Yes (5292)
No (7)
Used filters
(3)
Number of found documents:
5299
Published from
to
Interakce mezi antikodonovým ramenem tRNA a malými ribozomálními proteiny tvořícími dekódovací místo při pročtení stop kodonu
Čapková, Zuzana; Valášek, Leoš; Eliáš, Marek; Macíčková Cahová, Hana
2024 - English
Transfer RNAs (tRNAs) represent an indispensable part of protein synthesis by delivering amino acids into ribosomal A site during elongation. The rules that govern the correct match between the tRNA anticodon and the A-site mRNA codon are set by the genetic code. Specifically, the code defines that 61 sense codons are recognized by tRNAs and 3 stop codons marking translation termination are recognized by the release factor. In certain circumstances, a near-cognate (or a cognate) tRNA can be incorporated at the stop codon and translation elongation proceeds further. This process, called stop codon readthrough, may be beneficial as a therapy for inherited genetic diseases caused by premature termination codons (PTCs), and importantly, it is crucial for organisms with stop codon reassignment(s). Here I show that apart from the anticodon itself, the peculiar anticodon stem of two different near-cognate tRNAs, namely yeast S. cerevisiae tRNAGln CUG and Blastocrithidia nonstop tRNATrp CCA, is critical for their readthrough promoting potential. In particular, yeast tRNAGln CUG relies on the specific pyrimidine 28 : purine 42 base pair forming the 4th pair of its anticodon stem, whereas tRNATrp CCA of B. nonstop acquired a mutation that shortened its anticodon stem from the canonical 5 to the 4 base pairs,... Transferové RNA (tRNA) představují nepostradatelnou součást tvorby proteinů, které během elongace přivádějí aminokyseliny na A-místo ribozomu. Pravidla, kterými se řídí správná shoda mezi antikodonem tRNA a kodonem mRNA v A-místě, jsou stanovena genetickým kódem. Konkrétně kód definuje, že 61 kodonů je rozpoznáváno tRNA a 3 stop kodony označující ukončení translace jsou rozpoznávány uvolňovacím faktorem. Za určitých okolností však může být stop kodon rozeznán tzv. near-cognate (nebo cognate) tRNA a translace pokračuje dále. Tento proces, nazývaný pročítání stop kodonu, může být přínosný pro terapii dědičných genetických onemocnění způsobených předčasnými terminačními kodony (PTC) a také je klíčový pro organismy s přeřazováním identity stop kodonu na kodon kódující aminokyselinu. V této práci ukazuji, že kromě samotného antikodonu, antikodonové rameno dvou různých near-cognate tRNA, jmenovitě kvasinkové tRNAGln CUG a tRNATrp CCA Blastocrithidie nonstop, je rozhodující pro jejich potenciál pročíst stop kodony. Konkrétně demonstruji, že kvasinková tRNAGln CUG spoléhá na specifický pár bází pyrimidin 28 : purin 42, představující čtvrtý pár v jeho antikodonovém rameni (přesněji řečeno, ve stopce), zatímco tRNATrp CCA B. nonstop získala mutaci, která způsobila zkrácení jeho antikodonové stopky z...
Keywords:
tRNA; terminace translace; readthrough; tRNA; termination of translation; readthrough
Available in a digital repository NRGL
Interakce mezi antikodonovým ramenem tRNA a malými ribozomálními proteiny tvořícími dekódovací místo při pročtení stop kodonu
Transfer RNAs (tRNAs) represent an indispensable part of protein synthesis by delivering amino acids into ribosomal A site during elongation. The rules that govern the correct match between the tRNA ...
Úloha telomer / DNA reparací v solidních tumorech
Tomášová, Kristýna; Vodička, Pavel; Dušinská, Mária; Campa, Daniele
2024 - English
Loss of telomere function and unrepaired DNA damage contribute to chromosome integrity disruption and genomic instability development, which can initiate malignant transformation of the cells. This dissertation focused on telomeres and their maintenance and regulation mechanisms in sporadic colorectal, breast, and ovarian tumors. In colorectal cancer (CRC), a place was also dedicated to research on base excision repair glycosylases. The findings of the Thesis are elaborated in detail in seven attached Manuscripts. The main results of each of the articles are as follows: I) Mitochondrial DNA copy number changes and telomere length (TL) shortening already occur in precancerous lesions of CRC, but in early carcinomas, the association between their mitochondrial DNA content and TL diminishes; II) TL of leukocytes in peripheral blood of patients with CRC can be affected by postoperative cytostatic treatment based on 5-fluorouracil; III) CRC liver metastases maintain the same TL as primary tumors. In addition, neoadjuvant treatment with (chemo)radiotherapy applied to patients with rectal cancer probably causes telomere shortening in the primary tumor and the surrounding rectal cells in addition to DNA damage; IV) TL of ovarian cancer cells can be influenced by epigenetic regulations and expressions of... Ztráta funkce telomer a neopravená poškození DNA přispívají k narušení integrity chromozomů a rozvoji genomové nestability, která může iniciovat maligní zvrat buněk. Tato disertační práce je zaměřena na studium telomer a mechanismů jejich údržby a regulace u sporadických nádorů tlustého střeva a konečníku, prsu a ovárií. U rakoviny tlustého střeva a konečníku (kolorektální karcinom; KRK) byl prostor věnován i výzkumu DNA glykosyláz zapojených do bázové excizní opravy. Výsledky této disertační práce jsou detailně rozvedeny v sedmi přiložených rukopisech. Stěžejní výsledky každého z článků jsou následující: I) Ke změnám počtu kopií mitochondriální DNA a zkracování telomerové délky (TL) dochází již u prekancerózních lézí KRK, avšak u časných karcinomů souvislost mezi obsahem jejich mitochondriální DNA a TL zaniká; II) TL leukocytů v periferní krvi u pacientů s KRK může být ovlivněna postoperační cytostatickou léčbou na bázi 5-fluorouracilu; III) Metastázy KRK v játrech si udržují stejnou TL jako primární nádory. Dále bylo zjištěno, že neoadjuvatní léčba (chemo)radioterapií nasazovaná pacientům s rakovinou rekta pravděpodobně primárnímu nádoru i okolním buňkám rekta způsobuje mimo poškození DNA i krácení telomer; IV) TL buněk karcinomů ovárií můžou ovlivňovat epigenetické regulace a exprese genů...
Available in a digital repository NRGL
Úloha telomer / DNA reparací v solidních tumorech
Loss of telomere function and unrepaired DNA damage contribute to chromosome integrity disruption and genomic instability development, which can initiate malignant transformation of the cells. This ...
Analýza vzájemných interakcí komponent lidského multifaktoriálního komplexu v iniciaci translace
Prilepskaja, Terezie; Valášek, Leoš; Demo, Gabriel; Mašek, Tomáš
2024 - English
A key task of translation initiation is to select a proper start codon. The start codon defines not only the position from which the protein translation is initiated but also the reading frame in which the protein sequence is decoded. The accuracy of start codon recognition is controlled by number of initiation factors (eIFs) and their mutual interactions. One of them, the largest, is called eukaryotic initiation factor 3 (eIF3). The exact mechanism by which eIF3 affects the accuracy of start codon recognition is not understood. Here, using CryoEM, formaldehyde gradient cross- linking and various biochemical methods, we elucidated contributions of individual human eIF3 subunits to this intricate process. In particular, my work and the work of our collaborators revealed that eIF3d promotes loading of eIF3 to the ribosome at the onset of initiation and that the minimalistic eIF3 subcomplex (YLC - for Yeast Like Complex) still preserves basic eIF3 functions, like formation of the 43S pre- initiation complex (PIC) and mRNA recruitment. Another study then implicated human eIF3c is fine-tuning the fidelity of start codon recognition, as downregulation of eIF3c causes a codon- specific decrease in start codon recognition fidelity and an increase in the eIF5 abundance; eIF5 is together with eIFs 1, 1A and... Hlavním úkolem eukaryotické iniciace translace je rozpoznání správného start kodonu. Start kodon určuje nejen pozici, z které je zahájená translace proteinu, ale rovněž čtecí rámec, ve kterém je dekodována sekvence proteinu. Přesnost rozeznání start kodonu je řízena pomocí iniciačních faktorů a jejich vzájemnými interakcemi. Jeden z nich, největší, je nazýván eukaryotická iniciační factor 3 (eIF3). Přesný mechanismus, jakým eIF3 ovlivňuje přesnost rozpoznání start kodonu není známý. Zde jsme pomocí CryoEM, formaldehydem zasítěných gradientů a řady biochemických metod objasnila vliv jednotlivých lidských eIF3 podjednotek na tento komplikovaný proces. Moje práce a práce našich spolupracovníků zejména ukázala, že eIF3d podporuje vazbu eIF3 na ribozom na začátku iniciace translace a že minimalistický eIF3 subkomplex (YLC- komplex podobný kavasinkovému eIF3) má zachované základní funkce eIF3 jako je sestavení 43S preiniciačního komplexu a navázání mRNA. Další studie ukázala, že lidské eIF3c je zapojeno do vylaďování přesnosti rozeznání start kodonu, jelikož snížení hladiny eIF3c způsobuje kodon specifické snížení přesnosti rozpoznání start kodonu a zvýšení množství eIF5; eIF5 je společně s eIF1, 1A a 2 jedním z hlavních faktorů v ovlivňující tento proces. Objevila jsem, že eIF3 váže eIF5 špičkou svého...
Keywords:
eIF3c; translace; iniciace translace; eIF3c; translation; iniciation of translation
Available in a digital repository NRGL
Analýza vzájemných interakcí komponent lidského multifaktoriálního komplexu v iniciaci translace
A key task of translation initiation is to select a proper start codon. The start codon defines not only the position from which the protein translation is initiated but also the reading frame in ...
Cesta k funkčnímu řízení zdravotního systému v Ghaně: Centralizace politiky a institucí a definice hlavních aktérů ve snaze o vymýcení malárie u dětí do 5 let věku
Amoako, Martha; Potůček, Martin; Dlouhý, Martin; Mpinga, Emmanuel Kabengele
2024 - English
Zásady udržitelného rozvoje vyžadují silný zdravotnický sektor řešící problémy v oblasti dětského zdraví, a to zejména v rozvojových zemích jako Ghana. Snahu vybudovat silné zdravotnictví nicméně může zmařit výskyt malárie, což je právě případ Ghany. Malárie zůstává v Ghaně významnou příčinou úmrtí dětí mladších pěti let, a to navzdory různorodým globálním i národním zdravotnickým programům a politikám. Tato studie se soustředí na implikace politik, aktérů a veřejných institucí v boji proti malárii mezi dětmi mladšími pěti let ve čtyřech okresech země: obec Obuasi, okres Mpohor, Východní okres Kassena-Nankana a Západní okres Ada. Studie zpracovává primární a sekundární data metodou deskriptivní i empirické analýzy. V rámci studie byly připraveny dotazníky a provedeny rozhovory s 241 respondenty z řad individuálních i institucionálních aktérů s cílem sběru podrobných informací o formulaci politik, aktérských interakcích a výsledcích léčby malárie ve skupině dětí mladších pěti let v kontextu případových studií z různých administrativních oblastí. Tyto oblasti vykazují různá sociální, ekonomická a politická prostředí, která jsou pro posouzení výsledků zdravotnických programů v oblasti boje proti malárii zásadní. Výsledky regrese sekundárních dat metodou nejmenších čtverců (OLS), která byla v rámci...
Keywords:
Řízení a správa; zdravotnictví; zdravotní péče; zdravotnická politika; ITN (insekticidní moskytiéry); malárie; NHIS (Národní zdravotní pojištění); úmrtnost dětí mladších; Do pěti let (U5); Governance; Health system; Healthcare; Health policy; ITNs; Malaria; NHIS; Under-five; Mortality Rate
Available in a digital repository NRGL
Cesta k funkčnímu řízení zdravotního systému v Ghaně: Centralizace politiky a institucí a definice hlavních aktérů ve snaze o vymýcení malárie u dětí do 5 let věku
Zásady udržitelného rozvoje vyžadují silný zdravotnický sektor řešící problémy v oblasti dětského zdraví, a to zejména v rozvojových zemích jako Ghana. Snahu vybudovat silné zdravotnictví nicméně může ...
Růst a ontogeneze pohlavní dvojtvárnosti ve velikosti těla u ještěrů
Meter, Brandon; Starostová, Zuzana; Kupfer, Alexander; Vrtílek, Milan
2024 - English
Růst byl u plazů historicky považovaný za neukončený. Tento obecně sdílený předpoklad byl v posledních letech zpochybněn a narůstaly důkazy o ukončeném růstu u ještěrů. Tento obrat způsobila především analýza růstových plotének kostí, která ukázala jejich uzavření a tím nemožnost dalšího prodlužování kostí, což způsobuje dosažení konečné velikosti těla. Paralelně s touto změnou v nahlížení na ukončený růst byly zpochybněny i dlouhodobé předpoklady o zásadní přímé roli energetického rozpočtu a s ním spojených trade-offs v ovlivňování růstu. Tento posun v perspektivě ovlivňuje nejen naše chápání individuálního růstu, ale také se odráží ve studiu souvisejícího znaku - pohlavního dimorfismu ve velikosti (SSD) - rozdílu ve velikosti mezi pohlavími v rámci druhu. Existují tři hlavní hypotézy o příčinách SSD u plazů: pohlavně-specifické náklady na reprodukci, ovlivnění růstu samčími gonadálními androgeny a ovariálními hormony. Tato práce přináší další důkazy o ukončeném růstu u ještěrů a diskutuje jeho důsledky pro evoluci SSD. Review o růstu zaměřené na gekona Paroedura picta, kde jsou větší samci než samice, zdůrazňuje značnou kanalizovanost růstu a současně poskytuje základ o úvahách týkajících se proximátních příčin SSD. V této práci dále předkládám podporu pro pravděpodobnou roli ovariálních hormonů...
Keywords:
plazi; plasticita; růst; velikost těla; pohlavní dimorfismus; genová exprese; reptiles; plasticity; growth; body size; sexual dimorphism; gene expression
Available in a digital repository NRGL
Růst a ontogeneze pohlavní dvojtvárnosti ve velikosti těla u ještěrů
Růst byl u plazů historicky považovaný za neukončený. Tento obecně sdílený předpoklad byl v posledních letech zpochybněn a narůstaly důkazy o ukončeném růstu u ještěrů. Tento obrat způsobila především ...
Útlak versus posílení postavení žen: Filosofická analýza účasti žen ve sportu
Howe, Olivia Rose; Parry, Silvan James; Schneider, Angela; Edgar, Andrew
2024 - English
Název: Útlak versus posílení postavení žen: Filosofická analýza účasti žen ve sportu Cíle: Cílem této práce je na základě knihy feministické filosofky Simone de Beauvoir Druhé pohlaví definovat a kriticky analyzovat, co znamená pojmy "útlak" a "posílení postavení" žen. Zjištění, že útlak žen je systémový, internalizovaný a vykořisťovatelský, jsou aplikována do ženské kategorie ve sportu. Tato diskuse se zaměřuje především na zjištění, zda má sport tendenci utvrzovat útlak žen prostřednictvím svých pravidel a konvencí, kategorizace, finančně a emocionálně vykořisťujících praktik a prostřednictvím nových metod, jako je manipulace se zdravotními údaji. Na základě současných textů z oblasti kinantropologie je rovněž diskutováno téma sportu jakožto zdroje pro posílení postavení žen. Metodologie: Tato práce je čistě teoretickou studií, ve které byly shromažďovány, interpretovány a kriticky hodnoceny informace z filosofických textů, odborných článků, novinových článků a sociálních médií. Tato práce vychází z myšlenek knihy Simone de Beauvoir Druhé pohlaví, která poskytuje důkladnější filosofickou analýzu pojmů "útlak" a "posílení postavení". Práce rovněž vychází z teorie...
Keywords:
Útlak; posílení postavení; Beauvoir; etika; sport; filosofie; Oppression; Empowerment; Beauvoir; Ethics; Sport; Philosophy
Available in a digital repository NRGL
Útlak versus posílení postavení žen: Filosofická analýza účasti žen ve sportu
Název: Útlak versus posílení postavení žen: Filosofická analýza účasti žen ve sportu Cíle: Cílem této práce je na základě knihy feministické filosofky Simone de Beauvoir Druhé pohlaví definovat a ...
Evoluce interakcí mezi proteiny a kofaktory/RNA
Sanchez Rocha, Alma Carolina; Hlouchová, Klára; Lepšík, Martin; Berka, Karel
2024 - English
Genetický kód je překládán do bílkovin s využitím abecedy 20 proteinogenních aminokyselin. Přes současnou dominanci kanonicke abecedy je pravděpodobné, že primordiální proteiny byly složeny pouze z části tohoto aminokyselinového repertoáru. V této práci jsme prozkoumali soubor peptidů a proteinů s cílem objasnit, jak vyvíjející se repertoár aminokyselin ovlivnil jejich fyzikálně-chemické a biologické vlastnosti a sklon k interakci s evolučně konzervovanými molekulami, jako jsou kofaktory a RNA. V první části jsme prozkoumali soubor nejkonzervovanejších protoribozomálních peptidů s cilem odhalit jejich strukturní a funkční charakteristiky. Pomocí experimentálních a bioinformatických analýz jsme potvrdili převážně nestrukturovanou povahu těchto peptidů a odhalili jejich úlohu při stabilizaci peptidyltransferázového centra a ochraně RNA před degradací. Tyto procesy odráží nejstarší pochody koevoluce RNA a peptidů jež předcházely zrodu posledního univerzálního společného předka (LUCA z angl. Last Universal Common Ancestor). Dále jsme se zaměřili na pre-ribozomálni peptidy s potenciálním prebiotickým významem. Pomocí bioinformatických metod jsme prozkoumali strukturní charakteristiky kompletních knihoven peptidů zahrnujících kanonické a prebioticky přípustné nestandardní aminokyseliny. Predikce...
Keywords:
proteinové knihovny; evoluce genetického kódu; reverzní evoluce; Protein libraries; genetic code evolution; reverse evolution
Available in a digital repository NRGL
Evoluce interakcí mezi proteiny a kofaktory/RNA
Genetický kód je překládán do bílkovin s využitím abecedy 20 proteinogenních aminokyselin. Přes současnou dominanci kanonicke abecedy je pravděpodobné, že primordiální proteiny byly složeny pouze z ...
Syntéza nových heteroanelovaných 7-deazapurinových nukleosidů a nukleotidů s potenciální biologickou aktivitou a pro modifikace DNA a RNA
Fleuti, Marianne Heidi; Hocek, Michal; Míšek, Jiří; Hlaváč, Jan
2024 - English
Doctoral Thesis Abstract Marianne Fleuti Synthesis of novel hetero-fused 7-deazapurine nucleosides and nucleotides with potential biological activity or for modifications of DNA and RNA In medicinal chemistry, 7-deazapurine ribonucleosides are important analogues to purine nucleosides and represent a privileged scaffold in the research for new treatments against cancer, leukemia, and diseases caused by viruses. This thesis discusses the synthesis of new heteroaryl-fused 7-deazapurine ribonucleosides and reports on the biological activity of the target nucleosides against different cancer cell lines and viruses in vitro. In the first part of the thesis, the focus lies on the comparison of strategies for the synthesis of different methylpyrazolo-fused 7-deazapurine ribonucleosides. The tricyclic nucleobase was furnished by (i) a six-step classical heterocyclization approach starting from 5-chloro-1-methyl- 4-nitropyrazole, and by (ii) a three-step cross-coupling and cyclization approach starting from the zincated 4,6-dichloropyrimidine and 5-iodo-1-methylpyrazole. Both strategies resulted in comparable yields overall. Then, three different glycosylation methods were explored to give the β-anomeric nucleoside intermediate. Only the Vorbrüggen glycosylation yielded the intermediate as a pure β-anomer.... Dizertační práce Abstrakt Marianne Fleuti Syntéza nových heteroanelovaných 7-deazapurinových nukleosidů a nukleotidů s potenciální biologickou aktivitou a pro modifikace DNA a RNA V medicinální chemii jsou 7-deazapurinové ribonukleosidy důležitými analogy purinových nukleosidů a představují výsadní strukturu ve výzkumu nových léčebných přípravků na rakovinu, leukémii a virová onemocnění. Tato práce diskutuje syntézu nových heteroaryl- fúzovaných 7-deazapurinových ribonukleosidů a uvádí biologickou aktivitu cílových nukleosidů proti různým liniím rakovinných buněk a virům in vitro. První část práce se zaměřuje na porovnání strategií pro syntézu různých methylpyrazolo- fúzovaných 7-deazapurinových ribonukleosidů. Tricyklická nukleobáze byla připravena (i) šestikrokovým klasickým heterocyklizačním přístupem vycházejícím z 5-chlor-1-methyl-4- nitropyrazolu a (ii) tříkrokovým přístupem s využitím cross-couplingu a cyklizace vycházejícím ze zinkovaného 4,6-dichloropyrimidinu a 5-jod-1-methylpyrazolu. Obě strategie vedly celkově ke srovnatelným výtěžkům. Poté byly prozkoumány tři různé metody glykosylace pro získání β-anomerního nukleosidového intermediátu. Pouze glykosylace podle Vorbrüggena poskytla intermediát jako čistý β-anomer. Derivatizace a deprotekce poskytly sérii osmi různých pyrazolo-fúzovaných...
Keywords:
nukleosidy; nukleotidy; DNA; RNA; nucleosides; nucleotides; DNA; RNA
Available in a digital repository NRGL
Syntéza nových heteroanelovaných 7-deazapurinových nukleosidů a nukleotidů s potenciální biologickou aktivitou a pro modifikace DNA a RNA
Doctoral Thesis Abstract Marianne Fleuti Synthesis of novel hetero-fused 7-deazapurine nucleosides and nucleotides with potential biological activity or for modifications of DNA and RNA In medicinal ...
Organokatalytická redukce aminů pomocí trichlorsilanem
Popov, Kirill; Kočovský, Pavel; Baszczyňski, Ondřej; Starý, Ivo
2024 - English
Reductive amination and its stepwise variant stands as a cornerstone in the synthesis of amines, crucial molecules in both natural and synthetic chemistry, especially in pharmaceutical industry. Trichlorosilane-mediated reductive amination emerges as a particularly attractive method, offering simplicity, efficacy, and versatility across various functional groups. This thesis explores the application and enhancement of this method, aiming to expand its utility, particularly focusing on the synthesis of cholesterol-lowering compounds exemplified by Ezetimibe. The research begins with an investigation into the stability of diverse functional groups under HSiCl3-mediated reductive amination conditions with dimethylformamide as a catalyst, establishing a fundamental understanding of the reaction scope. Among the stable functional groups identified is the pentafluorosulfanyl (SF5) moiety, known for its distinct properties and potential in medicinal chemistry. The investigation delves into the applicability of this method to aldehydes and prochiral ketones, demonstrating its versatility. Building upon this groundwork, the study progresses towards the development and application of an asymmetric version of reductive amination, targeting Ezetimibe and its analogues. The synthetic pathway involves the... Reduktivní aminace je základním kamenem syntézy aminů, klíčových molekul v přírodní i syntetické chemii, zejména ve farmaceutickém průmyslu. Reduktivní aminace zprostředkovaná trichlorosilanem se jeví jako obzvláště atraktivní metoda, která nabízí jednoduchost, účinnost a univerzálnost pro různé funkční skupiny. Tato práce se zabývá použitím a zdokonalením této metody s cílem rozšířit její využití, zejména se zaměřením na syntézu sloučenin snižujících hladinu cholesterolu na příkladu ezetimibu. Výzkum začíná zkoumáním stability různých funkčních skupin za podmínek reduktivní aminace zprostředkované HSiCl3 s dimethylformamidem jako katalyzátorem, čímž se vytváří základní představa o rozsahu reakce. Mezi identifikovanými stabilními funkčními skupinami je i pentafluorosulfanylový (SF5) fragment, známý svými výraznými vlastnostmi a potenciálem v medicinální chemii. Výzkum se zabývá použitelností této metody na aldehydy a prochirální ketony, což ukazuje její všestrannost. Na základě těchto poznatků studie směřuje k vývoji a použití asymetrické verze reduktivní aminace zaměřené na ezetimib a jeho analogy. Syntetická cesta zahrnuje katalytické využití dříve syntetizovaného chirálního katalyzátoru Kenamid ve spojení s trichlorsilanem, který nabízí výhody oproti tradičním metodikám z hlediska...
Available in a digital repository NRGL
Organokatalytická redukce aminů pomocí trichlorsilanem
Reductive amination and its stepwise variant stands as a cornerstone in the synthesis of amines, crucial molecules in both natural and synthetic chemistry, especially in pharmaceutical industry. ...
Charakterizace tumor supresorové dráhy indukované pomocí LACTB
Escudeiro Lopes, Sara Eliana; Kečkéšová, Zuzana; Brábek, Jan; Eriksson-Rosenberg, Ove
2024 - English
(English) Tumor suppressors genes are capable of repressing the growth of neoplastic cells; therefore, their inactivation is an important hallmark of cancer. The novel tumor suppressor Serine beta-lactamase-like protein (LACTB), highly expressed in normal tissues but often downregulated in cancer cells, is a ubiquitously expressed mitochondrial protein with an active serine catalytic site and unknown substrates. In this project we show that LACTB possesses autoproteolytic activity which, in cancer cells, is enhanced by the MRPS34 (Mitochondrial Ribosomal Protein S34) protein thus leading to post-translational downregulation of LACTB. This process can be partially reverted by "A4" chemical compound that has the ability to reactivate LACTB. Our results reveal a novel and previously unknown regulatory mechanism by which cancer cells downregulate a potent tumor suppressor and offer promising new avenues for its therapeutic reactivation and cancer treatment. We further elucidate the biology of LACTB through uncovering binding partners and additional substrate candidates of LACTB and uncover the requirements for salts and ions in LACTB's filament formation and enzymatic activity. Furthermore, we unveiled the mechanistic circuitries of LACTB-induced cell death, revealing that LACTB can induce... Nádorové supresorové geny jsou schopny potlačit růst neoplastických buněk; proto je jejich inaktivace důležitým znakem rakoviny. Nový tumor supresorový protein podobný serin-beta-laktamáze (LACTB), vysoce exprimovaný v normálních tkáních, ale často downregulovaný v rakovinných buňkách, je všudypřítomný mitochondriální protein s aktivním serinovým katalytickým místem a neznámými substráty. V tomto projektu ukazujeme, že LACTB má autoproteolytickou aktivitu, která je v rakovinných buňkách zesílena proteinem MRPS34 (mitochondriální ribozomální protein S34), což vede k posttranslační downregulaci LACTB. Tento proces lze částečně zvrátit chemickou sloučeninou "A4", která má schopnost reaktivovat LACTB. Naše výsledky odhalují nový a dříve neznámý regulační mechanismus, kterým rakovinné buňky downregulují silný nádorový supresor a nabízejí slibné nové cesty pro jeho terapeutickou reaktivaci a léčbu rakoviny. Dále objasňujeme biologii LACTB prostřednictvím odhalování vazebných partnerů a dalších potenciální substrát LACTB a odhalujeme požadavky na soli a ionty při tvorbě filament a enzymatické aktivitě LACTB. Dále jsme odhalili mechanismy buněčné smrti indukované LACTB a ukázali jsme, že LACTB může vyvolat buněčnou smrt nezávislou na kaspázách, zejména prostřednictvím zvýšení kyslíkových radikálů (ROS) v...
Available in a digital repository NRGL
Charakterizace tumor supresorové dráhy indukované pomocí LACTB
(English) Tumor suppressors genes are capable of repressing the growth of neoplastic cells; therefore, their inactivation is an important hallmark of cancer. The novel tumor suppressor Serine ...
NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web
Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz
Provider
Other bases