Systematické zhodnocení nálezů fosilních dřev z oblasti oherského riftu se zaměřením na vulkanická tělesa Českého středohoří a Doupovských hor
Koutecký, Vít; Sakala, Jakub; Gryc, Vladimír; Klusek, Marzena
2024 - English The present thesis is conceived as a commentary to the attached publications and represents several years of study of the fossil woods from the volcanic rocks of the České středohoří and Doupovské hory Mts. (Paleogene, Czech Republic). A brief introduction to the subject is followed by an overview of the used methods, a short geological setting and the history of fossil wood research in the study area. The results are presented by individual localities, where the description of the locality is followed by a systematic evaluation of the fossil woods. In the studied fossil wood material, there are 3 conifers from 2 families: Glyptostroboxylon rudolphii, Taxodioxylon gypsaceum (both Cupressaceae s.l.) and Pinuxylon parryoides (Pinaceae) and 17 angiosperms from 9 families: Cinnamomoxylon seemanianum (Lauraceae), Platanoxylon bohemicum, Platanoxylon sp. (both Platanaceae), Ulmoxylon marchesonii, Ulmoxylon cf. kersonianum, ?Ulmoxylon sp. (all Ulmaceae), Quercoxylon böckhianum, Castanoxylon bavaricum, Lithocarpoxylon sp. (all Fagaceae), Eucaryoxylon crystallophorum (Juglandaceae), Alnus tschemrylica (Betulaceae), Grewioxylon ortenburgense, cf. Grewioxylon ortenburgense (both Malvaceae s.l.), Paradiospyroxylon kvacekii (Ebenaceae), Fraxinoxylon cf. prambachense (Oleaceae) and two indeterminable samples... Předkládaná práce je koncipována jako pojednání k souboru přiložených vědeckých publikací a představuje výsledek několikaletého výzkumu fosilních dřev pocházejících z vulkanických hornin paleogénu Českého středohoří a Doupovských hor. Po krátkém uvedení do problematiky následuje seznámení s použitou metodikou, stručnou geologickou charakteristikou a historií výzkumu fosilních dřev zájmové oblasti. Výsledky jsou prezentovány dle jednotlivých lokalit, kdy za obecnou charakteristikou lokality následuje systematické zhodnocení fosilních dřev. Ve studovaném materiálu se podařilo identifikovat dřeva 3 jehličnanů ze 2 čeledí: Glyptostroboxylon rudolphii, Taxodioxylon gypsaceum (oba Cupressaceae s.l.) a Pinuxylon parryoides (Pinaceae) a 17 listnáčů z 9 čeledí: Cinnamomoxylon seemanianum (Lauraceae), Platanoxylon bohemicum, Platanoxylon sp. (oba Platanaceae), Ulmoxylon marchesonii, Ulmoxylon cf. kersonianum, ?Ulmoxylon sp. (všechny Ulmaceae), Quercoxylon böckhianum, Castanoxylon bavaricum, Lithocarpoxylon sp. (všechny Fagaceae), Eucaryoxylon crystallophorum (Juglandaceae), Alnus tschemrylica (Betulaceae), Grewioxylon ortenburgense, cf. Grewioxylon ortenburgense (oba Malvaceae s.l.), Paradiospyroxylon kvacekii (Ebenaceae), Fraxinoxylon cf. prambachense (Oleaceae) a dva neidentifikovatelné vzorky označené... Available in a digital repository NRGL Systematické zhodnocení nálezů fosilních dřev z oblasti oherského riftu se zaměřením na vulkanická tělesa Českého středohoří a Doupovských hor

The present thesis is conceived as a commentary to the attached publications and represents several years of study of the fossil woods from the volcanic rocks of the České středohoří and Doupovské ...

Koutecký, Vít; Sakala, Jakub; Gryc, Vladimír; Klusek, Marzena
Univerzita Karlova, 2024

Paleoekologické aspekty a evoluce ústřičných asociací pozdní křídy
Rantuch, Jakub; Košťák, Martin; Mergl, Michal; Reháková, Daniela
2024 - English The presented thesis explores the palaeoecological aspects of the evolution of the well-known fossil oyster genus Rhynchostreon Bayle, 1874, a significant representative of Cretaceous fauna. The study integrates sedimentological (quartz grain size), geochemical (concentration of major oxides) and palaeobiological (taphonomy) proxies to categorise five oyster-bearing localities in the Bohemian Massif and the Pieniny Klippen Belt (Western Carpathians) into three environments with differing substrate characteristics, environmental energy levels and salinity regimes. Subsequently, the five specific palaeopopulations of Rhynchostreon suborbiculatum (Lamarck, 1801), occupying these habitats (including the dynamic Cenomanian nearshore, the quiet environment of the Turonian hemipelagic sea and the Cenomanian-Turonian marginal marine system influenced by variable fluvial activity), underwent a series of morphological and population studies. These studies involved the analyses of size-frequency distributions, morphotype structure, and shell thickness. Results from this multidisciplinary approach suggest that the salinity tolerance of R. suborbiculatum may be higher than commonly assumed, and its ecological response to climatic changes (i.e. the fluctuation of salinity, level of eutrophism, etc.) aligns with... Předkládaná práce se věnuje studiu paleoekologických aspektů evoluce ústřičného rodu Rhynchostreon Bayle, 1874, významného zástupce křídové fauny. Prostřednictvím integrovaného studia řady sedimentologických (velikost křemenných zrn), geochemických (koncentrace hlavních oxidů) a paleobiologických (tafonomie) proxy, bylo pět studovaných lokalit původem z oblasti Českého masivu a Pieninského bradlového pásma (Západní Karpaty) rozděleno do tří typů prostředí, které se liší charakterem substrátu, úrovní vnitřní energie (dynamiky) a převládajícím salinitním režimem. Posléze bylo celkem pět paleopopulací ústřičného druhu Rhynchostreon suborbiculatum (Lamarck, 1801), osídlujících tyto habitaty (dynamické cenomanské příbřeží, klidné prostředí turonského hemipelagického moře a cenomansko-turonské okrajově-mořské prostředí s proměnlivým vlivem fluviální aktivity) podrobeno sérii morfologických a populačních analýz (zejména analýze početností velikostních tříd, struktury morfotypů a tloušťky schránky). Výsledky dosažené kombinací uvedených přístupů neindikují jenom širší ekologickou a salinitní valenci druhu R. suborbiculatum, ale také skutečnost, že ekologická odpověď jednoho z nejznámějších druhů fosilních ústřic na faktory spojené s klimatickou změnou (např. fluktuace salinity, úroveň eutrofie apod.) byla... Keywords: Svrchní křída; ústřice; paleoekologie; evoluce; Upper Cretaceous; oysters; palaeoecology; evolution Available in a digital repository NRGL Paleoekologické aspekty a evoluce ústřičných asociací pozdní křídy

The presented thesis explores the palaeoecological aspects of the evolution of the well-known fossil oyster genus Rhynchostreon Bayle, 1874, a significant representative of Cretaceous fauna. The study ...

Rantuch, Jakub; Košťák, Martin; Mergl, Michal; Reháková, Daniela
Univerzita Karlova, 2024

Vápníkové kanály typu T u neurologických poruch
Stringer, Robin Nicholas; Weiss, Norbert Alphonse Léon; Bébarová, Markéta; Vyklický, Ladislav
2024 - English Keywords: Ion channel; Calcium channel; T-type channel; Glycosylation; SCAMP2; Trafficking; Diabetes; Amyotrophic lateral sclerosis; Epilepsy; Encephalopathy; Trigeminal neuralgia; Pain; Mutation; Channelopathy; Quinoline; Neurons; Biophysics; Ion channel; Calcium channel; T-type channel; Glycosylation; SCAMP2; Trafficking; Diabetes; Amyotrophic lateral sclerosis; Epilepsy; Encephalopathy; Trigeminal neuralgia; Pain; Mutation; Channelopathy; Quinoline; Neurons; Biophysics Available in a digital repository NRGL Vápníkové kanály typu T u neurologických poruch

Stringer, Robin Nicholas; Weiss, Norbert Alphonse Léon; Bébarová, Markéta; Vyklický, Ladislav
Univerzita Karlova, 2024

Dopředné a zpětné modelování spektroskopických diagnostik fúzního plazmatu
Tomeš, Matěj; Seidl, Jakub; De Bock, Maarten; Den Hartog, Daniel J.
2024 - English Title: Forward and Backward Modelling of Spectroscopic Diagnostics in Fusion Plasmas Author: Matěj Tomeš Department: Department of Surface and Plasma Science Supervisor: Mgr. Jakub Seidl, Ph.D., Institute of Plasma Physics of the Czech Academy of Sciences Abstract: The thesis primarily focuses on developing forward and backward models for fusion diagnostics. It encompasses the development and application of these models for Thomson scattering, the inference of neon concentrations in JET's divertor and for synchrotron radiation. In the first chapter, the forward model of Thomson scattering designed for Cherab is detailed. This includes the development of a laser module intended for a wide range of applications, primarily to facilitate Thomson scattering simulations. An application example is provided by a comprehensive model of the Thomson scattering diagnostic used at the COMPASS tokamak. The model of the diagnostic is combined with experimentally obtained electron profiles to assess its performance. The second half of the chapter focuses on the development of a backward model for Bayesian inference of temperature profiles from measured Thomson scattering data. The effectiveness of this model is compared to the conventional approach based on least square error optimization, revealing clear advantages of... Název: Forward and Backward Modelling of Spectroscopic Diagnostics in Fusion Plasmas Autor: Matěj Tomeš Katedra: Katedra fyziky povrchů a plazmatu Vedoucí práce: Mgr. Jakub Seidl, Ph.D., Ústav fyziky plazmatu AV ČR, v. v. i. Abstrakt: Práce se primárně zaměřuje na vývoj dopředných a zpětných modelů pro diagnostiku fúzního plazmatu. Zahrnuje vývoj a aplikaci těchto modelů pro Thomsonův rozptyl, odhad koncentrace neonu v divertoru tokamaku JET a pro synchrotronní záření. V první kapitole je podrobně popsán dopředný model Thomsonova rozptylu napsaný pro simulační software Cherab. To zahrnuje vývoj laserového modulu určeného pro širokou škálu aplikací, především ale pro umožnění simulací Thom- sonova rozptylu. Příkladem aplikace je komplexní model diagnostiky Thomsonova rozptylu z tokamaku COMPASS. Model diagnostiky je kombinován s experi- mentálně získanými profily elektronové teploty a hustoty za účelem zhodnocení jeho přesnosti. Druhá polovina kapitoly se zaměřuje na vývoj zpětného modelu pro bayesovský odhad teplotních profilů z naměřených dat Thomsonova rozptylu. Účinnost tohoto modelu je srovnávána s tradičním přístupem založeným na op- timalizaci součtu nejmenších čtverců, což odhaluje jasné výhody... Keywords: tokamak; tokamak Available in a digital repository NRGL Dopředné a zpětné modelování spektroskopických diagnostik fúzního plazmatu

Title: Forward and Backward Modelling of Spectroscopic Diagnostics in Fusion Plasmas Author: Matěj Tomeš Department: Department of Surface and Plasma Science Supervisor: Mgr. Jakub Seidl, Ph.D., ...

Tomeš, Matěj; Seidl, Jakub; De Bock, Maarten; Den Hartog, Daniel J.
Univerzita Karlova, 2024

Anti-establishmentové strany: Hrozba pro demokracii nebo šance na její nové equilibrium?
Červinka, Lukáš Lev; Wintr, Jan; Přibáň, Jiří; Pin, Andrea
2024 - English (English) Anti-Establishment Parties: Threat to Democracy or Chance for Its New Equilibrium? The thesis focuses on the anti-establishment parties from the perspective of constitutional theory, also considering the sociological theoretical approaches of Niklas Luhmann, Charles Taylor, and Benedict Anderson. The primary purpose of the work is to explore how the establishment, as an empirical contextualisation of democracy and structural coupling between the state and the people, might be conceptualised and what role the political parties play in it. First, the thesis proposes a theoretical conceptualisation of establishment as a structural coupling between the constitutional identity of state and the popular identity of the political people. Both the state and the political people are understood as autopoietic organisational systems defined by their constitutional / popular imaginaries, which are articulated by their organisational structures. The work adapts the integrative theory of Rudolf Smend in the understanding of the organisational structure as a system of personal, procedural, and value elements. The role of the parliamentary parties is analysed through the examination of their legislative activity in parliament, using the holistic grading method to determine the anti-establishment rate of... (čeŚky) establishmentovf strany: Hrozba pro demokracii nebo šance na její novf equilibrium? DiŚertace Śe zaměřuje na anti teoretickf příŚtupy NiklaŚe Luhmanna Primbrním cílem prbce je prozkoumat; jakzm způŚobem může bzt eŚtabliŚhment jakožto utvbření hrají politickf Śtrany. Prbce nejprve předŚtavuje teoretickou koncepci eŚtabliŚhmentu jakožto Śtrukturblního propojení vŚtavní identity Śtbtu a lidovf identity politickfho lidu; přičemž Śtbt i lid chbpe jakožto autopoietickf organizační ŚyŚtfmy definovanf jejich vŚtavní; reŚp. lidovou imaginací jež Śe artikuluje Śkrze organizační Śtrukturu Śtbtu; reŚp. politickfho lidu; na kterfmžto míŚtě prbce adaptuje integrační teorii Rudolfa Smenda; když organizační Śtrukturu zkoumb jakožto ŚouŚtavu oŚobnoŚtních; procedurblních a hodnotovzch prvků. Śkrze jejich legiŚlativní činnoŚt užívajíc metodu holiŚtickfho zjištění míry anti eŚtabliŚhmentovoŚti jednotlivzch nbvrhů zbkonů; nbvrhy aŚpirují změnit ŚoučaŚnou vŚtavní identitu Śtbtu; a nbŚledně ke změření míry anti Jakožto případovf Śtudie; k ověření teorie eŚtabliŚhmentu předloženf v diŚertační prbci a prozkoumbní role politickzch Śtran ve změnbch vŚtavní identity Śtbtu; poŚloužilo ČeŚko a Itblie; jenž na jednf Śtraně mají doŚtatečně podobnz inŚtitucionblní rbmec vŚtavního ŚyŚtfmu a v obdobnzmi ŚpolečenŚkzmi jevy (nutnoŚt... Keywords: establishment; politické strany; ústavní identita; lidová identita; Česká republika; Itálie; holistické hodnocení; establishment; political parties; constitutional identity; popular identity; Czechia; Italy; holistic grading Available in a digital repository NRGL Anti-establishmentové strany: Hrozba pro demokracii nebo šance na její nové equilibrium?

(English) Anti-Establishment Parties: Threat to Democracy or Chance for Its New Equilibrium? The thesis focuses on the anti-establishment parties from the perspective of constitutional theory, also ...

Červinka, Lukáš Lev; Wintr, Jan; Přibáň, Jiří; Pin, Andrea
Univerzita Karlova, 2024

Charakterizace serinových proteáz u motolice Schistosoma mansoni participujících na interakci s hostitelem
Ulrychová, Lenka; Horn, Martin; Schabussova, Irma; Sojka, Daniel
2024 - English Schistosomiasis is a serious parasitic disease, caused by blood flukes of the genus Schistosoma. It remains a global health problem in the 21st century, with more than 250 million people infected in 78 countries. Current therapy relies on the drugs praziquantel and oxamniquine, for which there are concerns of emerging drug resistance. Proteases of schistosomes are involved in critical steps of host-parasite interactions and are promising targets for the development of new therapeutic strategies against schistosomiasis. This work focuses on the characterization of Schistosoma mansoni serine proteases (SmSPs) and the determination of their role in the interaction with the human host using a variety of genomic, bioinformatic, RNA- and protein-based techniques. First, the major types of proteolytic activities secreted by the blood-dwelling developmental stages of S. mansoni were classified using functional proteomics. The analysis revealed the complexity of proteolytic activities secreted by the schistosome life stages parasitizing the human host. All stages secreted significant serine protease activities, and consequently their genes were retrieved from the genome database and annotated. Localization in adult worms determined by fluorescence in situ RNA hybridization revealed complex expression... Schistosomóza je závažné parazitární onemocnění způsobené motolicemi rodu Schistosoma. I ve 21. století zůstává celosvětovým zdravotním problémem, neboť je jí nakaženo více než 250 milionů lidí v 78 zemích světa. Současná terapie je založena především na dvou lécích, praziquantelu a oxamniquinu. Vzrůstající riziko vzniku rezistence vyvolává potřebu nových alternativních chemoterapeutik nebo vakcín. Proteázy schistosom se podílejí na mnoha kritických interakcích parazita s hostitelem, a proto představují slibné cíle pro vývoj nových léčebných strategií proti schistosomóze. Tato dizertační práce se zaměřuje na charakterizaci serinových proteáz krevničky Schistosoma mansoni a na určení jejich role v interakci s lidským hostitelem za použití genomických a bioinformatických přístupů, včetně metod molekulární biologie RNA a proteinové biochemie. Nejprve byly pomocí funkční proteomiky klasifikovány hlavní typy proteolytických aktivit v exkrečně sekrečních produktech vylučovaných vývojovými stadii S. mansoni žijícími v krvi hostitele. Analýza odhalila komplexnost těchto proteolytických aktivit, které jsou jedinečné pro každé stádium parazitující v lidském hostiteli. U všech studovaných stádií byla v sekrečních produktech detekován významný podíl aktivit serinových proteáz. Následně byla v genomové databázi... Available in a digital repository NRGL Charakterizace serinových proteáz u motolice Schistosoma mansoni participujících na interakci s hostitelem

Schistosomiasis is a serious parasitic disease, caused by blood flukes of the genus Schistosoma. It remains a global health problem in the 21st century, with more than 250 million people infected in ...

Ulrychová, Lenka; Horn, Martin; Schabussova, Irma; Sojka, Daniel
Univerzita Karlova, 2024

Experimentální zvířecí modely a přenašeči leishmanií podrodu Mundinia
Bečvář, Tomáš; Sádlová, Jovana; Courtenay, Orin; Soares Maia, Carla Alexandra
2024 - English Leishmania are vector-borne dixenous protozoan parasites of vertebrates causing diseases collectively called leishmaniases, which threaten more than 1 billion people mainly in tropical and subtropical regions. These parasites are divided into four subgenera: Leishmania, Viannia, Sauroleishmania, and Mundinia. The last named are geographically widely dispersed and their distribution covers all continents except Antarctica. Although their medical and veterinary importance is increasing, there is currently almost no information on natural reservoir hosts, vector species, and experimental research options due to the very limited range of model animals. This thesis summarizes our efforts to unravel possible vectors and laboratory models for this subgenus. In the first three studies, we focused on potential models; therefore, we experimentally infected guinea pigs (Cavia porcellus), BALB/c mice, Chinese hamsters (Cricetulus griseus), and steppe lemmings (Lagurus lagurus) with five species of Mundinia and we also tested reservoir potential of African grass rat (Arvicanthis niloticus) and Natal multimammate mouse (Mastomys natalensis) to Leishmania chancei. The second part focused on potential vectors of the parasites. We experimentally infected biting midges Culicoides sonorensis and sand flies sharing... Leishmanie jsou dvojhostitelští a hmyzem přenášení parazité obratlovců, kteří způsobují onemocnění označované jako leishmanióza, ohrožující více než miliardu lidí po celém světě. Tito parazité jsou aktuálně rozděleni do čtyř podrodů: Leishmania, Viannia, Sauroleishmania a Mundinia. Zástupci posledního jmenovaného podrodu se vyskytují na všech kontinentech kromě Antarktidy. Ačkoliv jejich medicínský i veterinární význam stále roste, o jejich rezervoárových hostitelích a přenašečích se ví jen velmi málo, stejně tak jako o možných modelových organismech využitelných pro jejich výzkum. Tato práce shrnuje výsledky naší snahy o rozšíření znalostí o tomto podrodu. V prvních třech studiích jsme se zaměřili na potenciální modelové hostitele a postupně jsme experimentálně infikovali morčata (Cavia porcellus), BALB/c myši, křečíky čínské (Cricetulus griseus) a pestrušky písečné (Lagurus lagurus) celkem 5 druhy leishmanií z podrodu Mundinia, a navíc jsme testovali rezervoárový potenciál afrických hlodavců myši nilské (Arvicanthis niloticus) a krysy mnohobradavkaté (Mastomys natalensis) pro L. chancei. Čtvrtá studie byla zaměřena na přenašeče. Provedli jsme experimentální infekce flebotomů, sdílejících rozšíření s danými druhy leishmanií, a tiplíků Culicoides sonorensis, abychom mohli sledovat vývoj leishmanií... Keywords: Mundinia; Leishmania; flebotomus; Phlebotomus; Lutzomyia; tiplíci; Culicoides; Mundinia; Leishmania; sand fly; Phlebotomus; Lutzomyia; biting midges; Culicoides Available in a digital repository NRGL Experimentální zvířecí modely a přenašeči leishmanií podrodu Mundinia

Leishmania are vector-borne dixenous protozoan parasites of vertebrates causing diseases collectively called leishmaniases, which threaten more than 1 billion people mainly in tropical and subtropical ...

Bečvář, Tomáš; Sádlová, Jovana; Courtenay, Orin; Soares Maia, Carla Alexandra
Univerzita Karlova, 2024

Změny srážko-odtokového režimu a biogeochemismu v pramenných oblastech
Fraindová, Kateřina; Matoušková, Milada; Komínková, Dana; Matschullat, Jörg
2024 - English Headwater areas are a very important current or potential drinking water source. Their ecological value for the whole ecosystem is equally important. Headwater areas are sites with minimal anthropogenic intervention and usually the least polluted water sources. Changes in climate and rainfall-runoff (R-R) regime together with water quality in these areas affect the status and availability of water further downstream significantly. It is also one of the most sensitive areas and is an early indicator of ongoing changes. This thesis focuses on the main issues that are already ongoing and are affecting the availability of drinking water significantly. Some of these are trends in R-R regime in the context of the climate change and glacier retreat in headwater areas. As a very good example of a mid-latitude river with a complex rainfall-runoff regime, where a large impact of regional climate warming and glacier retreat are strongly manifested, The Athabasca River Basin was selected for this study. Related to this issue is the river water quality, which is influenced by changes in both temperature and R-R regime, together with the increasing occurrence of extreme hydrometeorological situations such as droughts and floods. The effects of land cover on water quality are also analysed, along with consideration of... Pramenné oblasti představují v současné době velice významný aktuální či potenciální zdroj pitné vody, přičemž neméně důležitý je i jejich ekologický význam pro celý ekosystém. Jedná se o lokality s minimálními antropogenními zásahy a s obvykle nejméně znečištěnými vodními zdroji. Změna klimatu a srážko-odtokového režimu i kvalita vody v těchto oblastech významně ovlivňují stav a dostupnost vody dále po proudu. Zároveň se jedná o jednu z nejcitlivějších oblastí, která je včasným indikátorem probíhajících změn. Práce se zaměřuje na hlavní problémy, které v současné době již probíhají a významným způsobem ovlivňují dostupnost pitné vody. Jedním z nich jsou trendy srážko-odtokového režimu v souvislosti se změnou klimatu a ústupu ledovců v pramenných oblastech. Jako velmi dobrý příklad řeky ve středních zeměpisných šířkách s komplexním odtokovým režimem, kde se silně projevuje velký vliv regionálního oteplování klimatu a ústupu ledovců, bylo pro toto téma vybráno povodí řeky Athabasca. S tímto tématem souvisí i změna kvality vody, která je ovlivněná jak změnou teplot, tak srážko-odtokového režimu spolu s narůstajícím výskytem extrémních situací, jako je sucho a povodně. Dále jsou analyzovány i vliv krajinného pokryvu na kvalitu vody, a jejich změn spolu se zohledněním geografické polohy. Za tímto účelem bylo... Keywords: Srážko-odtokový režim; výška sněhu; teplota; kvalita vody; živiny; DOC; regionální změna klimatu; Rainfall-runoff regime; snow cover depth; temperature; water quality; nutrients; DOC; regional climate change Available in a digital repository NRGL Změny srážko-odtokového režimu a biogeochemismu v pramenných oblastech

Headwater areas are a very important current or potential drinking water source. Their ecological value for the whole ecosystem is equally important. Headwater areas are sites with minimal ...

Fraindová, Kateřina; Matoušková, Milada; Komínková, Dana; Matschullat, Jörg
Univerzita Karlova, 2024

Molekulární charakterisace parvalbuminového genu ryb: evoluční pohled a forenzní aplikace pro identifikaci a autentizaci druhů ryb
Mukherjee, Subham; Horká, Petra; Kalous, Lukáš; Flajšhans, Martin
2024 - English Abstract Parvalbumin (pvalb), a low molecular weight calcium-binding protein, plays a crucial role in regulating Ca2+ switching in fast-twitch muscle fibres and has been identified as a major cause of fish-induced food allergies. The molecular evolution of pvalb genes in teleost fish and its cause, duplication of the whole genome, was investigated, revealing high diversity and complex gene repertoires, making detection and identification challenging. This study provides robust genomic evidence of the complex evolution of parvalbumin genes in teleost fish. In addition to its role as a potent allergen, the pvalb gene, a nuclear gene, can serve as a valuable molecular marker. Keeping this in mind, a real-time PCR assay is developed to detect and quantify two European anglerfish species simultaneously, Lophius piscatorius and Lophius budegassa, which are susceptible to illegal species substitutions in the global seafood trade. The assay targets the intronic region of the pvalb gene, demonstrating high specificity, efficiency, and robustness, making it a potential forensic tool to prevent food fraud and ensure the accurate identification of fish species. Furthermore, a standardised quantitative PCR-based method is presented for the β-pvalb gene in Lophius piscatorius, utilising a plasmid DNA calibrator... Keywords: gen; parvalbumin; sekvence; paralog; pseudogen; PCR; klonování; gene; parvalbumin; sequence; paralog; pseudogene; PCR; cloning Available in a digital repository NRGL Molekulární charakterisace parvalbuminového genu ryb: evoluční pohled a forenzní aplikace pro identifikaci a autentizaci druhů ryb

Abstract Parvalbumin (pvalb), a low molecular weight calcium-binding protein, plays a crucial role in regulating Ca2+ switching in fast-twitch muscle fibres and has been identified as a major cause of ...

Mukherjee, Subham; Horká, Petra; Kalous, Lukáš; Flajšhans, Martin
Univerzita Karlova, 2024

Investigating associations of saproxylic beetles with forest structure through the analysis of species composition and feeding guilds
KOZEL, Petr
2024 - English The thesis contains studies focusing on various forest biotopes of Central Europe and saproxylic beetles as a model group for forest ecology research. In the review, current knowledge about the threats for forest biota, mainly saproxylic beetles are discussed in the context of species composition and trait-based approach. Various stages of succession in the patches of disturbed forests, their connectivity, the introduction non-native tree species, and the assessment of feeding guilds using stable isotopes are studied in the relation to saproxylic beetles in separate chapters. Keywords: connectivity; forest ecology; non-native tree species; trait-based approach; saproxylic beetles; species composition; stable isotopes; succession Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Investigating associations of saproxylic beetles with forest structure through the analysis of species composition and feeding guilds

The thesis contains studies focusing on various forest biotopes of Central Europe and saproxylic beetles as a model group for forest ecology research. In the review, current knowledge about the ...

KOZEL, Petr
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024