Biometrické testování při studiu kognitivní zátěže v prostředí ArcGIS StoryMaps
BLAŽEK, Vojtěch
2022 - český Hlavním tématem předložené disertační práce je detailní analýza toho, jak žáci pracují s webovou mapovou aplikací ArcGIS StoryMaps, pomocí metod biometrického testování. Výběr tohoto tématu souvisí s rozvojem a větším zapojováním digitálních technologií do výuky, který byl akcelerován vypuknutím pandemie Covidu-19. Vliv digitálních technologií na současnost společnost zapříčinil novou průmyslovou revoluci 4.0, kdy většina pracovních procesů začíná být automatizována a řízena počítači. Tento trend se promítá i do reforem kurikulárních dokumentů po celém světě. Společným rysem kurikulárních reforem je zavádění digitálních kompetencí a změna pohledu na výuku informatiky. Tyto změny přenáší některé požadavky v oblasti digitálních kompetencí i na ostatní předměty včetně geografie. Úvodní teoretická část práce se věnuje transformaci kurikulárních dokumentů a vývoji GIS, včetně jeho vazbě na geografické vzdělávání v perspektivě 21. století. Nedílnou součástí je shrnutí dosavadních poznatků v oblasti kognitivní zátěže včetně možností jejího měření. Analytická část práce se zaměřuje na hodnocení dat naměřených pomocí systému Gazepoint. The main focus of the present dissertation is a detailed analysis of how students interact with the ArcGIS StoryMaps web mapping application using biometric testing methods. The choice of this topic is related to the development and greater involvement of digital technologies in education, which was accelerated by the outbreak of the Covid-19 pandemic. The impact of digital technologies on contemporary society has caused a new industrial revolution 4.0, where most work processes are becoming automated, and computer controlled. This trend is reflected in curriculum reforms around the world. A common feature of curriculum reforms is the introduction of digital competencies and a change in the way we view the teaching of computer science. These changes transfer some of the requirements in the area of digital competences to other subjects, including geography. The introductory theoretical part of the thesis is devoted to the transformation of curriculum documents and the development of GIS, including its relation to geographic education in the perspective of the 21st century. An integral part is a summary of the existing knowledge in the field of cognitive load, including the possibilities of its measurement. The analytical part of the thesis focuses on the evaluation of data measured by the Gazepoint system. Klíčová slova: Biometrické testování; eye-tracking; kognitivní zátěž; webový GIS; ArcGIS; ArcGIS StoryMaps; Biometric testing; eye-tracking; cognitive load; web GIS; ArcGIS; ArcGIS StoryMaps Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Biometrické testování při studiu kognitivní zátěže v prostředí ArcGIS StoryMaps

Hlavním tématem předložené disertační práce je detailní analýza toho, jak žáci pracují s webovou mapovou aplikací ArcGIS StoryMaps, pomocí metod biometrického testování. Výběr tohoto tématu souvisí s ...

BLAŽEK, Vojtěch
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Lentiviry malých přežvýkavců - analýza prevalence onemocnění a distribuce genotypů SRLV v chovech ovcí a koz v ČR
VERNEROVÁ, Kateřina
2022 - český Maedi-visna u ovcí a artritida a encefalitida u koz jsou celosvětově rozšířená, progresivní zánětlivá onemocnění způsobená retroviry, které patří do skupiny lentivirů malých přežvýkavců (SRLV). U postižených zvířat způsobují celoživotní infekce, které se vyznačují pomalou progresí až do zjevného onemocnění a končí vždy letálně. Cílem této práce bylo zjistit prevalenci onemocnění SRLV v ČR, pomocí fylogenetické analýzy zmapovat genotypové zastoupení SRLV a analyzovat TMEM154, jakožto vybraný kandidátní marker rezistence proti SRLV u ovcí a koz. Celkem bylo odebráno 3410 vzorků krve ovcí a koz z 21 stád. Zjištěná sérologická prevalence maedi visna u ovcí byla 19,9 % (556/2801) a séroprevalence artritidy a encefalitidy u koz byla 14,1 % (86/609). Všechna séropozitivní zvířata byla testována metodou nested polymerase chain reaction (nPCR) na přítomnost provirové DNA. Fylogenetická analýza identifikovala genotyp SRLV v 77 sekvencích, z nichž 60 vzorků ovcí a koz bylo genotypu A a 17 vzorků ovcí patřilo genotypu B. Zatímco všechny sekvence genotypu B byly klasifikovány jako subtyp B2, skupina izolátů genotypu A vykazovala vyšší variabilitu a byly příbuzné se subtypy A2 a A3. Dále bylo náhodně vybráno 40 séropozitivních vzorků a 50 séronegativních vzorků ovcí a koz cílem navrhnout metodiku pro LAMP diagnostiku SRLV u ovcí a koz. Séronegativita byla jednoznačně potvrzena metodou LAMP u všech vzorků, séropozitivní vzorky byly potvrzeny ve 31 případech ze 40 u ovcí i koz. Ke genotypizaci TMEM154 bylo náhodně vybráno 605 vzorků ovcí a 60 vzorků koz. Nejvíce séropozitivních zvířat bylo heterozygotních EK (61 %), homozygotních EE bylo 58 % a homozygotních KK bylo 45 %. U ovcí byly identifikovány všechny tři genotypy, zatímco všechny kozy byly homozygotní o genotypu EE. Maedi-visna in sheep, and arthritis and encephalitis in goats, are globally widespread and progressive inflammatory diseases caused by retroviruses belonging to the small ruminant lentivirus (SRLV) group. They cause lifelong infections in affected animals, characterised by slow progression to overt disease and are always fatal. The aim of this study was to determine the prevalence of SRLV disease in the Czech Republic, to map the genotypic representation of SRLV using phylogenetic analysis, and to analyse TMEM154 as a selected candidate marker of SRLV resistance in sheep and goats. A total of 3 410 sheep and goat blood samples were collected from 21 flocks. The seroprevalence of maedi-visna in sheep was found to be 19.9% (556/2801), and the seroprevalence of arthritis and encephalitis in goats was 14.1% (86/609). All seropositive animals were tested by nested polymerase chain reaction (nPCR) for the presence of proviral DNA. Phylogenetic analysis identified the SRLV genotype in 77 sequences, of which 60 sheep and goat samples were genotype A and 17 sheep samples were genotype B. While all genotype B sequences were classified as subtype B2, the group of genotype A isolates showed higher variability and were related to subtypes A2 and A3. In addition, 40 seropositive and 50 seronegative sheep and goat samples were randomly selected to design a methodology for LAMP (loop-mediated isothermal amplification) diagnosis of SRLV in sheep and goats. Seronegativity was clearly confirmed by the LAMP method in all samples, and seropositivity was confirmed in 31 out of 40 cases in both sheep and goats. 605 sheep and 60 goat samples were randomly selected for TMEM154 genotyping. Most seropositive animals were heterozygous EK (61%), 58% were homozygous EE, and 45% were homozygous KK. In sheep, all 3 genotypes were identified, while all goats were homozygous EE. Klíčová slova: maedi-visna; artritida a encefalitida koz; nPCR; LAMP; genotypizace; maedi-visna; goat arthritis and encephalitis; nPCR; LAMP; genotyping Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Lentiviry malých přežvýkavců - analýza prevalence onemocnění a distribuce genotypů SRLV v chovech ovcí a koz v ČR

Maedi-visna u ovcí a artritida a encefalitida u koz jsou celosvětově rozšířená, progresivní zánětlivá onemocnění způsobená retroviry, které patří do skupiny lentivirů malých přežvýkavců (SRLV). U ...

VERNEROVÁ, Kateřina
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Biodiversity of Myxozoa based on extensive screening of fish and environmental samples
LISNEROVÁ, Martina
2022 - anglický Myxozoans represent a group of morphologically simplified endoparasites infecting mainly fish, annelid and bryozoan hosts including more than 2,600 nominal species. However, the diversity seems to be unexplored and undervalued. Host searching and invasive dissection is a commonly used method for the identification of myxozoan species diversity. Metabarcoding and amplicon analyses of environmental DNA from sediment, water and soil is developing approach for biodiversity assessment and have been performed in many biological areas to identify the diversity of organisms, communities and populations. Using classical morphological and molecular approaches, we explored the myxozoan diversity in selected areas and host groups. In addition, we propose a new methodological approach for the studying of myxozoan diversity based on environmental DNA from sediment and amplicon sequencing. Illumina Mi-Seq with metabarcoding and newly designed primer sets is suitable for analyzing myxozoan communities without the need to find and capture intermediate or final hosts. Klíčová slova: Myxozoa; Diversity; Phylogeny; eDNA; elasmobranchs Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Biodiversity of Myxozoa based on extensive screening of fish and environmental samples

Myxozoans represent a group of morphologically simplified endoparasites infecting mainly fish, annelid and bryozoan hosts including more than 2,600 nominal species. However, the diversity seems to be ...

LISNEROVÁ, Martina
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Pastorace mládeže v českých a moravských diecézích. Pastorálně teologická analýza práce diecézních center života mládeže.
DUDOVÁ, Anna
2022 - český Disertační práce je tematicky zaměřena na pastoraci mládeže v českých a moravských diecézích. Cílem práce je přispět k reflexi pastorace mládeže v České republice, a to pomocí hlubší sondy do koncepce i praxe diecézních center života mládeže (DCŽM). Teologickým východiskem pro zpracování tohoto tématu jsou závazné dokumenty Německé biskupské konference (DBK), Italské biskupské konference (CEI) a Latinskoamerické biskupské konference (CELAM), které otevírají cestu k pokoncilnímu pojetí pastorace mládeže, které formulovali významní pastorální teologové jako Martin Lechner nebo Riccardo Tonelli. Zásady české pastorace mládeže jsou pak srovnány s výše uvedenými zahraničními dokumenty. Dále se pracuje také s ybranými výsledky výzkumných šetření provedených v prostředí aktivní katolické mládeže. Výsledkem je kritická analýza projektu diecézních center života mládeže a návrh jejich nové koncepce. The dissertation is thematically focused on the pastoral care of youth in the Czech and Moravian dioceses. The aim of the thesis is to contribute to the reflection on youth pastoral care in the Czech Republic by means of a deeper probe into the concept and practice of diocesan youth life centres. The theological basis for the elaboration of this topic are the binding documents of the German Bishops' Conference (DBK), the Italian Bishops' Conference (CEI) and the Latin American Bishops' Conference (CELAM), which open the way to the post-conciliar concept of youth pastoral, formulated by prominent pastoral theologians such as Martin Lechner or Riccardo Tonelli. The principles of Czech youth pastoral are then compared with the above-mentioned foreign documents. In addition, selected results of research investigations carried out in the environment of active Catholic youth are presented. The result is a critical analysis of the project of diocesan youth life centres and a proposal for their new concept. Klíčová slova: pastorace; pastorace mládeže; pastorální teologie; diakonická práce s mládeží; Sekce pro mládež ČBK; diecézní centra života mládeže; pastoral care; youth ministry; pastoral theology; diaconal youth work; Section for Youth of the Czech Bishops' Conference; Diocesan Youth Centers of Life Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Pastorace mládeže v českých a moravských diecézích. Pastorálně teologická analýza práce diecézních center života mládeže.

Disertační práce je tematicky zaměřena na pastoraci mládeže v českých a moravských diecézích. Cílem práce je přispět k reflexi pastorace mládeže v České republice, a to pomocí hlubší sondy do koncepce ...

DUDOVÁ, Anna
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

On the Influences of Technology on Morality
ARZROOMCHILAR, Ehsan
2022 - český Technology is such ubiquitous today that one barely can contact the world around where no artefact is involved. The most basic needs of humans, e.g., food and shelter, hinge heavily upon artefacts. Now, what are the consequences of the current technologically-saturated surroundings on morals? To answer the question, in my writing, I have gone through different traditions as well as movements to figure out how to accommodate moral dimensions of technology. Ultimately I have suggested to integrate the relevant pieces of two movements of Social Construction of Technology (SCOT) as well as ctor-Network-Theory (ANT) into postphenomenology. Further, I have also proposed a three-stage schema for moralization of technology along the process of the design of technology. The schema consists of a descriptive stage, an evaluative stage, and an imperative stage. In the descriptive stage designers need to provide an illustration of what a particular technology brings about. In the second stage, they are supposed to evaluate the description provided in stage one. And in the last stage, they must embed the insights into the technology in question. The work closes its tale by an application of the schema on a case study. Klíčová slova: Technology; Postphenomenology; ANT; SCOT; STS; Morality; Ethics Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. On the Influences of Technology on Morality

Technology is such ubiquitous today that one barely can contact the world around where no artefact is involved. The most basic needs of humans, e.g., food and shelter, hinge heavily upon artefacts. ...

ARZROOMCHILAR, Ehsan
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Genotypizace vybraných kandidátních markerů rezistence proti lentivirovým infekcím malých přežvýkavců
FARKOVÁ, Barbora
2022 - český Lentivirové infekce malých přežvýkavců (SRLV - Small Ruminant Lentiviruses) známé jako onemocnění maede-visna u ovcí a virová artritida a encefalitida u koz jsou rozšířené po celém světě a způsobují značné ekonomické ztráty. Lentivirová onemocnění byla zahrnuta do aktuální Metodiky kontroly zdraví zvířat a nařízené vakcinace pro chovy zařazené v kontrole užitkovosti. Kontrolní programy jsou zpravidla založené na sérologickém screeningu a následně jsou sérologicky pozitivní zvířata vyřazena z chovu. V literárním přehledu uvádím významné lentiviry včetně těch, které nebyly předmětem analýz. Cílem této práce byl screening výskytu lentivirových infekcí u malých přežvýkavců v České republice a dále pak genotypizace vybraného kandidátního markeru a nalezení genotypu souvisejícího s možností genové rezistence. Celkem bylo odebráno přes 3200 vzorků krve ovcí a koz u chovatelů v rámci celé České republiky. Genotypizace byla provedena u stád, kde byl zachycen výskyt sérologicky pozitivních zvířat. Amplifikace zkoumané sekvence DNA byla prováděna pomocí PCR (Polymerase chain reaction) analýzy, při správné amplifikaci daného úseku následovala sekvenační analýza a výsledky byly statisticky vyhodnoceny. V mé práci jsem došla k závěru, že v České republice byl dosud zachycen výskyt 2 z 5 možných genotypů SRLV (genotyp A a B) a distribuce různých subtypů u ovcí a koz. Největší rozdíly vykazovaly sekvence u genotypu A, kde jedna skupina izolátů vykazovala možnost zařazení do zcela nového subtypu. U ovcí se podařilo identifikovat všechny tři genotypy genu TMEM154. Výskyt sérologicky pozitivních byl statisticky významně vyšší u zvířat s rizikovým genotypem. Z důvodu možné mutace viru a vzniku nového subtypu genotypu A je pravděpodobnost větší adaptace viru pro napadení a infekci jedinců s více rezistentním genotypem. U koz byl prokázán pouze jeden genotyp, takže zde s největší pravděpodobností nelze najít marker související s rezistencí proti SRLV infekcím. Small Ruminant Lentiviruses (SRLV) known as maedi-visna in sheep, and viral arthritis and encephalitis in goats are widespread worldwide and cause significant economic losses. Lentiviral diseases have been included in the current Animal Health Control and Vaccination Guidelines for Breeding Controls. Control programs are generally based on serological screening and subsequently serologically positive animals are removed from breeding. In the literature review I write about important lentiviruses, including those that have not been analyzed. The aim of this work was to screen for the occurrence of lentiviral infections in small ruminants in the Czech Republic and the genotyping of selected candidate markers and finding the genotype related to the possibility of gene resistance. In total, over 3200 blood samples were collected from sheep and goats from breeders all over the Czech Republic. Genotyping was carried out in herds where serologically positive animals were detected. Amplification of the DNA sequence of interest was performed by PCR (Polymerase Chain Reaction) analysis, followed by genotyping by sequence analysis, and the results were statistically evaluated. In my work, I came to the conclusion that in the Czech Republic the occurrence of 2 out of 5 possible SRLV genotypes (genotype A and B) and distribution of different subtypes in sheep and goats has been detected so far. The greatest differences were in the sequence of genotype A, where one group of isolates showed the possibility of classification into a completely new subtype. In sheep, all three genotypes of the TMEM154 gene were identified. The incidence of serologically positive was statistically significantly higher in animals with a risk genotype. Because of the possible mutation of the virus and the emergence of a new subtype of genotype A, the virus is more likely to adapt to attack and infect individuals with a more resistant genotype. Only one genotype has been demonstrated in goats, so most likely there is no marker associated with resistance to SRLV infections. Klíčová slova: lentiviry; SRLV; genotypizace; marker; přežvýkavec; rezistence; lentiviruses; SRLV; genotyping; marker; ruminant; resistance Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Genotypizace vybraných kandidátních markerů rezistence proti lentivirovým infekcím malých přežvýkavců

Lentivirové infekce malých přežvýkavců (SRLV - Small Ruminant Lentiviruses) známé jako onemocnění maede-visna u ovcí a virová artritida a encefalitida u koz jsou rozšířené po celém světě a způsobují ...

FARKOVÁ, Barbora
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Kryptosporidie a kryptosporidióza stromových a zemních veverek
PREDIGER, Jitka
2022 - český Kryptosporidie jsou jednobuněční, jedno-hostitelští paraziti (Apicomplexa, Cryptosporidiidae) infikující primárně gastrointestinální, respirační a urogenitální trakt řady obratlovců včetně člověka. Infekce, kryptosporidióza, způsobená zástupci rodu Cryptosporidium, je často spojována s průjmovým onemocněním různého stupně závažnosti. Některé druhy, C. parvum a C. hominis, celosvětově způsobují kryptosporidiózu milionů osob a představují významné ohrožení života pro děti do pěti let věku, u kterých jsou zejména v rozvojových zemích jednou z nejčastějších příčin úmrtí. Ekonomické ztráty způsobené C. parvum jsou často popisovány u mláďat hospodářsky významných přežvýkavců, zatímco úmrtnost u volně žijících zvířat je málo studována. Výsledky vědeckých prací v posledních deseti letech ukázaly, mnohem větší diverzitu kryptosporidií, než bylo předpokládáno. V současné době známe 49 platných druhů a velké množství genotypů kryptosporidií, jejichž počet již přesáhl hodnotu 100. Většina těchto druhů a genotypů, které s největší pravděpodobností představují samostatné druhy, pochází z volně žijících zvířat. O biologii těchto druhů toho víme dosud jen velmi málo. Veverky často sdílí životní prostor s lidmi, a představují významný rezervoár zoonotických patogenů, včetně kryptosporidií. Tato disertační práce přináší nové poznatky o výskytu, diverzitě a biologii kryptosporidií parazitujících u stromových a zemních veverek. Cryptosporidia are unicellular, single-host parasites (Apicomplexa, Cryptosporidiidae) that primarily infect the gastrointestinal, respiratory, and urogenital tracts of various vertebrates, including humans. Infection caused by members of the genus Cryptosporidium, cryptosporidiosis, is often associated with diarrheal disease of varying severity. Several species, C. parvum and C. hominis, cause cryptosporidiosis in millions of people worldwide and pose a significant threat to the lives of children under five years of age, in whom it is a leading cause of death, especially in developing countries. Economic losses due to C. parvum are frequently described in young animals of economically important ruminants, while mortality in wild animals has hardly been studied. The results of scientific work in the last decade have shown that the diversity of Cryptosporidium is much greater than previously thought. Currently, 49 valid species and many genotypes of Cryptosporidium spp. are known, exceeding 100. Most of these species and genotypes, which are most likely distinct species, are derived from wild animals. Very little is known about the biology of these species. Squirrels often share their habitat with humans and are an important reservoir of zoonotic pathogens, including Cryptosporidium spp. This Ph.D. thesis provides new insights into the occurrence, diversity, and biology of Cryptosporidium spp. parasitizing tree and ground squirrels. Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Kryptosporidie a kryptosporidióza stromových a zemních veverek

Kryptosporidie jsou jednobuněční, jedno-hostitelští paraziti (Apicomplexa, Cryptosporidiidae) infikující primárně gastrointestinální, respirační a urogenitální trakt řady obratlovců včetně člověka. ...

PREDIGER, Jitka
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Vliv světelného režimu na užitkovost a plodnost plemenic skotu
VRBOVÁ, Aneta
2022 - český Cílem práce bylo na základě analýzy dat zjistit plodnost a mléčnou užitkovost dojnic chovaných v moderní technologii v kontextu s mikroklimatickými prvky a kvalitou ustájení. Sledování probíhalo od 1. 1. 2013 do 31. 12. 2014 v Zemědělském družstvu Pluhův Žďár. Sledováno bylo 150 dojnic plemene Holštýn. Pro vyhodnocení sledovaných hodnot byl použit statistický program Statistica 12 (StatSoft?). Charakteristika dat byla provedena pomocí popisných statistik, dále byla použita korelační analýza a chí-kvadrát test. Při hodnocení mikroklimatu stáje bylo zjištěno, že průměrná teplota prostředí se pohybovala od 7,90 °C do 27,03 °C. Relativní vlhkost byla naměřena v rozmezí 73,44 % až 86,84 %. THI nabýval hodnot od 45,11 do 68,93. Dojivost korelovala negativně s teplotou během podzimních měsíců (r = - 0,377), v tomto období byla zjištěna také záporná korelace s relativní vlhkostí (r = - 0,356) a obdobně tomu bylo i s THI a dojivostí (r = - 0,409). Vliv délky fotoperiody na mléčnou užitkovost se projevil pozitivně u všech skupin pozorovaných dojnic. Skupina krav na 1. laktaci navýšila mléčnou užitkovost o 4,7 %, u dojnic na 2. laktaci vzrostla dojivost o 12,6 % a o 18 % více mléka nadojily dojnice na 3. a další laktaci. Vliv délky fotoperiody na zabřezávání nebyl statisticky průkazný (p = 0,100), ale projevila se tendence horšího zabřezávání při automatickém osvětlení v porovnání s přirozenou fotoperiodou. Při zohlednění teploty v den inseminace, 24 a 48 hodin před inseminací se míra zabřezávání pohybovala mezi 27 % a 51 %. Projevila se tendence lepšího zabřezávání u skupiny prvotelek v teplotním pásmu nad 15,1 °C v porovnání se skupinou krav na 2. a další laktaci. Vliv teploty prostředí na zabřezávání po první inseminaci 24 a 48 hodin před provedením inseminace byl satisticky průkazný (p < 0,05). Pozitivní vliv prodloužené fotoperiody na přežvykování byl zjištěn u všech skupin pozorovaných dojnic. Dojnice na 1. laktaci navýšily ruminační aktivitu o 42 minut, skupina starších krav o 25 minut za 24 hodin. Největší rozdíl u této skupiny krav byl pozorován v průběhu zimních měsíců (XII-II), kdy dojnice přežvykovaly v průměru o 21,7 % déle v porovnání s přirozenou fotoperiodou (p < 0,001). The main objective of the study was to ascertain fertility and milk productivity of dairy cows raised under the conditions of modern technology in the context of micro-climactic features and the quality of housing. The observation occurred from 1. 1. 2013 to 31. 12. 2014 in Cooperative Farm Pluhův Žďár and 150 dairy cows of the Holstein cattle were observed. The program Statistica 12 (StatSoft?) was used to evaluate observed values. Data characterisation was conducted through the use of descriptive statistics, and, furthermore, a correlation analysis and a chi-square test were used. During the evaluation of the micro-climate of the stables, it was detected that the average temperatures of the environment shifted from 7.90 °C to 27.03 °C. Relative humidity was measured in the range of 73.44 % and 86.84 %. THI achieved values from 45,11 to 68.93. The milk yield correlated negatively with the temperature during autumn months (r = - 0.377) and a negative correlation was also found in relation to the relative humidity (r = - 0.356) and a similar relation existed between the THI and the milk yield (r = - 0.409). The influence of the length of the photoperiod on milk productivity showed itself to be positive in the cases of all groups of observed dairy cows. The group of cows at the 1st lactation increased milk productivity by 4.7 % the cows at the 2nd lactation showed an increase of milk productivity by 12.6 % and the dairy cows at the 3rd and further lactations provided an increase of milk yield of 18 %. The influence of the length of the photoperiod on conception was not statistically conclusive (p = 0.100), but there was a tendency pointing to worse conception results when automatic lighting was used as opposed to when the natural photoperiod was used. With the temperature on the day of conception taken into consideration, the rate of conception ranged between 27 % and 51 % in the periods of 24 and 48 hours before insemination. There was a tendency of a better conception in the group of primiparous cows in the temperature range over 15.1 °C in comparison with the group of cows at the 2nd and further lactations. The influence of the temperature of the environment on conception after first insemination 24 and 48 hours before the insemination itself was statistically conclusive (p < 0.05). A positive influence of an extended photoperiod on rumination was found among all groups of observed dairy cows. The dairy cows at the 1st lactation increased their ruminative activity by 42 minutes and the group of older cows by 25 minutes in 24 hours. The greatest difference between these two groups was observed during the winter months (XII-II), during which time the dairy cows ruminated longer by 21.7 % on average in comparison with the natural photoperiod (p < 0.001). Klíčová slova: dojnice; mléčná užitkovost; plodnost; mikroklima stáje; fotoperioda; dairy cow; milk productivity; fertility; micro-climate of the stables; photoperiod Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Vliv světelného režimu na užitkovost a plodnost plemenic skotu

Cílem práce bylo na základě analýzy dat zjistit plodnost a mléčnou užitkovost dojnic chovaných v moderní technologii v kontextu s mikroklimatickými prvky a kvalitou ustájení. Sledování probíhalo od 1. ...

VRBOVÁ, Aneta
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Assembly and analysis of repeat-rich regions of plant genomes
VONDRAK, Tihana
2022 - anglický Satellite DNA has been identified in varying proportions in many eukaryotic genomes. It consists of monomeric units arranged in tandem into long, homogeneous arrays. Due to its repetitive nature, satellite DNA is difficult to assemble and analyze, and has therefore been largely neglected in research. With the development of next generation sequencing technologies such as Illumina, research on satellite DNA has intensified and our understanding of it has improved. However, the information we obtain with Illumina reads is limited by their short length. While we can characterize the sequence of satellite DNA and its abundance in genomes, it is not possible to study the long-range organization of satellite DNA, which limits our understanding of the origin and evolution of satellite DNA. This limitation can be addressed by using the latest generation of sequencing technologies that generate much longer reads of tens to hundreds of kilobases. The goal of this work was to develop bioinformatics approaches for analyzing the properties of satellite DNA arrays from long sequence reads or from genome assemblies generated with these reads. These were then used to analyze populations of satellite repeats throughout the genome or in the specific type of chromatin in three plant species that differ in the organization of their centromeres. Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Assembly and analysis of repeat-rich regions of plant genomes

Satellite DNA has been identified in varying proportions in many eukaryotic genomes. It consists of monomeric units arranged in tandem into long, homogeneous arrays. Due to its repetitive nature, ...

VONDRAK, Tihana
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Využití výpočetních metod v chovu koní
ČOUDKOVÁ, Veronika
2022 - český Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Využití výpočetních metod v chovu koní

ČOUDKOVÁ, Veronika
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022