Binding properties of boar seminal plasma proteins in the reproduction process
Jonáková, Věra; Maňásková, Pavla; Liberda, J.; Tichá, M.
2005 - anglický Boar seminal plasma proteins (spermadhesins and DQH protein)bind the sperm surface at ejaculation. binding of sperm to oviductal epithelial cells and to the glycoproteins of zona pellucida are mediated by the protein-saccharide (lectin-like)interactions.These intractions play role in the formation of sperm oviductal reservoir, in the release of capacitated sperm from the surface of oviduct and in sperm-zona pellucida interaction. Proteiny kančí semenné plasmy (spermadhesiny a DQH protein) se váží na povrch spermie při ejakulaci. Vazba spermie k epiteliálním buňkám oviduktu a ke glykoproteinům zony pellucidy je zprostředkována protein-sacharidovými interakcemi (lektin-like).Tyto interakce hrají roli v tvorbě oviduktálního rezervoáru spermií, v uvolnění kapacitovaných spermií z povrchu oviduktu a ve vazbě spermie na zonu pellucidu vajíčka. Klíčová slova: seminal plasma proteins; reproduction; binding properties Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Binding properties of boar seminal plasma proteins in the reproduction process

Boar seminal plasma proteins (spermadhesins and DQH protein)bind the sperm surface at ejaculation. binding of sperm to oviductal epithelial cells and to the glycoproteins of zona pellucida are ...

Jonáková, Věra; Maňásková, Pavla; Liberda, J.; Tichá, M.
Ústav molekulární genetiky, 2005

The origin of boar seminal plasma proteins
Maňásková, Pavla; Kyselová, Vendula; Tichá, M.; Jonáková, Věra
2005 - anglický Spermadhesins were detected with their antibodies in boar epididymal fluid, but DQH and beta-microseminoprotein were not. Indirect immunofluorescence technique was employed to determine the distribution of seminal plasma proteins on tissue sections of the reproductive organs. The mRNA of the DQH was found only in seminal vesicles, not in the epididymis, and the mRNA of beta-MSP in testis, seminal vesiclas and prostate. Spermadhesiny byly nalezeny pomocí svých protilátek v kančí epididymální tekutině, ale DQH a beta microseminoprotein nikoli. Nepřímá imunofluorescenční technika byla použita pro odhalení distribuce proteinů semenné plasmy na řezech tkání kančích reprodukčních orgánů. mRNA beta-MSP v testes, semenných vacích a prostatě. Klíčová slova: seminal plasma proteins; boar reproductive organs Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. The origin of boar seminal plasma proteins

Spermadhesins were detected with their antibodies in boar epididymal fluid, but DQH and beta-microseminoprotein were not. Indirect immunofluorescence technique was employed to determine the ...

Maňásková, Pavla; Kyselová, Vendula; Tichá, M.; Jonáková, Věra
Ústav molekulární genetiky, 2005

Regulation of ribosome synthesis in bacteria
Krásný, Libor
2005 - anglický Rapidly growing bacteria need a high number of ribosomes to satisly the cells need for increased translation. Starving bacteria need a low number of ribosomes to limit energy expenditure.The number of ribosomes is regulated at the level of ribosomal RNA (rRNA) transcription. Rychle rostoucí bakterie potřebují velké množství ribozomů pro pokrytí potřeby zvýšené buněčné translace. Bakterie v podmínkách omezené výživy mají potřebu ribozomů nízkou kvůli šetření energií. Počet ribozomů je regulován na úrovni transkripce ribozomální RNA (rRNA). Klíčová slova: ribosome synthesis; bacteria Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Regulation of ribosome synthesis in bacteria

Rapidly growing bacteria need a high number of ribosomes to satisly the cells need for increased translation. Starving bacteria need a low number of ribosomes to limit energy expenditure.The number of ...

Krásný, Libor
Ústav molekulární genetiky, 2005

Carbonic anhydrase IX (CA IX) mediates tumor cell interactions with microenvironment
Závada, Jan; Závadová, Zuzana
2004 - anglický CA IX zprostředkuje vzájemné reakce nádorových buněk s mikroprostředím několika způsoby: je enzymaticky aktivní, reguluje pH a řídí přenos iontů z/do buňky; CA IX je také adhezivní molekulou zprostředkující mezibuněčný kontakt; slouží jako senzor pH a účastní se invaze a metastáze nádorů CA IX mediates interaction between tumor cells and microenvironment in several ways: it is enzymatically active, it regulates pH and drives ion transport from/to the cell; CA IX is also an adhesion molecule, mediating cell-cell contact; it serves as a pH sensor and it participates in tumor invasion and metastasis Klíčová slova: cancer biology; microenvironmnet; carbonic anhydrase IX; nádorové buňky; buňky Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Carbonic anhydrase IX (CA IX) mediates tumor cell interactions with microenvironment

CA IX zprostředkuje vzájemné reakce nádorových buněk s mikroprostředím několika způsoby: je enzymaticky aktivní, reguluje pH a řídí přenos iontů z/do buňky; CA IX je také adhezivní molekulou ...

Závada, Jan; Závadová, Zuzana
Ústav molekulární genetiky, 2004

Structural Studies of anti-CA IX Monoclonal Antibody M75 Fab Fragment in Complex with its Epitope Peptide
Mader, Pavel; Štouračová, Renata; Brynda, Jiří; Závada, Jan
2004 - anglický CA IX is a cell surface protein that exerts capacity of binding cell surface receptors, and is associated with several types of human carcinomas. Monoclonal antibody M75 recognizes specifically an epitope identified as six repeats of amino acid sequence PGEEDLP, localized in the proteoglycan like domain of CA IX. Structural study of the M75 Fab fragment in complex with its epitope peptide PGEEDLPGEEDL is presented. Klíčová slova: CAIX; antibody; structure Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Structural Studies of anti-CA IX Monoclonal Antibody M75 Fab Fragment in Complex with its Epitope Peptide

CA IX is a cell surface protein that exerts capacity of binding cell surface receptors, and is associated with several types of human carcinomas. Monoclonal antibody M75 recognizes specifically an ...

Mader, Pavel; Štouračová, Renata; Brynda, Jiří; Závada, Jan
Ústav molekulární genetiky, 2004

A Phenylnorstatine Inhibitor Binding to HIV-1 Protease: Geometry, Protonation and Subsite-Pocket Interactions Analyzed at Atomic Resolution
Brynda, Jiří; Řezáčová, Pavlína; Fábry, Milan; Hořejší, Magdalena; Štouračová, Renata; Sedláček, Juraj; Souček, Milan; Hradilek, Martin; Lepšík, Martin; Konvalinka, Jan
2004 - anglický The x-ray structure of a complex of HIV-1 protease (PR) with a phenylnorstatine inhibitor Z-Pns-Phe-Glu-Glu-NH2 has been determined at 1.03 A, the highest resolution so far reported for any HIV PR complex. The inhibiot shows subnanomolar Ki values for both the wild-type PR and the variant representing one of the most common mutations linked to resistance development. The structure displays a unique pattern of hydrogen bonding to the two catalytic aspartate residues. The high resolution permints to assess the donor/acceptor relations of this hydrogen bonding and to indicate a proton shared by the two catalytic residues. Structural mechanism for the unimpaired inhibition of the protease Val82Ala mutant is also suggested, based on energy calculations and analyses Byla určena rentgenová struktura komplexu proteázy HIV-1 (PR) s fenylnorstatinovým inhibitorem Z-Pns-Phe-Glu-Glu-NH(2) při rozlišení 1,03 A, nejvyšším rozlišení, které bylo doposud uvedeno pro kterýkoli komplex HIV PR. Tento inhibitor vykazuje subnanomolární hodnoty K(i) jak pro PR divokého typu, tak pro variantu představující jednu z nejběžnějších mutací spojenou s vývojem rezistence. Struktura obsahující fenylnorstatinovou část chirality (2R,3S) vykazuje jedinečný obraz vazby vodíkových můstků na dva katalytické aspartátové zbytky. Toto vysoké rozlišení umožňuje zjistit donorové a akceptorové vztahy těchto vodíkových můstků a určit proton sdílený oběma katalytickými zbytky. Je také navržen strukturální mechanismus nenarušené inhibice mutanty proteázy Val82Ala založený na energetických výpočtech a analýzách Klíčová slova: inhibitor; HIV protease; atomic resolution Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. A Phenylnorstatine Inhibitor Binding to HIV-1 Protease: Geometry, Protonation and Subsite-Pocket Interactions Analyzed at Atomic Resolution

The x-ray structure of a complex of HIV-1 protease (PR) with a phenylnorstatine inhibitor Z-Pns-Phe-Glu-Glu-NH2 has been determined at 1.03 A, the highest resolution so far reported for any HIV PR ...

Brynda, Jiří; Řezáčová, Pavlína; Fábry, Milan; Hořejší, Magdalena; Štouračová, Renata; Sedláček, Juraj; Souček, Milan; Hradilek, Martin; Lepšík, Martin; Konvalinka, Jan
Ústav molekulární genetiky, 2004

Interakce povrchových proteinů spermií v reprodukčním procesu
Jonáková, Věra; Kraus, Marek; Maňásková, Pavla; Liberda, J.; Tichá, M.
2004 - český Savčí reprodukce zahrnuje vysoce regulované biochemické interakce mezi komplementárními molekulami lokalizovanými na povrchu spermie a vajíčka a rovněž s látkami přítomnými v přirozeném okolí obou gamet. Proteiny kančí semenné plasmy AQN, AWN spermadhesiny a DQH protein, které jsou vázány na spermii během ejakulace, hrají důležitou roli v procesech reprodukce. Vazba spermie k buňkám oviduktu, rozpoznávání gamet a vazba spermie ke glykoproteinové síti zony pellucidy je zprostředkována protein-sacharidovou interakcí, lektinovou vazbou. Přirozenou funkční formou proteinů kančí semenné plasmy se zdají být jejich agregované formy, při kterých se uplatňuje další typ interakce (protein-protein). Proteinové agregáty tvoří povrchovou vrstvu spermie a její remodelování v samičím reprodukčním traktu je důležité během kapacitace spermie a pro primární vazbu spermie na vajíčko. Mammalian fertilization includes highly regulated biochemical interactions between complementary molecules located on the surfaces of both gametes as well as those present in the natural environment of the gametes. Boar seminal plasma proteins AQN, AWN spermadhesins and DQH protein that are bound to the sperm at ejaculation play important role in the reproduction process. Binding of sperm to epithelial cells, recognition of gametes and binding of sperm to glycoprotein of zona pellucida are mediated by protein-saccharide interaction, lektin-type interaction. Another type of interaction (protein-protein) participates in the formation of aggregated forms, which seem to be the natural functional forms of seminal plasma proteins. Protein aggregates form the sperm coating layers and their re-modeling in the female reproductive tract is imporatnt for the sperm capacitation and for the primary binding of spermto the ovum. Klíčová slova: sperm surface proteins; lectin-like interaction; mammalian reproduction; bílkoviny; polygrafie Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Interakce povrchových proteinů spermií v reprodukčním procesu

Savčí reprodukce zahrnuje vysoce regulované biochemické interakce mezi komplementárními molekulami lokalizovanými na povrchu spermie a vajíčka a rovněž s látkami přítomnými v přirozeném okolí obou ...

Jonáková, Věra; Kraus, Marek; Maňásková, Pavla; Liberda, J.; Tichá, M.
Ústav molekulární genetiky, 2004

Characterization of the clones derived from the HT29 colorectal cancer cell line
Šloncová, Eva; Kučerová, Dana; Vojtěchová, Martina; Turečková, Jolana; Tuháčková, Zdena; Sovová, Vlasta
2004 - anglický During our analysis of HT29 cell line we established several clones, which differed in the expression of some molecular markers, e.g. phosphorylation of Src protein, PKCbeta2 activity, CEA-CAM1 expression and in the response to the differentiating effect of sodium butyrate, indicated by activity of alkaline phosphatase Během analýzy buněčné linie HT29 jsme připravili několik stabilních klonů, které se lišily expresí některých molekulárních markerů, např. fosforylací proteinu Src, aktivitou PKCbeta2, expresí CEA-CAM1 a odpovědí na diferenciační účinek butyrátu sodného Klíčová slova: colorectal carcinoma cells; differentiation Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Characterization of the clones derived from the HT29 colorectal cancer cell line

During our analysis of HT29 cell line we established several clones, which differed in the expression of some molecular markers, e.g. phosphorylation of Src protein, PKCbeta2 activity, CEA-CAM1 ...

Šloncová, Eva; Kučerová, Dana; Vojtěchová, Martina; Turečková, Jolana; Tuháčková, Zdena; Sovová, Vlasta
Ústav molekulární genetiky, 2004

Protilátky proti receptorům spřaženým s G-proteinem
Hýblová, D.; Veselský, Leopold; Velek, Jiří; Železná, Blanka
2004 - český Dvě protilátky proti angiotensinovému receptoru AT2 připravené proti dvěma krátkým sekvencím rozeznávaly receptor na Western blotech membrán různých tkání potkana a myši, v nichž se AT2 exprimuje. Obě protilátky rozeznávaly tytéž bílkoviny a po vysycení příslušným antigenním peptidem tuto schopnost ztratily. Jedna protilátka se osvědčila při imunoprecipitaci receptoru. Two antibodies against angiotensin receptor AT2 prepared against two short sequences recognized the receptor on Western blots of several rat and mouse tissues where AT2 is expressed. Both antibodies recognized the identical proteins; they lost this property after immunoabsorption with their antigen peptides. With one antibody, we were able to immunoprecipitate the receptor. Klíčová slova: angiotensin receptor antibody; protilátky; bílkoviny Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Protilátky proti receptorům spřaženým s G-proteinem

Dvě protilátky proti angiotensinovému receptoru AT2 připravené proti dvěma krátkým sekvencím rozeznávaly receptor na Western blotech membrán různých tkání potkana a myši, v nichž se AT2 exprimuje. Obě ...

Hýblová, D.; Veselský, Leopold; Velek, Jiří; Železná, Blanka
Ústav molekulární genetiky, 2004

Different expression of house-keeping genes by quantitative real time RT-PCR
Ullmannová, V.; Truksa, Jaroslav; Haškovec, C.; Kovář, Jan
2003 - český Klíčová slova: quantitative real time RT-PCR; house-keeping genes expression Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Different expression of house-keeping genes by quantitative real time RT-PCR

Ullmannová, V.; Truksa, Jaroslav; Haškovec, C.; Kovář, Jan
Ústav molekulární genetiky, 2003