Počet nalezených dokumentů: 2247
Publikováno od do

Placentární homeostáza monoaminů v průběhu těhotenství
Mahrla, Filip; Štaud, František; Vokřál, Ivan
2023 - anglický
Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmacology and Toxicology Student: Filip Mahrla Supervisor: Prof. PharmDr. František Štaud, Ph.D. Consultant: PharmDr. Rona Karahoda, Ph.D. Title of diploma thesis: Placental homeostasis of monoamines; effect of gestation age Catecholamines norepinephrine and dopamine have been implicated in numerous physiological processes within the central nervous system. Emerging evidence suggests their involvement in placental development and functions and a crucial role in fetal development and programming. Nonetheless, a comprehensive characterization of catecholamine synthesis, degradation, and transport in the fetoplacental unit is still lacking. Thus, in this thesis, we aimed to provide a comprehensive evaluation of catecholamine metabolism and transport in the fetoplacental unit. Gene and protein expression was evaluated using quantitative polymerase chain reaction (PCR) and Western blot analysis, respectively. Firstly, using several placental cell models (BeWo, JEG-3, primary trophoblast cells), we identified components of cellular catecholamine handling associated with the trophoblast cells. Next, we determined the effect of advancing gestation on the placental catecholamine system in humans (first trimester vs. term placenta) and... Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Student: Filip Mahrla Školitel: Prof. PharmDr. František Štaud, Ph.D. Konzultant: PharmDr. Rona Karahoda, Ph.D. Název diplomové práce: Placentární homeostáza monoaminů v průběhu těhotenství Katecholaminy noradrenalin a dopamin se podílejí na řadě fyziologických procesů v centrálním nervovém systému. Objevující se důkazy naznačují jejich zapojení do vývoje a funkcí placenty a klíčovou roli ve vývoji a programování plodu. Komplexní charakterizace syntézy, degradace a transportu katecholaminů ve fetoplacentární jednotce však stále chybí. V této diplomové práci jsme se tedy zaměřili na komplexní hodnocení metabolismu a transportu katecholaminů ve fetoplacentární jednotce. Exprese genů a proteinů byla hodnocena pomocí kvantitativní polymerázové řetězové reakce (PCR) a analýzy Western blot. Nejprve jsme pomocí několika modelů placentárních buněk (BeWo, JEG-3, primární trofoblastové buňky) identifikovali komponenty buněčného řízení katecholaminů spojené s buňkami trofoblastu. Dále jsme určili účinek postupující březosti na placentární katecholaminový systém u lidí (první trimestr vs. termální placenta) a potkanů (15., 18. a 21. den březosti). Nakonec jsme se zabývali expresí katecholaminové dráhy ve fetálních... Klíčová slova: placenta; monoaminy; těhotenství; placenta; monoamines; pregnancy Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Placentární homeostáza monoaminů v průběhu těhotenství

Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmacology and Toxicology Student: Filip Mahrla Supervisor: Prof. PharmDr. František Štaud, Ph.D. Consultant: PharmDr. Rona ...

Mahrla, Filip; Štaud, František; Vokřál, Ivan
Univerzita Karlova, 2023

Syntéza a hodnocení sond pro fluorescenční mikroskopii založených na kyanopyridinových a merocyaninových derivátech a lanthanoidových komplexech
Bajnok, Juraj; Kučerová, Marta; Zimčík, Petr
2023 - anglický
Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmaceutical Chemistry and Pharmaceutical Analysis Student: Juraj Bajnok Supervisor: PharmDr. Marta Kučerová, Ph.D. Consultant: Assist. prof. Stane Pajk, M. Pharm., Ph.D. Title of diploma thesis: Synthesis and evaluation of probes for fluorescent microscopy based on cyanopyridines and merocyanine scaffolds and lanthanide complexes Fluorescence as part of luminescence is a process, which describes how electrons of suitable materials are excited by the energy absorption of a photon, followed by the immediate emission of a photon with less energy compared to the absorbed photon. Suitable compounds must contain a system of conjugated double bonds. In this thesis, we present the synthesis and evaluation of fluorescence on derivates of cyanopyridines, merocyanine-type fluorescent probes, and lanthanide complexes of terbium, dysprosium, and europium. Lanthanide ions have low molar extinction coefficients, therefore they cannot be excited directly, without a proper ligand. We explored the influence of pH on the emission of synthesized derivates of cyanopyridines. We synthesized two merocyanine dyes with new alkyl moieties, which should change their emission spectra. Then, the merocyanine dyes could serve as new fluorescent probes for... Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Student: Juraj Bajnok Školitel: PharmDr. Marta Kučerová, Ph.D. Konzultant: Assist. prof. Stane Pajk, M. Pharm., Ph.D. Název diplomové práce: Syntéza a hodnocení sond pro fluorescenční mikroskopii založených na kyanopyridinových a merocyaninových derivátech a lanthanoidových komplexech Fluorescence jako součást luminiscence je proces, při kterém se elektrony molekul excitují, čímž se dostávají na vyšší energetickou hladinu díky absorpci energie fotonu. Následně elektrony vyzařují foton o nižší energii, čímž se vrácí zpět na nižší energetickou hladinu. Aby byla látka schopná vykazovat fluorescenci, musí obsahovat konjugovaný systém dvojných vazeb. V této práci představujeme syntézu a hodnocení fluorescence látek založených na derivátech merocyaninového a kyanopyridinové strukturního typu a komplexech s vybranými lanthanoidy, jako je terbium, europium a dysprosium. Lanthanoidové ionty nemohou být excitované přímo bez vhodného ligandu, což je způsobeno jejich nízkým molárním extinkčním koeficientem. Po syntéze kyanopyridinových derivátů jsme měřili vliv pH prostředí na jejich výsledná emisní spektra. Naším dalším cílem byla syntéza merocyaninových barviv s novými alkylovými substituenty ve... Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Syntéza a hodnocení sond pro fluorescenční mikroskopii založených na kyanopyridinových a merocyaninových derivátech a lanthanoidových komplexech

Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmaceutical Chemistry and Pharmaceutical Analysis Student: Juraj Bajnok Supervisor: PharmDr. Marta Kučerová, Ph.D. Consultant: ...

Bajnok, Juraj; Kučerová, Marta; Zimčík, Petr
Univerzita Karlova, 2023

Úloha T lymfocytů a makrofágů v experimentálních modelech rejekce alo a xenoštěpů
Pindjaková, Jana
2023 - anglický
Rejection of organs and tissues by recipient's immune system remains a major obstacle in further development of clinical transplantations. Critical shortage of allotransplants enhanced an interest in xenografts as a potential source of donor material in clinical medicine. In immunology research, as experimental models, skin and cornea transplantation are frequently used. Corneal transplantation became one of the most successful forms of tissue allotransplantation. The extraordinary success has been related to various features of the cornea and ocular microenvironment that together account for its immune-privilege status of anterior chamber. The rejection of skin and corneal allo- and xenografts in untreated recipients is primarily studied as a model of acute rejection. This process begins after the first week of transplantation. Predominant cells infiltrating rejected grafts are both T cell subsets CD4+ and CD8+ but some studies brought evidence that macrophages are the key cytotoxic cell population in graft rejection. The nature of cellular and humoral responses to xenogeneic tissues appears to differ from allograft immunity and is less understood. Majority of studies demonstrated that xenoreactive cellular response in acutely rejected xenograft is associated with production of both Th1 and Th2... Rejekce orgánů a tkání imunitním systémem příjemce zůstává hlavní překážkou v rozvoji klinických transplantací. Kritický nedostatek alotransplantátů zvýšil zájem o xenoštěpy jako potenciální zdroj dárcovského materiálu v klinické medicíně. V imunologickém výzkumu se často používají jako experimentální modely transplantace kůže a rohovky. Transplantace rohovky se stala jednou z nejúspěšnějších forem tkáňové alotransplantace. Mimořádný úspěch souvisí s vlastnostmi samotné rohovky a očního mikroprostředí, které společně vytvářejí tzv. imunitní privilegium přední oční komory. Rejekce kožních a rohovkových alo- a xenoštěpů u neléčených příjemců je primárně studována jako model akutní rejekce. Tento proces začíná už v prvním týdnu po transplantaci. Převládající buňky infiltrující štěp jsou především CD4+ a CD8+ T lymfocyty. Některé studie rovněž přinesly důkazy, že i makrofágy představují klíčovou cytotoxickou buněčnou populaci podílející se na rejekci štěpu. Zdá se, že povaha buněčných a humorálních odpovědí u xenotransplantátů se liší od reakce probíhající v alotransplantátě a je méně objasněna. Většina studií prokázala, že xenoreaktivní buněčná odpověď u akutně rejekovaného xenogenního tkaniva je spojena s produkcí cytokinů Th1 a Th2. Hlavním cílem této práce bylo objasnit roli adaptivní imunitní... Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Úloha T lymfocytů a makrofágů v experimentálních modelech rejekce alo a xenoštěpů

Rejection of organs and tissues by recipient's immune system remains a major obstacle in further development of clinical transplantations. Critical shortage of allotransplants enhanced an interest in ...

Pindjaková, Jana
Univerzita Karlova, 2023

Modelově založené shlukování vícerozměrných longitudinálních dat smíšeného typu
Vávra, Jan; Komárek, Arnošt
2023 - anglický
Model-based Clustering of Multivariate Longitudinal Data of a Mixed Type Jan Vávra October 3, 2022 Abstract In many nowadays studies, the data are collected repeatedly on the same units over a certain period of time. Moreover, such longitudinal data are composed of numeric values, count variables, binary indicators, ordered or nominal categories. A few variants of statistical model capa- ble of modelling such often highly correlated data jointly are introduced. On top of that, a methodology of model-based clustering is adapted to such models to discover hidden heterogeneity within the data by dividing units into clusters of specific characteristics. Bayesian approach is taken, generative model is proposed and MCMC methodology is developed for estimation. A simulation study verifying the estimation properties is con- ducted. The methodology is applied to real datasets such as medical data on patients suffering from primary biliary cholangitis (PBC) or econom- ical dataset consisting of thousands of Czech households followed since 2005 (EU-SILC database). 1 Modelově založené shlukování vícerozměrných longitudinálních dat smíšeného typu Jan Vávra 3. října 2022 Abstrakt Mnoho dnešních studií sbírá data opakovaně na těch samých jedin- cích po předem vymezenou časovou dobu. Takto vzniklá longitudinální data jsou navíc často tvořena číselnými, čítacími, binárními, ordinálními nebo obecně kategoriálními hodnotami. Je zde navrženo několik variant statistických modelů schopných modelovat takováto často velmi korelo- vaná data sdruženě. Metodologie modelově založeného shlukování je zde použita pro odhalení skryté heterogenity v datech tím, že jedince roztřídí do několika skupin specifických vlastností. Generativní model je zde vy- tvořen za bayesovského přístupu a jsou zde vyvinuty MCMC metody pro jeho odhad. Vlastnosti stvořených odhadů jsou podrobeny simulační stu- dii. Vyvinutá metodologie je aplikovaná na problémy z reálného prostředí, např. data z lékařské studie o pacientech trpících primární biliární cho- langitidou (PBC) či ekonomický dataset o tisících českých domácnostech sledovaných od roku 2005 (databáze EU-SILC). 1 Klíčová slova: modelově založené shlukování|MCMC|longitudinální data|GLMM|smíšený typ; model-based clustering|MCMC|longitudinal data|GLMM|mixed type Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Modelově založené shlukování vícerozměrných longitudinálních dat smíšeného typu

Model-based Clustering of Multivariate Longitudinal Data of a Mixed Type Jan Vávra October 3, 2022 Abstract In many nowadays studies, the data are collected repeatedly on the same units over a certain ...

Vávra, Jan; Komárek, Arnošt
Univerzita Karlova, 2023

Kvantová vakua, zakřivený prostoročas a singularity
Kůs, Pavel; Iorio, Alfredo
2023 - anglický
In this work we investigate the Weyl anomaly from a new perspective. Our goal is to identify a set-up for which the classical Weyl symmetry is not broken, at the quantum level by the usual arguments related to the Euler invariants, but rather by the impact of other geometrical obstructions. Therefore, we work, mostly, in three spatiotemporal dimensions, where general arguments guarantee the absence of trace anomalies. In par- ticular, our interest here is on whether various types of singularities, emerging in the description of the differential geometry of surfaces, could induce some form of quantum inequivalence, even though the classical symmetry is at work. To this end, we work with a very special three-dimensional metric, whose nontriviality is fully in its spatial two-dimensional part. The last ingredient we use, to clean-up the way from other com- plications, is to work with physical systems where no Weyl gauge field is necessary, to have the classical invariance. The system we focus on is then the massless Dirac field the- ory (that, as well known, enjoys local Weyl symmetry) in three-dimensional conformally flat spacetimes. With these premises, the research programme consists of three steps. The first step is to find the coordinate transformations that link the conformal factor identifying the... V této práci zkoumáme Weylovu anomálii z nové perspektivy. Naším cílem je iden- tifikovat situaci, v níž není klasická Weylova symetrie narušena na kvantové úrovni ob- vyklými argumenty mající vztah k Eulerovým invariantům, ale spíše dopadem jiných geometrických obstrukcí. Proto pracujeme, většinou, ve třech prostoročasových dimen- zích, kde obecné argumenty zaručují absenci stopových anomálií. Zejména se zajímáme o to, zda by různé typy singularit, které se objevují v popisu diferenciální geometrie ploch, mohly vyvolat nějakou formu kvantové nerovnosti, i když funguje klasická symetrie. Za tímto účelem pracujeme s velmi speciální trojrozměrnou metrikou, jejíž netrivialita je plně v její prostorové dvojrozměrné části. Poslední ingrediencí, kterou používáme k vy- čištění cesty od dalších komplikací, je práce s fyzikálními systémy, kde není nutné žádné Weylovo pole, abychom zajistili klasickou invarianci. Systém, na který se zaměřujeme, je nehmotné Diracovo pole (které, jak je známo, vykazuje lokální Weylovu symetrii) v trojrozměrných konformně plochých prostočasech. Za těchto předpokladů se náš výzkumný program skládá ze tří kroků. Prvním krokem je najít souřadnicové transformace, které spojují konformní faktor identifikující plochu s prostoročasový konformním faktorem. Tato úloha je velmi netriviální. V... Klíčová slova: Weylova symmetrie|Weylova anomálie|Singularity|Geometrie and Topologie|Kanonická a Bogoliubova transformace|Kvantová neekvivalence; Weyl symmetry|Weyl anomaly|Singularities|Geometry and Topology|Canonical and Bogoliubov transformation|Quantum inequivalence Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Kvantová vakua, zakřivený prostoročas a singularity

In this work we investigate the Weyl anomaly from a new perspective. Our goal is to identify a set-up for which the classical Weyl symmetry is not broken, at the quantum level by the usual arguments ...

Kůs, Pavel; Iorio, Alfredo
Univerzita Karlova, 2023

Modulace metabolismu cholesterolu a žlučových kyselin prostřednictvím solubilního endoglinu a farmakoterapie.
Igreja e Sá, Ivone Cristina; Nachtigal, Petr; Vítek, Libor; Červený, Lukáš
2023 - anglický
Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Training Workplace Department of Biological and Medical Sciences Doctoral Degree Program Pharmacology and Toxicology Candidate M.Sc. Ivone Cristina Igreja e Sá Supervisor prof. PharmD. Petr Nachtigal, Ph.D. Advisor Title of Doctoral Thesis Modulation of cholesterol and bile acid metabolism via soluble endoglin and pharmacotherapy Endoglin (Eng, CD105) is a transmembrane glycoprotein and co-receptor of the Transforming growth factor-β (TGFβ) receptor complex. Upregulated expression of Eng has been implicated in endothelial dysfunction, liver impairment, and hepatic fibrosis development. When Eng is cleaved by the matrix metalloproteinase-14 (MMP14), its soluble form termed soluble endoglin (sEng, sCD105) is released into the circulation. Increased plasma levels of sEng have not only been observed in patients with cardiovascular and metabolic diseases associated with hypercholesterolemia (e.g., atherosclerosis) but have also been reported to promote conditions of the metabolic syndrome (e.g., hypertension). However, the direct role of sEng in the modulation of hepatic metabolism and liver functions under physiologic or pathological conditions has not been previously explored. Therefore, this doctoral thesis aimed to test the hypothesis that... Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Školicí pracoviště Katedra biologických a lékařských věd Doktorský studijní program Farmakologie a toxikologie Kandidátka / kandidát M.Sc. Ivone Cristina Igreja e Sá Školitelka / školitel prof. Pharm.Dr. Petr Nachtigal, Ph.D. Konzultantka / konzultant Název disertační práce Modulace metabolismu cholesterolu a žlučových kyselin prostřednictvím solubilního endoglinu a farmakoterapie Endoglin (Eng, CD105) je transmembránový glykoprotein a koreceptor receptorového komplexu pro transformující růstový faktor β (TGFβ). Zvýšená exprese Eng se podílí na endotelové dysfunkci, poškození jater a rozvoji jaterní fibrózy. Když je Eng odštěpen metaloproteinázou-14 (MMP14), uvolňuje se do oběhu jeho rozpustná forma označovaná jako solubilní endoglin (sEng, sCD105). Zvýšené plazmatické hladiny sEng byly pozorovány nejen u pacientů s kardiovaskulárními a metabolickými onemocněními spojenými s hypercholesterolemií (např. aterosklerózou), ale byly dány do souvislosti s rozvojem metabolického syndromu (např. arteriální hypertenzí). Přímá role sEng v ovlivnění jaterního metabolismu a jaterních funkcí za fyziologických nebo patologických podmínek však dosud nebyla zkoumána. Cílem této disertační práce bylo proto ověřit hypotézu, že sEng hraje roli v modulaci... Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Modulace metabolismu cholesterolu a žlučových kyselin prostřednictvím solubilního endoglinu a farmakoterapie.

Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Training Workplace Department of Biological and Medical Sciences Doctoral Degree Program Pharmacology and Toxicology Candidate M.Sc. Ivone ...

Igreja e Sá, Ivone Cristina; Nachtigal, Petr; Vítek, Libor; Červený, Lukáš
Univerzita Karlova, 2023

Syntéza inhibitorů proteinových kináz využitelných v terapii nádorových onemocnění
Merdita, Sara; Roh, Jaroslav; Karabanovich, Galina
2023 - anglický
Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Organic and Bioorganic Chemistry in collaboration with Biomedical Research Center UH HK Author: Sara Merdita Supervisor: Assoc. Prof. PharmD. Jaroslav Roh, PhD. Advisors: PharmD. Lukáš Górecki, PhD.; Assoc. Prof. PharmD. Jan Korábečný, PhD. Title of diploma thesis: Synthesis of protein-kinase inhibitors as a potential treatment for cancer Cancer is one of the leading causes of fatalities worldwide, which is attracting attention of many researchers with desire to develop treatments that selectively target cancerous cells while simultaneously sparing healthy cells. The main overall strategy is to exploit features specific to cancer - the cancer hallmarks. Those are represented, for instance, by genomic instability and aberrant DNA damage response (DDR) pathways. The DDR consists of cascades of kinases and other proteins and messengers, where we highlighted the synthetic lethal interaction between the kinases ATM (ataxia-telangiectasia mutated) and ATR (ATM and Rad3-related). The two are major driving forces in the DDR, where in cancer ATM tends to be mutated and therefore dysfunctional, making the cells' viability reliant on ATR. Thus, ATR inhibition makes a particularly attractive strategy for abrogating cancer survival without... Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra organické a bioorganické chemie ve spolupráci s Centrem biomedicinského výzkumu FN HK Autorka: Sara Merdita Školitel: doc. PharmDr. Jaroslav Roh, PhD. Konzultanti: PharmDr. Lukáš Górecki, PhD.; doc. PharmDr. Jan Korábečný, PhD. Název diplomové práce: Syntéza inhibitorů proteinových kináz využitelných v terapii nádorových onemocnění Zhoubné nádory jsou jednou z hlavních příčin úmrtí po celém světě, což motivuje výzkumníky vyvinout léčbu, která selektivně cílí na nádorové buňky a zároveň ušetří zdravé buňky. Hlavní celkovou strategií je využít rysy specifické pro nádory. Ty jsou reprezentovány například nestabilitou genomové integrity a narušenou schopností opravy poškozené DNA (anglicky DDR). DDR se skládá z kaskád kináz a dalších proteinů a poslů, z nichž jsme se soustředili na syntetickou letální interakci mezi kinázami ATM (ataxia-telangiectasia mutated) a ATR (ATM and Rad3 related). Tyto dvě kinázy jsou předními hnacími silami v DDR, kde u nádorů má ATM tendenci být mutována, tedy dysfunkční, a tudíž životaschopnost buněk zbývá na ATR. Inhibice ATR je z toho důvodu zvláště atraktivní strategií pro eliminaci nádorových buněk, aniž by přitom byly zasaženy buňky zdravé. Čtyři inhibitory ATR již vstoupily do klinických studií jako... Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Syntéza inhibitorů proteinových kináz využitelných v terapii nádorových onemocnění

Charles University Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Organic and Bioorganic Chemistry in collaboration with Biomedical Research Center UH HK Author: Sara Merdita Supervisor: Assoc. ...

Merdita, Sara; Roh, Jaroslav; Karabanovich, Galina
Univerzita Karlova, 2023

Nové fluorescenční nukleotidy pro metabolické značení a konstrukci DNA sond
Kuba, Miroslav
2023 - anglický
The aim of the thesis was to synthesize new nucleosides, nucleotides and the corresponding DNA probes bearing various fluorescent labels, which can be used for bioanalytical applications. In the first part of the thesis, 2'-deoxycytidine and the corresponding nucleoside triphosphate bearing tryptophan-based imidazolinone fluorophore were synthesized by Sonogashira cross-coupling reaction. The fluorophore showed sensitivity to pH and viscosity. Nucleotide was used for the construction of modified oligonucleotides (ON) and DNA by primer extension (PEX) or polymerase chain reaction (PCR). Labelled ON probe was used for sensing interaction with single-strand binding protein, which resulted in increased fluorescence intensity of modified ON. Next, thymidine and thymidine triphosphate labelled by bezylidene- tetrahydroxanthylium fluorophore were synthesized by copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC). Fluorescence of the fluorophore is dependent on the polarity and viscosity of the environment. Incorporation of the modified nucleotide into DNA, by PEX or PCR, led to dramatic increase of the fluorescence presumably due to the interactions of the fluorophore in the major groove. Unfortunately, the modified nucleotide was not suitable for in cellulo imaging due to its cytotoxicity. The modified... Cílem této dizertační práce byla syntéza nových nukleosidů, nukleotidů a příslušných DNA sond nesoucích různé fluorescenční značky pro bioanalytické aplikace. V první části práce byl pomocí Sonogashiry cross-kapling reakce syntetizován 2'-deoxycytidin a jeho trifosfát nesoucí imidazolinový fluorofor na bázi tryptofanu. Daný fluorofor vykazoval citlivost na pH a viskozitu. Nukleotid byl použit pro konstrukci modifikovaných oligonukleotidů (ON) a DNA prodlužováním primeru (PEX) nebo polymerázovou řetězovou reakcí (PCR). Značená ON sonda byla použita pro snímání interakce se single-strand vazebným proteinem, což vedlo ke zvýšení intenzity fluorescence modifikovaného ON. Dále byl připraven thymidin a thymidin-5'-O-trifosfát, nesoucí benzyliden- tetrahydroxanthyliový fluorofor, pomocí mědí katalyzované azid-alkynové cykloadice (CuAAC). Fluorescence fluoroforu je závislá na polaritě a viskozitě prostředí. Inkorporace modifikovaného nukleotidu do DNA pomocí PEX nebo PCR vedlo k dramatickému zvýšení fluorescence, pravděpodobně díky interakcím fluoroforu ve velkém žlábku. Bohužel, modifikovaný nukleotid nebyl vhodný pro vizualizace v buňkách kvůli své cytotoxicitě. Modifikovaná dsDNA byla použita jako fluorescenční sonda pro snímání interakcí s malými molekulami a proteiny změnou fluorescence. Nakonec byl... Klíčová slova: nukleotidy; DNA; fluorescenční spektroskopie; nucleotides; DNA; fluorescence spectroscopy Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Nové fluorescenční nukleotidy pro metabolické značení a konstrukci DNA sond

The aim of the thesis was to synthesize new nucleosides, nucleotides and the corresponding DNA probes bearing various fluorescent labels, which can be used for bioanalytical applications. In the first ...

Kuba, Miroslav
Univerzita Karlova, 2023

Studium reakcí iontů s molekulami vody v plynné fázi pro stopovou analýzu
Lacko, Michal; Španěl, Patrik
2022 - anglický
Chemical ionization mass spectrometry (CI-MS) is a powerful analytical technique, capable to detect trace levels of organic molecules diluted in air samples in real-time. Processes leading to ionization of organic molecules, necessary for their detection and identification, are however often strongly affected by the presence of water vapours in form of sample humidity. In the present work, I studied the influence of water vapours on ion chemistry and, subsequently, the respective influence on sensitivity and selectivity of CI-MS techniques. Studies were carried out using several soft chemical ionization mass spectrometry instruments, including Selected Ion Flow Tube Mass Spectrometry (SIFT-MS), Proton Transfer Reaction Mass Spectrometry (PTR-MS) and Selected Ion Flow-Drift Tube Mass Spectrometry (SIFDT-MS). Experimental studies were also supplemented by theoretical simulation of proposed ion chemistry using the Kinetic of Ion-Molecular Interaction simulator (KIMI), developed by the author. In this thesis, I present a study of formaldehyde, glyoxal and phthalates ion chemistry with H3O+ , NO+ and O2 + reagent ions, focusing on secondary reactions with water vapours. Additionally, I also studied secondary reactions of protonated hydrated acetic acid with acetone. Finally, I have carried out... Metoda hmotnostní spektrometrie pomocí chemické ionizace je účinná analytická technika, umožňující detekovat v reálném čase stopová množství organických těkavých látek přítomné ve vzduchu. Procesy vedoucí k ionizaci organických molekul, nutné k jejich detekci a následnou identifikaci, jsou bohužel často ovlivněné přítomností vodní páry. V představené práci jsem studoval vliv vodní páry na chemii iontů a její následní vliv na citlivost a selektivitu metod hmotnostní spektrometrie pomocí chemické ionizace. Pro studium jsme využili několik hmotnostně-spektrometrických přístrojů, mimo jiné techniku hmotnostní spektrometrie v proudové trubici s vybranými ionty (SIFT-MS), techniku hmotnostní spektrometre pomocí reakce přenosu protonu (PTR-MS) a techniku hmotnostní spektrometrie v proudově-driftové trubice s vybranými ionty (SIFDT-MS). Experimentální stude je doplněná teoretickými simulacemi studovaných procesů pomocí autorem vytvořeným simulačním programem KIMI. V disertační práci prezentuji výsledky zkoumání iontové chemie molekul formaldehydu, glyoxalu a ftalátů pomocí H3O+ , NO+ and O2 + reakčních iontů, přičemž se zaměřuji na pochopení sekundárních reakci iontových produktů s vodní párou. Následně jsem také studoval sekundární reakce protonovaných a hydratovaných molekul kyseliny mravenčí s... Klíčová slova: hmotnostní spektrometrie pomocí měkké chemická ion|hmotnostní spektrometrie v proudové trubici s vybr|reakce přenosu protonu; Soft chemical ionization mass spectrometry|selected ion flow tube mass spectrometry|proton transfer reaction mass spectrometry|selected ion flow drift tube mass spectrometry Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Studium reakcí iontů s molekulami vody v plynné fázi pro stopovou analýzu

Chemical ionization mass spectrometry (CI-MS) is a powerful analytical technique, capable to detect trace levels of organic molecules diluted in air samples in real-time. Processes leading to ...

Lacko, Michal; Španěl, Patrik
Univerzita Karlova, 2022

The Rufous Sengi is not Elephantulus Multilocus reconstruction of evolutionary history of sengis from the subfamily Macroscelidinae
KRÁSOVÁ, Jarmila
2022 - anglický
We conducted multilocus phylogeny and divergence dating of sengis also known as elephant shrews from the subfamily Macroscelidinae. For the first time, we provided genetic evidence that the East African Rufous Sengi (Elephantulus rufescens) is closely related to the recently delimited genus Galegeeska known from the Horn of Africa and comprising a single species G. revolii. Our findings are in concordance with morphological traits and also biogeographical patterns known from Eastern Africa. Based on the results of divergence dating, the genus Galegeeska originated in the Pleistocene era. Klíčová slova: sengis; elephants shrews; taxonomy; phylogeny; Eastern Africa; Galegeeska Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
The Rufous Sengi is not Elephantulus Multilocus reconstruction of evolutionary history of sengis from the subfamily Macroscelidinae

We conducted multilocus phylogeny and divergence dating of sengis also known as elephant shrews from the subfamily Macroscelidinae. For the first time, we provided genetic evidence that the East ...

KRÁSOVÁ, Jarmila
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

O službě

NUŠL poskytuje centrální přístup k informacím o šedé literatuře vznikající v ČR v oblastech vědy, výzkumu a vzdělávání. Více informací o šedé literatuře a NUŠL najdete na webu služby.

Vaše náměty a připomínky posílejte na email nusl@techlib.cz

Provozovatel

http://www.techlib.cz

Facebook

Zahraniční báze