Populační a genetická struktura pstruha obecného a lipana podhorního jako základ úspěšného rybářského obhospodařování
Halačka, Karel; Papoušek, Ivo; Kohout, Jan; Vetešník, Lukáš; Lusk, Stanislav; Mendel, Jan; Šlechta, Vlastimil
2008 - český Cílem práce bylo poznání dynamiky populací lososovitých ryb. Pozornost byla zaměřena zejména na genetickou diverzitu populací pstruha obecného a lipana, dále pak na vybrané morfologické znaky (struktura pokožky). Genetické analýzy pomocí D-loop a cytochromu b ukázaly extrémní uniformitu našich populací v rámci všech třech úmořích. Vlivem antropogenních zásahů (umělé reprodukce spojená s převozy násad či generačních ryb) byl zcela narušen výsledek přirozené diverzifikace vedoucí ke vzniku místních, daným podmínkám přizpůsobených subpopulací (naprostá většina jedinců byla jednotného (atlantského) holotypu). Srovnávací studie zabývající se strukturou a dynamikou pokožky pstruha obecného, duhového, sivena amerického a lipana ukázala výrazné rozdíly zejména v zastoupení sekrečních buněk. Jejich nižší podíl v lipana může souviset citlivostí k zaplísnění v povýtěrovém období. The aim of the study is to contribute to knowledge about population dynamics of our salmonids. The study concentrated particularly on the genetic diversity of Salmo trutta and Thymallus thymallus populations, and also on selected morphological characters. Genetic analyses of the mitochondrial DNA have shown an existence of an extreme uniformity of populations in all three sea-drainage areas. Due to anthropogenic interventions, structure local subpopulations adapted to given local subpopulations, resulting from the natural diversification spanning thousands of years, has been disrupted. All other individuals carried a uniform (Atlantic) haplotype. A comparison study dealing with structure and dynamics of epidermis in S. trutta, O. mykiss, S. fontinalis and T. thymallus has shown significant differences particularly in fraction of the secretory cells. Lower proportion of the secretory cells in T. thymallus could be related to its sensitivity to molds in the post-spawning period. Klíčová slova: genetic diversity; trout; grayling Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Populační a genetická struktura pstruha obecného a lipana podhorního jako základ úspěšného rybářského obhospodařování

Cílem práce bylo poznání dynamiky populací lososovitých ryb. Pozornost byla zaměřena zejména na genetickou diverzitu populací pstruha obecného a lipana, dále pak na vybrané morfologické znaky ...

Halačka, Karel; Papoušek, Ivo; Kohout, Jan; Vetešník, Lukáš; Lusk, Stanislav; Mendel, Jan; Šlechta, Vlastimil
Ústav biologie obratlovců, 2008

Tutorial in phylogenetic analyses
Martínková, Natália
2008 - anglický Reconstruction of phylogeny plays an important role in presentday science. Aim of this paper is to introduce basic methods of phylogenetic analysis using DNA sequences. In a brief manner, approaches to phylogenetic inference, commonly used methods of tree reconstruction, and models of DNA evolution are presented. This compendium may serve as an introduction to this exciting discipline of biological science. Fylogenetické analýzy se rychle vyvíjejí a často se objevují nové metody nebo pokročilá vylepšení stávajících metod. Školení poskytne návod, jak určit důležité kroky ve fylogenetické analýze sekvencí DNA, které mohou být aplikovány na další výpočtové techniky. Tyto kroky zahrnují alignment sekvencí, identifikace alel a haplotypů, výběr substitučního modelu a rekonstrukce fylogenetických stromů. Klíčová slova: phylogenetic DNA sequence analysis Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Tutorial in phylogenetic analyses

Reconstruction of phylogeny plays an important role in presentday science. Aim of this paper is to introduce basic methods of phylogenetic analysis using DNA sequences. In a brief manner, approaches ...

Martínková, Natália
Ústav biologie obratlovců, 2008

Indikační význam rybího společenstva v případě chronického chemického znečištění toku
Jurajda, Pavel; Janáč, Michal; Valová, Zdenka; Streck, G.
2008 - český Studie se zabývá vlivem chemického znečištění toků na společenstvo ryb. V této práci jsem se zaměřili na střední tok Labe u Pardubic a Bílinu. Většina sledovaného úseku Labe je kanalizovaná. Bílina je silně ovlivněna vysokou koncentrací průmyslové výroby, důlní činností, výrobou energie a petrochemickým průmyslem. I když došlo k útlumu výše uvedených činností a k zavedení moderních technologií čištění vod, stále je řeka Bílina jedním z nejznečištěnějších toků v ČR. Průzkum Labe probíhal v červenci 2005 a 2006 a Bíliny v červnu a červenci 2006 a 2007. Rybí společenstvo se ukázalo špatným indikátorem chemického znečištění. V Labi u Pardubic nebyl zjištěn vliv odpadní vody na strukturu rybího společenstva, ale naopak jako rozhodující činitel se jeví technické úpravy toku. Na Bílině, kde je vzorkování rybího společenstva efektivnější, byl zjištěn jednoznačný vliv odpadních vod ČOV (deficit kyslíku) i přítomnosti nádrží na strukturu rybího společenstva. The aim of the study was to evaluate indicative capability of fish community in chronically polluted rivers. Fish were studied in the Elbe River in four inter-weir sections in July 2005 and 2006. Sixteen sites in Bílina stream were sampled in June 2006 and 2007. Twenty two species were registered in two seasons in selected sites of the Elbe River. However generalists form a majority of the fish community in all sections. There was no significant difference in fish species richness between polluted and unpolluted sections. Channelization of the Elbe River seems to be the most important determinant of fish community structure. Fish community in the Bílina stream is strongly influenced by anthropogenic impact. Presence of reservoir changed fish community and point source pollution affected water quality up to complete fish absence. Fish were not a good biological indicator of chemical pollution. Klíčová slova: chemical pollution in rivers; fish community; Elbe River Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Indikační význam rybího společenstva v případě chronického chemického znečištění toku

Studie se zabývá vlivem chemického znečištění toků na společenstvo ryb. V této práci jsem se zaměřili na střední tok Labe u Pardubic a Bílinu. Většina sledovaného úseku Labe je kanalizovaná. Bílina je ...

Jurajda, Pavel; Janáč, Michal; Valová, Zdenka; Streck, G.
Ústav biologie obratlovců, 2008

Nezbytnost cílených zásahů v záplavových územích pro rozvoj a stabilizaci rybí bioty
Lusk, Stanislav; Hartvich, P.; Lojkásek, B.; Lusková, Věra; Pražák, O.; Halačka, Karel; Sovíková, L.
2008 - český Původní záplavová území větších řek se zachovala v omezeném rozsahu a s výrazně pozměněným hydrologickým režimem. To postihuje negativně vodní biotu, především ryby. Prezentované poznatky byly získány při výzkumech autorů v záplavových území Odry, Dyje a Lužnice. Nejvýraznější změny: vznik rybníků, regulace toků, protipovodňové hráze, zánik lučního a pastevního hospodaření, změna dynamiky průtoků. Důsledky: omezení až zánik krajinotvorné funkce toku, zazemňování a zánik aluviálních biotopů, jejich úplné vysýchání během suchých roků, omezování až zánik populací původních charakteristických druhů ryb (zejména Misgurnus fossilis, Rhodeus amarus, Cobitis sp., Carassius carassius, Leucaspius delineatus, aj.). Náprava: aktivní zásahy a udržování optimálního stavu vodních biotopů, nové umělé mokřady, restaurace a posilování původních populací chráněných a ohrožených druhů ryb při zohlednění aspektů "ochrany genetické diverzity". Pasivní ochrana biotopů i druhů již není řešením. The preserved extent of the initial floodplains along major rivers is limited and has been distinctly altered by hydrological dynamics. The results exert a negative impact on aquatic biota, above all, fishes (the floodplains of Odra, Dyje, Lužnice rivers). The most marked changes include construction of ponds, canalization of streams with levees, absence of meadow management. The consequences: absent landscape formation activity of streams, expansion of wetland vegetation, gradual silting and downfall of alluvial habitats, their total drying, destruction of elements such as channels, ditches, river arms and other habitats, a limitation or disappearance of populations of Misgurnus fossilis, Rhodeus amarus, Cobitis spp., Carassius carassius, Leucaspius delineatus. Retrieval: maintenance of optimum condition of aquatic habitats, creation of artificial wetlands, restoration populations of protected fish species. Passive protection of habitat and species is no solution any longer. Klíčová slova: floodplain; fish biota; Odra, Lužnice and Dyje rivers Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Nezbytnost cílených zásahů v záplavových územích pro rozvoj a stabilizaci rybí bioty

Původní záplavová území větších řek se zachovala v omezeném rozsahu a s výrazně pozměněným hydrologickým režimem. To postihuje negativně vodní biotu, především ryby. Prezentované poznatky byly získány ...

Lusk, Stanislav; Hartvich, P.; Lojkásek, B.; Lusková, Věra; Pražák, O.; Halačka, Karel; Sovíková, L.
Ústav biologie obratlovců, 2008

Potravní ekologie siky
Kamler, Jiří; Homolka, Miloslav; Barančeková, Miroslava; Krojerová, Jarmila; Dvořák, J.
2007 - český Klíčová slova: sika deer; food Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Potravní ekologie siky

Kamler, Jiří; Homolka, Miloslav; Barančeková, Miroslava; Krojerová, Jarmila; Dvořák, J.
Ústav biologie obratlovců, 2007

Únosný stav zvěře – komplex vztahů mezi býložravci a vegetací
Kamler, Jiří; Homolka, Miloslav; Heroldová, Marta
2007 - český Klíčová slova: ungulates Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Únosný stav zvěře – komplex vztahů mezi býložravci a vegetací

Kamler, Jiří; Homolka, Miloslav; Heroldová, Marta
Ústav biologie obratlovců, 2007

Jaké jsou reálné stavy zvěře a jak je zjistit?
Plhal, R.; Kamler, Jiří; Dvořák, J.
2007 - český Klíčová slova: game management Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Jaké jsou reálné stavy zvěře a jak je zjistit?

Plhal, R.; Kamler, Jiří; Dvořák, J.
Ústav biologie obratlovců, 2007

Velkoplošná rehabilitace říční krajiny v záplavovém území dolní části řeky Dyje
Lusk, Stanislav; Pražák, O.; Lusková, Věra; Halačka, Karel; Vetešník, Lukáš
2007 - český Řeka Dyje v trati Lednice – Bulhary byla napřímena, zkanalizována a obklopena protipovodňovými hrázemi. Záplavové území u Podivína bylo z velké části přeměněno na ornou půdu. Plochy označené jako tzv. mokřady a rákosiny byly v důsledku eliminace záplav a postupného zanášení (zazemňování) až na výjimky v některých obdobích roku zcela bez vody. Došlo k vymizení původního společenstva ryb charakteristického pro aluviální biotopy. V levobřežní části záplavového území Dyje u Podivína byla vytvořena obora pro spárkatou zvěř o ploše cca 470 ha, kde je jeden soukromý vlastník celého tohoto územního fragmentu. V posledních dvou letech je postupně orná půda převáděna na louky a lužní les. Postupně je realizována i obnova a rozšiřování trvalého zavodnění částí označených jako mokřady. Dochází tak k výraznému zlepšení podmínek pro trvalý výskyt ryb a pro cílenou obnovu rybího společenstva s dominancí nativních druhů pro tuto oblast (společenstvo typu Carassius-Misgurnus). The Dyje River between Lednice and Bulhary was straightened, canalised, and provided with levees. Most of the alluvial area near Podivin was transformed to arable land. Due to elimination of floods, save for exceptions, areas denoted as wetlands and reed beds were qute dry for most of the year. As a result, the native fish communities typical of alluvial habitats gradually vanished from their habitats. In recent years, some 470 hectares on the left bank of the Dyje River, owned by a single private person, were transformed into a deer sanctuary. In the past two years, the arable land in that area has been gradually turned into meadows and a floodplain forest, together with restoring and enlarging the area of permanently waterlogged parts denoted as wetlands. As a result, the conditions permitting permanent occurrence of fish have been significantly improved and for a purposeful restoration of their fish communities in which native species predominate (the Carassius-Misgurnus type). Klíčová slova: floodplain; fish biota; Dyje river; wetlands; restoration of aquatic habitats Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Velkoplošná rehabilitace říční krajiny v záplavovém území dolní části řeky Dyje

Řeka Dyje v trati Lednice – Bulhary byla napřímena, zkanalizována a obklopena protipovodňovými hrázemi. Záplavové území u Podivína bylo z velké části přeměněno na ornou půdu. Plochy označené jako tzv. ...

Lusk, Stanislav; Pražák, O.; Lusková, Věra; Halačka, Karel; Vetešník, Lukáš
Ústav biologie obratlovců, 2007

Vlivy určující druhovou skladbu rybích společenstev řek Moravy, Dyje, Odry a Lužnice v úsecích s přilehlým záplavovým územím
Lusk, Stanislav; Lusková, Věra; Lojkásek, B.; Hartvich, P.
2007 - český Byla provedena analýza druhové skladby rybího osídlení řek Morava, Dyje (Černého moře), Odra (Baltické moře), Lužnice (Severní moře) v úsecích, kde uvedené toky mají vyvinuté rozsáhlé z části či zcela funkční záplavové území. Jako určující pro druhovou skladbu ichtyofauny hodnocených řek se jeví následující faktory: - úmoří, - lokalizace úseku v podélném profilu toku, - bezbariérové migrační napojení na toky vyššího řádu, - rybníky, - rybářství. Nejvyšší vliv má příslušnost k úmoří, dále se uplatňuje splavování ryb z výše položených částí povodí, významný vliv má migrační prostupnost vodního toku z dolních částí a z mateřského toku. Region soutok Morava a Dyje je v rámci České republiky z hlediska druhové pestrosti nejbohatší. Vyskytuje se tam 38 původních druhů, z toho 8 výlučně pouze v této oblasti a dále byl zjištěn i výskyt 6 nepůvodních druhů. V regionu Odra se vyskytuje 28 původních druhů a 4 nepůvodní druhy. V regionu Lužnice se vyskytuje 23 původních a 5 nepůvodních druhů. The species composition of fish communities was studied in sections of the rivers Morava and Dyje (Black S. basin), Odra (Baltic S.), Lužnice (North S.) with floodplains. The following factors appear to determine the species composition of the ichthyofaunae inhabiting the hydrological regions: Sea basin, location of the section in the longitudinal profile of a stream, absence of migration barriers, presence of fishponds, fishery management. As regards the origin of a community, the pertinence to a basin is of greatest importance and migration from the lower sections. As regards the species richness of ichthyofauna, the region of confluence of the rivers Morava and Dyje is the richest of the whole Czech Republic - 38 native species, 9 of which occur only in that region, 7 alien species was recorded in that region. The region of the Odra R. was found to harbour 29 native and 4 non-native species; that of the Lužnice R., 25 native and 5 non-native fish species and 1 lamprey species . Klíčová slova: floodplain; ichthyofauna; river sections; factors affecting species richness Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Vlivy určující druhovou skladbu rybích společenstev řek Moravy, Dyje, Odry a Lužnice v úsecích s přilehlým záplavovým územím

Byla provedena analýza druhové skladby rybího osídlení řek Morava, Dyje (Černého moře), Odra (Baltické moře), Lužnice (Severní moře) v úsecích, kde uvedené toky mají vyvinuté rozsáhlé z části či zcela ...

Lusk, Stanislav; Lusková, Věra; Lojkásek, B.; Hartvich, P.
Ústav biologie obratlovců, 2007

Individuální růst značkových jedinců kapra obecného (Cyprinus carpio f. domestica) ve dvou rozdílných nádržích povodí Moravy (ČR) v prvním roce po vysazení násad
Habán, V.; Prokeš, Miroslav; Baruš, Vlastimil; Mareš, J.; Peňáz, Milan
2007 - český V příspěvku jsou uvedeny výsledky srovnání růstu značkovaných jedinců kapra obecného ve dvou rozdílných nádržích, Novomlýnské a Dalešické, v prvním roce po vysazení násady. Do Novomlýnské nádrže bylo vysazeno 10000 značkovaných jedinců a do Dalešické 4000 značkovaných jedinců kapra obecného. Růst kapra obecného byl v průběhu prvního roku expozice v mělkovodní Novomlýnské nádrži dvojnásobně intenzívnější(TL=46,4 cm, w=2,26 kg) než v hlubokovodní Dalešické nádrži (TL=37,0 cm, w=1,08 kg), která se vyznačuje specifickým hydrologickým režimem. Významné rozdíly byly zjištěny ve všech dalších sledovaných parametrech. Růst kapra obecného byl v Novomlýnské nádrži obdobný jako v rybničních podmínkách, kdežto v Dalešické nádrži jako v tzv. volných vodách. The growth rate of tagged carps has been studied in two different man-made lakes, namely a shallow reservoir Novomlýnská and the deep reservoir Dalešická over one year after stocking of the two-year-old stockfish. Ten thousands of tagged individuals were released into the Novomlýnská reservoir while 4000 ones into the Dalešická reservoir. The body mass of carps found after one year rearing in the Novomlýnská reservoir (TL=46.4 cm, w=2.26 kg) was twice greater than obtained in the Dalešická reservoir (TL=37.0 cm, w=1.08 kg). Significant differences were stated in all followed parameters. The growth rate registered in the carp from Novomlýnská reservoir resembles that existing normally in pond culture whereas growth rate of carps stocked into the Dalešická reservoir was similar as in carps from running waters. Klíčová slova: carp; growth; tagging Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Individuální růst značkových jedinců kapra obecného (Cyprinus carpio f. domestica) ve dvou rozdílných nádržích povodí Moravy (ČR) v prvním roce po vysazení násad

V příspěvku jsou uvedeny výsledky srovnání růstu značkovaných jedinců kapra obecného ve dvou rozdílných nádržích, Novomlýnské a Dalešické, v prvním roce po vysazení násady. Do Novomlýnské nádrže bylo ...

Habán, V.; Prokeš, Miroslav; Baruš, Vlastimil; Mareš, J.; Peňáz, Milan
Ústav biologie obratlovců, 2007