Molekulární detekce Mycoplasma gallisepticum na základě celogenomových dat
KURÁŽ, Jakub
2024 - český Tato práce shrnuje základní poznatky o druhu Mycoplasma gallisepticum a navrhuje detekčně-rozlišovací metodu, která odlišuje tento druh od ostatních druhů rodu Mycoplasma. Optimalizací metody real time PCR bylo umožněno zpřesnění a zvýšení efektivity detekce unikátních sekvencí z genomu M. gallisepticum. Funkčnost a správnost metody byla posléze ověřena detekcí M. gallisepticum ve směsných vzor-cích ptačích a myších mykoplazem. This thesis reviews the basic knowlegde of a bacteria Mycoplasma gallisepticum and attempts to propose a functional detection protocol to distinguish M. gallisepticum from related species of the genus Mycoplasma. Real time PCR optimalization has refined the specificity and increased the efficiency of detection of selected genomic loci for M. gallisepticum. The functionality and accuracy of the method was verified in laboratory experiments by detecting the occurrence of M. gallisepticum in mixed Mycoplasma samples. Klíčová slova: Mycoplasma gallisepticum; Mollicutes; onemocnění drůbeže; bakterie; faktory viru-lence; detekce; vakcína; real time PCR; multiplex PCR; MAMA; mg2; glpK; potC; plpA; pvpA; Mycoplasma synoviae; Mycoplasma meleagridis; Mycoplasma imitans; Mycoplasma anatis; Mycoplasma pulmonis; Mycoplasma gallisepticum; Mollicutes; poultry disease; bacteria; virulence factors; detection; vaccine; real time PCR; multiplex PCR; MAMA; mg2; glpK; potC; plpA; pvpA; Mycoplasma synoviae; Mycoplasma meleagridis; Mycoplasma imitans; Myco-plasma anatis; Mycoplasma pulmonis Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Molekulární detekce Mycoplasma gallisepticum na základě celogenomových dat

Tato práce shrnuje základní poznatky o druhu Mycoplasma gallisepticum a navrhuje detekčně-rozlišovací metodu, která odlišuje tento druh od ostatních druhů rodu Mycoplasma. Optimalizací metody real ...

KURÁŽ, Jakub
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Molekulární detekce střevních parazitů u laboratorních hlodavců
FÜRSTOVÁ, Petra
2024 - český Diplomová práce se zaměřuje na problematiku molekulární detekce pomocí real-time PCR u laboratorních hlodavců s využitím primerů pro TaqMan real-time PCR. Navržené primery byly verifikovány na 22 vzorcích bukálních stěrů, biopsií ze střevní tkáně a exkrementů. Specificita byla ověřena na 9 příbuzných střevních parazitech. Také bylo provedeno stanovení detekčních limitů reakčních směsí. Detekční limit pro reakční směs pro Spironucleus muris byl stanoven na 3,3×10-5 ng/l, pro Tritrichomonas muris na 9,4×10-8 ng/l a pro Giardia muris na 1,66×10-6 ng/l. Mezi laboratorními hlodavci existuje mnoho onemocnění a přítomnost původců těchto onemocnění je potřeba detekovat. Mezi nejcitlivější detekční metody patří právě molekulární detekce. V dnešní době je stále k dispozici pouze málo navržených esejí pro detekci střevních parazitů, mezi které se řadí například Spironucleus muris, Tritrichomonas muris a v neposlední řadě Giardia muris. Potřeba detekovat tyto parazity vzrostla v důsledku stoupající poptávky po SPF (specified-pathogen free) laboratorních hlodavcích pro experimentální potřeby. Často se využívají jako indikátor selhání mikroizolační techniky. Střevní paraziti mohou také způsobovat velmi nepříjemná onemocnění, které je potřeba léčit. Cíle práce byly splněny. Optimalizované metody jsou vhodné pro použití k detekci Spironucleus muris, Tritrichomonas muris a Giardia muris. Výsledky diplomové práce mohou sloužit jako informační zdroj a mohou být využity k dalším výzkumným účelům. The master's thesis focuses on the issue of molecular detection by real-time PCR in laboratory rodents using primers for TaqMan real-time PCR. The designed primers were verified on 22 samples of buccal swabs, biopsies from intestinal tissue, and excrement. Specificity was verified on 9 related intestinal parasites. The detection limits of the reaction mixtures were also determined. The detection limit of the reaction mixture for Spironucleus muris was set at 3.3×10-5 ng/l, for Tritrichomonas muris at 9.4×10-8 ng/l and for Giardia muris at 1.66×10-6 ng/l. Many disease agents exist among laboratory rodents. The presence of these agents needs to be detected. Molecular detection is one of the most sensitive detection methods. Nowadays, only a few designed essays are available for detection of intestinal parasites, which include Spironucleus muris, Tritrichomonas muris and, last but not least, Giardia muris. The necessity to detect these parasites has increased due to the demand for SPF (specified-pathogen free) laboratory rodents for experimental purposes. The intestinal parasites are often used as an indicator of the failure of micro-isolation technology. Also, intestinal parasites can cause very unpleasant diseases that need to be treated. The aims has been met. The optimized methods are suitable for use in the detection of Spironucleus muris, Tritrichomonas muris and Giardia muris. The results of the thesis can serve as an information source and can be used for other investigative purposes. Klíčová slova: Molekulární detekce; Real-time PCR; TaqMan; Střevní paraziti; Molecular detection; Real-time PCR; TaqMan; Intestinal parasites Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Molekulární detekce střevních parazitů u laboratorních hlodavců

Diplomová práce se zaměřuje na problematiku molekulární detekce pomocí real-time PCR u laboratorních hlodavců s využitím primerů pro TaqMan real-time PCR. Navržené primery byly verifikovány na 22 ...

FÜRSTOVÁ, Petra
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Hodnocení kávových a kávovinových nápojů z hlediska senzorických vlastností a antioxidační aktivity
HONYSZOVÁ, Tereza
2024 - český Cílem diplomové práce bylo zhodnocení vybraných druhů káv a kávovinových nápojů z hlediska senzorických vlastností a chemických vlastností se zaměřením na antioxidační vlastnosti a polyfenolické látky. Diplomová práce byla rozdělena do dvou částí. První teoretická část se zabývá pěstováním a zpracováním kávy, konzumací kávových a kávovinových nápojů, legislativním vymezením této problematiky. Dále charakterizuje důležité chemické látky v kávě. Druhá praktická část se nejprve zabývala senzorickou analýzou vybraných vzorků kávy a kávovin a poté stanovením vybraných fyzikálních a chemických vlastností vzorků. To zahrnovalo stanovení antioxidační aktivity vzorků a celkový obsah polyfenolů. Mezi jednotlivými vzorky byly vyhodnoceny statisticky významné odlišnosti a zpracována byla i korelační analýza. Poslední částí diplomové práce bylo dotazníkové šetření, které se zaměřovalo na konzumaci kávových a kávovinových nápojů. Při hodnocení senzorických vlastností vzorků byly zjištěny statisticky významné odlišnosti u šesti z deseti deskriptorů. Vzorky se také významně lišily i z hlediska fyzikálněchemických rozborů. Nejvyšší hodnotu pH měl vzorek kávy Standard, z kávovin to byla Bio konopná káva. Vzorky káv měli vyšší rozpustnou sušinu než vzorky kávovin. Při měření barvy bylo zjištěno, že vzorky káv jsou tmavší než vzorky kávovin. Z měření antioxidační aktivity a obsahu polyfenolů byl nejlépe vyhodnocen vzorek kávovinového nápoje Red espresso. The aim of the thesis was to evaluate selected coffee and coffee substitutes in terms of sensory properties and chemical properties with a focus on antioxidant properties and polyphenolic substances. The thesis was divided into two parts. The first, theoretical part, deals with the cultivation and processing of coffee, consumption of coffee and coffee substitutes, legislative definition of this issue. It also characterizes the most important chemical substances in coffee. The second, practical part, deals with the sensory analysis of selected coffee and coffee substitutes samples. The physical and chemical properties of the selected samples were determined. Subsequently, the antioxidant activity of the samples and the total polyphenol content were determined. Statistical analysis evaluated differences between the samples and correlation analysis was performed. The last part of the thesis was a questionnaire that focused on the consumption of coffee and coffee substitutes. Statistically significant differences were found for six of ten descriptors when evaluating sensory attributes of the samples. The samples differed significantly also in the physicochemical analyses. The Standard coffee sample had the highest pH value, and among the coffee substitutes it was the Organic Hemp coffee. The coffee samples had higher soluble solids than the coffee substitutes samples. When colour was measured, the coffee samples were found to be darker than the coffee substitutes. From the measurements of antioxidant activity and polyphenol content, the sample of the coffee substitute Red espresso was evaluated as the best. Klíčová slova: káva; kávovinové nápoje; senzorická analýza; antioxidační aktivita; polyfenoly; coffee; coffee substitutes; sensory analysis; antioxidant activity; polyphenols Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Hodnocení kávových a kávovinových nápojů z hlediska senzorických vlastností a antioxidační aktivity

Cílem diplomové práce bylo zhodnocení vybraných druhů káv a kávovinových nápojů z hlediska senzorických vlastností a chemických vlastností se zaměřením na antioxidační vlastnosti a polyfenolické ...

HONYSZOVÁ, Tereza
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Vliv zatížení na pícninářskou hodnotu pastevních porostů ve vybraném pastevním areálu
BÖHMOVÁ, Miroslava
2024 - český Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Vliv zatížení na pícninářskou hodnotu pastevních porostů ve vybraném pastevním areálu

BÖHMOVÁ, Miroslava
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Vliv vybraných faktorů na rychlost kažení plodové zeleniny
ŠUTKOVÁ, Jana
2024 - český Plodová zelenina je jednou z nejvíce konzumovaných zelenin celosvětově, a proto je důležité neustále optimalizovat podmínky jejího skladování. Cílem diplomové práce bylo posoudit vliv ošetření rajčat (vodovodní voda, Cibulex) a skladovacích teplot (6,5 °C, 15 °C, 21 °C), na rychlost kažení, dále vyhodnotit preference respondentů (n=347) ohledně konzumace a nákupu rajčat a posoudit nabídku rajčat v tržní síti. Vzorky rajčat ošetřené roztokem Cibulex vykazovaly nižší nárůst vybraných skupin mikroorganismů v porovnání s kontrolními vzorky. V dotazníkovém šetření bylo zjištěno, že z celkové počtu respondentů (n=347) většina (97 %) rajčata konzumuje. Nejvíce jsou preferovaná tuzemská cherry rajčata, sladké chuti a šťavnaté konzistence. Při nákupu rajčat jsou respondenti ovlivňováni zejména cenou, kvalitou a vzhledem rajčat. Poměrně značná část respondentů (63 %) skladuje rajčata při chladničkové teplotě, která není vhodná z důvodu ztráty vůně a chutě rajčat. Při průzkumu nabídky rajčat v devíti obchodních řetězcích (Tesco, Albert, Penny, Kaufland, Globus, Flop, Coop, Norma a Lidl) byla v průběhu letního a zimního období, zjištěna široká nabídka tohoto sortimentu. Přičemž nejširší nabídka (n=12) se nacházela v obchodních řetězcích Globus a Lidl, a to v zimním období. Fruiting vegetables are among the most consumed vegetables worldwide, so it is important to constantly optimise storage conditions. The aim of the thesis was to assess the effect of tomato treatments (tap water, Cibulex) and storage temperatures (6.5 °C, 15 °C, 21 °C) on the rate of spoilage, to evaluate the preferences of respondents (n=347) regarding the consumption and purchase of tomatoes and to assess the supply of tomatoes in the market network. Tomato samples treated with Cibulex solution showed a lower increase of selected groups of microorganisms compared to control samples. In the questionnaire survey, it was found that 97% of the respondents consumed tomatoes and preferred domestic cherry tomatoes, with a sweet taste and juicy consistency. When purchasing tomatoes, respondents are mainly influenced by the price, quality and appearance of tomatoes. A relatively large proportion of respondents (63 %) store tomatoes at refrigerator temperature, which is not suitable because of the loss of flavour and taste of tomatoes. A survey of the tomato offer in nine supermarket chains (Tesco, Albert, Penny, Kaufland, Globus, Flop, Coop, Norma and Lidl) revealed a wide range of tomatoes during the summer and winter periods. The widest range (n=12) was found in the Globus and Lidl chains during the winter period. Klíčová slova: plodová zelenina; kažení; rajčata; mikrobiologická analýza; Cibulex; dotazníkové šetření; průzkum trhu; fruiting vegetables; spoilage; tomatoes; microbiological analysis; Cibulex; questi-onnaire survey; market research Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Vliv vybraných faktorů na rychlost kažení plodové zeleniny

Plodová zelenina je jednou z nejvíce konzumovaných zelenin celosvětově, a proto je důležité neustále optimalizovat podmínky jejího skladování. Cílem diplomové práce bylo posoudit vliv ošetření rajčat ...

ŠUTKOVÁ, Jana
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Hodnocení vybraných pekařských výrobků v závislosti na technologii výroby a receptuře
HRDLIČKOVÁ, Vanda
2024 - český Společně s nastupujícími trendy zdravého životního stylu, bio produktů a ekologického zemědělství se do povědomí populace čím dál tím více dostává domácí výroba nejrůznějších potravinářských výrobků a s ní i proces fermentace. Fermentační technologie zahrnují širokou škálu produktů, ať už v potravinářství či v jiných oborech. První zmínky o fermentaci mouky a vody (tedy pekařského kvasu) jsou mapovány již v době 1500 před Kristem ve starém Egyptě, a i přes nové technologie kypření těsta, jako jsou např. droždí, kypřící prášek a jedlá soda, se právě pekařský kvas dostává do obliby nejen pekařů, ale i běžné populace. Cílem diplomové práce bylo zhodnotit vliv použitého kvasu či pekárenských kvasnic na kvalitu pekařských výrobků. První část je věnována teoretickému pře-hledu, týkající se fermentací, obilovinám, pečivu a technologiím jeho výroby. Druhá část práce byla praktická, kde byly vzorky připraveného pečiva vyhodnoceny dvěma metodami na základě pekařského pokusu - tedy senzorickou analýzou a fyzikálněchemickými analýzami. Práce byla doplněna i o dotazníkové šetření. Byly zjištěny významné rozdíly ve fyzikálněchemických parametrech chlebů kypřených kvasem a kypřených za pomoci kvasnic (kyselost, objemová hmotnost, projevy stárnutí). Rovněž byl prokázán pozitivní vliv kvasu v senzorické analýze, při které byly kvasové chleby hodnoceny hodnotiteli lépe než vzorek chlebu kvasnicového. Together with the emerging trends of healthy lifestyle, organic products and organic farming, the domestic production of various food products and the fermentation process are becoming increasingly more important for the population. Fermentation technologies cover a wide range of products in the food industry or in other fields. The first references mentioning fermentation of flour and water (i.e. sourdough) date back to 1500 BC in ancient Egypt, and despite new doughraising technologies such as baker's yeasts, baking powder and baking soda, it is sourdough starter that is becoming popular not only for bakers but also for the whole population. The aim of this thesis was to evaluate the effect of the sourdough starter used on the quality of bakery products. The first part is devoted to a theoretical overview concerning fermentations, cereals, bakery products and their production technologies. The second part of the thesis was practical, where samples of the produced bakery products were evaluated by two methods based on the baking experiment, i.e. sensory analysis and physicochemical analysis. The thesis was also complemented by a questionnaire survey. Significant differences were found in the physicochemical parameters of yeast-leavened and sourdough leavened loaves of bread (acidity, bulk density, ageing symptoms). A positive effect of leavening was also demonstrated in the sensory analysis, in which the sourdough loaves of bread were rated better by the evaluators than the leavened bread samples. Klíčová slova: kvas; kvasnice; droždí; bakterie mléčného kvašení; kvasinky; chléb; sourdough; leaven; lactic acid bacteria; yeasts; bread Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Hodnocení vybraných pekařských výrobků v závislosti na technologii výroby a receptuře

Společně s nastupujícími trendy zdravého životního stylu, bio produktů a ekologického zemědělství se do povědomí populace čím dál tím více dostává domácí výroba nejrůznějších potravinářských výrobků a ...

HRDLIČKOVÁ, Vanda
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Netradiční rostlinné zdroje pektinu a možnosti jejich využití
ČERVENÁ, Simona
2024 - český Hlavním cílem diplomové práce je shromáždit informace o druzích rostlin, které by byly vhodnými netradičními zdroji pektinu. Dílčím cílem je na vybraném druhu ověřit možnost jeho využití jako zdroje pektinu pro potravinářství. Diplomová práce představuje 13 rostlinných druhů, u kterých hodnotí chemické složení, vlastnosti, a především možnosti jejich využití. Experimentální část ověřuje teoretické poznatky na jednom z představených zástupců ? tykvi olejné. U vybraného druhu byla stanovena: výtěžnost hrubého pektinu, vaznost vody, vaznost oleje, ochota tvorby želé a filmu. Nejperspektivnějšími rostlinami byly shledány: Amaranthus cruentus, Beta vulgaris, Crataegus monogyna, Cucurbita pepo, Daucus carota, Helianthus annuus, Linum usitatissimum, Pisum sativum, Solanum lycopersicum. Druhy mají potenciál pro vysoký obsah bioaktivních látek, zejména pektinů. Pektin lze doporučit k využití nejen v potravinářství, ale i v lékařství, farmacii a obalovém sektoru. The main objective of the diploma thesis is to collect information on plant species that would be suitable non-traditional sources of pectin. Another objective is to ve-rify on a selected species the possibility of its use as a source of pectin for the food industry. The diploma introduces 13 plant species and evaluates their chemical composition, properties and especially the possibilities of their use. The experimen-tal part verifies the theoretical knowledge on one of the introduced representatives ? oil pumpkin. The following parameters were determined for the selected species: yield of crude pectin, water binding, oil binding, and willingness to form jelly and film. The most promising plants were found to be: Amaranthus cruentus, Beta vul-garis, Crataegus monogyna, Cucurbita pepo, Daucus carota, Helianthus annuus, Linum usitatissimum, Pisum sativum, Solanum lycopersicum. The species have the potential for a high content of bioactive substances, especially pectins. Pectin can be recommended for use not only in the food industry, but also in the medical, pharmaceutical and packaging sectors. Klíčová slova: pektin; netradiční zdroje pektinu; želírovací schopnost; využití pektinu; pectin; non-traditional sources of pectin; gelling ability; pectin utili-zation Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Netradiční rostlinné zdroje pektinu a možnosti jejich využití

Hlavním cílem diplomové práce je shromáždit informace o druzích rostlin, které by byly vhodnými netradičními zdroji pektinu. Dílčím cílem je na vybraném druhu ověřit možnost jeho využití jako zdroje ...

ČERVENÁ, Simona
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Kvalitativni parametry zrna pšenice v závislosti na hnojeni N
DVOŘÁK, František
2024 - český Diplomová práce se zabývala kvalitativními parametry zrna pšenice v závislosti na hnojení dusíkem. Pro tento účel byly vybrány 4 odrůdy ozimé pšenice (Crossway, Megan, Kalbex a Bonanza) a založen maloparcelkový pokus na pozemcích Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích. Sledované ukazatele byly počet klasů na m2, počet zrn v klasu, HTZ, výnos jednotlivých odrůd, obsah dusíkatých látek, obsah mokrého lepku, sedimentační index a číslo poklesu. Dávky dusíkatého hnojení byly stanoveny následovně: 50 kg.ha-1, 90 kg.ha-1, 120 kg.ha-1. The theme of this Diploma's thesis was wheat grain quality parameters as a function of nitrogen fertilization. For this purpose, four varieties of winter wheat were chosen (Crossway, Megan, Kalbex and Bonanza) and small scale experiment was coducted on the grounds of the South Bohemian University in Ceske Budejovice. The monitored indicators were the quantity of ear per m2, quantity of grain in the ear, weight of thousand grains, yield of individual varieties, content of nitrogen substances, wet gluten content, sedimentation value and falling number. The nitrogen fertilization rates were set as follows: 50 kg.ha-1, 90 kg.ha-1, 120 kg.ha-1. Klíčová slova: Pšenice ozimá; hnojení dusíkem; kvalita; Winter wheat; nitrogen fertilization; quality Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Kvalitativni parametry zrna pšenice v závislosti na hnojeni N

Diplomová práce se zabývala kvalitativními parametry zrna pšenice v závislosti na hnojení dusíkem. Pro tento účel byly vybrány 4 odrůdy ozimé pšenice (Crossway, Megan, Kalbex a Bonanza) a založen ...

DVOŘÁK, František
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Vliv tvaru kopyta na výskyt hniloby kopyt koní
RUHSAMOVÁ, Kristýna
2024 - český Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Vliv tvaru kopyta na výskyt hniloby kopyt koní

RUHSAMOVÁ, Kristýna
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Vývoj územního plánování ve vybrané obci
SOUKUPOVÁ, Aneta
2024 - český Tématem diplomové práce je vývoj územního plánování ve vybrané obci. Lokalitou pro zmapování vývoje byla obec Olešník. Kvalifikační práce je členěna na dvě části, a to na část teoretickou a část praktickou. První část se zaměřuje na definici územního plánování, jeho cíle, úkoly či historii a zahrnuje také popis procesu územního plánování, vývoj legislativy, účastnící se subjekty a formy územního plánování. V druhé části je zpracován popis obce, výčet jednotlivých územních plánů či jejich změn v průběhu doby, včetně jejich porovnání a následného vyhodnocení. Na závěr jsou prací navrženy možné budoucí strategie, úpravy a změny stávajícího územního plánu obce Olešník. The topic of the diploma thesis is the development of territorial planning in the selected municipality. The location for development mapping was the municipality Olešník. The qualification work is divided into two parts, the theoretical part and the practical part. The qualification work is divided into two parts, the theoretical part and the practical part. The first part is focused on the definition of territorial planning, its goals, tasks or history and also includes a description of the spatial planning process, the development of legislation, participating entities and forms of spatial planning. In the second part, a description of the municipality, a list of individual territorial plans or their changes over time, including their comparison and subsequent evaluation, is processed. At the end, the work proposes possible future strategies, modifications and changes to the existing terrotorial plan of the municipality Olešník. Klíčová slova: krajinné plánování; Olešník; stavební zákon; územní plán; územní plánování; landscape planning; Olešník; building law; urban plan; urban planning Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Vývoj územního plánování ve vybrané obci

Tématem diplomové práce je vývoj územního plánování ve vybrané obci. Lokalitou pro zmapování vývoje byla obec Olešník. Kvalifikační práce je členěna na dvě části, a to na část teoretickou a část ...

SOUKUPOVÁ, Aneta
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024