Genome sequences of two Antarctic strains of Pseudomonas prosekii: insights into adaptation to extreme conditions
SNOPKOVÁ, Kateřina
2021 - Czech Rod Pseudomonas obsahuje ubikvitní bakterie s vysokým biotechnologickým potenciálem. Nově popsaný druh Pseudomonas prosekii pochází ze vzorků získaných na ostrově Jamese Rosse v Antarktidě. Ačkoli lze předpokládat jeho endemismus, nebyly dosud popsány adaptační mechanismy zajišťující přežití baterie v extrémních podmínkách Antarktidy. Cílem páce bylo stanovit celogenomovou sekvenci dvou kmenů P. prosekii, genomy charakterizovat a dále se soustředit na geny související s adaptací na chlad a další stresové podmínky. V práci jsme identifikovali a analyzovali geny vázané na chladový šok a oxidační stres, osmoregulaci, produkci exopolysacharidů a sideroforů i geny související s tvorbu biofilmu. Srovnávací analýza P. prosekii a P. aeruginosa PAO1 vyzdvihla rozdíly v genomu extremofilního druhu a mezofilní oportunně patogenní bakterie. Pseudomonas is ubiquitous bacterial genus with the high biotechnological potential. Pseudomonas prosekii is species recently described from James Ross Island (Antarctica). Although its endemic lifestyle could be assumed, its low-temperature adaptation mechanisms have not yet been described and understood. Therefore, we sequenced two P. prosekii strains and performed deep genome analysis with a special respect to the genes related to cold adaptation. We identified and analyzed the genes responsible for cold shock and oxidative stress response, osmoregulation, exopolysaccharide and siderophores production, and biofilm formation. Comparative genome analysis of P. prosekii and P. aeruginosa PAO1 highlighted differences in genome content between extremophile species and a mesophilic opportunistic pathogen. Keywords: Pseudomonas prosekii; Antarktida; adaptace na chlad; analýza genomu; Pseudomonas prosekii; Antarctica; cold adaptation; genome-wide analysis Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Genome sequences of two Antarctic strains of Pseudomonas prosekii: insights into adaptation to extreme conditions

Rod Pseudomonas obsahuje ubikvitní bakterie s vysokým biotechnologickým potenciálem. Nově popsaný druh Pseudomonas prosekii pochází ze vzorků získaných na ostrově Jamese Rosse v Antarktidě. Ačkoli lze ...

SNOPKOVÁ, Kateřina
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2021

Diplomatické styky Československa a Svatého stolce v meziválečném období
ŠMÍD, Marek
2020 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Diplomatické styky Československa a Svatého stolce v meziválečném období

ŠMÍD, Marek
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2020

Ochrana člověka a společnosti - vývoj vzdělávání v bezpečnostních tématech
KAVAN, Štěpán
2020 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Ochrana člověka a společnosti - vývoj vzdělávání v bezpečnostních tématech

KAVAN, Štěpán
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2020

Totální syntéza [15N4] cytokininů a jejich využití
BUČEK, Jan
2020 - Czech Rostlinné hormony cytokininy (CK), jejich metabolity a deriváty jsou jedny z esenciálních molekul ovlivňující celou řadu fyzilogických procesů rostlin jako je buněčné dělení, rostlinný růst a vývoj. Jejich stanovení a kvantifikace je náročné díky velmi malým konecntracím a komplikované rostlinné matrici. Z toho důvody je použití stabilně značených analogů nezbytné pro kvantifikaci, metabolické profilovaní a sledování biosyntetických drah. Tato práce představuje totální syntézu jedenácti [15N]-zančených C6-purinových derivátů, z toho pěti aromatických (4, 5, 6, 7, 8) a šesti isopreniodních (9, 10, 11) CK. Největší optimalizace, vzheldem k momentáně dostupným metodám, byla provedena v případě 6-amino-9H-[15N5]-purinu (adenin, 1) and 6-chloro-9H-[15N4]-purinu (6-chloropurin, 3). Poprvé je tak prezentován komplexní postup syntézy isotopově značených CKs z anorganického prekurzoru s vysokými výtěžky a chemickou čistotou. Identita připravených molekul byla v každém kroku ověřena pomocí řady fyzikálně chemických metod (TLC; HRMS; HPLC-MS; 1H, 13C, 15N NMR). Zde popsaný postup je v nepsolední řadě možno aplikovat na přípravu jakýchkoliv [15N4]-značených C6-substituovaných purinových derivátů. Cytokinins (CKs) and their metabolites and derivatives are essential for cell division, plant growth regulation and development. They are typically found at minute concentrations in plant tissues containing very complicated biological matrices. Therefore, defined standards labelled with stable isotopes are required for precise metabolic profiling and quantification of CKs, as well as in vivo elucidation of CK biosynthesis in various plant species. In this work, eleven [15N]-labelled C6-purine derivatives were prepared, among them five aromatic (4, 5, 6, 7, 8) and three isoprenoid (9, 10, 11) CKs. Compared to current methods, optimized syntheses of 6-amino-9H-[15N5]-purine (adenine, 1) and 6-chloro-9H-[15N4]-purine (6-chloropurine, 3) were performed to achieve more effective, selective and generally easier approaches. The chemical identity and purity of prepared compounds were confirmed by physico-chemical analyses (TLC; HRMS; HPLC-MS; 1H, 13C, 15N NMR). The presented approach is applicable for the synthesis of any other desired [15N4]-labelled C6-substituted purine derivatives. Keywords: cytokininy; [15N4]cytokininy; syntéza; isotopové značení; rostlinné hormony; puriny; cytokinins; [15N4]-cytokinins; synthesis; isotopic labelling; plant hormones; purnes Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Totální syntéza [15N4] cytokininů a jejich využití

Rostlinné hormony cytokininy (CK), jejich metabolity a deriváty jsou jedny z esenciálních molekul ovlivňující celou řadu fyzilogických procesů rostlin jako je buněčné dělení, rostlinný růst a vývoj. ...

BUČEK, Jan
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2020

Inovace výuky fyziky na studijním oboru obchodní akademie s ohledem na specifika oboru
JANTAČ, František
2020 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Inovace výuky fyziky na studijním oboru obchodní akademie s ohledem na specifika oboru

JANTAČ, František
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2020

Komunikace, kontrola, důvěra?
JUNGE, Martin
2020 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Komunikace, kontrola, důvěra?

JUNGE, Martin
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2020

Obrazné a řečnické prostředky v barokních kázáních B. H. J. Bílovského
HIPSKÁ, Petra
2020 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Obrazné a řečnické prostředky v barokních kázáních B. H. J. Bílovského

HIPSKÁ, Petra
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2020

Experimentální infekce Encephalitozoon cuniculi získaná z fermentovaných masných výrobků
BRDÍČKOVÁ, Klára
2019 - Czech V této studii byla popsána prevalence a koncentrace spor Encephalitozoon cuniculi ve vepřovém mase. Navíc byl studován vliv fermentace klobás na životaschopnost a infekčnost E. cuniculi u imunodeficientních a imunokompetentních myši pomocí molekulárních metod In this study described the prevalence and concentration of Encephalitozoon cuniculi spores in pork meat. Moreover, the effect of sausage fermentation on E. cuniculi viability and infectivity for immunodeficient and immunocompetent mice was studied by molecular methods. Keywords: mikrosporidie; Encephalitozoon cuniculi; fermentace; microsporidia; Encephalitozoon cuniculi; fermantation Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Experimentální infekce Encephalitozoon cuniculi získaná z fermentovaných masných výrobků

V této studii byla popsána prevalence a koncentrace spor Encephalitozoon cuniculi ve vepřovém mase. Navíc byl studován vliv fermentace klobás na životaschopnost a infekčnost E. cuniculi u ...

BRDÍČKOVÁ, Klára
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2019

Touha žít
PRÍVARA, Michal
2019 - Czech Práce se věnuje problému bolesti a utrpení mladého člověka, které mu brání rozvíjet se nebo limitují touhu žít. S důrazem na mladého člověka vychází z psychologického uvedení do problematiky. Všímá si doprovodné skutečnosti v podobě strachu a úzkosti, ale také protipólů ve formě naděje a radosti. Současně se snaží hledat smysl těchto negativních skutečností a předkládá několik poznatků z logoterapie. Dále rozvíjí křesťanské perspektivy, které se týkají problému bolesti a utrpení mladého člověka zejména na podkladu Bible, apoštolského listu Salvifici Doloris. Nabízí pohled víry na naději a radost, ale neopomíjí možnost vzniku pochybností a vznik temných nocí. Dále popisuje význam modlitby a snaží se hledat cesty, aby mladý člověk mohl přijmout svůj život také s utrpením. Ukazuje církev jako společenství lásky zejména podle vzoru milosrdného Samaritána. Poukazuje na význam komunikace ? dialogu s mladým člověkem a autentický význam pocitu přijetí a velice důležitou a často opomíjenou funkci vztahu, kde mladý člověk cítí svou hodnotu a důležitost. Rovněž rozvíjí kvalitativní funkci vztahu v rámci poskytování pomoci nad rámec profese, kde se spíše ukazuje důležitost osobní povahy, kde tento mladý člověk může zpátky objevovat svou touhu žít navzdory limitujícím faktorům ve formě bolesti a utrpení. V závěru je popsaných několik kazuistik z praxe, kde je význam osobního vztahu popsán a hodnocen jako prospěšný, který může přinést potřebnou změnu a objevit hodnotu lidského života mladého člověka. The work deals with the problem of the pain and suffering of a young person that prevents him from developing his desire to live. The work is focused on the young person and it is based on the psychological introduction to the issue. It notices accompanying facts of suffer as fear and anxiety, but also its counterparts in the form of hope and joy. The work also seeks to search for the meaning of these negative facts and presents several knowledge from logo therapy. It further develops Christian perspectives that relate to the problem of the pain and suffering of a young person, especially on the basis of the Bible, the apostolic letter Salvifici Doloris. It offers a view of faith, hope and joy, but does not negate the possibility of doubt and dark nights. It further describes the value of prayer and seeks to find ways for the young man to accept his life also with suffering. It shows the Church as a community of love, especially according to the example of the merciful Samaritan. It points to the importance of communication - dialogue with a young person and authenticity of human acceptance that is a very important function of the relationship when the young person feels his value and importance. It also develops the qualitative function of the relationship based on providing help beyond the profession, thanks to which fact a young person can once again discover his desire to live despite the limiting factors in the form of pain and suffering. In the end, there are described several case studies in the work focused on the importance of personal relationships that can bring the necessary changes for young man and to discover the value of human life. Keywords: bolest; utrpení; mladý člověk; smysl utrpení; přijetí; modlitba; naděje; radost; víra; společenství lásky; psychologie; služba; pomoc; komunikace; vztah; pain; suffering; young person; the meaning of suffering; acceptance; prayer; hope; joy; faith; community of love; psychology; utility; help; communication; relationship. Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Touha žít

Práce se věnuje problému bolesti a utrpení mladého člověka, které mu brání rozvíjet se nebo limitují touhu žít. S důrazem na mladého člověka vychází z psychologického uvedení do problematiky. Všímá si ...

PRÍVARA, Michal
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2019

Historický vývoj a vegetační změny nivy dolního úseku řeky Labe
ROTTENBORN, Jan
2018 - Czech Práce je rozdělena na dvě hlavní části teoretickou a výzkumnou. V teoretické části rozebírá východiska pro studovanou problematiku. Především definuje říční nivu a širší prostor řeky a předkládá vývoj poznání procesů, kterou označujeme jako vývoj a dynamiku vegetace. Od teorií rostlinné sukcese po vegetační sukcesi s ohledem na výrazně disturbované prostředí. A také ukazuje, jak se jednostranný pohled na vliv řeky na vegetaci s poznáním měnil až po biogemorfní přístup, kdy všechny popisované složky jsou ve vzájemném vztahu. Dnes už nikoho nepřekvapí, že vegetace ovlivňuje i geomorfní procesy erozi, transport i sedimentaci, ale i tento pohled na problematiku prošel svým vývojem. V další části práce představuje sledované území a charakterizuje přírodní poměry, jako jsou geomorfologie, geologie, hydrologie a vybrané ekologické charakteristiky (potenciální vegetace, klima, fytocelonologie a fytogeografie). Také shrnuje veškerá dostupná botanická data území a seznamuje s historií a současností botanického výzkumu. V poslední teoretické části práce předkládá známé změny, ke kterým v říční nivě v poslední době (řádově století) došlo. Především se jedná o změny v režimu řeky projevující se změněnou oscilaci vodní hladiny, úpravy říčního koryta a nivy jako takové, znečištění a eutrofizace řeky, změnu druhové garnitury (vstup neofytů a rostlinné invaze) a změnu managementu nivy. Část výzkumná je členěna na čtyři oddíly, které odpovídají publikovaným nebo v brzké době publikovaným článkům. První shromažďuje veškerá dostupná data o historickém druhovém složení, porovnává je současným stavem a snaží se je dát do souvislosti se změnami, ke kterým v nivě došlo a dochází. Druhá (z mého pohledu klíčová) vychází z dlouhodobého sběru dat na trvalých monitorovacích plochách. Obrovské množství nashromážděných snímků (více než 700) obsahuje velké množství informací o aktuálním složení vegetace a umožňuje tak porovnávat meziroční změny, dávat je do souvislosti se změnami sledovaných abiotickými faktorů a odhalovat zákonitosti procesů, ke kterým na štěrkopískových dnech dochází. Třetí část se zabývá druhem Corrigiola litoralis drobnokvětem pobřežním, který, jak bylo již řečeno v úvodu, je druhem kriticky ohroženým a zároveň velmi charakteristickým pro zkoumaná společenstva. Tato část se pokouší pokud možno v co nejucelenější formě představit druh, jeho biologii, změny jeho populace a identifikovat možná ohrožení, ale také příležitosti. Čtvrtá, závěrečná část, se snaží ukázat jiné možnosti zkoumaní vegetačních změn. Využívá prostředků geografických informačních systémů. Představuje ukázky toho, jak se za relativně krátkou dobu říční tok v "málo regulované" části změnil a jak na to reaguje vegetace. Využívá jak historické mapové podklady, tak novodobé letecké měřičské snímky upravené na ortofota. This work has been divided into two main sections theoretical and research sections. The theoretical section focuses on the bases for the studied issue. It mainly defines a floodplain and wider space of a river and presents development of recognition of processes, which we refer to as vegetation development and dynamics. These range from the theory of plant succession to vegetation succession in view of the significantly distributed environment. And it also shows how a one-sided view of the effect of a river on vegetation with recognition changed only after the biogemorphic approach, when all described parts are mutually related. Today no one will be surprised that vegetation also influences geomorphic processes, such as erosion and sedimentation, and that this view of the issue has been through its own development. The next part of the work presents the monitored territory and characterises natural phenomena, such as geomorphology, geology, hydrology and selected environmental characteristics (potential vegetation, climate, phytocelonology and phytogeography). It also summarises all available botanical data regarding the territory and familiarises the reader with the history and current status of botanical research. The final part of the work presents known changes which have occurred in the floodplain in the recent period (over several centuries). These mainly include changes in the manifestation of the river, indicated by changed oscillation of the water level, adjustments to the river bed and floodplain as such, along with pollution and eutrophisation of the river, a change to generic class (entry of neophytes and plant invasion) and a change to floodplain management. The research section is divided into four parts, which correspond to published or soon-to-be-published articles. The first collects all available data about historical species composition, compares them with the current situation and tries to put them into context with the changes that have occurred and area occurring in the floodplain. The second (and from my point of view crucial) part is based on long-term collection of data at permanent monitoring points. A large number of collected images (more than 700) include a large amount of information about the current composition of vegetation and make it possible to compare year-to-year changes, put them into context with changes in monitored abiotic factors and estimate the frequency of the processes that occur on gravel days. The third part focuses on the Corrigiola litoralis, known by its common name strapwort, which, as has already been stated in the introduction, is a critically endangered species and is also very characteristic for the studied groups. This part attempts if possible to present in the most effective way this species, its biology and changes in its population and to identify potential threats as well as opportunities. The fourth final part attempts to show other options for examination of vegetation changes. It uses the resources of geographical information systems. It presents examples of how the river flow in a relatively short period of time in a "little regulated" part has changed and how vegetation reacts to it. It uses both historical map data and modern aerial shots adjusted to orthophotographs. Keywords: Říční tok; Cévnaté rostliny; Vegetační dynamika; Ohrožené druhy; Obnažená dna; River flow; Vascular plants; Vegetation dynamics; Endangered species; Emerged bottom Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Historický vývoj a vegetační změny nivy dolního úseku řeky Labe

Práce je rozdělena na dvě hlavní části teoretickou a výzkumnou. V teoretické části rozebírá východiska pro studovanou problematiku. Především definuje říční nivu a širší prostor řeky a předkládá ...

ROTTENBORN, Jan
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2018