Yes (2260)
No (4)
Number of found documents:
2264
Published from
to
Pokročilé metody Monte Carlo v syntéze obrazu
Vévoda, Petr; Wilkie, Alexander
2023 - English
Monte Carlo (MC) integration is an essential tool in many fields of science. In image synthesis, it has enabled photorealistic rendering results via physically based light trans- port simulation. However, an inherent problem of MC integration is variance causing noise in rendered images. This thesis presents three methods, each taking a different approach to variance reduction in rendering. The first approach focuses on improving the sampling technique. An adaptive solution is proposed for unbiased direct illumination sampling, employing Bayesian regression and a novel statistical model of direct illumination to achieve robustness. This method was integrated into a production renderer, demonstrating both its theoretical soundness and practical utility. The second approach explores the combination of multiple sampling techniques via multiple importance sampling (MIS). Optimal weighting functions are derived, proving to minimize the variance of MIS estimators. The new weights outperform all common heuristics and provide novel design considerations for selecting appropriate sampling tech- niques in integration problems. Finally, the third approach involves pre-computation to handle challenging scenarios effectively. Pre-computed reference images of a clear sky are used to create a high- quality fitted model,... Integrace metodou Monte Carlo (MC) je základním matematickým nástrojem v mnoha vědních odvětvích. V syntéze obrazu pak umožnila dosažení fotorealistických výsledků skrze fyzikálně věrnou simulaci obrazu. Neodmyslitelným problémem MC integrace však je variance způsobující šum v renderovaných obrázcích. Tato práce představuje tři me- tody, z nichž každá uplatňuje jiný přístup ke snížení variance v renderování. První přístup se zaměřuje na zlepšení vzorkovací techniky. Je navrženo adaptivní řešení pro vzorkování přímého osvětlení, a to za využití Bayesovské regrese a nového sta- tistického modelu přímého osvětlení pro zajištění robustnosti. Tato metoda byla integro- vána v produkčním rendereru, kde demonstrovala svou teoretickou správnost i praktickou použitelnost. Druhý přístup se zabývá kombinací více vzorkovacích technik pomocí vícenásobného vzorkování podle důležitosti. Jsou odvozeny optimální váhové funkce, které prokaza- telně minimalizují varianci těchto kombinovaných estimátoru. Tyto nové váhy překonávají všechny běžně užívané heuristiky a poskytují nové možnosti při výběru vhodných vzor- kovacích technik v integračních problémech. Konečně třetí přístup zahrnuje předvýpočet, který umožňuje efektivní řešení i nároč- ných simulací. Předpočítané referenční obrázky bezmračné oblohy jsou použity k vytvo-...
Keywords:
Computer graphics|image synthesis|rendering|light transport simulation|Monte Carlo methods; Computer graphics|image synthesis|rendering|light transport simulation|Monte Carlo methods
Available in a digital repository NRGL
Pokročilé metody Monte Carlo v syntéze obrazu
Monte Carlo (MC) integration is an essential tool in many fields of science. In image synthesis, it has enabled photorealistic rendering results via physically based light trans- port simulation. ...
Vytváření umělých dat pro sestavování policejních fotorekognic
Dokoupil, Patrik; Peška, Ladislav
2023 - English
Eyewitness identification plays an important role during criminal proceedings and may lead to prosecution and conviction of a suspect. One of the methods of eyewitness identification is a police photo lineup when a collection of photographs is presented to the witness in order to identify the perpetrator of the crime. In the lineup, there is typically at most one photograph (typically exactly one) of the suspect and the remaining photographs are the so-called fillers, i.e. photographs of innocent people. Positive identification of the suspect by the witness may result in charge or conviction of the suspect. Assembly of the lineup is a challenging and tedious problem, because the wrong selection of the fillers may end up in a biased lineup, where the suspect will stand out from the fillers and would be easily identifiable even by a highly uncertain witness. The reason why it is tedious is due to the fact that this process is still done manually or only semi-automatically. This thesis tries to solve both issues by proposing a model that will be capable of generating synthetic data, together with an application that will allow users to obtain the fillers for a given suspect's photograph. 1 Fotorekognice hraje důležitou roli při policejním vyšetřování a může vést až ke stíhání a usvědčení podezřelé osoby. Během fotorekognice je svědkovi předložena sada fotografií a dále je tázán, jestli na některé z fotografií poznává pachatele. Tato sada fotografií typicky obsahuje nejvýše jednu fotografií podezřelého, často pak právě jednu takovou fotografii. Na ostatních fotografiích v sadě jsou pak vyobrazeny nevinné osoby, tzv. figuranti. Iden- tifikace podezřelého svědkem může vést až k obvinění a případně následnému usvědčení podezřelého. Sestavení fotorekognice je náročný a časově zdlouhavý proces, protože volba nevhod- ných figurantů může vést k určitému zkreslení a znatelně tak ovlivnit celý proces rekog- nice. Tohle zkreslení je obvykle způsobeno tím, že v případě figurantů, kteří jsou odlišní od podezřelého, dojde k situaci, kdy podezřelý bude znatelně vyčnívat a pro svědka tedy bude velmi snadné jej identifikovat. Zdlouhavost celého procesu je způsobena tím, že tvorba fotorekognice je z velké části prováděna manuálně, v lepším případě pak polo- automaticky. Tato práce se snaží řešit oba tyto problémy za pomocí navrhnutého modelu který bude schopný generovat umělé obrázky pro tvorbu fotorekognice a za pomocí aplikace, která uživateli na základě vstupního obrázku podezřelého vygeneruje vhodné...
Keywords:
generativní modely|policejní fotorekognice|hluboké učení|GAN|generování obrázků; GAN|generative adversarial network|police lineup|deep learning|image generation
Available in a digital repository NRGL
Vytváření umělých dat pro sestavování policejních fotorekognic
Eyewitness identification plays an important role during criminal proceedings and may lead to prosecution and conviction of a suspect. One of the methods of eyewitness identification is a police photo ...
2D & 3D počítačové modelování stínících vrstev nízkoteplotního plazmatu se zaměřením na jejich vzájemnou interakci
Hromádka, Jakub; Hrachová, Věra
2023 - English
The presented thesis deals with the study of the sheath layer which is formed during the interaction of a low-temperature plasma with a solid object using computer modelling techniques. The theoretical part of the thesis summarizes knowledge about the physics of the sheath layer of electropositive and electronegative plasma and presents the theory of measuring plasma parameters using a Langmuir probe, including a discussion of the effect of collisions of charged particles with neutrals on the probe measurements. Further, theoretical descriptions of the plasma are presented which are the basis of the computer models created in the framework of the thesis: a particle model based on the Particle-in-Cell method and a fluid model of the drift-diffusion approximation of the plasma. The developed particle model works in 3D space, uses the null-collision Monte Carlo method to account for the effects of collisions of charged particles with neutrals and implements the Intel Math Kernel Library functions to solve the Poisson's equation. The fluid model is implemented using FeniCS software. At first, the developed models are used for the calculation of the sheath layer and the current-voltage characteristics of free-standing Langmuir probes of several types: a 1D model of an infinitely large planar probe, a 2D model of... Předložená práce se zabývá studiem stínící vrstvy, která vzniká při interakci nízkoteplotního plazmatu s pevnou látkou, pomocí techniky počítačového modelování. Teoretická část práce shrnuje poznatky o fyzice stínící vrstvy elektropozitivního i elektronegativního plazmatu a prezentuje teorii měření parametrů plazmatu pomocí Langmuirovy sondy včetně diskuze vlivu srážek nabitých částic s neutrálními na sondová měření. Dále jsou předneseny teoretické popisy plazmatu, ze kterých vycházejí počítačové modely vytvořené v rámci práce: částicový model založený na metodě Particle-in-Cell a spojitý model drift-difúzní aproximace plazmatu. Vyvinutý částicový model pracuje ve 3D prostoru, využívá Monte Carlo metodu nulové srážky pro započítání efektů srážek nabitých částic s neutrálními a implementuje funkce knihovny Intel Math Kernel Library pro řešení Poissonovy rovnice. Spojitý model byl implementován pomocí software FeniCS. Vyvinuté modely byly nejprve využity pro výpočet stínící vrstvy a voltampérových charakteristik samostatně stojících Langmuirových sond několika typů: 1D model nekonečně rozlehlé rovinné sondy, 2D model válcové sondy a 3D model rovinné sondy konečných rozměrů. Výpočty byly úspěšně srovnány s teorií a diskutovány byly vzájemné rozdíly při užití různých modelovacích technik. Pozornost byla dále...
Keywords:
nízkoteplotní plazma|stínící vrstva|metoda Particle-in-Cell|Langmuirova sonda|interakce stínících vrstev; low-temperature plasma|plasma sheath|Particle-in-Cell method|Langmuir probe|sheath interaction
Available in a digital repository NRGL
2D & 3D počítačové modelování stínících vrstev nízkoteplotního plazmatu se zaměřením na jejich vzájemnou interakci
The presented thesis deals with the study of the sheath layer which is formed during the interaction of a low-temperature plasma with a solid object using computer modelling techniques. The ...
Elektrotransportní vlastnosti monokrystalu CuMnAs
Volný, Jiří; Uhlířová, Klára
2023 - English
Electrical transport measurement of small, irregular shape sample is difficult task. In order to overcome these limitations, this thesis employed a focused ion beam microfabrication. Process of microfabrication is successfully tested on a room temperature antiferromagnet CuMnAs. Temperature dependence resistivity and magnetoresistance of tetragonal bulk CuMnAs single crystal is found to be strongly anisotropic due to layered structure and magnetic order. Anisotropic magnetoresistance shows two fold symmetry and reached a magnitude of 0.12 %. Employing the∼ phenomenological Stoner-Wohlfarth we conclude that the sample has uniaxial magnetic anisotropy with an easy axis not pointing along any principal crystallographic direction and behaves like a two domain antiferromagnet. Měření elektro-transportních vlastnostní malých vzorků nepravidelného tvaru je nesnadný úkol. Pro překonání těchto obtíží byla v této práci použita technika mikro-obrábění vzorků pomocí fokusovaného iontového svazku. Proces mikroobrábění byl úspěšně odzkoušen na sloučenině CuMnAs, jež vykazuje antiferomagnetické chování za pokojové teploty. Teplotní závislost elektrického odporu a magnetorezistence vykazuje silně anizotropní chování, způsobené vrstevnatou strukturou a magnetickým uspořádáním. Anizotropní magnetorezistence vykazuje dvojčetnou symetrii s amplitudou nepřesahující 0.12%. Použití fenomenologického Stoner-∼ Wohlfarthova modelu poukazuje na uniaxiální magnetickou anizotropii vzorku, se snadnou osou nemířící podél žádného význačného krystalografického směru a chování jako dvou doménového antiferomagnetu.
Keywords:
Anizotropie|antiferomagnetismus|CuMnAs; Anisotropy|antiferromagnetism|CuMnAs
Available in a digital repository NRGL
Elektrotransportní vlastnosti monokrystalu CuMnAs
Electrical transport measurement of small, irregular shape sample is difficult task. In order to overcome these limitations, this thesis employed a focused ion beam microfabrication. Process of ...
Laserem buzené zdroje rentgenového záření pro zobrazování
Lamač, Marcel; Nejdl, Jaroslav
2023 - English
With the advent of high-power lasers in recent decades, a unique source of hard X-ray radiation has become availible. This source of collimated, broadband, femtosecond, incoherent and hard X-ray radiation is produced when a focused laser with intensity above 10^18 W/cm^2 collides with a gas target. The strong electric field of the laser pulse ionizes the gas and interacts with the plasma generating a strong plasma wake wave. This space charge separation inside the target generates longitudal electric fields of the order of 100 GV/m. This resulting electrostatic wakefield accelerates the electrons to relativistic velocities and causes them to travel in oscillatory motion behind the laser pulse, producing hard and collimated X-ray radiation. This thesis is focused on a theoretical evaluation and an experimental design of this laser-plasma X-ray source. Furthermore, we consider the source's unique properties for novel imaging applications. Díky příchodu vysoko-intenzitních laserů v posledních dekádách je k dispozici nový zdroj tvrdého rentgenového záření. Tento zdroj kolimovaného, širokopásmového, ultrakrátkého a prostorově koherentního rentgenového záření je produkován když vstoupí laserový puls s intenzitou nad 10^18 W/cm^2 v ohnisku do plynného terče. Silné elektrické pole laseru ionizuje plyn a interaguje se vzniklým plazmatem, čímž excituje silnou brázdovou vlnu v plazmatu. Takto vzniklé rozložení náboje v terči generuje podélné elektrické pole v řádu 100 GV/m. Vzniklé elektrostatické brázdové pole urychluje elektrony na relativistické rychlosti a způsobuje, že oscilují za laserovým pulsem, což produkuje kolimované rentgenové záření. Tato práce je zaměřena na teoretické vyhodnocení a experimentální design tohoto laser-plazmového rentgenového zdroje. Dále diskutujeme unikátní vlastnosti zdroje vhodné pro moderní aplikace v zobrazování.
Keywords:
Laser; plazma; rentgenové záření; radiografie; zobrazení s fázovým kontrastem; Laser; plasma; X-rays; radiography; phase-contrast imaging
Available in a digital repository NRGL
Laserem buzené zdroje rentgenového záření pro zobrazování
With the advent of high-power lasers in recent decades, a unique source of hard X-ray radiation has become availible. This source of collimated, broadband, femtosecond, incoherent and hard X-ray ...
Tři hlasy, z nichž jeden je Paulův
Sabir, Adam Hemen; Ryšková, Mireia
2023 - English
The main question of the text is to explore what concern that is at the center of the arguments in the Corinthian debate surrounding food sacrificed to idols? To be able to answer the question we apply a new method to the text to reach the various positions in Corinth. The objective of this present text is therefore to provide a textual division which in the latter part of my dissertation (of which this paper is a chapter) is exegetically interpreted and further contextualized as to its central argumentation. Hlavní otázkou textu je prozkoumat, jaké obavy jsou středem argumentů v korintské debatě o jídle obětovaném modlám? Abychom byli schopni odpovědět na otázku, aplikujeme na text novou metodu, abychom dosáhli různých pozic v Korintu. Cílem tohoto předkládaného textu je proto poskytnout textové členění, které je ve druhé části mé disertační práce (jehož je tato práce kapitolou) exgeticky interpretováno a dále kontextualizováno, pokud jde o jeho ústřední argumentaci. The main question of the text is to explore what concern that is at the center of the arguments in the Corinthian debate surrounding food sacrificed to idols? To be able to answer the question we apply a new method to the text to reach the various positions in Corinth. The objective of this present text is therefore to provide a textual division which in the latter part of my dissertation (of which this paper is a chapter) is exegetically interpreted and further contextualized as to its central argumentation. Hlavní otázkou textu je prozkoumat, jaké obavy jsou středem argumentů v korintské debatě o jídle obětovaném modlám? Abychom byli schopni odpovědět na otázku, aplikujeme na text novou metodu, abychom dosáhli různých pozic v Korintu. Cílem tohoto předkládaného textu je proto poskytnout textové členění, které je ve druhé části mé disertační práce (jehož je tato práce kapitolou) exgeticky interpretováno a dále kontextualizováno, pokud jde o jeho ústřední argumentaci.
Available in a digital repository NRGL
Tři hlasy, z nichž jeden je Paulův
The main question of the text is to explore what concern that is at the center of the arguments in the Corinthian debate surrounding food sacrificed to idols? To be able to answer the question we ...
Polský model populistické strany, nový pohled na popuistickou radikální pravici
Greger, Vojtěch; Kofroň, Jan; Guasti, Petra
2023 - English
The Polish model of the populist party: a new perspective on the populist radical right Master's thesis Bc. Vojtěch Greger Abstract The rise of the populist radical right (PRR), a group of parties critical of the established norms of Western liberal democracy, in the 2010s, manifesting itself in events such as Brexit or the illiberal takeover of Hungary, has been a subject of considerable attention both from academics and the general public, and has been viewed with great concern. Academic studies of the PRR have often elevated the nativist elements in such parties' rhetoric while paying considerably less attention to the economic appeals thereof. However, in recent years, literature highlighting the importance of economic deprivation in fomenting support for Eurosceptic and PRR movements has begun to appear. This thesis is predicated on this literature's argument that the electoral successes of the PRR are very often driven precisely by economic deprivation and the discontent stemming from it. To illustrate our argument, we examine the electoral support of the Polish Law and Justice (PiS) party in the 2015 and 2019 elections using ordinary least squares regression (OLS) and geographically weighted regression (GWR). Our findings show that structural economic factors, mainly the share of workers employed in... The Polish model of the populist party: a new perspective on the populist radical right Master's thesis Bc. Vojtěch Greger Abstrakt Vzestup populistické radikální pravice (PRP), skupiny stran kritických vůči zavedeným normám západní liberální demokracie, v desátých letech, který se manifestoval například událostmi jako Brexit či převzetí Maďarska neliberálními silami, se stal předmětem značného zájmu ze stran akademiků i veřejnosti, byv vnímán s velkými obavami. Akademické studie PRP často vyvyšovaly nativistické prvky přítomné v rétorice těchto stran a apelům ekonomickým věnovaly značně méně času. V posledních několika letech se však v akademické sféře začala objevovat literatura poukazující na důležitost ekonomické deprivace v umocňování podpory stran PRP. Tato práce je založena na argumentu této literatury, že volební úspěchy PRP jsou velmi často taženy právě ekonomickou deprivací a nespokojeností, která z ní plyne. Tento argument je ilustrován analýzou volební podpory polské strany Právo a spravedlnost (PiS) ve volbách v letech 2015 a 2019 za použití regrese nejmenších čtverců (OLS) a geograficky vážené regrese (GWR). Naše výsledky ukazují, že strukturální ekonomické faktory, zejména podíl pracujících v primárním sektoru, jsou klíčovými prediktory podpory PiS. Těmito zjištěními podporujeme zjištění již...
Keywords:
populismus; volby; Polsko; OLS regrese; geograficky vážená regrese; ekonomické hlasování; primární sektor; populism; elections; Poland; OLS regression; geographically weighted regression; economic voting; primary sector
Available in a digital repository NRGL
Polský model populistické strany, nový pohled na popuistickou radikální pravici
The Polish model of the populist party: a new perspective on the populist radical right Master's thesis Bc. Vojtěch Greger Abstract The rise of the populist radical right (PRR), a group of parties ...
Snaha o usmíření mezi Gruzií a Abcházií: Strategie bottom-up od roku 2008
Salát, Patrik; Brisku, Adrian; Horák, Slavomír
2023 - English
The diploma thesis deals with the reconciliation process between Georgia and Abkhazia after 2008. It focuses on the bottom-up approach to reconciliation and its potential for the transformation of protracted and unresolved conflict. As bilateral negotiations at the political level between Georgia and Abkhazia have been stuck since 2006, this approach may be the only tool to disrupt the current status quo. Nevertheless, the research results show that this potential is quite limited in Georgia. The current discourse about the conflict that supports the status quo is related to ethnic identity and is also supported internationally. Middle-range leaders who are a significant part of the civil peace process between Georgia and Abkhazia have attempted to disrupt this discourse. Still, even their willingness to compromise is limited by a myth-symbol complex. Moreover, participants in peace projects are not homogeneous groups that aim to disrupt the current discourse. The research results show that reconciliation outside the state level has contributed at least to the preservation of negative peace because its participants mostly avoid stereotypes, do not feel negative emotions towards the other side, and reject violence as a tool for conflict resolution. Diplomová práce se zabývá usmiřováním mezi Gruzií a Abcházií po roce 2008. Soustředí se přitom na bottom-up strategii k usmíření a její dosavadní přínos a potenciál k transformaci vleklého a nevyřešeného konfliktu. Vzhledem k tomu, že bilaterální jednání na politické úrovni mezi Gruzií a Abcházií neprobíhají od roku 2006, může být tato strategie jedním z mála nástrojů, jak současný status quo narušit. Výsledky výzkumu ale ukazují, že tento potenciál je v Gruzii značně omezený. Současný státní diskurz o konfliktu, který status quo podporuje, je navázaný na etnickou identitu a také podporovaný na mezinárodní úrovni. Vlivní lídři občanské společnosti, kteří jsou zainteresování v civilním mírovém procesu mezi Gruzií a Abcházií, mají sice snahu tento diskurz narušit, nicméně i jejich ochota ke kompromisům je značně svázaná mýticko-symbolickým komplexem. Účastníci mírových projektů navíc nejsou jednolitá homogenní skupina, která by se snažila současný diskurz narušit. Výsledky výzkumu ukazují, že proces usmiřování mimo státní úroveň přispívá alespoň k zachování negativního míru, protože jeho účastníci se většinou vyhýbají stereotypům, necítí negativní emoce vůči druhé straně a odmítají násilí jako nástroj k řešení konfliktu.
Keywords:
Gruzínsko-Abchazský konflikt; Rusko; Etnický konflikt; Usmíření; Transformace konfliktu; Budování míru; Symbolická politika; Georgian-Abkhaz Conflict; Russia; Ethnic Conflict; Reconciliation; Conflict Transformation; Peacebuilding; Symbolic Politics
Available in a digital repository NRGL
Snaha o usmíření mezi Gruzií a Abcházií: Strategie bottom-up od roku 2008
The diploma thesis deals with the reconciliation process between Georgia and Abkhazia after 2008. It focuses on the bottom-up approach to reconciliation and its potential for the transformation of ...
Kataklyzmické proměnné hvězdy
Kára, Jan; Wolf, Marek
2023 - English
Cataclysmic variable stars are semi-detached binary systems consisting of a white dwarf primary star and a late-type secondary star. The secondary star in these systems is over- filling its Roche lobe, which enables a mass transfer to occur between the components. The transferred matter forms an accretion disc around the white dwarf when no strong magnetic field is present. This thesis presents a study of four different cataclysmic variables using light-curve modelling of eclipses and Doppler tomography as the main methods of analysis. The systems selected for the study belong to different subtypes of cataclysmic variables, but all of them exhibit mass-transfer rates which put them close to a border between systems with stable and unstable accretion disc. Although each of the systems studied represents a different type of cataclysmic variables, the presented study shows that they share some common characteristics and that the study of such systems is important for understanding the evolution of cataclysmic variables and the physical processes connected with them. Kataklyzmické proměnné hvězdy jsou polodotykové dvojhvězdné systémy. Primární slož- kou těchto systémů je bílý trpaslík, sekundární složkou je hvězda pozdního spektrálního typu. Sekundární hvězda vyplňuje svůj Rocheův lalok až po mez, kdy dochází k přetékání hmoty mezi složkami. V systémech se slabým magnetickým polem pak přetékající hmota utváří akreční disk kolem bílého trpaslíka. Tato práce předkládá studii čtyř různých kataklyzmic- kých proměnných hvězd zakládající se primárně na modelování světelných křivek zákrytů a Dopplerovské tomografii. Vybrané systémy patří k různým typům kataklyzmických proměn- ných hvězd, ale míra přenosu hmoty těchto systémů se pohybuje v blízkosti hranice mezi systémy se stabilními a nestabilními akrečními disky. I když každý ze systémů studovaných v této práci představuje jiný typ kataklyzmických proměnných hvězd, tato práce ukazuje, že sdílí některé společné vlastnosti, a že studování takovýchto systémů je důležité pro pochopení evoluce kataklyzmických proměnných hvězd a fyzikálním procesů s nimi spojenými.
Keywords:
Kataklyzmické dvojhvězdy|akreční disk|trpasličí novy|novám podobné dvojhvězdy; Cataclysmic variable|accretion disk|dwarf novae|nova-likes
Available in a digital repository NRGL
Kataklyzmické proměnné hvězdy
Cataclysmic variable stars are semi-detached binary systems consisting of a white dwarf primary star and a late-type secondary star. The secondary star in these systems is over- filling its Roche ...
Přístupy k enzymové syntéze hypermodifikovaných DNA polymerů
Ondruš, Marek
2023 - English
The aim of this thesis was to synthesize new series of modified 2'-deoxynucleoside triphosphates (dNTPs) bearing hydrophobic modifications, use them in enzymatic synthesis of fully-modified DNA and study its bio-physical properties. In the first part of the thesis, a set of four 2'-deoxynucleosides bearing a linear or branched alkane, indole or phenyl group were synthesized by Sonogashira cross-coupling reactions using alkynes and iodinated nucleosides. Ethynyl linkers of corresponding nucleosides were reduced by catalytic hydrogenation to obtain another four nucleosides bearing the modifications through alkyl linker. All eight nucleosides were then transformed into 2'-deoxynucleoside triphosphates (dNTPs) by Yoshikawa phosphorylation and individually tested as substrates for polymerase synthesis by primer extension (PEX). Their combinations were systematically tested to generate DNA containing one or even four modified nucleotides. It was possible to replace all four canonical nucleotides with hydrophobically-modified counterparts and thus synthesize DNA with high density of modifications. Nevertheless, only nucleotides bearing modifications through rigid ethynyl linker were suitable for synthesis of longer hypermodified DNA. Nucleotides with more flexible alkyl linker destabilized duplex during... Cílem této práce bylo nasyntetizovat novou sérii modifikovaných 2'- deoxynukleosidtrifosfátů (dNTP) nesoucích hydrofobní modifikace, použít je v enzymové syntéze plně modifikované DNA a studovat její bio-fyzikální vlastnosti. V první části práce byla nasyntetizována série čtyř 2'-deoxynukleosidů nesoucích lineární nebo rozvětvenou alkylovou, indolovou nebo fenylovou skupinu pomocí Sonogashirovy cross- couplingové reakce. Ethynylové linkry příslušných nukleosidů byly redukovány katalytickou hydrogenací za účelem získání dalších čtyř nukleosidů nesoucích modifikace prostřednictvím alkylového linkeru. Všech osm nukleosidů bylo poté přeměněno fosforylací na 2'- deoxynukleosidtrifosfáty (dNTP), podle Yoshikawy, a jednotlivě testovány jako substráty pro polymerázovou syntézu prodloužením primeru (PEX). Byla zkoumána jejich kombinace za účelem vytvoření DNA obsahující jednu nebo dokonce čtyři modifikované nukleotidy. Podařilo se nahradit všechny čtyři kanonické nukleotidy hydrofobně modifikovanými protějšky a syntetizovat tak DNA s vysokou hustotou modifikací. Nicméně pro syntézu delší plně modifikované DNA byly vhodné pouze nukleotidy nesoucí modifikace prostřednictvím rigidního ethynylového linkru. Nukleotidy s vice flexibilním alkylovým linkerem destabilizovaly během syntézy duplex DNA, pravděpodobně...
Keywords:
aptamery; DNA; RNA; aptamers; DNA; RNA
Available in a digital repository NRGL
Přístupy k enzymové syntéze hypermodifikovaných DNA polymerů
The aim of this thesis was to synthesize new series of modified 2'-deoxynucleoside triphosphates (dNTPs) bearing hydrophobic modifications, use them in enzymatic synthesis of fully-modified DNA and ...
NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web
Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz
Provider
Other bases