Methodology for co-cryostorage of virus isolates in their host plants and relevant data
Bilavčík, A.; Bjerkestrand, R.; Bjelland, B.; Blystad, D.-R.; Bobrova, O.; Fránová, Jana; Faltus, M.; Hamborg, Z.; Hammond Hammond, S. D.; Koloniuk, Igor; Zámečník, J.
2023 - English
Currently, the nursery production of plant material emphasizes the production of healthy, virus-free material. For this reason, it is necessary to have reference plant materials in which the virus is present. Some types of viruses are difficult to maintain outside the plant host. Because of the potential transmission to outdoor plantings, it is necessary to keep infected plants in special cultivation areas, and net-houses, which brings considerable financial and labour costs. Therefore, a methodology was developed in which the virus status in plant material is analysed, the infected material can be stored using cryopreservation in liquid nitrogen and then regenerated in vitro, and relevant data in GeneEver cryobox can be stored.
Keywords:
genetic resources; virus; Rubus idaeus L.
Fulltext is available at external website.
Methodology for co-cryostorage of virus isolates in their host plants and relevant data
Currently, the nursery production of plant material emphasizes the production of healthy, virus-free material. For this reason, it is necessary to have reference plant materials in which the virus is ...
Virus eradication method by cryopreservation tool - a cryoknife
Bilavčík, A.; Bobrova, O.; Faltus, M.; Fránová, Jana; Hammond, S.; Koloniuk, Igor; Zámečník, J.
2023 - Czech
Currently, in the nursery production of plant material, emphasis is placed on the propagation of healthy material. For this reason, it is necessary to pay attention to the topic of healthy virus-free nuclear stock when preserving collections of genetic resources of vegetatively propagated plants. Some raspberry viruses are difficult to remove from the plant host by existing methods of thermotherapy or chemotherapy. That is why, using the example of black raspberry necrosis virus (BRNV), a comprehensive methodology for testing health status and cryotherapy in raspberry was developed. The resulting methodical procedure makes it possible to eradicate BRNV from raspberry using cryotherapy of in vitro cultures. The user of the methodology is the Ministry of Agriculture, which applies it as part of the 'National Program for the Conservation and Use of Genetic Resources of Plants, Animals and Microorganisms Important for Nutrition and Agriculture'. V současné době je ve školkařské produkci rostlinného materiálu kladen důraz na množení zdravého materiálu. Z tohoto důvodu je nutné věnovat tématu zdravé bezvirózní sadby pozornost při uchování kolekcí genových zdrojů vegetativně množených rostlin. Některé viry maliníku je obtížné stávajícími metodami termoterapie či chemoterapie odstranit z rostlinného hostitele. Proto byla, na příkladu viru černé nekrózy maliníku (black raspberry necrosis virus, BRNV), vyvinuta komplexní metodika testování zdravotního stavu a kryoterapie u maliníku. Výsledný metodický postup umožňuje ozdravit maliník od BRNV pomocí kryoterapie in vitro kultur. Uživatelem metodiky je MZe, které ji uplatní v rámci 'Národního programu konzervace a využívání genetických zdrojů rostlin, zvířat a mikroorganismů významných pro výživu a zemědělství'.\n
Keywords:
raspberry; BRNV; cryotherapy; in vitro
Fulltext is available at external website.
Virus eradication method by cryopreservation tool - a cryoknife
Currently, in the nursery production of plant material, emphasis is placed on the propagation of healthy material. For this reason, it is necessary to pay attention to the topic of healthy virus-free ...
Guidebook to care of localities of endangered butterflies and moths in the Czech Republic
Konvička, Martin; Beneš, Jiří; Spitzer, Lukáš; Bartoňová, Alena; Zapletal, Michal
2017 - Czech
This methodology concerns the care of the biotopes of butterflies (Lepidoptera) included in the Red List of Invertebrates of the Czech Republic. It deals with day and night butterflies from the traditional „Macrolepidoptera“ group. It describes the principles of various types of care for butterfly habitats, and also management principles for particular biotope types. The other part of the methodology defines the areas of the Czech Republic, which are priority for the protection of species of interest. For selected location there is management designed. Metodika se zabývá péčí o biotopy motýlů (Lepidoptera) zařazených do Červeného seznamu bezobratlých ČR. Zabývá se denními i nočními motýly z tradiční skupiny Macrolepidoptera. Popisuje principy a zásady různých způsobů péče o stanoviště motýlů a zásady managementu pro jednotlivé typy biotopů. V další části metodiky jsou vymezeny oblasti ČR, které jsou prioritní pro ochranu zájmových druhů. Pro vybrané lokality je navržen způsob péče.
Keywords:
conservation; management; Lepidoptera recent distribution
Fulltext is available at external website.
Guidebook to care of localities of endangered butterflies and moths in the Czech Republic
This methodology concerns the care of the biotopes of butterflies (Lepidoptera) included in the Red List of Invertebrates of the Czech Republic. It deals with day and night butterflies from the ...
Methodology for identification and quantification of sediments in water reservoirs
Borovec, Jakub; Jan, Jiří; Vrzák, J.; Knotek, J.
2017 - Czech
The study was designed to find methodical procedures for effective and accurate detection and quantification of bottom sediments in water reservoirs, including an assessment of their impact on the quality of water in the reservoirs. The study summarizes the overall problem of sediments in the water bodies. Advantages and disadvantages of methods and equipment widely used for sediment sampling procedures for their quantification are assessed. The result is a developed optimal methodical procedure for proper spatial localization of sediments and determination of their volumes in given zones. The methodology also includes a precise procedure for the evaluation of its chemical parameters and the P cycle with further determination of the sediment potential to deteriorate water quality in the reservoirs. Studie byla vytvořena za cílem nalezení metodických postupů pro cílenou a efektivní lokalizaci a kvantifikaci dnových sedimentů v daných zónách vodních nádrží, včetně základního posouzení jejich vlivu na kvalitu vody. Ve studii je shrnuta celková problematika sedimentů a posouzeny výhody a nevýhody používaných metod a zařízení pro odběr vzorků sedimentů a postupy pro jeho kvantifikaci. Výsledkem je vyvinutý optimální metodický postup pro správnou prostorovou lokalizaci sedimentů a stanovení jejich mocností v daných zónách. Metodika zahrnuje přesný postup k hodnocení jeho chemických parametrů včetně cyklu P v sedimentech a určení rizikovosti sedimentu na kvalitu vody v nádržích.
Keywords:
bottom sediments; characterization; methodology
Available in digital repository of the ASCR
Methodology for identification and quantification of sediments in water reservoirs
The study was designed to find methodical procedures for effective and accurate detection and quantification of bottom sediments in water reservoirs, including an assessment of their impact on the ...
Methodology for identification and quantification of sediments in water reservoirs
Borovec, Jakub; Jan, Jiří; Vrzák, J.; Knotek, J.
2017 - Czech
Our contribution briefly introduces the Methodology for the assessment of sediments, which was certified by the Ministry of agriculture of the Czech Republic under the registration number 13084-2017-MZE-15000. The Methodology finds its use especially among the managers and owners of various water works, reservoirs, and ponds, but also project architects and implementation companies who come across and need to resolve many sediment-related problems. The Methodology also serves as a basic introduction into the problematics of reservoir sediments, but primarily offers the correct and most effective procedures, which should ensure significant savings and eliminate potential risks. Příspěvek přibližuje obsah Metodiky pro průzkum sedimentů, která byla certifikována Ministerstvem zemědělství ČR pod číslem 13084-2017- MZE-15000. Metodika nachází uplatnění především u správců a majitelů vodních děl, nádrží a rybníků, kde je potřeba tuto problematiku řešit. Jedná se především o státní organizace typu Podniky Povodí, ale i Krajské úřady, obce, AOPK, rybářské subjekty, ČEZ, soukromé vlastníky a další. Dále nachází uplatnění u projektantů a případně i realizačních firem. Metodika slouží jednak k základnímu zorientování v problematice, ale především pro správný a efektivní postup při řešení dané problematiky, který by měl ve výsledku znamenat značné úspory a eliminovat ostatní potenciální rizika.
Keywords:
methodology; water bodies; sediment identification and quantification
Fulltext is available at external website.
Methodology for identification and quantification of sediments in water reservoirs
Our contribution briefly introduces the Methodology for the assessment of sediments, which was certified by the Ministry of agriculture of the Czech Republic under the registration number ...
Use of a research sonar to determine sediment thickness
Borovec, Jakub; Vrzák, J.; Knotek, J.
2017 - Czech
The study summarizes research results aimed at the identification and quantification of sediments in freshwater reservoirs. An algorithm for the interpretation of sonar data, and the calculation of sediment thickness as well as for the estimation of basic sediment characteristics was developed. A device for the collection of sediment cores, which are used for the calibration of sonar output data was introduced. Práce shrnuje výsledky výzkumu zaměřeného na identifikaci a kvantifikaci sedimentů ve vodních nádržích. Byl vyvinut algoritmus pro interpretaci sonarových záznamů a výpočet mocnosti a odhadu základních vlastností sedimentů. Bylo představeno zařízení pro odběr zatloukaných hlubokých kórů, které slouží pro kalibraci sonarových výstupů.
Keywords:
bottom mapping; sonar; 3D-model
Fulltext is available at external website.
Use of a research sonar to determine sediment thickness
The study summarizes research results aimed at the identification and quantification of sediments in freshwater reservoirs. An algorithm for the interpretation of sonar data, and the calculation of ...
Phosphorus concentration in the Orlík and Slapy reservoirs: a result of socio-economic trends in the catchment and climate change
Hejzlar, Josef; Jarošík, Jiří; Kopáček, Jiří; Vystavna, Yuliya
2017 - Czech
Based on existing phosphorus data series in the Slapy and Orlík reservoirs and their main tributaries, we reconstructed P inputs to the reservoirs from the catchment during 1961–2016 and compiled\nempirical models of P retention. P concentrations in both reservoirs increased from the 1960s to 1991 and then declined, with the Slapy Reservoir having a significantly increased year-on-year\nvariability. Trends in the increase and decrease of P reflected the socio-economic development in the Vltava river basin, in particular sewerage, wastewater discharges, fertilizer application, livestock,\nand fishpond fisheries. In the Slapy reservoir after 1991, the P concentrations increased during wet summers and created conditions for growth of phytoplankton, whereas in dry summers they\ndecreased to mesotrophy. Climatic and hydrological processes have now apparently begun to compete with a generally decreasing P pollution and support eutrophication despite the drop in P loads from the catchment. Na základě existujících datových řad pro fosfor v nádržích Slapy a Orlík a v jejich hlavních přítocích jsme rekonstruovali vstup P z povodí do těchto dvou nádrží pro období 1961–2015 a sestavili\nnádržové modely retence P. Koncentrace P v obou nádržích rostly od 60. let minulého století do roku 1991 a pak začaly klesat, v nádrži Slapy ale s výrazně větší meziroční variabilitou. Trendy\nkoncentračního nárůstu a poklesu P byly odrazem vývoje socio-ekonomiky v povodí Vltavy, zejména stavu kanalizací, vypouštění odpadních vod, aplikace hnojiv, množství hospodářských zvířat\na intenzity rybničního chovu ryb. Po roce 1991 se v nádrži Slapy koncentrace P za zvýšených letních průtoků začaly zvyšovat a podporovat rozvoj fytoplanktonu, kdežto v suchých létech klesaly až\nk mezotrofii. Klimaticko-hydrologicky podmíněné procesy v současnosti zjevně začaly konkurovat obecně klesajícímu trendu znečištění P a zvyšují eutrofizaci nádrže navzdory poklesu zatížení P\nz povodí.
Keywords:
Orlík and Slapy reservoirs; modelling of phosphorus retention; eutrophication; socio-economic indicators
Available in digital repository of the ASCR
Phosphorus concentration in the Orlík and Slapy reservoirs: a result of socio-economic trends in the catchment and climate change
Based on existing phosphorus data series in the Slapy and Orlík reservoirs and their main tributaries, we reconstructed P inputs to the reservoirs from the catchment during 1961–2016 and ...
Combining the results of particle and pore water analyzes - setting decision criteria for sediment management
Borovec, Jakub; Jan, Jiří; Hubáček, Tomáš; Tomková, Iva
2017 - Czech
The study focuses on the prediction of sediments behavior in specific locations within the reservoir, and determination of risks they pose in terms of phosphorus (P) release into the water column. The introduced combination of two methods is used for these purposes: i) the vertical profiling of dissolved ions in the pore water and ii) the specific composition of particles in the corresponding sediment layers. Příspěvek se zabývá odborným přístupem ke stanovení chování sedimentu za různých podmínek ve vodě nad sedimentem a identifikace jeho rizikovosti ve smyslu uvolňování P do vodního sloupce. Interpretace složení rozpuštěných iontů v pórové vodě vertikálního profilu sedimentů v kombinaci se specifickým složením částic sedimentu ve stejných vrstvách je využita pro stanovení potenciálního vlivu sedimentu na kvalitu vody v nádrži.
Keywords:
phosphorus release potential; phosphorus fractionation; sediment pore water
Fulltext is available at external website.
Combining the results of particle and pore water analyzes - setting decision criteria for sediment management
The study focuses on the prediction of sediments behavior in specific locations within the reservoir, and determination of risks they pose in terms of phosphorus (P) release into the water column. The ...
Trends in the balance and material flows of phosphorus in the Czech Republic.
Hejzlar, Josef
2016 - Czech
In developed countries, many voices call for increasing the recycling of phosphorus (P) that is a strategic raw material for agriculture and other production sector; phosphorus is also causing environmental problems, for example. eutrophication. Using the methodology of material flow analysis, van Dijk et al. (Sci. Total Environ. 2016, 552: 1078-1093) quantified the main flows and stocks of P in 27 states of the European Union. The contribution presents and discusses data from that publication for the material flows P in the Czech Republic (CR) and compared with the EU. The P balance of CR shows the dependence on imported P through mineral fertilizers (1 kg/ca/yr), food and feed (1.5 kg/ca/yr) and also draws attention to significant environment losses and unused recycling potential. For example, municipal sludge (0.4 kg/ca/yr) and bone meal (0.25 kg/ca/yr) could replace 70% of the P amount in applied mineral fertilizers. P recycling rate in CR in comparison with EU-27 is below average (68% in livestock production, 21% in food production, 10% for human consumption). Agricultural production in CR still uses P reserves in the soil of mineral fertilizers in the past. V poslední době se v rozvinutých zemích volá po zvýšení recyklace fosforu (P), který je strategickou surovinou pro zemědělství a další produkční sféry; zároveň P působí vážné environmentální problémy, např. eutrofizaci vod. S použitím metodiky analýzy materiálových toků van Dijk et al. (Sci. Total Environ. 2016, 552: 1078–1093) kvantifikovali hlavní toky a zásoby P v 27 státech Evropské unie. V příspěvku jsou představena a diskutována data z uvedené publikace pro materiálové toky P v ČR ve srovnání s EU. Bilance pro ČR ukazuje její závislost na dovozu P prostřednictvím minerálních hnojiv (1 kg/os/rok), potravin a krmiv (1,5 kg/os/rok) a zároveň upozorňuje na značné ztráty do prostředí a nevyužitý potenciál recyklace. Například komunální kaly (0,4 kg/os/rok) a masokostní moučka (0,25 kg/os/rok) by mohly nahradit 70 % množství aplikovaných minerálních hnojiv. Míra recyklace P je v ČR ve srovnání s EU-27 podprůměrná (68 % v živočišné výrobě, 21 % v produkci potravin, 10 % v lidské spotřebě). Zemědělská výroba v ČR dosud využívá zásobu P v půdě z minerálních P hnojiv aplikovaných v minulosti.
Keywords:
phosphorus cycle; material flow analysis; nutrient use efficiency; agricultural balance; consumer system
Available in digital repository of the ASCR
Trends in the balance and material flows of phosphorus in the Czech Republic.
In developed countries, many voices call for increasing the recycling of phosphorus (P) that is a strategic raw material for agriculture and other production sector; phosphorus is also causing ...
The influence of nutrient loading, meteorological and hydrological conditions and operating manipulations on phytoplankton in the water suply reservoir Římov.
Hejzlar, Josef; Jarošík, Jiří; Nedoma, Jiří; Seďa, Jaromír; Znachor, Petr
2016 - Czech
Analysis of data collected during long-term and complex limnologic monitoring of the Římov reservoir in the period 1983 – 2015, which depict the development of physico-chemical conditions, hydrology and hydrodynamics of the reservoir with links to biological data on phytoplankton, zooplankton etc. showed that the concentration and species composition of phytoplankton depend on the supply and availability of nutrients, but are also influenced by climatic and hydrological conditions and water management operation of the reservoir.\n Analýza dat získaných během dlouhodobého a komplexního limnologického monitoringu nádrže Římov v období 1983 – 2015, která zachycují vývoj fyzikálně-chemických ukazatelů, hydrologie a hydrodynamiky nádrže s návazností na biologická data o fytoplanktonu, zoooplanktonu aj. ukázala, že koncentrace a druhové složení fytoplanktonu závisejí na přísunu a dostupnosti živin, ale zároveň jsou také významně ovlivňovány klimatickými a hydrologickými podmínkami i vodohospodářským provozem nádrže.\n
Keywords:
37-year data series of reservoir monitoring; reservoir operation; changes in water chemistry; increase of DOC; phosphorus loading; phytoplankton groups
Available in digital repository of the ASCR
The influence of nutrient loading, meteorological and hydrological conditions and operating manipulations on phytoplankton in the water suply reservoir Římov.
Analysis of data collected during long-term and complex limnologic monitoring of the Římov reservoir in the period 1983 – 2015, which depict the development of physico-chemical conditions, hydrology ...
NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web
Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz
Provider
Other bases