Yes (1525)
No (465)
Used filters
(2)
Number of found documents:
1990
Published from
to
Robotem asitovaný laparoskopický staging karcinomu endometria daVinci S systémem
MAREK, Radim; ŠPAČEK, Jiří; WEINBERGER, Vít; PILKA, Radovan
2019 - Czech
Tato práce je zaměřena na komplexní vyhodnocení modality roboticky asistované laparoskopie daVinci S systémem v managementu chirurgického stagingu časných stádii karcinomu endometria. Danou modalitu chirurgického přístupu jsme studovali z tří různých pohledu, které byly cílem této práce. V první fázi byl výzkum práce zaměřen na proveditelnost roboticky asistované laparoskopické operace na základě perioperačních a pooperačních výstupy a zároveň jsme provedli zhodnocení z hlediska získávání erudice v dané technice na základě porovnání prvních 30 a posledních 30 případů operovaných pacientek z první stovky provedených operací. V druhé fázi jsme se soustředili na operační tkáňové trauma vznikající při tomto rozsáhlém výkonu. Srovnávali jsme míru operačního traumatu u žen, které podstoupily radikální stagingový výkon z důvodu karcinomu endometria, při různých operačních přístupech (konvenční laparoskopii s vaginální asistencí, roboticky asistované laparoskopii, klasické laparotomické operaci). Na základě klinických vyšetření a laboratorních parametrů jsme prováděli objektivní zhodnocení operačního traumatu a jeho dopad na imunitní a pro-inflamatorní reakci organismu. Ve třetí fázi této práce se zaměřuji na hodnocení rozdílných přístupů v dokování robotického systému při provádění multikvadrantového stagingového výkonu. Srovnali jsme vliv jednoduchého a duálního dokování robotického systému da Vinci S na rozsah provedení stagingové para-aortální lymfadenektomie. This project is focused for complex appraisal of robotically assisted surgery in patient with early stages of endometrial cancer. This type of surgery was evaluated from different point of view. I. To describe and evaluate our experience with robotically assisted laparoscopic staging of endometrial cancer in first hundred cases as compared with the first and last 30 cases of patients staged by this method. II. To study inflammatory response and nutritional biomarkers in operated endometrial cancer (EC) patients. III. To compare two different methods of staging robotic transperitoneal paraaortic lymphadenectomies in patients with early stages of endometrial cancer.
Keywords:
da Vinci S systém; robotická chirurgie; karcinom endometria; da Vinci S systém; robotic surgery; endometrial cancer
Available in digital repository of UPOL.
Robotem asitovaný laparoskopický staging karcinomu endometria daVinci S systémem
Tato práce je zaměřena na komplexní vyhodnocení modality roboticky asistované laparoskopie daVinci S systémem v managementu chirurgického stagingu časných stádii karcinomu endometria. Danou modalitu ...
Identifikace cílů protinádorových léčiv proteomickými metodami
RYLOVÁ, Gabriela; BOUCHAL, Jan; ULDRIJAN, Stepjan; DŽUBÁK, Petr
2019 - English
Tato práce je zaměřena na identifikaci cílů protinádorových léčiv. V teoretické části jsou popsány metody, které se k odhalení cílů a mechanismů účinků léčiv používají. Experimentální část je rozdělena do dvou částí podle dvou projektů. První projekt se zabývá identifikací molekulárního cíle chinolonových derivátů. Využívali jsme zde metody afinitní purifikace spojené s hmotnostní spektrometrií pro identifikaci cílů, dále pro validaci jsme použili enzymatické eseje, analýzu metabolitů a izotermální titrační miktokalorimetrii. Podařilo se nám identifikovat molekulární cíl elongační faktor 1 alfa 1 a objasnit dopady léčby touto látkou na buněčné mechanismy. Druhým projektem je identifikace molekulárního mechanismu nukleosidového analoga AB61. Cílem bylo zjistit, který proces tato molekula cílí a jaký je mechanismus účinku. Zjistili jsme, že studovaná látka AB61 není účinně fosforylována ve fibroblastech, na rozdíl od nádorových buněk. Dále jsme potvrdili, že templátová RNA s inkorporovaným cytostatikem inhibuje translaci. Při studii jsme použili metody hmotnostní spektrometrie spojené s UPLC a analýzu protoesyntézy. The thesis is focused on identification of targets of two selected anticancer compounds. In the theoretical part, methods used for drug target identification are described. Experimental part is divided into two parts corresponding to two projects. The first project is focused on identification of molecular target of quinolone derivatives. We have used affinity purification coupled to mass spectrometry for identification. Further, we have used enzymatic assays, metabolite analysis and isothermal titration microcalorimetry for validation. We have succeeded in identification of the elongation factor 1 alpha 1 as the molecular target of compound 3 and explain how these compound affect cell mechanisms. The second project was focused on identification of molecular mechanism of AB61 nucleoside analogue. The aim was to find the target process that is affected by the compound and describe the mechanism of its action. We have found inefficient phosphorylation of AB61 in fibroblasts compared to cancer cells. Further, we have described that template RNA with incorporated cytostatic inhibits translation. We have used mass spectrometry coupled to UPLC and analysis of proteosynthesis for this purpose.
Keywords:
chinolony; identifikace molekulárních cílů; elongační faktor; afinitní purifikace; translace; nukleosidová cytostatika; quinolones; molecular target identification; elongation factor; affinity purification; translation; nucleoside cytostatics
Available in digital repository of UPOL.
Identifikace cílů protinádorových léčiv proteomickými metodami
Tato práce je zaměřena na identifikaci cílů protinádorových léčiv. V teoretické části jsou popsány metody, které se k odhalení cílů a mechanismů účinků léčiv používají. Experimentální část je ...
Netradiční metody vyučování matematice jako prostředek zlepšení vztahů ve třídě
BORŮVKOVÁ, Radka; EMANOVSKÝ, Petr
2019 - Czech
Budování a znalost vztahů v třídním kolektivu je důležitá pro všechny učitele. Klima třídy a vztahy mezi spolužáky mohou ovlivnit celkové fungování třídy, práci v hodinách, schopnost se domluvit a spolupracovat. Pro správné fungování třídy jako skupiny by snahou každého učitele mělo být posilování pozitivních vztahů mezi žáky, motivace a začlenění osamocených žáků. Disertační práce se zabývá zkoumáním vlivu užití netradičních vyučovacích metod v matematice na zlepšení vzájemných vztahů ve třídě. Zvláštní pozornost je zde věnována problematice izolovaných žáků a možnostem jejich začlenění do třídního kolektivu pomocí skupinové a kooperativní výuky. Prostředkem ke zjištění vlivu těchto metod na vztahy v třídním kolektivu posloužily sociometrické metody s dotazníkem B-3. Užitím Wilcoxonova statistického testu bylo ověřeno, že počty izolovaných žáků po použití netradičních metod výuky byly statisticky významně nižší než před jejich použitím. Práce rovněž obsahuje hodnocení postoje žáků ke skupinové práci v matematice užitím metody sémantického diferenciálu a průzkumu názorů prostřednictvím cíleně formulovaných otázek. Součástí práce bylo také vytvoření nového návrhu projektu a návrhu skupinové práce. Building and knowing relationships in the classroom is important for all teachers. Classroom climate and classmates' relationships can affect the overall functioning of the classroom, work in hours, ability to communicate and collaborate. Each teacher should strive to strengthen the positive relationships between the pupils, the motivation and the inclusion of single pupils for the proper functioning of the class as a group. The dissertation deals with the study of the influence of the use of non-traditional teaching methods in mathematics to improve the class relations. Special attention is paid to the problems of isolated pupils and the possibilities of their integration into the classroom by means of group and cooperative teaching. To assess the effect of these methods with regard to the relationships in the class was used sociometrical surveys with questionnaire B -3. Using the Wilcoxon statistical test, it was verified that the numbers of isolated pupils after using non-traditional teaching methods were statistically significantly lower than before their use. The work includes an assessment of pupils' attitude to group work in mathematics using the semantic differential method and survey of opinions through specifically formulated questions. The work also included the creation of a new project proposal and group work.
Keywords:
skupinové vyučování; kooperativní učení; vztahy žáků ve třídě; sociometrický dotazník; izolovaní žáci; klima třídy; sémantický diferenciál; small group learning methods; coopearative learning; learners' relationships; sociometric methods; isolated learners; classroom climate; semantic differential
Available in digital repository of UPOL.
Netradiční metody vyučování matematice jako prostředek zlepšení vztahů ve třídě
Budování a znalost vztahů v třídním kolektivu je důležitá pro všechny učitele. Klima třídy a vztahy mezi spolužáky mohou ovlivnit celkové fungování třídy, práci v hodinách, schopnost se domluvit a ...
Zdokonalení časné diagnostiky invazivní plicní aspergilózy způsobené Aspergillus funigatus pomocí specifických biomarkerů ze séra a moče
DOBIÁŠ, Radim; RŮŽIČKA, Filip; HUBÁČEK, Petr; HAMAL, Petr
2019 - Czech
Detekce sérových galaktomananů (GM) a (1-3) -?-D-glukanů (BG) je považována za užitečnou pro diagnostiku invazivní plicní aspergilózy (IPA) u neutropenických pacientů. Doposud pouze několik studií hodnotilo tyto biomarkery u non-neutropenických pacientů, kteří byli v podezření z IPA. Cílem této studie bylo vyhodnotit přínos obou testů společně s testem detekce IgA a IgG (IgAG) specifických k Aspergillus fumigatus pro sérologickou diagnostiku IPA u non-neutropenických pacientů. Dalšími intra a extracelulárními biomarkery hub, které byly využity v této práci jsou siderofory. Siderofory jsou molekuly s nízkou molekulovou hmotností které chelatující železo a jsou vylučované různými skupinami bakterií a hub. Tyto molekuly by mohly být využity jako časný vysoce specifický biomarker IPA. GM, BG, IgAG: Séra 87 pacientů s podezřením na IPA byla analyzována retrospektivně. Pacienti byli zařazeni do skupin s prokázanou IPA (n = 10), pravděpodobnou IPA (n = 31), pacienti bez IPA nebo kolonizovaní A. fumigatus (n = 46). Při použití testů GM, BG a IgAG u pacientů zařazených do studie byla senzitivita / specificita / pozitivní prediktivní hodnota (PPH) / negativní prediktivní hodnota (NPH) 48,8 % / 91,3 % / 83,3 % / 66,7 %, 82,9 % / 73,9 % / 73,9 % / 82,9 % a 75,6 % / 95,7 % / 93,9 % / 81,5 %. Nejvyšší specificita a PPH byla dosažena stanovením IgAG. Zvýšení senzitivity a NPH bylo dosaženo pomocí metody "alespoň jeden pozitivní test" s testy GM a BG, přičemž hodnoty senzitivity / specificity / PPH / NPH byly 85,0 % / 69,6 % / 71,4 % / 84,2 %. Nicméně nejvyšší senzitivita a NPH byla dosažena metodou "alespoň jeden pozitivní test" při kombinaci testů GM, BG a IgAG (97,6 % a 96,8 %). Zapojení testu IgAG vylepšuje diagnostiku IPA u non-neutropenických pacientů tím, že zvýší senzitivitu a NPH analýzy v kombinaci s testováním GM nebo BG, zejména v případě, když existují pochybností v diagnóze IPA. TAFC: Do studie bylo zařazeno osm pacientů z jednotek intenzivní péče s podezřením na IPA. Hmotnostní spektrometrie byla pro IPA citlivějším nástrojem než detekce GM ve dvou případech. Pro IPA způsobenou A. fumigatus byl TAFC dominantním biomarkerem, který prokázán metodou HPLC / ESI-FTICR. Stanovení koncentrace TAFC z moči může být užitečné v diagnostice IPA jako test suplementární či alternativní k v současnosti hojně využívanému průkazu GM v séru u neutropenických pacientů. V případě non-neutropenických pacientů by měl průkaz TAFC v moči lépe, časněji a citlivěji identifikovat IPA než je tomu v případě GM. Detection of serum galactomannan (GM) and (1-3)-?-D-glucan (BG) is considered useful for non-culture diagnosis of invasive pulmonary aspergillosis (IPA) in neutropenic patients. Only few studies evaluated these seromarkers in non-neutropenic patients suspected for having IPA. The aim of this study was to evaluate both tests together with the Aspergillus fumigatus-specific serum IgG and IgA (IgAG) test for serological IPA diagnosis in non-neutropenic patients. Other intracellular and extracellular fungi biomarkers used in this work are siderophores. Siderophores are low molecular weight chelating molecules secreted by various groups of bacteria and fungi that could be used as an early highly specific biomarker of IPA. GM, BG, IgAG: Sera from 87 patients suspected of having IPA were retrospectively analyzed. Patients were categorized into groups of proven IPA (n=10), pravděpodobná (AspICU) IPA (n=31), and non-IPA colonization (n=46). When the GM, BG, and IgAG assays were used for patients included in the study, the sensitivity/specificity / positive predictive value (PPV) / negative predictive value (NPV) were 48.8 %/91.3 %/83.3 %/66.7 %, 82.9 %/73.9 %/73.9 %/82.9 %, and 75.6 %/95.7 %/93.9 %/81.5 %, respectively. Thus, the highest specificity and PPV were confirmed for the IgAG assay. Improvements in the sensitivity and NPV were achieved by "at least one positive" analysis with the GM and BG assays, with the sensitivity/specificity/PPV/NPV values being 85.0 %/69.6 %/71.4 %/84.2 %. Nevertheless, the highest sensitivity and NPV were achieved by the "at least one positive" analysis combining the GM, BG, and IgAG tests (97.6 % and 96.8 %, respectively). The involvement of the IgAG assay could improve IPA diagnosis in non-neutropenic patients by increasing the sensitivity and NPV when combined with the GM or BG assays. Further improvement was achieved by combining the GM, BG, and IgAG assays using the "at least one positive test" strategy, especially if doubt exists. TAFC: The study included seven patients from intensive care units that were suspected of IPA. Results of TAFC detection by Mass spectrometry was more sensitive to IPA than GM detection in two cases. For the A. fumigatus-induced IPA, TAFC was the dominant biomarker that could easily be detected by HPLC / ESI-FTICR. Determination of TAFC concentration from urine may be useful in the diagnosis of IPA as an adequate specific test for the currently widely used serum GM in neutropenic patients, and in the case of non-neutropenic patients, urinary TAFC should be better, more timely and more sensitive to IPA.
Keywords:
invazivní plicní aspergilózy; A. fumigatus; galaktomanan; 1;3-?-d-glukan; specifické IgA a IgG proti A. fumigatus; triacetylfusarinin C; invasive pulmonary aspergillosis; A. fumigatus; galactomannan; 1;3-?-d-glucan; A. fumigatus specific IgA and IgG; triacetylfusarinin C
Available in digital repository of UPOL.
Zdokonalení časné diagnostiky invazivní plicní aspergilózy způsobené Aspergillus funigatus pomocí specifických biomarkerů ze séra a moče
Detekce sérových galaktomananů (GM) a (1-3) -?-D-glukanů (BG) je považována za užitečnou pro diagnostiku invazivní plicní aspergilózy (IPA) u neutropenických pacientů. Doposud pouze několik studií ...
Study of the Ligand Specificity of Cytokinin Receptors
HLUSKOVÁ, Lucia; SPÍCHAL, Lukáš; SPÍCHAL, Lukáš
2019 - English
Cytokiníny patria medzi dôležité rastlinné hormóny, ktoré sú prijímané hybridnými histidinovými kinázami. Receptory cytokinínov už boli identifikované a charakterizované medzi mnohými modelovými rastlinami. Identifikovali sme 5-člennú rodinu cytokinínových receptorov u agronomicky dôležitej plodiny repky olejnej (Brassica napus). Naklonovali sme 3 receptory (BnCHK1, 3, 5) a určili ich väzbovú špecifitu. Štruktúra cytokinín-vnímajúcej CHASE domény už bola vopred objasnená, ale ostáva nejasný mechanizmus aktivácie receptora a prenos signálu cez membránu. Dva leucíny tvoria platformu v tvare písmena C, ktorá interaguje s N9 atómom na molekule cytokinínu. Na potvrdenie dôležitosti tejto väzby sme nasyntetizovali 9-deaza analógy cytokinínov a testovali sme ich vplyv na afinitu a aktiváciu CRE1/AHK4. Vnesením bodových mutácií do vnútra CHASE domény CRE1/AHK4 sme analyzovali dôležitost konzervovaných zvyškov vo väzbovom mieste. Využili sme miestne riadenú mutagenézu za účelom zmeny preferencie ligandov špecifickejšie k vlastnostiam AHK3. The important plant hormones cytokinins are perceived by hybrid histidine kinases. The cytokinin receptors have been identified and characterised already in many model plants. Here, we have identified 5 memberfamily of cytokinin receptors in agronomically important plant Brassica napus. We have cloned three receptors (BnCHK1, 3, 5) and determined their ligand specificity. The structure of the cytokinin-sensing CHASE domain has been elucidated previously, but the mechanism of activation of the receptor and of the transfer of the signal accross the membrain is still unclear. Two leucines form a C-shaped docking platform interacting with the N9 atom of bound cytokinin. To confirm importance of this bond, we have synthesised 9-deaza-analogues of cytokinins and tested its influence on affinity and activation of CRE1/AHK4. To analyse the importance of conserved residues in the binding pocket, point mutations within the CHASE domain of CRE1/AHK4 were introduced. Side-directed mutagenesis was used to change the ligand preference to obtain an AHK3-like profile.
Keywords:
cytokiníny; viažuca doména recepora; aktívne miesto; arábkovka Thalova (Arabidopsis thaliana); repka olejná (Brassica napus); histidinkináza; Cytokinins; Receptor Binding Domain; Active Site; Arabidopsis thaliana; Brasica napus; Histidine Kinases
Available in digital repository of UPOL.
Study of the Ligand Specificity of Cytokinin Receptors
Cytokiníny patria medzi dôležité rastlinné hormóny, ktoré sú prijímané hybridnými histidinovými kinázami. Receptory cytokinínov už boli identifikované a charakterizované medzi mnohými modelovými ...
Rezistentní arteriální hypertenze a obstrukční spánková apnoe
KAMASOVÁ, Monika; HEINC, Petr; TURČÁNI, Pavel; VÁCLAVÍK, Jan
2019 - Czech
Obstrukční spánková apnoe (OSA) je jednou z nejčastějších příčin sekundární hypertenze. U rezistentních hypertoniků je důležité vyloučit OSA jako možnou sekundární příčinu hypertenze. Noční monitorace přístrojem ApneaLink je jednoduché a dostupné ambulantní vyšetření, ale efektivita této metody nebyla u specifické populace rezistentních hypertoniků dosud zhodnocena. V této práci jsou shrnuty aktuální poznatky z výzkumu diagnostiky obstrukční spánkové apnoe u rezistentních hypertoniků a prezentovány výsledky naší studie. Cílem naší práce bylo u pacientů s rezistentní arteriální hypertenzí porovnat výsledky skríningového ambulantního vyšetření ApneaLink s noční monitorací respirační polygrafií a srovnat jednotlivé parametry OSA. Obstructive sleep apnea (OSA) is one of the most common causes of secondary arterial hypertension. It is important to rule out OSA as a cause of resistant hypertension. The ApneaLink device is a simple and cost-efficient outpatient examination, but its usefulness in screening OSA in resistant hypertension has not yet been evaluated. This paper summarizes current findings from the research on the diagnosis of obstructive sleep apnea in resistant hypertensive patients, where the results of our study are presented. The aim of our study was to compare the results of screening using the outpatient bedside monitoring device ApneaLink with the results of respiratory polygraphy in patients with resistant hypertension. We also compared and correlated the severity of OSA with the anthropometric measurements.
Keywords:
rezistentní arteriální hypertenze; obstrukční spánková apnoe; noční hypertenze; skríning spánkové apnoe; resistant arterial hypertension; obstructive sleep apnea; nocturnal hypertension; screening of sleep apnea
Available in digital repository of UPOL.
Rezistentní arteriální hypertenze a obstrukční spánková apnoe
Obstrukční spánková apnoe (OSA) je jednou z nejčastějších příčin sekundární hypertenze. U rezistentních hypertoniků je důležité vyloučit OSA jako možnou sekundární příčinu hypertenze. Noční monitorace ...
Vývoj radionuklidových a ultrazvukových nálezů u pacientů po operaci kojenecké hydronefrózy - dlouhodobé výsledky
ŠARAPATKA, Jan; BROĎÁK, Miloš; ŠVIHRA, Ján; ŠMAKAL, Oldřich
2019 - Czech
V současné době se diagnostika obstrukce pelviureterální junkce (PUJ) opírá o morfologické vyšetření ledvin pomocí ultrazvuku (UZ), funkční a drenážní parametry se hodnotí pomocí scintigrafie. Přetrvávají dva názory na léčbu obstrukce PUJ. Jedna skupin autorů zastává konzervativní postup, tedy sledování dětí s prokázanou obstrukcí, přičemž k operačnímu řešení přistupují až po poklesu ledvinné funkce během sledování. Druhá skupina se kloní k časné operaci u dětí s prokázanou obstrukcí PUJ. Currently, diagnosis of ureteropelvic junction obstruction (UPJ) is based on morphological examination of the kidney by ultrasound (US), functional and drainage parameters are evaluated by renal scan. Two views persist on the treatment options of UPJ obstruction. One group of authors maintains a conservative approach, by following-up children with proven obstruction, while the operative solution being approached only after the renal function has decreased during follow-up. The second group of authors tends to early surgery in children with proven UPJ obstruction.
Keywords:
hydronefróza; obstrukce pelviureterální junkce; pyeloplastika; ultrazvuk; relativní funkce; hydronephrosis; ureteropelvic junction obstruction; pyeloplasty; ultrasound; split renal function
Available in digital repository of UPOL.
Vývoj radionuklidových a ultrazvukových nálezů u pacientů po operaci kojenecké hydronefrózy - dlouhodobé výsledky
V současné době se diagnostika obstrukce pelviureterální junkce (PUJ) opírá o morfologické vyšetření ledvin pomocí ultrazvuku (UZ), funkční a drenážní parametry se hodnotí pomocí scintigrafie. ...
Lidský papilomavirus a jeho význam pro diagnosticko-léčebnou rozvahu
JAWOREK, Hana; PROCHÁZKA, Martin; UVÍROVÁ, Magdalena; KOUDELÁKOVÁ, Vladimíra
2019 - Czech
Screening cervikálního karcinomu pomocí HPV diagnostiky doplněné triážovými testy pravděpodobně nahradí screening založený na cytologickém vyšetření ve všech rozvinutých zemích světa. Zásadní výhodou HPV screeningu je vysoká negativní prediktivní hodnota vyšetření po dobu 5 let, což umožňuje prodloužit screeningový interval. HPV testy však nejsou schopny rozlišit přechodnou a transformující HPV infekci, proto je nezbytné je doplnit triážovými testy. Na základě výsledku triážového testu jsou ze skupiny HPV pozitivních žen ke kolposkopii s biopsií odeslány pouze ženy s vysokým rizikem vzniku pokročilých přednádorových lézí nebo cervikálního karcinomu. HPV detekci je na rozdíl od cytologického vyšetření možné použít k vyšetření vzorků získaných samoodběrem. Možnost samoodběru pro ženy, které se cervikálního screeningu neúčastní, se v řadě studií ukázala natolik slibnou, že ji některé země implementovaly do screeningového programu. V současné době je v České republice cervikální screening stále založen na cytologickém vyšetření, doplnění HPV testem pouze v případech s abnormální cytologií s neznámým významem (ASC-US). Prvním projektem této práce byla pilotní studie zaměřená na využití samoodběrových souprav a HPV diagnostiky pro cervikální screening v České republice. Z rozeslaných 215 samoodběrových sad bylo k analýze doručeno 174 (81%) cervikovaginálních stěrů. Všechny vzorky byly odebrány správně a bylo možné je vyšetřit cobas 4800 HPV testem. PapilloCheck? HPV-Screening systémem bylo možné za zisku validního výsledku vyšetřit 98 % vzorků. Přítomnost hrHPV byla detekována u 24 % vzorků a přítomnost pouze lrHPV byla nalezena v dalších 4 % případů. Ženy dotázané na svou zkušenost se samoodběrovou sadou ji hodnotily jako dobrou až výbornou. Návod k použití Evalyn? Brush byl považován za dobrý až vynikající všemi ženami. Většina žen z tohoto souboru (88 %) by dala přednost samoodběru před odběrem vzorku lékařem. Vzhledem k tomu, že byla možnost samoodběru českými ženami velmi dobře přijata, mohlo by zavedení samoodběru jako způsobu účasti na cervikálním screeningu, vést k významnému zvýšení návštěvnosti tohoto programu. Další projekt této disertační práce byl zaměřen na přímé porovnání detekce HPV16, HPV18 a skupiny dalších 12 hrHPV genotypů pomocí metod cobas? 4800 HPV Test, PapilloCheck? HPV-Screening a LMNX Genotyping Kit HPV GP. HPV DNA byla detekována ve 21,2 % vzorků, z toho u 21 % (251 z 1.196) cervikálních stěrů a 22,7 % (40 ze 176) cervikovaginálních stěrů. Celkově, nevyšší sensitivity (0,983) a specificity (0,992) pro detekci hrHPV dosahoval cobas? 4800 HPV Test. PapilloCheck? HPV-Screening and LMNX Genotyping Kit HPV GP dosahovaly porovnatelné specificity jako cobas? 4800 HPV Test (0,989 vs. 0,955), ale nižší sensitivity (0,897 vs. 0,909). Cobas? 4800 HPV Test dosahoval také nejvyšší sensitivity (0,980) a specificity (0,994) pro detekci hrHPV u cervikálních stěrů odebraných gynekologem. Při vyšetření cervikovaginálních stěrů, získaných pomocí samoodběrové sady, byla nejvyšší sensitivita pozorována rovněž u cobas? 4800 HPV Test (1,00), nejvyšší specificity (0,993) však dosahovala metoda PapilloCheck? HPV-Screening. Všechny testované metody vykazovaly vysokou sensitivitu i specificitu při analýze cervikálních stěrů odebraných gynekology i cervikovaginálních stěrů získaných pomocí samoodběrové sady. HPV testing with triage of HPV positive women will probably replace cytology based primary cervical cancer screening in all developed countries. The main advantage of HPV screening is a high negative predictive value of HPV test for the next 5 years which allows extension of the screening period. Nevertheless, HPV tests are not able to distinguish transient and transforming HPV infection. That is why another test is needed to triage HPV positive women. Triage test should distinguish women at high risk of high-grade cervical neoplasia and refer them to colposcopy with biopsy. In contrast with cytology, testing of self-samples using HPV tests have comparable sensitivity and specificity to testing clinician acquired samples. The possibility of self-sampling is a promising option for screening non-attenders. Several countries already implemented self-sampling to their cervical cancer screening program. Current cervical cancer screening in the Czech Republic is cytology-based, using HPV test only in cases with atypical squamous cells of undetermined significance (ASC-US). The first project of this thesis was pilot study to get initial experience with alternative sampling (self-sampling) for HPV testing as the means of cervical cancer screening program in the Czech Republic. One hundred seventy-four of 215 (81%) distributed self-sampling devices have been delivered to analysis. All cervicovaginal swabs were sampled correctly and it was possible to analyze them by cobas 4800 HPV test. Similarly, 98% samples were analyzable by PapilloCheck? HPV-Screening. High risk HPV infection was present in 24% of samples, and low risk HPV infection was detected only in 4% of samples. Majority (98%) of women rated their experience with self-sampling device as good to excellent. User manual of self-sampling device was considered good to excellent by all women (100%). As expected, most of the women (88%) preferred self-sampling to physician sampling. Cervicovaginal self-sampling was accepted by Czech women very well. The self-sampling as an opportunity to participate in cervical cancer screening could increase the attendance of the screening program. The second project of the thesis was focused on a head-to-head comparison of HPV16, HPV18 and pool of other 12 high risk HPVs detection using cobas? 4800 HPV Test, PapilloCheck? HPV-Screening, and LMNX Genotyping Kit HPV GP. HPV DNA was detected in 21.2% of all samples, 21% of cervical swabs (251 of 1,196) and 22.7% of cervicovaginal swabs (40 of 176). The cobas 4800 HPV Test was the most sensitive (0.983) and specific (0.992) for hrHPV detection overall. The PapilloCheck HPV-Screening and LMNX Genotyping Kit HPV GP had comparable specificity with that of the cobas (0.989 and 0.955, respectively), but lesser sensitivity (0.897 and 0.909, respectively). In physician-obtained cervical swabs, the cobas showed the highest sensitivity and specificity (0.980 and 0.994, respectively) for hrHPV detection, whereas in cervicovaginal swabs, the cobas had the highest sensitivity (1.00), but the PapilloCheck had the highest specificity (0.993). In conclusion, all of the detection methods evaluated were highly sensitive and specific for hrHPV detection from both clinician-collected cervical swabs and self-sampled cervicovaginal swabs.
Keywords:
lidský papilomavirus; screening cervikálního karcinomu; samoodběr; PCR; human papillomavirus; cervical cancer screening; self-sampling; PCR
Available in digital repository of UPOL.
Lidský papilomavirus a jeho význam pro diagnosticko-léčebnou rozvahu
Screening cervikálního karcinomu pomocí HPV diagnostiky doplněné triážovými testy pravděpodobně nahradí screening založený na cytologickém vyšetření ve všech rozvinutých zemích světa. Zásadní výhodou ...
Testování citlivosti kryptických druhů aspergilů ze sekcí Fumigati a Nidulantes mikrodilučními standardizovanými metodami
LYSKOVÁ, Pavlína; RŮŽIČKA, Filip; ČERMÁK, Pavel; HAMAL, Petr
2019 - Czech
Aspergilóza je nejfrekventovanější systémovou infekcí vyvolanou vláknitými houbami a jejím nejčastějším etiologickým agens je A. fumigatus sensu stricto. Dalšími obvyklejšími původci humánních mykóz jsou A. nidulans, A. flavus, A. niger a A. terreus. Z taxonomického hlediska nejsou uvedené druhy samostatné, ale řadí se do sekcí (Fumigati, Nidulantes, Flavi, Nigri, Terrei), v nichž představují nečastější zástupce. V klinických vzorcích však mohou být přítomny kmeny, které morfologicky vypadají identicky, ve skutečnosti se však jedná o jiné druhy. Bývají označovány jako kryptické a v rutinních mykologických laboratořích jsou pomocí běžných identifikačních postupů, založených na morfologických znacích, velmi často nesprávně identifikovány. Důsledkem může být nezjištění jejich rezistence k antimykotikům, což je časté zejména v sekci Fumigati (např. u druhového komplexu A. viridinutans, A. lentulus, A. udagawae). Cílem předložené dizertační práce bylo zjistit antifungální profil testovaných kmenů pomocí standardizované metodiky a porovnat s komerční soupravou YO. Studováno bylo celkem 171 kmenů aspergilů sekce Fumigati (n=90) a Nidulantes (n=81), převážně kryptických druhů, jejichž identifikace byla ověřena molekulárně-genetickými metodami. Bylo provedeno testování citlivosti k AMB, VRC, ITC, POS a echinokandinům pomocí standardizované metodiky EUCAST a komerční diagnostické soupravy YO. Byly stanoveny MIC uvedených antimykotik a procentuální shoda obou metod. Většina zástupců sekce Fumigati, zejména komplexu A. viridinutans, vykazovala zvýšené hodnoty MIC k ITC a VRC, míra in vitro rezistence k AMB byla variabilní. Naopak k POS a echinokandinům byly izoláty obvykle dobře citlivé. Celkový antifungální profil se mezi jednotlivými druhy výrazně lišil a rovněž vnitrodruhová variabilita byla poměrně vysoká. Shoda MIC mezi EUCAST a YO byla u všech ATM poměrně vysoká, zejména v případě klinicky významných druhů (A. felis, A. udagawae a A. pseudoviridinutans). Důležitým zjištěním byla skutečnost, že YO často neodhalila zvýšené MIC k ITC. Všichni testovaní zástupci sekce Nidulantes obvykle vykazovali poměrně nízké hodnoty MIC ke všem testovaným azolovým ATM. V případě AMB měly kryptické druhy této sekce obvykle nižší hodnoty MIC v porovnání s A. nidulans sensu stricto. Shoda EUCAST a YO byla poměrně vysoká pro azolová antimykotika. U zástupců obou testovaných sekcí bylo dosaženo lepší shody po 72 než 48 h. Z výsledků vyplývá, že vzhledem ke zjištěné vysoké vnitrodruhové variabilitě MIC aspergilů z komplexu viridinutans je nezbytné pro jejich stanovení používat spolehlivé metody, které dokáží odhalit častou rezistenci k systémovým ATM. Výsledky hodnocení citlivosti in vitro jsou proto u těchto izolátů v podstatě důležitější než správná druhová identifikace. V případě sekce Nidulantes se většina testovaných zástupců kryptických druhů vyznačovala spíše srovnatelnými nebo dokonce nižšími hodnotami MIC v porovnání s hlavním představitelem, proto se jejich neodhalení nejeví jako zásadní problém. Aspergillosis is the most common systemic infection caused by filamentous fungi, and the most common etiologic agent is A. fumigatus sensu stricto. Other species frequently causing human infections are A. flavus, A. nidulans, A. niger and A. terreus. Taxonomically, these species do not stand alone but are classified into sections (Fumigati, Nidulantes, Flavi, Nigri, Terrei) in which they are the most common representatives. In clinical specimens, however, strains may be present that morphologically appear to be identical but they actually belong to different species. These are called cryptic species and are very often misidentified using conventional morphological identification techniques. As a result, their antifungal resistance may not be detected, as frequently seen in the section Fumigati (e.g. A. viridinutans species complex, A. lentulus, A. udagawae). The aim of the study was to determine the antifungal profile of the tested strains using standardized methodology and to compare it with the commercial kit YO. A total of 171 Aspergillus strains were studied, predominantly cryptic agents from the sections Fumigati (n = 90) and Nidulantes (n = 81), whose identification was confirmed by molecular-genetic methods. Susceptibility to AMB, VRC, ITC, POS and echinocandins was tested in accordance with the EUCAST standardized methodology and with the YO commercial panel. MICs for the above antifungals were determined and percentage agreement for the two methods was calculated. Most isolates from the section Fumigati, in particular A. viridinutans species complex, demonstrated elevated MICs for ITC and VRC, in vitro resistance to AMB was variable. In contrast, the isolates mostly showed good susceptibility to POS and echinocandins. There were considerable differences in the overall antifungal profile between the species, and intraspecific variation was relatively high. The agreement between the YO and the EUCAST method was high, especially for clinically important species (A. felis, A. udagawae, and A. pseudoviridinutans). Importantly, however, the YO frequently failed to detect elevated MICs of ITC. All the tested strains from the section Nidulantes usually exhibited relatively low MIC values for all azole antifungals. Concerning AMB, cryptic species from the section typically had lower MICs compared to A. nidulans sensu stricto. The agreement between the YO and EUCAST was relatively high for azole antifungals. For both sections, better agreement was observed after 72 hours than after 48 hours. The result suggest that given the detected high intraspecific variability in MICs for strains from the A. viridinutans species complex, reliable methods for MIC determination able to reveal early resistance to systemic antifungals are needed. Therefore, in vitro susceptibility testing results are more important than correct species identification in case of these isolates. Since most of the tested cryptic species from the section Nidulantes showed comparable or even lower MIC values compared to the main representative, the failure to detect them does not seem to be a major problem.
Keywords:
Aspergillus; kryptické druhy; EUCAST; Sensititre YestOne; amfotericin B; vorikonazol; itrakonazol; posakonazol; Aspergillus; cryptic species; EUCAST; Sensititre YestOne; amphotericin B; voriconazole; itraconazole; posaconazole
Available in digital repository of UPOL.
Testování citlivosti kryptických druhů aspergilů ze sekcí Fumigati a Nidulantes mikrodilučními standardizovanými metodami
Aspergilóza je nejfrekventovanější systémovou infekcí vyvolanou vláknitými houbami a jejím nejčastějším etiologickým agens je A. fumigatus sensu stricto. Dalšími obvyklejšími původci humánních mykóz ...
Hodnocení ztrát ekosystémových služeb vlivem zástavby zemědělské půdy v ČR v kontextu udržitelného rozvoje
VRUBLOVÁ, Kateřina; MACHAR, Ivo
2019 - Czech
Hlavním cílem práce je zhodnotit, jaké ekosystémové služby poskytuje české společnosti zemědělská půda a odhadnout jaké je jejich finanční ocenění. V návaznosti na to určit, které ekosystémové služby zcela zanikají nebo jsou omezeny vlivem záborů zemědělské půdy pro výstavbu. Dále pak definovat, jaká hodnota těchto ekosystémových služeb zaniká a porovnat toto ohodnocení s hodnotou poplatku za trvalé vynětí půdy ze zemědělského půdního fondu, který se platí v současnosti. Výsledkem práce bude upravená metodika pro ohodnocení úbytku ekosystémových služeb vlivem zástavby zemědělské půdy a také odhad hodnoty ekosystémových služeb zaniklých při záboru zemědělské půdy v České republice v časovém horizontu let 1989 - 2015. Ekosystémové služby, tedy užitky poskytované společnosti přírodou, jsou v současnosti brány jako hlavní ukazatel toho, jakou hodnotu vyjádřenou ve finančních jednotkách nám poskytuje určitý typ ekosystému. Výpočet ekosystémové služby zemědělské půdy povede k upřesnění její součtové hodnoty v rámci České republiky. Praktické uplatnění této dizertační práce v sobě zahrnuje lepší pohled na funkci a hodnotu půdy, která zaniká při jejím zastavění a současně přiblížení této skutečnosti veřejnosti a změně pohledu na v současnosti vzrůstající trend zástavby půdy nezastavitelným tempem. Při zahrnutí výpočtu ekosystémových služeb do skladby poplatku za vynětí půdy ze zemědělského půdního fondu by také mohlo být docíleno lepší ochrany půdy a posílila by se snaha o rozvoj měst a obcí udržitelným způsobem bez nekontrolovatelného záboru půdy. The main goal of this thesis is to evaluate what ecosystem services are provided to Czech society by the agricultural land and assess their financial value and also evaluate which ecosystem services disappear or are limited due urban development on agricultural land. The next goal is then to define what financial value of these services has been lost and compare this loss to the payment for exclusion of land from agricultural land fund which are in effect today. The outcome of this thesis will be modified methodology for evaluating the loss of ecosystem services due to urban development on agriculture land and also value estimate of ecosystem services lost due to appropriation of agricultural land in the Czech Republic during years 1989 to 2015. Ecosystem services, therefore benefits provided to the society by nature, are today the main indicator of what financial value does each ecosystem have. The calculation of ecosystem services provided by the agriculture land will lead to specification of its overall value in the Czech Republic. The practical output of this thesis comprises of better insight on function and value of soil which is lost due to urban development and raising the awareness amongst the society on the fast growing trend of unsustainable urban development. By including the calculation of ecosystem services to the fee for exclusion of land from agricultural land fund a better protection of land might be achieved. It would also strengthen the pursuit of sustainable development of cities and villages without the uncontrolled urban sprawl.
Available in digital repository of UPOL.
Hodnocení ztrát ekosystémových služeb vlivem zástavby zemědělské půdy v ČR v kontextu udržitelného rozvoje
Hlavním cílem práce je zhodnotit, jaké ekosystémové služby poskytuje české společnosti zemědělská půda a odhadnout jaké je jejich finanční ocenění. V návaznosti na to určit, které ekosystémové služby ...
NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web
Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz
Provider
Other bases