Národní úložiště šedé literatury

Regulace biosyntézy vysoce nenasycených mastných kyselin (LC-PUFA) u ryb
BLÁHOVÁ, Zuzana
2022 - English Předložená dizertační práce se zabývá studiem biosyntézy vysoce nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem u ryb, přičemž se zaměřuje na její roli v adaptaci ryb na nové měnící se podmínky životního prostředí. V experimentální části zkoumá vliv narušené dráhy LC-PUFA biosyntézy na reprodukci ne modelovém organizmu ryby zebřičky (Danio rerio) reverzně genetickým přístupem využívajícím populární systém CRISPR/Cas9. Po celou dobu historie Země se živé organizmy vyvíjely v reakci na přirozenou změnu klimatu, pomalý přírodní jev trvající tisíce až miliony let. V posledních necelých 100 letech však lidské činnosti vyvolaly překotné globální oteplování. Kvalita potravy, pokud ji definujeme jako hodnotu produktu pro fyzické zdraví, růst, vývoj a reprodukci, je ohrožena. Klesá v ní totiž zastoupení jedněch z esenciálních složek potravy pro prakticky všechna zvířata a pro člověka vysoce nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem (LC-PUFA). Zvířata a lidé obvykle mají schopnost tvořit si tyto biomolekuly uvnitř svých buněk z esenciálních kratších a méně nenasycených osmnáctiuhlíkových mastných kyselin, ovšem výtěžek takto vytvořených molekul je příliš nízký na to, aby pokryl fyziologické potřeby organizmu. Spíše je předpokládáno, že tato dráha plní funkci jakéhosi kompenzačního aparátu jehož úkolem je udržení homeostázy za kolísajících podmínek prostředí. První krok LC-PUFA biosyntézy je katalyzován enzymem FADS2. Bylo prokázáno, že fads2 byl klíčovým metabolickým genem, který v minulosti umožnil kolonizování nutričně chudého prostředí sladkých vod po ústupu ledovců některým rybám. A dokonce i v lidské populace vykazoval fads2 gen silné známky selekce, jak bylo prokázáno u grónských Eskymáků osídlujících polární oblasti. Kapitola 2 této práce shrnuje současné poznatky a zhodnocuje strukturně-funkční vlastnosti desaturázy FADS2 u ryb v kontextu adaptací na prostředí a jako cíle pro genetické inženýrství. Práce zdůraznila potenciál FADS2 hrát zásadní roli v přizpůsobování se novým podmínkám prostředí, zhodnotila dosavadní výzkum v této oblasti s cílem objasnit evoluční historii FADS2 u ryb přičemž vyzdvihuje pozoruhodnou plasticitu FADS2. Nastínila I některá řešení genetického inženýrství v podobě geneticky modifikovaných organizmů. Prezentovali jsme FADS2 jako fascinující enzym s dalekosáhlými důsledky pro udržitelnost životního prostředí. Z dosavadního výzkumu jasně plyne, že množství a kompozice LC-PUFA přijmutích v potravě ovlivňují reprodukční vlastnosti generačních ryb. Dosud však nebyl studován vliv delece genu fads2 (úbytku endogenně vytvořených LC-PUFA biomolekul) na reprodukci u ryb a dokonce i u anamniote obecně. Cílem práce shrnuté v kapitole 3 této práce proto bylo zjistit, zda existuje přímá funkční souvislost mezi genem fads2 a některými vlastnostmi souvisejícími s reprodukcí u vybraného modelového organizmu ryby - zebřičky (Danio rerio) reverzně genetickými přístupy. Zhotovili jsme "knockout" zebřičky fads2 genu a poté jsme stanovili profil mastných kyselin jiker, které dospělé samice kladly. Pozorovali jsme existenci alternativní ?8 desaturační dráhy (elongace ? ?8 desaturace ? ?5 desaturace) vedle klasické ?6 dráhy (?6 desaturace ? elongace? ?5 desaturace) u samic zebřiček in vivo. Vysvětlujeme si ji jako aktivní regulaci biosyntézy LC-PUFA za podmínek nedostatku funkčních alel fads2 genu v důsledku cílených mutací pomocí metody cíleného editování genomu CRISPR/Cas9. Dospěli jsme k závěru, že bifunkční desaturáza ?6/ ?5 je ve skutečnosti trifunkční ?8/?6/?5 desaturáza. The aim of the thesis was to explore the biosynthesis of long-chain polyunsaturated fatty acids (LC-PUFAs) with special focus on its role in adaptation to new environmental conditions in fish. The impact of impaired LC-PUFA pathway on reproduction of zebrafish (Danio rerio) was studied by the modern reverse genetic approach CRISPR/Cas9. Throughout the Earth´s history, the living organisms evolved to its current form in response to natural climate change, a slow natural phenomenon that has lasted for thousands or millions of years. However, in recent less than 100 years, anthropogenic factors induced a rapid process of global warming. Nutritional quality, when defined as the value of the product for the consumer´s physical health, growth, development and reproduction, is at a risk. Long-chain polyunsaturated fatty acid (LC-PUFA) biomolecules are essential dietary components for virtually all animals and humans. However, LC-PUFAs provisioning by changing ecosystems is predicted to decline significantly. Animals and human are usually able to produce LC-PUFAs endogenously from shorter and less unsaturated C18 fatty acid precursors obtained from the diet. However, the yield of LC-PUFA biomolecules biosynthesized is too low to meet physiological needs. Rather, LC-PUFA biosynthesis is considered to play a role as a compensational apparatus to maintain homeostasis under fluctuating environmental conditions. The first and rate-limiting step in LC-PUFA biosynthesis is catalysed by FADS2 enzyme. It has been demonstrated that fads2 was the key metabolic gene important for overcoming the nutritional constraints associated with colonisations of nutritionally pure water environments after glacial retreat. In human population, fads2 showed strong signatures of selection as well as confirmed in Greenland Eskimos colonising polar regions. Chapter 2 of the thesis summarized the current knowledge and assessed fatty acid desaturase (FADS2) structure-function properties in fish in the context of environmental adaptations and as a target for genetic engineering. The work highlighted the FADS2 potential to play roles fundamental to adaptation to novel environmental conditions and reviewed investigations to elucidate the evolutionary history of fish FADS2, explaining the remarkable plasticity of this enzyme in fish, depicted the importance of FADS2 in the context of dwindling LC-PUFAs supply and mentioned a few remedies in the form of genetic engineering to improve endogenous LC-PUFA biosynthesis. FADS2 was presented as a fascinating enzyme with far-reaching implications for environmental sustainability and playing roles in adaptations to novel environments. Previous research has provided substantial evidence of significant effects of dietarily obtained LC-PUFA levels and ?3: ?6 LC-PUFA balance on broodstock reproduction success (Sarih et al., 2020). However, the information on the impact of ablation of LC-PUFAs of endogenous origin was missing in fish and other anamniotic vertebrates as well. That fact prompted us to fill this gap of knowledge. Chapter 3 of this thesis investigated a direct functional link between fads2 gene and reproduction success in zebrafish (Danio rerio) by reverse genetic approach. We have investigated the functional link between FADS2 and reproduction success of zebrafish females by observing the direct impact of partial fads2 gene knock out on their egg batches fatty acyl methyl ester (FAMEs) profile. We observed the presence of an alternative ?8 desaturation pathway (elongation ? ?8 desaturation ? ?5 desaturation) besides the classical ?6 pathway (?6 desaturation ? elongation? ?5 desaturation) in zebrafish in vivo, which we explain as an active regulation of LC-PUFA biosynthesis under the depletion of functional fads2 gene alleles following the CRISPR/Cas9 genome targeting. We suggest that zebrafish bifunctional ?6/ ?5 desaturase is, in fact, the trifunctional ?8/?6/?5 desaturase. Keywords: Biosyntéza polynenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem (LC-PUFA); \recke{Delta}6; ?5; ?8 desaturáza FADS2; ?3; ?6; CRISPR/Cas9 knockout; zebřička (Danio rerio); environmentální adaptace; kyselina linoleová (LA); eicosadienová; dihomo ?-linolenová (DGLA); arachidonová (AA); ?-linolenová (ALA); eicosatrienová; stearidonová (SDA); eicosapentaenová (EPA); docosahexaenová (DHA). Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Regulace biosyntézy vysoce nenasycených mastných kyselin (LC-PUFA) u ryb

Předložená dizertační práce se zabývá studiem biosyntézy vysoce nenasycených mastných kyselin s dlouhým řetězcem u ryb, přičemž se zaměřuje na její roli v adaptaci ryb na nové měnící se podmínky ...

BLÁHOVÁ, Zuzana
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Společenstva vodních makrobezobratlých ovlivněna lidskými činnostmi
LET, Marek
2022 - English Bezobratlí představují významnou součást vodních ekosystémů, podílející se na řadě nezbytných ekosystémových služeb. Narušením stanovišť a druhově i funkčně rozmanitých společenstev může snadno dojít k jen těžko vratným změnám. Tato práce byla zaměřena na výzkum vztahů společenstev vodních bezobratlých ovlivněných lidskou činností. Byl pozorován obecně negativní vztah mezi gradientem kontaminace insekticidy a četností proudomilných bezobratlých na úrovni vyšších taxonomických jednotek (Kapitola 2). Gradient hydrologického sucha negativně koreloval s četností skupiny jepic (Ephemeroptera), pošvatek (Plecoptera) a chrostíků (Trichoptera) - dále jen EPT - a nejlépe pozitivně koreloval s četností dospělců brouků (Coleoptera), ploštic (Heteroptera), lasturnatek (Ostracoda) a berušek vodních (Asellus aquaticus). Na základě porovnání stavu společenstva v kontrolním odběrového úseku se stavy společenstev z úseků zasažených počáteční insekticidní otravou byl předpokládán nepříznivý synergický efekt hydrologického sucha a splachů ze zemědělsky obhospodařovaných ploch. Metody v moderním zemědělství lze považovat za jednu z největších hrozeb pro vodní bezobratlé. Výsledky shrnuté v Kapitole 3 ukazují klesající zaznamenaný počet druhů EPT (avšak nikoliv četnosti EPT jedinců) spolu s rostoucí kumulací antropogenních faktorů. Nicméně pouze společenstva jepic a obzvláště pošvatek vykazovala signifikantní úbytky, zatímco chrostíci vykazovali určitou rezistenci k předpokládaným nejsilnějším antropogenním faktorům. Tyto hlavní faktory zahrnovaly zatížení kovy (kadmium, olovo a zinek) s následným vyústěním městských vyčištěných a špatně vyčištěných odpadních vod s obsahem pesticidů, léčiv, organického materiálu ze splašků a nepochybně i řady dalších neanalyzovaných látek. Navzdory zvýšené četnosti chrostíků byly u čeledí Hydropsychidae, Limnephilidae a Rhyacophilidae pozorovány známky zhoršené kondice (malformace a přítomnost uhynulých kukel) v obou typech znečištění. Prostředí znečištěné odpadními vodami bylo osídleno signifikantně zvýšeným podílem pasivních filtrátorů a predátorů z řádu chrostíků. Vidím zde nutnost dále studovat reakce společenstev vodních organismů na přísun vyčištěných odpadních vod, jelikož technologie čištění jsou v mnoha zemích světa stále zdokonalovány a je k dispozici poměrně málo publikovaných výstupů sledujících efekty zaváděných postupů na přirozené vodní ekosystémy. Kapitola 4 odhaluje negativní působení nepůvodního raka signálního (Pacifastacus leniusculus) na původní komunitu potočnic (Branchiobdellidae). Dle našich výsledků může úplné nahrazení původního raka říčního (Astacus astacus) rakem signálním vést k vymizení sledovaných dvou druhů potočnic, Branchiobdella parasita a B. pentadonta. Na lokalitě se sympatrickým výskytem raka říčního a signálního byly rovněž pozorovány potenciální rozdíly mezi oběma raky v korelacích mezi četnostmi obou druhů potočnic. Četnosti větší potočnice B. parasita pozitivně korelovaly s četností menší B. pentadonta pouze u raka signálního, přičemž tento vztah může být až negativní u velkých hustě osídlených jedinců raka říčního. Byla tudíž předpokládána potenciální kompetice o životní prostor. Doprovodný laboratorní experiment ukázal, že rak signální se mechanicky zbavuje epibiontů ve vyšší míře ve srovnání s rakem říčním. Výsledky tedy demonstrují potenciální ztráty v biodiverzitě nenápadných skupin organismů vznikající introdukcí invazních druhů. Poznatky v oblasti reakcí přírodních společenstev vodních bezobratlých na člověkem vyvolané změny v životním prostředí mohou být důležité například při posuzování důsledků nově plánovaných nebo aktuálně působících antropogenních činností v kulturní krajině. Tato dizertační práce rovněž poskytuje zpětnou vazbu laboratorním studiím, jejichž aplikovatelnost na reálné podmínky je často omezena zjednodušeným umělým prostředím. Macroinvertebrates represent an essential part of aquatic environments contributing to various ecosystem services. Disregarding the importance of their habitats and stable and functionally diverse communities can cause hardly reversible losses. This Thesis aimed to reveal relationships between responses of aquatic macroinvertebrate communities and the consequences of human activities. The general negative relationship between the gradient of insecticide contamination and abundances of higher taxonomic units of the stream macroinvertebrates was observed (Chapter 2). The gradient of droughts correlated negatively to the abundances of mayflies (Ephemeroptera), stoneflies (Plecoptera) and caddisflies (Trichoptera) - hereinafter referred as "EPT" - and the most positively to the abundances of coleopteran adults, heteropterans, ostracods, and water lice. Disturbing synergic effects of droughts and agricultural runoff were assumed based on the comparisons between communities sampled in the control site and initially contaminated downstream sites. The practices in modern agricultural systems can be considered one of the greatest threats to aquatic macroinvertebrate fauna. Results summarised in Chapter 3 show decreasing richness of EPT taxa (however, not their abundances) along with the involvement of an increasing number of anthropogenic factors. Nevertheless, only the mayflies and especially stoneflies showed significant negative responses, whilst caddisflies generally exhibited resistance to the presumably strongest anthropogenic factors; namely to contamination by trace metals (cadmium, lead and zinc) and to subsequent loads of treated and "poorly treated" municipal wastewaters containing pesticides, pharmaceutical active compounds, sewage-derived organic matter, and undoubtedly other not identified kinds of pollutants. Despite the higher caddisfly abundance, there were detected signs of worsened health status in hydropsychids, limnephilids and rhyacophilids, particularly detected malformations and the presence of dead pupae in both types of contaminated environments. However, the environment polluted by wastewaters exhibited a significant relationship to a highly increased relative contribution of passive filter feeders and predators within the EPT community. Since wastewater treatment technologies have been enhanced in many countries and there is a lack of published evidence about their complex effect on aquatic ecosystems, future studies are required. Chapter 4 reveals the negative effect of non-native signal crayfish (Pacifastacus leniusculus) on the native branchiodellid community. According to our results, the total replacement of the native noble crayfish (Astacus astacus) by signal crayfish can lead to the disappearance of two species Branchiobdella parasita and B. pentadonta. Potential differences between crayfish species in correlations between abundances of both branchiobdellids were observed in the locality with the sympatric occurrence of noble crayfish and signal crayfish; the abundance of bigger-sized B. parasita positively correlated to the abundance of B. pentadonta only in the signal crayfish, whilst this relationship may be negative in the big-sized noble crayfish densely infested by both species. Potential competition for space was assumed. The experiment in laboratory conditions revealed more intensive grooming in signal crayfish. The results demonstrate the loss of overlooked biodiversity associated with the invasive species introduction. Knowledge of how communities of aquatic invertebrates respond to anthropogenic changes in the environment can be useful, e.g., during the assessment of the implications of planned or currently active human interferences for cultural landscapes. This Thesis will provide useful information for laboratory studies, of which the interpretation is often limited as they are carried out in artificial environments. Keywords: Makrozoobentos; Environmentální podmínky; Disturbance; Znečištění; Degradace stanovišť Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Společenstva vodních makrobezobratlých ovlivněna lidskými činnostmi

Bezobratlí představují významnou součást vodních ekosystémů, podílející se na řadě nezbytných ekosystémových služeb. Narušením stanovišť a druhově i funkčně rozmanitých společenstev může snadno dojít ...

LET, Marek
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Obsah vybraných rizikových prvků v plodnicích hub s léčivými účinky
VONDRUŠKA, Jan
2022 - Czech Disertační práce se zabývá obsahem vybraných rizikových a esenciálních prvků v plodnicích hub s léčivými účinky. Studovanými druhy hub byly boltcovitka ucho Jidášovo (Auricularia auricula-judae), hřib žlučník (Tylopilus felleus), hlíva ústřičná (Pleurotus ostreatus), penízovka sametonohá (Flammulina velutipes), václavka smrková (Armillaria ostoyae) a hnojník obecný (Coprinus comatus). Vzorky byly sbírány z lokalit nalézajících se v jižních Čechách. Hlíva ústřičná byla pěstována na komerčně dodávaném substrátu. Jednotlivé prvky byly stanovovány atomovou absorpční spektrometrií v režimu plamenové nebo elektrotermické atomizace a pomocí plamenové fotometrie. Bylo zjištěno, že volně rostoucí boltcovitka ucho Jidášovo je bohatým zdrojem Ca a Mg (2200 a 2080 mg kg-1 sušiny) a hřib žlučník silně akumuluje Rb, Cd, Cu, Zn, Se a Mg (biokoncentrační faktory: 65,7; 2,47; 2,32; 1,93; 1,67 a 1,27). Jako další volně rostoucí houba byla studována penízovka sametonohá, která ve svých plodnicích obsahovala značné množství Ca, Fe, Mg, Mn a Zn (375, 112, 1200, 26, 98 mg kg-1 sušiny). Pro václavku smrkovou byly stanoveny vysoké obsahy následujících prvků (v mg kg-1 sušiny): Ag (5,6), Ca (149), Cu (29), Fe (186), Mg (1100), Mn (30) a Zn (40). Posledním studovaným volně rostoucím druhem byl hnojník obecný, který ve svých plodnicích silně akumuloval Ag, Cd, Cu, Se a Rb (biokoncentrační faktory: 12; 2,5; 2,3; 1,8 a 1,1). Koncentrace rizikových prvků v těchto houbách byly převážně nízké, nelze tudíž předpokládat negativní vliv na lidský organismus v případě jejich využití jako potravinových doplňků nebo při jejich konzumaci. Na druhou stranu mohou být využity jako alternativní zdroj esenciálních prvků (zejména Zn a Se). V případě hlívy ústřičné byly provedeny experimenty s obohacením růstového substrátu zinkem a selenem. U zinku byl nárůst koncentrace v plodnicích zcela minimální a lze tedy usuzovat, že míra obohacení růstového substrátu nemá významný vliv na výsledný obsah Zn. U selenu byla situace s obohacením růstového substrátu zcela odlišná. Už při přídavku 1 mg Se (ve formě Na2SeO3) do bloku růstového substrátu o hmotnosti zhruba 2 kg došlo k nárůstu obsahu Se v sušině plodnic na 3 až 6 mg kg-1, což představuje více než o jeden řád vyšší obsah ve srovnání s blokem substrátu, který nebyl selenem obohacen. V případě přídavku 5 mg Se došlo k dalšímu výraznému nárůstu koncentrace tohoto prvku na 40 až 60 mg kg-1 sušiny. This dissertation thesis is focused on determination of detrimental and essential elements in fruiting bodies of selected medicinal mushrooms. Auricularia auricula-judae, Tylopilus felleus, Pleurotus ostreatus, Flammulina velutipes, Armillaria ostoyae and Coprinus comatus were studied. Individual samples were collected from selected sites in South Bohemia. Pleurotus ostreatus was cultivated on the block of the substrate. Individual elements were determined using atomic absorption spectrometry with the flame or electrothermal atomization and flame photometry. Wild growing Auricularia auricula-judae was a good source of Ca and Mg (2200 a 2080 mg kg-1 dry matter) and Tylopilus felleus strongly accumulated Rb, Cd, Cu, Zn, Se and Mg (bioconcentration factors: 65.7; 2.47; 2.32; 1.93; 1.67 and 1.27). Another studied wild growing mushroom species was Flammulina velutipes; it was characterized with significant contents of Ca, Fe, Mg, Mn and Zn (375, 112, 1200, 26 and 98 mg kg-1 dry matter). For Armillaria ostoyae, high contents of the following elements were determined (mg kg-1 dry matter): Ag (5.6), Ca (149), Cu (29), Fe (186), Mg (1100), Mn (30) and Zn (40). The last wild growing species studied was Coprinus comatus. It strongly accumulated Ag, Cd, Cu, Se and Rb (bioconcentration factors: 12; 2.5; 2.3; 1.8 and 1.1). The concentrations of detrimental elements were generally rather low indicating no considerably negative effect on human health in the case of studied species consumed as a delicacy or used as food supplements. On the other hand, the mushroom species can be used as an alternative source of essential elements (especially Zn and Se). An experiment with enrichment of the cultivation substrate with zinc and selenium was performed in the case of Pleurotus ostreatus. The increase in the zinc content in fruiting bodies was low, thus it can be concluded that the level of enrichment indicates no considerable effect on the final content of zinc in fruiting bodies. The bioconcentration of selenium was totally different. The addition of 1 mg of Se (in the form of Na2SeO3) into the cultivation substrate (cca 2 kg) increased the content of Se in fruiting bodies to about 3 - 6 mg kg-1 dry matter. This content was one order higher compared to the Se content in fruiting bodies harvested from the substrate with no Se addition. In the case of the addition of 5 mg of Se, there was a further significant increase in the content of this element to about 40 - 60 mg kg-1 dry matter. Keywords: rizikové a esenciální prvky; houby s léčivými účinky; atomová absorpční spektrometrie; obohacování růstového substrátu; risk and essential elements; medicinal mushrooms; atomic absorption spectrometry; enrichment of the cultivation substrate Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Obsah vybraných rizikových prvků v plodnicích hub s léčivými účinky

Disertační práce se zabývá obsahem vybraných rizikových a esenciálních prvků v plodnicích hub s léčivými účinky. Studovanými druhy hub byly boltcovitka ucho Jidášovo (Auricularia auricula-judae), hřib ...

VONDRUŠKA, Jan
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Vliv invazní želvy nádherné na vývoj pulců skokana hnědého v různých etapách jeho vývoje
VODRÁŽKOVÁ, Magda
2022 - Czech Interakce predátor-kořist řídí vývoj mnoha behaviorálních a morfologických změn u živočichů. Ve vodním prostředí chemické podněty spolehlivě umožňují kořisti posoudit a vyhnout se riziku predace. Přítomnost predátora ovlivňuje populace kořisti buď přímou predací snížením její početnosti a změnou jejího chování, nebo modifikací různých částí jejich životní historie. Efekt vyvolaný rizikem predace může mít na populace silnější dopad, než přímý efekt mortality V posledních desetiletích se četnost a význam invazních druhů zvyšuje především v důsledku neúměrného růstu světového obchodu se zvířaty a rostlinami. Nepůvodní želva nádherná (Trachemys scripta elegans) má potenciál narušit vodní ekosystémy ve střední Evropě kvůli svým silným konkurenčním schopnostem a oportunní stravě. Tato práce přináší výsledky experimentů, ověřujících vliv přítomnosti nepůvodní a potenciálně invazní želvy nádherné na parametry životní historie embryí a larev skokana hnědého (Rana temporaria). Konkrétně se jedná o to, zda chemické podněty přenášené predátory způsobují změny v době líhnutí, vývojové fázi a velikosti těla při líhnutí pulců skokana a při jejich metamorfóze. současně jsem experimentálně ověřila dynamiku ontogeneze pulců v různých časových vzorcích přítomnosti invazního predátora. Přítomnost predátora ovlivnila všechny zkoumané faktory. Zjistila jsem, že při absenci želvy se embrya vylíhla za 12 dní, zatímco za přítomnosti predátora bylo líhnutí urychleno o dva dny. Embrya se se navíc vylíhla menší a v nižším stupni vývoje než bez přítomnosti predátora. Přítomnost želv zkrátila dobu metamorfózy pulců ze 110?11,7 dnů na 93?13,0 dnů (průměr ? S.D.). První metamorfovaní jedinci byli zaznamenáni 65. den a 80. den od vylíhnutí v přítomnosti predátora a v kontrolní skupině, resp. Metamorfovaní jedinci byli statisticky významně menší (12,8?0,99mm) v přítomnosti predátora než v kontrolní skupině (15,2?1,27mm). Trajektorie rychlosti růstu byly podobné u obou variant. Obrana pulců vyvolaná predátory byla tedy evidentní ve vyšších rychlostech vývoje a menších velikostech při metamorfóze bez významných změn v růstu. Pulci měli delší larvální období a byli menší velikosti při metamorfóze a nižší tělesné hmotnosti, když byl predátor přítomen v raném vývoji, než když se pulci vyvíjeli bez predátora. Časná přítomnost predátora nápadně snižovala růstové přírůstky pulců v raném vývoji. Po odstranění predátora se růst zrychlil nad úroveň naměřenou v podmínkách, kdy byl predátor přítomen v pozdní fázi vývoje, i bez přítomnosti predátora. Tyto rychlosti růstu však nepřesáhly rychlosti růstu stejně velkých pulců v ostatních treatmentech, a proto nebyly dostatečné pro kompenzaci zpomalení růstu v první části vývoje. Přítomnost predátora v pozdním vývoji pulce neovlivnila ani dobu do metamorfózy, ani velikost/hmotnost těla při metamorfóze. Výsledky ukazují spíše vzácně dokumentované typy reakcí kořisti obojživelníků na predátory. Tato studie rozšiřuje okruh studovaných predátorů, včetně vlivu na různé fáze vývoje potenciální kořisti. In the last few decades, the frequency and importance of invasive species has been increasing mainly due to the disproportionate growth of world trade in animals and plants. Predator-prey interactions drive the evolution of many behavioral and morphological traits in aquatic animals. In aquatic environments, chemical cues reliably enable prey to assess and avoid predation risk. The presence of a predator affects prey populations either by direct predation by reducing its abundance and changing its behavior, or by modifying various parts of its life history. The effect induced by the risk of predation can have a stronger impact on populations than the direct effect of mortality. Non-native red-eared sliders (Trachemys scripta elegans) have the potential to disrupt aquatic ecosystems in Central Europe because of their superior competitive abilities and omnivorous diets. I investigated whether continuous predator-borne cues are tied to changes in the hatching time, developmental stage, and body size at hatching of common frog tadpoles (Rana temporaria). Whether the developmental rates, growth rates and sizes at metamorphosis would alter in the presence of a predator and examined the dynamics of the ontogeny of tadpoles under different time patterns of an alien predator presence. The presence of a predator affected all factors examined. I found that in the absence of the slider, the embryos hatched in 12 days, while hatching was accelerated by two days in slider treatment. At the same time, the embryos hatched smaller and at a lower stage of development with the slider than without it. The presence of turtles shortened the time at metamorphosis of tadpoles from 110?11.7 days to 93?13.0 days (mean ? S.D.). The froglets were significantly smaller (12.8?0.99mm) in the presence of the predator than in the control treatment (15.2?1.27mm). The growth rate trajectories were similar between the predator treatment and the control. Thus, predator-induced tadpole defences were evident in higher developmental rates and smaller sizes at metamorphosis without significant changes in growth. I also found out that the tadpoles had a longer larval period and were smaller in size at metamorphosis and lower in body mass when the predator was present in early development than when the tadpoles developed without a predator. The early presence of a predator conspicuously reduced the growth increments of the tadpoles at early development. After the removal of the predator, growth accelerated above the level measured under the conditions of both the late predator and no predator. However, these growth rates did not exceed the growth rates of equally sized tadpoles in the other treatments and therefore were not sufficient to compensate for the growth slowdown in the first part of development. The presence of a predator in late tadpole development influenced neither the time to metamorphosis nor size/body mass at metamorphosis. Results show rather rarely documented types of amphibian prey responses to caged predators. This study extends the range of predators studied, including the effect on different phases of development of potential amphibian prey. Keywords: antipredátorská reakce; Rana temporaria; Trachemys scripta; adaptivní plasticita; doba vývoje; kairomony; antipredator response; Rana temporaria; Trachemys scripta; adaptive plasticity; development time; kairomones Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Vliv invazní želvy nádherné na vývoj pulců skokana hnědého v různých etapách jeho vývoje

Interakce predátor-kořist řídí vývoj mnoha behaviorálních a morfologických změn u živočichů. Ve vodním prostředí chemické podněty spolehlivě umožňují kořisti posoudit a vyhnout se riziku predace. ...

VODRÁŽKOVÁ, Magda
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Reproductive diapause in males of the linden bug, Pyrrhocoris apterus
HEJNÍKOVÁ, Markéta
2022 - English This thesis focuses on the male reproductive diapause in the linden bug, Pyrrhocoris apterus. We examined in detail the response of males to changing photoperiodic conditions, the change in levels of juvenile hormone, and its role in male diapause, as well as the effect of low temperature on diapause termination. We compared the physiology of males and females and pointed out important sexual dimorphism in the control of diapause. Finally, we analyzed a completely novel insect neuropeptide to and explored its possible link in the chain of control of reproductive diapause. This thesis focuses on the male reproductive diapause in the linden bug, Pyrrhocoris apterus. We examined in detail the response of males to changing photoperiodic conditions, the change in levels of juvenile hormone, and its role in male diapause, as well as the effect of low temperature on diapause termination. We compared the physiology of males and females and pointed out important sexual dimorphism in the control of diapause. Finally, we analyzed a completely novel insect neuropeptide to and explored its possible link in the chain of control of reproductive diapause. Keywords: Reproductive diapause; juvenile hormone; males; Methoprene-tolerant; Taiman; Corpus allatum; accessory glands; fertility Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Reproductive diapause in males of the linden bug, Pyrrhocoris apterus

This thesis focuses on the male reproductive diapause in the linden bug, Pyrrhocoris apterus. We examined in detail the response of males to changing photoperiodic conditions, the change in levels of ...

HEJNÍKOVÁ, Markéta
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Biometrické testování při studiu kognitivní zátěže v prostředí ArcGIS StoryMaps
BLAŽEK, Vojtěch
2022 - Czech Hlavním tématem předložené disertační práce je detailní analýza toho, jak žáci pracují s webovou mapovou aplikací ArcGIS StoryMaps, pomocí metod biometrického testování. Výběr tohoto tématu souvisí s rozvojem a větším zapojováním digitálních technologií do výuky, který byl akcelerován vypuknutím pandemie Covidu-19. Vliv digitálních technologií na současnost společnost zapříčinil novou průmyslovou revoluci 4.0, kdy většina pracovních procesů začíná být automatizována a řízena počítači. Tento trend se promítá i do reforem kurikulárních dokumentů po celém světě. Společným rysem kurikulárních reforem je zavádění digitálních kompetencí a změna pohledu na výuku informatiky. Tyto změny přenáší některé požadavky v oblasti digitálních kompetencí i na ostatní předměty včetně geografie. Úvodní teoretická část práce se věnuje transformaci kurikulárních dokumentů a vývoji GIS, včetně jeho vazbě na geografické vzdělávání v perspektivě 21. století. Nedílnou součástí je shrnutí dosavadních poznatků v oblasti kognitivní zátěže včetně možností jejího měření. Analytická část práce se zaměřuje na hodnocení dat naměřených pomocí systému Gazepoint. The main focus of the present dissertation is a detailed analysis of how students interact with the ArcGIS StoryMaps web mapping application using biometric testing methods. The choice of this topic is related to the development and greater involvement of digital technologies in education, which was accelerated by the outbreak of the Covid-19 pandemic. The impact of digital technologies on contemporary society has caused a new industrial revolution 4.0, where most work processes are becoming automated, and computer controlled. This trend is reflected in curriculum reforms around the world. A common feature of curriculum reforms is the introduction of digital competencies and a change in the way we view the teaching of computer science. These changes transfer some of the requirements in the area of digital competences to other subjects, including geography. The introductory theoretical part of the thesis is devoted to the transformation of curriculum documents and the development of GIS, including its relation to geographic education in the perspective of the 21st century. An integral part is a summary of the existing knowledge in the field of cognitive load, including the possibilities of its measurement. The analytical part of the thesis focuses on the evaluation of data measured by the Gazepoint system. Keywords: Biometrické testování; eye-tracking; kognitivní zátěž; webový GIS; ArcGIS; ArcGIS StoryMaps; Biometric testing; eye-tracking; cognitive load; web GIS; ArcGIS; ArcGIS StoryMaps Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Biometrické testování při studiu kognitivní zátěže v prostředí ArcGIS StoryMaps

Hlavním tématem předložené disertační práce je detailní analýza toho, jak žáci pracují s webovou mapovou aplikací ArcGIS StoryMaps, pomocí metod biometrického testování. Výběr tohoto tématu souvisí s ...

BLAŽEK, Vojtěch
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Lentiviry malých přežvýkavců - analýza prevalence onemocnění a distribuce genotypů SRLV v chovech ovcí a koz v ČR
VERNEROVÁ, Kateřina
2022 - Czech Maedi-visna u ovcí a artritida a encefalitida u koz jsou celosvětově rozšířená, progresivní zánětlivá onemocnění způsobená retroviry, které patří do skupiny lentivirů malých přežvýkavců (SRLV). U postižených zvířat způsobují celoživotní infekce, které se vyznačují pomalou progresí až do zjevného onemocnění a končí vždy letálně. Cílem této práce bylo zjistit prevalenci onemocnění SRLV v ČR, pomocí fylogenetické analýzy zmapovat genotypové zastoupení SRLV a analyzovat TMEM154, jakožto vybraný kandidátní marker rezistence proti SRLV u ovcí a koz. Celkem bylo odebráno 3410 vzorků krve ovcí a koz z 21 stád. Zjištěná sérologická prevalence maedi visna u ovcí byla 19,9 % (556/2801) a séroprevalence artritidy a encefalitidy u koz byla 14,1 % (86/609). Všechna séropozitivní zvířata byla testována metodou nested polymerase chain reaction (nPCR) na přítomnost provirové DNA. Fylogenetická analýza identifikovala genotyp SRLV v 77 sekvencích, z nichž 60 vzorků ovcí a koz bylo genotypu A a 17 vzorků ovcí patřilo genotypu B. Zatímco všechny sekvence genotypu B byly klasifikovány jako subtyp B2, skupina izolátů genotypu A vykazovala vyšší variabilitu a byly příbuzné se subtypy A2 a A3. Dále bylo náhodně vybráno 40 séropozitivních vzorků a 50 séronegativních vzorků ovcí a koz cílem navrhnout metodiku pro LAMP diagnostiku SRLV u ovcí a koz. Séronegativita byla jednoznačně potvrzena metodou LAMP u všech vzorků, séropozitivní vzorky byly potvrzeny ve 31 případech ze 40 u ovcí i koz. Ke genotypizaci TMEM154 bylo náhodně vybráno 605 vzorků ovcí a 60 vzorků koz. Nejvíce séropozitivních zvířat bylo heterozygotních EK (61 %), homozygotních EE bylo 58 % a homozygotních KK bylo 45 %. U ovcí byly identifikovány všechny tři genotypy, zatímco všechny kozy byly homozygotní o genotypu EE. Maedi-visna in sheep, and arthritis and encephalitis in goats, are globally widespread and progressive inflammatory diseases caused by retroviruses belonging to the small ruminant lentivirus (SRLV) group. They cause lifelong infections in affected animals, characterised by slow progression to overt disease and are always fatal. The aim of this study was to determine the prevalence of SRLV disease in the Czech Republic, to map the genotypic representation of SRLV using phylogenetic analysis, and to analyse TMEM154 as a selected candidate marker of SRLV resistance in sheep and goats. A total of 3 410 sheep and goat blood samples were collected from 21 flocks. The seroprevalence of maedi-visna in sheep was found to be 19.9% (556/2801), and the seroprevalence of arthritis and encephalitis in goats was 14.1% (86/609). All seropositive animals were tested by nested polymerase chain reaction (nPCR) for the presence of proviral DNA. Phylogenetic analysis identified the SRLV genotype in 77 sequences, of which 60 sheep and goat samples were genotype A and 17 sheep samples were genotype B. While all genotype B sequences were classified as subtype B2, the group of genotype A isolates showed higher variability and were related to subtypes A2 and A3. In addition, 40 seropositive and 50 seronegative sheep and goat samples were randomly selected to design a methodology for LAMP (loop-mediated isothermal amplification) diagnosis of SRLV in sheep and goats. Seronegativity was clearly confirmed by the LAMP method in all samples, and seropositivity was confirmed in 31 out of 40 cases in both sheep and goats. 605 sheep and 60 goat samples were randomly selected for TMEM154 genotyping. Most seropositive animals were heterozygous EK (61%), 58% were homozygous EE, and 45% were homozygous KK. In sheep, all 3 genotypes were identified, while all goats were homozygous EE. Keywords: maedi-visna; artritida a encefalitida koz; nPCR; LAMP; genotypizace; maedi-visna; goat arthritis and encephalitis; nPCR; LAMP; genotyping Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Lentiviry malých přežvýkavců - analýza prevalence onemocnění a distribuce genotypů SRLV v chovech ovcí a koz v ČR

Maedi-visna u ovcí a artritida a encefalitida u koz jsou celosvětově rozšířená, progresivní zánětlivá onemocnění způsobená retroviry, které patří do skupiny lentivirů malých přežvýkavců (SRLV). U ...

VERNEROVÁ, Kateřina
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Biodiversity of Myxozoa based on extensive screening of fish and environmental samples
LISNEROVÁ, Martina
2022 - English Myxozoans represent a group of morphologically simplified endoparasites infecting mainly fish, annelid and bryozoan hosts including more than 2,600 nominal species. However, the diversity seems to be unexplored and undervalued. Host searching and invasive dissection is a commonly used method for the identification of myxozoan species diversity. Metabarcoding and amplicon analyses of environmental DNA from sediment, water and soil is developing approach for biodiversity assessment and have been performed in many biological areas to identify the diversity of organisms, communities and populations. Using classical morphological and molecular approaches, we explored the myxozoan diversity in selected areas and host groups. In addition, we propose a new methodological approach for the studying of myxozoan diversity based on environmental DNA from sediment and amplicon sequencing. Illumina Mi-Seq with metabarcoding and newly designed primer sets is suitable for analyzing myxozoan communities without the need to find and capture intermediate or final hosts. Keywords: Myxozoa; Diversity; Phylogeny; eDNA; elasmobranchs Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Biodiversity of Myxozoa based on extensive screening of fish and environmental samples

Myxozoans represent a group of morphologically simplified endoparasites infecting mainly fish, annelid and bryozoan hosts including more than 2,600 nominal species. However, the diversity seems to be ...

LISNEROVÁ, Martina
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Pastorace mládeže v českých a moravských diecézích. Pastorálně teologická analýza práce diecézních center života mládeže.
DUDOVÁ, Anna
2022 - Czech Disertační práce je tematicky zaměřena na pastoraci mládeže v českých a moravských diecézích. Cílem práce je přispět k reflexi pastorace mládeže v České republice, a to pomocí hlubší sondy do koncepce i praxe diecézních center života mládeže (DCŽM). Teologickým východiskem pro zpracování tohoto tématu jsou závazné dokumenty Německé biskupské konference (DBK), Italské biskupské konference (CEI) a Latinskoamerické biskupské konference (CELAM), které otevírají cestu k pokoncilnímu pojetí pastorace mládeže, které formulovali významní pastorální teologové jako Martin Lechner nebo Riccardo Tonelli. Zásady české pastorace mládeže jsou pak srovnány s výše uvedenými zahraničními dokumenty. Dále se pracuje také s ybranými výsledky výzkumných šetření provedených v prostředí aktivní katolické mládeže. Výsledkem je kritická analýza projektu diecézních center života mládeže a návrh jejich nové koncepce. The dissertation is thematically focused on the pastoral care of youth in the Czech and Moravian dioceses. The aim of the thesis is to contribute to the reflection on youth pastoral care in the Czech Republic by means of a deeper probe into the concept and practice of diocesan youth life centres. The theological basis for the elaboration of this topic are the binding documents of the German Bishops' Conference (DBK), the Italian Bishops' Conference (CEI) and the Latin American Bishops' Conference (CELAM), which open the way to the post-conciliar concept of youth pastoral, formulated by prominent pastoral theologians such as Martin Lechner or Riccardo Tonelli. The principles of Czech youth pastoral are then compared with the above-mentioned foreign documents. In addition, selected results of research investigations carried out in the environment of active Catholic youth are presented. The result is a critical analysis of the project of diocesan youth life centres and a proposal for their new concept. Keywords: pastorace; pastorace mládeže; pastorální teologie; diakonická práce s mládeží; Sekce pro mládež ČBK; diecézní centra života mládeže; pastoral care; youth ministry; pastoral theology; diaconal youth work; Section for Youth of the Czech Bishops' Conference; Diocesan Youth Centers of Life Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Pastorace mládeže v českých a moravských diecézích. Pastorálně teologická analýza práce diecézních center života mládeže.

Disertační práce je tematicky zaměřena na pastoraci mládeže v českých a moravských diecézích. Cílem práce je přispět k reflexi pastorace mládeže v České republice, a to pomocí hlubší sondy do koncepce ...

DUDOVÁ, Anna
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

On the Influences of Technology on Morality
ARZROOMCHILAR, Ehsan
2022 - Czech Technology is such ubiquitous today that one barely can contact the world around where no artefact is involved. The most basic needs of humans, e.g., food and shelter, hinge heavily upon artefacts. Now, what are the consequences of the current technologically-saturated surroundings on morals? To answer the question, in my writing, I have gone through different traditions as well as movements to figure out how to accommodate moral dimensions of technology. Ultimately I have suggested to integrate the relevant pieces of two movements of Social Construction of Technology (SCOT) as well as ctor-Network-Theory (ANT) into postphenomenology. Further, I have also proposed a three-stage schema for moralization of technology along the process of the design of technology. The schema consists of a descriptive stage, an evaluative stage, and an imperative stage. In the descriptive stage designers need to provide an illustration of what a particular technology brings about. In the second stage, they are supposed to evaluate the description provided in stage one. And in the last stage, they must embed the insights into the technology in question. The work closes its tale by an application of the schema on a case study. Keywords: Technology; Postphenomenology; ANT; SCOT; STS; Morality; Ethics Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. On the Influences of Technology on Morality

Technology is such ubiquitous today that one barely can contact the world around where no artefact is involved. The most basic needs of humans, e.g., food and shelter, hinge heavily upon artefacts. ...

ARZROOMCHILAR, Ehsan
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022