Bacteriophage 936 by qPCR quantification in dairy products.
Olša Fliegerová, Kateřina; Mrázek, Jakub; Štrosová, Lenka; Němečková, I.; Kopečný, Jan
2018 - Czech
Virulent bacteriophages are still representing significant threat in dairy production even with frequent disinfection and sterilization all the equipment in dairy plants. Therefore a reliable \nmethod of phage monitoring and quantification necessary part of phage prevention. Method is based on qPCR amplification and fluorescent detection of copies number of the phage main\nstructural protein and therefore is independent on the phage cultivation. It is quick, reliable a sensitive enough to estimate phage copy numbers in dairy starters and whey in any phase of dairy production. \n Virulentní bakteriofágy stále představují vážnou hrozbu pro průmyslové fermentace mléka, a to i při časté dezinfekci a sterilizaci všech zařízení v mlékárenských provozech. Proto je spolehlivá metoda monitorování přítomnosti bakteriofágů, ale zejména jejich kvantifikace, nutnou součástí boje proti virové infekci. Tato práce popisuje kvantifikaci laktokokového bakteriofága 936 pomocí polymerázové řetězové reakce (qPCR) a aplikaci tohoto postupu na vzorky provozních zákysů a syrovátek. Metoda je založena na amplifikaci a fluorescenční detekci nárůstu počtu kopií úseku genu pro hlavní strukturální protein fága 936 a je tudíž nezávislá na kultivaci bakteriofága. Metoda qPCR je rychlá, citlivá, umožňuje kvantifikaci bakteriofága 936 v malých objemech průmyslových vzorků a v kterékoliv fázi fermentačního procesu.\n
Keywords:
Bacteriophage 936; dairy products; lactobacillus
Available at various institutes of the ASCR
Bacteriophage 936 by qPCR quantification in dairy products.
Virulent bacteriophages are still representing significant threat in dairy production even with frequent disinfection and sterilization all the equipment in dairy plants. Therefore a reliable \nmethod ...
Sequencing of DNA variable fragment coding aspartyl-tRNA synthetase suitable for taxonomic classification and phylogenetic analysis of bacterial genera closely related to genus Lactobacillales \n
Killer, Jiří; Mrázek, Jakub
2018 - Czech
There was designed and tested a reliable marker for aspartyl-tRNA synthetase suitable for taxonomic classification and phylogenetic analysis of bacterial genera closely related to genus Lactobacillales. Method enables reliable a sensitive estimation in dairy starters and is independent on the phage cultivation. It is quick, reliable a sensitive estimation of dairy bacteria. It is possible to use it for basic research as well as for the effective analysis in dairy production plants. \n Byl připraven a ověřen marker (aspartyl-tRNA syntáza) pro klasifikaci a fylogenetické analýzy zástupců rodů náležejících do řádu Lactobacillales. Umožňuje rychlé a přesné druhové stanovení mléčných bakterií. Předkládanou metodiku lze využít v základním výzkumu při klasifikaci a fylogenetických analýzách vybraných rodů bakterií mléčného kvašení. Především je určen pro rychlé analýzy v provozech mléčného průmyslu. \n
Keywords:
Lactobacillales; PCR; marker
Available at various institutes of the ASCR
Sequencing of DNA variable fragment coding aspartyl-tRNA synthetase suitable for taxonomic classification and phylogenetic analysis of bacterial genera closely related to genus Lactobacillales \n
There was designed and tested a reliable marker for aspartyl-tRNA synthetase suitable for taxonomic classification and phylogenetic analysis of bacterial genera closely related to genus ...
Methodology of „acute“and transgenic Huntington disease model design in miniature pigs and its application for new methods of treatment and drugs testing in neurodegenerative diseases area
Motlík, Jan; Juhás, Štefan; Juhásová, Jana; Vodička, Petr; Baxa, Monika
2014 - Czech
The aim of this methodology is to develop a biomedical model of Huntington's disease in miniature pigs and its use in practice for preclinical testing of new treatments both pharmacological and using new molecular biological methods. Cílem metodiky je vypracování biomedicínského modelu Huntingtonovy choroby u miniaturních prasat a jeho využití v preklinické praxi pro testování nových léčebných postupů jak farmakologických, tak pomocí nových molekulárně biologických metod.
Keywords:
Huntington´s disease
Available at various institutes of the ASCR
Methodology of „acute“and transgenic Huntington disease model design in miniature pigs and its application for new methods of treatment and drugs testing in neurodegenerative diseases area
The aim of this methodology is to develop a biomedical model of Huntington's disease in miniature pigs and its use in practice for preclinical testing of new treatments both pharmacological and using ...
Methodology of spinal cord injury model design in miniature pigs and its application for new methods of treatment and drugs testing
Maršala, M.; Motlík, Jan; Juhás, Štefan; Juhásová, Jana
2014 - Czech
The goal of proposed methodology is to describe the possibilities of reproducible and adjustable minipigs spinal cord injury model utilization in preclinical practice for new methods of treatment and drugs testing potentially favorable for therapy of acute and chronic spinal cord injury in human. The methodology has been developed as a part of solution to program of applied research and experimental development ALFA Technology Agency of the Czech Republic, subprogram Progressive technologies, materials and systems (TA01011466; 80%) and Operational Program Research and Development for Innovation Ministry of Education, Youth and Sports (project ExAM - CZ.1.05./2.1.00/03.0124; 20%). Cílem předložené metodiky je popsat možnosti využití reprodukovatelného a nastavitelného modelu míšního poškození miniaturních prasat v preklinické praxi pro testování nových léčebných postupů a terapeutik potenciálně vhodných pro léčbu akutního nebo chronického poškození míchy u lidí. Metodika vznikla jako součást řešení programu aplikovaného výzkumu ALFA Technologické Agentury ČR, podprogramu Progresivní technologie, materiály a systémy (TA01011466; 80%) a operačního programu Výzkum a vývoj pro inovace Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy (projekt ExAM - CZ.1.05./2.1.00/03.0124; 20%).
Keywords:
spinal cord injury; minipig
Available at various institutes of the ASCR
Methodology of spinal cord injury model design in miniature pigs and its application for new methods of treatment and drugs testing
The goal of proposed methodology is to describe the possibilities of reproducible and adjustable minipigs spinal cord injury model utilization in preclinical practice for new methods of treatment and ...
Quantitative monitoring of anaerobic rumen fungus Anaeromyces in complex microbial ecosystem of anaerobic fermenter
Fliegerová, Kateřina; Mrázek, Jakub; Štrosová, Lenka
2012 - Czech
The aim of method is quantitative monitoring of anaerobic rumen fungus Anaeromyces in complex microbial ecosystem of anaerobic fermenter. Method is based on qPCR approach using following primer pair: forward ITS1F and reverse NeoQPCR rev. Amplification is performed using commercial kit qPCR 2x SYBR Master mix (Top-Bio, Czech Republic) by quantitative PCR cycler machine Mx3005P (Stratagene, USA). Cílem předkládaného metodického postupu je kvantitativní monitorování mikroskopické anaerobní vláknité houby rodu Anaeromyces ve složitém mikrobiálním ekosystému anaerobního fermentoru. Metoda je založena na kvantitativní PCR metodě s použitím primerů forward ITS1F a reverzního primeru. Amplifikace se provádí pomocí komerčního kitu qPCR 2x SYBR Master mixu (Top-Bio, ČR) na přístroji Mx3005P (Stratagene, USA).
Keywords:
Anaeromyces
Available at various institutes of the ASCR
Quantitative monitoring of anaerobic rumen fungus Anaeromyces in complex microbial ecosystem of anaerobic fermenter
The aim of method is quantitative monitoring of anaerobic rumen fungus Anaeromyces in complex microbial ecosystem of anaerobic fermenter. Method is based on qPCR approach using following primer pair: ...
NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web
Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz
Provider
Other bases