešení konfliktů lze označit za reakce na určité situace nebo specifické ...
The role of macrophages in the regulation of systemic metabolism in Drosophila
KREJČOVÁ, Gabriela
2023 - English
Macrophages are immensely versatile cells in the mammalian body, fulfilling roles ranging from protection against pathogenic intruders and engulfing apoptotic cells to morphogenesis and maintenance of tissue homeostasis. This impressive functional versatility may be achieved due to plasticity of macrophage cellular metabolism called metabolic polarization. The adoption of different polarization phenotypes by macrophages determines their function and is essential for the health of the organism. Nonetheless, if the cells lose their metabolic plasticity or polarize inadequately to a particular situation, it can lead to the development of chronic pathological states such as metabolic syndrome. Metabolic polarization of immune cells is thus a key factor in determining whether macrophage function within the organism will be adaptive or pathological. Despite Drosophila melanogaster represents a major model organism for immunological studies, the metabolic setup of activated immune cells has not been addressed up to now. The results of this thesis document that Drosophila immune cells undergo metabolic polarization toward aerobic glycolysis when challenged by extracellular bacteria. Mammals alike, this cellular metabolic switch is regulated by the transcription factor HIF1, thus documenting the conservation of this process between insects and vertebrates. Furthermore, we show that the adoption of aerobic glycolysis is directly linked to the production of the signaling factor IMPL2, which induces the mobilization of lipid stores from the fat body via the silencing of insulin signaling. By this mechanism, immune cells secure sufficient nutrients for successful elimination of the pathogen. Moreover, the mammalian ImpL2 homolog IGFBP7 appears to act analogously in the mammalian liver not only during severe infectious states but also in the liver of obese individuals. While such macrophage activity in regulating systemic metabolism is beneficial to the host during bacterial infection, it becomes maladaptive when chronically activated. Further evidence for a metabolism-regulatory role of immune cells has been found during insect metamorphosis and early post-metamorphic development. This thesis documents that during this period, macrophages infiltrate and engulf the histolyzing larval fat body and convert nutrients into storage peptides and lipoproteins. Subsequently, these nutrients are exploited by the maturing adult structures. Macrophages are immensely versatile cells in the mammalian body, fulfilling roles ranging from protection against pathogenic intruders and engulfing apoptotic cells to morphogenesis and maintenance of tissue homeostasis. This impressive functional versatility may be achieved due to plasticity of macrophage cellular metabolism called metabolic polarization. The adoption of different polarization phenotypes by macrophages determines their function and is essential for the health of the organism. Nonetheless, if the cells lose their metabolic plasticity or polarize inadequately to a particular situation, it can lead to the development of chronic pathological states such as metabolic syndrome. Metabolic polarization of immune cells is thus a key factor in determining whether macrophage function within the organism will be adaptive or pathological. Despite Drosophila melanogaster represents a major model organism for immunological studies, the metabolic setup of activated immune cells has not been addressed up to now. The results of this thesis document that Drosophila immune cells undergo metabolic polarization toward aerobic glycolysis when challenged by extracellular bacteria. Mammals alike, this cellular metabolic switch is regulated by the transcription factor HIF1, thus documenting the conservation of this process between insects and vertebrates. Furthermore, we show that the adoption of aerobic glycolysis is directly linked to the production of the signaling factor IMPL2, which induces the mobilization of lipid stores from the fat body via the silencing of insulin signaling. By this mechanism, immune cells secure sufficient nutrients for successful elimination of the pathogen. Moreover, the mammalian ImpL2 homolog IGFBP7 appears to act analogously in the mammalian liver not only during severe infectious states but also in the liver of obese individuals. While such macrophage activity in regulating systemic metabolism is beneficial to the host during bacterial infection, it becomes maladaptive when chronically activated. Further evidence for a metabolism-regulatory role of immune cells has been found during insect metamorphosis and early post-metamorphic development. This thesis documents that during this period, macrophages infiltrate and engulf the histolyzing larval fat body and convert nutrients into storage peptides and lipoproteins. Subsequently, these nutrients are exploited by the maturing adult structures.
Keywords:
makrofág; metabolismus; imunitní odpověď; polarizace; ImpL2; octomilka; tukové těleso; infiltrace; insulinová rezistence; glukanové částice
Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
The role of macrophages in the regulation of systemic metabolism in Drosophila
Macrophages are immensely versatile cells in the mammalian body, fulfilling roles ranging from protection against pathogenic intruders and engulfing apoptotic cells to morphogenesis and maintenance of ...
Obranné reakce včel vůči přírodním toxinům
KAINZOVÁ, Klára
2023 - Czech
Cílem této magisterské práce bylo monitorování obranných reakcí včel po aplikaci včelího jedu. To zahrnovalo expresi vitellogeninu v tukovém tělese u trubce a dělnice a hladiny vitellogeninu v jednotlivých orgánech (hemolymfa, Malpighické trubice, střevo, tukové těleso), hladiny biogenních aminů, konkrétně dopaminu v jednotlivých včelích orgánech dělnice a trubce, hladiny adipokinetického hormonu v centrální nervové soustavě (CNS). Tyto biochemické studie byly doplněny analýzami mikrostrukturálních změn ve svalových buňkách pomocí elektronové mikroskopu. Výsledky ukázaly, že hladina AKH nebyla výrazně změněna, exprese vitellogeninu byla snížena v tukovém tělese trubců i dělnic. Tato inhibice byla zaznamenána i u samotné hladiny vitellogeninu v tukovém tělese a hemolymfě. Aktivita katalázy byla stimulována ve střevě včelí dělnice, opačný trend byl pozorován u trubců. Hladina dopaminu byla u všech orgánů (mozek, tukové těleso, Malpighické trubice) mírně zvýšena, ale pouze v tukovém tělese trubců bylo toto zvýšení statisticky průkazné. V neposlední řadě byl sledován efekt včelího jedu na strukturu thorakálních svalů. U dělnic došlo k destrukci svalových vláken a mitochondrií a současná aplikace AKH s jedem dokázala těmto změnám zabránit; situace u trubců zůstává nejasná. The aim of this master thesis was to describe the effect of honeybee venom on several physiological characteristics in the honeybees Apis mellifera themselves. They included the expression and level of vitellogenin in selected organs, AKHs production in CNS, level of dopamine in brain, fat body and Malpighian tubules, oxidative stress (the activity of catalase) and the structure of thoracic muscles in workers and drones. Results showed that the bee venom did not change the AKH level in CNS. However, the envenomation decreased the expression of vitellogenin in fat body, as well as the level of vitellogenin proteins both in fat body and haemolymph. Catalase activity was increased in the gut of workers but decreased in the gut of drones. The venoms application slightly increased dopamine levels in the fat body, brain and Malpighian tubules, but only in the fat body the rise was significant. Honeybee venom damaged the structures of myofibrils and mitochondria in the thoracic muscles of workers, however, co-application of the venom with AKH generally abolished this effect; situation in drones remains unknown.
Keywords:
včela medonosná; vitellogenin; AKH; včelí jed; dopamin; honeybee; vitellogenin; AKH; venom; dopamin
Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Obranné reakce včel vůči přírodním toxinům
Cílem této magisterské práce bylo monitorování obranných reakcí včel po aplikaci včelího jedu. To zahrnovalo expresi vitellogeninu v tukovém tělese u trubce a dělnice a hladiny vitellogeninu v ...
Fixace dusíku v půdách malých lesních povodí v České republice
MICHALČÁKOVÁ, Petra
2023 - Czech
Tato bakalářská práce sjednocuje informace týkající se fixace dusíku v půdě. Detailněji se věnuje biologické nesymbiotické fixaci (fixaci volně žijících organismů) se zaměřením na půdy jehličnatých lesů a zabývá se faktory, které ovlivňují její rychlost. Experimentální část spočívá ve stanovení rychlosti nesymbiotické fixace v půdách odebraných v rámci monitoringu čtrnácti malých lesních povodí v Čechách. Rychlost fixace byla měřena metodou inkorporace 15N2, která byla doplněna stanovením kvantity bakteriálního nifH genu kódujícího jeden z proteinů enzymu nitrogenázy. This bachelor thesis summarises the information about nitrogen fixation with an emphasis on the biological non-symbiotic (free-living organisms) fixation in soil of temperate coniferous forests and it also discusses critical factors, which have an impact on the fixation efficiency. The experimental part evaluates the potential rate of non-symbiotic nitrogen fixation in soil samples from fourteen temperate forest catchments in the Czech Republic. The 15N2-incorporation method was used, complemented by the determination of the quantity of the bacterial nifH gene, which encodes one of the nitrogenase's proteins.
Keywords:
fixace dusíku; nesymbiotická fixace dusíku; půda; volná půda; jehličnaté lesy; rychlost fixace; inkorporace 15N2; nifH; qPCR; nitrogen fixation; non-symbiotic nitrogen fixation; free-living nitrogen fixation; cryptic fixation; soil; bulk soil; temperate coniferous forests; 15N2 incorporation; nifH; qPCR
Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Fixace dusíku v půdách malých lesních povodí v České republice
Tato bakalářská práce sjednocuje informace týkající se fixace dusíku v půdě. Detailněji se věnuje biologické nesymbiotické fixaci (fixaci volně žijících organismů) se zaměřením na půdy jehličnatých ...
Koevoluce genů a jazyků - kritická rešerše
VODIČKOVÁ, Klára
2023 - Czech
V této bakalářské práci shrnuji studie, které využívají fylogenetické nebo populačně-genetické metody ke studiu koevoluce nebo korelace mezi geny a jazyky v různých oblastech světa a v různých prostorových měřítcích. Nejprve popisuji teoretické základy studia koevoluce genů a jazyků a důvody, proč očekávám shodu mezi populační historií a jazykovou historií nebo její nedostatek. Dále přezkoumám publikované studie, data a metody, které používají, a jejich výsledky. Nakonec diskutuji omezení dat a metod používaných k odhalení koevoluce nebo korelace mezi geny a jazyky. In this bachelor's thesis, I review studies that utilize phylogenetic or population-genetic methods to study coevolution or correlation between genes and languages in different regions of the world and at different spatial scales. First, I describe the theoretical foundations of the study of gene-language coevolution and the reasons for expecting correspondence between population history and language history or lack thereof. Next, I review published studies, the data and methods they use, and their results. Finally, I discuss the limitations of the data and methods used to uncover coevolution or correlation between genes and languages.
Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Koevoluce genů a jazyků - kritická rešerše
V této bakalářské práci shrnuji studie, které využívají fylogenetické nebo populačně-genetické metody ke studiu koevoluce nebo korelace mezi geny a jazyky v různých oblastech světa a v různých ...
Vliv dostupnosti živin na mykorhizní symbiózu lučních rostlin
PECKOVÁ, Tereza
2023 - Czech
Arbuskulární mykorhizní symbióza se vyskytuje u většiny cévnatých rostlin. Jedním z faktorů, které ovlivňují její projevy, je dostupnost živin v půdě. Tato práce zkoumá, jak množství fosforu a dusíku v půdě ovlivňuje kolonizaci a společenstvo arbuskulárních mykorhizních hub (AMF) a fine root endophytes (FE) u jednoděložných a dvouděložných rostlin. Zvýšená dostupnost fosforu vedla k nižší kolonizaci AMF a FE, zejména u jednoděložných rostlin. Přidání dusíku znamenalo větší kolonizaci FE a dominanci jediného taxonu ve společenstvu AMF. Nejnižší úroveň kolonizace a největší taxonomická diverzita byly zjištěny u rostlin hnojených oběma živinami. Arbuscular mycorrhizal symbiosis occurs in most of the vascular plants. One of the factors influencing expression of a symbiosis is the availability of nutrients in soil. This thesis explores how different levels of phosphorus and nitrogen affect the colonisation and community of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) and fine root endophytes (FE) in monocotyledonous and dicotyledonous plants. Increased phosphorus availability resulted in lower AMF and FE colonisation, especially in monocotyledonous plants. Nitrogen addition to soil resulted in greater FE colonisation and dominance of a single taxon in the AMF community. The lowest levels of colonisation and the greatest taxonomic diversity were found in plants fertilised with both nutrients.
Keywords:
arbuskulární mykorhizní symbióza; fine root endophytes; dostupnost živin; Arbuscular mycorrhizal symbiosis; fine root endophytes; nutrient availability
Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Vliv dostupnosti živin na mykorhizní symbiózu lučních rostlin
Arbuskulární mykorhizní symbióza se vyskytuje u většiny cévnatých rostlin. Jedním z faktorů, které ovlivňují její projevy, je dostupnost živin v půdě. Tato práce zkoumá, jak množství fosforu a dusíku ...
Antrakologická analýza a možnosti rekonstrukce skladby a struktury dřevin z ranně středověkých hradišť jihozápadních Čech
PETRLÍKOVÁ, Veronika
2023 - Czech
Tato studie se zaměřuje na možnosti rekonstrukce vegetace na základě analýzy zuhelnatělých zbytků dřeva pocházející ze dvou hradišť Prácheň a Netolice. Analyzované uhlíky pocházely jak z hradišť, tak z ploch v podhradí. U souborů byla sledována specifická antrakomasa, relativní podíl velikostních frakcí a použitá část stromu (podle zakřivení letokruhů). Tato data byla porovnávána s výsledky analýzu pylu a rekonstrukční mapou vegetace. Vývoj osídlení oblasti byl popsán na základě archeologické databáze (Archeologická mapa České republiky). This study focuses on the possibility of regional vegetation reconstruction based on anthracological evidence originating from two hillforts Prácheň and Netolice. Charcoals were analyzed from both hillforts and from the areas under the hillfort. Specific anthracomass, the relative proportion of mass fractions and the part of the tree used according to the curvature of the tree rings were monitored for the sets. This data was compared with the results of the pollen analysis and with the reconstruction map of the vegetation. The development of the area's settlement was described on the basis of the archaeological database Archaelogical map of Czech Republic
Keywords:
Antrakologická analýza; raný středověk; hradiště; rekonstrukce vegetace; Anthracological analysis; early Middle Ages; hillfort; reconstruction of vegetation
Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Antrakologická analýza a možnosti rekonstrukce skladby a struktury dřevin z ranně středověkých hradišť jihozápadních Čech
Tato studie se zaměřuje na možnosti rekonstrukce vegetace na základě analýzy zuhelnatělých zbytků dřeva pocházející ze dvou hradišť Prácheň a Netolice. Analyzované uhlíky pocházely jak z hradišť, tak ...
NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web
Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz
Provider
Other bases