Number of found documents: 7622
Published from to

Studium netěkavých nitrososloučenin v pivovarství
Malečková, Michaela; Sobotníková, Jana; Čabala, Radomír; Karabín, Marcel
2024 - English
4 Abstract Nitroso compounds are beer contaminants related to carcinogenicity and can be naturally formed during brewing. They are generally categorized as volatile and non-volatile. Well-characterized and proven carcinogenic compounds are mostly volatile N-nitrosamines, whereas specific non-volatile nitroso compounds are nearly unknown even by structure. This deficiency limits improvements in health-risk assessment and control of beer. The present study focused on these barely known compounds in beer, related to their molecule structures and natural occurrence in beer and malt. Since these compounds form by nitrite reactions with naturally occurring compounds in beer or raw materials, the beer sample was parallelly treated by nitrite and isotopically labelled nitrite-15N at acidic conditions. Due to isotopic labelling, formed nitrite-related reaction products were distinguished by gas chromatography with tandem mass spectrometry. By this approach, up to 22 unknown nitrite-related reaction products (N-products) were found and structurally studied from mass spectrometric fragmentation patterns. Besides previously found N-nitrosoproline and N-nitrosoproline ethyl ester, newly characterized compounds in beer were 4-cyanophenol, pyruvic acid oxime, 2-methoxy-5-nitrophenol, nitrosoguaiacol, and 4-nitrosophenol.... 5 Abstrakt Nitrososloučeniny jsou kontaminanty piva s karcinogenními účinky, které se přirozeně tvoří během pivoarského procesu. Obecně jsou děleny na těkavé a netěkavé. Dostatečně charakterizované a prokázané karcinogenní látky jsou těkavé N-nitrosaminy, což nelze konstatovat pro strukturně neznámé zástupce netěkavých nitrososloučenin. Tato neznalost limituje vývoj nových analytických metod vedoucí k přesnějšímu zhodnocení a kontrole zdravotních rizik piva. Předložená studie se proto zabývá těmito méně známými sloučeninami, zejména strukturou molekul a jejich přirozeným výskytem v pivu i sladu. Jelikož je jejich vznik spojován s reakcemi dusitanu se sloučeninami piva a jeho surovin, byl vzorek piva paralelně ošetřen dusitanem (standardním a izotopickým-15N) v kyselém prostředí. Díky izotopickému značení byly vzniklé reakční produkty identifikovány plynovou chromatografií s tandemovou hmotnostní spektrometrií. Tímto přístupem bylo nalezeno a strukturně studováno až 22 neznámých reakčních produktů dusitanu (N-produktů) pomocí hmotnostně spektrometrických fragmentací. Kromě dříve nalezeného N-nitrosoprolinu a N-nitrosoprolin ethyl esteru, byly nově v pivu charakterizovány: 4-kyanofenol, oxim kyseliny pyrohroznové, 2-methoxy-5-nitrofenol, nitrosoguajakol a 4-nitrosofenol. Několik N-produktů bylo... Available in a digital repository NRGL
Studium netěkavých nitrososloučenin v pivovarství

4 Abstract Nitroso compounds are beer contaminants related to carcinogenicity and can be naturally formed during brewing. They are generally categorized as volatile and non-volatile. ...

Malečková, Michaela; Sobotníková, Jana; Čabala, Radomír; Karabín, Marcel
Univerzita Karlova, 2024

Teologie svatosti podle sv. Jana Pavla II.
Bušková, Magda; Novotný, Vojtěch; Červenková, Denisa; Svatoň, Robert
2024 - English
v anglickém jazyce: The primary focus of this study on the theology of holiness, according to St John Paul II, is to explore how he understands and interprets Christian holiness and what perspective he brings to the subject. The study offers a brief view of the saints he beatified and canonised, followed by insight into the moments of his life and spirituality, exploring, in line with the approach of spiritual theology, the appeal to understand him from within. The study's approach further reflects the theme of holiness from the position of selected texts of the Second Vatican Council. It intentionally takes into account the post-conciliar interpretation of Karol Wojtyła to consider the roots of his theology of holiness. The research of the theology of holiness in John Paul II's magisterium follows within selected encyclicals, especially Redemptor Hominis, Dives in Misericordia, Dominum et Vivificantem, and Redemptoris Missio, to explore aspects and characteristics he emphasised. The basic thesis and the study's golden thread is the approach of Christian holiness described as the union of Jesus Christ with a Christian in the Holy Spirit and the realisation of such union in the Church. Klíčová slova v anglickém jazyce: St John Paul II, holiness, union with Christ, Holy Spirit, mission, kingdom of God v českém jazyce: Tato studie o teologii svatosti podle svatého Jana Pavla II. se zaměřuje především na otázku, jak chápe a interpretuje křesťanskou svatost a jakou perspektivu k tomuto tématu přináší. Studie nabízí stručný pohled na jím blahořečené a kanonizované světce, následuje vhled do momentů jeho života a spirituality a v souladu s přístupem spirituální teologie zkoumá výzvu k jeho vnitřnímu pochopení. Přístup studie dále reflektuje téma svatosti z pozice vybraných textů Druhého vatikánského koncilu. Záměrně zohledňuje pokoncilní interpretaci Karola Wojtyły, aby se zamyslela nad kořeny jeho teologie svatosti. Výzkum teologie svatosti v magisteriu Jana Pavla II. je následně realizován v rámci vybraných encyklik, zejména Redemptor Hominis, Dives in Misericordia, Dominum et Vivificantem a Redemptoris Missio, se záměrem prozkoumat zdůrazňované aspekty a charakteristiky. Základní tezí a hlavní osou studie je přístup ke křesťanské svatosti interpretované jako spojení Ježíše Krista s křesťanem v Duchu svatém a uskutečňování tohoto spojení v církvi. Klíčová slova v českém jazyce: Sv. Jan Pavel II., svatost, spojení s Kristem, Duch svatý, misie, království Boží Keywords: Sv. Jan Pavel II; svatost; spojení s Kristem; Duch svatý; misie; království Boží; St John Paul II; holiness; union with Christ; Holy Spirit; mission; kingdom of God Available in a digital repository NRGL
Teologie svatosti podle sv. Jana Pavla II.

v anglickém jazyce: The primary focus of this study on the theology of holiness, according to St John Paul II, is to explore how he understands and interprets Christian holiness and what perspective ...

Bušková, Magda; Novotný, Vojtěch; Červenková, Denisa; Svatoň, Robert
Univerzita Karlova, 2024

Způsoby seznamování v současné společnost
Topinková, Renáta; Hamplová, Dana; Katrňák, Tomáš; Nešporová, Olga
2024 - English
In the past decade, online dating has been displacing other ways of meeting partners. In the US, online dating has surpassed meeting through friends and family around the 2013 for heterosexual couples. Despite the widespread popularity of online dating, relatively little is known about its prevalence, user perceptions, and behavioral dynamics in online dating platforms within the context of Czechia. This dissertation aims to fill this gap in empirical insights into Czech online dating market by utilizing two main data sources: 1) a survey of adult Czech internet users, 2) digital trace data from a Czech mobile dating app. The study starts with the historical overview of matchmaking, transitioning from newspaper ads in the 19th and early 20th centuries to the flourishing of online platforms in the modern era, reflecting societal norms and demands of different eras. The survey of Czech internet users reveals that online dating is a prevalent mode of finding romantic partners among surveyed Czechs, resonating with trends observed in the US and other Western countries. The fast emergence and widespread popularity of online dating begs the question of how it is related to one of the most persistent patterns in the research on partnerships and families - homogamy. The remainder of the thesis therefore... V posledních letech se z online seznamování stal dominantní prostředek, jakým se nové páry seznamují, přičemž již v roce 2013 v USA u heterosexuálních párů předstihlo seznamování prostřednictvím přátel a rodiny. Navzdory široké popularitě online seznamování je o jeho rozšíření, vnímání společností a dynamice chování uživatelů na online seznamovacích platformách v kontextu Česka známo poměrně málo. Tato disertační práce si klade za cíl zaplnit tuto mezeru v empirických poznatcích o českém trhu online seznamování s využitím dvou hlavních zdrojů dat: 1) dotazníkového šetření mezi dospělými českými uživateli internetu, 2) digitálních stop z české mobilní seznamovací aplikace. Studie začíná historickým přehledem seznamování, který přechází od novinových inzerátů v 19. a na počátku 20. století k rozkvětu online platforem v moderní době, přičemž odráží společenské normy a požadavky různých historických period. Šetření na kvótním výběru českých uživatelů internetu ukazuje, že online seznamování je mezi dotazovanými Čechy převládajícím způsobem hledání romantických partnerů, což odpovídá trendům v USA a dalších západních zemích. Rychlý nástup a široká obliba online seznamování vyvolává otázku, jak souvisí s jedním z nejstabilnějších vzorců ve výzkumu partnerských vztahů a rodin - homogamií. Zbývající část... Keywords: online seznamování|homofilie|homogamie|výběr partnera|digitální stopy|computational social science|věková preference|desirabilita; online dating|homophily|homogamy|partner selection|digital trace data|computational social science|age preferences|desirability Available in a digital repository NRGL
Způsoby seznamování v současné společnost

In the past decade, online dating has been displacing other ways of meeting partners. In the US, online dating has surpassed meeting through friends and family around the 2013 for heterosexual ...

Topinková, Renáta; Hamplová, Dana; Katrňák, Tomáš; Nešporová, Olga
Univerzita Karlova, 2024

Prostorově časová distribuce aerosolu v městském a venkovském prostředí
Bendl, Jan; Hovorka, Jan; Mikuška, Pavel; Vojtíšek, Michal
2024 - English
Air quality in Europe remains a significant environmental concern, affecting the health and quality of life of its population. While stationary network ambient air quality monitoring allows for the observation of main trends, it is not fully representative of personal exposure of citizens due to high spatio-temporal variability of atmospheric aerosol. Therefore, highly time-and- space resolved measurements with state-of-the-art instruments and methods are needed to observe the aerosol variability, dynamics, identify hot-spots, and pollution sources, which are necessary for successful targeted mitigation measures. This thesis addresses this gap focusing on the characterization of spatio-temporal distribution of atmospheric aerosol in inhabited environments. Novel mobile measurement systems were developed and employed to investigate diverse environments, including rural, urban and suburban area. Aerosol source-apportionment were conducted, and the toxicological effects associated with these environments were also investigated. A novel mobile measurement system was developed for personal exposure measurements and pollution mapping in urban and rural environments. The system was used to measure air quality in the Munich subway, revealing high aerosol dynamics with significantly higher concentrations of... Kvalita ovzduší v Evropě zůstává významným problémem v oblasti životního prostředí, který ovlivňuje zdraví a kvalitu života obyvatel. Stacionární síť monitorování kvality venkovního ovzduší sice umožňuje sledovat hlavní trendy, ale vzhledem k vysoké časoprostorové proměnlivosti atmosférického aerosolu není plně reprezentativní pro osobní expozici občanů. Proto jsou zapotřebí měření s vysokým časovým a prostorovým rozlišením, která umožní sledovat jak dynamiku aerosolu, tak identifikovat horká místa a zdroje znečištění. To je nezbytný předpoklad pro úspěšná cílená opatření ke zlepšení kvality ovzduší. Práce se zaměřuje na charakterizaci časoprostorového rozložení atmosférického aerosolu v obydleném prostředí. Byly vyvinuty a použity nové systémy pro mobilní měření určené pro charakterizaci venkovských, městských a příměstských oblastí. Byly provedeny experimenty vedoucí k rozlišení zdrojů aerosolu a stanovení jeho toxikologických účinků. Byl vyvinut nový mobilní měřicí systém pro měření osobní expozice a mapování znečištění v městském a venkovském prostředí. Systém byl použit k měření kvality ovzduší v mnichovském metru a odhalil vysokou dynamiku aerosolů s výrazně vyššími koncentracemi především hrubých částic - především oxidů železa z kolejnic a otěrů kol - ve srovnání s okolním ovzduším (rukopis... Keywords: atmosférický aerosol; prostorově časová distribuce; kvalita ovzduší; aerosolové částice; složení aerosolu; identifikace zdrojů; emise; mezní vrstva atmosféry; polycyklické aromatické uhlovodíky; elementární složení; zdravotní účinky; genotoxicita; atmospheric aerosol; spatio-temporal variability; air quality; particulate matter; aerosol composition; source apportionment; emissions; planetary boundary layer; polycyclic aromatic hydrocarbons; elemental composition; health effects; genotoxicity Available in a digital repository NRGL
Prostorově časová distribuce aerosolu v městském a venkovském prostředí

Air quality in Europe remains a significant environmental concern, affecting the health and quality of life of its population. While stationary network ambient air quality monitoring allows for the ...

Bendl, Jan; Hovorka, Jan; Mikuška, Pavel; Vojtíšek, Michal
Univerzita Karlova, 2024

Strojový překlad na základě jednojazyčných textů
Kvapilíková, Ivana; Bojar, Ondřej; Espana-Bonet, Cristina; Čmejrek, Martin
2024 - English
Title: Towards Machine Translation Based on Monolingual Texts Author: Ivana Kvapilíková Institute: Institute of Formal and Applied Linguistics Supervisor: doc. RNDr. Ondřej Bojar, Ph.D., Institute of Formal and Applied Linguistics Abstract: The current state of the art in machine translation (MT) heavily relies on parallel data, i.e. texts that have been previously translated by humans. This type of resource is expen- sive and only available for several language pairs in limited domains. A new line of research has emerged to design models capable of learning to translate from monolingual texts which are signicantly easier to obtain, e.g. by web-crawling. While it is impressive that such models achieve translation capabilities, the translation quality of the output they produce is still low for practical applications. This dissertation thesis strives to improve their performance. We explore the existing approaches of using monolingual resources to train translation models and propose a new technique to generate pseudo-parallel training data articially without expensive human input. We automatically select similar sentences from monolingual corpora in different languages and we show that using them in the initial stages of MT training leads to a signicant enhancement in translation quality. We also... Název: Strojový překlad na základě jednojazyčných textů Autor: Ivana Kvapilíková Ústav: Ústav aplikované a formální lingvistiky Vedoucí: doc. RNDr. Ondřej Bojar, Ph.D., Ústav aplikované a formální lingvistiky Abstrakt: Současné systémy strojového překladu (SP) jsou závislé na existenci paralelních dat, tedy textů, které byly dříve přeloženy lidmi. Tento typ dat je drahý a je dostupný pouze pro několik jazykových párů v omezených doménách. Vznikl tedy nový výzkumný směr zaměřený na navrhování modelů schopných naučit se překládat z jednojazyčných textů, které jsou výrazně dostupnější než texty paralelní, např. z internetu. I když je působivé, že takové modely překládat skutečně dokáží, kvalita jimi vyprodukovaných výstupů je pro praktické aplikace stále nedostatečná. Tato disertační práce se snaží vylepšit jejich výkonnost. Zkoumáme stávající přístupy používání jednojazyčných zdrojů k trénování překladových modelů a navrhujeme novou techniku generování pseudo-paralelních trénovacích dat uměle, bez drahého lidského vstupu. Automaticky hledáme podobné věty v jednojazyčný korpusech v různých jazycích a ukazujeme, že jejich použití v počátečních fázích trénování SP vede k... Keywords: strojový překlad|neřízené učení|hluboké neuronové sítě|nízkozdrojové jazyky|zpracování přirozeného jazyka; machine translation|unsupervised learning|deep neural networks|low-resource languages|natural language processing Available in a digital repository NRGL
Strojový překlad na základě jednojazyčných textů

Title: Towards Machine Translation Based on Monolingual Texts Author: Ivana Kvapilíková Institute: Institute of Formal and Applied Linguistics Supervisor: doc. RNDr. Ondřej Bojar, Ph.D., Institute of ...

Kvapilíková, Ivana; Bojar, Ondřej; Espana-Bonet, Cristina; Čmejrek, Martin
Univerzita Karlova, 2024

Metody pracující s omezeným množstvím zdrojů pro využití v dialogových systémech
Hudeček, Vojtěch; Dušek, Ondřej; Skantze, Gabriel; Schwarz, Petr
2024 - English
This thesis focuses on developing and improving task-oriented dialogue systems design in the rapidly growing landscape of artificial intelligence and natural language processing. We propose techniques that can substantially decrease development and deployment costs, motivated by the desire to make these systems more adaptable and scalable. We introduce multiple novel approaches to achieving these goals. Firstly, we present a weakly supervised automatic data annotation pipeline that can transform raw dialogue transcript into a refined set of semantically coherent concepts, bypassing the need for exhaustive manual annotations in natural language understanding for a given domain and significantly streamlining the development process. We also explore the largely uninvestigated field of latent variable models in task-oriented dialogue system modeling. These models offer excellent capabilities with the potential to uncover the structure of behavioral patterns seen in the dialogue through inspection of the latent space and comparison with actions taken by the model. Furthermore, we explore the potential of these models to form hierarchical representations using our proposed architecture. Following recent progress in the field, we harness the power of pre-trained large language models using in-context learning. We... Tato práce se zaměřuje na vývoj a zdokonalování návrhu tzv. task-oriented dialogových systémů v rychle se rozvíjejícím prostředí výzkumu umělé inteligence a zpracování přirozeného jazyka. Navrhujeme techniky, které mohou podstatně snížit náklady na vývoj a nasazení těchto systémů, což je motivováno snahou o jejich větší přizpůsobivost a škálovatelnost. V práci představujeme několik nových přístupů k dosažení těchto cílů. Nejdříve představujeme automatickou metodu anotace dat, která dokáže extrahovat sadu sémanticky koherentních konceptů (dialogových slotů) z prostého přepisu zaznamenaných konverzací. Tímto přístupem snižujeme množství manuální anotace potřebné pro porozumění přirozenému jazyku v dané doméně a výrazně tak zefektivňujeme proces vývoje. Zkoumáme také modely využívající latentní proměnné v modelování task-oriented dialogových systémů. Tato oblast je do značné míry neprobádána. Modely využívající latentní proměnné nabízejí možnost využití neanotovaných dat s potenciálem odhalit strukturu vzorců chování pozorovaných v dialogu. Toho lze dosáhnout prostřednictvím analýzy latentního prostoru a porovnání s akcemi provedenými modelem. Dále zkoumáme potenciál těchto modelů pro vytváření hierarchických reprezentací pomocí námi navržené architektury. V návaznosti na nedávný pokrok v této oblasti také... Keywords: zpracování přirozeného jazyka; neuronové sítě; stromové struktury; natural language processing; neural networks; tree structures Available in a digital repository NRGL
Metody pracující s omezeným množstvím zdrojů pro využití v dialogových systémech

This thesis focuses on developing and improving task-oriented dialogue systems design in the rapidly growing landscape of artificial intelligence and natural language processing. We propose techniques ...

Hudeček, Vojtěch; Dušek, Ondřej; Skantze, Gabriel; Schwarz, Petr
Univerzita Karlova, 2024

Vývoj protinádorových imunoterapeutických molekul na bázi fragmentů protilátek specifických pro prostatický specifický membránový antigen
Das, Gargi; Bařinka, Cyril; Vaněk, Ondřej; Ormsby, Tereza
2024 - English
Prostate cancer (PCa) remains a leading cause of male cancer-related mortality, necessitating thus the development of novel therapeutic approaches as conventional treatments have limited efficacy. Prostate-specific membrane antigen (PSMA) is an established biomarker for both imaging and therapy of PCa, as it is highly upregulated in neoplastic PCa tissues and metastatic castration- resistant prostate cancer. Consequently, immunological targeting of PSMA has gained significant attention as a therapeutic platform for the management of the disease. The thesis is focused on engineering of antibody fragments and fusion proteins derived from the high affinity anti-PSMA 5D3 monoclonal antibody that can be used as immune cell engagers to target and eliminate PSMA-positive cells. To this end, we engineered 5D3 single chain variable fragments (scFv) that were subsequently fused to anti-CD3 scFv and CP33 sequences, creating thus immune cell engagers targeting T-cells (BiTE) and monocytes (5D3-CP33), respectively. The engagers were expressed in insect cells, purified to homogeneity and their biophysical and functional characteristics evaluated using size exclusion chromatography, differential scanning fluorimetry, ELISA and flow cytometry. Ensuing cell-based assays revealed that both BiTE and 5D3-CP33 can... (Czech) Rakovina prostaty (PCa) představuje jednu z hlavních příčin mortality související s rakovinou v populaci mužů. Tento stav vyžaduje vývoj nových terapeutických přístupů přesahujících současnou konvenční léčbu s omezenou účinností. Prostatický specifický membránový antigen (PSMA) je jedním z nejpokročilejších biomarkerů pro zobrazování i terapii PCa díky své expresi specificky výrazně zvýšené neoplastických tkáních PCa a v metastatickém kastračně rezistentním karcinomu prostaty. Imunoterapeutické postupy zaměřené na PSMA skýtají v současné době velký potenciál jakožto nová platforma pro účinnou léčbu onemocnění. Předkládaná doktorská práce je zaměřena na inženýrství protilátkových fragmentů a fúzních proteinů odvozených z vysoce afinní monoklonální protilátky 5D3 specificky rozpoznávající PSMA. Cílem vývoje těchto molekul bylo dosažení specifického spojení imunitních buněk s biomarkerem PSMA vyvolávajícího eliminaci buněk prezentujících tento antigen. Za tímto účelem jsme zkonstruovali jednořetězcové variabilní fragmenty (scFv) protilátky 5D3, které byly následně fúzovány se sekvencemi anti-CD3 scFv a CP33, čímž jsme vytvořili fúzní proteiny specificky spojující imunitní buňky s T lymfocyty (BiTE) nebo s monocyty (5D3-CP33). Fúzní molekuly byly produkovány pomocí hmyzího expresního systému,... Keywords: rakovina prostaty; prostatický specifický membránový antigen; glutamátkarboxypeptidasa II; imunoterapie; bispecifická protilátka aktivující T lymfocyty; protilátka; jednořetězcové variabilní fragmenty; bispecifická protilátka aktivující monocyty; reaktivní formy kyslíku; fagocytóza; prostate cancer; prostate-specific membrane antigen; glutamate carboxypeptidase II; immunotherapy; T lymphocyte-activating bispecific antibody; antibody; single-chain variable fragments; monocyte-activating bispecific antibody; reactive oxygen species; phagocytosis Available in a digital repository NRGL
Vývoj protinádorových imunoterapeutických molekul na bázi fragmentů protilátek specifických pro prostatický specifický membránový antigen

Prostate cancer (PCa) remains a leading cause of male cancer-related mortality, necessitating thus the development of novel therapeutic approaches as conventional treatments have limited efficacy. ...

Das, Gargi; Bařinka, Cyril; Vaněk, Ondřej; Ormsby, Tereza
Univerzita Karlova, 2024

Změny střevního mikrobiomu u pacientů s idiopatickými střevními záněty
Schierová, Dagmar; Jirásková Zákostelská, Zuzana; Hrdý, Jiří; Kohout, Pavel
2024 - English
(EN) Microbes have coevolved with humans forming symbiotic communities that constantly challenge the immune system and, when imbalanced, could lead to diseases like inflammatory bowel disease (IBD). Patients with IBD suffer from microbial dysbiosis and chronic inflammation which could be potentiated by immune system reaction to the commensal microbiota. In the research presented here, firstly I have focused on the description of the gut and skin microbiome from patients with IBD and secondly, I investigated the process of antimicrobial defense. Patients with IBD on two different biological therapies targeting TNFα, IL-12 and IL-23 cytokines were tracked for changes in their gut and skin microbiome features. Although, neither differences in gut microbial diversity nor composition were linked with the progression of the therapies, an increased similarity to the healthy control group at week 38 of anti-TNFα therapy was found. This shift in microbiome could be considered beneficial and could be attributed to the inflammation reducing effect of the therapy. While analyzing the microbiome features, various patient characteristics were taken into account and the sources microbiome of variability were uncovered, out of which the interindividual variability stood out the most. Regarding the skin microbiome,... (CZ) Mikrobi se vyvíjeli společně s jejich lidskými hostiteli a vytvořili s nimi symbiotický celek, což ale představuje náročný úkol pro imunitní systém. Pacienti s ISZ trpí mikrobiální dysbiózou a chronickým zánětem, který může být způsoben reakcí imunitního systému na komenzální mikrobiotu. Ve zde prezentovaném výzkumu jsem se nejprve zaměřila na popis střevního a kožního mikrobiomu pacientů s ISZ, a na proces antimikrobiální obrany. Pacienti s IZS na dvou různých biologických terapiích cílící na cytokiny TNFα, IL-12 a IL-23 byli sledováni na výskyt změn v jejich střevním a kožním mikrobiomu. Ačkoli s průběhem sledovaných biologických terapií nebyly spojeny změny v diverzitě ani složení střevního mikrobiomu, v týdnu 38 anti-TNFα léčby byla zjištěna zvýšená podobnost se zdravou kontrolní skupinou. Tento posun ve složení mikrobiomu by mohl být považován za prospěšný a mohl by být připsán účinku terapie, tedy snížení zánětu. Při analýze mikrobiomu byly zohledněny různé charakteristiky pacientů a byly odhaleny zdroje variability mikrobiomu, z nichž nejvíce vynikla interindividuální variabilita. Pokud jde o kožní mikrobiom na místech bohatých na mazové žlázy, byly zjištěny rozdíly ve složení a diverzitě mezi zdravými jedinci a pacienty s ISZ. Toto pozorování je první svého druhu mimo střevo a... Keywords: střevní mikrobiom; terapie IBD; bacteriální DNA; gut microbiome; IBD therapy; bacterial DNA Available in a digital repository NRGL
Změny střevního mikrobiomu u pacientů s idiopatickými střevními záněty

(EN) Microbes have coevolved with humans forming symbiotic communities that constantly challenge the immune system and, when imbalanced, could lead to diseases like inflammatory bowel disease (IBD). ...

Schierová, Dagmar; Jirásková Zákostelská, Zuzana; Hrdý, Jiří; Kohout, Pavel
Univerzita Karlova, 2024

Anthropogenic impact on early-life stages of rheophilic fish
BARTOŇ, Daniel
2024 - English
This study focuses on the problems faced by the early-life stages of fish living in a river influenced by reservoirs and suggests possible solutions to enhance recruitment. The model fish for the study is the asp (Leuciscus aspius), known for its significant and protected population in the Želivka Reservoir, from where it migrates for reproduction to the tributary of Želivka River. The asp migrates upstream in spring to spawn in shallow, fast-flowing waters. At a research site, the adult population of asp is monitored using passive telemetry. Fish are caught, tagged, and released back into the reservoir. The asp population faces threats due to hydropeaking and river fragmentation. Hydropeaking causes egg detachment from the pebbles and their sedimentation in the reservoir. The study suggests that water should not exceed a velocity of 0.7 m×s-1 at the spawning ground. Periodically increasing discharge also shifts spawning fish outside their preferred spawning site, causing disruption of spawning and potentially lowering recruitment. A flowdeflector was built to protect newly spawned eggs from hydropeaking. However, there are additional threats to the asp recruitment process such as egg consumption by non-indigenous fish like common bream (Abramis brama). Water flow conditions are crucial for the conservation of rheophilic fish, as these fish, aside from habitat loss and modification, also face newly interacting generalist fish species moving from lentic to lotic sections of the system. Fish communities can be affected by reservoir construction far upstream, and these anthropogenic habitat alterations have severe negative impacts on threatened rheophilic fish recruitment. This study focuses on the problems faced by the early-life stages of fish living in a river influenced by reservoirs and suggests possible solutions to enhance recruitment. The model fish for the study is the asp (Leuciscus aspius), known for its significant and protected population in the Želivka Reservoir, from where it migrates for reproduction to the tributary of Želivka River. The asp migrates upstream in spring to spawn in shallow, fast-flowing waters. At a research site, the adult population of asp is monitored using passive telemetry. Fish are caught, tagged, and released back into the reservoir. The asp population faces threats due to hydropeaking and river fragmentation. Hydropeaking causes egg detachment from the pebbles and their sedimentation in the reservoir. The study suggests that water should not exceed a velocity of 0.7 m×s-1 at the spawning ground. Periodically increasing discharge also shifts spawning fish outside their preferred spawning site, causing disruption of spawning and potentially lowering recruitment. A flowdeflector was built to protect newly spawned eggs from hydropeaking. However, there are additional threats to the asp recruitment process such as egg consumption by non-indigenous fish like common bream (Abramis brama). Water flow conditions are crucial for the conservation of rheophilic fish, as these fish, aside from habitat loss and modification, also face newly interacting generalist fish species moving from lentic to lotic sections of the system. Fish communities can be affected by reservoir construction far upstream, and these anthropogenic habitat alterations have severe negative impacts on threatened rheophilic fish recruitment. Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Anthropogenic impact on early-life stages of rheophilic fish

This study focuses on the problems faced by the early-life stages of fish living in a river influenced by reservoirs and suggests possible solutions to enhance recruitment. The model fish for the ...

BARTOŇ, Daniel
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Signální dráhy v T-lymfocytární imunitě
Janušová, Šárka; Štěpánek, Ondřej; Hons, Miroslav; Abramson, Jakub
2024 - English
The immune system provides protection of the host against pathogens, and tumor cells while maintaining a tolerance to self-tissues. T cells are important players in orchestrating the immune response. Helper T cells navigate other cells in the course of the immune response, cytotoxic T cells directly kill infected or altered cells, and regulatory T cells suppress the overt activation of above mentioned. T cells are activated via their antigen-specific T-cell receptor (TCR), but for proper activation, they need additional signals from co-stimulatory or inhibitory receptors. This double-step activation is one of the regulatory steps to prevent aberrant T-cell activation. The main part of this thesis is focused on understanding of the signal propagation and regulation of the T-cell signaling. We used a tandem affinity purification followed by mass- spectrometry analysis to describe the composition of the receptor signaling complex of TNFR- SF members, GITR and OX40. We employed the same method to analyze the signalosome of IL-17R. One of the described components of all the receptors is ABIN1. We generated ABIN1 knock-out mice that exhibited signs of autoimmunity and its T cells were hyperresponsive to various stimulation in vitro and in vivo. We reported ABIN1 as a regulator ot T-cell signaling. In the... (Czech Version) Imunitní systém zajišťuje ochranu organismu proti patogenům a nádorovému bujení, ale zároveň toleruje buňky tělu vlastní. T buňky jsou důležitou součástí imunitní odpovědi. Pomocné T buňky zajišťují komunikaci mezi jednotlivými buněčnými typy, cytotoxické T buňky zajišťují eliminaci nakažených nebo pozměněných buněk a regulační T buňky poskytují ochranu organismu proti přílišné aktivaci pomocných a cytotoxických T buněk. T buňky jsou aktivované pomocí antigenně-specifického T-buněčného receptoru (TCR), který mají na svém povrchu. Nicméně pro dostatečnou aktivaci potřebují dodatečnou stimulaci přes kostimulační či inhibiční receptory. Tato dvoukroková aktivace slouží jako regulační mechanismus pro zabránění neúměrné aktivace T buněk. Hlavní část této dizertační práce se zabývá studiem a pochopením přenosu signálu po T-buněčné aktivaci a také jeho regulací. Pro objasnění těchto procesů jsme využili tandemovou afinitní purifikaci s následnou analýzou pomocí hmotnostní spektrometrie. Popsali jsme složení signálních komplexů receptorů GITR a OX40, které patří do rodiny receptorů tumor nekrotizujícího faktoru (TNFR), a také receptoru pro interleukin 17 (IL-17R). Ve všech studovaných signálních komplexech jsme popsali protein ABIN1. Následně jsme vytvořili ABIN1-deficientní myši, u kterých... Available in a digital repository NRGL
Signální dráhy v T-lymfocytární imunitě

The immune system provides protection of the host against pathogens, and tumor cells while maintaining a tolerance to self-tissues. T cells are important players in orchestrating the immune response. ...

Janušová, Šárka; Štěpánek, Ondřej; Hons, Miroslav; Abramson, Jakub
Univerzita Karlova, 2024

About project

NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web

Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz

Provider

http://www.techlib.cz

Facebook

Other bases