DEAD-box RNA helicase is dispensable for mitochondrial translation in Trypanosoma brucei
RICHTEROVÁ, Lenka
2016 - anglický Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. DEAD-box RNA helicase is dispensable for mitochondrial translation in Trypanosoma brucei

RICHTEROVÁ, Lenka
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Korespondence Šťastného Václava Pětipeského z Chýš a Egrberku z let 1600-1621
ŽITNÝ, Miroslav
2016 - český Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Korespondence Šťastného Václava Pětipeského z Chýš a Egrberku z let 1600-1621

ŽITNÝ, Miroslav
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Rapid turnover of the W chromosome in geographical populations of wild silkmoths, Samia cynthia ssp.
ŠÍCHOVÁ, Jindra
2016 - anglický Geographical subspecies of wild silkmoths, Samia cynthia ssp. (Lepidoptera: Saturniidae) exhibit a unique polymorphism in chromosome numbers, resulting from variations in the sex chromosome systems. Three different sex chromosome constitutions were identified: Z0/ZZ in S. c. ricini (2n=27/28), neo-Wneo-Z/neo-Zneo-Z in S. c. walkeri (2n=26/26), and neo-WZ1Z2/Z1Z1Z2Z2 in S. cynthia subsp. indet. (2n=25/26). It has been proposed, that the common ancestor of S. cynthia subspecies had a classical WZ/ZZ constitution with diploid chromosome number of 2n=28/28 and the neo-sex chromosomes in S. c. walkeri and S. cynthia subsp. indet. arose by repeated sex chromosome-autosome fusions. Our sampling effort enabled us to examine five populations of S. cynthia with an ancestral-like karyotype with the aim to verify a hypothesis about sex chromosome evolution in this species complex. Obtained results suggest that the curious WZ system of S. cynthia pryeri may represent an ancestral state of the Samia species complex. However, they do not exclude an alternative hypothesis of its derived origine. Klíčová slova: Fluorescence in situ hybridisation; heterochromatin; insects; Lepidoptera; sex chromosome evolution Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Rapid turnover of the W chromosome in geographical populations of wild silkmoths, Samia cynthia ssp.

Geographical subspecies of wild silkmoths, Samia cynthia ssp. (Lepidoptera: Saturniidae) exhibit a unique polymorphism in chromosome numbers, resulting from variations in the sex chromosome systems. ...

ŠÍCHOVÁ, Jindra
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Fylogeneze, diverzita, distribuce a hostitelská specifita parazitů Haemoproteus spp. (Apicomplexa: Haemosporida: Haemoproteidae) u suchozemských želv Palearktu.
MARŠÍKOVÁ, Aneta
2016 - anglický This study provides unique data on distribution, prevalence, host specificity, phylogeny, and intraspecific variability of two Haemoproteus species of Palearctic tortoises. Analyses based on cytochrome b sequences confirm the existence of two monophyletic lineages/species of Haemoproteus infecting Testudo tortoises. Microscopically, the species corresponding to H. anatolicum was revealed in blood smears of T. graeca, and H. caucasica was detected in two tortoise species, T. graeca and T. horsfieldii. Klíčová slova: Barcoding; cytochrome b; intraspecific variability; Leptoconops; morphology; Testudo. Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Fylogeneze, diverzita, distribuce a hostitelská specifita parazitů Haemoproteus spp. (Apicomplexa: Haemosporida: Haemoproteidae) u suchozemských želv Palearktu.

This study provides unique data on distribution, prevalence, host specificity, phylogeny, and intraspecific variability of two Haemoproteus species of Palearctic tortoises. Analyses based on ...

MARŠÍKOVÁ, Aneta
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Prevalence of Cryptosporidium spp., Enterocytozoon bieneusi, Encephalitozoon spp. and Giardia intestinalis in wild, semi-wild and captive orangutans (Pongo abelii and Pongo pygmaeus) on Sumatra and Borneo, Indonesia.
MYNÁŘOVÁ, Anna
2016 - anglický The prevalence and diversity of Cryptosporidium spp., microsporidia and Giardia intestinalis in orangutans (Pongo abelii and Pongo pygmaeus) at seven different sites on Sumatra and Kalimantan were described using molecular methods. Out of the 298 examined animals, 33 were positive for the tested parasites at least once during the study. Microsporidia(Encephalitozoon spp. and Enterocytozoon bieneusi) were detected in orangutans for the first time and molecular data were obtained on Cryptosporidium spp. and G. intestinalis in this host. Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Prevalence of Cryptosporidium spp., Enterocytozoon bieneusi, Encephalitozoon spp. and Giardia intestinalis in wild, semi-wild and captive orangutans (Pongo abelii and Pongo pygmaeus) on Sumatra and Borneo, Indonesia.

The prevalence and diversity of Cryptosporidium spp., microsporidia and Giardia intestinalis in orangutans (Pongo abelii and Pongo pygmaeus) at seven different sites on Sumatra and Kalimantan were ...

MYNÁŘOVÁ, Anna
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Symbionti Arsenophonus a Sodalis v kloších: analogie k systému Wigglesworthia a Sodalis v mouchách tsetse
ŠOCHOVÁ, Eva
2016 - anglický Tato studie přináší nový symbiotický model ve skupině Hippoboscidae vhodný k porovnávání s dobře charakterizovaným symbiotickým systémem ve skupině Glossinidae. Distribuce symbiontů byla odhalena pomocí elektronové mikroskopie a jejich evoluční původ byl potvrzen rekonstrukcí jejich fylogeneze. Pomocí genomických dat byl zkoumám jejich metabolický přínos hostiteli a osvětlen metabolismus B vitamínů. This study provides a new comparative model of symbiosis in sheep ked to well-characterized tsetse fly symbiotic system. Distribution of symbiotic associates was revealed by transmission electron microscopy and their evolutionary origin was confirmed by reconstruction of their phylogenies. Using genomic data, it explores their metabolic contribution to host and sheds light on B-vitamin metabolism. Klíčová slova: Genomika; Kloši; Endosymbionti; Arsenophonus; Sodalis; Bartonella Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Symbionti Arsenophonus a Sodalis v kloších: analogie k systému Wigglesworthia a Sodalis v mouchách tsetse

Tato studie přináší nový symbiotický model ve skupině Hippoboscidae vhodný k porovnávání s dobře charakterizovaným symbiotickým systémem ve skupině Glossinidae. Distribuce symbiontů byla odhalena ...

ŠOCHOVÁ, Eva
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Conservation value of post-mining headwaters: drainage channels at a lignite spoil heap harbour threatened stream dragonflies
TICHÁNEK, Filip
2016 - anglický V práci jsme se prozkoumaly společenstva vážek 52 sekcí (30m) odvodňovacích kanálů Radovesické výsypky. Pomocí zobecněných lineárních modelů a mnohorozměrných metod analýzy dat jsem identifikovaly klíčové faktory ovlivňující složení, diverzitu a ochranářskou hodnotu společenstev vážek na studovaném území. V práci pak navrhujeme řadu doporučení pro obnovu podobných post-těžebních území. In the work, we studied the biodiversity of dragonflies and damselflies (Odonata) at 53 sections (30 m) of an extraordinarily dense system of drainage ditches at a large lignite spoil heap in the Czech Republic. Using generalized linear models and canonical correspondence analyses we identified crucial factors affecting dragonfly communities and suggested implications for restoration ecology practise. Klíčová slova: Ochrana biodiverzity; odvodňovací kanály; sladkovodní biotopy; vážky; post-industriální stanoviště; ekologie obnovy Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Conservation value of post-mining headwaters: drainage channels at a lignite spoil heap harbour threatened stream dragonflies

V práci jsme se prozkoumaly společenstva vážek 52 sekcí (30m) odvodňovacích kanálů Radovesické výsypky. Pomocí zobecněných lineárních modelů a mnohorozměrných metod analýzy dat jsem identifikovaly ...

TICHÁNEK, Filip
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Expression of SANT/HTH Myb mRNA, a plant morphogenesis-regulating transcription factor, changes due to viroid infection
LOMNICKÁ, Anna
2016 - anglický Potato spindle tuber viroid (PSTVd) belongs to plant-pathogenic, circular, non-coding RNAs. Its propagation is accompanied by (mis)regulation of host genes and induction of pathogenesis symptoms including changes of leaf morphogenesis depending on the strength of viroid variant. We found strong genotype-dependent suppression of tomato morphogenesis-regulating transcription factor SANT/HTHMyb (SlMyb) due to viroid pathogenesis. Its relative mRNA level was found to be significantly decreased in PSTVd-sensitive tomato (cvs Rutgers and Heinz 1706) due to degradation processes, but increased in PSTVd-tolerant (cv. Harzfeuer). In heterologous system of Nicotiana benthamiana, we observed a SlMyb-associated necrotic effect in agroinfiltrated leaf sectors during ectopic overexpression. Leaf sector necroses were accompanied by activation of nucleolytic enzymes but were suppressed by a strongly pathogenic PSTVd variant. Contrary to that, PSTVd's effect was inhibited by the silencing suppressor p19. It was found that in both, Solanum lycopersicum leaves and N. benthamiana leaf sectors, SlMyb mRNA degradation was significantly stronger in viroid-infected tissues. Necroses induction as well as gene silencing experiments using the SANT/HTH-Myb homologues revealed involvement of this Myb in physiological changes like distortions in flower morphogenesis and growth suppression. Potato spindle tuber viroid (PSTVd) belongs to plant-pathogenic, circular, non-coding RNAs. Its propagation is accompanied by (mis)regulation of host genes and induction of pathogenesis symptoms including changes of leaf morphogenesis depending on the strength of viroid variant. We found strong genotype-dependent suppression of tomato morphogenesis-regulating transcription factor SANT/HTHMyb (SlMyb) due to viroid pathogenesis. Its relative mRNA level was found to be significantly decreased in PSTVd-sensitive tomato (cvs Rutgers and Heinz 1706) due to degradation processes, but increased in PSTVd-tolerant (cv. Harzfeuer). In heterologous system of Nicotiana benthamiana, we observed a SlMyb-associated necrotic effect in agroinfiltrated leaf sectors during ectopic overexpression. Leaf sector necroses were accompanied by activation of nucleolytic enzymes but were suppressed by a strongly pathogenic PSTVd variant. Contrary to that, PSTVd's effect was inhibited by the silencing suppressor p19. It was found that in both, Solanum lycopersicum leaves and N. benthamiana leaf sectors, SlMyb mRNA degradation was significantly stronger in viroid-infected tissues. Necroses induction as well as gene silencing experiments using the SANT/HTH-Myb homologues revealed involvement of this Myb in physiological changes like distortions in flower morphogenesis and growth suppression. Klíčová slova: mRNA target; RNA decay; biolistic plant inoculation; transgenote; Nicotiana benthamiana; Solanum lycopersicum Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Expression of SANT/HTH Myb mRNA, a plant morphogenesis-regulating transcription factor, changes due to viroid infection

Potato spindle tuber viroid (PSTVd) belongs to plant-pathogenic, circular, non-coding RNAs. Its propagation is accompanied by (mis)regulation of host genes and induction of pathogenesis symptoms ...

LOMNICKÁ, Anna
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Functional diversity of staphylinid beetles (Coleoptera: Staphylinidae) in maize fields: testing the possible effect of genetically modified, insect resistant maize
SVOBODOVÁ, Zdeňka
2016 - anglický Drabčíci jsou doporučenými bioindikátory pro posouzení rizika geneticky modifikované (GM) kukuřice exprimující Cry3Bb1 toxin pro životní prostředí před uvedením na trh. U 25 nejvíce zastoupených druhů drabčíků byla určena bionomie, potravní specializace, požadavky na teplotu a zařazení do velikostní skupiny (funkční skupiny). Tyto vlastnosti blíže specifikují výskyt drabčíků na pokusné lokalitě a potravní zdroje, které využívají, a determinují tak i pravděpodobný způsob kontaktu drabčíků s Cry3Bb1 toxinem. Vystavení drabčíků Cry toxinu v rostlinných zbytcích zaoraných do půdy bylo prokázáno přítomností saprofágních larev dvoukřídlého hmyzu, které jsou běžnou kořistí dravých druhů drabčíků a hostiteli parazitoidních druhů drabčíků. Statistické analýzy početnosti, Rao indexů a mnohorozměrná analýza distribuce jednotlivých kategorií funkčních skupin na pokusné lokalitě neodhalily žádný signifikantní vliv různých experimentálních ploch, včetně ploch osetých GM kukuřicí, na společenstvo drabčíků. Staphylinid beetles are recommended bioindicators for the pre-market environmental risk assessment of genetically modified (GM) insect protected maize expressing the Cry3Bb1 toxin. Bionomics, food specialization, temperature requirements and size group were assigned for 25 most common staphylinid species. These traits determine the occurrence of staphylinid beetles in the field, the food sources they could utilize and thus also their likely contact with the Cry3Bb1 toxin. The opportunity for exposure to Cry toxin from plant residues ploughed into the soil was shown by the presence of saprophagous dipteran larvae that are common prey of predatory staphylinid species and hosts of the parasitoid species. Statistical analysis of activity abundance, Rao indices and multivariate analysis of distribution of particular categories of functional traits in the field showed negligible effects of the experimental treatments, including the GM maize, upon the staphylinid community. Klíčová slova: GM plodiny; Bt kukuřice; Cry3Bb1; necílový; drabčíci; početnost; funkční skupiny; larvy dvoukřídlých Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Functional diversity of staphylinid beetles (Coleoptera: Staphylinidae) in maize fields: testing the possible effect of genetically modified, insect resistant maize

Drabčíci jsou doporučenými bioindikátory pro posouzení rizika geneticky modifikované (GM) kukuřice exprimující Cry3Bb1 toxin pro životní prostředí před uvedením na trh. U 25 nejvíce zastoupených druhů ...

SVOBODOVÁ, Zdeňka
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Light propagation in burrows of subterranean rodents
KOTT, Ondřej
2016 - anglický Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Light propagation in burrows of subterranean rodents

KOTT, Ondřej
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016