Yes (14988)
No (409)
Used filters
(2)
Number of found documents:
15397
Published from
to
Význam různých zdrojů a sekvenančních protokolů při zvyšování přesnosti NGS analýz v diagnostických aplikacích
Kvapilová, Kateřina
2024 - English
1 ABSTRACT Continued advances in next-generation sequencing (NGS) technology, such as capacity, speed, and reduced cost per sequenced base, revolutionize personalized medicine and bring genomics into routine clinical practice. Nevertheless, NGS is still under rapid development, and the variability of sequencing protocols and validation procedures is one of its current bottlenecks. This thesis aimed to study the influence of different sample sources and NGS protocols (NGS library construction-sequencing-data analysis) on the accuracy of NGS analysis in diagnostic applications. In the first study, performed during the COVID-19 pandemic outbreak, we developed NGS protocols suitable for a whole genome analysis of the SARS-CoV-2 virus. Subsequently, in the second study, we examined the suitability of human saliva-derived gDNA for genomic/genetic analysis of selected variant types compared to traditional blood-derived gDNAusing validated NGS protocol and statistical comparison of the obtained data. Whole genome analysis of the SARS-CoV-2 genome was performed using two captured- based approaches and one amplicon-based approach to study the quality and effectivity of the respective NGS protocols. Synthetic controls were employed to verify the accuracy and specificity of the developed NGS protocols. We proved that... 1 Souhrn Neustálé pokroky v technologii sekvenování nové generace (NGS), jakými jsou kapacita, rychlost a snížené náklady na sekvenovaní, vedou k revoluci v personalizované medicíně, tím, jak postupně přináší genomiku do rutinní klinické praxe. NGS se stále rychle vyvíjí, avšak variabilita sekvenačních protokolů a validačních postupů je jedním z jeho problematických rysů. Cílem této práce bylo zhodnotit význam různých zdrojů vzorků a sekvenačních protokolů (od přípravy sekvenační knihovny-sekvenování-analýzi dat) pro zvýšení přesnosti NGS analýzy v diagnostických aplikacích. V první studii, provedené během vypuknutí pandemie COVID-19, jsme vyvinuli NGS protokoly vhodné pro analýzu celého genomu viru SARS-CoV-2. Následně jsme ve druhé studii zkoumali vhodnost lidské genomické DNA (gDNA) pocházející ze slin pro genomickou/genetickou analýzu vybraných variantních k tradiční gDNApocházející z krve pomocí validovaného NGS protokolu a statistického srovnání získaných dat. K ověření účinnosti sekvenačních protokolů pro analýzu celého genomu SARS-CoV-2 byly použity dva sekvenační přístupy založené na zachycení části genomu a jeden sekvenanční přístup založený na amplifikaci částí genomů. K ověření přesnosti a specifičnosti vyvinutých NGS protokolů byly použity syntetické kontroly. Prokázali jsme, že kvantifikace...
Keywords:
NGS; WGS; WES; analýza variant; slinná gDNA; validace NGS protokolu; NGS; WGS; WES; genomics variant analysis; saliva-derived gDNA; validation guideline
Available in a digital repository NRGL
Význam různých zdrojů a sekvenančních protokolů při zvyšování přesnosti NGS analýz v diagnostických aplikacích
1 ABSTRACT Continued advances in next-generation sequencing (NGS) technology, such as capacity, speed, and reduced cost per sequenced base, revolutionize personalized medicine and bring genomics into ...
Anthelmintika v prostředí: cirkulace, metabolismus a jejich působení.
Navrátilová, Martina; Matoušková, Petra; Pohanka, Miroslav; Česlová, Lenka
2024 - English
Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Training Workplace Department of Biochemical Sciences Doctoral Degree Program Xenobiochemistry and Pathobiochemistry Candidate Mgr. Martina Navrátilová Supervisor Assoc. Prof. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. Advisor PharmDr. Ivan Vokřál, Ph.D. Title of Doctoral Thesis Anthelmintics in the environment: circulation, metabolism and effects This dissertation investigates the environmental impact of anthelmintics, specifically focusing on their circulation, metabolism, and effects in the environment. The primary objective was to explore the extent to which anthelmintics, particularly albendazole, affect plants under laboratory and field conditions and the potential for these effects to contribute to drug resistance in parasites. The study used an analytical technique, UHPLC-MS/MS, to monitor the uptake and biotransformation of albendazole and biochemical assays to asses phytotoxicity in plants like alfalfa and clover. Field experiments demonstrated the circulation of albendazole and its metabolites from sheep dung to plants and back to the sheep, indicating continuous environmental exposure. Furthermore, the investigation into the parasitic nematode Haemonchus contortus revealed changes in the expression of drug-metabolizing enzymes and the... Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Školicí pracoviště Katedra biochemických věd Doktorský studijní program Xenobiochemie a patobiochemie Kandidátka / kandidát Mgr. Martina Navrátilová Školitelka / školitel Assoc. Prof. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. Konzultantka / konzultant PharmDr. Ivan Vokřál, Ph.D. Název disertační práce Anthelmintika v prostředí: cirkulace, metabolismus a jejich působení Tato disertační práce se zabývá dopadem anthelmintik na životní prostředí, konkrétně se zaměřuje na jejich cirkulaci, metabolismus a účinky v životním prostředí. Primárním cílem bylo prozkoumat, do jaké míry anthelmintika, zejména albendazol, ovlivňují rostliny v laboratorních a teréních experimentech, a potenciál těchto účinků přispívat k lékové rezistenci parazitů. Laboratorní studie využívala analytickou techniku UHPLC-MS/MS ke sledování příjmu a biotransformace albendazolu a biochemické testy k posouzení fytotoxicity v rostlinách jako vojtěška a jetel. Terénní experimenty prokázaly cirkulaci albendazolu a transformačních produktů z ovčího trusu do rostlin a zpět k ovcím, což ukazuje na kontinuální expozici v životním prostředí. Dále zkoumání parazitické hlístice Haemonchus contortus odhalilo změny v expresi enzymů metabolizujících léčiva a schopnost hlístice metabolizovat albendazol,...
Available in a digital repository NRGL
Anthelmintika v prostředí: cirkulace, metabolismus a jejich působení.
Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Training Workplace Department of Biochemical Sciences Doctoral Degree Program Xenobiochemistry and Pathobiochemistry Candidate Mgr. Martina ...
Hodnocení stejnoměrnosti dávkování veterinárních očních kapek
Marková, Jana; Šklubalová, Zdeňka; Vraníková, Barbora
2024 - Czech
Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of: Pharmaceutical technology Consultant: doc. PharmDr. Zdeňka Šklubalová, Ph.D. Student: Mgr. Jana Marková Title of Thesis: Evaluation of uniformity of dose of veterinary eye drops The thesis studies the effect of dispensing angle and residual volume on drop mass produced by commercially available eye drops for vaccination using two dispensing regimes. Manual dispensing regime done via commercial dispensing system which consists of a plastic bottle and a dropper is compared to dispensing regime done via prototype device which produces drops at an angle of 45ř. Experiment confirmed significant effect of dispensing angle on drop mass produced by manual dispensing regime; by decreasing the dispensing angle from 90ř to 45ř the drop mass has decreased. Standard dropping rate had significantly decreasing drop mass with decreasing residual volume in the bottle for manually produced drops and also the for the prototype produced drops. When comparing the standard dropping rate and fast dropping rate, higher drop mass was recorded mostly for the standard dropping rate. Disregarding the dropping rate, higher drop mass was recorder for the drops produced by the prototype device, with shorter dispensing time needed for producing ten drops in... Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Farmaceutická technologie Školitel: doc. PharmDr. Zdeňka Šklubalová, Ph.D. Posluchač: Mgr. Jana Marková Název diplomové práce: Hodnocení stejnoměrnosti dávkování veterinárních očních kapek Rigorózní práce studuje vliv dispenzačního úhlu a zbytkového objemu náplně lahvičky na hmotnost kapky při dispenzaci komerčních očních kapek pro vakcinaci při dvou režimech kapání. Manuální dispenzace pomocí konvenčního dávkovacího systému složeného z lahvičky a kapátka je porovnána s dávkováním pomocí prototypového zařízení, který produkuje kapky při dispenzačním úhlu 45ř. Byl potvrzen významný vliv dispenzačního úhlu na hmotnost kapky při manuálním kapání; snížením úhlu z 90ř na 45ř se hmotnost snížila. Při standardním dispenzačním režimu pomalého kapání vedlo snížení zbytkového objemu přípravku v lahvičce k významnému zmenšení kapky pro manuální systém i prototyp. Ve většině případů byly při standardním dispenzačním režimu pomalého kapání zaznamenány kapky s vyšší hmotností oproti rychlejšímu režimu kapání. Bez ohledu na použitý režim kapání produkoval prototyp oproti manuálnímu dispenzačnímu systému větší kapky, za kratší čas potřebný pro dispenzaci deseti kapek a s nižší variabilitou.
Available in a digital repository NRGL
Hodnocení stejnoměrnosti dávkování veterinárních očních kapek
Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of: Pharmaceutical technology Consultant: doc. PharmDr. Zdeňka Šklubalová, Ph.D. Student: Mgr. Jana Marková Title of Thesis: ...
Studium netěkavých nitrososloučenin v pivovarství
Malečková, Michaela
2024 - English
4 Abstract Nitroso compounds are beer contaminants related to carcinogenicity and can be naturally formed during brewing. They are generally categorized as volatile and non-volatile. Well-characterized and proven carcinogenic compounds are mostly volatile N-nitrosamines, whereas specific non-volatile nitroso compounds are nearly unknown even by structure. This deficiency limits improvements in health-risk assessment and control of beer. The present study focused on these barely known compounds in beer, related to their molecule structures and natural occurrence in beer and malt. Since these compounds form by nitrite reactions with naturally occurring compounds in beer or raw materials, the beer sample was parallelly treated by nitrite and isotopically labelled nitrite-15N at acidic conditions. Due to isotopic labelling, formed nitrite-related reaction products were distinguished by gas chromatography with tandem mass spectrometry. By this approach, up to 22 unknown nitrite-related reaction products (N-products) were found and structurally studied from mass spectrometric fragmentation patterns. Besides previously found N-nitrosoproline and N-nitrosoproline ethyl ester, newly characterized compounds in beer were 4-cyanophenol, pyruvic acid oxime, 2-methoxy-5-nitrophenol, nitrosoguaiacol, and 4-nitrosophenol.... 5 Abstrakt Nitrososloučeniny jsou kontaminanty piva s karcinogenními účinky, které se přirozeně tvoří během pivoarského procesu. Obecně jsou děleny na těkavé a netěkavé. Dostatečně charakterizované a prokázané karcinogenní látky jsou těkavé N-nitrosaminy, což nelze konstatovat pro strukturně neznámé zástupce netěkavých nitrososloučenin. Tato neznalost limituje vývoj nových analytických metod vedoucí k přesnějšímu zhodnocení a kontrole zdravotních rizik piva. Předložená studie se proto zabývá těmito méně známými sloučeninami, zejména strukturou molekul a jejich přirozeným výskytem v pivu i sladu. Jelikož je jejich vznik spojován s reakcemi dusitanu se sloučeninami piva a jeho surovin, byl vzorek piva paralelně ošetřen dusitanem (standardním a izotopickým-15N) v kyselém prostředí. Díky izotopickému značení byly vzniklé reakční produkty identifikovány plynovou chromatografií s tandemovou hmotnostní spektrometrií. Tímto přístupem bylo nalezeno a strukturně studováno až 22 neznámých reakčních produktů dusitanu (N-produktů) pomocí hmotnostně spektrometrických fragmentací. Kromě dříve nalezeného N-nitrosoprolinu a N-nitrosoprolin ethyl esteru, byly nově v pivu charakterizovány: 4-kyanofenol, oxim kyseliny pyrohroznové, 2-methoxy-5-nitrofenol, nitrosoguajakol a 4-nitrosofenol. Několik N-produktů bylo...
Available in a digital repository NRGL
Studium netěkavých nitrososloučenin v pivovarství
4 Abstract Nitroso compounds are beer contaminants related to carcinogenicity and can be naturally formed during brewing. They are generally categorized as volatile and non-volatile. ...
Úloha signální dráhy oxysterolů v rozvoji solidních nádorů
Spálenková, Alžběta
2024 - Czech
Oxysterols are oxidized derivatives of cholesterol that play an important role in the pathogenesis of many diseases, including cancer. They affect processes such as cell proliferation, apoptosis, and cell migration and may also influence the efficacy of some anticancer drugs. Their levels may also be associated with the prognosis of cancer patients. The present thesis summarizes studies that expand the knowledge on the importance of oxysterols in breast cancer at different levels. In the first study, we analyzed gene expression of key factors of the oxysterol signaling pathway on the prognosis of patients with estrogen receptor (ER)-positive breast cancer. The results of this analysis revealed the association of the expression of some genes with clinico- pathological data of patients, such as tumor stage (according to TNM classification) or the tumor grade. Furthermore, we revealed an association between ABCG2 gene expression and disease free survival of patients. However, for other genes, the prognostic potential will require validation in a larger cohort of patients. The second study was designed to determine plasma levels of seven oxysterols in patients with ER-positive breast cancer. This study resulted in an association of the levels of different oxysterols with tumor size or stage. Higher... Oxysteroly jsou oxidované deriváty cholesterolu, které hrají významnou roli v patogenezi řady onemocnění, včetně nádorových. Ovlivňují procesy jako je buněčná proliferace, apoptóza, či migrace buněk a mohou také ovlivňovat účinnost některých protinádorových léčiv. Jejich hladina může být rovněž asociována s prognózou onkologických pacientů. Předkládaná dizertační práce shrnuje studie, které na různých úrovních rozšiřují znalosti o významu oxysterolů u karcinomu prsu. V první studii jsme se zaměřili na analýzu genové exprese klíčových faktorů signální dráhy oxysterolů na prognózu pacientek s estrogen receptor (ER) pozitivním typem karcinomu prsu. V rámci výsledků této analýzy jsme odhalili souvislost exprese některých genů s klinicko- patologickými daty pacientek, jako je například stádium dle TNM klasifikace, či stupeň diferenciace onemocnění. Dále jsme odhalili asociaci mezi expresí genu ABCG2 a bezpříznakovým přežíváním pacientek. Avšak pro ostatní geny bude jejich případný prognostický potenciál vyžadovat ověření na rozsáhlejší kohortě pacientek. Druhá studie měla za úkol stanovení hladiny sedmi oxysterolů v plasmě pacientek s ER pozitivním karcinomem prsu. Výsledkem této studie byla asociace hladiny některých oxysterolů s velikostí, či stádiem nádoru. Vyšší hladina cholestan-3β,5α,6β-triolu...
Available in a digital repository NRGL
Úloha signální dráhy oxysterolů v rozvoji solidních nádorů
Oxysterols are oxidized derivatives of cholesterol that play an important role in the pathogenesis of many diseases, including cancer. They affect processes such as cell proliferation, apoptosis, and ...
Vliv nabídky stravovacích zařízení na environmentálně udržitelný rozvoj cestovního ruchu
Lochman, Josef
2024 - Czech
Food accompanies a tourist's stay in a destination from the very beginning to the very end and significantly influences the overall travel experience. However, gastronomic experiences also have a significant impact on the environment, as food has to be produced, transported, and processed. This thesis addresses the environmental issue of tourists' diet in detail. The main purpose is to comprehensively approach the problem from several perspectives. Specifically, the thesis has four objectives: 1) to quantify the amount of food consumed globally in tourism and its environmental requirements; 2) to identify the potential drivers behind excessive negative pressure on the environment; 3) to evaluate the level of environmental sustainability of selected European urban destinations and 4) to consider possible opportunities for the sustainable development of a destination in relation to its gastronomic offer. In terms of theoretical framework, the thesis uses the concept of time geography and the theory of planned behaviour to demonstrate the importance of the role of catering facilities in the environmental sustainability of a destination. The reason for this is primarily the limited movement of tourists and their access to catering facilities. Another key element is the structure of local offer (menus),... Jídlo provází pobyt turistů v destinaci od samotného počátku až po úplný konec a významně ovlivňuje celkový dojem z cestování. Gastronomické zážitky ale zároveň mají nezanedbatelný dopad na životní prostředí, neboť potraviny je nezbytné produkovat, transportovat a zpracovat. Tato dizertační práce se blíže věnuje právě environmentální problematice stravování turistů. Hlavní snahou je komplexně uchopit zkoumaný problém z několika perspektiv. Konkrétně si práce klade čtyři cíle: 1) kvantifikovat množství globálně spotřebovaných potravin v rámci cestovního ruchu a jejich environmentální nároky; 2) poznat potenciální příčiny, které stojí za nadměrným negativním tlakem na životní prostředí; 3) vyhodnotit úroveň environmentální udržitelnosti vybraných evropských městských destinací a 4) posoudit možné příležitosti pro udržitelný rozvoj destinace ve vztahu k její gastronomické nabídce. Práce z hlediska teoretického ukotvení využívá koncept geografie času a teorii plánovaného chování, jimiž dokládá význam role stravovacích zařízení v oblasti environmentální udržitelnosti destinace. Důvodem je primárně omezený pohyb turistů a jejich přístup ke stravovacím zařízením. Stěžejní vliv má dále struktura nabídky (jídelníčků) ovlivňující selekci zákazníků. K dosažení cílů je využito především sekundárních a volně...
Keywords:
environmentální dopady; udržitelný cestovní ruch; stravovací zařízení; udržitelná gastronomie; environmental impacts; sustainable tourism; catering establishments; sustainable gastronomy
Available in a digital repository NRGL
Vliv nabídky stravovacích zařízení na environmentálně udržitelný rozvoj cestovního ruchu
Food accompanies a tourist's stay in a destination from the very beginning to the very end and significantly influences the overall travel experience. However, gastronomic experiences also have a ...
Substrátem kontrolované fyzikální vlastnosti tenkých vrstev magnetických oxidů pro spintronické aplikace
Maleček, Tomáš; Veis, Martin
2024 - English
As conventional electronics approaches its fundamental limits, new paradigms are re- quired. Integration of new spintronic materials with current silicon technology shows great promise. This thesis demonstrates the possibility of growing textured stress-free La2/3Sr1/3MnO3 (LSMO) thin films on silicon with properties comparable to epitaxi- ally grown layers on SrTiO3 (STO). Growth of LSMO is achieved by a two-dimensional nanosheet (NS) seed layer of Ca2Nb3O10 inducing epitaxial stabilization of LSMO films. Samples of LSMO on NS/Si, prepared by pulsed laser deposition, have been shown to have lower magnetization than samples of LSMO on STO yet also possess a higher Curie temperature by more than 10 K. Spectral dependence of the full permittivity tensor was calculated from optical and magneto-optical measurements. Spectra of the off-diagonal element have been fitted with three diamagnetic transitions located around 1.9, 2.9 and 3.5 eV for samples on NS/Si as well as for samples on STO. Similarities between the samples open the possibility of integration of LSMO into silicon technology using NS. Temperature-dependent optical and magneto-optical properties of a sample of LSMO on STO have been evaluated. Vývoj klasické elektroniky se přibližuje svým fyzikálním mezím a žádá si nových přís- tupů. Slibným se ukazuje být integrace nových spintronických materiálů s dosavadní křemíkovou technologií. Tato práce představuje možnost růstu relaxovaných textur- ovaných tenkých vrstev La2/3Sr1/3MnO3 (LSMO) na křemíku s vlastnostmi srovnatelnými s epitaxní vrstvou na SrTiO3 (STO). Růstu LSMO bylo dosaženo díky dvoudimenzionální nanovrstvě (NV) Ca2Nb3O10, která epitaxně stabilizovala růst LSMO. Bylo ukázáno, že vzorky LSMO na NV/Si, připravené pulzní laserovou depozicí, vykazují nižší saturační magnetizaci než vzorky LSMO na STO, ale přesto mají vyšší Curieovu teplotu a to o více než 10 K. Optická a magneto-optická měření byla využita na dopočtení kompletního tenzoru permitivity zkoumaného materiálu. Spektra nediagonální složky byla parametri- zována třemi diamagnetickými přechody s energiemi okolo 1.9, 2.9 a 3.5 eV a to pro LSMO na NV/Si i LSMO na STO. Podobnosti fyzikálních vlastností vzorků otevírají možnost integrace LSMO do křemíkové technologie s využitím NV. Dále v této diplomové práci byly studovány optické a magneto-optické vlastnosti vybraného vzorku LSMO na STO v závislosti na teplotě.
Keywords:
magneto-optický Kerrův jev|tenzor permitivity|epitaxní pnutí|nanovrstva|pulzní laserová depozice|LSMO; magneto-optical Kerr effect|permittivity tensor|epitaxial strain|nanosheets|pulsed laser deposition|LSMO
Available in a digital repository NRGL
Substrátem kontrolované fyzikální vlastnosti tenkých vrstev magnetických oxidů pro spintronické aplikace
As conventional electronics approaches its fundamental limits, new paradigms are re- quired. Integration of new spintronic materials with current silicon technology shows great promise. This thesis ...
Fyzikální vlastnosti dopovaného a nedopovaného Tb3Fe5O12 studované optickými spektroskopiemi
Hubert, Michal; Veis, Martin
2024 - English
This thesis focuses on systematic study of optical and magneto-optical properties of non-doped and doped Tb3Fe5O12 thin films, on gadolinium gallium garnet and silicon substrates. Spectroscopic ellipsometry measurements were performed to obtain optical properties, thicknesses and surface roughness values of studied samples. The magneto- optical properties were investigated using the Kerr and Faraday effect measurements. Obtained experimental data were used to calculate the spectral dependence of the off- diagonal components of permittivity tensor. The results were compared with literature, and the effect of doping was discussed. On three samples, the spectral magneto-optical Kerr rotation hysteresis loops were measured, for the purpose of separating the individual contributions of sublattices. The analysis revealed that the method is probably insensitive to sublattice contributions but is sensitive to the contributions of regions with different magnetic anisotropy within the deposited layer. 1 Táto práca je zameraná na systematické štúdium optických a magnetooptických vlast- ností nedopovaných a dopovaných Tb3Fe5O12 tenkých vrstiev na gadolínium gálium gra- nátových a kremíkových substrátoch. Z vykonaných meraní spektroskopickej elipsometrie boli u skúmaných vzoriek získané optické vlastnosti, hrúbky vrstiev a drsnosti povrchov. Magnetooptické vlastnosti boli skúmané použitím meraní Kerrovho a Faradayovho javu. Získané experimentálne dáta boli použité na výpočet spektrálnej závislosti mimodia- gonálnych komponentov tenzoru permitivity. Výsledky boli porovnané s literatúrou a bol diskutovaný efekt dopovania. Na troch vzorkách boli zmerané spektrálne hysterézne slučky magnetooptického Kerrovho javu pre účel oddelenia individuálnych príspevkov podmrieží. Analýza ukázala, že táto metóda pravdepodobne nie je citlivá na príspevky podmrieží, ale je citlivá na príspevky oblastí s rozdielnou magnetickou anizotropiou vnútri deponovanej vrstvy. 1
Keywords:
ferimagnetické granáty|magnetooptická spektroskopia|príspevky podmrieží; ferrimagnetic garnets|magneto-optical spectroscopy|sublattice contributions
Available in a digital repository NRGL
Fyzikální vlastnosti dopovaného a nedopovaného Tb3Fe5O12 studované optickými spektroskopiemi
This thesis focuses on systematic study of optical and magneto-optical properties of non-doped and doped Tb3Fe5O12 thin films, on gadolinium gallium garnet and silicon substrates. Spectroscopic ...
Vývoj jakosti povrchových vod ve vybraných venkovských oblastech povodí Labe
Mrkva, Luboš
2024 - Czech
Development of surface water quality in selected rural areas of the Elbe River basin Water quality is an enduring issue in water management and has global importance. This work deals with surface water quality in the Elbe River basin, focusing on river basins in agricultural and rural areas where surface water quality remains a significant ecological problem. As part of this work, two watersheds with a significant representation of agriculturally used areas were chosen: the Mastník River catchment, which flows into the Vltava River, and the Šlapanka River catchment, which flows into the Sázava River. In the case of the Mastník stream, the work deals with the basin itself and changes in water quality in the Mastník bay, which is part of the Slapy reservoir located on the Vltava River. Water quality was analysed using the concentration of selected parameters through long-term field research supplemented with data from the State Enterprise of the Vltava River basin. In this part, it was proved that constructing new wastewater treatment plants (WWTPs) gradually improves the overall water quality. However, the parameter chlorophyll-α and the lack of dissolved oxygen remain problematic. The finding of high concentrations of chlorophyll in the stream is followed by an assessment of the changes in water quality in... Kvalita vody je stálým problémem vodního hospodářství a má celosvětový význam. Tato práce se zabývá kvalitou povrchových vod v povodí řeky Labe, se zaměřením na povodí toků v zemědělských a venkovských oblastech, kde je kvalita povrchových vod významným ekologickým problémem. V rámci této práce byla zvolena dvě povodí se značným zastoupením zemědělsky využívaných ploch - povodí Mastníku, který ústí do Vltavy, a povodí Šlapanky ústící do Sázavy. V případě toku Mastník se práce zabývá, jak samotným povodím, tak také změnami kvality vody v zátoce Mastník, která je součástí vodní nádrže Slapy na řece Vltavě. Kvalita vody byla analyzována dlouhodobým terénním výzkumem, sledováním koncentrace vybraných parametrů doplněnými daty od Státního podniku povodí Vltavy. Bylo prokázáno, že výstavba nových čistíren odpadních vod (ČOV) vede k postupnému zlepšování celkové kvality vody, přestože problematické zůstávají parametry chlorofylu - α a nedostatek rozpuštěného kyslíku. Na výzkum na toku Mastníku navazuje další část práce, která se zabývá změnami kvality vody v zátoce Mastníku v období 2016- 2018. Snížená kvalita vody na menších tocích v převážně venkovských oblastech byla zapříčiněna nedostatkem srážek v letních měsících, následkem čehož se potok Mastník podílel na abnormální eutrofizaci zátoky Mastníku. Nízké...
Keywords:
Povodí Labe; Kvalita povrchových vod; Zemědělské oblasti; Zdroje znečištění; Modelování kvality vody; Klimatická změna; Elbe catchment; Surface water quality; Rural areas; Sources of pollution; Water quality modelling; Climate change
Available in a digital repository NRGL
Vývoj jakosti povrchových vod ve vybraných venkovských oblastech povodí Labe
Development of surface water quality in selected rural areas of the Elbe River basin Water quality is an enduring issue in water management and has global importance. This work deals with surface ...
Dekomposice opadu, její význam pro biogeochemické cykly
Vicena, Jakub
2024 - Czech
Decomposition of litter is a key process in the soil nutrient cycle. It is a very complex process that is influenced by a number of factors. This dissertation studies these key factors influencing the rate of organic matter mineralization using modern analytical methods. The results of the dissertation are presented in four publications in international journals with IF and one manuscript ready for publication. The first publication shows a strong positive correlation between microbial diversity and organic matter decomposition per gram of carbon. In contrast, microbial respiration per gram soil was negatively correlated with bacterial diversity and positively correlated with fungal biomass. Thus, the relationship between microbial diversity and decomposition rate is context dependent. The second study (in manuscript form) shows that microbial respiration correlates with C/N of fallout only at the beginning of the experiment, but not at the end. However, respiration during litter decomposition at the beginning and end of the experiment is strongly negatively correlated with the C/N ratio of green leaves. This suggests that the stoichiometric C/N ratio may influence decomposition indirectly through correlation with other unknown parameters such as leaf morphology. The third study examined the... Dekomposice opadu je klíčovým procesem koloběhu živin v půdě. Jedná se o velmi složitý pochod, který je ovlivňován řadou faktorů. Tato disertační práce se věnuje studiu těchto klíčových faktorů ovlivňujících míru mineralizace organické hmoty, a to za použití moderních analytických metod. Výsledky disertační práce jsou prezentovány ve čtyřech publikacích v mezinárodních časopisech s IF a jednom rukopisu připraveném k publikování. První publikace ukazuje silnou pozitivní korelaci mezi mikrobiální diversitou a dekomposicí organické hmoty na gram uhlíku. Naproti tomu mikrobiální respirace na gram půdy negativně koreluje s bakteriální diverzitou a pozitivně s houbovou biomasou. Vztah mezi mikrobiální diverzitou a rychlostí dekomposice je tedy závislý na kontextu. Druhá studie (ve formě rukopisu) ukazuje, že mikrobiální respirace koreluje s C/N opadu pouze na počátku experimentu, nikoli však na jeho konci. Respirace při dekomposici opadu na začátku a na konci experimentu však úzce negativně koreluje s C/N poměrem zeleného listí. To naznačuje, že stechiometrický poměr C/N může ovlivňovat rozklad nepřímo prostřednictvím korelace s dalšími neznámými parametry jako je např. morfologie listů. V rámci třetí studie byla zkoumána struktura houbových a bakteriálních společenstev v jednotlivých frakcích půdní...
Keywords:
dekomposice opadu; poměr C:N; mikrobiální biomasa; mikrobiální diversita; litter decomposition; C:N ratio; microbial biomass; microbial diversity
Available in a digital repository NRGL
Dekomposice opadu, její význam pro biogeochemické cykly
Decomposition of litter is a key process in the soil nutrient cycle. It is a very complex process that is influenced by a number of factors. This dissertation studies these key factors influencing the ...
NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web
Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz
Provider
Other bases