Number of found documents: 42147
Published from to

Microbial and Viral Genomic Diversity in Freshwater Environments
SILVA KAVAGUTTI, Vinicius
2022 - English
Most abundant microbes from natural environments remain uncultured as traditional culture approaches fail to sufficiently simulate native conditions. Moreover, the efforts to obtain axenic cultures are also hampered due to inter-microbial dependencies. The absence of cultured representatives has several downstream effects, e.g., little chance of experimentation and creating genetic models or hypothesis testing, phage isolation, or even producing complete, closed reference genomes. Lack of all these maintains severe gaps in our abilities to understand microbes in appropriate phylogenetic and ecological contexts and also their habitat at large. This thesis tries to circumvent these issues through a meticulous investigation of freshwater microbes and their viruses using a metagenomic approach in the Římov reservoir. Most abundant microbes from natural environments remain uncultured as traditional culture approaches fail to sufficiently simulate native conditions. Moreover, the efforts to obtain axenic cultures are also hampered due to inter-microbial dependencies. The absence of cultured representatives has several downstream effects, e.g., little chance of experimentation and creating genetic models or hypothesis testing, phage isolation, or even producing complete, closed reference genomes. Lack of all these maintains severe gaps in our abilities to understand microbes in appropriate phylogenetic and ecological contexts and also their habitat at large. This thesis tries to circumvent these issues through a meticulous investigation of freshwater microbes and their viruses using a metagenomic approach in the Římov reservoir. Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Microbial and Viral Genomic Diversity in Freshwater Environments

Most abundant microbes from natural environments remain uncultured as traditional culture approaches fail to sufficiently simulate native conditions. Moreover, the efforts to obtain axenic cultures ...

SILVA KAVAGUTTI, Vinicius
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Characterization of pore opening relevant residues in TM3 and TM4 domains of Orai1
ANDOVA, Ana-Marija
2022 - English
Calcium (Ca2+) ions play a crucial role in almost every aspect of cellular life. The most prominent calcium entry pathway into the cell is the calcium release-activated calcium (CRAC) channel, composed of the Orai1 protein, and the stromal interaction molecule STIM1. The channel is activated through conformational changes upon STIM1 coupling to the C-terminus of Orai1 protein following store depletion, which in turn allows Ca2+ influx into the cell. The abnormal function of the CRAC channel caused by mutations gives rise to distinct pathologies. Since it has not yet been elucidated how the signal propagation moves to the pore upon coupling, this thesis dives into its investigation by focusing on characterizing the TM3 and TM4 domains and their importance in leading to an open permissive conformation of the channel. The pivotal foundation for the creation of novel strategies in the modulation of the Orai1 function lies with the understanding of the dynamics of the Orai1 pore opening. Calcium (Ca2+) ions play a crucial role in almost every aspect of cellular life. The most prominent calcium entry pathway into the cell is the calcium release-activated calcium (CRAC) channel, composed of the Orai1 protein, and the stromal interaction molecule STIM1. The channel is activated through conformational changes upon STIM1 coupling to the C-terminus of Orai1 protein following store depletion, which in turn allows Ca2+ influx into the cell. The abnormal function of the CRAC channel caused by mutations gives rise to distinct pathologies. Since it has not yet been elucidated how the signal propagation moves to the pore upon coupling, this thesis dives into its investigation by focusing on characterizing the TM3 and TM4 domains and their importance in leading to an open permissive conformation of the channel. The pivotal foundation for the creation of novel strategies in the modulation of the Orai1 function lies with the understanding of the dynamics of the Orai1 pore opening. Keywords: ion channel; calcium signaling; CRAC channels; channel; CRAC; Orai1; Orai protein; STIM1; STIM protein; CRAC channel activation; molecular biology; electrophysiology; cell culture; mutation; TM domain; TM3; TM4; SOCE; pore opening; transmembrane domain Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Characterization of pore opening relevant residues in TM3 and TM4 domains of Orai1

Calcium (Ca2+) ions play a crucial role in almost every aspect of cellular life. The most prominent calcium entry pathway into the cell is the calcium release-activated calcium (CRAC) channel, ...

ANDOVA, Ana-Marija
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Tesařík alpský (\kur{Rosalia alpina}) v Ralské pahorkatině
KOVÁŘOVÁ, Pavlína
2022 - Czech
The Rosalia longicorn (Rosalia alpina; Linnaeus, 1758) is a protected saproxylic (deadwood-depending) beetle species. Thanks to its attractive colouring, it acts as an umbrella species important for biodiversity conservation. The beetle has disappeared from many places in the Czech Republic, with one of the last populations surviving in the Ralska upland. Using the capture-mark-recapture method, I estimated the local population size, and mobility of the species, and related the results to the data obtained in previous years. The outcome will support more efficient conservation strategies targeted at this species in the Ralska upland. Keywords: tesařík; ohrožený druh; populace; zpětné odchyty; mrtvé dřevo; longhorn beetle; endangered species; population; mark-recapture; dead wood Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Tesařík alpský (\kur{Rosalia alpina}) v Ralské pahorkatině

The Rosalia longicorn (Rosalia alpina; Linnaeus, 1758) is a protected saproxylic (deadwood-depending) beetle species. Thanks to its attractive colouring, it acts as an umbrella species important for ...

KOVÁŘOVÁ, Pavlína
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Časoprostorové využití lokality stádem zpětně šlechtěných praturů
JAKEŠOVÁ, Kristýna
2022 - Czech
Cílem této práce bylo sledovat chování zpětně šlechtěných praturů v přírodní rezervaci Milovice. Předmětem sledování byla zaprvé jejich denní aktivita a možné rozdíly mezi věkovými a pohlavními kohortami, zadruhé sezónní cykly a zatřetí využití dané lokality. Výsledky byly diskutovány s literaturou týkající se vyhynulých praturů a dosud žijícího divokého skotu. The aim of this thesis was to monitor the behaviour of the back-crossed aurochs in the nature reserve Milovice. The subject of monitoring was first their daily activity and the possible differences between age and sex groups, second the seasonal cycles and third the usage of the locality. Results were discussed with literature concerning the extinct aurochs and still-living wild cattle. Keywords: pratur; přírodní rezervace; Milovice; polodivoký chov; aurochs; nature reserve; Milovice; semi-wild cattle Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Časoprostorové využití lokality stádem zpětně šlechtěných praturů

Cílem této práce bylo sledovat chování zpětně šlechtěných praturů v přírodní rezervaci Milovice. Předmětem sledování byla zaprvé jejich denní aktivita a možné rozdíly mezi věkovými a pohlavními ...

JAKEŠOVÁ, Kristýna
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Calling Haplotypes from duplex sequencing data and its application: a case study with Erbb2 data
MOUKBEL ALI ALDAWLA, Shehab
2022 - English
Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Calling Haplotypes from duplex sequencing data and its application: a case study with Erbb2 data

MOUKBEL ALI ALDAWLA, Shehab
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Role of adenosine pathway on cell growth and stress response in Drosophila
MAAROUFI, Houda Ouns
2022 - English
The thesis surveyed the effects of the adenosine pathway on cell growth and stress response. We described the effects of mutation of the concentrative nucleoside transporter cnt1 on male fertility, particularly spermatogenesis, using a Drosophila melanogaster model. We also described the effects of the adenosine pathway on the cytotoxicity of mHTT. The thesis surveyed the effects of the adenosine pathway on cell growth and stress response. We described the effects of mutation of the concentrative nucleoside transporter cnt1 on male fertility, particularly spermatogenesis, using a Drosophila melanogaster model. We also described the effects of the adenosine pathway on the cytotoxicity of mHTT. Keywords: cell growth; stress response; cnt1; adenosine pathway; metabolism; mHTT Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Role of adenosine pathway on cell growth and stress response in Drosophila

The thesis surveyed the effects of the adenosine pathway on cell growth and stress response. We described the effects of mutation of the concentrative nucleoside transporter cnt1 on male fertility, ...

MAAROUFI, Houda Ouns
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Ecology of alpine plants at their uppermost limit in the Himalayas
CHLUMSKÁ, Zuzana
2022 - English
This dissertation studies the key abiotic factors and plant characteristics that influence the performance of the highest growing herbaceous alpine plants in Ladakh, Western Himalayas, and examines vegetation changes likely associated with climate change. The study site, located in the Rupshu region of eastern Ladakh, hosts some of the world´s highest-growing angiosperm plant species that occur above 6000 m a.s.l. The gentle slopes characteristic for the region, resulting in long elevational gradients, are particularly suitable for studying plant adaptations to the harsh dry and cold environment typical of whole Ladakh. The study presents novel insights into the causes of plant elevation limits and the direction of the vegetation shifts related to climate change at the very edge of the existence of angiosperms. Keywords: alpine plants; herbaceous plants; Western Himalayas; high elevation; elevational distribution limits; climate change; nonstructural carbohydrates Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Ecology of alpine plants at their uppermost limit in the Himalayas

This dissertation studies the key abiotic factors and plant characteristics that influence the performance of the highest growing herbaceous alpine plants in Ladakh, Western Himalayas, and examines ...

CHLUMSKÁ, Zuzana
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Návrh aplikace pro automatizovanou extrakci atributů produktů webů
CHVOSTOVÁ, Petra
2022 - Czech
Tato diplomová práce se zabývá takzvaným web scrapingem, specificky ukazuje možnou cestu, jak extrahovat data produktů z webu a webových stránek na zvoleném příkladu. Teoretická část se věnuje popisu webu a jeho zdrojového kódu. Aby bylo možné stahovat data, je nejdříve potřeba těmto informacím rozumět. Dále je představeno prostředí jazyka R a některé metody, které jsou následně využity v praktické části při extrakci webu. Praktická část obsahuje postupy (analýzu a návrh) pro tvorbu nástroje využívaného ke stažení. Z konkrétního e-shopu jsou stažena data, u kterých je zkontrolována jejich úspěšnost extrahování. Poslední část je věnována porovnání funkčnosti vytvořeného nástroje na jiném e-shopu. This thesis deals with the so-called web scraping, specifically showing a possible way to extract product data from the web and web pages on a chosen example. The theoretical part is devoted to the description of the website and its source code. In order to download data, you first need to understand these information. Next, the R language environment and some methods, which are subsequently used in the practical part during web extraction, are introduced. The practical part contains procedures (analysis and design) for the creation of the tool used for scraping. Data is downloaded from a specific e-shop, and its extraction success is checked. The last part is dedicated to comparing the functionality of the created tool on another e-shop. Keywords: web scraping; extrakce; RSelenium; dynamický web; atributy produktu; Web scraping; extraction; RSelenium; dynamic website; product attributes Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Návrh aplikace pro automatizovanou extrakci atributů produktů webů

Tato diplomová práce se zabývá takzvaným web scrapingem, specificky ukazuje možnou cestu, jak extrahovat data produktů z webu a webových stránek na zvoleném příkladu. Teoretická část se věnuje popisu ...

CHVOSTOVÁ, Petra
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Selected factors affecting species and genetic diversity of oribatid mites (Acari: Oribatida) in Central Europe
GALICOVÁ, Petra
2022 - Czech
V první části disertační práce jsme se zabývali vlivem přirozené disturbance a následně aplikovaného managementu (přirozená regenerace vs. asanační těžba) na společenstva pancířníků ve smrkovém lese v Národním parku Šumava. Z našich výsledků je patrné, že změny způsobené těžbou poškozených stromů po přírodní disturbanci jsou patrné i po více než 15ti letech, alespoň ve společenstvech pancířníků. Ve druhé části jsou představeny výsledky fylogeografické studie dvou příbuzných druhů pancířníků. Kromě toho, že byly zdokumentovány zcela rozdílné fylogeografické vzory v populacích těchto druhů napříč střední Evropou, byl také objeven jeden nový druh. Jeho morfologický popis a fylogenetické zařazení v rámci rodu je prezentováno ve třetí části práce. The first part of the thesis focused on the impact of natural disturbances and subsequent management practices (natural regeneration vs. clear cutting) on the oribatid mites in the montane Norway spruce forest in Šumava National Park (Czech Republic). Our results showed that changes caused by logging after a natural disturbance could be evident even more than 15 years later, at least in oribatid mite communities. The results of a phylogeographic study of two closely related species are presented in the second part. Except for revealing distinct phylogeographic patterns in the populations of these species across Europe, one new species was discovered, and its morphological and genetic description is provided. Keywords: oribatid mites; genetic diversity; spruce forest; COI; natural disturbances; oribatid mites; genetic diversity; spruce forest; COI; natural disturbances Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Selected factors affecting species and genetic diversity of oribatid mites (Acari: Oribatida) in Central Europe

V první části disertační práce jsme se zabývali vlivem přirozené disturbance a následně aplikovaného managementu (přirozená regenerace vs. asanační těžba) na společenstva pancířníků ve smrkovém lese v ...

GALICOVÁ, Petra
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Řízení zásob ve vybraném podniku
KORBELOVÁ, Eliška
2022 - Czech
První kapitola se zabývá charakteristikou a členěním zásob v účetnictví. Jedná se o pochopení významu zásob, co mezi zásoby patří, jakou plní funkci a jejich klasifikaci. Dále je popsáno oceňování a účtování zásob. Poslední kapitolou teoretické části je řízení zásob. Cílem je minimalizovat náklady na pořízení a skladování. V praktické části jsou základní informace a data o vybrané společnosti. Všechna data jsou poskytnutá jednatelem společnosti. Popisuje se účtování podniku, oceňování zásob a finanční analýza podniku. V této části je aplikována metoda ABC, kde se nakupované zásoby rozdělily do jednotlivých skupin. Poté je použit model EOQ zaměřený na položky ve skupině A. Zde se vypočítá optimální velikost dodávky, dodací cyklus a optimální počet dodávek za rok. V závěru práce je soupis zhodnocení systému řízení zásob ve vybraném podniku. Návrhy na změny jsou podloženy výpočty v praktické části. The first chapter deals with the characteristics and classification of inventories in accounting. It is an clarification of the meaning of inventories, what they are, what function they perform and their classification. The valuation and accounting of inventories are described below. The last chapter of the theoretical part further describes inventory management. The aim is to minimize the costs of acquisition and storage. In the practical part, there is basic information and data about the selected company. All data is provided by the company managing director. The accounting of the company, the valuation of inventories and the financial analysis of the company are described. The ABC method is applied in practical part, where the purchased inventories are divided into individual groups. Then the EOQ model is used on the specific items in group A. The optimal delivery size, delivery cycle and the optimal number of deliveries per year are calculated afterward. The end of the bachelor thesis describes a summary of the inventory management system evaluation. Proposals for changes are based on calculations from the practical part. Keywords: zásoby; řízení zásob; metoda ABC; model EOQ; optimální velikost dodávky; inventory; inventory management; ABC method; EOQ model; optimal delivery size Available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Řízení zásob ve vybraném podniku

První kapitola se zabývá charakteristikou a členěním zásob v účetnictví. Jedná se o pochopení významu zásob, co mezi zásoby patří, jakou plní funkci a jejich klasifikaci. Dále je popsáno oceňování a ...

KORBELOVÁ, Eliška
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

About project

NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web

Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz

Provider

http://www.techlib.cz

Facebook

Other bases