Ano (16094)
Počet nalezených dokumentů:
16094
Publikováno od
do
Role klonální integrace v kompetici rostlin
Duchoslavová, Jana; Herben, Tomáš; Oborny, Beáta; Martínková, Jana
2024 - anglický
Clonal growth enables plant to replicate rooting units (i.e. ramets), adding another hierarchical level to plant modularity. Clonal growth is very common, at least in the temperate flora, and widespread over the angiosperm phylogenetic tree. Different clonal growth forms have specific sets of clonal traits that determine their performance in response to environmental conditions and under competition. Clonal integration is one of the important clonal traits and is associated with a number of other clonal functions. Integrated ramets can translocate resources and signals by connecting clonal organs, such as horizontal stems or roots. Such integration is particularly important for young developing ramets, but it may persist and help developed ramets cope with environmental heterogeneity. Clonal integration at both early and later stages of ramet development may be an important factor affecting plant competition and has been shown to promote expansion into vegetated areas in some species. However, competition is complex and differs aboveground and belowground. Translocation of carbon and nutrients under competition may differ accordingly, but very little is known about this. The costs and benefits of clonal integration have been predicted by theoretical models. However, there is considerable variability in the... Klonální růst umožňuje rostlinám replikovat kořenující jednotky (t.j. ramety), a přidává tak další hierarchickou úroveň k modularitě rostlinného těla. Klonální růst je velmi častý a vyskytuje se napříč celým fylogenetickým stromem krytosemenných rostlin. Jednotlivé formy klonálního růstu přinášejí rostlinám specifické sady klonálních vlastností, které určují jejich růst v různých podmínkách prostředí či v kompetici. Klonální integrace je jednou z důležitých klonálních vlastností související s řadou dalších funkcí klonality. Integrované ramety mohou translokovat zdroje a signální molekuly pomocí klonálních orgánů, jako jsou šlahouny, oddenky nebo kořeny. Integrace je zvláště důležitá pro mladé, vyvíjející se ramety, ale může přetrvat a vyrovnávat heterogenitu podmínek mezi vyvinutými rametami. Jak v raných, tak v pozdějších fázích vývoje může být klonální integrace důležitá v rostlinné kompetici. Experimentální studie ukázaly, že klonální integrace u některých druhů skutečně pomáhá jejich šíření do zápoje sousedních rostlin. Kompetice nad zemí a pod zemí se ale liší, což může mít vliv na translokaci uhlíku a živin. O tomto tématu se nicméně ví velmi málo. Výhody a nevýhody klonální integrace v různých podmínkách byly předpovídány pomocí teoretických modelů. Pozorované výhody klonální integrace se ale ukazují...
Klíčová slova:
klonální rostliny; fyziologická integrace; živiny; dusík; uhlík; translokace živin; heterogenita prostředí; kompetice; stabilní izotopy; pulzní značení; šlahouny; oddenky; ramety; klonální růstová forma; clonal plants; physiological integration; nutrients; nitrogen; carbon; resource translocation; environmental heterogeneity; competition; stable isotopes; pulse labelling; stolons; rhizomes; ramets; clonal growth form
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Role klonální integrace v kompetici rostlin
Clonal growth enables plant to replicate rooting units (i.e. ramets), adding another hierarchical level to plant modularity. Clonal growth is very common, at least in the temperate flora, and ...
Termodynamika prostoročasu: korekce z kvantové oblasti
Liška, Marek; Alonso Serrano, Ana; Chirco, Goffredo; Barceló, Carlos
2024 - anglický
This thesis explores the deep relation between gravitational dynamics and thermodynamics. It focuses on the notion that the gravitational dynamics is encoded in the thermodynamic equilibrium conditions applied to locally constructed, observer-dependent causal horizons. At the level of the (semi)classical gravity, we show that this approach leads to Weyl transverse gravity. The classical solutions of this gravitational theory are the same as those of general relativity, but it has different local symmetries, which leads to a different origin of the cosmological constant. As a useful computational tool for the (semi)classical part of the thesis, we also develop covariant phase space formalism for Weyl transverse gravity and identify the corresponding Wald entropy. We also generalise the formalism to arbitrary gravitational theories with the same symmetry group. Moreover, we explore the implications of the equivalence between gravitational dynamics and local equilibrium conditions for the low energy quantum gravitational dynamics. At the linearised level, we find a result consistent with quadratic gravity. However, beyond the linearised regime the dynamics becomes significantly different from quadratic gravity. We derive the equations for gravitational dynamics that capture this difference and study their... Tato práce zkoumá hluboký vztah mezi gravitací a termodynamikou. Zaměřuje se na představu, že gravitační dynamika je zakódována v podmínkách termodynamické rovnováhy aplikovaných na lokálně konstruované, na pozorovateli závislé kauzální horizonty. Na úrovni (semi)klasické gravitace jsme ukázali, že tento přístup vede k Weylově transversální gravitaci. Klasická řešení této gravitační teorie jsou stejná jako řešení obecné relativity, ale Weylova transversální gravitace má jiné lokální symetrie, což vede k jinému původu kosmologické konstanty. Jako užitečný výpočetní nástroj pro (semi)klasickou část práce jsme také vyvinuli kovariantní formalismus fázového prostoru pro Weylovu transversální gravitaci a identifikujeme odpovídající Waldovu entropii. Tento formalismus jsme také zobecnili na libovolné teorie gravitace se stejnou grupou symetrie. Navíc jsme zkoumali důsledky ekvivalence mezi gravitací a podmínkami lokální rovnováhy pro kvantovou gravitační dynamiku při nízkých energiích. Na linearizované úrovni jsme získali výsledek odpovídající kvadratické gravitaci. Mimo linearizovaný režim se však dynamika od kvadratické gravitace výrazně liší. Odvodili jsme rovnice pro gravitační dynamiku, které tento rozdíl zachycují, a prozkoumali jejich fyzikální důsledky na příkladu homogenních, izotropních kosmologií....
Klíčová slova:
termodynamika prostoročasu; kvantově gravitační korekce; gravitační entropie; rozlišení singularit; thermodynamics of spacetime; quantum gravity corrections; gravitational entropy; singularity resolution
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Termodynamika prostoročasu: korekce z kvantové oblasti
This thesis explores the deep relation between gravitational dynamics and thermodynamics. It focuses on the notion that the gravitational dynamics is encoded in the thermodynamic equilibrium ...
Eseje o třenicích ve finančních rozhodnutích
Šterc, Ante; Slavík, Ctirad; Rozsypal, Filip; Šustek, Roman
2024 - anglický
This disserta琀椀on analyzes individual 昀椀nancial decisions and their implica琀椀ons for wealth heterogeneity. In Chapter 1, I build a structural framework of a discrete investment fund choice. Using the Survey of Consumer Finances (SCF) data, I show that households exhibit limited considera琀椀on when choosing an investment fund. Speci昀椀cally, the structural model es琀椀mates show that households make their fund choice based only on a subset of available op琀椀ons. Condi琀椀onal on wealth, monetary losses from limited considera琀椀on are higher for less 昀椀nancially literate households, sugges琀椀ve of their choice simpli昀椀ca琀椀on. In Chapter 2, we focus on household mortgage take-up and re昀椀nancing decisions. Our novel U.S. data es琀椀mates show that the varia琀椀on in mortgage rates depends on individual 昀椀nancial skill level and search e昀昀ort. Speci昀椀cally, we implement stochas琀椀c record linkage and 昀椀nd that households with low 昀椀nancial literacy are up to 4% less likely to consider more lenders and lock in at 15-20 b.p. higher rates. Upon origina琀椀on, unskilled borrowers face a 35-45% higher mortgage delinquency and end up with a 30% lower likelihood of re昀椀nancing. We proceed to quan琀椀fy monetary losses due to ine昀昀ec琀椀ve search, and we show that households with low 昀椀nancial skills pay more than 10% extra at the 琀椀me of... Tato disertační práce analyzuje individuální 昀椀nanční rozhodování a jejich důsledky pro heterogenitu v bohatství. V kapitole 1 vytvářím strukturální rámec diskrétní volby inves琀椀čního fondu. Na základě údajů z Průzkumu spotřebitelských 昀椀nancí (Survey of Consumer Finances, SCF) ukazuji, že domácnos琀椀 zvažují výběr inves琀椀čního fondu omezeně. Odhady strukturálního modelu konkrétně ukazují, že domácnos琀椀 se při výběru fondu rozhodují pouze na základě podmnožiny dostupných možnos琀. V závislos琀椀 na bohatství jsou peněžní ztráty z omezeného zvažování vyšší u méně 昀椀nančně gramotných domácnos琀, což naznačuje, že jejich volba je zjednodušená. V kapitole 2 se zaměřujeme na rozhodování domácnos琀 o čerpání hypoték a re昀椀nancování. Naše nové odhady na amerických datech ukazují, že rozdíly v hypotečních sazbách závisí na úrovni 昀椀nančních dovednos琀 a úsilí jednotlivců při hledání. Konkrétně implementujeme stochas琀椀cké propojení záznamů a zjišeujeme, že domácnos琀椀 s nízkou 昀椀nanční gramotnos琀 mají až o 4% nižší pravděpodobnost, že budou zvažovat více věřitelů a za昀椀xují se na sazbách vyšších o 15-20 bazických bodů. Po poskytnu琀 hypotéky se nekvali昀椀kovaní dlužníci potýkají s o 35-45% vyšší delikvencí a nakonec mají o 30% nižší pravděpodobnost re昀椀nancování. Pokračujeme v kvan琀椀昀椀kaci peněžních ztrát způsobených...
Klíčová slova:
výběr investičního fondu; omezené zohlednění; finanční gramotnost; refinancování hypotéky; hledání hypotečního úvěru; fiskální multiplikátory; heterogenita bohatství; investment fund choice; limited consideration; financial literacy; mortgage refinancing; mortgage search; fiscal multipliers; wealth heterogeneity
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Eseje o třenicích ve finančních rozhodnutích
This disserta琀椀on analyzes individual 昀椀nancial decisions and their implica琀椀ons for wealth heterogeneity. In Chapter 1, I build a structural framework of a discrete investment fund choice. Using the ...
Šíření a přenos elektromagnetického záření v refraktivních a disperzivních prostředích v relativistických prostoročasech
Bezděková, Barbora; Heyrovský, David; Herdeiro, Carlos; Gallo, Emanuel
2024 - český
Light rays propagating around a compact gravitating object in a dispersive and re- fractive medium have been frequently studied analytically during recent years. Their description in the geometrical optics approximation is very appropriately performed in the Hamiltonian formalism. Despite the apparent simplifications, systems typically anal- ysed in the field are rather simple. The thesis presents results based on this formalism aimed to extend the current typical applications. First, a general axially symmetric ob- ject is considered and a generalized Carter constant for cold plasma is derived. Next, general expressions characterizing the basic properties of light propagation, such as the photon region or the deflection angle, are derived. Ray trajectories in the vicinity of ob- jects described both by the Kerr and Hartle-Thorne metrics are discussed. A refractive and dispersive medium characterised either by radial or rotational motion is considered and the deflection angles around a spherically symmetric object are calculated. A per- turbative approach to the moving medium is further presented in two distinctive ways. Light rays defined by their impact parameters are also studied in terms of the allowed regions around a Kerr black hole. 1 Světelné paprsky šířící se v okolí kompaktních gravitačních objektů v disperzivním a refraktivním prostředí jsou v posledních letech hojně studovány. Jejich popis v přiblížení geometrické optiky se značně zjednoduší použitím Hamiltonovského formalismu. I přesto, že je tento popis velmi efektivní, jsou systémy, které se v tomto přiblížení analyzují, stále poměrně jednoduché. Předkládaná práce představuje výsledky, které jsou založené na uvedeném formalismu, a jejím hlavním cílem je především rozšířit jeho možné použití. Nejdříve je definován obecný osově symetrický objekt ve studeném plazmatu a je nale- zený tvar zobecněné Carterovy konstanty. Dále jsou odvozeny obecné tvary některých veličin, které charakterizují šíření světla v daném systému, např. fotonová oblast nebo ohybový úhel. Trasování paprsků v okolí kompaktních objektů popsaných Kerrovou a Hartle-Thornovou metrikou je diskutováno v další části práce. Refraktivní a disperzivní prostředí pohybující se v radiálním nebo rotačním směru vůči sféricky symetrickému gra- vitačnímu objektu je definováno dále a v dané konfiguraci je vyjádřen odpovídající tvar pro ohybový úhel. Případ pohybujícího se prostředí je také studován ve formě porucho- vého počtu, který je v práci definován dvěma různými způsoby. Přístupové oblasti v okolí Kerrovy černé díry pro...
Klíčová slova:
relativistické prostoročasy-šíření elektromagnetických vln-geometrická optika-refraktivní a disperzivní prostředí-plazma-paprsky v prostředí s relativistickými rychlostmi-paprsky v prostředí kolem černých děr a v kosmologickém kontextu-gravitační čočkování-gravitační Hallův jev; relativistic spacetimes-propagation of electromagnetic waves-geometrical optics-refractive and dispersive media-plasma-rays in media moving with relativistic speeds in special relativity-rays in media around black holes and in cosmological context-gravitational lensing-gravitational Hall effect
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Šíření a přenos elektromagnetického záření v refraktivních a disperzivních prostředích v relativistických prostoročasech
Light rays propagating around a compact gravitating object in a dispersive and re- fractive medium have been frequently studied analytically during recent years. Their description in the geometrical ...
Eseje o Rozvojové Ekonomii
Sargsyan, Ella; Mittag, Nikolas Karl; Poyker, Michael; Fiorin, Stefano
2024 - anglický
This dissertation investigates effective household coping strategies during profound economic shocks, as well as the impact of violent conflicts and natural disasters on parents' child gender preferences in developing countries. In light of rising concerns about food insecurity caused by a variety of crises, the first chapter investigates effective coping strategies households can employ to mitigate the lasting impacts of income shocks and associated nutrition deficits. We uncover a previously unexplored coping mechanism - home production - and establish the extent of its effectiveness in mitigating the negative effects of crises on child health. To do so, we focus on the transition period after the collapse of the Soviet Union and investigate the role of household production of potatoes. Specifically, utilizing individual-level data from Russia, Kazakhstan, and other post-Soviet countries and exploiting the variation in the soil suitability index, we establish that households that grew potatoes on land more suitable for their cultivation were able to reduce the negative effects of transition shock on the health of their children as measured by adult height and height-for-age z-score. Our findings suggest that targeted nutritional interventions are needed to mitigate long-term adverse health... Tato disertační práce zkoumá účinné strategie domácností pro zvládání hlubokých ekonomických šoků a dopad násilných konfliktů a přírodních katastrof na genderové pref- erence rodičů v rozvojových zemích. Ve světle rostoucích obav z nedostatku potravin způsobeného různými krizemi zkoumá první kapitola účinné strategie zvládání, které mohou domácnosti využít ke zmírnění tr- valých dopadů příjmových šoků a souvisejícího nutričního deficitu. Odhalujeme dosud neprozkoumaný mechanismus zvládání - domácí výrobu - a zjišťujeme míru jeho účinnosti při zmírňování negativních dopadů krizí na zdraví dětí. Za tímto účelem se zaměřujeme na tranziční období po rozpadu Sovětského svazu a zkoumáme roli domácí produkce brambor. Konkrétně s využitím údajů na individuální úrovni z Ruska, Kazachstánu a dalších postsovětských zemí a s využitím variability indexu vhodnosti půdy zjišťujeme, že domácnosti, které pěstovaly brambory na půdě vhodnější pro jejich pěstování, dokázaly snížit negativní dopady transformačního šoku na zdraví svých dětí, měřeno výškou v dospělosti a z-skóre výšky na věk. Naše zjištění naznačují, že ke zmírnění dlouhodobých nepřiznivých...
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Eseje o Rozvojové Ekonomii
This dissertation investigates effective household coping strategies during profound economic shocks, as well as the impact of violent conflicts and natural disasters on parents' child gender ...
Chování a složitost v hospodaření domácností
Cota, Marta; Kapička, Marek; Schlafmann, Kathrin; Mazzonna, Fabrizio
2024 - anglický
This thesis explores mechanisms underlying differences in financial decision-making, includ- ing retirement saving and mortgage choice. Chapter 1 investigates the long-term effect of extrapolative expectations on retirement savings in subsidized employer-matched 401(k) ac- counts in the U.S. The chapter introduces a deviation from rational expectations in reproduc- ing worker-level retirement contribution rates over their tenure. Chapter 2 generates a novel U.S. data set and examines the correlation between financial literacy, mortgage rate attain- ment, and refinancing. Empirical estimates motivate the introduction of financial literacy and the level of search effort as dimensions of heterogeneity that generate differences in mort- gage repayments. I find that losses from low financial skill levels and search effort amount to almost 10 percent of the total loan, implying significant effects on the budgets of financially unskilled and inexperienced U.S. households. Chapter 3 leverages these empirical findings and embeds a micro-founded mortgage search framework in a standard heterogeneous agent model of consumption and saving. Financially skilled agents face lower cognitive search costs and thus explore more options, and ultimately achieve lower mortgage rates. Conditional on assets and... Tato práce zkoumá mechanismy, které jsou základem rozdílů ve finančním rozhodování, včetně spoření na důchod a výběru hypotéky. Kapitola 1 zkoumá dlouhodobý efekt extrapola- tivních očekávání na důchodové spoření v dotovaných zaměstnavatelských penzijních fondech 401(k) ve Spojených státech. Kapitola představuje odchylku od racionálních očekávání při reprodukci míry příspěvků na penzi na úrovni pracovníků v průběhu jejich zaměstnání. Kapitola 2 vytváří nový soubor dat z USA a zkoumá korelaci mezi finanční gramotností, dosažením hypoteční sazby a refinancováním. Empirické odhady motivují zavedení finanční gramotnosti a úrovně úsilí při vyhledávání jako dimenzí heterogenity, které vytvářejí rozdíly ve splácení hypoték. Zjišťuji, že ztráty z nízké úrovně finančních dovedností a úsilí při vyhledávání dosahují téměř 10% celkového úvěru, což znamená významný vliv na rozpočty finančně nekvalifikovaných a nezkušených amerických domácností. Kapitola 3 využívá těchto empirických zjištění a začleňuje rámec pro vyhledávání hypoték na mikroúrovni do standard- ního modelu spotřeby a úspor heterogenních agentů. Finančně zdatní agenti čelí nižším kog- nitivním nákladům na vyhledávání, a proto zkoumají více možností a v konečném důsledku dosahují nižších hypotečních sazeb. V závislosti na majetku a produktivitě se...
Klíčová slova:
očekávání příjmu; nezlikvidovatelné úspory; příspěvek na penzi; výběr hypotéky; finanční dovednosti; finanční vzdělání; nerovnost v spotřebě a úsporách; income expectations; illiquid savings; retirement contribution; mortgage choice; financial skills; financial education; consumption and saving inequality
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Chování a složitost v hospodaření domácností
This thesis explores mechanisms underlying differences in financial decision-making, includ- ing retirement saving and mortgage choice. Chapter 1 investigates the long-term effect of extrapolative ...
Cesta Hora: Panství a přechodová symbolika ve Sporu Hora a Sutecha
Čermák, Michal; Pehal, Martin; Spalinger, Anthony John; Goebs, Katja
2024 - anglický
The present study explores the Ancient Egyptian tale Contendings of Horus and Seth, attested from the New Kingdom Papyrus Chester Beatty I, with focus on its complex symbolism and relationship to contemporary Egyptian religious thought and royal ideology. Intertextual ties between the tale and multiple Egyptian textual corpora are outlined, including ritual texts, funerary inscriptions, royal inscriptions of various types and literature proper. The symbolic analysis is followed by an interpretation of the story as a literary rite of passage, centred on the drama of royal succession, represented in the tale by the maturation of the god Horus. Elements of individual stages of this process are identified, with particular attention being given to the liminal aspect of succession, in which the various symbolic layers merge into a single narrative focused on the transformation of a prince into a king. The study shows how the tale presents a complex theology of kingship as an earthly image of the creator god, who subsumes in the drama of his ascension to the throne the totality of vital processes in the universe, including the revival of the dead in the afterlife and a cyclic renewal of the whole cosmos. The figure of the god Seth serves as another major focus of the thesis, which describes his... Tato studie zkoumá staroegyptský příběh Spor Hora a Sutecha, doložený na papyru Chester Beatty I z Nové říše se zaměřením na jeho složitou symboliku a vztah k soudobému egyptskému náboženskému myšlení a královské ideologii. Věnuje se intertextuálním vazbám mezi příběhem a četnými egyptskými textovými korpusy včetně rituálních textů, pohřebních nápisů, královských inskripcí a literatury. Po této symbolické analýze následuje výklad příběhu jako literárního přechodového rituálu, jehož středobod představuje drama královského nástupnictví, které je v příběhu reprezentováno dospíváním boha Hora. Práce identifikuje prvky jednotlivých fází tohoto procesu, přičemž zvláštní pozornost je věnována liminálnímu aspektu nástupnictví, v němž se různé symbolické vrstvy spojují v jediné vyprávění zaměřené na proměnu prince v krále. Studie v příběhu odhaluje komplexní teologii královského úřadu jako pozemského obrazu boha stvořitele, který v dramatu svého nástupu na trůn subsumuje souhrn vitálních procesů ve vesmíru včetně oživení mrtvých v posmrtném životě a cyklické obnovy celého kosmu. Zkoumání postavy boha Sutecha představuje druhý ústřední prvek práce, která popisuje jeho nezastupitelnou funkci v životním cyklu kralování. Sutech je ukázán jako komplementární kosmický princip k Horovi, a zajišťuje trvalou...
Klíčová slova:
Arnold van Gennep|Dér el-Medína|Hor|Kruhová kompozice|Liminalita|Maurice Bloch|Mýtus a rituál|Papyrus Chester Beatty I|Pozdně egyptská literatura|Přechodové rituály|Přechodové rituály (Starý Egypt)|Spor Hora a Sutecha|Staroegyptská kosmologie|Staroegyptská literatura|Staroegyptská mytologie|Staroegyptské náboženství|Staroegyptský královský úřad|Sutech|Victor Turner; Ancient Egyptian Cosmology|Ancient Egyptian Kingship|Ancient Egyptian Literature|Ancient Egyptian Mythology|Ancient Egyptian Religion|Arnold van Gennep|Contendings of Horus and Seth|Deir el-Medina|Horus|Late Egyptian Literature|Liminality|Maurice Bloch|Myth and Ritual|Papyrus Chester Beatty I|Ring Composition|Rites of Passage|Rites of Passage (Ancient Egypt)|Seth|Victor Turner
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Cesta Hora: Panství a přechodová symbolika ve Sporu Hora a Sutecha
The present study explores the Ancient Egyptian tale Contendings of Horus and Seth, attested from the New Kingdom Papyrus Chester Beatty I, with focus on its complex symbolism and relationship to ...
Struktura minoritních alkaloidů čeledi Amaryllidaceae jako inspirace pro syntézu sloučenin s biologickou aktivitou cílenou vůči Alzheimerově chorobě
Pidaný, Filip; Cahlíková, Lucie; Drašar, Pavel; Strnad, Miroslav
2024 - slovenský
Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmacognosy and Pharmaceutical Botany Candidate: Mgr. Filip Pidaný Supervisor: Prof. Ing. Lucie Cahlíková, Ph.D. Consultant: Assoc. Prof. Jan Korábečný, Ph.D. Title of Doctoral Thesis: The structure of minor alkaloids of the Amaryllidaceae family as inspiration for the synthesis of compounds with biological activity targeting Alzheimer's disease The theoretical part of this dissertation provides a basic overview of the Amaryllidaceae family known for its rich occurrence of structurally diverse alkaloids. These substances exhibit a wide range of pharmacological effects, with our studies focusing on their potential therapeutic use in the treatment of Alzheimer's disease (AD). It is the most common form of dementia, which is characterized by progressive neurodegeneration. As the life expectancy of the population increases, the global prevalence of AD is also rising. This trend presents not only economic but also social challenges for healthcare systems, and society as a whole. The thesis provides detailed descriptions of the most well-known hypotheses of AD development and the characteristics of clinically used medications. Attention is given to the decline in levels of acetylcholinesterase, the dominant enzyme in a healthy... Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakognozie a farmaceutické botaniky Kandidát: Mgr. Filip Pidaný Školiteľ: prof. Ing. Lucie Cahlíková, Ph.D. Konzultant: doc. PharmDr. Jan Korábečný, Ph.D. Názov dizertačnej práce: Štruktúra minoritných alkaloidov čeľade Amaryllidaceae ako inšpirácia pre syntézu zlúčenín s biologickou aktivitou cielenou voči Alzheimerovej chorobe Predkladaná dizertačná práca v teoretickej časti poskytuje základný prehľad o čeľadi Amaryllidaceae známej pre bohatý výskyt štruktúrne rozmanitých alkaloidov. Tieto látky vykazujú široké spektrum farmakologických účinkov, pričom naše štúdie sa zameriavajú na ich potenciálne terapeutické využitie v terapii Alzheimerovej choroby (AD). Ide o najčastejšiu formu demencie, ktorá je charakterizovaná progresívnou neurodegeneráciou. S narastajúcou dĺžkou života populácie rastie aj celosvetová prevalencia AD. Tento trend predstavuje nielen ekonomické, ale aj sociálne výzvy pre zdravotné systémy a spoločnosť ako celok. V práci sú detailne popísané najznámejšie hypotézy vzniku AD a charakteristiky klinicky používaných liečiv. Pozornosť je venovaná poklesu hladín acetylcholínesterázy, dominantného enzýmu zdravého mozgu, ako aj postupnému nárastu hladín kompenzačného enzýmu butyrylcholínesterázy (BChE). Experimentálna...
Klíčová slova:
prírodné látky; liečivá; alkaloidy; neurodegeneratívne ochorenia; Alzheimerova choroba; natural products; drugs; alkaloids; neurodegenerative diseases; Alzheimer's disease
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Struktura minoritních alkaloidů čeledi Amaryllidaceae jako inspirace pro syntézu sloučenin s biologickou aktivitou cílenou vůči Alzheimerově chorobě
Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmacognosy and Pharmaceutical Botany Candidate: Mgr. Filip Pidaný Supervisor: Prof. Ing. Lucie Cahlíková, Ph.D. Consultant: ...
Intravitální diagnostika neurodegenerativních onemocnění.
Baranová, Soňa; Holada, Karel; Kaňovský, Petr; Žáková, Dana
2024 - anglický
Prionopathies, also called transmissible spongiform encephalopathies (TSE) and synucleinopathies are neurodegenerative diseases that are associated with the accumulation of misfolded proteins (prion and α-synuclein) mostly in the central nervous system. To this day, early and definite diagnosis remains unavailable during the patient's lifetime, mainly due to the absence of reliable biomarker which makes clinical diagnosis more challenging. Therefore, the gold standard in diagnostics remains direct post-mortem evaluation of misfolded proteins within brain tissue by western blot and immunohistochemistry. In the recent years, seeding amplification assays (SAAs) like Real-Time Quacking-Induced Conversion (RT-QuIC) emerged for ultra-sensitive ante-mortem diagnosis of neurodegenerative diseases. SAAs exploit ability of pathological misfolded proteins present in patient's samples to change the conformation and initiate aggregation of native recombinant protein substrate by prion-like seeding mechanism. In the presented dissertation thesis, we exploited second-generation RT-QuIC assay (55řC, 700 rpm, cycles of 1 min double-orbital shaking and 1 min incubation) utilizing recombinant hamster shortened prion protein (rHAPrP90-231) to evaluate prion seeding activity in post-mortem TSE (n=38) and non-TSE (n=30)... Prionopatie, taktiež nazývané transmisívne spongiformné encefalopatie (TSE), a synukleínopatie predstavujú skupinu neurodegeneratívnych ochorení, ktoré sú asociované s akumuláciou nesprávne zložených proteínov (prión a α-synukleín) prevažne v centrálnom nervovom systéme. Kvôli absencii spoľahlivého biomarkera je včasná a definitívna diagnostika počas života pacienta nedostupná. Zlatým štandardom preto zostáva priama post-mortem detekcia patologicky zložených proteínov v mozgovom tkanive pomocou western blotu a imunohistochémie. Avšak v posledných rokoch sa pre ultra-senzitívnu ante-mortem diagnostiku zaviedli metódy so spoločným názvom ʺseeding amplification assays (SSAs)ʺ akou je aj Real-Time Quacking-Induced Conversion (RT-QuIC). SAAs využívajú schopnosť patologicky zložených proteínov, ktoré sú prítomné v pacientskej vzorke, zmeniť konformáciu a iniciovať agregáciu monomérneho rekombinantného proteínu v substráte vďaka ʺprion-likeʺ mechanizmu. V prezentovanej dizertačnej práci sme analyzovali prión konvertujúcu aktivitu v post- mortem TSE (n=38) a non-TSE (n=30) vzorkách cerebrospinálneho moku (CSF) a korešpondujúcich vzoriek koží pomocou druhej generácie RT-QuIC metódy (55řC, 700 rpm, cykly 1 min dvoj orbitálneho trepania a 1 min inkubácia) s využitím rekombinantného skráteného priónového...
Klíčová slova:
diagnostika; neurodegeneratívne ochorenia; prión; CJCH; α-synukleín; synukleínopatia; RT-QuIC; diagnosis; neurodegenerative diseases; prion; CJD; α-synuclein; synucleinopathy; RT-QuIC
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Intravitální diagnostika neurodegenerativních onemocnění.
Prionopathies, also called transmissible spongiform encephalopathies (TSE) and synucleinopathies are neurodegenerative diseases that are associated with the accumulation of misfolded proteins (prion ...
Význam různých zdrojů a sekvenančních protokolů při zvyšování přesnosti NGS analýz v diagnostických aplikacích
Kvapilová, Kateřina; Kozmik, Zbyněk; Piherová, Lenka; Slabý, Ondřej
2024 - anglický
1 ABSTRACT Continued advances in next-generation sequencing (NGS) technology, such as capacity, speed, and reduced cost per sequenced base, revolutionize personalized medicine and bring genomics into routine clinical practice. Nevertheless, NGS is still under rapid development, and the variability of sequencing protocols and validation procedures is one of its current bottlenecks. This thesis aimed to study the influence of different sample sources and NGS protocols (NGS library construction-sequencing-data analysis) on the accuracy of NGS analysis in diagnostic applications. In the first study, performed during the COVID-19 pandemic outbreak, we developed NGS protocols suitable for a whole genome analysis of the SARS-CoV-2 virus. Subsequently, in the second study, we examined the suitability of human saliva-derived gDNA for genomic/genetic analysis of selected variant types compared to traditional blood-derived gDNAusing validated NGS protocol and statistical comparison of the obtained data. Whole genome analysis of the SARS-CoV-2 genome was performed using two captured- based approaches and one amplicon-based approach to study the quality and effectivity of the respective NGS protocols. Synthetic controls were employed to verify the accuracy and specificity of the developed NGS protocols. We proved that... 1 Souhrn Neustálé pokroky v technologii sekvenování nové generace (NGS), jakými jsou kapacita, rychlost a snížené náklady na sekvenovaní, vedou k revoluci v personalizované medicíně, tím, jak postupně přináší genomiku do rutinní klinické praxe. NGS se stále rychle vyvíjí, avšak variabilita sekvenačních protokolů a validačních postupů je jedním z jeho problematických rysů. Cílem této práce bylo zhodnotit význam různých zdrojů vzorků a sekvenačních protokolů (od přípravy sekvenační knihovny-sekvenování-analýzi dat) pro zvýšení přesnosti NGS analýzy v diagnostických aplikacích. V první studii, provedené během vypuknutí pandemie COVID-19, jsme vyvinuli NGS protokoly vhodné pro analýzu celého genomu viru SARS-CoV-2. Následně jsme ve druhé studii zkoumali vhodnost lidské genomické DNA (gDNA) pocházející ze slin pro genomickou/genetickou analýzu vybraných variantních k tradiční gDNApocházející z krve pomocí validovaného NGS protokolu a statistického srovnání získaných dat. K ověření účinnosti sekvenačních protokolů pro analýzu celého genomu SARS-CoV-2 byly použity dva sekvenační přístupy založené na zachycení části genomu a jeden sekvenanční přístup založený na amplifikaci částí genomů. K ověření přesnosti a specifičnosti vyvinutých NGS protokolů byly použity syntetické kontroly. Prokázali jsme, že kvantifikace...
Klíčová slova:
NGS; WGS; WES; analýza variant; slinná gDNA; validace NGS protokolu; NGS; WGS; WES; genomics variant analysis; saliva-derived gDNA; validation guideline
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Význam různých zdrojů a sekvenančních protokolů při zvyšování přesnosti NGS analýz v diagnostických aplikacích
1 ABSTRACT Continued advances in next-generation sequencing (NGS) technology, such as capacity, speed, and reduced cost per sequenced base, revolutionize personalized medicine and bring genomics into ...
NUŠL poskytuje centrální přístup k informacím o šedé literatuře vznikající v ČR v oblastech vědy, výzkumu a vzdělávání. Více informací o šedé literatuře a NUŠL najdete na webu služby.
Vaše náměty a připomínky posílejte na email nusl@techlib.cz
Provozovatel
Zahraniční báze