Národní úložiště šedé literatury

Význam vybraných proteinů v klinicko-patologickém hodnocení karcinomu prostaty
KURFÜRSTOVÁ, Daniela; BÁRTEK, Jiří; BRYCHTOVÁ, Svetlana; BELEJ, Kamil
2017 - English Hlavním cílem disertační práce bylo přispět k pochopení vztahů mezi proteiny zapojenými do složitého mechanismu oprav poškozené DNA ve vývoji a progresi karcinomu prostaty. The main objective of the dissertation was to contribute to the understanding of relationships between proteins involved in the complex mechanism of DNA damage repair in the development and progression of prostate cancer. Keywords: karcinom prostaty; odpověď buňky na poškození DNA; imunohistochemická analýza; oxidativní stres; kalikrein 7 a 11; prostate carcinoma; DNA damage response; immunohistochemical analysis; oxidative stress; effect of fixation; kallikreins 7 and 11 Available in digital repository of UPOL. Význam vybraných proteinů v klinicko-patologickém hodnocení karcinomu prostaty

Hlavním cílem disertační práce bylo přispět k pochopení vztahů mezi proteiny zapojenými do složitého mechanismu oprav poškozené DNA ve vývoji a progresi karcinomu prostaty....

KURFÜRSTOVÁ, Daniela; BÁRTEK, Jiří; BRYCHTOVÁ, Svetlana; BELEJ, Kamil
Univerzita Palackého v Olomouci, 2017

Tracking optical properties and antioxidant activities of polyphenols by joint theoretical and experimental approaches.
BILER, Michal; KUBALA, Martin; KUBALA, Martin
2016 - English Polyfenoly jsou hojně zastoupeny v mnoha druzích ovoce, zeleniny, nápojů atd. a mají mnoho biologických aplikací. Tato disertační práce využívá výpočetní kvantové metody k popisu a racionalizaci fyzikálně-chemických vlastnosti flavonolignanů a pyranoantokyaninů pro lepší porozumění jejich biologických účinků na molekulární úrovni. Všechny výstupy z teoretických výpočtů jsou diskutovány vzhledem k experimentálním datům. Metody funkcionálu hustoty (DFT) byly použity při studiu antioxidační aktivity daných sloučenin. Časově závislé TD-DFT metody posloužily pro popis UV/Vis absorpčních spekter flavonolignanů a pyranoantokyaninů a jejich pH závislosti, a disperzně-korigované DFT-D metody byly využity při popisu nekovalentních interakcí. Stručně jsou také popsány interakce těchto molekul s biomolekulami. Kapitola 6 představuje zatím nepublikované výsledky týkající se nekovalentních interakcí v systémech pigment: kopigment, které poslouží pro budoucí studie k nalezení 'nejlepšího' kopigmentu. Polyphenols are abundantly found in many fruit, vegetables, beverages, etc. and they possess many potential health benefits. Computational methods were thoroughly used through this thesis to rationalize, describe and predict physical chemical properties of flavonolignans and pyranoanthocyanins. Here, we aim at an understanding of polyphenol biological actions at a molecular level. All outcomes from the theoretical computations were discussed with respect to experimental data. The properties related to antioxidant activity of flavonolignans were investigated by density functional theory (DFT) methods. The pH dependence of ultraviolet/visible (UV/Vis) absorption properties of flavonolignans and pyranoanthocyanins were evaluated by time dependent (TD-) DFT methods, and noncovalent interactions were investigated within dispersion-corrected DFT methods. A short overview is also given on interaction of such compounds with biomolecules. Chapter 6 presents yet not published results of several noncovalent pigment: copigment systems. This part of the results serves as a good starting point to search for 'the best copigment'. Keywords: Polyfenoly; DFT; Nekovalentní interakce; UV/Vis absorpce; Antioxidanty; Polyphenols; DFT; Noncovalent interactions; UV/Vis absorption; Antioxidants Available in digital repository of UPOL. Tracking optical properties and antioxidant activities of polyphenols by joint theoretical and experimental approaches.

Polyfenoly jsou hojně zastoupeny v mnoha druzích ovoce, zeleniny, nápojů atd. a mají mnoho biologických aplikací. Tato disertační práce využívá výpočetní kvantové metody k popisu a racionalizaci ...

BILER, Michal; KUBALA, Martin; KUBALA, Martin
Univerzita Palackého v Olomouci, 2016

Synthesis of D-Glucosamine Derivatives and their Reactivity Study at Position 1, 2, and 3
RUČIL, Tomáš; CANKAŘ, Petr
2016 - English Předložená práce je zaměřena na syntézu a studium nových derivátů s potenciální biologickou aktivitou vycházejících ze struktury D-glukosaminu. D-glukosamin je všeobecně znám jako molekula s širokým spektrem vlastností. Je prekurzorem glykosaminoglykanů, což jsou stavební prvky chrupavek, či je obsažen v polymerní struktuře hyaluronové kyseliny. Tento polymer je důležitý pro své antibakteriální či hojivé účinky; své využití našel i v prostředcích pečující o pleť. Další, z pohledu lidstva velmi důležitou, vlastností, je inkorporace D-glukosaminu do skeletu peptidoglykanu. Tyto makromolekuly jsou základní stavební jednotkou buněčných stěn bakterií. Bylo zjištěno, že narušení tvorby buněčných stěn vede k přerušení reprodukce bakteriálních buněk. Tento princip antibakteriální léčby využívají mnohá antibiotika, jako například penicilin. Z výše zmíněných užitečných vlastností D-glukosaminu si tato práce klade za cíl přípravu nových derivátů, které by mohly rozšířit tuto stále se rozvíjející oblast. Diskuzní část je rozdělena do tří základních částí. První část je věnována cyklizačním reakcím, kde cyklus může být uzavřen mezi dusíkem na uhlíku C2 a anomerním uhlíkem C1 (produkt B) anebo alternativně je cyklus uzavřen přes uhlík C3 (produkt C). Během výzkumu byly připraveny výchozí látky a intermediáty, které umožňovaly cyklizační reakce, avšak samotná cyklizace probíhala buďto velmi problematicky anebo prakticky vůbec. Dále byla syntéza významně komplikována tvorbou anomerů v takřka každém reakčním kroku, kde následná separace byla zdlouhavá díky podobným fyzikálně-chemickým vlastnostem látek. Prostřední část je zaměřena na přípravu a studium reaktivity derivátu D-glukosaminu D s volnou hydroxy skupinou. Byly navrženy a optimalizovány dvě reakční cesty vedoucí k derivátu D. Následně byl meziprodukt D podroben alkylačním a oxidačním reakčním krokům. Během Fukuyama-Mitsunobu alkylace bylo zjištěno, že vzniká trojčetný aziridinový kruh E jakožto významný vedlejší produkt. Formace aziridinu nastává ovšem jen v případě, když byl k ochránění C4 a C6 hydroxy skupiny využit aceton dimethylacetal. Oxidace sloučeniny D vedla ke keto derivátu F, který byl následně podroben kondenzačním reakcím. Tyto reakce avšak nevedly k očekávaným produktům. Třetí část práce, co do počtu nově připravených sloučenin, nejúspěšnější, je zaměřena na syntézu 2,3 - altropyranosidů H z dinosylovaného derivátu G. Tato skupina látek není nijak zvlášť prozkoumána, dosud známé syntézy zahrnují mnoho reakčních kroků s kolísavými výtěžky. Naproti tomu náš postup nabízí jednoduchou a univerzálně použitelnou metodu vycházející z komerčně dostupného N-acetyl glukosaminu pro přípravu 2,3- diaminoaltropyranosidů H s velmi dobrými výtěžky. The submitted thesis is focused on the synthesis and study of new potentially biologically active derivates, based on the D-glucosamine motif. D-glucosamine is well known molecule with plenty of interesting properties. It is a precursor of glucosaminoglycans, which are building units of cartilages or it can be found in the polymer structure of hyaluronic acid. This polymer is important for its antibacterial or healing effect; it is also a component of skin-care products. Moreover, the structure of D-glucosamine is incorporated into the skeleton of peptidoglycan. Such molecules are building units of bacteria cell walls. It has been found, that disruption of cell wall formation process leads to inhibition of bacteria reproduction. Lots of antibiotics, such as penicillin, use this mechanism of action. It is obvious, that D-glucosamine found the application in many aspects of our live. Therefore, this thesis is focused on the preparation of new D-glucosamine based derivates, which can extend the current knowledge of reactivity of the D-glucosamine molecule. The discussion part is divided into the three chapters. The first one is dedicated to cyclization reactions, where the cycle can be formed either between the nitrogen at C2 carbon and anomeric C1 carbon (product B) or the cyclization occurs between the nitrogen at C2 carbon and C3 carbon (product C). During the research, the starting compounds and intermediates allowing the cyclization were prepared. Nevertheless, the cyclization itself was troublesome or it did not undergo at all. Moreover, the synthesis of nearly all products was significantly complicated with formation of anomers, where further separation was extremely difficult due to its similar chemical properties. The middle part is based on the synthesis and reactivity study of D-glucosamine derivate containing the free hydroxyl group D. We suggested and optimized two synthetic routes leading to derivate D. Subsequently, intermediate D was used in alkylation and oxidation reactions. During Fukuyama-Mitsunobu reactions we found that three - membered ring - aziridine as an important byproduct is easily formed. However, the aziridine formation was observed only when acetone dimethylacetal was used for the hydroxyl protection at C4 and C6 groups. The oxidation of D led to ketoderivate F, which was further tested toward the condensation reactions. These reactions did not lead to the desired products. The last part is focused on the synthesis of 2,3-altropyranosides H from dinosylated derivate G. This family of compounds is not well explored. The known syntheses involve plenty of reaction steps with fluctuating yields. To the contrary, we developed simple and universal method utilizing commercially available N-acetyl glucosamine as a starting compound. This method affords 2,3-diaminoaltropyranosides in very good yields. Keywords: D-glukosamin; acylace; aziridin; cyklizace; D-Glucosamine; acylation; aziridine; cyclisation Available in digital repository of UPOL. Synthesis of D-Glucosamine Derivatives and their Reactivity Study at Position 1, 2, and 3

Předložená práce je zaměřena na syntézu a studium nových derivátů s potenciální biologickou aktivitou vycházejících ze struktury D-glukosaminu. D-glukosamin je všeobecně znám jako molekula s širokým ...

RUČIL, Tomáš; CANKAŘ, Petr
Univerzita Palackého v Olomouci, 2016

Internet Memes and their Signifiance for Myth Studies
GONČAROV, Pavel; ARBEIT, Marcel; ARBEIT, Marcel
2016 - English Tato dizertační práce tvrdí, že základ mýtu spočívá v novelizujícím se a komplexifikujícím se rituálu post-totemistické oběti. Její příklad spatřuje v poezii a snaží se ukázat, jak chápání poezie a umění směřovalo historií až k definovanému aktu snad jakéhokoli obsahu. S ohledem na výhledy transhumanismu prochází práce s myšleným básníkem od cvičení v konkrétní poezii za psacím strojem ke kódované ASCII tabulce, emotikonám a polychromatickým glyfům, které při zobrazování podléhají kódovým úpravám výrobců technologií. Práce dále představuje pohled na memetický přenos informace, což je zapracováno do modelu, který čerpá z différance Jacquesa Derridy. Od konstrukce stromu hypotetických změn ve vývoji stavu kultury primitivního kmene Waoraniů se práce přesouvá k logickému cvičení o hypernymech a hyponymech. Práce dále uvádí příklady vazbení mezi komplexifikujícími se vrstvami různých sémiotických systému a spolu s analýzou mýtu kentaura nabízí schematický model, který by měl pomoci při jejich diachronní memetické analýze. Následuje dlouhodobá statistická srovnávací studie 3351 západních a čínských webových komiksů rage comics a[:baozou manhua:], která má pomoci poukázat na fungování mýtu. Konečná interpretace je pak srovnána se závěry, kterých se dobrali povolaní mytologové. This dissertation posits that the heart of myth rests with the novelizing and complexifying ritual of post-totemic sacrifice. As it makes an example of its delivery through poetry it tries to show the changing nature of poetry and art through history towards a designated act of whichever content. Transhumanism is seen as a tendency and so the dissertation imagines a poet whose practical exercise in the workings of typewriter produced concrete poetry are then tied to the coded ASCII table, emoticons and polychromatic glyphs which are subject to default visual modifications by manufacturers of technology. The dissertation then offers a view at memetic information transmission which is worked into a model that draws on Jacque Derrida's différance. From a construction of a tree of hypothetical changes in the evolution of a state of culture of the primitive Waorani tribe, the dissertation moves to a logical exercise about hypernyms and hyponyms. The dissertation then points out examples of different discharges between complexifying layers of semiotic systems, and together with an analysis of the myth of centaur it offers a schematic model which should aid their diachronic memetic analysis. This is followed by a long-term comparative statistical study of 3,351 western and Chinese web comicsrage comics and[:baozou manhua:] respectivelyin order to draw attention to the workings of myth. The resulting interpretation is then compared with conclusions reached by some of the more notable mythologists. Keywords: mýtus; mytologie; návrat k archaismu; poezie; konkrétní poezie; sémiotika; participační média; digitální kultura; mem; memetika; internetové memy; rage comics; čínské rage comics; baozou manhua; baoman; myth; mythology; archaic revival; poetry; concrete poetry; semiotics; participatory media; digital culture; meme; memetics; internet memes; rage comics; Chinese rage comics; baozou manhua; baoman Available in digital repository of UPOL. Internet Memes and their Signifiance for Myth Studies

Tato dizertační práce tvrdí, že základ mýtu spočívá v novelizujícím se a komplexifikujícím se rituálu post-totemistické oběti. Její příklad spatřuje v poezii a snaží se ukázat, jak chápání poezie a ...

GONČAROV, Pavel; ARBEIT, Marcel; ARBEIT, Marcel
Univerzita Palackého v Olomouci, 2016

The Portrayal of the American South in the Vampire series True Blood and The Vampire Diaries
ADAMOVÁ, Diana; ARBEIT, Marcel
2016 - English Tato práce pojednává o zobrazení amerického Jihu a jeho společenských a politických aspektů ve dvou upírských románových ságách Pravá krev a Upíří deníky a také jejich televizními adaptacemi. Práce se zabývá problematikou rasy, stereotypizací pohlaví, společenskou stratifikací a také psychoanalytickou analýzou Sigmunda Freuda. Nedílnou součástí je teorie adaptace, gotického románu a přehled dosavadní upírské literatury nejen s jižanskou tématikou. Cílem práce je komparace románů a seriálových adaptací s ohledem na různé věkové skupiny a prokázání jižanského vlivu na vybrané ságy. The thesis deals with the portrayal of the American South and its sicial and political features in two vampire series, True Blood and The Vampire Diaries, and their television adaptations. The thesis focuses on racial and gender stereotypes, social stratification as well as psychoanalysis by Sigmund Freud. It also uses the theory of adaptation, Gothic novel and provides an overview of vampire literature. The aim of the Ph.D. thesis is a comparative analysis of the novels and their television adaptations with different target audiences, and prove the influence of the American South. Keywords: Americký Jih; Pravá krev; Upírské deníky; adaptace; stereotypy; American South; True Blood; The Vampire Diaries; adamptation; stereotypes Available in digital repository of UPOL. The Portrayal of the American South in the Vampire series True Blood and The Vampire Diaries

Tato práce pojednává o zobrazení amerického Jihu a jeho společenských a politických aspektů ve dvou upírských románových ságách Pravá krev a Upíří deníky a také jejich televizními adaptacemi. Práce se ...

ADAMOVÁ, Diana; ARBEIT, Marcel
Univerzita Palackého v Olomouci, 2016

Strukturní charakterizace rostlinných fotosyntetických superkomplexů
NOSEK, Lukáš; KOUŘIL, Roman
2016 - English Ve své dizertační práci jsem se věnoval optimalizaci izolace a strukturní charakterizaci rostlinných fotosyntetických superkomplexů pomocí transmisní elektronové mikroskopie, která ve spojení s obrazovou analýzou poskytuje strukturní informace o studovaném komplexu. Mezi hlavní studované objekty patřily superkomplexy fotosystému 1 (PSI) a fotosystému 2 (PSII). V obou případech se jedná o velké pigment-proteinové superkomplexy tvořené mnoha podjednotkami, jejichž hlavním úkolem je transformace absorbované světelné energie na energii chemickou. Tyto superkomplexy nejsou v rostlině přítomny volně, ale jsou vázané v thylakoidní membráně chloroplastů. Zmíněné superkomplexy mohou navíc asociovat s dalšími proteinovými komplexy thylakoidní membrány, případně i mezi sebou navzájem a vytvářet tak velké megakomplexy. Jedním z takových příkladů je tzv. PSI-NDH supercomplex, který představuje asociaci mezi PSI a NDH a jehož existence byla již dříve předpovězena na základě různých biochemických analýz. V disertační práci je detailně popsána jeho strukturní charakterizace pomocí elektronové mikroskopie. Důležitým krokem předcházejícím samotné strukturní charakterizaci byla optimalizace podmínek pro izolaci zmíněného komplexu v dostatečné kvantitě i kvalitě. Optimalizace zahrnovala volbu vhodného rostlinného materiálu, který obsahoval dostatečné množství PSI-NDH superkomplexu a dále také výběr vhodného detergentu, který by účinně a šetrně superkomplex z thylakoidních membrán solubilizoval. Solubilizované thylakoidní membrány z ječmene jarního byly poté separovány pomocí bezbarvé nativní polyakrylamidové gelové elektroforézy (CN-PAGE), optimalizované pro separaci vysokomolekulárních komplexů. Strukturní analýza izolovaného PSI-NDH superkomplexu odhalila prvotní informace o jeho specifické organizaci a schopnosti NDH komplexu vázat dva komplexy PSI. Během optimalizace izolačních podmínek za účelem zisku dostatečného množství PSI-NDH superkomplexu byly v CN-PAGE detekovány další proteinové pásy s komplexy o velmi vysoké molekulové hmotnosti. Následná strukturní analýza, která je v dizertační práci detailně popsána, ukázala, že zmíněný pás obsahoval několik typů megakomplexů tvořených dvěma PSII superkomplexy. Tyto megakomplexy tvořily dvě skupiny, ve kterých PSII superkomplexy interagovaly buď paralelně, nebo neparalelně. Megakomplexy s paralelně interagujícími fotosystémy byly objeveny již dříve, nicméně strukturní charakterizace megakomplexů s neparalelně interagujícími fotosystémy prezentovaná v dizertační práci byla provedena vůbec poprvé. Detekce PSII megakomplexů na úrovni izolované thylakoidní membrány indikuje jejich fyziologický význam a je předmětem dalšího výzkumu. Dalším studovaným objektem byl PSII superkomplex izolovaný ze smrku ztepilého. Smrk je zástupce nahosemenných rostlin, čeledi borovicovitých, a struktura prezentovaná v dizertační práci představuje úplně první strukturální studii PSII superkomplexu provedenou na zástupci zmíněné rostlinné skupiny. Strukturní analýza v kombinaci s genetickou analýzou vedla k nečekanému zjištění, že smrk a další zástupci čeledi borovicovitých jsou evolučně odchýleni od zbytku vyšších rostlin, což se projevilo i ve změně struktury PSII superkomplexu oproti ostatním zástupcům vyšších rostlin. This thesis is aimed on the structural characterization of various plant photosynthetic complexes using a combination of CN-PAGE and single particle electron microscopy. Single particle electron microscopy is a powerful structural technique and provides ample structural information about a studied complex. In order to facilitate the structural characterization, optimization of a specimen preparation for electron microscopy is a very important step. The optimization is a complex process and comprises of several steps, as described in details in the chapter 3. Experimental approach. First of all, a proper plant material has to be selected. Then, conditions of a protein separation using CN-PAGE, including selection of a proper detergent and its concentration, are optimized. Final step involves extraction of separated protein complexes from the CN-PAGE gel and a preparation of specimen for electron microscopy. Once the workflow is optimized, it can be successfully applied in a structural study. The aim of my thesis was a structural characterization of three large protein assemblies involved in photosynthesis like the PSI-NDH supercomplex from barley, the PSII-LHCII supercomplex from Norway spruce and the PSII megacomplex from Arabidopsis thaliana. The first paper deals with the structural characterization of the PSI-NDH supercomplex isolated from barley (Hordeum vulgare). The structural analysis revealed that one NDH complex binds up to two PSI supercomplexes, which are to NDH bound at asymmetric positions. Moreover, positions of rare Lhca5 and Lhca6 antennas stabilizing the whole supercomplex were indicated. As we discovered both supercomplexes with one and two PSI bound to NDH, it implies that gradual formation and dissociation of the PSI-NDH supercomplex may function as a tuning of cyclic electron flow around PSI. The second paper describes the structural characterization of the PSII supercomplex isolated from Norway spruce (Picea abies). Spruce belongs to the group of gymnospermous plants (family Pinaceae) and we provided the first structural analysis of PSII supercomplex isolated from this plant group. Moreover, using an extensive genomic analysis we also discovered that the group of land plants including families Pinaceae and also Gnetales lack genes for Lhcb3 and Lhcb6 subunits, which has a noticeable impact on the structural organization of PSII supercomplexes. These two subunits have evolved during transition of plants from water to land and were considered to be characteristic for all land plants. Their absence in these plant groups breaks the current evolutionary dogma and modifies PSII supercomplex in such a way that it resembles PSII from evolutionary older organism, alga Chlamydomonas reinhardtii. The third paper structurally characterizes PSII megacomplexes isolated from Arabidopsis thaliana. These megacomplexes are formed of two PSII supercomplexes, which mutually interact in parallel and in non-parallel. The structural characterization of megacomplexes interacting in non-parallel was performed for the first time. The presence of both groups of megacomplexes was also detected on the level of native grana thylakoid membrane, which is an evidence of their nativity and thus a physiological significance. Keywords: CN-PAGE; Electron microscopy; Photosystem I; Photosystem II; PSI-NDH; CN-PAGE; Electron microscopy; Photosystem I; Photosystem II; PSI-NDH Available in digital repository of UPOL. Strukturní charakterizace rostlinných fotosyntetických superkomplexů

Ve své dizertační práci jsem se věnoval optimalizaci izolace a strukturní charakterizaci rostlinných fotosyntetických superkomplexů pomocí transmisní elektronové mikroskopie, která ve spojení s ...

NOSEK, Lukáš; KOUŘIL, Roman
Univerzita Palackého v Olomouci, 2016

Method and Practice of Oral Disputation in the 16th and 17th Century - The Jesuit Tradition
KOTALA, Lukáš; DVOŘÁK, Petr; FELIPE, Donald; HANKE, Miroslav
2016 - English Disertace "Metoda a praxe ústní disputace 16. a 17. století v je-zuitské tradici" se zabývá ústně prováděnými disputacemi. Hlav-ním jejím cílem je přispět k hlubšímu porozumění tomuto fenoménu. Dvě úrovně obecně ustavují tento fenomén a těm také odpovídá základní struktura práce. První část pojednává o metodě jezuitských disputací. Jejími prameny jsou díla jezuitů Toleda, Fonsecy, Alfonsa, Garniera, Marcellia, Chanevellea, Freytaga a Heimbacha, ale také Ratio Studiorum a n-jezuita Sanderson. Jezuitská metoda je obecně zformována podle paradigmatické metody řešení námitky. Avšak její specifická vlastnost spočívá v imperativu odkládat distinkci a v běžném zapojení paradigmatické metody dotazování-odpovídání. Druhá část se věnuje praxi jezuitských disputací. Disertace navrhuje v Úvodu také určitou "ontologii disputačního fenoménu" kde každá z úrovní "metody" a "praxe" získává definováním svůj přesný pojem. The dissertation 'Method and Practice of Disputation in the 16th and 17th Century - The Jesuit Tradition' deals with the 'viva voce' or the oral disputations. The main objective is to contribute to a more inner understanding of this phenomenon. Two levels gener-ally constitute its nature and the structure of the thesis corresponds to them. The Part One deals with the 'Method of Jesuit Disputations.' Its sources are Jesuits Toledo, Fonseca, Alfonso, Garnier, Marcellius, Chanevelle, Freytag, and Heimbach, Ratio Studiorum and the non-Jesuit Sanderson. The Jesuit method is generally shaped along the line of the Objection-solving paradigmatic method. But its special feature consists in the imperative to postpone distinction and in the routine application of Asking-answering paradigmatic method. The Part Two treats the 'Practice of Jesuit Disputations.' The thesis proposes a sort of 'disputation phenomena ontology' in the Introduction, where each of these levels of 'method' and 'practice' obtains a precise notion by their definitions. Keywords: disputace; jezuité; Tovaryšstvo Ježíšovo; jezuitský řád; pedagogika; teologie; filosofie; scholastika; novověk; metoda; argumentace; debata; logika; neformální logika; sokratická metoda; dialektika; disputation; Jesuit Order; Jesuits; pedagogy; theology; philoso-phy; scholasticism; post-medieval period; method; argumentation; debate; logics; informal logic; Socratic method; dialectic Available in digital repository of UPOL. Method and Practice of Oral Disputation in the 16th and 17th Century - The Jesuit Tradition

Disertace "Metoda a praxe ústní disputace 16. a 17. století v je-zuitské tradici" se zabývá ústně prováděnými disputacemi. Hlav-ním jejím cílem je přispět k hlubšímu porozumění tomuto fenoménu. Dvě ...

KOTALA, Lukáš; DVOŘÁK, Petr; FELIPE, Donald; HANKE, Miroslav
Univerzita Palackého v Olomouci, 2016

Subcelulární distribuce cytokininů v rostlinách
JISKROVÁ, Eva; FRÉBORT, Ivo
2016 - English Tato práce je zaměřena na stanovení obsahu cytokininů na buněčné úrovni u modelových rostlin Arabidopsis thaliana a Hordeum vulgare (ječmen). Rešerše v teoretické části se věnuje základní charakteristice cytokininů, jejich metabolismu a biologickým účinkům. Větší důraz je kladen na výskyt a metabolismus cytokininů uvnitř buňky. Praktická část obsahuje výsledky izolace protoplastů a vakuol z listů A. thaliana a ječmene, ve kterých byla následně stanovena hladina cytokininů. Pro izolaci protoplastů a vakuol, založené na enzymatickém odstranění buněčné stěny a následné separaci organel pomocí hustotního gradientu, byly použity 2 genotypy A. thaliana (wild type a mutantní forma wat1-1) a 3 genotypy ječmene (wild type, AtCKX1, HvCKX1). Ve vzorcích listů a získaných protoplastů a vakuol byla následně stanovena koncentrace 25 jednotlivých typů cytokininů pomocí UHPLC-MS/MS. Zjištěné množství cytokininů bylo porovnáno pomocí obsahu tonoplastové V-ATPasy a hodnoty byly následně vztaženy na extracelulární prostor, cytosol a vakuoly. Nejvyšší podíl cytokininů byl v případě Arabidopsis i ječmene mimo buňku, až 90 %, s majoritním zastoupením O- a N-glykosidů; přibližně 5 % cytokininů bylo poté obsaženo v cytosolu a ve vakuolách. V listech Arabidopsis byly nejpočetnější inaktivní formy cytokininů, převážně tZ7G, tZ9G and iP7G. Mutantní linie wat1-1 vykazovala oproti wild type formě výrazně vyšší obsah extracelulárního iP a iPR, obsah tZ glukosidů a iP glukosidů zůstal nezměněn. U obou linií A. thaliana byly porovnatelné hladiny derivátů DHZ a cZ, pouze v případě extracelulárního cZROG a cytosolárního cZR byl u wat1-1 detekován 5-násobný a 3-násobný nárůst. V případě ječmene byly pro stanovení hladiny cytokininů použity mladé listy. Celkový obsah cytokininů byl pro obě transgenní linie srovnatelný a v porovnání k wild type formě byl o trochu nižší. Nejvyšší rozdíl byl nalezen u extracelulárního tZ9G, kdy došlo u AtCKX1 i HvCKX1 k více než 50% poklesu. Linie AtCKX1 také vykázala 4x nižší obsah tZ mimo buňku a virtuálně žádný tZ uvnitř buňky. Oproti tomu obě transgenní linie obsahovaly dvakrát vyšší obsah extracelulárního iP a vakuolárního iPR. Přibližně 10% nárůst byl také detekován u cZOG mimo buňku. Metodu pro stanovení obsahu cytokininů popsanou v této práci je možné použít i pro analýzu dalších rostlinných hormonů možnost oddělit buněčné organely lze využít při studiu lokalizace, transportu a percepce fytohormonů v rostlinách. This thesis is focused on uncovering cytokinin distribution at cellular level for model plant Arabidopsis thaliana and Hordeum vulgare. The theoretical part deals with the general characterization of cytokinins, their metabolism and biological effects. The special attention is paid to the cellular localization of cytokinins and enzymes involved in their metabolism. The experimental part shows the results of the isolation of intact protoplasts and vacuoles obtained from leaves of A. thaliana and barley and the subsequent determination of cytokinin contents. Two genotypes of A. thaliana (wild type and wat1-1) and three genotypes of barley (wild type, AtCKX1, HvCKX1) were used for protoplasts and vacuoles isolations based on enzymatic removal of cell walls and separation of cell compartments at the Ficoll density gradient. Then, totally 25 unique cytokinin types were determined by UHPLC-MS/MS in the leaves and obtained protoplasts and vacuoles. Cytokinin quantities in extracellular space, cytosol and vacuoles were compared using tonoplast V-ATPase as a marker. The highest portion of cytokinins, almost 90 %, was located outside the cell in both plant species, with majority of O- and N-glycosides, while cytosol and vacuoles held approx. 5 % of total cytokinins each. In Arabidopsis matured leaves, the most abundant cytokinins were the inactive forms, especially tZ7G, tZ9G and iP7G. The wat1-1 mutant differed from the wild type by a significantly higher content of extracellular tZ and intracellular iP and iPR while the content of tZ and iP glucosides were unchanged. The levels of DHZ and cZ types were comparable for wild type and wat1-1, except the 5-fold and 3-fold increase of extracellular cZROG and cytosolic cZR in wat1-1. In barley young leaves, the total content of cytokinins was for AtCKX1 and HvCKX1 mutant lines comparable to each other and, in the same time, slightly lower than a wild type. The highest divergence was detected for the extracellular tZ9G with more than 50% decline in both transgenic lines. The AtCKX1 mutant showed about 4-fold decreased content of tZ in the extracellular space while intracellular tZ was virtually absent. Contrary to that, the 2-fold increase of extracellular iP and vacuolar iPR was detected in both mutants. Approx. 10% rise was also found for cZOG occurring in extracellular space of mutant lines. The developed experimental method can be applied to hormone analysis in general; the ability to separate some cellular compartments can help to understand to their localization, transport and perception in plants. Keywords: Arabidopsis thaliana; cytokininy; ječmen; protoplasty; vakuola; V-ATPáza; wat1-1; Arabidopsis thaliana; barley; cytokinins; protoplasts; vacuoles; V-ATPase; wat1-1 Available in digital repository of UPOL. Subcelulární distribuce cytokininů v rostlinách

Tato práce je zaměřena na stanovení obsahu cytokininů na buněčné úrovni u modelových rostlin Arabidopsis thaliana a Hordeum vulgare (ječmen). Rešerše v teoretické části se věnuje základní ...

JISKROVÁ, Eva; FRÉBORT, Ivo
Univerzita Palackého v Olomouci, 2016

Linking Development and Security - Critical Analysis of Human Security
DUŠKOVÁ, Lenka; BUREŠ, Oldřich
2016 - English Lidská bezpečnost byla konceptualizována a představena ve Zprávě OSN o lidském rozvoji v roce 1994, nicméně i po více než dvou dekádách zůstává tento koncept kontroverzním. Cílem dizertační práce je mapovat a kriticky zhodnotit vývoj bezpečnostních a rozvojových teorií a diskursů, které předcházely konceptu lidské bezpečnosti, a také analyzovat, jak se vzájemně, zejména v období po konci studené války, bezpečnost a rozvoj ovlivňovaly. Práce představuje koncept lidské bezpečnosti jako případ sbližování rozvoje a bezpečnosti. Důraz je kladen také na kritickou reflexi čtyř hlavních pilířů (univerzalita; vzájemná závislost; zaměření na člověka; prevence) za využití kritických teorií s cílem identifikovat a analyzovat zásadní rozpory. Práce argumentuje, že v rámci konceptu lidské bezpečnosti existují aspekty, které jej stále přibližují spíše k tradičnímu vnímání bezpečnosti a rozvoje, ačkoliv byl konstruován jako přístup, který se vůči tradičním přístupům vymezoval. Interdisciplinární výzkum propojil teoretické přístupy z mezinárodní bezpečnosti a rozvojových studií, čímž umožnil širší vhled do konceptu lidské bezpečnosti, konceptu dosud studovaného pouze v rámci (těchto) jednotlivých vědních oborů The Human Security was conceptualised and presented in the United Nations Human Development Report in 1994. However, more than two decades later it keeps being a contested concept. The aim of the thesis is to map and critically reflect the evolution of security and development theories and discourses that have preceded and influenced the concept of Human Security and also to analyze how development and security have been influencing each other throughout of history and yet more intensively after the end of Cold War. It is argued that Human Security is a case example of convergence of the development and security. The thesis also focuses on the theoretical inquiry into the four central pillars (universality; interdependency; human focus; prevention) that constitute the base of Human Security using the perspective of Critical Theories with the aim to critically analyze the inherent contradictions. There are certain aspects, inbuilt within Human Security concept, which keep it close to the traditional security and development narratives. The interdisciplinary research combining the theoretical approaches from International Security and International Development Studies allowed for the broader insights into the Human Security concept, previously unexplored by the research community operating within the single disciplines. Keywords: Lidská bezpečnost; mezinárodní rozvoj; bezpečnost; rozvojové teorie; bezpečnostní teorie; Human Security; international development; security; development theories; security theories Available in digital repository of UPOL. Linking Development and Security - Critical Analysis of Human Security

Lidská bezpečnost byla konceptualizována a představena ve Zprávě OSN o lidském rozvoji v roce 1994, nicméně i po více než dvou dekádách zůstává tento koncept kontroverzním. Cílem dizertační práce je ...

DUŠKOVÁ, Lenka; BUREŠ, Oldřich
Univerzita Palackého v Olomouci, 2016

Molekulární patofyziológie vrozených erytrocytóz
KAPRAĽOVÁ, Katarína; HORVÁTHOVÁ, Monika; INDRÁK, Karel; SCHWARZ, Jiří
2016 - English Hlavným cieľom tejto dizertačnej práce bolo študovať molekulárnú patofyziológiu vybraných prípadov erytrocytóz/polycytémií. V prvej časti práce sa venujeme mechanizmu asociovanému s in vitro hypersensitivitou erytroidných progenitorov k erytropoetínu v skupine pacientov s primárnou a sekundárnou polycytémiou. V druhej časti sme identifikovali mutáciu spôsobujúcu polycytémiu u detského pacienta. V poslednej časti dizeračnej práce sme sa venovali štúdiu kooperácie dvoch vrodených JAK2 mutácií asociovaných s vrodenou erytrocytózou. The main aim of the thesis was to uncover etiopathogenesis of selected erythrocytosis/polycythemia cases. In the first part of the thesis we tried to elucidate mechanisms associated with in vitro hypersensitivity of erythroid progenitors to EPO in the cohort of patents with primary and secondary polycythemias. In the second part of the thesis we identified polycythemia causing mutations in one pediatric patient. The last part was focused on studing the cooperation of two JAK2 germline mutations associated with congenital erythrocytosis. Keywords: erytryocytóza; JAK2; VHL; HIF; erythrocytosis; JAK2; VHL; HIF Available in digital repository of UPOL. Molekulární patofyziológie vrozených erytrocytóz

Hlavným cieľom tejto dizertačnej práce bolo študovať molekulárnú patofyziológiu vybraných prípadov erytrocytóz/polycytémií. V prvej časti práce sa venujeme mechanizmu asociovanému s in vitro ...

KAPRAĽOVÁ, Katarína; HORVÁTHOVÁ, Monika; INDRÁK, Karel; SCHWARZ, Jiří
Univerzita Palackého v Olomouci, 2016