Yes (1992)
No (4)
Used filters
(3)
Number of found documents:
1996
Published from
to
Funkce RNA demetylázy FTO v diferenciaci, regulaci energetického metabolismu a citlivosti k streprozotocinu modelových neuronálních a gliových buněk
Čočková, Zuzana
2023 - English
Fat mass and obesity associated (FTO) demethylase is responsible for erasure of the most abundant epitranscriptomic mark in eukaryotic mRNA, the N6-methyladenosine (m6A) residue. Together with other m6A erasers, writers (methyltransferases) and readers it forms an m6A regulatory pathway that controls the amount, location and biological effect of m6A. The dynamic regulation of the brain's m6A methylome during neurodevelopment is essential for maintaining cerebral functions. In addition, preclinical research suggests that the m6A regulatory pathway regulates energy balance in a tissue- and cell type-specific manner. The FTO gene has been associated with lifelong risks of obesity and metabolic syndrome as well as regulation of total body energy intake and expenditure. However, little is understood about the function of the m6A pathway in control of brain energy metabolism. That is of interest in pursuit of understanding Alzheimer's disease, as this illness is characterized by profound disruptions in cerebral energy metabolism and mounting evidence suggests that disrupted brain bioenergetics may play a role in the disease's early genesis, before the appearance of clinical symptoms. In the present thesis we aimed to investigate the role of FTO in models of two brain cell types, neurons and astrocytes.... Demetyláza FTO (z angl. Fat mass and obesity associated) je zodpovědná za odstraňování nejrozšířenější epitranskriptomické modifikace v eukaryotické mRNA, N6- methyladenosinu (m6A). FTO spolu s dalšími demetylázami, metyltransferázami a m6A- čtecími proteiny tvoří regulační dráhu, která řídí množství, lokalizaci a biologický účinek m6A. Dynamická regulace metylomu m6A v mozku během vývoje je nezbytná pro zachování mozkových funkcí. Předklinický výzkum navíc ukázal, že způsob regulace energetické rovnováhy pomocí m6A dráhy může být rozdílný v odlišných tkáních či buněčných typech. Gen FTO je spojován s celoživotním rizikem obezity a rozvojem metabolického syndromu, a také s regulací celkového příjmu a výdeje energie v těle. O funkci dráhy m6A při řízení energetického metabolismu v mozku je však známo jen málo. Studium tohoto fenoménu je žádoucí mimo jiné pro lepší porozumění Alzheimerově chorobě, protože toto onemocnění je charakteristické poruchami energetického metabolismu mozku a stále více důkazů naznačuje, že narušená bioenergetika mozku může hrát roli v ranných fázích onemocnění, ještě před objevením klinických příznaků. V této práci jsme se zaměřili na zkoumání role FTO v modelech dvou typů mozkových buněk, neuronů a astrocytů. Pomocí neuronálních buněk SH-SY5Y jsme chtěli zjistit, zda FTO...
Keywords:
FTO; energetický metabolismus; mitochondriální respirace; isulinová signalizace; amyloidový β-peptid; FTO; energy metabolism; mitochondrial respiration; insuline signaling; amyloid β-peptide
Available in a digital repository NRGL
Funkce RNA demetylázy FTO v diferenciaci, regulaci energetického metabolismu a citlivosti k streprozotocinu modelových neuronálních a gliových buněk
Fat mass and obesity associated (FTO) demethylase is responsible for erasure of the most abundant epitranscriptomic mark in eukaryotic mRNA, the N6-methyladenosine (m6A) residue. Together with other ...
Závaznost rozhodnutí a nálezů v mezinárodníchsporech
Kadlec, Nicole; Šturma, Pavel
2023 - English
1 Abstract and Key Words: The Binding Effect of Decisions and Awards in International Disputes Abstract International investment law accords foreign investors two main types of protection: first, it articulates standards of protection a host State must adhere to with respect to foreign investments, and, second, it provides an investor with a choice to have investment disputes settled by an independent international tribunal. While standards of protection and the mandate of arbitrators stem from an international investment treaty, arbitrators apply both national law and international law. Nevertheless, being regarded as principally deciding on the international responsibility of States, questions of national law are usually sidelined in the academic debate. This thesis rectifies this neglect and asks: How should an arbitrator in investment treaty arbitration treat national judicial decisions? The thesis addresses this question from doctrinal angle by analysing academic writings, judicial decisions, and arbitral awards in the field of international investment arbitration, international commercial arbitration, and the practice of the International Court of Justice. This is because investment treaty arbitration is a hybrid formation oscillating between public international law adjudication and national... a klíčová slova: Závaznost rozhodnutí a nálezů v mezinárodních sporech Abstrakt Mezinárodní investiční právo poskytuje zahraničním investorům dva základní typy ochrany: standardy ochrany, které musí státy dodržovat vůči investorům a jejich investicím, a možnost řešit spory týkající se těchto investic před nestranným mezinárodním rozhodčím tribunálem. Přestože standardy ochrany a mandát rozhodců jsou zakotveny v mezinárodní úmluvě, rozhodce při řešení investičních sporů aplikuje jak mezinárodní, tak i národní právo. Nicméně jelikož je takový rozhodce vnímán především jako arbitr rozhodující o mezinárodněprávní odpovědnosti států, otázky národního práva jsou v akademické diskuzi upozaďovány. Tato disertační práce napravuje tento nedostatek a pokládá si následující otázku: Jak by měl rozhodce v mezinárodní investiční arbitráži zaházet s národní judikaturou? Práce tuto otázku zodpovídá doktrinální analýzou akademických prací, soudních rozhodnutí a rozhodčích nálezů z oblasti práva mezinárodní investiční arbitráže, mezinárodní obchodní arbitráže a analyzuje také praxi Mezinárodního soudního dvora. Rozličnost zdrojů, ze kterých tato práce čerpá a které analyzuje, je dána hybridní povahou mezinárodní investiční arbitráže, která se pohybuje mezi národním způsobem řešení sporů a řešením sporů v rovině...
Keywords:
mezinárodní investiční arbitráž; zacházení s národní judikaturou; národní právo; investment treaty arbitration; treatment of national case law; national law
Available in a digital repository NRGL
Závaznost rozhodnutí a nálezů v mezinárodníchsporech
1 Abstract and Key Words: The Binding Effect of Decisions and Awards in International Disputes Abstract International investment law accords foreign investors two main types of protection: first, it ...
Vliv různých stresových faktorů na mitochondriální procesy patogenních protistů
Ženíšková, Kateřina
2023 - English
Mitochondria perform various important functions in cells. They are the main site of energy metabolism, biosynthetic and regulatory processes, and the center of iron metabolism. Additionally, mitochondria are also the central organelle responsible for the production of potentially dangerous reactive oxygen species and possess a self-destructive arsenal capable of inducing whole-cell apoptosis. This single organelle thus controls the fate of the entire cell. Given these facts, this organelle has become the focus of interest for many scientists and pharmaceutical companies developing drugs targeting mitochondria. During evolution, unicellular parasites have evolved several mechanisms to survive, defend themselves and reproduce in the hostile environment of their host. One of these mechanisms is the ability to adapt its mitochondrial metabolism to maintain the viability of the whole cell. This work focuses on mitochondria from two different perspectives: First, concerning the phenomenon of nutritional immunity, we studied the effect of iron and copper deprivation on the mitochondria of the "brain-eating" amoeba Naegleria fowleri. Proteomic analysis of cells pre-incubated with specific chelators, together with the determination of several enzyme activities and measurements of oxygen consumption,... Mitochondrie plní v buňkách různé důležité funkce. Jsou hlavním místem energetického metabolismu, biosyntetických a regulačních procesů a také centrem metabolismu železa. Kromě toho jsou mitochondrie také ústřední organelou odpovědnou za produkci potenciálně nebezpečných reaktivních forem kyslíku a disponují sebedestruktivním arzenálem schopným vyvolat apoptózu celé buňky. Tato jediná organela tak řídí osud celé buňky. Vzhledem k těmto skutečnostem se tato organela stala středem zájmu mnoha vědců a farmaceutických společností vyvíjejících léčiva cílená na mitochondrie. Jednobuněční parazité si během evoluce vyvinuli několik mechanismů, jak přežít, bránit se a rozmnožovat se v nepřátelském prostředí svého hostitele. Jedním z těchto mechanismů je schopnost přizpůsobit svůj mitochondriální metabolismus k udržení životaschopnosti celé buňky. Tato práce se zaměřuje na mitochondrie ze dvou různých hledisek: Za prvé, s ohledem na fenomén nutriční imunity, jsme studovali vliv deprivace železa a mědi na mitochondrie "mozkožravé" améby Naegleria fowleri. Proteomická analýza buněk předem preinkubovaných se specifickými chelátory, spolu se stanovením aktivit enzymů a měřením spotřeby kyslíku ukázala, že mitochondrie N. fowleri se těmto limitujícím faktorům přizpůsobují upregulací alternativních složek...
Available in a digital repository NRGL
Vliv různých stresových faktorů na mitochondriální procesy patogenních protistů
Mitochondria perform various important functions in cells. They are the main site of energy metabolism, biosynthetic and regulatory processes, and the center of iron metabolism. Additionally, ...
Molekulární podstata deficitu F1Fo-ATP syntázy a jeho dopad na energetický metabolismus buňky
Štufková, Hana
2023 - English
Mitochondria's primary function is to produce energy through the process of oxidative phosphorylation. ATP synthase is a macromolecular rotary machine located in the inner mitochondrial membrane that catalyzes the synthesis of adenosine triphosphate (ATP) from adenosine diphosphate (ADP) and inorganic phosphate (Pi). The mitochondrial disorders due to ATP synthase deficiency represent a heterogeneous group of diseases characterized by variable severity of the phenotype with onset at birth or later in life till adulthood. Mutations in both, mitochondrial or nucelar DNA encoded genes, may result in ATP synthase impairment, either isolated or combined with deficits of other complexes of oxidative phosphorylation. The aims of the thesis were to characterize TMEM70 protein, an ATP synthase assembly factor, and to analyze the impact of novel disease variants leading to ATP synthase deficiency in patients' derived samples. TMEM70 is a 21 kDa hairpin structure protein localized in the inner mitochondrial membrane, with both termini oriented into the matrix, which forms higher oligomer structures. Our results demonstrated that the absence of TMEM70 protein leads to an isolated deficiency of complex V followed in some stage by adaptive/compensatory effect of respiratory chain complexes. Different severities... Hlavní funkcí mitochondrií je produkce energie prostřednictvím procesu oxidační fosforylace. ATP syntáza je makromolekulární rotační stroj lokalizovaný ve vnitřní mitochondriální membráně katalyzující syntézu adenosintrifosfátu (ATP) z adenosindifosfátu (ADP) a anorganického fosfátu (Pi). Mitochondrialní poruchy ATP syntázy představují heterogenní skupinu onemocnění charakterizovanou různou závažností klinického fenotypu s nástupem od narození nebo v pozdějších fázích života. Mutace v mitochondriální nebo jaderné DNA mohou vést k poruše ATP syntázy, a to buď izolovaně, nebo v kombinaci s defekty dalších komplexů systému oxidační fosforylace. Cílem práce bylo charakterizovat protein TMEM70, asemblační faktor ATP syntázy, a studovat vliv nových variant vedoucích k deficitu ATP syntázy v pacientských vzorcích. TMEM70 je 21 kDa velký protein vnitřní mitochondriální membrány s orientací obou konců do mitochondriální matrix, který tvoří v membráně vyšší oligomerní struktury. Naše výsledky ukázaly, že absence proteinu TMEM70 vede ke vzniku izolovaného deficitu komplexu V, s přítomností adaptačního/kompenzačního efektu komplexů dýchacího řetězce. Ve svalových mitochondriích byly pozorovány různé stupně deficitu ATP syntázy způsobené extrémně vzácnými heteroplazmatickými variantami v genu MT-ATP6. Zatímco...
Available in a digital repository NRGL
Molekulární podstata deficitu F1Fo-ATP syntázy a jeho dopad na energetický metabolismus buňky
Mitochondria's primary function is to produce energy through the process of oxidative phosphorylation. ATP synthase is a macromolecular rotary machine located in the inner mitochondrial membrane that ...
Ekologické a evoluční procesy určující strukturu sítí rostlin a opylovačů
Hadrava, Jiří
2023 - English
Associations between flowers and pollinators are responsible for reproduction of majority of plant species as well as food supply for substantial part of animal diversity on the Earth. Until recently, the studies on plant-pollinator relationship were focused predominantly on pollination of particular plant species, with only little or no accent on community perspective. In recent decades, however, pollination ecology shifted its focus rather to community context by introducing so called pollination networks. This approach allows us to view the ubiquity and complexity of the interactions between plants and their pollinators and it opened up many new opportunities to study the pollination from animal perspective or to access spatio-temporal variability in the interactions. However, we still have only limited insight into the processes driving the structure and dynamics of such networks. The assembly of plants, pollinators and their interactions are driven by various ecological as well as evolutionary processes. From the ecological point of view, species co-occurrence in time and space may affect the interactions, or species flexibility for various community contexts providing different food sources may play role. In the evolutionary perspective, species may have various co-adaptations due to their... Abtrakt Rozmnožování většiny druhů rostlin a potrava značné části diverzity živočichů na této planetě přímo závisí na vztazích mezi květy a opylovači. Donedávna se však převážná většina výzkumu opylování zaměřovala pouze na studium opylování konkrétních rostlin a jen málo pozornosti bylo věnováno celým společenstvům rostlin i opylovačů. V posledních desetiletích se však zaměření ekologie opylování posunulo díky zavedení konceptu opylovacích sítí. Tento koncept umožnil zabývat se opylováním v kontextu celého společenstva, poukázal na rozmanitost i komplexitu vztahů mezi rostlinami a jejich opylovači a otevřel řadu nových možností výzkumu těchto vztahů z pohledu jeho významu pro živočichy nebo z pohledu časové a prostorové dynamiky opylovacích interakcí. Přesto však dosud máme jen matné představy o tom, jaké procesy jsou zodpovědné za strukturu a dynamiku těchto sítí. Podoba opylovací sítě je formována jak ekologickými, tak evolučními procesy. Z ekologického pohledu hraje roli například to, jak se druhy v čase a prostoru potkávají nebo jak si jednotlivé taxony opylovačů vybírají mezi rostlinami v závislosti na kontextu prostředí, aktuálních potravních potřebách či nabídce květních zdrojů. Z evolučního pohledu je pak podoba sítě vztahů mezi rostlinami a opylovači určena tím, jak se druhy na sebe vzájemně...
Keywords:
Opylovači; pestřenky; včely; ekologie; evoluce; Pollinators; hover flies; bees; ecology; evolution
Available in a digital repository NRGL
Ekologické a evoluční procesy určující strukturu sítí rostlin a opylovačů
Associations between flowers and pollinators are responsible for reproduction of majority of plant species as well as food supply for substantial part of animal diversity on the Earth. Until recently, ...
Použití zpětnovazebního učení pro hraní textových her
Zelinka, Mikuláš; Kadlec, Rudolf
2023 - English
The ability to learn optimal control policies in systems where action space is defined by sentences in natural language would allow many interesting real-world applications such as automatic optimisation of dialogue systems. Text-based games with multiple endings and rewards are a promising platform for this task, since their feedback allows us to employ reinforcement learning techniques to jointly learn text representations and control policies. We present a general text game playing agent, testing its generalisation and transfer learning performance and showing its ability to play multiple games at once. We also present pyfiction, an open-source library for universal access to different text games that could, together with our agent that implements its interface, serve as a baseline for future research. Schopnost naučit se optimálnímu chování v prostředích, kde jsou stavy i akce vyjádřeny v přirozeném jazyce, by se dala aplikovat na řadu skutečných problémů, jako je optimalizace dialogových systémů. Pro tento učící problém jsou vhodnou doménou textové hry s větším počtem možných konců se zpětnou vazbou v podobně číselných ohodnocení. S její pomocí můžeme v tomto kontextu využít technik zpětnovazebního učení pro současné učení vhodné reprezentace textových dat a rozhodovacích pravidel. Představujeme model obecného agenta schopného hrát textové hry a zkoumáme jeho schopnost generalizace a přenosu získaných znalostí na nová prostředí. Rovněž demonstrujeme, že se agent dokáže naučit hrát více textových her najednou. Dále prezentujeme otevřenou knihovnu pyfiction, která sjednocuje přístup k různým textovým hrám a doufáme, že společně s agentem, který je její součástí, by v budoucnu mohla sloužit jako referenční rámec pro podobné úlohy.
Keywords:
zpětnovazební učení; textové hry; neuronové sítě; reinforcement learning; text games; neural networks
Available in a digital repository NRGL
Použití zpětnovazebního učení pro hraní textových her
The ability to learn optimal control policies in systems where action space is defined by sentences in natural language would allow many interesting real-world applications such as automatic ...
Finančněprávní aspekty globálních platebních systémů
Moravec, Jiří; Boháč, Radim
2023 - English
Financial Aspects of Global Payment Systems Abstract This dissertation summarizes findings on Digital Asset's development, which would fit under the era of Blockchain 1.0. We analyzed and synthetized available resources focusing on the following areas: (i) historic aspects of Digital Assets, (ii) technical solutions of Digital Assets, (iii) actual use of Digital Assets, (iv) abuse of Digital Assets, (v) Digital Assets' legal integration, (vi) Digital Assets as a global payment system. Analyzing history of Digital Assets, we summarize that Digital Assets were developed with the intent to liberate payment systems from existing financial supervision. Once such system became functional it was immediately abused. In connection with technical solutions, we find that as technical complexity of Digital Assets (especially the lack of the trusted third party) diminishes protection of Digital Assets users, it incentivizes criminal activity. Consequently, Digital Assets are vastly abused for different criminal purposes, including development of services dedicated to criminal activity, such as Dark Web Marketplaces or Digital Assets Mixer. Further, Digital Assets are used for payments on minimal scale, and the retail use if practically nonexistent. Currently, Digital Assets' legal integration is slow and fractional;... Finančněprávní aspekty globálních platebních systémů Abstrakt Disertační práce shrnuje poznatky o vývoji digitálních aktiv, které spadají do éry Blockchainu 1.0. Při studiu a zpracování dostupných dat jsme se zaměřili na následující oblasti: (i) historické aspekty digitálních aktiv, (ii) technická řešení digitálních aktiv, (iii) skutečné využití digitálních aktiv, (iv) zneužití digitálních aktiv, (v) právní začlenění digitálních aktiv, (vi) digitální aktiva a jejich schopnost fungovat jako globální platební systém. Z analýzy historických dat vyplývá, že digitální aktiva byly vyvinuty tak, aby na ně nedosáhla ruka stávajícího finančního dohledu. V důsledku toho byl takový systém od začátku zneužíván. Ukazuje se, že s tím, jak technická složitost digitálních aktiv (zejména absence centrální autority) snižuje ochranu nezkušených uživatelů digitálních aktiv, motivuje ostatní k trestné činnosti. V důsledku toho jsou digitální aktiva ve velké míře zneužívány k různým kriminálním aktivitám, včetně vývoje služeb určených čistě k trestné činnosti, jako jsou Dark Web Marketplaces nebo Digtal Asset Mixers. Další důležitou skutečností je, že se digitální aktiva používají k platbám v minimálním rozsahu a jejich maloobchodní využití, prakticky neexistuje. V současné době je právní integrace digitálních aktiv pomalá a...
Available in a digital repository NRGL
Finančněprávní aspekty globálních platebních systémů
Financial Aspects of Global Payment Systems Abstract This dissertation summarizes findings on Digital Asset's development, which would fit under the era of Blockchain 1.0. We analyzed and synthetized ...
Populační struktura a evoluční historie středoevropských zvonků z okruhu Campanula rotundifolia agg.
Šemberová, Kristýna
2023 - English
6 Abstract For understanding extant species diversity, knowledge about processes acting at the population level is crucial. Besides mutations generating de novo genetic variation, three major processes, i.e., polyploidy, hybridization and local adaptation, notably impact population structure and cause evolutionary novelty. Campanula rotundifolia agg. was chosen as a model group for the joint study of these processes because it represents a polyploid complex with three major cytotypes (2x, 4x, 6x), a hitherto unknown ability to hybridize, and a pleiad of putative species that have undergone local adaptation to different conditions. In particular, polyploidization in the complex is acknowledged for generating morphological variation, facilitating long-distance dispersal and shifts in the environmental niche. It also creates a reproductive barrier, thus enabling sympatric speciation. Prerequisites for local adaptation are morphological variation and strong selection pressures leading to adaptive divergence and the rise of many endemic taxa, mainly at the extremes of environmental gradients. On the other hand, for locally adapted or endemic taxa, hybridization with a widespread taxon is one of the main existential threats. Here, I focused on C. rotundifolia agg. populations in Central Europe its hypothetical... 7 Abstrakt zace novinky. Campanula rotundifolia agg.) byl vy studium a . polyploidizace zdroj komplexu a a ved k posunu klady pro i jsou k ke v hybridizace s V C. rotundifolia a alopatrii. a o na a tetraploid , a to jak v mi ami, studovala jsem morfologickou v v by variabilita ve velikosti genomu, v gneice a morfoligii. Vysok variabilita, s m vysok C. rotundifolia m ch ch model ne y rekonstruovanou , jsem porovnala genetickou a morfologickou variabilitu a variabilitu ve velikosti genomu u rostlin z C. rotundifolia s. str. Morfologick podobnost a genetick C. bohemica a C. scheuchzeri z Alp byl C. gelida ve v C. rotundifolia subsp. sudetica. Campanula rotundifolia subsp. sudetica C. rotundifolia s. str. Campanula rotundifolia fenotypovou taxonomy : Campanula rotundifolia agg,
Available in a digital repository NRGL
Populační struktura a evoluční historie středoevropských zvonků z okruhu Campanula rotundifolia agg.
6 Abstract For understanding extant species diversity, knowledge about processes acting at the population level is crucial. Besides mutations generating de novo genetic variation, three major ...
Mikrobiota hostitele, zánětlivá imunitní odpověď a fyziologická senescence u volně žijících ptáků
Těšický, Martin
2023 - English
Triggered by microbial ligands, inflammation serves as a "double-edged sword" to fight infections on the one hand, but on the other hand causing tissue damage due to oxidative stress if it is dysregulated. For example, chronic inflammation can contribute to inflammaging, which is now widely regarded as one of the causes of ageing. In my interdisciplinary dissertation, my colleagues and I investigated three interrelated aspects of inflammation, using an evolutionary framework and various free-living birds as models: (1) ecological and evolutionary determinants of gut microbiota (GM) composition and diversity, a driver of wild bird immunity, (2) diversity in immune genes affecting inflammatory responses in wild birds and (3) inflammation-related physiological senescence in a free-living passerine bird, the great tit (Parus major). Firstly, using 16S rRNA gene metabarcoding, we revealed high intra- and interspecific variation in passerine gut microbiota (GM) dominated by the major phyla Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria and Bacteroidetes. Although in mammals GM depends strongly on host phylogeny and diet, in birds we found only moderate effects of phylogeny and very limited effects of host geography and ecology on GM composition. While microbiota diverged between the upper and lower... Mikrobiálními ligandy vyvolaný zánět je klíčový imunologický proces, který na jedné straně zajišťuje obranyschopnost proti infekčním onemocněním, ale jeho dysregulace může vést také k oxidačnímu poškození tkání. K tomu dochází např. během chronického zánětu, který může způsobovat tzv. inflammaeging, o němž se nyní uvažuje jako o možné příčině stárnutí. Ve své multidisciplinární disertaci jsem za využití evolučně-komparativních přístupů a ptáků jako modelové skupiny zkoumal tři vzájemně propojené aspekty zánětu: (1) evoluční a ekologické determinanty vnitro- a mezidruhové variability střevní mikrobioty (SM), které ovlivňují evoluci ptačí imunity, (2) genetickou diverzitu imunitních genů ovlivňující zánětlivou imunitní odpověď u ptáků a (3) stárnutí ve fyziologických znacích spojených s tzv. inflammagingem na modelu volně žijícího pěvce, sýkory koňadry (Parus major). (1) Pomocí sekvenování bakteriální 16S rRNA jsme zjistili značnou vnitro- i mezidruhovou diverzitu ve složení SM u pěvců a dominanci taxononů z kmenů Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria and Bacteroidetes. V porovnání se savčí SM, které je do velké míry determinována fylogenezí hostitele a jeho stravou, naše výsledky u pěvců ukazují pouze na středně silný vliv fylogeneze hostitele a velmi slabý vliv ekologických faktorů (potrava a...
Keywords:
ptáci; adaptivní konvergence; genová ztráta; vrozená imunita; positivní selekce; strukturní bioinformatika; mikrobiota hostitele; mikrobiom; pěvci; pattern-recognition receptory; senescence; stárnutí; inflammaging; zánět; oxidativní stress; antioxidanty; redoxní rovnováha; sýkora koňadra; Parus major; birds; adaptive convergence; gene loss; innate immunity; positive selection; structural bioinformatics; host microbiota; microbiome; passerines; pattern-recognition receptors; senescence; ageing; inflammaging; inflammation; oxidative stress; antioxidants; redox balance; great tit; Parus major
Available in a digital repository NRGL
Mikrobiota hostitele, zánětlivá imunitní odpověď a fyziologická senescence u volně žijících ptáků
Triggered by microbial ligands, inflammation serves as a "double-edged sword" to fight infections on the one hand, but on the other hand causing tissue damage due to oxidative stress if it is ...
Strukturní charakterizace komplexů domén PA podjednotky chřipkové polymerasy s novými inhibitory
Radilová, Kateřina
2023 - English
Influenza RNA-dependent RNA polymerase is a heterotrimeric complex and has an essential role in the life cycle of the virus. It is responsible for viral replication and transcription. One of its subunits, the polymerase acidic protein, interacts with the PB1 subunit via a crucial protein- protein interaction at its C-terminal domain. This 310 helix-mediated intersubunit interaction is required for the whole heterotrimer assembly. The N-terminal domain carries the endonuclease active site with two manganese ions. Both domains are considered promising drug targets. Current strategies to fight the influenza virus are limited to seasonal vaccines, and there are only a few anti-influenza drugs targeting mostly other viral proteins. Many used antivirals are susceptible to rapid resistance mutations development or cause severe side effects. This thesis provides structural insights into the two domains of the PA subunit. The first part is devoted to the characterization and optimization of a PB1-derived minimal peptide interacting with the C-terminal domain. Results from this part may be considered as a starting point for the rational design of first-in-class anti-influenza inhibitors of the PA-PB1 protein-protein interaction. In the other half, we have explored the inhibitory potency of flavonoids and... RNA-dependentní RNA polymerasa viru chřipky je heterotrimerický komplex, který má zásadní roli v životním cyklu viru. Je zodpovědná za virovou replikaci a transkripci. Jedna z jejích podjednotek, PA podjednotka, interaguje s PB1 podjednotkou prostřednictvím důležité protein-proteinové interakce na své C-koncové doméně. Tato interakce, která je zprostředkovaná 310 helixem, je nutná k utvoření celého heterotrimerického komplexu. N-koncová doména navíc obsahuje místo s endonukleasovou aktivitou se dvěma manganatými ionty. Obě tyto domény jsou považovány za slibné terapeutické cíle. V současnosti jsou přístupy v léčbě a prevenci chřipkového onemocnění limitované na sezónní očkování a existuje pouze několik léků, které ve velké většině cílí na jiné proteiny viru chřipky. U řady z nich však dochází k rychlému vývoji rezistentních mutací, nebo mají závažné vedlejší účinky. Tato práce nabízí strukturní náhledy na dvě domény PA podjednotky. První část se věnuje charakterizaci a optimalizaci minimálního peptidu odvozeného z PB1 podjednotky, který interaguje s C-koncovou doménou PA podjednotky a brání jejich dimerisaci. Výsledky z této části mohou být považovány za počáteční bod pro racionální vývoj prvních inhibitorů PA-PB1 protein-proteinové interakce proti viru chřipky. V druhé polovině jsme zkoumali...
Available in a digital repository NRGL
Strukturní charakterizace komplexů domén PA podjednotky chřipkové polymerasy s novými inhibitory
Influenza RNA-dependent RNA polymerase is a heterotrimeric complex and has an essential role in the life cycle of the virus. It is responsible for viral replication and transcription. One of its ...
NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web
Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz
Provider
Other bases