Yes (34591)
No (24748)
Number of found documents:
59339
Published from
to
Reaktivní modifikace RNA pro biokonjugace s proteiny a nové enzymové metody pro syntézu RNA s modifikovanými bázemi
Brunderová, Mária; Hocek, Michal; Míšek, Jiří; Vaňáčová, Štěpánka
2024 - English
This doctoral thesis focuses on the enzymatic synthesis of base-modified RNA probes with diverse functional groups, including reactive cross-linking, hydrophobic and fluorescent moieties, or affinity tags. The construction of nucleobase-modified oligonucleotides is accomplished either through conventional in vitro transcription with T7 RNA polymerase or by an innovative approach leveraging engineered mutant DNA polymerases and primer extension reaction (PEX). In the first section of the thesis, a novel ribonucleoside triphosphate building block with reactive chloroacetamide functionality was synthesised using an aqueous Pd-catalysed Sonogashira cross- coupling reaction, directly applied on iodinated nucleotide. The chloroacetamide modified triphosphate was then tested as a putative substrate for T7 RNA polymerase in in vitro transcription reaction, aiming to construct RNA probes with one or multiple reactive groups. The selectivity of chloroacetamide- modified RNA for thiol-, or cysteine-, and histidine-containing (bio)molecules was demonstrated by model bioconjugation reactions and cross-linking experiments with three RNA-binding proteins of diverse structures and functions. The efficient formation of RNA-protein covalent adducts was confirmed by western blot or gel, and mass spectrometry analyses... Tato disertační práce je zaměřena na enzymovou syntézu na bázi modifikovaných RNA s různými funkčními skupinami, včetně reaktivních pro síťování proteinů, hydrofobních a fluorescenčních skupin nebo afinitních značek. Konstrukce oligonukleotidů modifikovaných na bázi je zabezpečena buď konvenční in vitro transkripcí s T7 RNA polymerázou, nebo inovativním přístupem využívajícím upravené mutantní DNA polymerázy a reakci prodlužování primerů (PEX). V první části práce byl nasyntetizován nový ribonukleosid trifosfátový stavební blok s reaktivní chloracetamidovou funkční skupinou pomocí Sonogashirovy kaplingové reakce ve vodní fázi katalyzované Pd, přímo aplikované na jodovaný nukleotid. Chloracetamidem modifikovaný trifosfát byl poté testován jako vhodný substrát pro in vitro transkripci s T7 RNA polymerázou s cílem zkonstruovat RNA sondy s jednou nebo více reaktivními skupinami. Selektivita chloracetamidem modifikovaných RNA pro thiol, nebo cystein a histidin obsahující (bio)molekuly byla ukázána modelovými biokonjugačními reakcemi a experimenty pro síťování se třemi RNA-vazebnými proteiny s různými strukturami a funkcemi. Účinná tvorba kovalentních RNA-protein aduktů byla potvrzena western blotem, gelovou elektroforézou a hmotnostní analýzou, které byly prováděny za denaturačních podmínek....
Keywords:
RNA; nukleotidy; biokonjugace; RNA; nucleotides; bioconjugations
Available in a digital repository NRGL
Reaktivní modifikace RNA pro biokonjugace s proteiny a nové enzymové metody pro syntézu RNA s modifikovanými bázemi
This doctoral thesis focuses on the enzymatic synthesis of base-modified RNA probes with diverse functional groups, including reactive cross-linking, hydrophobic and fluorescent moieties, or affinity ...
Vlastnosti druhů půdní fauny a funkce ekosystémů během obnovy po velkých disturbancích
Salazar Fillippo, Andres Alberto; Frouz, Jan; Tajovský, Karel; Józefowska, Agnieszka
2024 - English
Growing evidence indicates that interactions between above and belowground communities are essential for healthy and functioning ecosystems. This, however, has exposed a disproportionate knowledge gap in soil communities, which remain poorly understood both at a taxonomic and ecological level when compared to their aboveground counterpart. Studying assembly processes of communities along with structuring forces driving these changes facilitate observing key dynamics within the ecosystem. For this reason, three out of four manuscripts included in the current thesis focus on chronosequences in different successional stages after restoration of major disturbances. The first chronosequence consisted of four sites (10 years, 30 years, 50 years, and a >100 years reference site) in heathlands restored using top-soil removal from North- East Belgium. Here I studied trait assemblages of oribatid mite communities that revealed different ecomorphological groups changing with time during succession, and we also quantitatively assessed the contribution of phoresy via rodents to the dispersal of oribatid mites between restored sites. In the second chronosequence on spoil heaps from the mining district of Sokolov (Czech Republic) with sites ranging from 1 to 41 years, I identified explicit relationships between... Stále více důkazů naznačuje, že interakce mezi nadzemními a podzemními společenstvy jsou nezbytné pro zdravé a fungující ekosystémy. To však odhalilo neúměrnou mezeru ve znalostech o půdních společenstvech, která jsou ve srovnání se svými nadzemními protějšky stále nedostatečně prozkoumána jak na taxonomické, tak na ekologické úrovni. Studium procesů při vzniku společenstev spolu se strukturními silami, které změny ve společenstvech pohánějí, usnadňuje pozorování klíčové dynamiky v ekosystému. Z tohoto důvodu se tři ze čtyř rukopisů zahrnutých do této práce zaměřují na chronosekvence v různých sukcesních stadiích po obnově velkých disturbancí. První chronosekvence se skládala ze čtyř lokalit (10 let, 30 let, 50 let a referenční lokalita >100 let) ve vřesovištích obnovených odstraněním ornice ze severovýchodní Belgie. Zde jsem studoval znaky společenstev pancířníků (Oribatida), které odhalily různé ekomorfologické skupiny měnící se s časem během sukcese, a také jsem kvantitativně hodnotil podíl foresie prostřednictvím hlodavců na šíření pancířníků mezi obnovenými lokalitami. Ve druhé chronosekvenci na výsypce v těžební oblasti Sokolov (Česká republika) s lokalitami o stáří v rozmezí od 1 do 41 let jsem identifikoval explicitní vztahy mezi specifickými znaky pancířníků a parametry prostředí, což dále...
Keywords:
Soil fauna; post-mining chronosequences; community assembly; traits; belowground interactions; bioindication; microarthropods
Available in a digital repository NRGL
Vlastnosti druhů půdní fauny a funkce ekosystémů během obnovy po velkých disturbancích
Growing evidence indicates that interactions between above and belowground communities are essential for healthy and functioning ecosystems. This, however, has exposed a disproportionate knowledge gap ...
Důkazová složitost CSP
Gaysin, Azza; Krajíček, Jan; Kolokolova, Antonina; Kompatscher, Michael
2024 - English
In this thesis we formalize Zhuk's decision algorithm solving in p-time tractable con- straint satisfaction problems (CSPs) in a weak theory of bounded arithmetic W1 1 . As a consequence, we show that tautologies that express the negative instances of such CSPs have polynomial proofs in the quantified propositional calculus G. 1 V této práce formalizujeme Zhukův polynomiální algoritmus rozhodující řešitelnost problémů splňování podmínek (CSPs), které nejsou NP-úplné, ve slabé teorii omezené aritmetiky W1 1 . Jako důsledek odvodíme, že tautologie odpovídající negativním instancím oněch CSP mají polynomiální důkazy v kvantifikovaném výrokovém počtu G. 1
Keywords:
omezená aritmetika|problém splňování podmínek|důkazová složitost|univerzální algebra; bounded arithmetic|constraint satisfaction problem|proof complexity|universal algebra
Available in a digital repository NRGL
Důkazová složitost CSP
In this thesis we formalize Zhuk's decision algorithm solving in p-time tractable con- straint satisfaction problems (CSPs) in a weak theory of bounded arithmetic W1 1 . As a consequence, we show that ...
Strukturní studie vybraných proteinových komplexů účastnících se přenosu signálu v buňce
Honzejková, Karolína; Obšil, Tomáš; Bouřa, Evžen; Pavlíček, Jiří
2024 - English
Protein-protein interactions are critical for most physiological and pathophysiological processes. Detailed characterization of these interactions is therefore essential not only to understand the nature of these events, but also to design strategies to target these interactions. This work focuses on the study of the structure and interactions of several proteins and their complexes. Apoptosis signal-regulating kinase 1 (ASK1) is a mitogen-activated protein kinase kinase kinase (MAP3K) that activates the p38/JNK protein kinase pathways, thereby directing cells toward an inflammatory response or apoptosis. ASK1 interacts with thioredoxin (TRX), a small dithiol oxidoreductase, which inhibits ASK1, but the mechanism of this inhibition has not been clarified. CaMKK1 and CaMKK2 are Ca2+ /calmodulin (CaM)-dependent protein kinases that regulate cellular energy balance, memory, and inflammation, among others. Both are inhibited by 14-3-3 proteins, but despite their domain and sequence similarities, the extent of 14-3-3 protein- mediated inhibition is different. Estrogen receptor alpha (ERα) is a nuclear receptor involved in breast cancer. Tamoxifen, an ERα antagonist, is used to treat this disease, but resistance often develops. 14-3-3 proteins interact with ERα and inhibit its transcriptional activity,... Protein-proteinové interakce jsou klíčové pro většinu fyziologických i patofyziologických dějů. Detailní charakterizace těchto interakcí je proto nezbytná nejen k porozumění podstaty těchto dějů, ale i pro návrh strategií, jak tyto interakce cíleně ovlivňovat. Tato práce se zaměřuje na studium struktury a interakcí několika proteinů a jejich komplexů. ASK1 (z anglického "apoptosis signal-regulating kinase 1") je mitogeny aktivovaná proteinkinasa kinasa kinasa (MAP3K), která aktivuje dráhy proteinkinas p38/JNK, čímž směruje buňky k zánětlivé reakci nebo apoptóze. ASK1 interaguje s thioredoxinem (TRX), malou dithioloxidoreduktasou, která inhibuje ASK1, nicméně mechanismus této inhibice je nejasný. CaMKK1 a CaMKK2 jsou Ca2+ /kalmodulin (CaM)- dependentní proteinkinasy, které regulují např. energetickou rovnováhu buňky, paměť či zánět. Obě jsou inhibovány proteiny 14-3-3, ale navzdory svým doménovým a sekvenčním podobnostem je rozsah inhibice zprostředkovaný proteiny 14-3-3 odlišný. Estrogenový receptor alfa (ERα) je jaderný receptor, který se podílí na vzniku rakoviny prsu. Pro léčbu tohoto onemocnění se používá tamoxifen, antagonista ERα, který však často způsobuje vznik rezistence. Proteiny 14-3-3 interagují s ERα a inhibují jeho transkripční aktivitu, povaha této interakce je však stále nejasná....
Keywords:
ASK1; CaMKK1; CaMKK2; proteinkinasa; apoptosa; 14-3-3; ER alfa; ASK1; CaMKK1; CaMKK2; protein kinase; apoptosis; 14-3-3; ER alpha
Available in a digital repository NRGL
Strukturní studie vybraných proteinových komplexů účastnících se přenosu signálu v buňce
Protein-protein interactions are critical for most physiological and pathophysiological processes. Detailed characterization of these interactions is therefore essential not only to understand the ...
Strukturní studie opravy abazického místa a tvorba kovalentního spojení opačných řetězců DNA
Landová, Barbora; Bouřa, Evžen; Bařinka, Cyril; Schneider, Bohdan
2024 - English
DNA damage refers to any alteration or modification in the DNA structure that deviates from its natural state. Abasic site (Ap site) is one of the most common DNA lesions resulting from spontaneous depurination/depyrimidination or enzymatic base excision. When left unrepaired it can lead to a cascade of genetic mutations, potentially causing diseases like cancer. Understanding DNA repair mechanisms is vital for medical research and applications. Bacterial MutM is a DNA repair glycosylase, removing DNA damage generated by oxidative stress and preventing mutations and genomic instability. MutM belongs to the Fpg/Nei family of procaryotic enzymes, sharing structural and functional similarities with their eukaryotic counterparts, such as NEIL1-NEIL3. Here, I present two crystal structures of MutM from pathogenic Neisseria meningitidis: MutM holoenzyme and MutM bound to DNA. The free enzyme exists in an open conformation, while upon binding to DNA, both the enzyme and DNA undergo substantial structural changes and domain rearrangement. One of the DNA lesion repaired by MutM is the Ap site, which, if not repaired, may spontaneously lead to the formation of an abasic site interstrand crosslink (Ap-ICL) with an adjacent adenine in the opposite strand. NEIL3 glycosylase is known to remove Ap-ICL. With a... Poškozením DNA se rozumí jakákoli změna nebo modifikace struktury DNA, která se odchyluje od jejího přirozeného stavu. Abasické místo (Ap místo) je jedním z nejčastějších poškození DNA, které vzniká spontánní depurinací/depyrimidinací nebo enzymatickým odstraněním báze. Pokud se neopraví, může vést ke genetické mutaci a potenciálně způsobit onemocnění, jako je například rakovina. Pochopení mechanismu opravy DNA je zásadní pro lékařský výzkum a aplikaci. Bakteriální MutM je glykosyláza opravující DNA, která odstraňuje poškození DNA vzniklé oxidačním stresem a zabraňuje mutacím a genomové nestabilitě. MutM patří do rodiny prokaryotických enzymů Fpg/Nei a je strukturně i funkčně podobná se svým eukaryotickým protějškům, jako jsou NEIL1-NEIL3. Zde prezentuji dvě krystalové struktury MutM z patogenní Neisseria meningitidis: MutM holoenzym a MutM vázaný na DNA. Volný enzym existuje v otevřené konformaci, zatímco po vazbě na DNA, dochází k podstatným strukturním změnám a přeskupení domén enzymu i ohybu DNA. Jednou z poškození DNA opravovaných MutM je Ap místo, které, pokud není opraveno, může spontánně vést k vytvoření mezivláknového kovanetního prokřízení DNA (Ap-ICL) se sousedním adeninem na opačném vlákně DNA. Je známo, že glykosyláza NEIL3 odstraňuje Ap-ICL. Pomocí série různých oligonukleotidů jsme...
Keywords:
poškození DNA; oprava DNA; glykosylásy; struktura; DNA damage; DNA repair; glycosylases; structure
Available in a digital repository NRGL
Strukturní studie opravy abazického místa a tvorba kovalentního spojení opačných řetězců DNA
DNA damage refers to any alteration or modification in the DNA structure that deviates from its natural state. Abasic site (Ap site) is one of the most common DNA lesions resulting from spontaneous ...
Úloha transkripčních faktorů MEIS při vzniku a diferenciaci buněk neurální lišty
Fábik, Jaroslav
2024 - English
Unique to the vertebrate embryo, neural crest cells represent a multipotent cell population that migrates throughout the body and gives rise to a multitude of different types of cells and tissues. Cranial neural crest cells populate the developing pharyngeal arches and establish skeletogenic condensations that generate the future bones and cartilages of the face and neck. Moreover, these cells send out and receive signals from adjacent tissues of non-neural crest origin, such as the mandibular epithelium and muscle precursor cells. Such reciprocal interactions give rise to organs and structures, for instance, to the tongue. The aim of this work was to elucidate the roles of homeodomain-containing MEIS transcription factors in neural crest cells and in craniofacial development, by using a mouse model with conditional inactivation of Meis2 gene in neural crest cells. We show that transcription factor MEIS2 is expressed in the medial region of the developing mandible and in the developing tongue. Conditional Meis2 inactivation using the Wnt1-Cre2 mouse strain caused mandible and tongue hypoplasia, and ectopic bone formation at the expense of tongue development. These mandibular arch anomalies were accompanied by the loss of Hedgehog signaling in the mandibular epithelium, expanded RUNX2 expression in... (SLOVAK) Jedinečná u stavovcov, neurálna lišta predstavuje multipotentnú bunkovú populáciu, ktorá migruje cez telo a dáva vznik množstvu rôznych typov buniek a tkanív. Bunky hlavovej neurálnej lišty osídľujú vyvíjajúce sa faryngové oblúky a zakladajú skeletogénne kondenzácie, ktoré vytvárajú budúce kosti a chrupky tváre a krku. Tieto bunky tiež vysielajú a prijímajú signály zo susedných tkanív ne-neurálneho pôvodu, akými sú napríklad mandibulárny epitel a prekurzory svalových buniek. Takéto vzájomné interakcie dávajú vznik orgánom a štruktúram, ako napríklad jazyku. Cieľom tejto práce bolo objasniť úlohy transkripčných faktorov MEIS, obsahujúcich homeodoménu, v bunkách neurálnej lišty a behom kraniofaciálneho vývoja, a to prostredníctvom myšieho modelu s kondicionálnou inaktiváciou Meis2 génu v bunkách neurálnej lišty. V našej práci ukazujeme, že transkripčný faktor MEIS2 je exprimovaný v mediálnej oblasti vyvíjajúcej sa mandibuly (dolnej čeľuste) a vo vyvíjajúcom sa jazyku. Kondicionálna inaktivácia Meis2 v bunkách neurálnej lišty prostredníctvom myšej línie Wnt1-Cre2 vedie k hypoplázii jazyka a mandibuly, ako i k tvorbe ektopickej kosti na úkor vývoja jazyka. Tieto anomálie súvisiace s mandibulárnym oblúkom sú sprevádzané stratou Hedgehog signalizácie v mandibulárnom epiteli, rozšírenou expresiou...
Keywords:
Meis; neurálna lišta; kraniofaciálny vývoj; faryngové oblúky; jazylka; mandibula; Meis; neural crest; craniofacial development; pharyngeal arches; hyoid bone; mandible
Available in a digital repository NRGL
Úloha transkripčních faktorů MEIS při vzniku a diferenciaci buněk neurální lišty
Unique to the vertebrate embryo, neural crest cells represent a multipotent cell population that migrates throughout the body and gives rise to a multitude of different types of cells and tissues. ...
Atomová fluorescenční spektrometrie s generováním těkavých specií - citlivý nástroj pro ultrastopovou prvkovou analýzu
Štádlerová, Barbora; Musil, Stanislav; Spěváčková, Věra; Dočekalová, Hana
2024 - English
This thesis encompasses a development of innovative methodologies based on atomic fluorescence spectrometry, offering precise and sensitive determination of ultra-trace elements, such as bismuth, cadmium, and nickel. The common denominator of all parts of this work is the use of a research-grade non-dispersive atomic fluorescence spectrometer (AFS). First part of this work is dedicated to the development of a highly sensitive methodology for bismuth determination based on hydride generation (HG) coupled with AFS. Bismuthane was generated by the reaction with NaBH4 in HCl medium in a flow injection arrangement and directed by a stream of carrier argon and hydrogen to an atomizer. A detailed optimization of the optical path of the spectrometer (electrodeless discharge lamp, lenses and interference filter) and atomization parameters in two flame atomizers - miniature diffusion flame (MDF) and flame-in-gas-shield atomizer (FIGS) - was performed. An excellent repeatability and extremely low limits of detection were achieved, namely 1.8 ng L−1 with the MDF and 0.9 ng L−1 with the FIGS. Subsequently, a photochemical vapour generation (PVG) of bismuth was coupled to AFS, employing a flow injection arrangement of the generator, a standard mercury low-pressure UV lamp and a coiled Teflon reactor. A flow rate... Tato disertační práce se zabývá vývojem nových analytických metodologií založených na atomové fluorescenční spektrometrii - detekční metodě, která nabízí precizní a citlivé stanovení ultrastopových prvků, mezi něž patří například bismut, kadmium a nikl. Společným jmenovatelem této práce je použití nekomerčního nedisperzního atomového fluorescenčního spektrometru (AFS) vyvinutého v laboratoři. První část této práce se věnuje vývoji vysoce citlivé metody pro stanovení bismutu pomocí generování hydridů (HG) ve spojení s AFS. Bismutan byl generován reakcí s NaBH4 v prostředí HCl v uspořádání průtokové injekční analýzy a pomocí proudu nosného plynu argonu a vodíku byl unášen do atomizátoru. Byla provedena detailní optimalizace optické cesty spektrometru (pozice bezelektrodové výbojky, čoček a interferenčního filtru) a atomizačních podmínek ve dvou plamenových atomizátorech - miniaturním difúzním plamenu (MDF) a tzv. flame-in-gas-shield atomizátoru (FIGS). Bylo dosaženo výborné opakovatelnosti a extrémně nízkých mezí detekce, jmenovitě 1,8 ng l−1 s využitím MDF a 0,9 ng l−1 s FIGS. Následně byl AFS spojen s fotochemickým generátorem těkavých specií (PVG), opět v uspořádání injekční průtokové analýzy. Použitý fotoreaktor se skládal ze standardní rtuťové nízkotlaké UV výbojky ovinuté teflonovou trubičkou....
Keywords:
atomová fluorescenční spektrometrie; generování těkavých specií; ultrastopová prvková analýza; hydridotvorné prvky; přechodné kovy; atomic fluorescence spectrometry; volatile species generation; ultratrace elemental analysis; hydride forming elements; transition metals
Available in a digital repository NRGL
Atomová fluorescenční spektrometrie s generováním těkavých specií - citlivý nástroj pro ultrastopovou prvkovou analýzu
This thesis encompasses a development of innovative methodologies based on atomic fluorescence spectrometry, offering precise and sensitive determination of ultra-trace elements, such as bismuth, ...
Distančně magické očíslování
Pfeiffer, Hayden; Gregor, Petr; Pangrác, Ondřej
2024 - English
Title: Distance Magic Labelings Author: Hayden Pfeiffer Department: Dept. of Theoretical Computer Science and Mathematical Logic Supervisor: doc. Mgr. Petr Gregor, Ph.D., KTIML, MFF UK Abstract: A distance magic labeling of a graph G is a bijection f : V (G) → {1, 2, . . . , |V (G)|} such that the sum of labels on the neighbourhood of each vertex is constant. A framework based on linear algebra has been developed using the notion of neighbour balance to determine whether there exists a distance magic labeling for a hypercube with dimension n. In this thesis, we extend this framework to all Cayley graphs on Zn 2 . We use this framework to reprove some known results from recent literature. We also use this framework to introduce the notion of component-wise distance magic labelings on Cayley graphs of Zn 2 . Keywords: distance magic labeling, Cayley graph, hypercube, neighbour balance iii
Keywords:
distančně magické očíslování|Cayleyho graf|hyperkrychle; distance magic labeling|Cayley graph|hypercube
Available in a digital repository NRGL
Distančně magické očíslování
Title: Distance Magic Labelings Author: Hayden Pfeiffer Department: Dept. of Theoretical Computer Science and Mathematical Logic Supervisor: doc. Mgr. Petr Gregor, Ph.D., KTIML, MFF UK Abstract: A ...
Dvoufázové rozvrhování s neznámými rychlostmi
Minařík, Josef; Sgall, Jiří; Eberle, Franziska
2024 - English
Speed-robust scheduling is a two-stage scheduling problem with a makespan objective. We are given processing times of n jobs, number of machines m and number of bags b. We have to group the jobs into bags that are to be scheduled on machines of currently unknown speed. The goal is to minimize the worst-case ratio of our makespan and makespan of an adversary who does not have to create bags and assigns jobs directly to machines. So far, the problem has been mostly studied for b = m. We generalize previously known results for infinitesimal jobs (called sand) and prove that the best achievable competitive ratio is mb mb−(m−1)b . We present an algorithm for the case of identical jobs (called bricks) with competitive ratio at most 1.6 in the case b = m, improving the best previously known value of 1.8. We introduce a new category called p-pebbles, those are jobs with processing time at most p times the average load of a machine. Pebbles are half way between sand and the general case (called rocks). We present an algorithm for pebbles that has better robustness factor than the best known algorithm for rocks for small values of p (for p less than 2 − e e−1 in the case b = m). 1 Rychlostně robustní rozvrhování je dvoufázový rozvrhovací problém. Na vstupu je dána doba běhu pro každý z n úkolů, počet strojů m a počet balíčků b. Naším úkolem je rozdělit úkoly do balíčků, které budou následně zpracovány na strojích, které mají v tomto okamžiku neznámé rychlosti. Naším cílem je minimalizovat poměr délky našeho rozvrhu a délky optimáního rozvrhu, který by vznil umisťováním úkolů rovnou na stroje. Nejpodrobněji studovaný případ doposud byl b = m. V této práci zobecňujeme známé výsledky pro infinitizemálně malé úkoly (tento případ se nazývá písek) a dokážeme, že nejlepší kompetitivní poměr, kterého je možné dosáhnout, je mb mb−(m−1)b . Dále formulujeme algoritmus řešící případ s identickými úkoly (nazývaný cihly) za podmínky b = m s kompetitivním poměrem 1.6, což zlepšuje nejlepší doposud známou hodnotu 1.8. Zavedeme nový speciální případ, který budeme nazývat p-oblázky. V tomto případě jsou doby běhu jednotlivých úkolů nejvýše p-násobky průměrné zátěže stroje. Oblázky jsou vlastnostmi i obtížností na půl cesty mezi pískem a obecným případem (nazývaným kameny). Popíšeme algoritmus pro oblázky, který je pro malé hodnoty p lepší než nejlepší známý algoritmus pro kameny (pro p menší než 2 − e e−1 v případě b = m). 1
Keywords:
rozvrhování|aproximační algoritmy|délka rozvrhu|uniformní rychlosti; scheduling|approximation algorithms|makespan|uniform speeds
Available in a digital repository NRGL
Dvoufázové rozvrhování s neznámými rychlostmi
Speed-robust scheduling is a two-stage scheduling problem with a makespan objective. We are given processing times of n jobs, number of machines m and number of bags b. We have to group the jobs into ...
Studium netěkavých nitrososloučenin v pivovarství
Malečková, Michaela; Sobotníková, Jana; Čabala, Radomír; Karabín, Marcel
2024 - English
4 Abstract Nitroso compounds are beer contaminants related to carcinogenicity and can be naturally formed during brewing. They are generally categorized as volatile and non-volatile. Well-characterized and proven carcinogenic compounds are mostly volatile N-nitrosamines, whereas specific non-volatile nitroso compounds are nearly unknown even by structure. This deficiency limits improvements in health-risk assessment and control of beer. The present study focused on these barely known compounds in beer, related to their molecule structures and natural occurrence in beer and malt. Since these compounds form by nitrite reactions with naturally occurring compounds in beer or raw materials, the beer sample was parallelly treated by nitrite and isotopically labelled nitrite-15N at acidic conditions. Due to isotopic labelling, formed nitrite-related reaction products were distinguished by gas chromatography with tandem mass spectrometry. By this approach, up to 22 unknown nitrite-related reaction products (N-products) were found and structurally studied from mass spectrometric fragmentation patterns. Besides previously found N-nitrosoproline and N-nitrosoproline ethyl ester, newly characterized compounds in beer were 4-cyanophenol, pyruvic acid oxime, 2-methoxy-5-nitrophenol, nitrosoguaiacol, and 4-nitrosophenol.... 5 Abstrakt Nitrososloučeniny jsou kontaminanty piva s karcinogenními účinky, které se přirozeně tvoří během pivoarského procesu. Obecně jsou děleny na těkavé a netěkavé. Dostatečně charakterizované a prokázané karcinogenní látky jsou těkavé N-nitrosaminy, což nelze konstatovat pro strukturně neznámé zástupce netěkavých nitrososloučenin. Tato neznalost limituje vývoj nových analytických metod vedoucí k přesnějšímu zhodnocení a kontrole zdravotních rizik piva. Předložená studie se proto zabývá těmito méně známými sloučeninami, zejména strukturou molekul a jejich přirozeným výskytem v pivu i sladu. Jelikož je jejich vznik spojován s reakcemi dusitanu se sloučeninami piva a jeho surovin, byl vzorek piva paralelně ošetřen dusitanem (standardním a izotopickým-15N) v kyselém prostředí. Díky izotopickému značení byly vzniklé reakční produkty identifikovány plynovou chromatografií s tandemovou hmotnostní spektrometrií. Tímto přístupem bylo nalezeno a strukturně studováno až 22 neznámých reakčních produktů dusitanu (N-produktů) pomocí hmotnostně spektrometrických fragmentací. Kromě dříve nalezeného N-nitrosoprolinu a N-nitrosoprolin ethyl esteru, byly nově v pivu charakterizovány: 4-kyanofenol, oxim kyseliny pyrohroznové, 2-methoxy-5-nitrofenol, nitrosoguajakol a 4-nitrosofenol. Několik N-produktů bylo...
Available in a digital repository NRGL
Studium netěkavých nitrososloučenin v pivovarství
4 Abstract Nitroso compounds are beer contaminants related to carcinogenicity and can be naturally formed during brewing. They are generally categorized as volatile and non-volatile. ...
NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web
Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz
Provider
Other bases