Number of found documents: 5108
Published from to

Mapování profilace strategických partnerství
Rosendorf, Ondřej; Parízek, Michal; Karlas, Jan; Faude, Benjamin
2024 - English
Since the end of the Cold War, states have increasingly resorted to the establishment of informal alignments, with "strategic partnerships" at the forefront, whereas the number of formal military alliances has been stagnating. In spite of the rapid proliferation of these partnerships-next to other forms of informal cooperation-the extant International Relations literature has paid only limited attention to this phenomenon. In this dissertation, I introduce and analyze the first dataset of Bilateral Intergovernmental Strategic Partnerships (BISPs) established by G20 members between 1993 and 2020. Utilizing insights from international alignment and institutionalist literature, I aim to: (1) provide the first empirical account of the extent to which strategic partnerships have proliferated among the G20 and over time; (2) identify factors driving states to form strategic partnerships; and (3) determine whether these partnerships operate primarily as complements to the existing alliance structures, or exist in place of them as "low-cost" alternatives. Firstly, I found that G20 members alone established approximately 382 strategic partnerships by the end of 2020, surpassing previous estimations. Secondly, I found that the onset of strategic partnerships correlates with factors such as economic... Od konce studené války se státy stále častěji uchylují k vytváření neformálních spojenectví, v čele se "strategickými partnerstvími," zatímco počet formálních vojenských aliancí stagnuje. Navzdory rychlému šíření těchto partnerství-vedle jiných forem neformální spolupráce-věnovala dosavadní literatura o mezinárodních vztazích tomuto fenoménu jen omezenou pozornost. V této disertační práci představuji a analyzuji první soubor dat o bilaterálních mezivládních strategických partnerstvích (BISP) založených členy skupiny G20 v letech 1993 až 2020. S využitím poznatků z literatury o mezinárodních spojenectvích a institucionalismu se snažím: (1) poskytnout první empirický popis rozsahu, v jakém se strategická partnerství rozšířila mezi členy G20 a v průběhu času; (2) identifikovat faktory, které vedou státy k vytváření strategických partnerství; a (3) určit, zda tato partnerství fungují především jako doplněk stávajících aliančních struktur, nebo existují místo nich jako "nízkonákladové" alternativy. Zaprvé jsem zjistil, že jen členové skupiny G20 do konce roku 2020 navázali přibližně 382 strategických partnerství, což překonává předchozí odhady. Za druhé jsem zjistil, že vznik strategických partnerství koreluje s faktory, jako jsou ekonomické zájmy, rostoucí mocenský status a podobnost režimů. A konečně... Available in a digital repository NRGL
Mapování profilace strategických partnerství

Since the end of the Cold War, states have increasingly resorted to the establishment of informal alignments, with "strategic partnerships" at the forefront, whereas the number of formal military ...

Rosendorf, Ondřej; Parízek, Michal; Karlas, Jan; Faude, Benjamin
Univerzita Karlova, 2024

Zastoupení v mezinárodních organizacích: Velikost a složení národních delegací
Vlček, Václav; Parízek, Michal; Karlas, Jan; Sommerer, Thomas
2024 - English
In general, states and their governments make decisions in international politics and international organizations. However, the states are, in fact, represented by people. How many and who are they? This dissertation thesis deals with state representation in international organizations. In particular, it studies the size and composition of national delegations to plenary meetings of international organizations. From the theoretical perspective, the thesis builds on rationalist assumptions and tests established theories in the field. As for the causes of the various delegation sizes, the thesis hypothesizes 1) various institutional power, 2) different economic resources, 3) various intensity of national interests, 4) different levels of government effectiveness, and 5) different domestic political regimes. Next, the theoretical framework explains the various delegation composition by 1) different intensity of the national preferences, 2) different levels of government effectiveness, and 3) different domestic political regimes. From the methodological perspective, the thesis builds on an extensive statistical analysis using a unique quantitative dataset across seventeen international organizations and the UN General Assembly sessions from 1993 to 2016. The delegation composition is operationalized in... V obecné rovině v mezinárodní politice a mezinárodních organizacích rozhodují státy a jejich vlády. Ty jsou však zastoupeny konkrétními lidmi. Kolik jich je a o koho se ve skutečnosti jedná? Tato disertační práce se zabývá fenoménem reprezentace států v mezinárodních organizacích. Konkrétně pak studuje velikost a složení národních delegací, jež členské země posílají k plenárním shromáždění mezinárodních organizací. Z teoretického hlediska práce staví na racionalistických předpokladech a testuje v oboru etablovaná teoretická vysvětlení. Jako příčiny odlišných velikostí předpokládá: 1) odlišnou institucionální moc, 2) rozdílné ekonomické zdroje, 3) různou intenzitu národních zájmů, 4) odlišnou efektivitu státních aparátů a 5) různou povahu domácích politických režimů. Rozdílné složení delegací pak teoretický rámec vysvětluje 1) různou intenzitu národních zájmů, 2) odlišnou efektivitou státních aparátů a 3) rozdílnou povahou domácích politických režimů. Po metodologické stránce práce statisticky analyzuje unikátní kvantitativní dataset, který pokrývá velikost národních delegací napříč sedmnácti mezinárodními organizacemi a Valné shromáždění OSN od roku 1993 do roku 2016. Složení národních delegací je pak operacionalizováno pro Valná shromáždění OSN v letech 1995, 2005 a 2015. Kvantitativní dataset je... Keywords: reprezentace; národní delegace; plenární shromáždění; mezinárodní organizace; Organizace spojených národů; Valné shromáždění; representation; national delegations; plenary meetings; international organizations; United Nations; General Assembly Available in a digital repository NRGL
Zastoupení v mezinárodních organizacích: Velikost a složení národních delegací

In general, states and their governments make decisions in international politics and international organizations. However, the states are, in fact, represented by people. How many and who are they? ...

Vlček, Václav; Parízek, Michal; Karlas, Jan; Sommerer, Thomas
Univerzita Karlova, 2024

Fenomenologické pojetí těla a jeho možné důsledky pro praxi oborů pracujících s tělem
Kříž, Petr; Parry, Silvan James; Jirásek, Ivo; Hurych, Emanuel
2024 - English
Title: Phenomenological notion of the body and its possible consequences for practice of body- oriented disciplines Objectives: This thesis aims to clarify the possible projection of phenomenological findings about the body into the body-oriented disciplines. The interpretation of René Descartes, Edmund Husserl and, above all, Maurice Merleau-Ponty comes to the postulate that the body itself is not an object, but rather it is that by which objects exist as objects in the first place. From this phenomenological postulate there follows the deep opposition of the phenomenological notion of the body to the notion on which body-oriented disciplines commonly (but usually only implicitly) base their theory and practice. The thesis thus presents not only the interpretation of positive phenomenological concepts, but also the interpretation of phenomenological criticism of the physiological and psychological (or psychologizing) concept of the body, which stand on the flaws and prejudices of the empiricist and intellectualist traditions of Western thought. Subsequently, the possible impacts of both phenomenological criticism and phenomenological concepts on the practice of body-oriented disciplines are discussed. Methodology: This dissertation is a philosophical treatise. The first part is a philosophical... Název: Fenomenologické pojetí těla a jeho možné důsledky pro praxi oborů pracujících s tělem Cíle: Tato disertační práce si klade za cíl osvětlit možné promítnutí fenomenologických poznatků o těle do oborů pracujících s tělem. Interpretací klíčových tezí Reného Descartesa, Edmunda Husserla a především Maurice Merleau-Pontyho dochází k postulátu, že vlastní tělo není předmět, nýbrž to, díky čemu vůbec předměty existují jako předměty. Od tohoto fenomenologického postulátu se dále odvíjí hluboká opozice fenomenologického pojetí těla vůči pojetí, z kterého obory pracující s tělem běžně (obvykle však pouze implicitně) vycházejí ve své teorii i praxi. Práce proto předkládá nejen interpretaci některých pozitivních fenomenologických konceptů, nýbrž i interpretaci fenomenologické kritiky fyziologického a psychologického (či psychologizujícího) pojetí těla, stojících na omylech a předsudcích empiristické a intelektualistické tradice západního myšlení. Následně jsou diskutovány možné dopady obojího - jak fenomenologické kritiky, tak fenomenologických konceptů - na praxi oborů pracujících s tělem. Metodologie: Tato disertační práce je filosofickým pojednáním. První část je filosofickou interpretací klíčových autorů, kteří přispěli k fenomenologickému pojetí těla. Jsou-li použity příklady, je to pouze za účelem... Keywords: tělo; fenomenologie; Merleau-Ponty; kritika vědy; obory pracující s tělem; body; phenomenology; Merleau-Ponty; criticism of science; body-oriented disciplines Available in a digital repository NRGL
Fenomenologické pojetí těla a jeho možné důsledky pro praxi oborů pracujících s tělem

Title: Phenomenological notion of the body and its possible consequences for practice of body- oriented disciplines Objectives: This thesis aims to clarify the possible projection of phenomenological ...

Kříž, Petr; Parry, Silvan James; Jirásek, Ivo; Hurych, Emanuel
Univerzita Karlova, 2024

Fylogenomika, evoluce genomu a dynamika repetitivních elementů v rodu Amomum Roxb. (Zingiberaceae)
Hlavatá, Kristýna; Fér, Tomáš; Haevermans, Thomas; Zedek, František
2024 - English
Amomum Roxb. s.l. (black cardamom) is a complicated genus in the ginger family Zingiberaceae (subfamily Alpinioideae) that according to some definitions includes groups of species recognized as separate genera, e.g. genus Elettariopsis Baker. Phylogenetic studies have so far failed to elucidate both the position of Amomum within Alpinioideae and the relationship between Amomum and other genera like Elettariopsis. In this work, Amomum was subjected to a detailed morphological analysis of the largest possible sampling, together with a phylogenetic analysis. Amomum was recircumscribed, Amomum s.s. and three new genera were established, three genera were resurrected, and genus Elettariopsis was merged into Amomum. Meanwhile, new species were described and others epitypified. A well-resolved nuclear-gene phylogeny of Amomum s.s. was obtained using next-generation sequencing (Hyb-Seq) and showed the existence of four clades (A, B, C, D) within the genus. Clade D, the former genus Elettariopsis, was further divided into three subclades (D1-D3). A chloroplast DNA-based phylogeny supported this structure, but additional phylogenies based on ribosomal DNA were incongruent with it, indicating that the frequently used ITS marker and other rDNA markers may not be suitable for reconstructing deeper phylogenetic... Amomum Roxb. s.l. (černý kardamom) je složitý rod v čeledi zázvorovitých (Zingiberaceae) v podčeledi Alpinioideae, který podle některých vymezení zahrnuje i skupiny druhů považované za samostatné rody, jako je např. rod Elettariopsis Baker. Dosavadní fylogenetické výzkumy nedokázaly objasnit ani pozici rodu Amomum v podčeledi Alpinioideae, ani vztah mezi rodem Amomum a ostatními rody, jako je Elettariopsis. V této práci bylo Amomum podrobeno detailní morfologické analýze s použitím co největšího počtu vzorků, spolu s fylogenetickou analýzou. Amomum bylo nově vymezeno, bylo ustanoveno Amomum s.s. a tři nové rody, tři rody byly obnoveny a Elettariopsis byl včleněn do rodu Amomum. Mezitím bylo popsáno několik nových druhů a dva byly epitypifikovány. S použitím sekvenování nové generace (next-generation sequencing; Hyb-Seq) byla získána dobře podpořená fylogeneze založená na jaderných genech, která prokázala v rodu existenci čtyř cladů (A, B, C, D); clade D, původní rod Elettariopsis, se dále dělí na tři subclady (D1 - D3). Fylogeneze založená na chloroplastové DNA tuto strukturu podpořila, ale doplňující fylogeneze založené na ribosomálním cistronu (rDNA) se od té založené na nukleárních genech odlišovaly; to poukazuje na potenciální nevhodnost často používaného markeru ITS při rekonstrukci hlubších... Keywords: NGS; Hyb-Seq; fylogenomika; biogeografie; FCM; evoluce velikosti genomu; NGS; Hyb-Seq; phylogenomics; biogeography; FCM; genome size evolution Available in a digital repository NRGL
Fylogenomika, evoluce genomu a dynamika repetitivních elementů v rodu Amomum Roxb. (Zingiberaceae)

Amomum Roxb. s.l. (black cardamom) is a complicated genus in the ginger family Zingiberaceae (subfamily Alpinioideae) that according to some definitions includes groups of species recognized as ...

Hlavatá, Kristýna; Fér, Tomáš; Haevermans, Thomas; Zedek, František
Univerzita Karlova, 2024

Efekty elektronové struktury v molekulárních spojích
Marek, Štěpán; Korytár, Richard; Frederiksen, Thomas; Vázquez Melis, Héctor
2024 - English
Molecular electronics is a field investigating transport and transport induced phenom- ena on the one of the smallest functional circuit components - molecules. In this work, we explore the effect of electronic structure effects on the conductance and rotation of the molecules in the junction. We use density functional theory, GW approximation and simple analytical models to understand experimentally observed phenomena and warn about possible drawbacks of adapting GW for cluster based conductance calculations. 1 Molekulární elektronika je oblast zkoumající transportní a transportem indukované jevy na možná nejmenších jednotkách elektrických obvodů - molekulách. V této práci prozkoumáváme vliv jevů elektronové struktury na vodivost a rotaci molekul ve spojích. Používáme teorii funkcionálu hustoty, přiblížení GW a jednoduché analytické modely k porozumnění experimentálním pozorováním a k varování před možnými nevýhodami při adaptaci GW pro výpočty vodivosti ve shlukovém (cluster) formalismu. 1 Keywords: Molekulární elektronika|Kvantová a statistická mechanika|Teoretická fyzika pevných látek|Výpočetní fyzika kondenzovaných látek|Výpočty z prvních principů|Programování a superpočítače; Molecular electronics|Quantum and statistical mechanics|theoretical solid-state physics|computational condensed-matter theory|ab-initio calculations|programming and super-computing Available in a digital repository NRGL
Efekty elektronové struktury v molekulárních spojích

Molecular electronics is a field investigating transport and transport induced phenom- ena on the one of the smallest functional circuit components - molecules. In this work, we explore the effect of ...

Marek, Štěpán; Korytár, Richard; Frederiksen, Thomas; Vázquez Melis, Héctor
Univerzita Karlova, 2024

Algebraické nástroje v kombinatorické geometrii a topologii
Bulavka, Denys; Tancer, Martin; Benedetti, Bruno; Holmsen, Andreas
2024 - English
In this thesis we study combinatorial problems through the lenses of the exterior alge- bra. This algebra is a natural object to model set systems as well as simplicial complexes. Moreover, it is possible to translate the classical operations from the combinatorial set- ting to the setting of exterior algebra. For example, set intersection and the classical boundary map from topology. Often this point of view makes it possible to translate the combinatorial problem to a problem regarding the dimension of certain vector space. The latter one might turn up to be easier since we can study the dimension of a vector space with linear maps. We follow such approach in this thesis. In the first part we study the weak saturation problem introduced by Bollobás in the 60's. This problem consists in, given a host graph F and a pattern graph H, to determine the minimum number of infected edges of F one has to start with in order for the infection to spread, according to the pattern H, to the whole host graph F. We study this problem when the host and the pattern are complete uniform multipartite hypergraphs. Next, we work on a generalization of a theorem by Helly regarding intersecting pat- terns of convex sets. Concretely, given a finite family of convex sets in Rd partitioned into d + 1 colors classes such that a... V této práci se zabýváme kombinatorickými problémy optikou Grassmanovy alge- bry. Tato algebra je přirozenou matematickou strukturou pro modelování množinových systémů i simpliciálních komplexů. Umožňuje navíc převést operace z kombinatorických struktur do Grassmanovy algebry. Například operace jako množinový průnik nebo stan- dardní hraniční operátor z topologie. To nám často umožňují převést kombinatorický problém na problém týkající se dimenze určitého vektorového prostoru, což se může uká- zat jako jednodušší přístup, protože poté můžeme zkoumat dimenzi vektorového prostoru pomocí lineárních zobrazení. Takový přístup uplatňujeme i v této práci. V první části zkoumáme problém slabé saturace, který zavedl Bollobás v 60. letech. Jedná se o následující problém. Pro zadaný "hostitelský" graf F a "vzorový" graf H je potřeba určit minimální počet "nakažených" hran grafu F, se kterými je třeba začít, aby se infekce rozšířila na celý hostitelský graf F podle vzorového grafu H. Konkrétně nás zajímá případ, kdy hostitelské i vzorové grafy jsou úplné uniformní multipartitní hypergrafy. Dále se zabýváme zobecněním Hellyho věty, která se týká průsečíkových struktur kon- vexních množin. Konkrétně se ptáme na následující otázku. Je-li zadán konečný systém konvexních množin v Rd rozdělených do d+1 tříd barev tak, že... Keywords: kombinatorika|topologie|geometrie|komutativní algebra|homologická algebra|Stanley-Reisnerův okruh|těžká Lefschetzova věta; Combinatorics|Topology|Geometry|Commutative Algebra|Homological Algebra|Stanley-Reisner Ring|Hard Lefschetz Theorem Available in a digital repository NRGL
Algebraické nástroje v kombinatorické geometrii a topologii

In this thesis we study combinatorial problems through the lenses of the exterior alge- bra. This algebra is a natural object to model set systems as well as simplicial complexes. Moreover, it is ...

Bulavka, Denys; Tancer, Martin; Benedetti, Bruno; Holmsen, Andreas
Univerzita Karlova, 2024

Propojení jazyka a národa: Změny v jazyce australské literatury od roku 1830 do současnosti
Císlerová, Magdalena; Čermák, Jan; Willoughby, Louisa; Horáková, Martina
2024 - English
While previous research has explored the relationship between national identity and language in Australia, it has not been examined on language data through history. This dissertation thus aims to trace linguistic manifestations of emerging local identity on a corpus of canonical Australian literature from 1830 up to the present. The corpus is divided into four periods based on the stages of development of postcolonial Englishes as per Schneider's Dynamic model (2007). The central hypothesis is that local identity manifests linguistically in an increased presence of the vernacular and domestic frames of reference in periods of heightened nationalism. Consequently, the nature of this study is interdisciplinary, combining linguistics with literary and cultural studies to offer a complex picture of the relationship between language and identity via a quantitative as well as qualitative analysis. The quantitative analysis concentrates on keywords, exploring both keywords generated from the corpus, using an analogically created corpus of British literature as reference, and culturally significant keywords, following Wierzbicka's (1997) theory of every culture having a set of keywords that reflect its core values. The generated lists reflect the socio-historical and cultural context, revealing common... Ačkoli studie věnující se vztahu mezi národní identitou a jazykem v Austrálii existují, toto téma nikdy nebylo zkoumáno na datech napříč australskou historií. Předkládaná disertační práce si proto sleduje jazykové projevy rodící se národní identity na korpusu kanonických románů australské literatury od roku 1830 do současnosti. Korpus je rozdělen do čtyř období, která vycházejí z vývojových fází postkoloniálních variet angličtiny Schneiderova Dynamického modelu (2007). Hlavní tezí práce je, že lokální identita se jazykově projevuje v obdobích spjatých s nacionalismem vyšším zastoupením australského dialektu a odkazováním na lokální referenční rámce. Z povahy tématu vyplývá, že jde o mezioborový výzkum, který kombinuje lingvistiku s literárními a kulturními studii. Toto spojení umožňuje vykreslit vztah jazyka a identity komplexně pomocí jak kvantitativní, tak kvalitativní analýzy. Kvantitativní analýza se věnuje klíčovým slovům - nejprve vygenerovaným přímo z korpusu, kdy byl jako referenční korpus použit analogicky vytvořený korpus britské literatury, poté kulturně významným klíčovým slovům na základě Wierzbické teorie (1997), jež tvrdí, že pro každou kulturu existuje soubor klíčových slov, který odráží její základní hodnoty. Vygenerované seznamy klíčových slov odráží socio-historický a kulturní... Keywords: jazyk a identita|australská angličtina|kulturně významná klíčová slova|australská literatura|korpusová lingvistika|pozorné čtení|stylistika krajiny; language and identity|Australian English|cultural keywords|Australian literature|corpus linguistics|close reading|stylistics of landscape Available in a digital repository NRGL
Propojení jazyka a národa: Změny v jazyce australské literatury od roku 1830 do současnosti

While previous research has explored the relationship between national identity and language in Australia, it has not been examined on language data through history. This dissertation thus aims to ...

Císlerová, Magdalena; Čermák, Jan; Willoughby, Louisa; Horáková, Martina
Univerzita Karlova, 2024

Eseje o Mezinárodní Migraci
Adunts, Davit; Mittag, Nikolas Karl; Elsner, Benjamin; Dinkelman, Taryn
2024 - English
This thesis explores the effects of international migration on human capital formation in countries of origin. The first chapter investigates the short-run effect of paternal absence due to circular migration on the perseverance skills of children left behind. Using exogenous variation in the timing of return migration induced by bilateral migration laws between Ukraine and Poland, I show that current paternal absence due to circular migration negatively affects the perseverance skills of children left behind. This result is not explained by cognitive skills and is robust to including school and classroom fixed effects. The second chapter (jointly with Bohdana Kurylo) examines the impact of international migration opportunities on origin-country skills composition by exploiting changes in migration opportunities induced by visa liberalization between EU countries and Ukraine. Our results suggest that greater opportunities to emigrate to EU countries increased the probability students will choose subjects that are more likely to lead to internationally transferable skills in Ukraine. We find no evidence that greater opportunities to emigrate to the EU significantly affect student performance or the probability of failing exams in subjects that are likely to lead to more internationally transferable... Tato práce zkoumá vliv mezinárodní migrace na tvorbu lidského kapitálu v zemích původu. První kapitola zkoumá krátkodobý vliv nepřítomnosti otců v důsledku cirkulační migrace na vytrvalostní schopnosti dětí, které zůstaly v zemi původu. Na základě exogenní variability v načasování návratové migrace vyvolané bilaterálními migračními zákony mezi Ukrajinou a Polskem ukazuji, že nepřítomnost otců v důsledku cirkulační migrace negativně ovlivňuje vytrvalostní dovednosti dětí, které zůstaly na Ukrajině. Tento výsledek není vysvětlen kognitivními dovednostmi a je robustní při zahrnutí fixních efektů školy a třídy. Druhá kapitola (společně s Bohdanou Kurylovou) zkoumá dopad mezinárodních migračních příležitostí na složení kvalifikací v zemích původu na základě změn migračních příležitostí vyvolaných liberalizací vízového režimu mezi zeměmi EU a Ukrajinou. Naše výsledky naznačují, že větší možnosti emigrace do zemí EU zvýšily pravděpodobnost, že si ukrajinští středoškoláci zvolí předměty, které s větší pravděpodobností povedou k mezinárodně přenositelným dovednostem. Nenašli jsme žádné důkazy o tom, že by větší možnosti emigrace do EU významně ovlivňovaly výsledky studentů nebo pravděpodobnost neúspěšného složení zkoušek z předmětů, které povedou k mezinárodně přenositelnějším dovednostem. To naznačuje, že... Keywords: Migrační příležitosti; Lidský kapitál; Výkonnost studentů; Cirkulační migrace; Děti ponechánybez rodičů; Schopnost vytrvat; Formování sociálně-emocionálních dovedností; Remitence,Efekty přelévání; Migration opportunities; Human capital; Student performance; Circular migration; Childrenleft behind; Perseverance skills; Formation of socio-emotional skills; Remittances; Spillovereffects Available in a digital repository NRGL
Eseje o Mezinárodní Migraci

This thesis explores the effects of international migration on human capital formation in countries of origin. The first chapter investigates the short-run effect of paternal absence due to circular ...

Adunts, Davit; Mittag, Nikolas Karl; Elsner, Benjamin; Dinkelman, Taryn
Univerzita Karlova, 2024

Reaktivní modifikace RNA pro biokonjugace s proteiny a nové enzymové metody pro syntézu RNA s modifikovanými bázemi
Brunderová, Mária; Hocek, Michal; Míšek, Jiří; Vaňáčová, Štěpánka
2024 - English
This doctoral thesis focuses on the enzymatic synthesis of base-modified RNA probes with diverse functional groups, including reactive cross-linking, hydrophobic and fluorescent moieties, or affinity tags. The construction of nucleobase-modified oligonucleotides is accomplished either through conventional in vitro transcription with T7 RNA polymerase or by an innovative approach leveraging engineered mutant DNA polymerases and primer extension reaction (PEX). In the first section of the thesis, a novel ribonucleoside triphosphate building block with reactive chloroacetamide functionality was synthesised using an aqueous Pd-catalysed Sonogashira cross- coupling reaction, directly applied on iodinated nucleotide. The chloroacetamide modified triphosphate was then tested as a putative substrate for T7 RNA polymerase in in vitro transcription reaction, aiming to construct RNA probes with one or multiple reactive groups. The selectivity of chloroacetamide- modified RNA for thiol-, or cysteine-, and histidine-containing (bio)molecules was demonstrated by model bioconjugation reactions and cross-linking experiments with three RNA-binding proteins of diverse structures and functions. The efficient formation of RNA-protein covalent adducts was confirmed by western blot or gel, and mass spectrometry analyses... Tato disertační práce je zaměřena na enzymovou syntézu na bázi modifikovaných RNA s různými funkčními skupinami, včetně reaktivních pro síťování proteinů, hydrofobních a fluorescenčních skupin nebo afinitních značek. Konstrukce oligonukleotidů modifikovaných na bázi je zabezpečena buď konvenční in vitro transkripcí s T7 RNA polymerázou, nebo inovativním přístupem využívajícím upravené mutantní DNA polymerázy a reakci prodlužování primerů (PEX). V první části práce byl nasyntetizován nový ribonukleosid trifosfátový stavební blok s reaktivní chloracetamidovou funkční skupinou pomocí Sonogashirovy kaplingové reakce ve vodní fázi katalyzované Pd, přímo aplikované na jodovaný nukleotid. Chloracetamidem modifikovaný trifosfát byl poté testován jako vhodný substrát pro in vitro transkripci s T7 RNA polymerázou s cílem zkonstruovat RNA sondy s jednou nebo více reaktivními skupinami. Selektivita chloracetamidem modifikovaných RNA pro thiol, nebo cystein a histidin obsahující (bio)molekuly byla ukázána modelovými biokonjugačními reakcemi a experimenty pro síťování se třemi RNA-vazebnými proteiny s různými strukturami a funkcemi. Účinná tvorba kovalentních RNA-protein aduktů byla potvrzena western blotem, gelovou elektroforézou a hmotnostní analýzou, které byly prováděny za denaturačních podmínek.... Keywords: RNA; nukleotidy; biokonjugace; RNA; nucleotides; bioconjugations Available in a digital repository NRGL
Reaktivní modifikace RNA pro biokonjugace s proteiny a nové enzymové metody pro syntézu RNA s modifikovanými bázemi

This doctoral thesis focuses on the enzymatic synthesis of base-modified RNA probes with diverse functional groups, including reactive cross-linking, hydrophobic and fluorescent moieties, or affinity ...

Brunderová, Mária; Hocek, Michal; Míšek, Jiří; Vaňáčová, Štěpánka
Univerzita Karlova, 2024

Vlastnosti druhů půdní fauny a funkce ekosystémů během obnovy po velkých disturbancích
Salazar Fillippo, Andres Alberto; Frouz, Jan; Tajovský, Karel; Józefowska, Agnieszka
2024 - English
Growing evidence indicates that interactions between above and belowground communities are essential for healthy and functioning ecosystems. This, however, has exposed a disproportionate knowledge gap in soil communities, which remain poorly understood both at a taxonomic and ecological level when compared to their aboveground counterpart. Studying assembly processes of communities along with structuring forces driving these changes facilitate observing key dynamics within the ecosystem. For this reason, three out of four manuscripts included in the current thesis focus on chronosequences in different successional stages after restoration of major disturbances. The first chronosequence consisted of four sites (10 years, 30 years, 50 years, and a >100 years reference site) in heathlands restored using top-soil removal from North- East Belgium. Here I studied trait assemblages of oribatid mite communities that revealed different ecomorphological groups changing with time during succession, and we also quantitatively assessed the contribution of phoresy via rodents to the dispersal of oribatid mites between restored sites. In the second chronosequence on spoil heaps from the mining district of Sokolov (Czech Republic) with sites ranging from 1 to 41 years, I identified explicit relationships between... Stále více důkazů naznačuje, že interakce mezi nadzemními a podzemními společenstvy jsou nezbytné pro zdravé a fungující ekosystémy. To však odhalilo neúměrnou mezeru ve znalostech o půdních společenstvech, která jsou ve srovnání se svými nadzemními protějšky stále nedostatečně prozkoumána jak na taxonomické, tak na ekologické úrovni. Studium procesů při vzniku společenstev spolu se strukturními silami, které změny ve společenstvech pohánějí, usnadňuje pozorování klíčové dynamiky v ekosystému. Z tohoto důvodu se tři ze čtyř rukopisů zahrnutých do této práce zaměřují na chronosekvence v různých sukcesních stadiích po obnově velkých disturbancí. První chronosekvence se skládala ze čtyř lokalit (10 let, 30 let, 50 let a referenční lokalita >100 let) ve vřesovištích obnovených odstraněním ornice ze severovýchodní Belgie. Zde jsem studoval znaky společenstev pancířníků (Oribatida), které odhalily různé ekomorfologické skupiny měnící se s časem během sukcese, a také jsem kvantitativně hodnotil podíl foresie prostřednictvím hlodavců na šíření pancířníků mezi obnovenými lokalitami. Ve druhé chronosekvenci na výsypce v těžební oblasti Sokolov (Česká republika) s lokalitami o stáří v rozmezí od 1 do 41 let jsem identifikoval explicitní vztahy mezi specifickými znaky pancířníků a parametry prostředí, což dále... Keywords: Soil fauna; post-mining chronosequences; community assembly; traits; belowground interactions; bioindication; microarthropods Available in a digital repository NRGL
Vlastnosti druhů půdní fauny a funkce ekosystémů během obnovy po velkých disturbancích

Growing evidence indicates that interactions between above and belowground communities are essential for healthy and functioning ecosystems. This, however, has exposed a disproportionate knowledge gap ...

Salazar Fillippo, Andres Alberto; Frouz, Jan; Tajovský, Karel; Józefowska, Agnieszka
Univerzita Karlova, 2024

About project

NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web

Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz

Provider

http://www.techlib.cz

Facebook

Other bases