Využití iontových kapalin pro přípravu epoxidů
Rebei, Marwa; Beneš, Hynek; Machotová, Jana; Polášková, Martina
2024 - English Epoxy resins represent an important category of thermosets widely as coatings, electronic encapsulants, matrices for composites, etc., due to their beneficial properties, such as strong adhesion, high chemical and electrical resistance, and good processability. However, their curing reactions present some limitations, such as using catalysts (for example, organometallics, complexes and MOFs) which are active at high reaction temperatures. In most cases, these catalysts are toxic and require organic solvents. Consequently, alternative non-toxic catalysts/initiators that can promote well-controlled fast curing under mild conditions have been explored while maintaining sufficient thermomechanical properties of the formed epoxy networks. In this thesis, three different epoxy ring opening reactions induced by various imidazolium ionic liquids (ILs) were studied. The first subsection (4.1) discusses the step-growth epoxy-dicarboxylic acid polymerization in an imidazolium IL medium conducted under mild conditions (T = 80-120 řC). The IL was shown to act as both a solvent and an initiator/catalyst for the reaction. In addition, IL-anions (chloride, bis(trifluoromethylsulfonyl) imide, or methanesulfonate) strongly affect the progress of the reaction. It was found that the Cl- anion is the most effective... Epoxidové pryskyřice představují důležitou skupinu reaktoplastů, široce používaných jako nátěrové hmoty, licí pryskyřice v elektronice, matrice strukturních kompozitů atd., a to díky svým výhodným vlastnostem, jako je silná adheze, vysoká chemická a elektrická odolnost a dobrá zpracovatelnost. Nevýhodou jsou jejich nároky na vytvrzování, související s dlouhými vytvrzovacími cykly a potřebou specifických katalyzátorů (například organokovové sloučeniny a komplexy či využití tzv. metal-organic framework, MOF, struktur), které jsou dostatečně aktivní až při vysokých reakčních teplotách. Ve většině případů jsou tyto katalyzátory toxické či vyžadují použití organických rozpouštědel. V důsledku toho jsou zkoumány alternativní netoxické katalyzátory/iniciátory, které podporují dobře kontrolovatelné a rychlé vytvrzování za mírných podmínek, a přitom vedou k vytvoření kovalentních sítí s vynikajícími termomechanické vlastnosti. V této práci byly studovány tři různé reakce otevření epoxidového kruhu vyvolané různými typy imidazoliových iontových kapalin. První kapitola (4.1) pojednává o stupňovité polymeraci mezi epoxidovou pryskyřicí a dikarboxylovou kyselinou v přítomnosti imidazoliových iontových kapalin, která se prováděla za mírných podmínek (T = 80-120 řC). Bylo prokázáno, že iontová kapalina působí... Keywords: Ionic liquid; metal ionic liquids; Epoxy resin; Copolymerization; Anhydride; Cross-linking; Kinetics; mechanism; carbon dioxide Available in a digital repository NRGL Využití iontových kapalin pro přípravu epoxidů

Epoxy resins represent an important category of thermosets widely as coatings, electronic encapsulants, matrices for composites, etc., due to their beneficial properties, such as strong adhesion, high ...

Rebei, Marwa; Beneš, Hynek; Machotová, Jana; Polášková, Martina
Univerzita Karlova, 2024

Kombinovaný výpočet přesnosti v numerické lineární algebře
Oktay, Eda; Carson, Erin Claire; Buttari, Alfredo; Šístek, Jakub
2024 - English Keywords: mixed-precision|sparse solvers|stability|finite precision|multiprecision|numerical linear algebra; mixed-precision|sparse solvers|stability|finite precision|multiprecision|numerical linear algebra Available in a digital repository NRGL Kombinovaný výpočet přesnosti v numerické lineární algebře

Oktay, Eda; Carson, Erin Claire; Buttari, Alfredo; Šístek, Jakub
Univerzita Karlova, 2024

Charakterizace biofilmu Pseudomonas syringae a jeho interakcí s antibakteriálními látkami - biofyzikální přístupy
Budil, Jakub; Lišková, Petra; Mackuľak, Tomáš; Viktorová, Jitka
2024 - English 4 Abstract The objectives of this thesis are the application of Attenuated Total Reflectance Fourier Transform Infrared (ATR FT-IR) spectroscopy for the analysis of Pseudomonas syringae biofilms grown in a flow cell and its subsequent interaction with antibacterial agents. Based on the combination of the recorded ATR spectra with the biofilm morphology analysis via light and fluorescent microscopy, I suggested a model for the development of Pseudomonas syringae pathovar morsprunorum CCM 2534 biofilm in a flow cell with 2% Luria-Bertani (LB) complex medium. This model consists of the initial colonization of the ZnSe prism (adhesion), subsequent washing of weakly attached cells due to the replacement of the inoculation suspension with the fresh 2% LB medium, which is followed by a brief substrate recolonization phase. Subsequently, the biofilm undergoes a restructuration with a motile subpopulation of Pseudomonas syringae migrating on top of already existing early microcolonies, where the availability of nutrients including oxygen is higher. The last developmental stage, a maturation of Pseudomonas syringae biofilms, is occurring predominantly outside the ATR FT-IR detection range and leads to a formation of large mushroom-shaped microcolonies. I also investigated the changes to the development of Pseudomonas... 3 Abstrakt Cílem této práce je využití techniky zeslabeného úplného odrazu (Attenuated Total Reflectance, ATR) u infračervené spektroskopie s Fourierovou transformací (FT-IR) k analýze tvorby in vitro biofilmu Pseudomonas syringae v průtokové komoře a jeho následné interakce s antibakteriálními látkami. Na základě naměřených ATR spekter v kombinaci s analýzou struktury biofilmu prostřednictvím světelné a fluorescenční mikroskopie jsem navrhl model vývoje biofilmu Pseudomonas syringae patovar morsprunorum CCM 2534 v průtokové komoře s 2% Luria-Bertani (LB) komplexním médiem. V tomto modelu je rozlišena počáteční kolonizace ZnSe hranolu (adheze) a následný oplach volně uchycených bakterií v důsledku výměny inokulační suspenze za čerstvé 2% LB médium, na který navazuje krátká perioda znovuosídlení uvolněného prostoru na substrátu. Následuje restrukturace biofilmu, kdy pohyblivá část populace Pseudomonas syringae migruje na vršek raných mikrokolonií, kde je vyšší dostupnost živin včetně kyslíku. Poslední fází je maturace biofilmu Pseudomonas syringae, která již probíhá převážně mimo dosah ATR FT-IR techniky a vede ke tvorbě mohutných mikrokolonií ve tvaru houbiček. V této práci jsem také zkoumal změny ve vývoji biofilmu Pseudomonas syringae za modelových podmínek (inokulace usmrcenými bakteriemi, inokulace... Keywords: Biofilm; Pseudomonas syringae; FT-IR spektroskopie; antibakteriální látky; Biofilm; Pseudomonas syringae; FT-IR spectroscopy; antibacterial agents Available in a digital repository NRGL Charakterizace biofilmu Pseudomonas syringae a jeho interakcí s antibakteriálními látkami - biofyzikální přístupy

4 Abstract The objectives of this thesis are the application of Attenuated Total Reflectance Fourier Transform Infrared (ATR FT-IR) spectroscopy for the analysis of Pseudomonas syringae biofilms grown ...

Budil, Jakub; Lišková, Petra; Mackuľak, Tomáš; Viktorová, Jitka
Univerzita Karlova, 2024

Epitranskriptomika a kardioprotektivní intervence
Benák, Daniel; Hlaváčková, Markéta; Štengl, Milan; Bohuslavová, Romana
2024 - English 1 Ischemic heart disease stands as the foremost global cause of mortality. Myocardial ischemia results in damage to cardiomyocytes which can further lead to impaired heart function. However, the extent of ischemic injury hinges not only on the intensity and duration of the ischemic stimulus but also on cardiac tolerance to ischemia. Therefore, it is extremely important to unravel the molecular basis of cardioprotective interventions such as adaptation to chronic hypoxia or fasting. We focused on the novel epitranscriptomic mechanisms around RNA modifications - N6 -methyladenosine (m6 A) and N6 ,2'-O-dimethyladenosine (m6 Am). Our findings revealed that while most epitranscriptomic modifiers displayed differential regulation in the heart following hypoxic adaptation and fasting, demethylases (ALKBH5 and FTO) were consistently upregulated after these cardioprotective interventions. Furthermore, we detected a discernible reduction in cardiac total RNA methylation levels after fasting. On the contrary, transcripts Nox4 and Hdac1, both of which play a role in the cytoprotective action of ketone bodies, exhibited increased methylation in hearts of fasting rats. Finally, inhibition of epitranscriptomic demethylases ALKBH5 and FTO decreased the hypoxic tolerance of adult rat primary cardiomyocytes isolated from... 1 Ischemická choroba srdeční je celosvětově nejčastější příčinou úmrtí. Ischemie myokardu vede k poškození kardiomyocytů, což může vést k poruše srdeční funkce. Rozsah ischemického poškození však závisí nejen na intenzitě a délce trvání ischemického podnětu, ale také na toleranci srdce vůči ischemii. Objasnění molekulárního pozadí kardioprotektivních intervencí, jako je adaptace na chronickou hypoxii nebo hladovění, tak nabývá zásadního významu. Proto jsme se zaměřili na nové epitranskriptomické regulace dvou rozšířených modifikací RNA - N6 -methyladenosinu (m6 A) a N6 ,2'- O-dimethyladenosinu (m6 Am). Zjistili jsme, že většina epitranskriptomických regulátorů v srdci reaguje na hypoxickou adaptaci a na hladovění odlišným způsobem, demetylázy (ALKBH5 a FTO) byly ale v obou případech zvýšeny. Po hladovění bylo navíc v srdci patrné znatelné snížení hladin celkové metylace RNA. Hladina metylace v transkriptech Nox4 a Hdac1, které se účastní cytoprotektivních drah spouštěných ketolátkami, ale byla naopak zvýšena. V neposlední řadě, inhibice epitranskriptomických demetyláz ALKBH5 a FTO vedla ke snížení hypoxické tolerance kardiomyocytů izolovaných z hladovějících potkanů. Celkově naše zjištění ukazují na regulaci epitranskriptomických modifikací m6 A a m6 Am při kardioprotektivních intervencích, jako je adaptace... Keywords: epitranskriptomika; m6A; m6Am; FTO; ALKBH5; kardioprotektivní intervence; srdce; epitranscriptomics; m6A; m6Am; FTO; ALKBH5; cardioprotective interventions; heart Available in a digital repository NRGL Epitranskriptomika a kardioprotektivní intervence

1 Ischemic heart disease stands as the foremost global cause of mortality. Myocardial ischemia results in damage to cardiomyocytes which can further lead to impaired heart function. However, the ...

Benák, Daniel; Hlaváčková, Markéta; Štengl, Milan; Bohuslavová, Romana
Univerzita Karlova, 2024

Úloha interakce cirkadiánního a imunitního systému při rozvoji obesity a diabetu 2. typu
Honzlová, Petra; Sumová, Alena; Okuliarová, Monika; Vodička, Martin
2024 - English Disruptions within the circadian, metabolic, and immune systems contribute to the onset of metabolic illnesses, including type 2 diabetes. This doctoral thesis aimed to examine the mutual interactions between these three systems in relation to the development of metabolic disorders. The circadian system regulates a variety of mammalian physiological processes. On the molecular level, the circadian clock is in individual cells maintained by a complex of interconnected transcription-translation feedback loops. The circadian system is hierarchically organized, consisting of the central circadian clock residing within the suprachiasmatic nuclei (SCN) and of peripheral oscillators found in various organs and tissues, including the pancreas and compartments of the innate immune system such as macrophages and microglia. The central circadian clock synchronizes the peripheral oscillators via multiple pathways, including feeding- related metabolic changes to which some of the peripheral oscillators are highly sensitive. Misaligned feeding can thus induce dyssynchrony between individual peripheral oscillators. Our results show that a reverse restricted feeding (rRF) regimen, when food is available only for a limited time during the resting period of the day, has distinct effects on the circadian clocks in... Poruchy v rámci cirkadiánního, metabolického a imunitního systému přispívají ke vzniku metabolických onemocnění, včetně diabetu 2. typu. Cílem této disertační práce bylo prozkoumat vzájemné interakce mezi těmito třemi systémy ve vztahu k rozvoji metabolických poruch. Mnohé fyziologické procesy jsou u savců regulovány cirkadiánním systémem. Na molekulární úrovni jsou cirkadiánní hodiny v jednotlivých buňkách udržovány komplexem vzájemně propojených transkripčně-translačních zpětnovazebných smyček. Cirkadiánní systém je hierarchicky uspořádán a skládá se z centrálních cirkadiánních hodin sídlících v suprachiasmatických jádrech (SCN) a z periferních oscilátorů, které se nacházejí v různých orgánech a tkáních, včetně pankreatu a složek vrozeného imunitního systému, jako jsou makrofágy a mikroglie. Centrální cirkadiánní hodiny synchronizují periferní oscilátory pomocí mnohočetných drah, včetně těch souvisejících se změnou metabolismu vlivem příjmu potravy, ke kterým jsou některé periferní oscilátory vysoce citlivé. Rozpor mezi synchronizujícími signály pocházejícími z SCN a z příjmu potravy tak může vyvolat desynchronizaci mezi jednotlivými periferními oscilátory. Naše výsledky prokázaly, že režim obráceného a omezeného příjmu potravy (rRF z angl. reverse restricted feeding), kdy bylo jídlo dostupné... Keywords: cirkadiánní hodiny; pankreas; mikroglie; makrofágy; reverzní omezený příjem potravy; suprachiasmatická jádra; circadian clock; pancreas; microglia; macrophage; reverse restricted feeding; polarization; suprachiasmatic nuclei Available in a digital repository NRGL Úloha interakce cirkadiánního a imunitního systému při rozvoji obesity a diabetu 2. typu

Disruptions within the circadian, metabolic, and immune systems contribute to the onset of metabolic illnesses, including type 2 diabetes. This doctoral thesis aimed to examine the mutual interactions ...

Honzlová, Petra; Sumová, Alena; Okuliarová, Monika; Vodička, Martin
Univerzita Karlova, 2024

Modulace nociceptivní signalizace na míšní úrovni za normálních a patologických podmínek
Pontearso, Monica; Špicarová, Diana; Uchytilová, Eva; Krůšek, Jan
2024 - English Present pain therapies are often insufficient and poorly managed, mainly for neuropathic pain treatment. In the past years, research has provided a body of evidence on the association of nerve injury and inflammation with mobilized immune reactions. Many cytokines and hormones are released during injury or inflammation, and these factors regulate neuronal encoding of painful sensations. For example, in pre-clinical models, inflammatory cytokines cause or amplify nociception by enhancing neuron excitability. Besides increased excitability via direct neuronal sensitization, it has also been demonstrated that a reduction of synaptic inhibition (disinhibition) occurs naturally in the course of neuropathic and inflammatory pain states. The spinal cord dorsal horn (SCDH) is the first relay station of the ascending pain pathway and a crucial modulatory site of painful stimuli transmission. Three main aims characterize this doctoral thesis; each focused on the modulation of spinal nociceptive transmission by different molecules fundamental for pain processing. The first aim was to study the role of proinflammatory cytokine macrophage migration inhibitory factor (MIF) in nociceptive signalling following peripheral neuropathy induced by chronic constriction injury (CCI) of the sciatic nerve. The second aim... Léčba bolesti je i v současné době často nedostatečná, zvláště pokud je vyvolávací příčinou neuropatie. V posledních letech se množí vědecké důkazy o spojení poranění nervů s neuroinflamací a mobilizací imunitních buněk. Během poranění nebo zánětu se uvolňuje mnoho cytokinů a hormonů, které regulují nociceptivní signalizaci vedoucí k vjemu bolesti. V preklinických modelech, prozánětlivé cytokiny vyvolávají nebo zesilují nocicepci zvýšením dráždivosti neuronů. Kromě zvýšené excitability neuronů procesem senzitizace, bylo také prokázáno, že v průběhu neuropatických a zánětlivých bolestivých stavů dochází ke snížení synaptické inhibice (disinhibice). V zadním rohu míšním jsou uloženy první nociceptivní synapse vzestupných drah bolesti, je to tedy významné modulační místo, kde je informace o přítomnosti bolestivého podnětu regulována. Tuto disertační práci charakterizují tři hlavní cíle, každý je zaměřen na modulaci míšního synaptického přenosu, avšak různými molekulami, zásadními pro zpracování bolesti. Prvním cílem bylo studovat úlohu prozánětlivého cytokinu - inhibičního faktoru migrace makrofágů (MIF), v nociceptivní signalizaci po navození periferní neuropatie vyvolané chronickou konstrikcí sedacího nervu. Druhým cílem bylo studovat úlohu anandamidu (AEA) v modulaci excitačního synaptického... Keywords: bolest; nocicepce; zadní roh míšní; synaptický přenos; TRPV1; opioidní receptory; pain; nociception; spinal cord dorsal horn; synaptic transmission; TRPV1; opioid receptors Available in a digital repository NRGL Modulace nociceptivní signalizace na míšní úrovni za normálních a patologických podmínek

Present pain therapies are often insufficient and poorly managed, mainly for neuropathic pain treatment. In the past years, research has provided a body of evidence on the association of nerve injury ...

Pontearso, Monica; Špicarová, Diana; Uchytilová, Eva; Krůšek, Jan
Univerzita Karlova, 2024

Eseje o meta-analýze hlubokých parametrů
Elminejad Anjileh, Mohammad Ali; Havránek, Tomáš; Laroche, Patrice; Rachinger, Heiko; Stanley, Tom
2024 - English Available in a digital repository NRGL Eseje o meta-analýze hlubokých parametrů

Elminejad Anjileh, Mohammad Ali; Havránek, Tomáš; Laroche, Patrice; Rachinger, Heiko; Stanley, Tom
Univerzita Karlova, 2024

Eseje o reprodukovatelnosti výzkumu v ekonomii
Buliskeria, Nino; Baxa, Jaromír; Furukawa, Chishio; Reed, William Robert; Brodeur, Abel
2024 - English Tato disertační práce přispívá k pokračující debatě o důvěryhodnosti empiric- kého výzkumu v ekonomii, která začala kritikou selektivních postupů při výběru modelů Edwardem Leamerem na počátku 80. let. Tato práce se proto prostřednic- tvím série podrobných analýz zabývá klíčovými problémy meta-výzkumu, repliko- vatelností a rozšíření publikačních zkreslení a p-hackingu v akademickém výzkumu. První studie se vrací k vlivné analýze Burgesse a Pandeho o dopadu státem iniciovaného rozšiřování bankovních poboček do chudých oblastí Indie na míru chu- doby. Odhaluji, že údajný významný efekt nových poboček se výrazně sníží, pokud vezmeme v úvahu komplexnější analýzu politických změn v daném období. Toto zjištění podtrhuje nutnost zohlednění vlivů vnější politiky, aby byla zajištěna ro- bustnost empirických výsledků. Druhá část analyzuje indexy nejistoty hospodář- ské politiky (EPU) z Německa, Francie, Itálie, Španělska a Spojeného království a zjišťuje, že dlouhodobé trendy v těchto indexech pramení spíše z metodologických rozhodnutí při tvorbě indexu než ze skutečné ekonomické nejistotě. Použitím al- ternativních normalizačních technik tato studie ukazuje, jak takové metodologické nuance mohou vést k výrazně odlišným interpretacím ekonomických jevů, jako je Brexit nebo pandemie COVID-19. Poslední část... Available in a digital repository NRGL Eseje o reprodukovatelnosti výzkumu v ekonomii

Tato disertační práce přispívá k pokračující debatě o důvěryhodnosti empiric- kého výzkumu v ekonomii, která začala kritikou selektivních postupů při výběru modelů Edwardem Leamerem na počátku 80. ...

Buliskeria, Nino; Baxa, Jaromír; Furukawa, Chishio; Reed, William Robert; Brodeur, Abel
Univerzita Karlova, 2024

Interakce mezi antikodonovým ramenem tRNA a malými ribozomálními proteiny tvořícími dekódovací místo při pročtení stop kodonu
Čapková, Zuzana; Valášek, Leoš; Eliáš, Marek; Macíčková Cahová, Hana
2024 - English Transfer RNAs (tRNAs) represent an indispensable part of protein synthesis by delivering amino acids into ribosomal A site during elongation. The rules that govern the correct match between the tRNA anticodon and the A-site mRNA codon are set by the genetic code. Specifically, the code defines that 61 sense codons are recognized by tRNAs and 3 stop codons marking translation termination are recognized by the release factor. In certain circumstances, a near-cognate (or a cognate) tRNA can be incorporated at the stop codon and translation elongation proceeds further. This process, called stop codon readthrough, may be beneficial as a therapy for inherited genetic diseases caused by premature termination codons (PTCs), and importantly, it is crucial for organisms with stop codon reassignment(s). Here I show that apart from the anticodon itself, the peculiar anticodon stem of two different near-cognate tRNAs, namely yeast S. cerevisiae tRNAGln CUG and Blastocrithidia nonstop tRNATrp CCA, is critical for their readthrough promoting potential. In particular, yeast tRNAGln CUG relies on the specific pyrimidine 28 : purine 42 base pair forming the 4th pair of its anticodon stem, whereas tRNATrp CCA of B. nonstop acquired a mutation that shortened its anticodon stem from the canonical 5 to the 4 base pairs,... Transferové RNA (tRNA) představují nepostradatelnou součást tvorby proteinů, které během elongace přivádějí aminokyseliny na A-místo ribozomu. Pravidla, kterými se řídí správná shoda mezi antikodonem tRNA a kodonem mRNA v A-místě, jsou stanovena genetickým kódem. Konkrétně kód definuje, že 61 kodonů je rozpoznáváno tRNA a 3 stop kodony označující ukončení translace jsou rozpoznávány uvolňovacím faktorem. Za určitých okolností však může být stop kodon rozeznán tzv. near-cognate (nebo cognate) tRNA a translace pokračuje dále. Tento proces, nazývaný pročítání stop kodonu, může být přínosný pro terapii dědičných genetických onemocnění způsobených předčasnými terminačními kodony (PTC) a také je klíčový pro organismy s přeřazováním identity stop kodonu na kodon kódující aminokyselinu. V této práci ukazuji, že kromě samotného antikodonu, antikodonové rameno dvou různých near-cognate tRNA, jmenovitě kvasinkové tRNAGln CUG a tRNATrp CCA Blastocrithidie nonstop, je rozhodující pro jejich potenciál pročíst stop kodony. Konkrétně demonstruji, že kvasinková tRNAGln CUG spoléhá na specifický pár bází pyrimidin 28 : purin 42, představující čtvrtý pár v jeho antikodonovém rameni (přesněji řečeno, ve stopce), zatímco tRNATrp CCA B. nonstop získala mutaci, která způsobila zkrácení jeho antikodonové stopky z... Keywords: tRNA; terminace translace; readthrough; tRNA; termination of translation; readthrough Available in a digital repository NRGL Interakce mezi antikodonovým ramenem tRNA a malými ribozomálními proteiny tvořícími dekódovací místo při pročtení stop kodonu

Transfer RNAs (tRNAs) represent an indispensable part of protein synthesis by delivering amino acids into ribosomal A site during elongation. The rules that govern the correct match between the tRNA ...

Čapková, Zuzana; Valášek, Leoš; Eliáš, Marek; Macíčková Cahová, Hana
Univerzita Karlova, 2024

Úloha telomer / DNA reparací v solidních tumorech
Tomášová, Kristýna; Vodička, Pavel; Dušinská, Mária; Campa, Daniele
2024 - English Loss of telomere function and unrepaired DNA damage contribute to chromosome integrity disruption and genomic instability development, which can initiate malignant transformation of the cells. This dissertation focused on telomeres and their maintenance and regulation mechanisms in sporadic colorectal, breast, and ovarian tumors. In colorectal cancer (CRC), a place was also dedicated to research on base excision repair glycosylases. The findings of the Thesis are elaborated in detail in seven attached Manuscripts. The main results of each of the articles are as follows: I) Mitochondrial DNA copy number changes and telomere length (TL) shortening already occur in precancerous lesions of CRC, but in early carcinomas, the association between their mitochondrial DNA content and TL diminishes; II) TL of leukocytes in peripheral blood of patients with CRC can be affected by postoperative cytostatic treatment based on 5-fluorouracil; III) CRC liver metastases maintain the same TL as primary tumors. In addition, neoadjuvant treatment with (chemo)radiotherapy applied to patients with rectal cancer probably causes telomere shortening in the primary tumor and the surrounding rectal cells in addition to DNA damage; IV) TL of ovarian cancer cells can be influenced by epigenetic regulations and expressions of... Ztráta funkce telomer a neopravená poškození DNA přispívají k narušení integrity chromozomů a rozvoji genomové nestability, která může iniciovat maligní zvrat buněk. Tato disertační práce je zaměřena na studium telomer a mechanismů jejich údržby a regulace u sporadických nádorů tlustého střeva a konečníku, prsu a ovárií. U rakoviny tlustého střeva a konečníku (kolorektální karcinom; KRK) byl prostor věnován i výzkumu DNA glykosyláz zapojených do bázové excizní opravy. Výsledky této disertační práce jsou detailně rozvedeny v sedmi přiložených rukopisech. Stěžejní výsledky každého z článků jsou následující: I) Ke změnám počtu kopií mitochondriální DNA a zkracování telomerové délky (TL) dochází již u prekancerózních lézí KRK, avšak u časných karcinomů souvislost mezi obsahem jejich mitochondriální DNA a TL zaniká; II) TL leukocytů v periferní krvi u pacientů s KRK může být ovlivněna postoperační cytostatickou léčbou na bázi 5-fluorouracilu; III) Metastázy KRK v játrech si udržují stejnou TL jako primární nádory. Dále bylo zjištěno, že neoadjuvatní léčba (chemo)radioterapií nasazovaná pacientům s rakovinou rekta pravděpodobně primárnímu nádoru i okolním buňkám rekta způsobuje mimo poškození DNA i krácení telomer; IV) TL buněk karcinomů ovárií můžou ovlivňovat epigenetické regulace a exprese genů... Available in a digital repository NRGL Úloha telomer / DNA reparací v solidních tumorech

Loss of telomere function and unrepaired DNA damage contribute to chromosome integrity disruption and genomic instability development, which can initiate malignant transformation of the cells. This ...

Tomášová, Kristýna; Vodička, Pavel; Dušinská, Mária; Campa, Daniele
Univerzita Karlova, 2024