Počet nalezených dokumentů: 568
Publikováno od do

Novel conformationally locked nucleosides and nucleotides
Nencka, Radim; Šála, Michal; Hřebabecký, Hubert; Procházková, Eliška; Mackman, R.; Barauskas, O.; Lee, Y. J.; Tian, Y.
2014 - anglický
We report on a synthesis of two novel types of conformationally locked nucleoside analogues. We prepared 7 membered ring 3’,5’-bridged nucleoside analogs locked in a Southern conformation. These nucleoside analogues were converted in one pot to appropriate phosphoramidate prodrugs using boronate methodology. We also devised and prepared a novel carbocyclic nucleoside by replacing furanose with cyclohexene that resulted in a locked Northern conformation similar to LNA monomers. Further details on the biological activity and application for oligonucleotide synthesis will be discussed in detail. Klíčová slova: locked nucleoside analogues; oligonucleotide synthesis Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR.
Novel conformationally locked nucleosides and nucleotides

We report on a synthesis of two novel types of conformationally locked nucleoside analogues. We prepared 7 membered ring 3’,5’-bridged nucleoside analogs locked in a Southern conformation. These ...

Nencka, Radim; Šála, Michal; Hřebabecký, Hubert; Procházková, Eliška; Mackman, R.; Barauskas, O.; Lee, Y. J.; Tian, Y.
Ústav organické chemie a biochemie, 2014

Redox značení DNA - od jednoduché detekce DNA pomocí modifikace komplexy oxidu osmičelého k ratiometrické analýze sekvencí
Havran, Luděk; Balintová, Jana; Vidláková, Pavlína; Macíčková-Cahová, Hana; Pivoňková, Hana; Hocek, Michal; Fojta, Miroslav
2014 - český
Elektrochemické metody našly široké uplatnění jak v analýze DNA a studiu jejích interakcí s různými látkami, tak i při vývoji senzorů pro detekci hybridizace DNA. DNA je přirozeně elektroaktivní molekula, která poskytuje na různých typech pracovních elektrod řadu analyticky využitelných elektrochemických signálů. Pro některé typy analýz, zvláště pak při vývoji DNA hybridizačních senzorů, se osvědčilo užití redox aktivních značek. Jedním ze způsobů jak zavést do DNA elektroaktivní značku je její modifikace pomocí komplex oxidu osmičelého s dusíkatými ligandy (Os,L). Vznikající adukty poskytují na rtuťových i uhlíkových elektrodách elektrochemické signály v důsledku redukce/oxidace atomu osmia v molekule aduktu. Tato metoda značení DNA našla uplatnění ve vysoce citlivé analýze DNA a také v analýze nukleotidových sekvencí. Další z metod pro přípravu redox značené DNA je enzymatická inkorporace značených deoxyribonukleotid trifosfátů (dNTP) pomocí DNA polymeráz. Značené dNTP lze připravit jednoduchou cross-coupling reakcí ve vodném prostředí. V tomto příspěvku bude demonstrována aplikace různých redox aktivních značek v elektrochemické analýze DNA. DNA is electroactive molecule producing analytically useful intrinsic voltammetric signals. For some applications is a useful use redox active tag to improve specificity of the analysis. One from approaches how to prepare DNA bearing redox label is its modification by complexes of osmium tetroxide with nitrogen ligands. This method find wide used in highly sensitive DNA detection and in development of electrochemical DNA hybridization sensors. Another possibility for preparation of redox labeled DNA is incorporation of redox tags modified deoxynucleotide triphosphates by DNA polymerases. In this contribution will be demonstrated application of various redox labels in electrochemical analysis of DNA. Klíčová slova: DNA electrochemical analysis; chemically modified DNA; DNA sensors; redox labels Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR.
Redox značení DNA - od jednoduché detekce DNA pomocí modifikace komplexy oxidu osmičelého k ratiometrické analýze sekvencí

Elektrochemické metody našly široké uplatnění jak v analýze DNA a studiu jejích interakcí s různými látkami, tak i při vývoji senzorů pro detekci hybridizace DNA. DNA je přirozeně elektroaktivní ...

Havran, Luděk; Balintová, Jana; Vidláková, Pavlína; Macíčková-Cahová, Hana; Pivoňková, Hana; Hocek, Michal; Fojta, Miroslav
Ústav organické chemie a biochemie, 2014

Structure of an immunoactive polysaccharide isolated from Korean mulberry fruit (Morus alba L.)
Bleha, R.; Lee, J. S.; Capek, P.; Pohl, Radek; Kim, H. B.; Choi, D. J.; Lee, S.; Lee, J.; Jang, S. J.; Synytsya, A.; Park, Y. I.
2014 - anglický
A water-soluble polysaccharide (JS-MP-1) was isolated from the water extract of Korean white mulberry fruits (Morus alba L.) by ethanol precipitation and then purified by DEAE-cellulose ion exchange chromatography. Obtained final polysaccharide (1600 KDa) consisted of galactose, arabinose and rhamnose as major neutral sugars. JS-MP-1 also contains galacturonic and glucuronic acids (4:1). Sugar linkage, FTIR and correlation NMR analyses confirmed that it is a rhamnogalacturonan type I (RG I), which contains the alternating sequence of 1,4-alpha-D-GalAp and 1,2-alpha-L-Rhap units in the backbone. Neutral sugar side chains of JS-MP1 were identified as (1 -> 5)-alpha-L-arabinan and arabinogalactan type II (AG II) having the (1 -> 6)-beta-D-galactan core. The arabinan side chains are bound to the backbone at the O-4 position of some alpha-L-Rhap units, while the way of linkage between RG I and AG II chains is unclear. It was demonstrated that JS-MP-1 significantly stimulates murine macrophage RAW 264.7 cells to release chemokines (RANTES and MIP-1 alpha) and proinflammatory cytokines like INF-alpha and IL-6, and induce the iNOS and COX-2 gene expression, which are responsible for the production of NO and prostaglandin PGE2, respectively. These results suggest that JS-MP-1 can act as a potent immunomodulator and these observations may support the applicability of this polysaccharide or the water extracts of mulberry fruit can be used as an immunotherapeutic adjuvant or health beneficial food material. Klíčová slova: pectic polysaccharides Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR.
Structure of an immunoactive polysaccharide isolated from Korean mulberry fruit (Morus alba L.)

A water-soluble polysaccharide (JS-MP-1) was isolated from the water extract of Korean white mulberry fruits (Morus alba L.) by ethanol precipitation and then purified by DEAE-cellulose ion exchange ...

Bleha, R.; Lee, J. S.; Capek, P.; Pohl, Radek; Kim, H. B.; Choi, D. J.; Lee, S.; Lee, J.; Jang, S. J.; Synytsya, A.; Park, Y. I.
Ústav organické chemie a biochemie, 2014

Development and applications of ionization techniques in ambient mass spectrometry
Rejšek, Jan; Vrkoslav, Vladimír; Cvačka, Josef
2014 - anglický
Ambient mass spectrometry is a sharply developing subject area. Desorption electrospray ionization (DESI) and desorption atmospheric pressure photoionization (DAPPI) are two types of ionization techniques in the ambient mass spectometry. Herein, they were investigated in two research areas: (1) TLC analysis. (2) Localization of insect defense glands. Klíčová slova: ambient mass spectrometry; desorption electrospray ionization; desorption atmospheric pressure photoionization; thin-layer chromatography; insect defense compounds; mass spectrometry imaging Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR.
Development and applications of ionization techniques in ambient mass spectrometry

Ambient mass spectrometry is a sharply developing subject area. Desorption electrospray ionization (DESI) and desorption atmospheric pressure photoionization (DAPPI) are two types of ionization ...

Rejšek, Jan; Vrkoslav, Vladimír; Cvačka, Josef
Ústav organické chemie a biochemie, 2014

Analysis and characterization of antimicrobial peptides by capillary electromigration methods
Tůmová, Tereza; Monincová, Lenka; Čeřovský, Václav; Kašička, Václav
2014 - anglický
High-performance capillary electromigration methods (zone electrophoresis, affinity electrophoresis, isotachophoresis and micellar electrokinetic chromatography) have been applied to analysis and physicochemical characterization of halictines – antimicrobial peptides isolated from the bee Halictus sexcinctus. Klíčová slova: antimicrobial peptides; capillary electrophoresis; coating Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR.
Analysis and characterization of antimicrobial peptides by capillary electromigration methods

High-performance capillary electromigration methods (zone electrophoresis, affinity electrophoresis, isotachophoresis and micellar electrokinetic chromatography) have been applied to analysis and ...

Tůmová, Tereza; Monincová, Lenka; Čeřovský, Václav; Kašička, Václav
Ústav organické chemie a biochemie, 2014

Sborník 14. ročníku Školy hmotnostní spektrometrie
Cvačka, Josef; Vrkoslav, Vladimír
2013 - český
Sborník plných verzí přednášek zaměřených na základy hmotnostní spektrometrie, ionizační techniky, hmotnostní analyzátory, spojení hmotnostní spektrometrie a chromatografie, kvantifikaci, proteomiku, metabolomiku a interpretaci dat. Proceedings of full versions of lectures covering basics of mass spectrometry, ionization techniques, mass analyzers, coupling of mass spectrometry to chromatography, quantification, proteomics, metabolomics and data interpretation. Klíčová slova: mass spectrometry; fundamentals; proteomics; metabolomics Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR.
Sborník 14. ročníku Školy hmotnostní spektrometrie

Sborník plných verzí přednášek zaměřených na základy hmotnostní spektrometrie, ionizační techniky, hmotnostní analyzátory, spojení hmotnostní spektrometrie a chromatografie, kvantifikaci, proteomiku, ...

Cvačka, Josef; Vrkoslav, Vladimír
Ústav organické chemie a biochemie, 2013

Hmotnostní spektrometrie v lipidomice
Cvačka, Josef
2013 - český
Podrobně jsou diskutovány současné postupy analytické chemie v lipidomice založené na hmotnostní spektrometrii a chromatografii. Jsou uvedeny příklady kvalitativních a kvantitativních metod včetně hmotnostně-spektrometrického zobrazování. Current approaches of analytical chemistry in lipidomics based on mass spectrometry and chromatography are discussed in detail. Examples of qualitative, quantitative and imaging approaches are given. Klíčová slova: lipids; analysis; mass spectrometry; chromatography Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR.
Hmotnostní spektrometrie v lipidomice

Podrobně jsou diskutovány současné postupy analytické chemie v lipidomice založené na hmotnostní spektrometrii a chromatografii. Jsou uvedeny příklady kvalitativních a kvantitativních metod včetně ...

Cvačka, Josef
Ústav organické chemie a biochemie, 2013

Desorpční ionizační techniky
Vrkoslav, Vladimír
2013 - český
V přednášce jsou shrnuty a popsány principy různých desorpčních ionizačních technik. Důraz je kladen hlavně techniky v současnosti nejvíce používané a jejich souvislost s hmotnostně-spektrometrickým zobrazováním. The principles of the various desorption ionization techniques are summarized and described. Widely used techniques and their relationship with mass-spectrometric imaging are discussed in details. Klíčová slova: mass spectrometry; analysis; mass spectrometry imaging Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR.
Desorpční ionizační techniky

V přednášce jsou shrnuty a popsány principy různých desorpčních ionizačních technik. Důraz je kladen hlavně techniky v současnosti nejvíce používané a jejich souvislost s hmotnostně-spektrometrickým ...

Vrkoslav, Vladimír
Ústav organické chemie a biochemie, 2013

Analytical methods Used in the Studies on Chemical Ecology of Termites
Krasulová, Jana; Hanus, Robert; Sillam-Dusses, David; Žáček, Petr; Jiroš, Pavel; Šobotník, Jan; Kalinová, Blanka; Bosáková, Z.; Valterová, Irena
2012 - anglický
In this paper, I review our recent results on the trail-following communication in the Neotropical termite Glossotermes oculas (Serritermitidae) and the defensive chemistry of the African termite Psammotermes hybostoma (Rhinotermitidae). These findings belong to our current project focused on chemical ecology of critical termite genera from families Rhinotermitidae and Serritermitidae. Klíčová slova: defensive compounds; GC-MS; GCxGC-MS; termites; trail-following pheromone Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR.
Analytical methods Used in the Studies on Chemical Ecology of Termites

In this paper, I review our recent results on the trail-following communication in the Neotropical termite Glossotermes oculas (Serritermitidae) and the defensive chemistry of the African termite ...

Krasulová, Jana; Hanus, Robert; Sillam-Dusses, David; Žáček, Petr; Jiroš, Pavel; Šobotník, Jan; Kalinová, Blanka; Bosáková, Z.; Valterová, Irena
Ústav organické chemie a biochemie, 2012

Photoluminiscent diamond nanoparticles - new diagnostic and visualization probes
Cígler, Petr
2012 - anglický
Selected problems connected with surface modification of nanosized diamond crystals, attachment of chemical sensing architectures to them and their colloidal stability were addressed. Fluorescent nanodiamonds modified by proper functional structures were shown as unique unbleachable nanoprobes for construction of future sensors useful in biological and medicinal applications. Klíčová slova: nanodiamond; fluorescence probe; nanosensor Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR.
Photoluminiscent diamond nanoparticles - new diagnostic and visualization probes

Selected problems connected with surface modification of nanosized diamond crystals, attachment of chemical sensing architectures to them and their colloidal stability were addressed. Fluorescent ...

Cígler, Petr
Ústav organické chemie a biochemie, 2012

O službě

NUŠL poskytuje centrální přístup k informacím o šedé literatuře vznikající v ČR v oblastech vědy, výzkumu a vzdělávání. Více informací o šedé literatuře a NUŠL najdete na webu služby.

Vaše náměty a připomínky posílejte na email nusl@techlib.cz

Provozovatel

http://www.techlib.cz

Facebook

Zahraniční báze