Použitá omezení (2)  Zrušit všechna omezení
Počet nalezených dokumentů: 1435
Publikováno od do

Current view on phylogeny within the genus Flabellula Schaeffer, 1926 (Amoebozoa: Leptomyxida)
LISNEROVÁ, Martina
2022 - anglický
The present study deals with the molecular phylogeny of the genus Flabellula Schaeffer, 1926 that has been updated by determining SSU rRNA and actin gene sequences of 19 new strains. The descriptions of two novel species, F. schaefferi n. sp. and F. sawyeri n. sp., are provided based on the congruence of morphological data with SSU rRNA and actin gene sequence phylogenies, in-silico secondary structure prediction of the V2 region in the SSU rRNA, and by recognition of species-specific sequential motifs within this region. Klíčová slova: Flabellula; Flabellulidae; amoeba Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Current view on phylogeny within the genus Flabellula Schaeffer, 1926 (Amoebozoa: Leptomyxida)

The present study deals with the molecular phylogeny of the genus Flabellula Schaeffer, 1926 that has been updated by determining SSU rRNA and actin gene sequences of 19 new strains. The descriptions ...

LISNEROVÁ, Martina
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Orthohantaviruses in the reservoir and atypical hosts in the Czech Republic: spillover infection and indication of virus-specific tissue tropism
KAMIŠ, Jan
2022 - anglický
Aim of this study was to reveal the presence of hantaviruses in natural reservoir rodent hosts in selected urban areas in the Czech Republic. Hantavirus rodent hosts were trapped, sampled and tested for hantavirus RNA in different tissues. Universal and specific primers for amplification of the large and medium fragments of hantavirus genomic RNA were used. Phylogenetic relationships were based on the obtained nucleotide sequences. Four different hantaviruses were detected, including two species pathogenic (or potentially pathogenic) for humans, further suggesting a threat for public health. Moreover, inter-family spillover infections and hantavirus species-associated tissue tropism were recorded in rodent hosts. Klíčová slova: Kurkino virus; Tula virus; Seewis virus; Asikkala virus; spillover infection; phylogeny; host specificity; tissue specificity; hantavirus Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Orthohantaviruses in the reservoir and atypical hosts in the Czech Republic: spillover infection and indication of virus-specific tissue tropism

Aim of this study was to reveal the presence of hantaviruses in natural reservoir rodent hosts in selected urban areas in the Czech Republic. Hantavirus rodent hosts were trapped, sampled and tested ...

KAMIŠ, Jan
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Modelling of tick borne enecephalitis virus (TBEV) proteins and their complexes
HALBEISEN, Marco
2022 - anglický
In this bachelor thesis the focus was on the study of non-structural proteins of the tick-borne encephalitis virus involved in the replicatory process of the virus. Non-structural protein number 3 (NS3) and number 5 (NS5) contain a helicase and an RNA-dependent RNA polymerase domain, respectively, and play a crucial role in the life cycle of the virus. Therefore, they are of interest to develop a potential antiviral drug inhibiting the replication of the pathogen. It has been found that these two proteins form a dimer during the replication of the viral RNA. The aim of the thesis was to identify the exact interaction of the two proteins with existing hydrogen-deuterium mass spectroscopy data as well as modelling the RNA into the complexes. The research was conducted by using computational biology tools including homology modelling using MODELLER, manual modelling in PyMOL and Chimera as well as Molecular Dynamics Simulations in GROMACS. In this bachelor thesis the focus was on the study of non-structural proteins of the tick-borne encephalitis virus involved in the replicatory process of the virus. Non-structural protein number 3 (NS3) and number 5 (NS5) contain a helicase and an RNA-dependent RNA polymerase domain, respectively, and play a crucial role in the life cycle of the virus. Therefore, they are of interest to develop a potential antiviral drug inhibiting the replication of the pathogen. It has been found that these two proteins form a dimer during the replication of the viral RNA. The aim of the thesis was to identify the exact interaction of the two proteins with existing hydrogen-deuterium mass spectroscopy data as well as modelling the RNA into the complexes. The research was conducted by using computational biology tools including homology modelling using MODELLER, manual modelling in PyMOL and Chimera as well as Molecular Dynamics Simulations in GROMACS. Klíčová slova: PyMOL; Homology modelling; Molecular dynamics simulation; site directed mutagenesis Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Modelling of tick borne enecephalitis virus (TBEV) proteins and their complexes

In this bachelor thesis the focus was on the study of non-structural proteins of the tick-borne encephalitis virus involved in the replicatory process of the virus. Non-structural protein number 3 ...

HALBEISEN, Marco
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Bacterial life history strategies in gamma-irradiated arable soil receiving different microbial inocula
FARKOVÁ, Karolína
2022 - anglický
Půda obsahuje mimořádnou úroveň mikrobiální biodiverzity, která podporuje klíčové funkce ekosystému. Pochopení toho, jak se půdní mikrobiální společenstva v zemědělských ekosystémech utvářejí a jaké vlastnosti vykazují (tj. jaké funkce a služby zprostředkovávají), je nezbytné pro lepší předvídání důsledků ztráty biologické rozmanitosti. Tato práce analyzuje složení, diverzitu a životní strategie půdních bakteriálních společenstev po zavedení mikrobiálních společenstev z různých zdrojů (tj. půdy a kravských exkrementů) do sterilní půdy (ozářené -zářením). Výsledky ukazují, že bakterie z půdy a exkrementů se v -ozářené půdě úspěšně etablovaly a že složení a diverzita bakteriálních společenstev silně závisí na zdroji inokulace. Analýzy vybraných funkčních znaků prokázaly, že taxony časných kolonizátorů se vyznačovaly vyšším počtem kopií genu 16S rRNA, menšími genomy a zvýšenou pohyblivostí a schopností sporulace než původní půdní bakteriální společenstva. Kromě toho, přestože půdy vykazovaly podobné počáteční fyzikálně-chemické a biochemické vlastnosti, různá mikrobiální společenstva vytvářela podstatné rozdíly ve vlastnostech půdy a mikrobiálně zprostředkovaných funkcích. Tato práce přispívá k lepšímu pochopení toho, jak je složení bakteriálního společenstva důležité pro mikrobiální biodiverzitu v půdě a jak naopak může biodiverzita přispívat ke změnám půdní úrodnosti a aktivity bakterií prostřednictvím různých životních strategií a vlastností. Soil contains an extraordinary level of microbial biodiversity that supports key ecosystem functions. Understanding how soil microbial communities assemble in agricultural ecosystems, as well as what traits they exhibit (i.e., what functions and services they mediate), is essential to better predict the consequences of biodiversity loss. This thesis analyzes the composition, diversity, and life history strategies of soil bacterial communities after the introduction of microbial communities from different sources (i.e., soil and cow excreta) into sterile soil (-irradiated). The results show that bacteria from soil and excreta successfully established in the -irradiated soil and that the bacterial composition and diversity strongly depends on the inoculation source. Analyses of selected functional traits proved that early colonizer taxa were characterized by having higher 16S rRNA copy numbers, smaller genomes and elevated motility and sporulation abilities than the original soil bacterial community. In addition, despite the soils showing similar initial physicochemical and biochemical properties, the different bacterial assemblages generated strong differences in soil properties and microbially-mediated functions. This thesis contributes to a better understanding on how the composition of microbial community is important for the microbial biodiversity in soil and in turn, how biodiversity can contribute to changes in soil fertility and bacterial activity through different life history strategies and traits. Klíčová slova: půda; bakteriální komunita; funkční znaky; životní strategie; zemědělství Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Bacterial life history strategies in gamma-irradiated arable soil receiving different microbial inocula

Půda obsahuje mimořádnou úroveň mikrobiální biodiverzity, která podporuje klíčové funkce ekosystému. Pochopení toho, jak se půdní mikrobiální společenstva v zemědělských ekosystémech utvářejí a jaké ...

FARKOVÁ, Karolína
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Expression and purification of Tick-borne encephalitis virus Capsid protein
SCHMELZER, Jakob
2022 - anglický
Tick-borne encephalitis virus (TBEV) is an important pathogen of the family Flaviviridae with an emerging health concern. Virus causes severe neurological disorders to human population in Europa and Asia. Despite effective vaccine, there is no specific antiviral treatment till now. The capsid protein encapsules the viral positive-sense single-stranded RNA and is essential in packaging and assembling of new virions within the host. A deeper understanding of these interactions and their implications should lead to new antiviral strategies and drug design. This thesis deals with the expression and purification of the capsid protein without membrane anchor using Escherichia coli expression system. Tick-borne encephalitis virus (TBEV) is an important pathogen of the family Flaviviridae with an emerging health concern. Virus causes severe neurological disorders to human population in Europa and Asia. Despite effective vaccine, there is no specific antiviral treatment till now. The capsid protein encapsules the viral positive-sense single-stranded RNA and is essential in packaging and assembling of new virions within the host. A deeper understanding of these interactions and their implications should lead to new antiviral strategies and drug design. This thesis deals with the expression and purification of the capsid protein without membrane anchor using Escherichia coli expression system. Klíčová slova: Flavivirus; Tick-borne encephalitis virus; Capsid protein; Cloning; Expression; IPTG; BL21-CodonPlus (DE3)-RIPL; Immobilized Metal Affinity Chromatography Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Expression and purification of Tick-borne encephalitis virus Capsid protein

Tick-borne encephalitis virus (TBEV) is an important pathogen of the family Flaviviridae with an emerging health concern. Virus causes severe neurological disorders to human population in Europa and ...

SCHMELZER, Jakob
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Prevalence střevního prvoka Dientamoeba fragilis ve zdravé populaci lidí a zvířat v České republice
KAŠPAROVÁ, Andrea
2023 - anglický
Dientamoeba fragilis je kosmopolitně rozšířený střevní prvok, přičemž prevalence závisí na studované kohortě lidí a použitých diagnostických metodách. Jeho role v lidském zdraví zůstává nejasná především kvůli velmi malému počtu studií zaměřených na populaci, která netrpí zažívacími obtížemi. Hlavním cílem této studie bylo rozšířit znalosti o epidemiologii prvoka D. fragilis u zdravých lidí a jejich zvířat v České republice. Dientamoeba fragilis is a cosmopolitan intestinal protist colonizing the human gut with varying prevalence depending on the cohort studied and the diagnostic methods used. Its role in human health remains unclear mainly due to the very sporadic number of cross-sectional studies in gut-healthy populations. The main objective of this study was to expand knowledge of the epidemiology of D. fragilis in gut-healthy humans and their animals in the Czech republic. Klíčová slova: dientamoeba fragilis; prvok; prevalence; zdraví dobrovolníci; genotyp; domácí zvířata; molekulární metody Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Prevalence střevního prvoka Dientamoeba fragilis ve zdravé populaci lidí a zvířat v České republice

Dientamoeba fragilis je kosmopolitně rozšířený střevní prvok, přičemž prevalence závisí na studované kohortě lidí a použitých diagnostických metodách. Jeho role v lidském zdraví zůstává nejasná ...

KAŠPAROVÁ, Andrea
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2023

Účinnost mykoparazitických a entomopatogenních hub proti houbovým původcům onemocnění rostlin
SINKALA, Natasha
2023 - anglický
Entomopatogenní a mykoparazitické houby mají potenciál být využívány na místní i mezinárodní úrovni jako účinná a ekologicky šetrná strategie boje proti škůdcům a chorobám rostlin způsobeným houbovými patogeny. V bakalářské práci byla tes-tována účinnost užitečných hub v laboratorních podmínkách. Metodika zahrnovala izolaci a popis užitečných druhů hub a následné testování užitečných hub s poten-cionálními mykoparazitickými a antagonistickými účinky. Účinnost hub byla tes-tována na patogenech, které byly převážně odizolovány z osiva nebo nemocných ros-tlin luskovin. V rámci pokusů bylo zjištěno, že všechny kmeny Trichoderma izolo-vané z půd ČR prokázaly mykoparazitický efekt na vybrané patogeny. Nicméně, účinnost kmenů závisela na druhu houbového patogenu. Hodnocena byla i produkce spor kmenů Trichoderma jak v kontrolní variantě, tak i ve vzájemné kombinaci s patogeny. Výsledky opět prokázaly rozdíly v produkci spor u jednotlivých kmenů Trichoderma. Zároveň byl hodnocen mykoparazitický účinek entomopatogenních hub Isaria fumosorosea a Akanthomyces attenuatus proti patogenu Botrytis cinerea. Výsledky ukázaly, že ačkoli I. fumosorosea a A. attenuatus vykazovaly významný mykoparazitický účinek proti Botrytis cinerea, nejvyšší účinnost proti patogenu prokázala mykoparazitická houba T.virens. Zjištění naznačila, že jak mykoparazitické, tak entomopatogenní houby jsou udržitelnou alternativou umělých pesticidů v boji proti houbovým původcům chorob rostlin. Entomopathogenic and mycoparasitic fungi have the potential to be used both locally and internationally as an effective and environmentally friendly strategy for the man-agement of pests and plant diseases caused by fungal pathogens. In this bachelor thesis, the efficacy of beneficial fungi was tested under laboratory conditions. The methodology involved isolation and description of useful fungal species and subse-quent testing of useful fungi with potential mycoparasitic and antagonistic effects. The efficacy of the fungi was tested on pathogens that were mainly isolated from seeds or diseased legume plants. The experiments revealed that all Trichoderma strains isolated from soil of the Czech Republic showed mycoparasitic effect on se-lected pathogens. However, the efficacy of the strains depended on the type of fun-gal pathogen. Spore production of Trichoderma strains was also evaluated both in the control variant as well as the mutual interactions with pathogens. The results again showed differences in spore production among the Trichoderma strains. The myco-parasitic effect of the entomopathogenic fungi Isaria fumosorosea and Akanthomyces attenuatus against the pathogen Botrytis cinerea was also evaluated. The results re-vealed that although I. fumosorosea and A. attenuatus showed a significant mycopar-asitic effect against Botrytis cinerea, the mycoparasitic fungus T. virens showed the highest efficacy against the pathogen. The findings indicated that both mycoparasitic and entomopathogenic fungi are sustainable alternatives to artificial pesticides in the fight against fungal agents of plant diseases. Klíčová slova: biologicka ochrana; mykoparazitické houby; entomopatogenní houby; Trichoderma spp.; Akanthomyces attenuatus; Isaria fumosorosea; patogeny rostlin Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Účinnost mykoparazitických a entomopatogenních hub proti houbovým původcům onemocnění rostlin

Entomopatogenní a mykoparazitické houby mají potenciál být využívány na místní i mezinárodní úrovni jako účinná a ekologicky šetrná strategie boje proti škůdcům a chorobám rostlin způsobeným houbovými ...

SINKALA, Natasha
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2023

Influence of wheat/legumes mixtures on production parameters and grain quality
ALTINSOY, Yalcin
2023 - anglický
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Influence of wheat/legumes mixtures on production parameters and grain quality

ALTINSOY, Yalcin
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2023

Účinky rostlinných produktů na růst, stravitelnost, složení těla, imunitní a stresovou reakci u ryb
ZARE, Mahyar
2023 - anglický
Očekává se, že v nadcházejících desetiletích bude akvakultura hrát zásadní roli při produkci potravin pro rostoucí lidskou populaci. Nicméně propuknutí nemocí může bránit dalšímu rozvoji tohoto odvětví. Jedním ze slibných řešení pro řešení tohoto problému je použití přírodních krmných aditiv, jako jsou rostlinné moučky a extrakty, které obsahují bioaktivní sloučeniny, včetně fenolických sloučenin, proteinů, vitamínů a minerálů. Bylo prokázáno, že tyto sloučeniny mají na ryby antistresové, antivirové, antibakteriální a antifungální účinky. Zatímco kopřiva byla rozsáhle studována v medicíně savců, její účinky na druhy využívané v akvakultuře nebyly dostatečně zdokumentovány. Nedávné studie však prokázaly pozitivní vliv kopřivy na růstovou výkonnost, hematologii, biochemii krve a imunitní systém ryb. Prášek z listů kopřivy v dávce 30 g/kg krmiva vedl k významnému zvýšení konečné hmotnosti ryb, hmotnostního přírůstku, procentuálního hmotnostního a specifické rychlosti růstu pstruha duhového. Přídavek moučky z listů kopřivy navíc zvýšil celkový obsah bílkovin a popelovin v těle ryb a zároveň snížil obsah tuku. Přídavek moučky z listů estragonu, v dávce 30 g/kg krmiva, významně zvýšil Hct% a počet leukocytů. Kombinace 10 g/kg moučky z listů kopřivy a 10 g/kg moučky z listů estragonu se projevila nejvyššími hladinámi erytrocytů a hemoglobinu. Moučka z listů kopřivy v dávce 30 g/kg krmiva, moučka z listů estragonu v množství 30 g/kg krmiva a kombinace moučky z listů kopřivy v dávce 10 g/kg a 10 g/kg moučky z listů estragonu v krmivu významně zvýšily hladiny albuminu v krevním séru. Moučka z listů estragonu v dávce 10 g/kg krmiva vykazovala nejvyšší aktivitu enzymu lysozymu v krevním séru ve srovnání s kontrolou. Hladiny celkového imunoglobulinu v krevním séru a celkového proteinu byly významně spojeny s použitím moučky z listů kopřivy v dávce 30 g/kg krmiva. Studie potvrzuje pozitivní účinky těchto aditiv na růstovou výkonnost, složení celého těla, imunologické, hematologické a vybrané biochemické faktory krevního séra. Různé úrovně česnekového prášku významně neovlivnily rychlost růstu a somatické indexy u okouna říčního. Přidání 30 g/kg česnekového prášku v krmivu však vedlo k výrazně vyšší hladině bílkovin v těle ryb. Použití jak dávky 10 g/kg krmiva, tak 30 g/kg krmného česnekového prášku se projevilo ve významně vyšší stravitelnosti tuku v porovnání s kontrolní skupinou a 20 g/kg krmivového česnekového prášku. Dieta obsahující 20 g/kg česnekového prášku vedla k významně vyššímu počtu erytrocytů a leukocytů. Kromě toho měly všechny skupiny s přídavkem česnekuvýznamně nižší hladiny cholesterolu v krevním séru ve srovnání s kontrolou. Česnekový prášek v dávce 30 g/kg zlepšil odolnost okouna říčního proti stresu z vysoké hustoty a manipulace, jakož to i jeho hematologické a imunologické parametry. Bezprostředně po stresu byla hladina kortizolu ve všech skupinách krmených česnekem významně vyšší než v kontrolní skupině a mezi skupinami nebyl žádný významný rozdíl v hladinách glukózy. Po 24 hodinách však byly hladiny kortizolu i glukózy významně nižší ve všech skupinách krmených česnekem ve srovnání s kontrolní skupinou. Tyto výsledky naznačují, že krmení okouna říčního dietou s česnekovým práškem může mít pozitivní vliv na zvládání stresové reakce. Česnekový prášek v množství 10 g/kg krmiva zlepšil stravitelnost tuků, obsah proteinu v těle ryb, hematologické parametry, imunologické parametry a odolnost při vysoké hustotě a manipulaci. Celkově lze česnekový prášek považovat za potenciální doplněk stravy pro zvládání stresu u okouna evropského, je však zapotřebí dalšího výzkumu, aby se určilo optimální dávkování a dlouhodobé účinky. Výsledky disertační práce naznačují, že používání přírodních krmných fytoaditiv by mohlo být potenciálním řešením pro řešení zdravotních problémů v akvakultuře, což povede k udržitelnější a efektivnější produkci potravin. The plant powders and extracts contain bioactive compounds, including phenolic compounds, proteins, vitamins, and minerals. These compounds have been shown to possess antistress, antiviral, antibacterial, and antifungal effects on fish. Nettle has been extensively studied in mammalian medicine, but its effects on aquaculture species have not been well documented. Recent studies have demonstrated the positive impact of nettle on the growth performance, hematology, blood biochemistry, immune system, and pathogens resistance of fish species. Nettle leaf powder at a rate of 30 g/kg feed, improved the final body weight (FBW), weight gain (WG), weight gain percent% (WG%), specific growth rate (SGR%), and increased whole-body proximate protein and ash content while reducing whole-body proximate fat rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) fingerlings. Tarragon leaf powder at a rate of 30 g/kg feed, significantly increased the haematocrit% (Hct%) and leukocyte count. The combination of 10 g/kg feed nettle leaf powder and 10 g/kg feed tarragon leaf powder resulted in the highest levels of erythrocyte count and haemoglobin (Hb). Nettle leaf powder at 30 g/kg feed, tarragon leaf powder at 30 g/kg feed, and a combination of 10 g/kg feed nettle leaf powder and 10 g/kg feed tarragon leaf powder significantly increased albumin levels in blood serum. Tarragon leaf powder at 10 g/kg feed showed the highest blood serum lysozyme enzyme activity compared to the control. Blood serum total immunoglobulin and total protein levels were significantly associated with nettle leaf powder at 30 g/kg feed. The study confirms the positive effects of these additives on growth performance, whole body proximate composition, immunological, haematological, and selected blood serum biochemical factors. Different levels of garlic powder did not significantly affect growth performance and somatic indices in European perch (Perca fluviatilis). However, adding 30 g/kg feed garlic powder resulted in a significantly higher level of whole-body proximate protein. Both 10 g/kg feed and 30 g/kg feed garlic powder showed significantly higher fat digestibility than the control and 20 g/kg feed garlic powder groups. The 20 g/kg feed garlic powder diet resulted in significantly higher erythrocyte and leukocyte count. Furthermore, all garlic groups had significantly lower blood serum cholesterol levels compared to the control. Garlic powder at level 30 g/kg feed improved European perch's resistance against high density and net handling stress, as well as their haematological and immunological parameters. Immediately after stress, the level of cortisol in all garlic-fed groups was significantly higher than in the control group, and there was no significant difference in glucose levels among the groups. However, after 24 hours, the levels of both cortisol and glucose were lower in all garlic-fed groups compared to the control group significantly. Garlic powder at a level of 10 g/kg feed improved apparent fat digestibility, whole body proximate protein, hematological parameters, immunological parameters, and increased resistance in high density and net handling stress. Overall, garlic powder could be considered as a potential dietary supplement for managing stress in European perch, however, further research is needed to determine the optimal dosage and long-term effects. Results of present thesis suggest that the use of natural feed phyto-additives could be a potential solution to address health issues in aquaculture, leading to more sustainable and efficient food production. Klíčová slova: Bioaktivní látky; konverzekrmiva; listové moučky; kortizol; hematologie; imunologie; myeloidní buňky; stres Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Účinky rostlinných produktů na růst, stravitelnost, složení těla, imunitní a stresovou reakci u ryb

Očekává se, že v nadcházejících desetiletích bude akvakultura hrát zásadní roli při produkci potravin pro rostoucí lidskou populaci. Nicméně propuknutí nemocí může bránit dalšímu rozvoji tohoto ...

ZARE, Mahyar
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2023

Integrovaná ochrana proti škůdcům a chorobám v akvaponii
FOLORUNSO, Ewumi Azeez Olatunji
2023 - anglický
Tato práce přináší zásadní znalosti pro vývoj ověřených přístupů řešení problematiky škůdců a chorob v akvaponii. Naše hodnocení rizik spojených s využitím integrované ochrany proti škůdcům a chorobám (IPM) v akvaponii pomohlo nejen při kustomizaci pyramidového schématu IPM pro akvaponii, ale také zavedlo zásadní postupy IPM v chovných částech akvaponického systému napomáhající akvaponickým farmářům, kteří často nejsou odborníky v chovu ryb. Kromě toho náš literární přehled identifikoval zamoření rostlinnými patogeny jako prioritní výzvu ve srovnání s infestací bezobratlými škůdci a chorobami v chovných jednotkách ryb, a tudíž naléhavou potřebu zavést bezpečné přístupy managementu fytopatogenů. Na tyto závěry navazoval výzkum bezpečných agens biologické kontroly, kde byla zkoumána účinnost entomopatogenních a mykoparazitických hub proti padlí okurkovému a byla prokázána jejich nízká šance na přežití ve vodě v recirkulačních akvakulturních systémech (RAS), což potvrdilo jejich vhodnost pro různé designy akvaponie (jednosmyčkové i dvousmyčkové). S nastalými otázkami o spolehlivosti biologické kontroly v akvaponii, jsme zkoumali potenciální možnosti chemické kontroly, které by mohly být využity v akvaponických systémech, přičemž jsme zkoumali jejich možné negativní dopady na akvaponický systém. Zkoumané přírodní (azadirachtin, lecitin a hřebíčkový olej), mikrobiální (spinosad) a syntetické (tebukonazol) pesticidy aplikované foliárně byly ve významných koncentracích detekovány v živném roztoku, a to v různých časových bodech po aplikaci. Jejich procentuální vyplavení v živném roztoku vztažené k aplikované dávce v postřiku se výrazně lišilo mezi fungicidy (0,1 - 2,3 %) v důsledku rozdílů v podílu účinných látek, doporučených dávkách a vlastnostech aktivní látky. Procentuální vyplavení azadirachtinu, eugenolu, spinosadu a tebukonazolu v živinovém roztoku se pohybovalo mezi 0,1 - 0,8 % aplikovaných účinných látek. Naproti tomu, lecitinu bylo v akvaponické vodě detekováno 2,3 % aplikované dávky. Protože eugenol a spinosad byly detekovány v koncentracích nižších než jejich odpovídající hodnoty NOEC a LC50, jsou tyto látky považovány za bezpečné pro všechny akvaponické systémy. Pyrethrum v živném roztoku zjištěno nebylo, což mohlo být způsobeno jeho nízkou perzistencí a rychlou degradací ve vodě. Jeho účinná látka (pyrethrin) je však vysoce toxická pro ryby a další vodní organismy a její použití by mělo být omezeno pouze na dvousmyčkové akvaponické systémy. Pokud jde o účinky těchto látek na ryby a biofiltr, měl tebukonazol významně přetrvávající účinky na hematologické ukazatele u ryb, ale také biochemické a antioxidační aktivity po 28denním semistatickém testu, což ukazuje na jeho nevhodnost pro všechny typy akvaponie. Tebukonazol však neměl významné účinky na nitrifikační procesy v biofiltru ani při maximální koncentraci naměřené v živném roztoku. Naproti tomu lecitin při maximální koncentraci zvýšil hladiny amoniaku a dusitanů v biofiltru, tzn. že tato látka není vhodná pro jednosmyčkové akvaponické systémy. Změny v nitrifikaci, hematologii ryb a biochemických parametrech po aplikaci azadirachtinu a eugenolu byly pouze nevýznamné, což ukazuje na jejich nízká rizika pro všechny typy akvaponie (při aplikaci podle pokynů výrobce). Nakonec jsme zkoumali vliv biologické ochrany a fungicidů na běžící akvaponické systémy. Mikrobiální přípravky s T. virens, I. fumosorosea a L. attenuatum potlačovaly rozvoj padlí v průběhu čtyřtýdenní kultivace. Navíc aplikace T. virens zlepšila růst rostlin. Naproti tomu fungicidy (hřebíčkový olej, lecitin a tebukonazol) neovlivnily růst bazalky, ale byly detekovány v akvaponické vodě. This thesis has laid an essential foundation for developing aquaponics-safe approaches to address pest and disease outbreaks in aquaponics. Our review on adopting integrated pest and disease management in aquaponics not only customized pyramid-flow IPDMs for aquaponics but also inclusively initiated essential fish management pathways for aquaponics farmers who are primarily not fish farm experts. Furthermore, our review identified pathogen infestation challenges as priorities over macro-pests and diseases in fish culture units and the urgent need to establish safe phytopathogen management options. These conclusions were followed up by investigating safe biological control agents, where the efficacy of entomopathogenic and mycoparasitic fungi was investigated against powdery mildew, and their low-survival chance in RAS water was determined to affirm their suitability for different aquaponics designs (coupled and decoupled). With raving questions on the reliability of biological control, we explored potentially safe chemical control options that could be adopted for aquaponics systems, and investigated their possible negative impacts on aquaponics. The natural (azadirachtin, lecithin, and clove oi), microbial (spinosad) and synthetic (tebuconazole) pesticides investigated, runoff into nutrient solutions after foliar application, and were detected in significant concentrations at different time points post applications. Their percentage runoff in regard to spray solution varies significantly (0.1-2.3 %), owing to differences in the proportion of the active ingredients, recommended dosages and the properties of the compound. The percentage runoff of azadirachtin, eugenol, spinosad and tebuconazole ranged between 0.1 and 0.8 % of the sprayed active ingredients. On the other hand, 2.3 % of the sprayed lecithin were detected in the aquaponics water. Since eugenol and spinosad were detected at concentrations lower than their corresponding NOEC and LC50, they are considered safe for all aquaponics systems. Pyrethrum, on the other hand, was not detected in the nutrient solution, which could be due to its non-persistence and fast degradation in water. However, its active ingredient (pyrethrin) is highly toxic to fish and other aquatic organisms, and its usage should only be limited to decoupled aquaponics systems. Regarding their effects on fish and biofilter, tebuconazole had a significantly persistent effects on fish hematology, biochemical and antioxidative activities over a 28 day semi-static period, indicating its unsuitability for coupled aquaponics designs. However, tebuconazole did not have significant effects on nitrification processes in the biofilter at the maximum runoff concentration. Lecithin, on the other hand, altered and spiked ammonium and nitrite levels in biofilter at its maximum runoff concentration, making the compound unsuitable for coupled aquaponics. In contrast, only mild non-significant effects of azadirachtin and eugenol were seen in biofilter nitrification, fish hematology, and biochemical parameters, indicating their low risks for all aquaponics systems (when applied according to the manufacturer's instruction). Lastly, we explored the influence of biological control and fungicides on running aquaponics systems. T. virens, I. fumosorosea and L. attenuatum, controlled and suppressed powdery mildew over a period of four weeks. In addition, T. virens was able to improve the growth of the plant. The fungicides (clove oil, lecithin, and tebuconazole), on the other hand, did not show any influence on the basil growth. Klíčová slova: akvaponii; biologické kontroly; pesticidy; fungicidy; entomopatogenních hub; ryby Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Integrovaná ochrana proti škůdcům a chorobám v akvaponii

Tato práce přináší zásadní znalosti pro vývoj ověřených přístupů řešení problematiky škůdců a chorob v akvaponii. Naše hodnocení rizik spojených s využitím integrované ochrany proti škůdcům a chorobám ...

FOLORUNSO, Ewumi Azeez Olatunji
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2023

O službě

NUŠL poskytuje centrální přístup k informacím o šedé literatuře vznikající v ČR v oblastech vědy, výzkumu a vzdělávání. Více informací o šedé literatuře a NUŠL najdete na webu služby.

Vaše náměty a připomínky posílejte na email nusl@techlib.cz

Provozovatel

http://www.techlib.cz

Facebook

Zahraniční báze