Number of found documents: 30314
Published from to

Dynamika rezidenční diferenciace a segregace cizinců v metropolitních areálech Česka
Klsák, Adam; Ouředníček, Martin; Čermák, Zdeněk; Uherek, Zdeněk
2024 - Czech
Czechia has become a noteworthy case study of international migration within Central and Eastern Europe. With a steadily increasing inflow of international migrants, it is anticipated that their contribution to the societal and urban dynamics will become more pronounced. This influx has led to a rise in socio-economic and ethnic heterogeneity, reflected in spatial patterns where distinctive population groups are localized. The expe- riences from traditional immigration countries indicate that the voluntary concentration of foreigners into ethnic enclaves often serves as an intermediary phase in the integration process. However, it can also pose significant risks in situations where immigrants are not willing to participate in broader society or face exclusion. The primary goal of this dissertation is to enhance the comprehension of the spatial distribution of foreigners across selected Czech metropolitan areas and to explain the related phenomena on multiple scales within the urban hierarchy. The investigation seeks suitable data sources and methodological frameworks to analyze the current state, trajectory, determinants, and particularities of socio-spatial differentiation and segrega- tion. Furthermore, a significant focus lies in the nuanced and theoretically grounded interpretation of results,... Česko je v otázce mezinárodní migrace v kontextu střední a východní Evropy výz- namným fenoménem. Počet přicházejících cizinců kontinuálně roste a dá se očeká- vat, že poroste také jejich aktivní podíl na řadě procesů zásadně ovlivňujících naši společnost i sídla. Rostoucí socio-ekonomická i etnická rozmanitost populace se propisuje do prostoru, kde může docházet ke koncentraci různých skupin obyvatelstva. Zkušenosti z tradičních imigračních zemí ukazují, že dobrovolné shlukování přistěhovalců do etnick- ých enkláv bývá přechodným stupněm v integračním procesu, v případě nedobrovolnosti a exkluze však také může být výrazně rizikové. Hlavním cílem této dizertační práce je lépe porozumět distribuci cizinců ve vybraných českých metropolitních areálech a vysvětlit s ní spojené jevy na různých měřítkových úrovních sídelního systému. K zachycení stavu, vývoje, podmíněností a specifik socio- prostorové diferenciace a segregačních procesů se váže hledání vhodných datových zdrojů a metodických přístupů. Krom toho je kladen důraz i na kontextuálně a konceptuálně platnou interpretaci zjištěných výsledků, která v co největší míře přispěje k možnostem efektivního formování celostátních i místních agend ve vztahu k integraci cizinců. Snahou je tedy obohatit dosavadní vědecké poznatky v této oblasti a také... Keywords: rezidenční segregace; cizinci; migrace; metropolitní areály; urbánní geografie; Česko; residential segregation; foreigners; migration; metropolitan areas; urban geography; Czechia Available in a digital repository NRGL
Dynamika rezidenční diferenciace a segregace cizinců v metropolitních areálech Česka

Czechia has become a noteworthy case study of international migration within Central and Eastern Europe. With a steadily increasing inflow of international migrants, it is anticipated that their ...

Klsák, Adam; Ouředníček, Martin; Čermák, Zdeněk; Uherek, Zdeněk
Univerzita Karlova, 2024

Cenomanská vegetace české křídové pánve
Čepičková, Jana; Kvaček, Jiří; Teodoridis, Vasilis; Spicer, Robert A.
2024 - English
Cenomanian plant fossils from the Peruc-Korycany Formation of the Bohemian Cretaceous Basin, Czech Republic are described, analysed and their palaeoenvironment is interpreted. Cycad foliage Nilssonia mirovanae Čepičková et J.Kvaček including micromorphology of its cuticle was described. It shows deeply sunken stomatal apparati surrounded by papillae overhanging the stomatal pit. The haplocheilic stomata are arranged in rows. Todziaphyllum saportanum (Velen.) Čepičková et J.Kvaček is a serrate-margined leaf with semicraspedodromous venation. Since the cuticle of this plant fossil has not been preserved, macro-observation is the only method available. Ascarinophyllum pecinovense Čepičková et J.Kvaček is a serrate-margined leaf, having an abaxial cuticle covered by striations, randomly oriented, and radially oriented striations around the stomata. This species shows a combination of laterocytic/laterocyclocytic, stephanocytic-bicyclic, amphibrachyparacytic, less frequently brachyparacytic and holoparacytic stomata, sometimes with T-shaped thickenings of the internal cuticle at the poles. Papillaephyllum labutae Čepičková et J.Kvaček is characterised by leaves with serrate margins. It shows an abaxial cuticle covered by large papillae. Its stomatal apparatus shows a combination of latero-cyclocytic and... Disertační práce popisuje, analyzuje a interpretuje rostlinné fosílie paleoprostředí Bylo popsáno olistění cykasu druhu Čepičková et J.Kvaček včetně jeho kutikuly. Druh vykazuje hluboce zanořené průduchy obklopené papilami, které přečnívají přes stomatální dvůrek. Průduchy jsou haplocheilní a jsou uspořádány do pásů. (Velen.) Čepičková et J.Kvaček je zubatý list odromní žilnatinou. Z důvodu chybějící zachované kutikuly bylo možné pouze Čepičková et J.Kvaček je list se zubatým okrajem, jehož abaxiální kutikula je pokryta vráskováním. Toto vráskování je náhodně orientované, pouze kolem průduchů je uspořádané radiálně. je charakteristické kombinací několika druhů průduchů: laterocytními/laterocyklocytními, bicyklickými, amphibrachyparacytními, méně často brachyparacytními racytními. Průduchy v některých případech mají z vnitřní strany na pólech ztluštěniny ve tvaru "T". Čepičková et J.Kvaček je list se zubatým okrajem. Vnější strana abaxiální kutikuly je velmi hustě pokryta velkými papilami. Průduchy Pro zjišťování míry stresu z nedostatku sladké vody byla použita mikromorfologie kutikuly a izotopový signál rostlinných fosílií (δ13C v n C29). Z lomu Pecínov byly k analýze použ U5. Na základě paleobotanických, palynologických, paleoprostředí a rostlinná společenstva perucké flóry: Vegetace slaných marší,... Keywords: Perucko-korycanské souvrství; angiospermy; gymnospermy; kutikulární analýza; paleokelogie; Peruc-Korycany Formation; angiosperms; gymnosperms; cuticle analysis; palaeoecology Available in a digital repository NRGL
Cenomanská vegetace české křídové pánve

Cenomanian plant fossils from the Peruc-Korycany Formation of the Bohemian Cretaceous Basin, Czech Republic are described, analysed and their palaeoenvironment is interpreted. Cycad foliage Nilssonia ...

Čepičková, Jana; Kvaček, Jiří; Teodoridis, Vasilis; Spicer, Robert A.
Univerzita Karlova, 2024

Odezva letokruhů a NDVI středoevropských jehličnanů na extrémní klimatické události
Mašek, Jiří; Treml, Václav; Šilhán, Karel; Piermattei, Alma
2024 - English
Terrestrial ecosystems, mainly forests are important sinks of atmospheric carbon with high year-to-year variability driven by moisture availability. Trees store carbon in various compartments of the biomass, namely in stems, roots, and leaves. In this doctoral thesis, I investigated climate-growth responses of stem biomass (represented by tree rings) and leaf biomass (represented by normalized difference vegetation index; NDVI) of Pinus sylvestris and Picea abies in temperate forests of Czechia. I was interested in (i) general climate-growth responses and specifically, in reactions to drought and (ii) topographical factors influencing these responses at various spatial scales. We demonstrated that climate-growth responses of both species' tree rings in the lowlands revealed a significant positive and negative influence of moisture and temperature, respectively, while in higher elevations the responses were opposite. At a landscape level, the topography of relief modulated responses of Pinus sylvestris tree rings, while at the large-scale level, the geographical position and elevation (temperature gradients) were the main factors for both species. Responses of NDVI were slightly weaker compared to tree rings and did not show the influence of topography at any scale probably because vegetation... Terestrické ekosystémy, především lesy jsou důležitým úložištěm atmosférického uhliku s vysokou meziroční variabilitou řízenou dostupností vody. Stromy ukládají uhlík v různých částech nadzemní i podzemní biomasy, hlavně ve kmeni, listech a kořenech. V této dizertační práci jsem studoval klimatické reakce růstu kmenové biomasy (reprezentované letokruhy) a listové biomasy (reprezentované normalizovaným diferenčním vegetačním indexem; NDVI) u smrku ztepilého (Picea abies) a borovice lesní (Pinus sylvestris). Zabýval jsem se (i) všeobecnými klimatickými reakcemi, specificky pak dopady suchých událostí a (ii) topografickými faktory, které tyto rekace ovlivňují na různých prostorových úrovních. Výsledky ukázaly, že letokruhy obou druhů v nížinách vykazují signifikantní pozitivní vztah k dostupné vlhkosti a negativní k teplotám, zatímco ve vysokých nadmořských výškách byl tento vztah obrácený. Na krajinné úrovni byla reakce letokruhů borovice lesní ovlivněna topografií reliéfu, zatímco ve větším měřítku byla podstatná geografická pozice a nadmořská výška (gradienty teploty) u obou druhů. Reakce NDVI byla oproti letokruhům slabší. NDVI navíc nevykázalo jakékoli ovlivnění topografií, pravděpodobně, protože zelenost vegetace (fotosyntéza) je méně klimaticky závislá oproti růstu kmenové biomasy. Koherence... Keywords: borovice lesní; smrk ztepilý; letokruhy; NDVI; odezvy na sucho; topografie; Pinus sylvestris; Picea abies; tree rings; NDVI; drought responses; topography Available in a digital repository NRGL
Odezva letokruhů a NDVI středoevropských jehličnanů na extrémní klimatické události

Terrestrial ecosystems, mainly forests are important sinks of atmospheric carbon with high year-to-year variability driven by moisture availability. Trees store carbon in various compartments of the ...

Mašek, Jiří; Treml, Václav; Šilhán, Karel; Piermattei, Alma
Univerzita Karlova, 2024

Studie ještěrky zelené, Lacerta viridis, a ekologicky provázaných druhů plazů v České republice
Chmelař, Jan; Rehák, Ivan; Vojar, Jiří; Moravec, Jiří
2024 - Czech
The European green lizard, Lacerta viridis (Laurenti, 1768), is protected in the Czech Republic as critically endangered. Its distribution in the Bohemia region is restricted to small isolated local populations which are located beyond the northern border of continuous range of the species and are closely related to very specific biotopes. We analysed the distribution of the species both on a national and microhabitat scale and created a predictive model of the species distribution. The most relevant factors influencing the species distribution in the Czech Republic were: annual precipitation, terrain slope, average temperature of the warmest quarter and precipitation in the coldest quarter. On the microhabitat level, individuals selected their immediate vicinity with respect to elevated stones/tree stumps, shelter availability and a proximity to shrubs. Places with high percentage of grass and high vegetation were not preferred. Furthermore, we analysed distribution of selected reptile species ecologically interconnected with Lacerta viridis and identified their preferred habitats. We selected the dice snake, Natrix tessellata, the sand lizard, Lacerta agilis and the smooth snake, Coronella austriaca. All created models are compatible with published data and are applicable in both theory and... Ještěrka zelená Lacerta viridis (Laurenti, 1768) je v ČR legislativně chráněna jako kriticky ohrožená. Její rozšíření na území Čech je omezeno na malé izolované lokální populace, které se nacházejí za severní hranicí souvislého areálu výskytu druhu a jsou úzce spjaty s velmi specifickými biotopy. Analyzovali jsme distribuci druhů jak v celostátním měřítku, tak v měřítku mikrostanovišť a vytvořili prediktivní model rozšíření druhů. Nejrelevantnějšími faktory ovlivňujícími rozšíření druhu v ČR byly: roční srážky, sklon terénu, průměrná teplota nejteplejšího čtvrtletí a srážky v nejchladnějším čtvrtletí. Na úrovni mikrostanovišť si jedinci vybírali své bezprostřední okolí podle blízkosti vyvýšených kamenů/pařezů, dostupnosti úkrytů a blízkosti keřů. Nebyla preferována místa s vysokým procentem trávy a vysokou vegetací. Dále jsme analyzovali rozšíření vybraných druhů plazů ekologicky propojených s Lacerta viridis a identifikovali jejich preferovaná stanoviště. Pro tyto analýzy jsme vybrali užovku podplamatou, Natrix tessellata, ještěrku obecnou, Lacerta agilis a užovku hladkou, Coronella austriaca. Všechny vytvořené modely jsou kompatibilní s publikovanými daty a jsou použitelné v teorii i praxi ochrany vybraných druhů. Klíčová slova: Squamata, Lacertidae, říční fenomén, druhová ochrana, management... Keywords: Squamata; Lacertidae; říční fenomén; druhová ochrana; management habitatů; klimatická změna; distribuční modelování; Squamata; Lacertidae; river phenomenon; species conservation; habitat management; climatic change; distribution modelling Available in a digital repository NRGL
Studie ještěrky zelené, Lacerta viridis, a ekologicky provázaných druhů plazů v České republice

The European green lizard, Lacerta viridis (Laurenti, 1768), is protected in the Czech Republic as critically endangered. Its distribution in the Bohemia region is restricted to small isolated local ...

Chmelař, Jan; Rehák, Ivan; Vojar, Jiří; Moravec, Jiří
Univerzita Karlova, 2024

Tukové emulze v dlouhodobé parenterální výživě
Ševela, Stanislav; Novák, František; Cahová, Monika; Lahoda Brodská, Helena
2024 - Czech
The combination of intestinal failure and parenteral nutrition is a condition associated with mild chronic inflammation and organ injury, the most significant of which is hepatic injury. This crossover-controlled trial investigated the effects of different intravenous lipid emulsions (IVLE) enriched with increased doses of omega-3 polyunsaturated fatty acids (n-3 PUFA) from fish oil (FO) in patients on home parenteral nutrition (HPNP) for chronic intestinal failure. Twelve patients were consecutively given three different IVLEs, with an FO emulsion added after each IVLE. The study also included twelve paired healthy controls for comparison. The aim of this study was to investigate how long-term administration of these IVLEs affected primarily the erythrocyte and plasma fatty acid (FA) spectrum, as well as the inflammatory response, antioxidant status, markers of liver function and bile acid spectrum in HPNP, and how these changes differed from healthy subjects. We demonstrated successful incorporation of n-3 PUFA into erythrocyte phospholipids and corresponding changes in the plasma FA spectrum, characterized in particular by significant increases in n-3 versus n-6 PUFA, with a decrease in the n-6/n-3 PUFA ratio. We also found a more prolonged effect on these changes with high dose FO... Kombinace intestinálního selhání a parenterální výživy je stavem spojeným s mírným chronickým zánětem a orgánovým poškozením, z nichž nejvýznamnější je poškození jaterní. Tato zkřížená intervenční studie zkoumala účinky různých intravenózních lipidových emulzí (IVLE) obohacených o zvýšené dávky omega-3 polynenasycených mastných kyselin (n-3 PUFA) z rybího oleje (RO) u pacientů na domácí parenterální výživě (DPVP) pro chronické intestinální selhání. Dvanácti pacientům byly postupně podávány tři různé IVLE, po každé z nich ještě přidána emulze RO. Studie rovněž zahrnovala dvanáct párovaných zdravých kontrol ke srovnání. Cílem této studie bylo zjistit, jak dlouhodobé podávání těchto IVLE ovlivnilo primárně spektrum mastných kyselin (MK) v erytrocytech a plazmě, dále pak zánětlivou odpověď, antioxidační stav, markery jaterních funkcí a spektrum žlučových kyselin u DPVP a jak se tyto změny lišily od zdravých osob. Prokázali jsme úspěšnou inkorporaci n-3 PUFA do erytrocytárních fosfolipidů a odpovídající změny spektra plazmatických MK, charakterizované zejména signifikantní nárůsty n-3 vůči n-6 PUFA, s poklesem poměru n-6/n-3 PUFA. Zjistili jsme také dlouhodobější ovlivnění těchto změn při vysoké dávce podávaného RO. Konstatujeme zvýšené koncentrace cytokinů v séru a in vitro lipopolysacharidem (LPS)... Keywords: domácí parenterální výživa; lipidové emulze; omega-3 mastné kyseliny; intestinální selhání; cytokiny; zánět; oxidační stres; antioxidační enzymy; superoxid dismutáza 1; hepatopatie asociovaná s intestinálním selhání; fibroblastový růstový faktor 19; Home parenteral nutrition; lipid emulsions; omega-3 fatty acids; intestinal failure; cytokines; inflammation; oxidative stress; antioxidant enzymes; superoxide dismutase 1; intestinal failure associated liver disease; fibroblast growth factor 19 Available in a digital repository NRGL
Tukové emulze v dlouhodobé parenterální výživě

The combination of intestinal failure and parenteral nutrition is a condition associated with mild chronic inflammation and organ injury, the most significant of which is hepatic injury. This ...

Ševela, Stanislav; Novák, František; Cahová, Monika; Lahoda Brodská, Helena
Univerzita Karlova, 2024

Mediace v České republice
Jaroš, Jan; Macková, Alena; Zahradníková, Radka; Dörfl, Luboš
2024 - Czech
DISERTAČNÍ PRÁCE V ANGLICKÉM JAZYCE Mediation in the Czech Republic A doctoral thesis represents an evaluation of the fulfillment of the legislator's predicted objectives and expectations placed into the adopted legislation of mediation after ten years of its effectiveness in the legal system of the Czech Republic. The text is divided into thirteen chapters, which gradually address the main topics related to the new civil law regulation of mediation. The first chapter briefly describes the development and existing mediation regulation in the Czech Republic. Next, there are identified the main points of research interest, which are elaborated in more detail in the following chapters. The attention is successively paid to the topics of (i) the duplex legal regulation of mediation, (ii) the performance of mediation outside the framework of the Mediation Act, (iii) the presumed benefits and guarantees associated with mediation under the Mediation Act, (iv) confidentiality of the subjects involved in mediation, (v) the remuneration and reimbursement of the mediator's expenses, (vi) prerequisites for the registered mediator profession, (vii) special legislation for mediator-attorneys, (ix) regulation of the first ordered meeting with a registered mediator, (x) the statute of limitations, (xi) direct... DISERTAČNÍ PRÁCE V ČESKÉM JAZYCE Mediace v České republice Práce je bilancí o naplnění zákonodárcem předpokládaných cílů a očekávání vkládaných do přijímané právní úpravy mediace po deseti letech její účinnosti v právním řádu České republiky. Text je dělen do třinácti kapitol, které se postupně věnují hlavním tématům spojeným s novou civilně-právní úpravou mediace. V první kapitole je stručně popsán vývoj a stávající mediační regulace v ČR. Dále jsou zde identifikovaný hlavní body výzkumného zájmu, které jsou podrobněji rozpracovány v následujících kapitolách. Takto je postupně věnována pozornost tématům (i) dvoukolejnosti právní úpravy mediace, (ii) výkonu mediace mimo rámec zákona o mediaci, (iii) předpokládaným výhodám a garancím spojeným s mediací dle zákona o mediaci, (iv) mlčenlivosti subjektů zúčastněných na mediaci, (v) odměně a náhradám nákladů mediátora, (vi) předpokladům pro výkon činnosti mediátora, (vii) zvláštní úpravě mediace pro mediátory-advokáty, (ix) regulaci prvního nařízeného setkání se zapsaným mediátorem, (x) stavení promlčení, (xi) přímé vykonatelnosti mediačních dohod, a (xii) regulaci mediace v civilním řízení v ČR a zahraničí. V jednotlivých kapitolách jsou předestřena očekávání zákonodárce a navazující názory vzešlé z desíti let odborné diskuse. Následují vlastní závěry... Keywords: mediace; alternativní řešení sporů; procedurální spravedlnost; mediation; alternative dispute resolution; procedural justice Available in a digital repository NRGL
Mediace v České republice

DISERTAČNÍ PRÁCE V ANGLICKÉM JAZYCE Mediation in the Czech Republic A doctoral thesis represents an evaluation of the fulfillment of the legislator's predicted objectives and expectations placed into ...

Jaroš, Jan; Macková, Alena; Zahradníková, Radka; Dörfl, Luboš
Univerzita Karlova, 2024

Klasifikace globálních environmentálních systémů dle stupně antropogenní transformace
Hrdina, Aleš; Romportl, Dušan; Boltižiar, Martin; Václavík, Tomáš
2024 - English
The topic of the doctoral thesis is the development of a comprehensive classification of global environmental systems based on a geographical synthesis of abiotic, biotic and anthropogenic factors. The dramatic changes in the Earth's natural environment, the noticeable loss of biodiversity and the increasing impact of human activity in many different aspects raise the need for a comprehensive classification that provides an appropriate spatial framework for assessing the impacts of these changes. Several global classifications have been developed in the past, but most of them only work with various natural environmental gradients (especially climate or relief). However, most regions of the world have been so fundamentally affected or even completely transformed by human activity that the omission of anthropogenic factors in comprehensive environmental classifications may lead to erroneous conclusions. For this reason, new global environmental classifications have recently begun to emerge abroad that attempt to deal with anthropogenic changes to the natural environment and include them in a comprehensive assessment. The proposal of a methodology and the actual creation of the classification of global environmental systems based on abiotic gradients, biodiversity distribution and spatial... Tématem disertační práce je vytvoření komplexní klasifikace globálních environmentálních systémů založených na geografické syntéze abiotických, biotických i antropogenních faktorů. Zásadní změny přírodního prostředí Země, znatelný úbytek biodiverzity a v mnoha různých ohledech stále rostoucí vliv člověka vyvolávají potřebu vytvořit komplexní klasifikaci, která bude vhodným prostorovým rámcem pro vyhodnocování dopadů těchto změn. V minulosti vznikla celá řada globálních klasifikací, které však většinou pracují jen s různými přírodními gradienty prostředí (zejména klima či reliéf). Většina regionů světa je však natolik zásadně ovlivněna nebo dokonce zcela přeměněna činností člověka, že opomenutí antropogenních faktorů v komplexních klasifikacích prostředí může vést k mylným závěrům. Z tohoto důvodu v nedávné době začaly v zahraničí vznikat nové globální environmentální klasifikace, které se snaží s antropogenními změnami přírodního prostředí pracovat a zahrnout je do komplexního hodnocení. Návrh metodiky a vlastní vytvoření klasifikace globálních environmentálních systémů, která je založena na abiotických gradientech, distribuci biodiverzity a prostorové diferenciaci vlivu člověka, je hlavním cílem předložené práce. Klasifikace vychází z 22 datasetů charakterizujících abiotické, biotické a... Keywords: Klasifikace; antropogenní transformace; globální environmentální systémy; Classification; anthropogenic transformation; global environmental systems Available in a digital repository NRGL
Klasifikace globálních environmentálních systémů dle stupně antropogenní transformace

The topic of the doctoral thesis is the development of a comprehensive classification of global environmental systems based on a geographical synthesis of abiotic, biotic and anthropogenic factors. ...

Hrdina, Aleš; Romportl, Dušan; Boltižiar, Martin; Václavík, Tomáš
Univerzita Karlova, 2024

Molekulární příčiny a mechanismy dědičných cholestáz a statiny indukované myopatie
Neřoldová, Magdaléna; Jirsa, Milan; Dvořáková, Lenka; Bronský, Jiří
2024 - Czech
The discovery of the molecular basis of Rotor syndrome consisting in biallelic inactivating mutations in both SLCO1B1 and SLCO1B3 genes encoding hepatic transporters OATP1B1 and OATP1B3, together with the previously described association of the rs4149056 variant in OATP1B1 with statin-induced myopathy (SM), led us to hypothesis that private variants in OATP1B1 and OATP1B3 confer predisposition to SM. This hypothesis was not supported by our study of 88 patients in whom exome sequencing was performed. Interestingly, we detected candidate variants in several genes mutated in recessively inherited muscle disorders, namely CLCN1, whose carriage may predispose to SM. Pathogenic variants in several dozens of causative genes underlie hereditary cholestasis. We performed exome sequencing in 51 unexplained cases and revealed several unexpected diagnoses such as autosomal recessive polycystic polyposis, cutaneous porphyria or nephronophthisis. The most remarkable finding was that of yet unreported F11R deficiency due to a homozygous splice mutation found simultaneously in an index patient suffering from liver cirrhosis and her healthy sister. The F11R protein is involved in formation of tight intercellular junctions and mutations in F11r predispose to liver failure in mice. The finding of bialellic variants... Objev molekulární podstaty Rotorova syndromu spočívající v současné bialelické inaktivaci obou genů SLCO1B1 a SLCO1B3 kódujících jaterní transportéry OATP1B1 a OATP1B3 a již dříve popsaná asociace varianty rs4149056 v OATP1B1 se statiny indukovanou myopatii (SM) nás přivedly k hypotéze, že privátní varianty v OATP1B1 a OATP1B3 mohou přispívat k dědičné predispozici k SM. Tato hypotéza se v naší studii 88 nemocných, u kterých jsme provedli exomové sekvenování, nepotvrdila. Zajímavý byl nález variant v několika genech pro recesivně dědičná svalová onemocnění, především CLCN1, jejichž nosičství může při vzniku SM sehrát významnou úlohu. U cholestázy s dědičnou příčinou je známo několik desítek kauzálních genů. U 51 neobjasněných případů jsme provedli exomové sekvenování, kdy nálezem bylo několik neočekávaných diagnóz - autozomálně recesivní polycystóza, kožní porfyrie či nefronoftíza. Pozoruhodný byl nález dosud nepopsaného deficitu v genu F11R podmíněného homozygotní sestřihovou mutací v genu F11R u probandky s jaterní cirhózou a její zdravé sestry. Protein F11R se účastní vzniku těsných mezibuněčných spojení, deficit v genu F11r u myší predisponuje k postižení jater. Zásadním nálezem byly varianty v genu IFT172 asociovaném s fenotypově variabilní ciliopatií, které jsme nalezli u dvou nemocných s... Keywords: celoexomové sekvenování; statinová myopatie; cholestáza; CLCN1; IFT172; whole exom sequencing; statin myopathy; cholestasis; CLCN1; IFT172 Available in a digital repository NRGL
Molekulární příčiny a mechanismy dědičných cholestáz a statiny indukované myopatie

The discovery of the molecular basis of Rotor syndrome consisting in biallelic inactivating mutations in both SLCO1B1 and SLCO1B3 genes encoding hepatic transporters OATP1B1 and OATP1B3, together with ...

Neřoldová, Magdaléna; Jirsa, Milan; Dvořáková, Lenka; Bronský, Jiří
Univerzita Karlova, 2024

Kombinatorika, teorie grup, výpočetní složitost a topologie
Skotnica, Michael; Tancer, Martin; Hachimori, Masahiro; Bauer, Ulrich
2024 - English
In this thesis, we present new results related to combinatorial properties of topo- logical spaces given by abstract simplicial complexes, their relations and computational complexity. First, we generalize a result of Hachimori on relations between shellability and col- lapsibility which are important combinatorial properties of simplicial complexes. Next, we study the computational complexity of the PL geometric category of 2- dimensional polyhedra introduced by Borghini which is a combinatorial notion providing a natural upper bound for the Lusternik-Schnirelmann category. For 2-dimensional poly- hedra it can be equal to 1, 2 or 3. While it is easy to decide whether the PL geometric category of a 2-dimensional polyhedron is equal 1, we show that it is NP-hard to decide whether this category is at most 2. Finally, we show that computing the rank of higher homotopy groups of a simply connected topological space is #W[2]-hard using a problem called VEST, given by Anick, as an intermediate problem. We also establish results for the decision version of VEST and for its variants as self-contained problems. For most of them we show W[1]- or W[2]-hardness. 1 V této práci prezentujeme nové výsledky týkající se kombinatorických vlastností topo- logických prostorů zadaných pomocí abstraktních simpliciálních komplexů, jejich vztahy a výpočetní složitost. Nejprve zobecníme Hachimoriho výsledek ohledně vztahů mezi shellovatelností a ko- labovatelností, což jsou důležité kombinatorické vlastnosti simpliciálních komplexů. Dále se zabýváme výpočetní složitostí PL geometrické kategorie dvourozměrných mno- hostěnů definované Borghinim. To je kombinatorický pojem, který zároveň dává přirozený horní odhad pro Lusternik-Schnirelmannovu kategorii. Pro dvourozměrné mnohostěny může být tato kategorie rovna 1, 2, nebo 3. Zatímco je snadné rozhodnout, zda je PL geometrická kategorie dvourozměrného mnohostěnu rovna 1, ukážeme, že rozhodnout, zda je tato kategorie nejvýše 2, je NP-těžké. Nakonec ukážeme, že počítání ranku vyšších homotopických grup 1-souvislého topolo- gického prostoru je #W[2]-těžké, pomocí problému zvaného VEST definovaného Anickem jakožto pomocného problému. Prezentujeme také výsledky pro rozhodovací verzi VEST a její varianty. U většiny z nich dokážeme W[1]- nebo W[2]-těžkost. 1 Keywords: simpliciální komplex|kolabovatelnost|shellovatelnost|výpočetní složitost|homotopické grupy; simplicial complex|collapsibility|shellability|computational complexity|homotopy groups Available in a digital repository NRGL
Kombinatorika, teorie grup, výpočetní složitost a topologie

In this thesis, we present new results related to combinatorial properties of topo- logical spaces given by abstract simplicial complexes, their relations and computational complexity. First, we ...

Skotnica, Michael; Tancer, Martin; Hachimori, Masahiro; Bauer, Ulrich
Univerzita Karlova, 2024

Inhibice TET-1 proteinu pomocí chelátorů železa
Antonyová, Veronika; Jakubek, Milan; Mikula, Ivan; Gumulec, Jaromír
2024 - English
EN The objective of this work was to study novel synthetic iron chelators and to study their potential use in inhibition of TET1 (ten-eleven translocation methylcytosine dioxygenase 1) protein. Epigenetic mechanisms, such as hydroxymethylation of DNA, are promising target in many serious pathologies, including oncological disorders. In the presented study, we intended to discover novel inhibitors by screening small libraries of heterocyclic molecules, such as pyrrolo[3,2-b]pyrrole derivatives with hydrazide (compound 1) or hydrazone (compound 2-6) iron-binding group and hydrazone-based iron chelators (compound 7-10). Within the scope of this study, we used various analytical and biochemical techniques for the purpose of characterization of novel cancer therapies based on TET1 protein inhibition. The absorbance and the complexation of tested compounds with Fe(II) ions was studied by UV-Vis spectroscopy. Inhibition of TET1 protein was studied by fluorometric assay based on ELISA and further supported by microscale thermoporesis and in silico docking. The cytotoxicity of compounds on cancer cell lines was measured by MTT assay and intracellular distribution was determined by live-cell imaging. This study presents a biochemical analysis of potential TET1 protein inhibitors and brings significant... SK Cieľom tejto práce bolo študovať nové syntetické chelátory železa a študovať ich potenciálne využitie pri inhibícii proteínu TET1. Epigenetické mechanizmy, ako je hydroxymetylácia DNA, sú sľubným cieľom pri mnohých závažných patológiách, vrátane onkologických ochorení. V tejto štúdii sme zamýšľali objaviť nové inhibítory skríningom malých knižníc heterocyklických molekúl, ako sú pyrolo[3,2-b]pyrolové deriváty s hydrazidovou (molekula 1) alebo hydrazónovou (molekuly 2-6) skupinou viažúcou železo a chelátory železa na báze hydrazónu (molekuly 7-10). V rámci tejto štúdie sme použili rôzne analytické a biochemické techniky na účely charakterizácie nových terapií rakoviny založených na inhibícii TET1 proteínu. Absorbancia a komplexácia testovaných zlúčenín s iónmi Fe(II) bola študovaná UV- Vis spektroskopiou. Inhibícia TET1 proteínu bola študovaná fluorometrickým testom na báze ELISA a ďalej podporená termoporézou v mikromeradle a in silico dokovaním. Cytotoxicita testovaných molekúl na rakovinových bunkových líniách bola meraná testom MTT a intracelulárna distribúcia bola stanovená zobrazovaním živých buniek. Táto štúdia predstavuje biochemickú analýzu potenciálnych inhibítorov TET1 proteínu a prináša významné poznatky, ktoré by mohli viesť k objavu inovatívnej protirakovinovej liečby založenej na... Keywords: inhibítor TET1 proteínu; hydrazid; hydrazón; chelátory železa; epigenetika; protirakovinová terapia; TET1 protein inhibitor; hydrazide; hydrazone; Fe(II) chelators; epigenetics; anticancer therapy Available in a digital repository NRGL
Inhibice TET-1 proteinu pomocí chelátorů železa

EN The objective of this work was to study novel synthetic iron chelators and to study their potential use in inhibition of TET1 (ten-eleven translocation methylcytosine dioxygenase 1) protein. ...

Antonyová, Veronika; Jakubek, Milan; Mikula, Ivan; Gumulec, Jaromír
Univerzita Karlova, 2024

About project

NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web

Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz

Provider

http://www.techlib.cz

Facebook

Other bases