Národní úložiště šedé literatury

Cesta Hora: Panství a přechodová symbolika ve Sporu Hora a Sutecha
Čermák, Michal; Pehal, Martin; Spalinger, Anthony John; Goebs, Katja
2024 - English The present study explores the Ancient Egyptian tale Contendings of Horus and Seth, attested from the New Kingdom Papyrus Chester Beatty I, with focus on its complex symbolism and relationship to contemporary Egyptian religious thought and royal ideology. Intertextual ties between the tale and multiple Egyptian textual corpora are outlined, including ritual texts, funerary inscriptions, royal inscriptions of various types and literature proper. The symbolic analysis is followed by an interpretation of the story as a literary rite of passage, centred on the drama of royal succession, represented in the tale by the maturation of the god Horus. Elements of individual stages of this process are identified, with particular attention being given to the liminal aspect of succession, in which the various symbolic layers merge into a single narrative focused on the transformation of a prince into a king. The study shows how the tale presents a complex theology of kingship as an earthly image of the creator god, who subsumes in the drama of his ascension to the throne the totality of vital processes in the universe, including the revival of the dead in the afterlife and a cyclic renewal of the whole cosmos. The figure of the god Seth serves as another major focus of the thesis, which describes his... Tato studie zkoumá staroegyptský příběh Spor Hora a Sutecha, doložený na papyru Chester Beatty I z Nové říše se zaměřením na jeho složitou symboliku a vztah k soudobému egyptskému náboženskému myšlení a královské ideologii. Věnuje se intertextuálním vazbám mezi příběhem a četnými egyptskými textovými korpusy včetně rituálních textů, pohřebních nápisů, královských inskripcí a literatury. Po této symbolické analýze následuje výklad příběhu jako literárního přechodového rituálu, jehož středobod představuje drama královského nástupnictví, které je v příběhu reprezentováno dospíváním boha Hora. Práce identifikuje prvky jednotlivých fází tohoto procesu, přičemž zvláštní pozornost je věnována liminálnímu aspektu nástupnictví, v němž se různé symbolické vrstvy spojují v jediné vyprávění zaměřené na proměnu prince v krále. Studie v příběhu odhaluje komplexní teologii královského úřadu jako pozemského obrazu boha stvořitele, který v dramatu svého nástupu na trůn subsumuje souhrn vitálních procesů ve vesmíru včetně oživení mrtvých v posmrtném životě a cyklické obnovy celého kosmu. Zkoumání postavy boha Sutecha představuje druhý ústřední prvek práce, která popisuje jeho nezastupitelnou funkci v životním cyklu kralování. Sutech je ukázán jako komplementární kosmický princip k Horovi, a zajišťuje trvalou... Keywords: Arnold van Gennep|Dér el-Medína|Hor|Kruhová kompozice|Liminalita|Maurice Bloch|Mýtus a rituál|Papyrus Chester Beatty I|Pozdně egyptská literatura|Přechodové rituály|Přechodové rituály (Starý Egypt)|Spor Hora a Sutecha|Staroegyptská kosmologie|Staroegyptská literatura|Staroegyptská mytologie|Staroegyptské náboženství|Staroegyptský královský úřad|Sutech|Victor Turner; Ancient Egyptian Cosmology|Ancient Egyptian Kingship|Ancient Egyptian Literature|Ancient Egyptian Mythology|Ancient Egyptian Religion|Arnold van Gennep|Contendings of Horus and Seth|Deir el-Medina|Horus|Late Egyptian Literature|Liminality|Maurice Bloch|Myth and Ritual|Papyrus Chester Beatty I|Ring Composition|Rites of Passage|Rites of Passage (Ancient Egypt)|Seth|Victor Turner Available in a digital repository NRGL Cesta Hora: Panství a přechodová symbolika ve Sporu Hora a Sutecha

The present study explores the Ancient Egyptian tale Contendings of Horus and Seth, attested from the New Kingdom Papyrus Chester Beatty I, with focus on its complex symbolism and relationship to ...

Čermák, Michal; Pehal, Martin; Spalinger, Anthony John; Goebs, Katja
Univerzita Karlova, 2024

Intravitální diagnostika neurodegenerativních onemocnění.
Baranová, Soňa; Holada, Karel; Kaňovský, Petr; Žáková, Dana
2024 - English Prionopathies, also called transmissible spongiform encephalopathies (TSE) and synucleinopathies are neurodegenerative diseases that are associated with the accumulation of misfolded proteins (prion and α-synuclein) mostly in the central nervous system. To this day, early and definite diagnosis remains unavailable during the patient's lifetime, mainly due to the absence of reliable biomarker which makes clinical diagnosis more challenging. Therefore, the gold standard in diagnostics remains direct post-mortem evaluation of misfolded proteins within brain tissue by western blot and immunohistochemistry. In the recent years, seeding amplification assays (SAAs) like Real-Time Quacking-Induced Conversion (RT-QuIC) emerged for ultra-sensitive ante-mortem diagnosis of neurodegenerative diseases. SAAs exploit ability of pathological misfolded proteins present in patient's samples to change the conformation and initiate aggregation of native recombinant protein substrate by prion-like seeding mechanism. In the presented dissertation thesis, we exploited second-generation RT-QuIC assay (55řC, 700 rpm, cycles of 1 min double-orbital shaking and 1 min incubation) utilizing recombinant hamster shortened prion protein (rHAPrP90-231) to evaluate prion seeding activity in post-mortem TSE (n=38) and non-TSE (n=30)... Prionopatie, taktiež nazývané transmisívne spongiformné encefalopatie (TSE), a synukleínopatie predstavujú skupinu neurodegeneratívnych ochorení, ktoré sú asociované s akumuláciou nesprávne zložených proteínov (prión a α-synukleín) prevažne v centrálnom nervovom systéme. Kvôli absencii spoľahlivého biomarkera je včasná a definitívna diagnostika počas života pacienta nedostupná. Zlatým štandardom preto zostáva priama post-mortem detekcia patologicky zložených proteínov v mozgovom tkanive pomocou western blotu a imunohistochémie. Avšak v posledných rokoch sa pre ultra-senzitívnu ante-mortem diagnostiku zaviedli metódy so spoločným názvom ʺseeding amplification assays (SSAs)ʺ akou je aj Real-Time Quacking-Induced Conversion (RT-QuIC). SAAs využívajú schopnosť patologicky zložených proteínov, ktoré sú prítomné v pacientskej vzorke, zmeniť konformáciu a iniciovať agregáciu monomérneho rekombinantného proteínu v substráte vďaka ʺprion-likeʺ mechanizmu. V prezentovanej dizertačnej práci sme analyzovali prión konvertujúcu aktivitu v post- mortem TSE (n=38) a non-TSE (n=30) vzorkách cerebrospinálneho moku (CSF) a korešpondujúcich vzoriek koží pomocou druhej generácie RT-QuIC metódy (55řC, 700 rpm, cykly 1 min dvoj orbitálneho trepania a 1 min inkubácia) s využitím rekombinantného skráteného priónového... Keywords: diagnostika; neurodegeneratívne ochorenia; prión; CJCH; α-synukleín; synukleínopatia; RT-QuIC; diagnosis; neurodegenerative diseases; prion; CJD; α-synuclein; synucleinopathy; RT-QuIC Available in a digital repository NRGL Intravitální diagnostika neurodegenerativních onemocnění.

Prionopathies, also called transmissible spongiform encephalopathies (TSE) and synucleinopathies are neurodegenerative diseases that are associated with the accumulation of misfolded proteins (prion ...

Baranová, Soňa; Holada, Karel; Kaňovský, Petr; Žáková, Dana
Univerzita Karlova, 2024

Význam různých zdrojů a sekvenančních protokolů při zvyšování přesnosti NGS analýz v diagnostických aplikacích
Kvapilová, Kateřina; Kozmik, Zbyněk; Piherová, Lenka; Slabý, Ondřej
2024 - English 1 ABSTRACT Continued advances in next-generation sequencing (NGS) technology, such as capacity, speed, and reduced cost per sequenced base, revolutionize personalized medicine and bring genomics into routine clinical practice. Nevertheless, NGS is still under rapid development, and the variability of sequencing protocols and validation procedures is one of its current bottlenecks. This thesis aimed to study the influence of different sample sources and NGS protocols (NGS library construction-sequencing-data analysis) on the accuracy of NGS analysis in diagnostic applications. In the first study, performed during the COVID-19 pandemic outbreak, we developed NGS protocols suitable for a whole genome analysis of the SARS-CoV-2 virus. Subsequently, in the second study, we examined the suitability of human saliva-derived gDNA for genomic/genetic analysis of selected variant types compared to traditional blood-derived gDNAusing validated NGS protocol and statistical comparison of the obtained data. Whole genome analysis of the SARS-CoV-2 genome was performed using two captured- based approaches and one amplicon-based approach to study the quality and effectivity of the respective NGS protocols. Synthetic controls were employed to verify the accuracy and specificity of the developed NGS protocols. We proved that... 1 Souhrn Neustálé pokroky v technologii sekvenování nové generace (NGS), jakými jsou kapacita, rychlost a snížené náklady na sekvenovaní, vedou k revoluci v personalizované medicíně, tím, jak postupně přináší genomiku do rutinní klinické praxe. NGS se stále rychle vyvíjí, avšak variabilita sekvenačních protokolů a validačních postupů je jedním z jeho problematických rysů. Cílem této práce bylo zhodnotit význam různých zdrojů vzorků a sekvenačních protokolů (od přípravy sekvenační knihovny-sekvenování-analýzi dat) pro zvýšení přesnosti NGS analýzy v diagnostických aplikacích. V první studii, provedené během vypuknutí pandemie COVID-19, jsme vyvinuli NGS protokoly vhodné pro analýzu celého genomu viru SARS-CoV-2. Následně jsme ve druhé studii zkoumali vhodnost lidské genomické DNA (gDNA) pocházející ze slin pro genomickou/genetickou analýzu vybraných variantních k tradiční gDNApocházející z krve pomocí validovaného NGS protokolu a statistického srovnání získaných dat. K ověření účinnosti sekvenačních protokolů pro analýzu celého genomu SARS-CoV-2 byly použity dva sekvenační přístupy založené na zachycení části genomu a jeden sekvenanční přístup založený na amplifikaci částí genomů. K ověření přesnosti a specifičnosti vyvinutých NGS protokolů byly použity syntetické kontroly. Prokázali jsme, že kvantifikace... Keywords: NGS; WGS; WES; analýza variant; slinná gDNA; validace NGS protokolu; NGS; WGS; WES; genomics variant analysis; saliva-derived gDNA; validation guideline Available in a digital repository NRGL Význam různých zdrojů a sekvenančních protokolů při zvyšování přesnosti NGS analýz v diagnostických aplikacích

1 ABSTRACT Continued advances in next-generation sequencing (NGS) technology, such as capacity, speed, and reduced cost per sequenced base, revolutionize personalized medicine and bring genomics into ...

Kvapilová, Kateřina; Kozmik, Zbyněk; Piherová, Lenka; Slabý, Ondřej
Univerzita Karlova, 2024

Za zvukem literatury. Zkoumání inherentního hlasu literárních děl
Navrátilová, Eva; Bílek, Petr; Kaplický, Martin; Kroča, David
2024 - English Charles University Faculty of Arts Department of Czech and Comparative Literature Philology (P7310) - General and Comparative Literature (P0232D090050) Abstract (EN) Towards the Sound of Literature Examining the Inherent Voice of Literary Works Za zvukem literatury Zkoumání inherentního hlasu literárních děl Mgr. & MgA. Eva Navrátilová Prague, 2024 Supervisor: Prof. PhDr. Petr A. Bílek, CSc. The dissertation strives for a comprehensive and at the same time universal con- cept of the topic of sound and literature. It is done so in various ways and in diverse contexts. The text relies on the inseparability of the auditory perception from the reading process itself (with certain exceptions, of course), both in the sense of un- derstanding the content through its sound, and in perceiving the sound structure of the text as the reader's individual implicit and immediate interpretation of the work. The concept of sound is in the vast majority of cases specified to the phenomenon of voice and speech, i.e. sounds that are eminently human. For the sake of systematic argumentation, the dissertation is divided into three parts. The first one in a form of a "cycle" deals with basic literary-theoretical concepts such as narrator and speech of the characters, to which actual speech is added as well as the concept of... Univerzita Karlova Filozofická fakulta Ústav české literatury a komparatistiky Filologie (P7310) - Obecná a srovnávací literatura (P0232D090050) Abstrakt (CZ) Za zvukem literatury Zkoumání inherentního hlasu literárních děl Towards the Sound of Literature Examining the Inherent Voice of Literary Works Mgr. & MgA. Eva Navrátilová Praha, 2024 Školitel: Prof. PhDr. Petr A. Bílek, CSc. Disertace se snaží o komplexní a zároveň univerzální pojetí tématu zvuku a lite- ratury. Činí tak různými způsoby a v rozmanitých kontextech. Text se spoléhá na neoddělitelnost sluchového vjemu od samotného procesu čtení (samozřejmě až na ur- čité výjimky) a to jak ve smyslu porozumění obsahu skrze jeho ozvučení, tak při pojímání zvukové struktury textu jako čtenářova individuální implicitního a bezpro- střední výkladu díla. Pojem zvuku je v naprosté většině případů zúžen na fenomén hlasu a řeči, tj. zvuků výsostně lidských. Pro systematičnost argumentace je disertace rozdělena do tří částí. První se ve formě "cyklu" vyrovnává se základními literárně-teoretickými pojmy jako vypravěč a řeč postav, ke kterým se přidává skutečná řeč a také pojem ticha v literatuře. Druhá část je pojata jako čtyři epizodní ozvěny prvotního nástinu "cyklu" a jedná se o dílčí separované náměty související se zvukem a literaturou, která dotvářejí... Keywords: zvuk v literatuře|proces čtení|hlas|ozvěna|čtení nahlas|tiché čtení|audiální potenciál|naratologie|psycholingvistika|multioborovost v literatuře; sound in literature|process of reading|voice|echo|oral reading|silent reading|auditory potential|narratology|psycholinguistics|multidisciplinarity in literature Available in a digital repository NRGL Za zvukem literatury. Zkoumání inherentního hlasu literárních děl

Charles University Faculty of Arts Department of Czech and Comparative Literature Philology (P7310) - General and Comparative Literature (P0232D090050) Abstract (EN) Towards the Sound of Literature ...

Navrátilová, Eva; Bílek, Petr; Kaplický, Martin; Kroča, David
Univerzita Karlova, 2024

Proč Romové nejsou teroristé: Přehodnocení sporných faktorů radikalizace
Kocmanová, Markéta; Aslan, Emil; Droogan, Julian; Lakhani, Suraj
2024 - English Research on radicalisation is characterised by an excessive emphasis on risk factors that lead to manifestations of different forms of extreme political violence. This dissertation presents the results of research focused on factors that make communities resilient against behavioural radicalisation. The empirical basis draws on extensive data from 139 research participants from six countries, obtained primarily from in-depth interviews and other ethnographic data collection techniques. Utilising Grounded Theory in Ethnography as the overarching methodological framework, I provide robust empirical evidence to build a unique case of group resilience against radicalisation among the Romani ethnic group. I identified five main factors of resilience that complement each other and work as brakes on behavioural radicalisation in mutual synergy. The factors of resilience are grounded in the organisational ontology of the group, their strong sense of belonging to a community, their propensity to avoid conflict, their ability to forgive rather than seek revenge, and a category of complex flexibility that includes present-time orientation, effective emotional regulation, and cognitive adaptability. I also identify risk factors related to potential radicalisation in the community, mainly the risk of continued... Výzkum radikalizace se vyznačuje nadměrným důrazem na rizikové faktory, které vedou k projevům různých forem extrémního politického násilí. Tato disertační práce představuje výsledky výzkumu zaměřeného na faktory, které činí komunity odolnými vůči behaviorální radikalizaci. Empirický základ vychází z rozsáhlých dat od 139 účastníků výzkumu ze šesti zemí, získaných především z hloubkových rozhovorů a dalších etnografických technik sběru dat. Jako obecný metodologický rámec využívám postupů zakotvené teorie v etnografii, která umožňuje na robustních empirických základech vystavět přesvědčivou a unikátní případovou studii skupinové odolnosti vůči radikalizaci mezi romskou etnickou menšinou. Identifikovala jsem pět hlavních faktorů odolnosti, které se vzájemně doplňují a synergicky působí jako brzda proti behaviorální radikalizaci. Faktory odolnosti spočívají v organizační ontologii skupiny, silném pocitu sounáležitosti s komunitou, sklonu vyhýbat se konfliktu, schopnosti odpouštět spíše než hledat pomstu a kategorii komplexní flexibility, která zahrnuje orientaci na přítomný okamžik, účinnou emoční regulaci a kognitivní adaptabilitu. Identifikuji také rizikové faktory související s potenciální radikalizací v komunitě, které spatřuji především v pokračující erozi tradičních romských hodnot. Keywords: kvalitativní rozhovory; marginalizované skupiny; násilný extremismus; odolnost vůči radikalizaci; radikalizace; terénní výzkum; terorismus; zakotvená teorie; Fieldwork; Grounded Theory; Marginalised Groups; Qualitative Interviews; Radicalisation; Resilience Against Radicalisation; Violent Extremism; Terrorism Available in a digital repository NRGL Proč Romové nejsou teroristé: Přehodnocení sporných faktorů radikalizace

Research on radicalisation is characterised by an excessive emphasis on risk factors that lead to manifestations of different forms of extreme political violence. This dissertation presents the ...

Kocmanová, Markéta; Aslan, Emil; Droogan, Julian; Lakhani, Suraj
Univerzita Karlova, 2024

Propojení transkripční regulace lipidového metabolismu a katastrofické mitózy u poltivé kvasinky
Marešová, Anna; Převorovský, Martin; Čáp, Michal; Veverka, Václav
2024 - English Linking regulation of lipid metabolism with nuclear division has recently become a thoroughly investigated phenomenon. It has been shown that an undisturbed lipid metabolism is required for proper mitotic division from yeasts to mammals. In my doctoral project, I focused on the transcriptional regulation of lipid metabolism genes with respect to mitotic fidelity in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe. Cbf11 and Mga2 are two transcriptional regulators of lipid metabolism genes. For a long time, it was assumed that they act as two independently functioning units. However, we have identified a novel regulatory partnership between Cbf11 and Mga2. Our results show that Cbf11 and Mga2 work closely together. In addition to regulating lipid metabolism, Cbf11 was known to be involved in cell cycle progression and a range of other processes. We have now determined that all known functions of Cbf11 require its canonical DNA-binding ability. Interestingly, we have identified novel roles for both Cbf11 and Mga2 and found that Mga2 mirrors the functions of Cbf11, including cell cycle control. Furthermore, we have shown that lipid metabolism has a pronounced impact on chromatin structure and the proper regulation of gene expression, and we have suggested how fatty acid synthesis contributes to mitotic... Propojení regulace metabolismu lipidů s jaderným dělením se v poslední době stalo předmětem intenzivního studia. Ukázalo se, že pro správné mitotické dělení je nutný nenarušený metabolismus lipidů, a to od kvasinek až po savce. Ve svém doktorském projektu jsem se zaměřila na transkripční regulaci genů lipidového metabolismu s ohledem na průběh mitózy u poltivé kvasinky Schizosaccharomyces pombe. Cbf11 a Mga2 jsou dva transkripční regulátory genů metabolismu lipidů. Dlouho se předpokládalo, že působí jako dvě nezávisle fungující jednotky. My jsme však identifikovali nové regulační partnerství mezi Cbf11 a Mga2. Naše výsledky ukazují, že Cbf11 a Mga2 spolu úzce spolupracují. Kromě regulace metabolismu lipidů bylo známo, že se Cbf11 podílí na regulaci průchodu buněčným cyklem a na řadě dalších procesů. Nyní jsme zjistili, že všechny známé funkce proteinu Cbf11 vyžadují jeho schopnost kanonické vazby na DNA. Identifikovali jsme také nové role pro Cbf11 i Mga2 a zjistili jsme, že Mga2 zrcadlí funkce Cbf11, včetně regulace buněčného cyklu. Dále jsme ukázali, že metabolismus lipidů má výrazný vliv na strukturu chromatinu a správnou regulaci genové exprese, a popsali jsme, jak syntéza mastných kyselin přispívá ke správnému průběhu mitózy. Kromě toho jsme popsali nová propojení mezi metabolismem lipidů a... Keywords: Cbf11; Mga2; transkripční faktory; vazba na DNA; metabolismus lipidů; uzavřená mitóza; integrita genomu; poltivá kvasinka; Cbf11; Mga2; transcription factors; binding to DNA; lipid metabolism; closed mitosis; genome integrity; fission yeast Available in a digital repository NRGL Propojení transkripční regulace lipidového metabolismu a katastrofické mitózy u poltivé kvasinky

Linking regulation of lipid metabolism with nuclear division has recently become a thoroughly investigated phenomenon. It has been shown that an undisturbed lipid metabolism is required for proper ...

Marešová, Anna; Převorovský, Martin; Čáp, Michal; Veverka, Václav
Univerzita Karlova, 2024

Metamorfóza gabroidních hornin tepelsko-barrandienské oblasti
Holá, Petra; Racek, Martin; Janák, Marian; Collett, Stephen
2024 - English In the thesis I focuse on petrographic, geochronological and geochemical characterization of gabbroic rocks to provide constrains on the Cambro-Ordovician and Variscan evolution of the Teplá-Barrandian Unit in Bohemian Massif situated in Central Europe. The studied rocks occur in two areas of interest in the western margin of the Teplá-Barrandian: (1) along the contact of the Teplá Crystalline and Mariánské Lázně Complexes in the north-western part of the TBU, (2) in area between the Domažlice Crystalline Complex and Kdyně-Neukirchen Massif (KNM) in the south-western part of the Teplá-Barrandian Unit. Detailed petrological study together with U-Pb dating of representative samples allow to characterize three events (I-III) defined by different textural position of analyses zircon and titanite grains. The oldest (Cambrian) event I is recorded in isolated metamictized matrix-hosted grains that yield similar mean age of c. 500-510 Ma in both areas. The second Cambro-Ordovician event II was connected with formation of tiny zircon grains forming rim around ilmenite at ~480-490 Ma due to diffusion reaction of ilmenite and surrounding silicate matrix enabled by increase of temperature. The youngest (Variscan) event III is associated with the formation of zircon corona around baddeleyite at ca. 360-380 Ma.... Český abstrakt V této disertační práci se zabývám petrologickou, geochronologickou a geochemickou charakteristikou gabroidních hornin v kontextu kambro-ordovického a variského vývoje tepelsko-barrandienské jednotky, která je součástí Českého masivu. Studované horniny se vyskytují ve dvou zájmových oblastech podél západního okraje tepelsko-barrandienské jednotky: 1. oblast se nachází na kontaktu tepelského krystalinika a mariánsko-lázeňského komplexu a 2. zájmová oblast zabírá jiho-západní cíp tepelsko-barrandienské jednotky a táhne se z neukirchen-kdyňského masivu přes domažlické krystalinikum. Na základě detailní petrologické charakteristiky kombinované s datováním metodou uran-olovo aplikované na zirkony a monazity byly definovány tři etapy (I-III) vývoje gabbroidních hornin, kdy každá etapa je spojena s jinou texturní pozicí datovaného zirkonu, případně titanitu. Nejstarší událost I je kambrického stáří, v tomto případě byly průměrné věky c. 500-510 Ma stanoveny pro velká izolovaná zrna zirkonů nacházejících se v matrix. Druhá datovaná II událost ukazuje kambro-ordovické stáří (~480-490 Ma) a je spojena s výskytem malých zrnek zirkonu lemujících ilmenit. Vznik těchto malých zrnek tvořících lem kolem ilmenitu je výsledkem difúzní reakce mezi ilmenitem a okolní silikátovou matrix, kdy mobilita zirkonia je... Keywords: metamorfóza; gabro; metasomatóza; korony; metamorphism; gabbro; metasomatism; corona Available in a digital repository NRGL Metamorfóza gabroidních hornin tepelsko-barrandienské oblasti

In the thesis I focuse on petrographic, geochronological and geochemical characterization of gabbroic rocks to provide constrains on the Cambro-Ordovician and Variscan evolution of the ...

Holá, Petra; Racek, Martin; Janák, Marian; Collett, Stephen
Univerzita Karlova, 2024

Vliv obezity a metabolických onemocnění na molekulární vlastnosti kmenových buněk kostní dřeně ve vztahu k metabolismu kosti a tukové tkáně
Beňová, Andrea; Tencerová, Michaela; Kuda, Ondřej; Rauner, Martina
2024 - English Obesity and diabetes are metabolic complications associated with higher accumulation of fat in periphery and bones leading to higher fracture risk. Several approaches have been introduced in the treatment of obesity and diabetes - non-pharmacological (e.g. dietary intervention or physical activity) and pharmacological (e.g. metformin, thiazolidinediones (TZDs)) to improve metabolic complications. Dietary intervention including omega-3 polyunsaturated fatty acid (PUFA) supplementation showed multiple beneficial effects on bone parameters and bone marrow skeletal stem cells (BMSC) properties in animal and clinical studies. However, this was not well studied in obesogenic conditions. Further, TZDs (e.g. pioglitazone, rosiglitazone) are very effective insulin sensitizers but with several side effects (increased bone marrow adiposity (BMA) with higher fracture risk) due to their mechanism of action. MSDC-0602K, a novel TZD analog, has been developed to minimize side effects on fat metabolism. However, its impact on bone phenotype and bone marrow skeletal stem cells BMSCs in relation to obesity has not been intensively studied. Thus, in my PhD thesis I investigated both approaches using high-fat diet (HFD)-induced obesity mouse model. 8 weeks old male mice were fed with HFD or HFD supplemented with... Obezita a diabetes jsou metabolické komplikace spojené s vyšší akumulací tuku v periferii a kostech, mající za následek zvýšené riziko fraktury. Při léčbě obezity a diabetu bylo zavedeno několik přístupů - nefarmakologických (např. dietní intervence nebo fyzická aktivita) a farmakologických (např. metformin, tiazolidindiony (TZD)) ke snížení metabolických komplikací. Dietní intervence včetně suplementace omega-3 polynenasycenými mastnými kyselinami (PUFA) ve studiích na zvířatech a v klinických studiích prokázala mnohonásobné příznivé účinky na kostní parametry a vlastnosti kmenových buněk kostní dřeně (BMSC). To však nebylo dobře prozkoumáno v obezogenních podmínkách. Dále jsou TZD (např. pioglitazon, rosiglitazon) velmi účinnými sensibilizátory inzulinu, ale s několika vedlejšími účinky (zvýšená adipozita kostní dřeně (BMA) s vyšším rizikem fraktur) v důsledku jejich mechanismu účinku. MSDC-0602K, nový analog TZD, byl vyvinut pro minimalizaci vedlejších účinků na metabolismus tuků. Jeho vliv na kostní fenotyp a fenotyp BMSC ve vztahu k obezitě však nebyl intenzivně studován. V disertační práci jsem zkoumala oba přístupy pomocí myšího modelu dietou indukované obezity (HFD). Samci myší ve věku 8 týdnů byli krmeni HFD nebo HFD doplněným omega- 3 PUFA, MSDC-0602K nebo pioglitazonem po dobu 2 měsíců,... Keywords: Obezitou indukovaná křehkost kostí; Omega-3 polynenasycené mastné kyseliny; Analog thiazolidindionu MSDC-0602K; Kmenové buňky kostní dřeně; Buněčný metabolismus; Tuková tkáň kostní dřeně; Mikrostruktura kosti; Obesity-induced bone fragility; Omega-3 polyunsaturated fatty acids; Thiazolidinedione analog MSDC-0602K; Bone marrow stromal cells; Cellular metabolism; Bone marrow adipose tissue; Bone microstructure Available in a digital repository NRGL Vliv obezity a metabolických onemocnění na molekulární vlastnosti kmenových buněk kostní dřeně ve vztahu k metabolismu kosti a tukové tkáně

Obesity and diabetes are metabolic complications associated with higher accumulation of fat in periphery and bones leading to higher fracture risk. Several approaches have been introduced in the ...

Beňová, Andrea; Tencerová, Michaela; Kuda, Ondřej; Rauner, Martina
Univerzita Karlova, 2024

Funkční analýza role proteinů z Bcl-2 rodiny nejen v mitochondriálním metabolismu
Sovilj, Dana; Anděra, Ladislav; Mráček, Tomáš; Živný, Jan
2024 - English (CZ) Od jejich prvotní identifikace v háďátku C. elegans a také v lidských buňkách před více než 30 lety jsou proteiny z rodiny Bcl-2 spojovány s indukcí, regulací a potlačením mitochondriální apoptotické signalizace, ale také se mohou uplatňovat při modulaci neapoptotických signálních dráh. V této studii jsme si stanovili za hlavní cíl rozšířit stávající znalosti o neapoptotických rolích hlavních proapoptotických proteinů z Bcl-2 rodiny, BAX a BAK, zejména pak na jejich roli v buněčném metabolismu. Pomocí genové editace využitím CRISPR/Cas9 jsme eliminovali expresi těchto proteinů v lidských nádorových buňkách různého tkáňového původu a v těchto Bax/Bak- deficitních buňkách jsme primárně analyzovali mitochondriální respiraci a buněčnou glykolýzu. Zatímco eliminace exprese Bax a Bak neměla žádný patrný vliv na glykolýzu ve všech testovaných buněčných liniích, v závislosti na buněčném typu modulovala mitochondriální respiraci. Eliminace exprese Bax a Bak v buňkách rakoviny tlustého střeva HCT-116 neměla vliv na mitochondriální respiraci, ale zjevně ovlivnila mitochondriální respiraci v Bax/Bak-deficitních buňkách odvozených od glioblastomu (U87) a lymfomů (HBL-2, UPF1H, UPF1G). Bax/Bak -/- buňky U87 významně upregulovaly mitochondriální respiraci a akcelerovaly svou proliferaci a také nádorový růst... Keywords: Bcl-2 proteiny; metabolismus; apoptóza; mitochondrie; respirace; glycolýza; bunečná smrt; Bcl-2 proteins; metabolism; apoptosis; mitochondria; respiration; glycolysis; cell death Available in a digital repository NRGL Funkční analýza role proteinů z Bcl-2 rodiny nejen v mitochondriálním metabolismu

(CZ) Od jejich prvotní identifikace v háďátku C. elegans a také v lidských buňkách před více než 30 lety jsou proteiny z rodiny Bcl-2 spojovány s indukcí, regulací a potlačením mitochondriální ...

Sovilj, Dana; Anděra, Ladislav; Mráček, Tomáš; Živný, Jan
Univerzita Karlova, 2024

Gravitační zdroje v blízkosti černých děr
Kotlařík, Petr; Semerák, Oldřich; Hackmann, Eva; Mach, Patryk
2024 - English Black holes are among the most intriguing objects in the Universe. When isolated and stationary, they are described by the simple Kerr(-Newman) metric. However, astro- physical black holes are seldom isolated; in fact, we can only know of them through their interaction with the environment. Consequently, the actual gravitational field differs from the Kerr(-Newman) ideal. This thesis investigates the influence of the environment on the gravitational field of black holes. In the stationary (or static) and axially symmet- ric setting, we derive several analytical models describing a black hole surrounded by a disc or ring. The static problem is solved exactly, yielding the metric in closed form in some cases. Besides the basic physical properties of the results, we analyze the scalar- field quasinormal modes in such a deformed black-hole geometry. Our findings indicate a universal behaviour of the QNM response, which may help in distinguishing the envi- ronmental effects from those of modified theories of gravity. In the stationary case, we employ perturbation theory in the tetrad formalism. By introducing the Debye potential, we find the electromagnetic field of a ring source on the rotating black-hole background. We conclude with a discussion of similar treatment of gravitational perturbations. 1 Černé díry patří mezi nejzajímavější objekty ve vesmíru. Jsou-li izolované a stacionární, jejich gravitační pole je popsáno jednoduchou Kerrovou(-Newmanovou) metrikou. As- trofyzikální černé díry však nebývají izolované; ve skutečnosti se o nich dozvídáme právě prostřednictvím jejich interakce s okolím. Gravitační pole se tím pádem liší od Kerrova(- Newmanova). Tato práce zkoumá vliv okolní hmoty na gravitační pole černých děr. Ve stacionárním (nebo statickém) a axiálně symetrickém případě odvodíme několik analyt- ických modelů popisujících černou díru obklopenou diskem nebo prstencem. Statickou "superpozici" takových zdrojů vyřešíme přesně, v některých případech dokonce odvodíme metriku v uzavřeném tvaru. Kromě základních fyzikálních vlastností výsledných polí an- alyzujeme též kvazinormální módy (QNM) skalárního pole v takové geometrii. Výsledky naznačují jisté univerzální chování QNM, což může pomoci odlišit efekty způsobené okolní hmotou od efektů plynoucích z modifikovaných teorií gravitace. Ve stacionárním pří- padě použijeme perturbační teorii v tetrádovém formalismu. Díky zavedení Debyeova potenciálu nalezneme elektromagnetické pole prstence kolem rotující černé díry. Práci zakončíme podrobným popisem analogického přístupu ke gravitačním perturbacím. 1 Keywords: černé díry|akreční disky|přesná řešení|perturbační teorie|kvazinormální módy|Debyeův potenciál; black holes|accretion discs|exact solutions|perturbation theory|quasinormal modes|Debye potential Available in a digital repository NRGL Gravitační zdroje v blízkosti černých děr

Black holes are among the most intriguing objects in the Universe. When isolated and stationary, they are described by the simple Kerr(-Newman) metric. However, astro- physical black holes are seldom ...

Kotlařík, Petr; Semerák, Oldřich; Hackmann, Eva; Mach, Patryk
Univerzita Karlova, 2024