Methodics of detection of three cereal viruses (BYDV, WDV, WSMV) by Multiplex TaqMan RT-qPCR
Jarošová, Jana; Kumar, Jiban
2018 - Czech The family Poaceae is one of the most important groups of plants in the terms of agricultural production. The family Poaceae also hosts many pathogens including >100 known virus species. The three most important viruses affecting cereals in the Czech Republic are Barley yellow dwarf virus (BYDV), Wheat dwarf virus (WDV) and Wheat streak mosaic virus (WSMV). In this methodology we provide an assay for multiplex detection and quantification of those viruses by TaqMan RT-qPCR. The methodology is meant to serve scientific workers as well as the employees of state laboratories as a tool for individual virus occurrence monitoring in the Czech Republic. Čeleď Poaceae je zemědělsky nejdůležitější čeledí rostlin na světě. Čeleď Poaceae je také hostitelem mnoha patogenů včetně více než sta známých druhů virů. Tři nejdůležitější virové choroby napadající obilniny v ČR jsou virová zakrslost pšenice (WDV), žlutá zakrslost ječmene (BYDV) a čárkovitá mozaika pšenice (WSMV). Tato metodika poskytuje popis způsobu současné detekce a kvantifikace těchto tří virů obilnin a trav v jedné reakci pomocí metody TaqMan RT-qPCR. Metodika může sloužit vědeckým pracovníkům ke studijním účelům i pracovníkům státní správy k monitoringu výskytu jednotlivých virů na území ČR. Keywords: rostlinné viry; obilniny Available in a digital repository NRGL Methodics of detection of three cereal viruses (BYDV, WDV, WSMV) by Multiplex TaqMan RT-qPCR

The family Poaceae is one of the most important groups of plants in the terms of agricultural production. The family Poaceae also hosts many pathogens including >100 known virus species. The three ...

Jarošová, Jana; Kumar, Jiban
Výzkumný ústav rostlinné výroby, 2018

Long-term field experiments and their contribution to soil quality research
Madaras, Mikuláš; Mayerová, Markéta; Menšík, Ladislav
2018 - Czech Proceedings of the scientific conference with international guests. The conference was devoted to long-term experiments and soil quality assessment. Sborník z vědeckého semináře s mezinárodní účastí, věnovaného dlouhodobým polním pokusům a výzkumu půdní kvality. Keywords: úrodnost; půdní organická hmota; soil productivity; soil organic matter; půdoznalství; půdy Available in a digital repository NRGL Long-term field experiments and their contribution to soil quality research

Proceedings of the scientific conference with international guests. The conference was devoted to long-term experiments and soil quality assessment.

Madaras, Mikuláš; Mayerová, Markéta; Menšík, Ladislav
Výzkumný ústav rostlinné výroby, 2018

Cereal diseases from sowing to harvest (determination and protection options)
Slavíková, Lucie; Chrpová, Jana; Palicová, Jana; Hanzalová, Alena; Dumalasová, Veronika; Ripl, Jan; Jarošová, Jana; Kumar, Jiban
2018 - Czech The fungal and virus diseases are still very actual topics due to the high proportion of cereals in crop rotation and large cultivated area. The cereal crops often decimated by fungal diseases like eyespot, powdery mildew, smuts, rusts, Fusarium head blight and brown leaf spot diseases. The virus diseases include Barley yellow dwarf virus – BYDV, Wheat dwarf virus – WDV and Wheat streak mosaic virus – WSMV are also very important due to the epidemic incidence in some years. This methodology summarizes the current knowledge of these fungal and virus diseases, focuses on the description, symptoms, occurrence, field and laboratory diagnostics and possibilities of crop protection against these diseases. Individual diseases are ranked in the order of their occurrence in the agroecosystem. The methodology can serve the farming communities and agronomist as a key to identifying the diseases infecting wheat crop. Problematika houbových a virových chorob pšenice je vzhledem k vysokému zastoupení obilnin v osevních postupech a velké pěstované ploše stále velmi aktuální téma. Hlavními virovými chorobami jsou virová zakrslost pšenice, (původce WDV), žlutá virová zakrslost ječmene (původce BYDV) a virová čárkovitá mozaika pšenice způsobovaná virem WSMV. Z houbových chorob jsou obilné porosty nejčastěji decimovány stéblolamem, padlím, sněťmi, rzemi, klasovými fuzariózami a listovými skvrnitostmi. Tato metodika shrnuje současné poznatky o uvedených virových a houbových chorobách, zaměřuje se na popis, původce, symptomy, výskyt, polní i laboratorní diagnostiku a možnosti záměny. Jednotlivé choroby jsou řazeny v pořadí, v jakém je riziko jejich výskytu v agroekosystému. Metodika může sloužit široké zemědělské veřejnosti jako klíč k určování jednotlivých chorob obilnin. Keywords: Fusarium; Fusarium; obilniny; rostlinné viry Available in a digital repository NRGL Cereal diseases from sowing to harvest (determination and protection options)

The fungal and virus diseases are still very actual topics due to the high proportion of cereals in crop rotation and large cultivated area. The cereal crops often decimated by fungal diseases like ...

Slavíková, Lucie; Chrpová, Jana; Palicová, Jana; Hanzalová, Alena; Dumalasová, Veronika; Ripl, Jan; Jarošová, Jana; Kumar, Jiban
Výzkumný ústav rostlinné výroby, 2018

Annual report of Crop research institute 2017
Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
2018 - Czech Keywords: rostlinná výroba; vědecké instituce Available in a digital repository NRGL Annual report of Crop research institute 2017

Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
Výzkumný ústav rostlinné výroby, 2018

Resynthesis of oilseed rape from Brassica rapa and Brassica oleracea
Klíma, Miroslav; Hilgert-Delgado, Alois; Ulvrová, Tereza; Bryxová, Pavla; Vítámvás, Pavel; Prášil, Ilja Tom; Kosová, Klára
2018 - Czech In order to extend the variability of the genofond, so-called resynthesis can be used, when new genotypes are created by crossing selected Brassica rapa and B. oleracea, by early isolation of immature embryos from young eggs and their in vitro fertilization (Hilgert-Delgado et al., 2015). It has been shown that resyntetized genotypes are distinct from rape materials grown at present (Sosnowska et al., 2010), so that they can serve as a source of new variability in breeding programs focusing on cytoplasmic and pollen sterility, resistance to pathogens and tolerance to stresses (Warwick et al., 2009). Representatives of the initial components are characterized by wide variability in terms of morphology and agronomic characteristics, and are a prospective source of heterosis and other traits (Wu et al. The use of resyntetized genotypes for the direct production of rapeseed varieties is not possible due to the poor quality of the seed of these materials. It is mainly the high content of glucosinolates and erucic acid, typical of most of the initial components (Jesske et al., 2013). However, the required properties can be transferred by crossing to conventional breeding materials (Hilgert-Delgado et al., 2017). K rozšíření variability genofondu lze využít tzv. resyntézu, kdy nové genotypy vznikají křížením vybraných zástupců řepice a brukve, časnou izolací nezralých zárodků z vyvíjejících se šešulí a jejich dopěstováním v in vitro (Hilgert-Delgado et al. 2015). Bylo prokázáno, že resyntetizované genotypy jsou odlišné od materiálů řepky, vyšlechtěných a pěstovaných v současnosti (Sosnowska et al. 2010), takže mohou sloužit jako zdroj nové variability ve šlechtitelských programech se zaměřením na cytoplazmatickou a jadernou pylovou sterilitu, odolnost k patogenům a toleranci ke stresům (Warwick et al. 2009). Zástupci výchozích komponent řepky (řepice, vodnice, kadeřávek, zelí, kedluben, kapusta apod.) se vyznačují širokou variabilitou z hlediska morfologie i agronomických charakteristik a představují perspektivní zdroj heteróze a dalších znaků (Wu et al. 2014). Využití resyntetizovaných genotypů k přímé tvorbě odrůd řepky olejky není možné zejména z důvodu špatné kvality semene těchto materiálů. Jde především o vysoký obsah glukosinolátů a kyseliny erukové, typický u většiny výchozích komponent resyntézy (Jesske et al. 2013). Požadované vlastnosti lze ale přenést křížením do konvenčních lechtitelských materiálů (Hilgert-Delgado et al. 2017). Keywords: řepka; genetická variabilita; hybridizace; kultury in vitro Available in a digital repository NRGL Resynthesis of oilseed rape from Brassica rapa and Brassica oleracea

In order to extend the variability of the genofond, so-called resynthesis can be used, when new genotypes are created by crossing selected Brassica rapa and B. oleracea, by early isolation of immature ...

Klíma, Miroslav; Hilgert-Delgado, Alois; Ulvrová, Tereza; Bryxová, Pavla; Vítámvás, Pavel; Prášil, Ilja Tom; Kosová, Klára
Výzkumný ústav rostlinné výroby, 2018

Methodological guidance for management in vulnerable zones
Klír, Jan; Kozlovská, Lada; Haberle, Jan; Mühlbachová, Gabriela
2018 - Czech The methodology describes measures for protection of waters against pollution caused by nitrates from agricultural sources in vulnerable zones of the Czech Republic. The methodology clearly describes individual requirements of the 4th Action Programme of the Nitrates Directive for the period 2016–2020 as ratified by CR government for reduction of nitrogen losses by nitrates leaching into surface water and groundwater, reduction of surface water eutrophication and reduction of nitrates transmission to the neighboring countries in waters flowing from the territory of the Czech Republic. The aim is to reduce water pollution by nitrogen compounds from agricultural sources into the aquatic environment, the results of which are such as to cause hazards to human health, harm to living resources and to aquatic ecosystems, damage to amenities or interference with other legitimate uses of water. The publication also includes links to selected technical publications and related legislation. The second updated edition responds to amendment to the Government Regulation No. 262/2012 Coll., On determining the vulnerable areas and action programme, issued in 2018 as No. 27/2018 Coll. Metodika popisuje aktuální opatření pro ochranu vod před znečištěním dusičnany ze zemědělských zdrojů ve zranitelných oblastech České republiky. V metodice jsou přehledně popsány jednotlivé požadavky 4. akčního programu nitrátové směrnice pro období 2016–2020, schváleného vládou ČR za účelem omezení ztrát dusíku vyplavením dusičnanů do povrchových a podzemních vod, snížení rizika eutrofizace povrchových vod i omezení přenosu dusičnanů do okolních států vodami odtékajícími z území České republiky. Cílem je tedy snížit znečištění vod dusíkatými látkami pocházejícími ze zemědělství, jež má za následek ohrožení lidského zdraví, poškození zdrojů obživy, narušení vodních ekosystémů, škody na přírodních hodnotách nebo ohrožení oprávněného používání vod. Součástí publikace jsou i odkazy na vybrané odborné publikace a související předpisy. Druhé aktualizované vydání reaguje na novelu nařízení vlády č. 262/2012 Sb., o stanovení zranitelných oblastí a akčním programu, vydanou v roce 2018 pod č. 27/2018 Sb. Keywords: zranitelné oblasti; akční program; vulnerable zones; action programme; zemědělství; ochrana vody proti znečištění; dusičnany Available in a digital repository NRGL Methodological guidance for management in vulnerable zones

The methodology describes measures for protection of waters against pollution caused by nitrates from agricultural sources in vulnerable zones of the Czech Republic. The methodology clearly describes ...

Klír, Jan; Kozlovská, Lada; Haberle, Jan; Mühlbachová, Gabriela
Výzkumný ústav rostlinné výroby, 2018

Methodology of risk assessment of increased incidence of BYDV in winter cereals
Jarošová, Jana; Bartáková, Pavla; Broženská, Michaela; Kumar, Jiban
2018 - Czech One of the most important viruses affecting cereals in the Czech Republic is Barley yellow dwarf virus (BYDV). BYDV is transmitted by cereal aphids and intensity of its occurrence varies strongly in individual years. Insecticide application protects the stands against virus transmission. In some years, however, the application of the insecticide is groundless. In this methodology we provide a method for increased BYDV occurrence risk evaluation in the field by sample collection of volunteer plants. The methodology is meant to serve mainly to farmers, agronomists and agricultural advisors. Mezi nejdůležitější virové choroby napadající obilniny v ČR patří žlutá zakrslost ječmene (BYDV). BYDV je přenášen obilnými mšicemi a intenzita jeho výskytu ročníkově silně kolísá. Proti přenosu viru se lze chránit insekticidním postřikem. Jeho využití je však v některých letech neopodstatněné. Tato metodika poskytuje popis způsobu odhadnutí rizika zvýšeného výskytu viru žluté zakrslosti ječmene na pozemku osetém ozimými obilovinami (ječmen, pšenice). Tato metodika je určena zejména zemědělcům, agronomům a zemědělským poradcům. Keywords: žlutá zakrslost ječmene; Barley yellow dwarf virus; obilniny; virové nemoci; zemědělství; rostlinné viry Available in a digital repository NRGL Methodology of risk assessment of increased incidence of BYDV in winter cereals

One of the most important viruses affecting cereals in the Czech Republic is Barley yellow dwarf virus (BYDV). BYDV is transmitted by cereal aphids and intensity of its occurrence varies strongly in ...

Jarošová, Jana; Bartáková, Pavla; Broženská, Michaela; Kumar, Jiban
Výzkumný ústav rostlinné výroby, 2018

Certified methodology for rapid evaluation of the current level of resistance of stored product infesting pests to phosphine gas based fumigants
Aulický, Radek; Stejskal, Václav; Frýdová, Barbora
2018 - Czech The presented new methodology is a set of information and procedures for evaluation of the sensitivity/resistance of storage pests to the phosphine (PH3) which is plant protections and/or biocide active substance commonly used for fumigation of infested commodities and empty store spaces as a key pest control intervention. The procedure is based on the international tests Phosphine Resistance Test Kit (Detia DEGESH's) and on the originally scientifically developed findings and information. The regular assessment of the resistance or resistance of field populations is one of the pillars of IPM whose implementation into practice helps to reduce the consumption of chemical products. Předložená nová metodika je souborem informací a postupů pro hodnocení odolnosti/rezistence skladištních škůdců k účinné látce fosforovodík, která se běžně využívá pro plynování napadených komodit a prázdných prostor při dezinsekčních zásazích. Metodika vychází z mezinárodního testu Phosphine Resistance Test Kit (Detia DEGESH) a je doplněna o nové vědecké poznatky. Hodnocení odolnosti nebo rezistence populací polních a skladištních škůdců patří mezi základní pilíře IPM, jejichž implementace v praxi napomáhá snižování spotřeby chemických přípravků a tím i zatěžování životního prostředí účinnými látkami přípravků, které vykazují sníženou nebo nedostatečnou účinnost na danou populaci škůdce. Keywords: fosforovodík; phosphine; škůdci; skladování; agrochemikálie Available in a digital repository NRGL Certified methodology for rapid evaluation of the current level of resistance of stored product infesting pests to phosphine gas based fumigants

The presented new methodology is a set of information and procedures for evaluation of the sensitivity/resistance of storage pests to the phosphine (PH3) which is plant protections and/or biocide ...

Aulický, Radek; Stejskal, Václav; Frýdová, Barbora
Výzkumný ústav rostlinné výroby, 2018

Methodics of risk determination of increased BYDV occurrence in winter cereals
Jarošová, Jana; Bartáková, Pavla; Broženská, Michaela; Kumar, Jiban
2018 - Czech One of the most important viruses affecting cereals in the Czech Republic is Barley yellow dwarf virus (BYDV). BYDV is transmitted by cereal aphids and intensity of its occurrence varies strongly in individual years. Insecticide application protects the stands against virus transmission. In some years, however, the application of the insecticide is groundless. In this methodology we provide a method for increased BYDV occurrence risk evaluation in the field by sample collection of volunteer plants. The methodology is meant to serve mainly to farmers, agronomists and agricultural advisors. Mezi nejdůležitější virové choroby napadající obilniny v ČR patří žlutá zakrslost ječmene (BYDV). BYDV je přenášen obilnými mšicemi a intenzita jeho výskytu ročníkově silně kolísá. Proti přenosu viru se lze chránit insekticidním postřikem. Jeho využití je však v některých letech neopodstatněné. Tato metodika poskytuje popis způsobu odhadnutí rizika zvýšeného výskytu viru žluté zakrslosti ječmene na pozemku osetém ozimými obilovinami (ječmen, pšenice). Metodika je určena zejména zemědělcům, agronomům a zemědělským poradcům. Keywords: mšice; ozimé obilniny; aphids; winter cereals; rostlinné viry; obilniny Available in a digital repository NRGL Methodics of risk determination of increased BYDV occurrence in winter cereals

One of the most important viruses affecting cereals in the Czech Republic is Barley yellow dwarf virus (BYDV). BYDV is transmitted by cereal aphids and intensity of its occurrence varies strongly in ...

Jarošová, Jana; Bartáková, Pavla; Broženská, Michaela; Kumar, Jiban
Výzkumný ústav rostlinné výroby, 2018

Production and use of specialized substrates and organic fertilizers in agriculture
Šimon, Tomáš; Usťak, Sergej; Váňa, Vojtěch
2018 - Czech The aim of the methodology is to provide to farmers, agricultural advisors, gardeners, producers and users of organic fertilizers and cultivation substrates, research workers and agricultural educators and all other interested parties, the basic information on the possibilities to use specialized substrates and organic fertilizers in agriculture. Its application in practice can ensure environmentally acceptable and economically efficient fertilization of agricultural crops. In the introduction, the methodology provides a basic overview of literary information about the concerned issue. Furthermore, the methodology describes the results obtained during the research project, which can be used in practice and provides agrochemical, agronomic and economic assessment. Part of the methodology is the assessment of agrochemical efficiency of fertilizer application at the cultivation of selected agricultural crops. There are described application methods and effects on soil and plants. Finally, it provides a summary of the results achieved and general recommendations for practice. Cílem metodiky je poskytnout zemědělcům, zemědělským poradcům, zahrádkářům, výrobcům a uživatelům organických hnojiv a pěstebních substrátů, pracovníkům ve výzkumu a zemědělském školství a všem ostatním zájemcům základní informace o možnostech výroby a využití specializovaných organických hnojiv a substrátů v zemědělství. Její uplatnění v praxi může zajistit ekologicky přijatelné a ekonomicky efektivní hnojení zemědělských plodin. V úvodu metodika poskytuje základní přehled literárních informací ohledně dotčené problematiky. Dále metodika popisuje vlastní výsledky získané v průběhu řešení výzkumného projektu využitelné v praxi a poskytuje jejich agrochemické agronomické a ekonomické hodnocení. Součástí metodiky je hodnocení agrochemické efektivity použití hnojiva při pěstování vybraných zemědělských plodin. Popsány jsou způsoby aplikace a účinky na půdu a rostliny. Na závěr uvádí souhrnné hodnocení dosažených výsledků a obecná doporučení pro praxi. Keywords: organická hnojiva; půdní mikroorganismy; organic fertilizers; soil microorganisms; hnojiva; komposty; rostlinná výroba Available in a digital repository NRGL Production and use of specialized substrates and organic fertilizers in agriculture

The aim of the methodology is to provide to farmers, agricultural advisors, gardeners, producers and users of organic fertilizers and cultivation substrates, research workers and agricultural ...

Šimon, Tomáš; Usťak, Sergej; Váňa, Vojtěch
Výzkumný ústav rostlinné výroby, 2018