Number of found documents: 158
Published from to

Sekvence variabilního úseku genu kódujícího aspartyl-tRNA syntázu vhodná pro klasifikaci a fylogenetické analýzy zástupců určitých rodů náležejících do řádu Lactobacillales
Killer, Jiří; Mrázek, Jakub
2018 - Czech
Byl připraven a ověřen marker (aspartyl-tRNA syntáza) pro klasifikaci a fylogenetické analýzy zástupců rodů náležejících do řádu Lactobacillales. Umožňuje rychlé a přesné druhové stanovení mléčných bakterií. Předkládanou metodiku lze využít v základním výzkumu při klasifikaci a fylogenetických analýzách vybraných rodů bakterií mléčného kvašení. Především je určen pro rychlé analýzy v provozech mléčného průmyslu. \n There was designed and tested a reliable marker for aspartyl-tRNA synthetase suitable for taxonomic classification and phylogenetic analysis of bacterial genera closely related to genus Lactobacillales. Method enables reliable a sensitive estimation in dairy starters and is independent on the phage cultivation. It is quick, reliable a sensitive estimation of dairy bacteria. It is possible to use it for basic research as well as for the effective analysis in dairy production plants. \n Keywords: Lactobacillales; PCR; marker Available at various institutes of the ASCR
Sekvence variabilního úseku genu kódujícího aspartyl-tRNA syntázu vhodná pro klasifikaci a fylogenetické analýzy zástupců určitých rodů náležejících do řádu Lactobacillales

Byl připraven a ověřen marker (aspartyl-tRNA syntáza) pro klasifikaci a fylogenetické analýzy zástupců rodů náležejících do řádu Lactobacillales. Umožňuje rychlé a přesné druhové stanovení mléčných ...

Killer, Jiří; Mrázek, Jakub
Ústav živočišné fyziologie a genetiky, 2018

Metody detekce houbových chorob využitelné ve fenotypování rostlin a dálkovém průzkumu
Klem, Karel; Veselá, Barbora; Holub, Petr; Urban, Otmar; Mezera, J.
2018 - Czech
Tato metodika shrnuje poznatky z porovnání tří perspektivních metod detekce houbových chorob využitelných pro dálkový průzkum a fenotypování rostlin se zaměřením na odolnost vůči chorobám. Jedná se o metody měření spektrální odrazivosti, infračerveného termálního zobrazování a modro-zelené zobrazovací fluorescence. Na příkladu napadení rostlin ozimé pšenice padlím travním, rzí plevovou a rzí pšeničnou metodika demonstruje jejich přednosti a nedostatky z pohledu detekce jednotlivých chorob, přičemž je zřejmé, že všechny tři metody jsou pro nedestruktivní detekci houbových chorob potenciálně využitelné, ale jejich praktické použití se může lišit. Testování indexů spektrální odrazivosti pro detekci napadení houbovými chorobami ukazuje především vysokou spolehlivost detekce u indexů založených na odrazivosti v red-edge a zeleném pásmu vlnových délek. Infračervené termální zobrazování prokázalo vysokou přesnost detekce u napadení padlím travním, případně rzí pšeničnou, ale již nižší u rzi plevové. Modro-zelená fluorescence i termální zobrazování představují také velmi dobrý nástroj pro vyhodnocení intensity prostorové distribuce napadení listu. This methodology summarises findings from a comparison of three perspective methods of fungal disease detection applicable for remote sensing and plant phenotyping of fungal disease resistance. These methods are spectral reflectance, infrared thermal imaging, and blue-green fluorescence imaging. On the example of winter wheat infection with powdery mildew, stripe rust and brown rust the strengths and weaknesses of individual methods were demonstrated. From these results it is evident that all three methods are potentially applicable for non-destructive fungal disease detection, but their practical use may vary. Testing of spectral reflectance indices for the detection of fungal diseases showed particularly the high detection reliability of the red-edge and green band based spectral vegetation indices. Infrared thermal imaging has shown high detection accuracy for powdery mildew and brown rust, but lower for stripe rust. Blue-green fluorescence and thermal imaging seems to be also a very promising tools for evaluating the intensity and spatial distribution of infection on a leaf level. Keywords: infrared thermography; blue-green fluorescence; winter wheat; Triticum aestivum; fungal plant diseases; powdery mildew; stripe rust; brown rust; etection methods; diagnostic methods; non-destructive detection Fulltext is available at external website.
Metody detekce houbových chorob využitelné ve fenotypování rostlin a dálkovém průzkumu

Tato metodika shrnuje poznatky z porovnání tří perspektivních metod detekce houbových chorob využitelných pro dálkový průzkum a fenotypování rostlin se zaměřením na odolnost vůči chorobám. Jedná se o ...

Klem, Karel; Veselá, Barbora; Holub, Petr; Urban, Otmar; Mezera, J.
Ústav výzkumu globální změny , 2018

Příprava a uchování vzorků ryb pro průtokovou cytometrii
Halačka, Karel; Vetešník, Lukáš; Mareš, J.
2018 - Czech
Průtoková cytometrie umožňující rychlé měření obsahu DNA buněk našla široké využití v ichtyologii i rybářské praxi. Cílem metodiky je přispět k optimalizaci práce na průtokovém cytometru a to pomocí při výběru, odběru a možností fixace analyzovaná tkáně a interpretace získaných dat. Cílovou skupinou dané metodiky jsou zejména osoby z rybářské praxe a ichtyologové zabývající se problematikou populační struktury ryb ve volných vodách, s čímž souvisí i například omezená možnost fixačních prostředků a technik, případně snaha analýz materiálu původně neuchovaného pro účely stanovení ploidie (dočasné pracovní či archivní preparáty, muzejní materiál, atd.). Při výběru druhů k ověření byly preferovány představitelé polyploidních komplexů či hospodářsky využívané druhy se známou existencí polyploidních jedinců. Flow cytometry enabling rapid measurement of cellular DNA content has been widely used in ichthyology and fishery practice. The aim of the methodology is to contribute to optimization of work on the flow cytometer by helping with the selection, sampling and possibilities of fixation of analyzed tissue and interpretation of obtained data. The target group are people from fishery companies and ichthyologists dealing with the problem of the fish population structure in free water. During the sampling and analyzing of samples problem can be limited availability of fixative and techniques as well as analyzes of material not originally retained for the purpose of ploidy determination. Typical examples are temporary usable or archive preparations, museum material, etc. For the verification were preferred representatives of polyploid complexes or economically exploited species with a known existence of polyploid individuals. Keywords: Fish farming; DNA analyses; erythrocytes Fulltext is available at external website.
Příprava a uchování vzorků ryb pro průtokovou cytometrii

Průtoková cytometrie umožňující rychlé měření obsahu DNA buněk našla široké využití v ichtyologii i rybářské praxi. Cílem metodiky je přispět k optimalizaci práce na průtokovém cytometru a to pomocí ...

Halačka, Karel; Vetešník, Lukáš; Mareš, J.
Ústav biologie obratlovců, 2018

Využití předpovědi půdní vlhkosti a intenzity sucha pro lepší rozhodování v rostlinné výrobě
Trnka, Miroslav; Štěpánek, Petr; Chuchma, F.; Možný, M.; Bartošová, Lenka; Hlavinka, Petr; Balek, Jan; Zahradníček, Pavel; Skalák, Petr; Farda, Aleš; Semerádová, Daniela; Meitner, Jan; Bláhová, M.; Fiala, R.; Žalud, Zdeněk
2018 - Czech
Metodika popisuje způsob přípravy předpovědi půdní vlhkosti a intenzity a sucha a současně se zabývá tím, jak jsou tyto předpovědi spolehlivé a jak mohou být využívány. Schopnost předpovídat hodnoty půdní vlhkosti s výhledem až na 9 dní pomocí souboru modelů pro numerickou předpověď počasí sebou nese i nové možnosti reakce v oblasti zemědělského hospodaření. S ohledem na poměrně vysokou míru předpověditelnosti jak půdní vlhkosti i intenzity sucha metodika představuje základní postupy, které je možné využít pro přijetí vhodných opatření od využití závlah po extenzifikaci produkce. V rámci této publikace jsou pak jako příklad prezentovány výsledky analýzy úspěšnosti předpovědi zpracovávané v reálném čase v roce 2017. Prezentovaný systém je plně funkční a využitelný i pro následující sezóny na portále www.intersucho.cz. The methodology describes how to predict soil moisture and drought intensity, and at the same time addresses reliability of the predictions and how these can be used. The ability to predict soil moisture values over a period of up to 9 days is presented through using ensemble of models for numerical weather forecasts. This method brings also new opportunities to mitigate impacts during drought events by farmers using such forecasting tools. With regard to the relatively high predictability of soil moisture and drought intensity, the methodology introduces the basic procedures and provides necessary information for the users. In this methodology, the results of 2017 drought event are presented as an example. The drought forecasting system for the Czech Republic is fully functional and is and will be available through www.intersucho.cz. Keywords: agricultural drought; AVISO model; drought intensity; SoilClim model; weather forecast Available at various institutes of the ASCR
Využití předpovědi půdní vlhkosti a intenzity sucha pro lepší rozhodování v rostlinné výrobě

Metodika popisuje způsob přípravy předpovědi půdní vlhkosti a intenzity a sucha a současně se zabývá tím, jak jsou tyto předpovědi spolehlivé a jak mohou být využívány. Schopnost předpovídat hodnoty ...

Trnka, Miroslav; Štěpánek, Petr; Chuchma, F.; Možný, M.; Bartošová, Lenka; Hlavinka, Petr; Balek, Jan; Zahradníček, Pavel; Skalák, Petr; Farda, Aleš; Semerádová, Daniela; Meitner, Jan; Bláhová, M.; Fiala, R.; Žalud, Zdeněk
Ústav výzkumu globální změny , 2018

Postupy tvorby aplikačních map se zohledněním variability agrochemických vlastností půdy a výnosové úrovně pozemků
Lukas, V.; Neudert, L.; Širůček, P.; Kraus, M.; Novák, J.; Mezera, J.; Zemek, František; Pikl, Miroslav; Žížala, D.
2018 - Czech
Metodika popisuje postupy tvorby aplikačních map na základě digitálního mapování půdy a z výsledků půdního vzorkování a způsob stanovení dávky variabilní aplikace hnojiv s ohledem na stav zásobenosti půd přístupnými živinami a plošnou nevyrovnanost výnosových úrovní v rámci jednotlivých pozemků. Současně zahrnuje výsledky porovnání těchto postupů s ohledem na celkové množství aplikovaných hnojiv a přesnost rozložení dávek v rámci půdních bloků. The methodology describes how to create application maps based on digital soil mapping and soil sampling results and how to determine the dose of variable rate application of fertilizer addressed to spatial variability of nutrient content in soil and crop yields within the field. It includes also the results of a comparison of these procedures with respect to the total amount of fertilizer applied and the occuracy of the dose distribution across the fields. Keywords: soil properties; soil heterogeneity Available at various institutes of the ASCR
Postupy tvorby aplikačních map se zohledněním variability agrochemických vlastností půdy a výnosové úrovně pozemků

Metodika popisuje postupy tvorby aplikačních map na základě digitálního mapování půdy a z výsledků půdního vzorkování a způsob stanovení dávky variabilní aplikace hnojiv s ohledem na stav zásobenosti ...

Lukas, V.; Neudert, L.; Širůček, P.; Kraus, M.; Novák, J.; Mezera, J.; Zemek, František; Pikl, Miroslav; Žížala, D.
Ústav výzkumu globální změny , 2018

Metodika tvorby ekosystémových účtů na národní úrovni
Vačkář, David; Grammatikopoulou, Ioanna; Harmáčková, Veronika Zuzana
2018 - Czech
Cílem metodiky je poskytnout metodologický rámec pro environmentální a ekonomické účetnictví ekosystémových služeb. V současnosti nejsou přínosy plynoucí společnosti z užívání ekosystémů, stejně však i škody na přírodním bohatství způsobené ekonomickou a jinou lidskou činností zaúčtované v národních účtech a ukazatelích národního bohatství. V návaznosti na snahy rozšíření ukazatelů národní výkonnosti o environmentální dimenzi dochází k revizím statistických standardů a rozvoji nových směrů v rámci Systému environmentálního ekonomického účetnictví (SEEA). Jedním z nových směrů je účetnictví ekosystémových služeb. Metodika experimentálního ekosystémového účetnictví (EEA) zavádí nové postupy pro hodnocení ekosystémových služeb z hlediska účetnictví přírodního kapitálu. Předkládaná metodologie stanovuje základní východiska, postupy a typy účtování ekosystémových služeb v systému environmentálního ekonomického účetnictví. The aim of this document is to provide methodological framework for ecosystem accounting at the national level. Ecosystem accounting is a coherent and integrated approach to the assessment of the environment through the measurement of ecosystems, and measurement of the flows of services from ecosystems into economic and other human activity. Therefore, ecosystem accounting enables to account for the supply and use of ecosystem services within the system of national environmental statistical accounts.This methodology provides framework for the measurement of ecosystem services flows from the environment to the economy, supply of ecosystem services by ecosystem units, use of ecosystem services by economic sectors, and accounting for monetary value of ecosystem service flows and assets. The methodology presents examples of ecosystem accounts and describes their structure. The methodology should support development and implementation of ecosystem accounts within satellite environmental accounts of System of Environmental and Economic Accounting (SEEA) and serve as a reference for methodological developments in experimental ecosystem accounting Keywords: ekosystémové služby; environmentální účty; SEEA; experimentální ekosystémové účetnictví Available at various institutes of the ASCR
Metodika tvorby ekosystémových účtů na národní úrovni

Cílem metodiky je poskytnout metodologický rámec pro environmentální a ekonomické účetnictví ekosystémových služeb. V současnosti nejsou přínosy plynoucí společnosti z užívání ekosystémů, stejně však ...

Vačkář, David; Grammatikopoulou, Ioanna; Harmáčková, Veronika Zuzana
Ústav výzkumu globální změny , 2018

Metodika hodnocení biotopů AOPK ČR 2017
Seják, J.; Cudlín, Pavel; Petříček, V.; Prokopová, Marcela; Cudlín, Ondřej; Holcová, D.; Kaprová, K.; Melichar, J.; Škarková, P.
2018 - Czech
Metodika hodnocení biotopů AOPK ČR 2017 je novelizace metody hodnocení a oceňování biotopů ČR, vytvořené Českým ekologickým ústavem pro MŽP (Seják, Dejmal a kol., 2003). Principem metodiky je expertní hodnocení typů biotopů České republiky, které využívá vybrané parametry, založené převážně na hodnotách biodiverzity různých úrovní. Peněžní hodnocení je založené na analýze nákladů na revitalizační opatření. Metodu lze využít k hodnocení a peněžnímu ocenění ekologické kvality biotopů a krajinných segmentů s praktickým využitím při kvantifikaci ekologické újmy, ale také při porovnávání různých alternativ návrhů revitalizace krajiny. The presented habitat valuation method is an amendment of the original method for evaluation and pricing of habitats in the Czech Republic developed in the Ecological Institute (Seják et al. 2003). The method is based on expert evaluation of habitat types in the Czech Republic using selected parametres expressing biodiversity value of several levels. The monetary valuation is based on restoration costs analysis. The method can be be used for the evaluation and monetary valuation of ecological value of landscape segments with practical use in ecological demage quantification but also for a comparison of several alternatives of landscape restoration projects. Keywords: biotopes, nonmarket monetary valuation, environmental damage, nature restoration effectiveness; nonmarket valuation; environmental damage; nature restoration effectiveness Available at various institutes of the ASCR
Metodika hodnocení biotopů AOPK ČR 2017

Metodika hodnocení biotopů AOPK ČR 2017 je novelizace metody hodnocení a oceňování biotopů ČR, vytvořené Českým ekologickým ústavem pro MŽP (Seják, Dejmal a kol., 2003). Principem metodiky je expertní ...

Seják, J.; Cudlín, Pavel; Petříček, V.; Prokopová, Marcela; Cudlín, Ondřej; Holcová, D.; Kaprová, K.; Melichar, J.; Škarková, P.
Ústav výzkumu globální změny , 2018

Hodnocení zdravotního stavu lesních porostů v České republice pomocí satelitních dat Sentinel-2
Lukeš, Petr; Strejček, R.; Křístek, Š.; Mlčoušek, M.
2018 - Czech
Předkládaná metodika má za cíl navrhnout komplexní systém celoplošného hodnocení zdravotního stavu lesních porostů České republiky na základě analýzy satelitních dat Sentinel2. Metodika řeší celý proces od zpracování zdrojových satelitních dat pomocí zcela nového přístupu založeného na využití všech dostupných satelitních pozorování a jejich zpracování do formy bezoblačných mozaik České republiky za využití přístupu analýzy velkých dat. V\nnásledném kroku jsou produkty odvozené z těchto bezoblačných mozaik (vegetační indexy a jiné analýzy obrazu) porovnány s rozsáhlou databází pozemního šetření zdravotního stavu lesních porostů (hodnoty indexu listové plochy vzorkované v rámci vývoje metodiky - dále LAI, databáze defoliací porostů ICPForests, hyperspektrální letecká data pro vybrané zájmové území, globální databáze detekce těžby). Pro produkty s nejlepším vztahem k pozemním hodnotám indexu listové plochy je vyvinut predikční statistický model zisku hodnot LAI ze satelitních dat. Zdravotní stav porostů je hodnocen na základě sledování meziroční změny hodnot LAI pro bezoblačné mozaiky generované v maximu vegetační fáze vegetace, kde jsou jednotlivé pixely zařazeny do čtyř tříd zdravotního stavu dle míry růstu či poklesu LAI ve sledovaném období. Finální hodnocení zdravotního stavu je aplikováno na úrovni katastrálních území, kde je každé katastrální území zařazeno do čtyř tříd zdravotního stavu na základě procentického zastoupení porostů nejnižší třídy zdravotního stavu (výrazný pokles LAI) k celkové lesnatosti porostů do 80 let věku. This methodology aims to design a comprehensive system of nationwide assessment of the state of health of the Czech Republic based on Sentinel-2 satellite data analysis. The methodology addresses the entire process from the pre-processing of source satellite data using a novel approaches based on analysis of all-available satellite observations and their processing in the form of cloud-free mosaics of the Czech Republic using big data approach. In the next step, the products derived from cloud-free mosaics (vegetation indexes and other image analysis) are compared against extensive database of ground survey of forest health status (values of the leaf area index sampled as part of the development of the methodology - further denoted as LAI, database of tree defoliation ICPForests, airborne hyperspectral data acquired for selected study area, global forest losses database). For products with the best relationship to in-situ data, a predictive statistical model to yield LAI from satellite observations is developed. Forest health status is evaluated on the basis of yearly changes of the LAI values for cloud-free mosaics generated in the vegetation maximum. Individual pixels are classified into four health classes according to LAI growth rate or decrease in the observed period. The final assessment of the state of health is applied at the cadastral level, where each cadastral area is classified into four health classes based on the fraction of the lowest health status stands with significant LAI decrease to the total forest cover for stands up to 80 years of age Keywords: forests; health status; satellite data; Sentinel-2; leaf area index; monitoring Available in digital repository of the ASCR
Hodnocení zdravotního stavu lesních porostů v České republice pomocí satelitních dat Sentinel-2

Předkládaná metodika má za cíl navrhnout komplexní systém celoplošného hodnocení zdravotního stavu lesních porostů České republiky na základě analýzy satelitních dat Sentinel2. Metodika řeší celý ...

Lukeš, Petr; Strejček, R.; Křístek, Š.; Mlčoušek, M.
Ústav výzkumu globální změny , 2018

Metody hodnocení potenciální zranitelnosti podzemních vod reaktivním dusíkem při pěstování polních plodin na orné půdě
Zemek, František; Pikl, Miroslav; Holub, Petr; Klem, Karel; Záhora, J.; Vavříková, J.
2017 - Czech
Metodika identifikace potenciálního průsaku reaktivního dusíku do podzemních zdrojů vod je založena na hodnocení kombinace konzervativních, těžko měnitelných a časově stabilních faktorů povodí a těch faktorů, které může člověk svým působením v krajině ovlivňovat. K ním patří způsoby a intenzita pěstování polních plodin na orné půdě povodí. Parametry druhé skupiny jsou získávány na základě metod obrazové spektroskoie leteckých hyperspektrálních a satelitních multispektrálních dat Sentinel-2. The methodology demonstrates on the case study of a catchment (cca 200 km2 in size) how to identify the areas with high risk of nitrogen (N) leaching to underground water in arable land. It uses synergy between “conservative” characteristics of the catchment, such as orographic features, bedrock and soil hydrological properties, and the dynamic ones, which are represented by vegetation properties. The latter are identified through the imaging spectroscopy of wheat canopy obtained from airborne hyperspectral and/or Sentinel-2 multispectral data. Keywords: nitrogen leaching; underground water; remote sensing Available at various institutes of the ASCR
Metody hodnocení potenciální zranitelnosti podzemních vod reaktivním dusíkem při pěstování polních plodin na orné půdě

Metodika identifikace potenciálního průsaku reaktivního dusíku do podzemních zdrojů vod je založena na hodnocení kombinace konzervativních, těžko měnitelných a časově stabilních faktorů povodí a těch ...

Zemek, František; Pikl, Miroslav; Holub, Petr; Klem, Karel; Záhora, J.; Vavříková, J.
Ústav výzkumu globální změny , 2017

Management stanovišť ohrožených druhů denních a nočních motýlů v České republice
Konvička, Martin; Beneš, Jiří; Spitzer, Lukáš; Bartoňová, Alena; Zapletal, Michal
2017 - Czech
Metodika se zabývá péčí o biotopy motýlů (Lepidoptera) zařazených do Červeného seznamu bezobratlých ČR. Zabývá se denními i nočními motýly z tradiční skupiny Macrolepidoptera. Popisuje principy a zásady různých způsobů péče o stanoviště motýlů a zásady managementu pro jednotlivé typy biotopů. V další části metodiky jsou vymezeny oblasti ČR, které jsou prioritní pro ochranu zájmových druhů. Pro vybrané lokality je navržen způsob péče. This methodology concerns the care of the biotopes of butterflies (Lepidoptera) included in the Red List of Invertebrates of the Czech Republic. It deals with day and night butterflies from the traditional „Macrolepidoptera“ group. It describes the principles of various types of care for butterfly habitats, and also management principles for particular biotope types. The other part of the methodology defines the areas of the Czech Republic, which are priority for the protection of species of interest. For selected location there is management designed. Keywords: conservation; management; Lepidoptera recent distribution Fulltext is available at external website.
Management stanovišť ohrožených druhů denních a nočních motýlů v České republice

Metodika se zabývá péčí o biotopy motýlů (Lepidoptera) zařazených do Červeného seznamu bezobratlých ČR. Zabývá se denními i nočními motýly z tradiční skupiny Macrolepidoptera. Popisuje principy a ...

Konvička, Martin; Beneš, Jiří; Spitzer, Lukáš; Bartoňová, Alena; Zapletal, Michal
Biologické centrum, 2017

About project

NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web

Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz

Provider

http://www.techlib.cz

Facebook

Other bases