Úloha interakce cirkadiánního a imunitního systému při rozvoji obesity a diabetu 2. typu
Honzlová, Petra; Sumová, Alena; Okuliarová, Monika; Vodička, Martin
2024 - anglický Disruptions within the circadian, metabolic, and immune systems contribute to the onset of metabolic illnesses, including type 2 diabetes. This doctoral thesis aimed to examine the mutual interactions between these three systems in relation to the development of metabolic disorders. The circadian system regulates a variety of mammalian physiological processes. On the molecular level, the circadian clock is in individual cells maintained by a complex of interconnected transcription-translation feedback loops. The circadian system is hierarchically organized, consisting of the central circadian clock residing within the suprachiasmatic nuclei (SCN) and of peripheral oscillators found in various organs and tissues, including the pancreas and compartments of the innate immune system such as macrophages and microglia. The central circadian clock synchronizes the peripheral oscillators via multiple pathways, including feeding- related metabolic changes to which some of the peripheral oscillators are highly sensitive. Misaligned feeding can thus induce dyssynchrony between individual peripheral oscillators. Our results show that a reverse restricted feeding (rRF) regimen, when food is available only for a limited time during the resting period of the day, has distinct effects on the circadian clocks in... Poruchy v rámci cirkadiánního, metabolického a imunitního systému přispívají ke vzniku metabolických onemocnění, včetně diabetu 2. typu. Cílem této disertační práce bylo prozkoumat vzájemné interakce mezi těmito třemi systémy ve vztahu k rozvoji metabolických poruch. Mnohé fyziologické procesy jsou u savců regulovány cirkadiánním systémem. Na molekulární úrovni jsou cirkadiánní hodiny v jednotlivých buňkách udržovány komplexem vzájemně propojených transkripčně-translačních zpětnovazebných smyček. Cirkadiánní systém je hierarchicky uspořádán a skládá se z centrálních cirkadiánních hodin sídlících v suprachiasmatických jádrech (SCN) a z periferních oscilátorů, které se nacházejí v různých orgánech a tkáních, včetně pankreatu a složek vrozeného imunitního systému, jako jsou makrofágy a mikroglie. Centrální cirkadiánní hodiny synchronizují periferní oscilátory pomocí mnohočetných drah, včetně těch souvisejících se změnou metabolismu vlivem příjmu potravy, ke kterým jsou některé periferní oscilátory vysoce citlivé. Rozpor mezi synchronizujícími signály pocházejícími z SCN a z příjmu potravy tak může vyvolat desynchronizaci mezi jednotlivými periferními oscilátory. Naše výsledky prokázaly, že režim obráceného a omezeného příjmu potravy (rRF z angl. reverse restricted feeding), kdy bylo jídlo dostupné... Klíčová slova: cirkadiánní hodiny; pankreas; mikroglie; makrofágy; reverzní omezený příjem potravy; suprachiasmatická jádra; circadian clock; pancreas; microglia; macrophage; reverse restricted feeding; polarization; suprachiasmatic nuclei Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL Úloha interakce cirkadiánního a imunitního systému při rozvoji obesity a diabetu 2. typu

Disruptions within the circadian, metabolic, and immune systems contribute to the onset of metabolic illnesses, including type 2 diabetes. This doctoral thesis aimed to examine the mutual interactions ...

Honzlová, Petra; Sumová, Alena; Okuliarová, Monika; Vodička, Martin
Univerzita Karlova, 2024

Síňokomorová blokáda u dětí: dlouhodobý vliv bradykardie na srdeční funkci a indikace k intervenci
Jičínský, Michal; Janoušek, Jan; Klásková, Eva; Vančura, Vlastimil
2024 - český Introduction. Non-surgical complete atrioventricular block (CAVB) in children is a rare disease. In absence of physiological conduction from atria to ventricles, patients suffer from life-long bradycardia. As causal treatment is not available, the only option to alleviate clinical symptoms and prevent possible sudden cardiac death is to implant a permanent pacemaker (PM). Correct timing of PM implantation in asymptomatic children is often challenging and published data regarding this issue are scarce. In the light of potential complications of early PM implantation, it is desirable to postpone this treatment as much as possible. Aims. We aimed to create a model of natural history of non-surgical CAVB in children and to find risk factors predicting need for future PM implantation in these patients. Also, we aimed to evaluate the effect of cardiac resynchronization therapy in heart failure patients associated with left ventricular apical epicardial pacing. Methods: Retrospective analysis of a nation-wide cohort of paediatric patients with non- surgical CAVB between 1977 and 2016. Prospective case study evaluating the effect of cardiac resynchronization therapy in paediatric patients with heart failure associated with left ventricular apical pacing. Results. Progression of bradycardia in children with... Úvod: Nechirurgická kompletní síňokomorová blokáda (complete atrioventricular block, CAVB) u dětí je vzácné onemocnění, při kterém je pacient při absenci fyziologického převodu srdeční elektrické aktivity ze síní na komory celoživotně zatížen bradykardií. Kauzální léčba není většinou možná a jedinou dostupnou terapií k odstranění symptomů a prevenci náhlé srdeční smrti je zavedení trvalé kardiostimulace (TKS). Správné načasování TKS je u asymptomatických dětských pacientů často obtížné a dostupná data omezená. Vzhledem ke komplikacím celoživotní TKS je její odložení do co nejvyššího věku žádoucí. Cíl: Vytvořit model přirozeného průběhu CAVB u dětí a stanovit rizikové faktory predikující budoucí indikaci TKS. Analyzovat efekt srdeční resynchronizační léčby u pacientů s vývojem dysfunkce levé komory v důsledku v dětském věku převládající epikardiální stimulace z jejího hrotu. Metodika: Retrospektivní analýza celonárodní kohorty dětských pacientů s nechirurgickou CAVB od roku 1977 do 2016. Prospektivní případová studie efektu srdeční resynchronizační léčby u pacientů stimulovaných z hrotu levé komory. Výsledky: Progrese bradykardie u dětí s nechirurgickou CAVB je nejvýznamnější v prvních dvou letech života s následným pomalejším poklesem tepové frekvence do dospělosti. Správná funkce levé komory je po... Klíčová slova: Kompletní síňokomorová blokáda; přirozený průběh; trvalá kardiostimulace; srdeční resynchronizační terapie; Complete atrioventricular block; natural history; pacemaker; cardiac resynchronization therapy Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL Síňokomorová blokáda u dětí: dlouhodobý vliv bradykardie na srdeční funkci a indikace k intervenci

Introduction. Non-surgical complete atrioventricular block (CAVB) in children is a rare disease. In absence of physiological conduction from atria to ventricles, patients suffer from life-long ...

Jičínský, Michal; Janoušek, Jan; Klásková, Eva; Vančura, Vlastimil
Univerzita Karlova, 2024

Rozhodovací praxe Apelačního soudu a Constitutio Criminalis Josephina (1687-1727)
Vacek, Josef; Starý, Marek; Kindl, Vladimír; Knoll, Vilém
2024 - český ROZHODOVACÍ PRAXE APELAČNÍHO SOUDU A CONSTITUTIO CRIMINALIS JOSEPHINA (1687-1727) Disertační práce JUDr. Josef Vacek Keywords: court of appeal; legal history; 17th century; criminal law; decision-making practice; sources of law; early modern period Abstract This thesis deals with the change in the decision-making practice of the Prague Court of Appeal in criminal cases in connection with the new criminal code Constitutio Criminalis Josephina of 1707. The thesis first analyses the current state of research, followed by an analysis of the internal structure of the court, including the mechanisms of selection and recruitment of new councillors. Significant space is also devoted to the relevant legislation for the work of the Court of Appeal and for criminal law in general in the period from the late 16th century, when the Koldin's Municipal Code was published, to the early 18th century, when Josephina was published. The focus of the work is an analysis of the thousands of decisions handed down by the Court of Appeal in criminal cases, in three areas: offences against life, property crime and sexual offences. The basic source were the orthels bücher, books kept at the Court of Appeal, from which decisions (sentences) were recorded, especially in criminal cases - thousands of entries in Czech, German and... ROZHODOVACÍ PRAXE APELAČNÍHO SOUDU A CONSTITUTIO CRIMINALIS JOSEPHINA (1687-1727) Disertační práce JUDr. Josef Vacek Klíčová slova: apelační soud; právní dějiny; 17. století; trestní právo; rozhodovací praxe; prameny práva; raný novověk Abstrakt Předkládaná práce se zabývá proměnou rozhodovací praxe pražského apelačního soudu v trestních věcech a to v souvislosti s vydáním nového trestního zákoníku Constitutio Criminalis Josephina z roku 1707. V práci je nejprve analyzován dosavadní stav bádání, na který navazuje rozbor vnitřního uspořádání soudu, včetně mechanismů výběrů a přijímání nových radů. Významný prostor je věnován též relevantním právním předpisům pro činnost apelačního soudu a celkově pro trestní právo v období od konce 16. století od vydání Koldínova zákoníku do počátku 18. století, kdy byla Josephina vydána. Těžištěm práce je rozbor tisíců rozhodnutí vydaných apelačním soudem v trestních věcech, a to ve třech oblastech: delikty proti životu, majetková trestná činnost a sexuální delikty. Základním pramenem se staly ortelové manuály, knihy vedené u apelačního soudu, od kterých byla zaznamenávána rozhodnutí především v trestních věcech - jedná se o tisíce záznamů v češtiny, němčině a místy též latině. V každé z uvedených oblastí práva byly vybrány dva, resp. tři delikty, u nichž byla provedena... Klíčová slova: apelační soud; právní dějiny; 17. století; trestní právo; rozhodovací praxe; prameny práva; raný novověk; court of appeal; legal history; 17th century; criminal law; decision-making practice; sources of law; early modern period Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL Rozhodovací praxe Apelačního soudu a Constitutio Criminalis Josephina (1687-1727)

ROZHODOVACÍ PRAXE APELAČNÍHO SOUDU A CONSTITUTIO CRIMINALIS JOSEPHINA (1687-1727) Disertační práce JUDr. Josef Vacek Keywords: court of appeal; legal history; 17th century; criminal law; ...

Vacek, Josef; Starý, Marek; Kindl, Vladimír; Knoll, Vilém
Univerzita Karlova, 2024

Modulace nociceptivní signalizace na míšní úrovni za normálních a patologických podmínek
Pontearso, Monica; Špicarová, Diana; Uchytilová, Eva; Krůšek, Jan
2024 - anglický Present pain therapies are often insufficient and poorly managed, mainly for neuropathic pain treatment. In the past years, research has provided a body of evidence on the association of nerve injury and inflammation with mobilized immune reactions. Many cytokines and hormones are released during injury or inflammation, and these factors regulate neuronal encoding of painful sensations. For example, in pre-clinical models, inflammatory cytokines cause or amplify nociception by enhancing neuron excitability. Besides increased excitability via direct neuronal sensitization, it has also been demonstrated that a reduction of synaptic inhibition (disinhibition) occurs naturally in the course of neuropathic and inflammatory pain states. The spinal cord dorsal horn (SCDH) is the first relay station of the ascending pain pathway and a crucial modulatory site of painful stimuli transmission. Three main aims characterize this doctoral thesis; each focused on the modulation of spinal nociceptive transmission by different molecules fundamental for pain processing. The first aim was to study the role of proinflammatory cytokine macrophage migration inhibitory factor (MIF) in nociceptive signalling following peripheral neuropathy induced by chronic constriction injury (CCI) of the sciatic nerve. The second aim... Léčba bolesti je i v současné době často nedostatečná, zvláště pokud je vyvolávací příčinou neuropatie. V posledních letech se množí vědecké důkazy o spojení poranění nervů s neuroinflamací a mobilizací imunitních buněk. Během poranění nebo zánětu se uvolňuje mnoho cytokinů a hormonů, které regulují nociceptivní signalizaci vedoucí k vjemu bolesti. V preklinických modelech, prozánětlivé cytokiny vyvolávají nebo zesilují nocicepci zvýšením dráždivosti neuronů. Kromě zvýšené excitability neuronů procesem senzitizace, bylo také prokázáno, že v průběhu neuropatických a zánětlivých bolestivých stavů dochází ke snížení synaptické inhibice (disinhibice). V zadním rohu míšním jsou uloženy první nociceptivní synapse vzestupných drah bolesti, je to tedy významné modulační místo, kde je informace o přítomnosti bolestivého podnětu regulována. Tuto disertační práci charakterizují tři hlavní cíle, každý je zaměřen na modulaci míšního synaptického přenosu, avšak různými molekulami, zásadními pro zpracování bolesti. Prvním cílem bylo studovat úlohu prozánětlivého cytokinu - inhibičního faktoru migrace makrofágů (MIF), v nociceptivní signalizaci po navození periferní neuropatie vyvolané chronickou konstrikcí sedacího nervu. Druhým cílem bylo studovat úlohu anandamidu (AEA) v modulaci excitačního synaptického... Klíčová slova: bolest; nocicepce; zadní roh míšní; synaptický přenos; TRPV1; opioidní receptory; pain; nociception; spinal cord dorsal horn; synaptic transmission; TRPV1; opioid receptors Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL Modulace nociceptivní signalizace na míšní úrovni za normálních a patologických podmínek

Present pain therapies are often insufficient and poorly managed, mainly for neuropathic pain treatment. In the past years, research has provided a body of evidence on the association of nerve injury ...

Pontearso, Monica; Špicarová, Diana; Uchytilová, Eva; Krůšek, Jan
Univerzita Karlova, 2024

Charakterizace antibakteriálního potenciálu nově syntetizovaných látek a bakteriálních společenství
Diepoltová, Adéla; Nachtigal, Petr; Pávková, Ivona; Palyzová, Andrea
2024 - český Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biological and Medical Sciences Candidate: Mgr. Adéla Diepoltová Supervisor: prof. PharmDr. Petr Nachtigal, Ph.D. Consultant: RNDr. Klára Konečná, PhD. Title of Doctoral Thesis: Characterization of the antibacterial potential of recently synthesized compounds and bacterial communities The theoretical part of this dissertation thesis describes the issue of antimicrobial resistance, which represents one of the greatest current challenges to global health. Many different factors contribute to the criticality of this situation. In addition to undeniable human involvement, microbes themselves, such as bacteria from the ESKAPE group, are responsible for this serious problem. Microbes exhibit a variety of resistance mechanisms. The ability to form microbial biofilms is one of them. As a matter of fact, cells present in biofilm are up to 1000 × more resistant compared to their planktonic form. To reveal the most relevant data regarding the process of biofilm formation in vitro, it is essential to use reproducible methods in order to obtain robust biofilms with all their key attributes that represent the adaptive resistance (presence of an extracellular polymeric matrix, the architecture of a matured biofilm, etc.). These attributes are... Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Doktorský studijní program: Xenobiochemie a patobiochemie Kandidát: Mgr. Adéla Diepoltová Školitel: prof. PharmDr. Petr Nachtigal, Ph.D. Konzultantka: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. Název disertační práce: Charakterizace antibakteriálního potenciálu nově syntetizovaných látek a bakteriálních společenství Úvod předložené disertační práce je zasvěcen problematice antimikrobní rezistence, která představuje jednu z největších současných hrozeb celosvětového zdravotnictví. Ke kritické úrovni této situace přispívá celá řada faktorů. Kromě nepopiratelného lidského přičinění stojí za tak závažným stavem samotné mikroby, například bakterie skupiny ESKAPE, jež disponují celou řadou rezistenčních mechanismů. Jedním z významných mechanismů rezistence je, mimo jiné, schopnost tvorby mikrobiálních biofilmů. Pro co největší přínos studia anti-biofilmové aktivity nových antimikrobních látek je nezbytné využívat relevantních a reprodukovatelných metod pro tvorbu biofilmů in vitro, tj. robustních biofilmových biomas s charakteristikami, které reprezentují mechanismy adaptivní rezistence (přítomnost extracelulární polymerní matrice, typická architektura maturovaného biofilmu atd.). Vlastnosti požadovaného biofilmu jsou silně... Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL Charakterizace antibakteriálního potenciálu nově syntetizovaných látek a bakteriálních společenství

Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biological and Medical Sciences Candidate: Mgr. Adéla Diepoltová Supervisor: prof. PharmDr. Petr Nachtigal, Ph.D. Consultant: ...

Diepoltová, Adéla; Nachtigal, Petr; Pávková, Ivona; Palyzová, Andrea
Univerzita Karlova, 2024

Eseje o meta-analýze hlubokých parametrů
Elminejad Anjileh, Mohammad Ali; Havránek, Tomáš; Laroche, Patrice; Rachinger, Heiko; Stanley, Tom
2024 - anglický Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL Eseje o meta-analýze hlubokých parametrů

Elminejad Anjileh, Mohammad Ali; Havránek, Tomáš; Laroche, Patrice; Rachinger, Heiko; Stanley, Tom
Univerzita Karlova, 2024

Eseje o reprodukovatelnosti výzkumu v ekonomii
Buliskeria, Nino; Baxa, Jaromír; Furukawa, Chishio; Reed, William Robert; Brodeur, Abel
2024 - anglický Tato disertační práce přispívá k pokračující debatě o důvěryhodnosti empiric- kého výzkumu v ekonomii, která začala kritikou selektivních postupů při výběru modelů Edwardem Leamerem na počátku 80. let. Tato práce se proto prostřednic- tvím série podrobných analýz zabývá klíčovými problémy meta-výzkumu, repliko- vatelností a rozšíření publikačních zkreslení a p-hackingu v akademickém výzkumu. První studie se vrací k vlivné analýze Burgesse a Pandeho o dopadu státem iniciovaného rozšiřování bankovních poboček do chudých oblastí Indie na míru chu- doby. Odhaluji, že údajný významný efekt nových poboček se výrazně sníží, pokud vezmeme v úvahu komplexnější analýzu politických změn v daném období. Toto zjištění podtrhuje nutnost zohlednění vlivů vnější politiky, aby byla zajištěna ro- bustnost empirických výsledků. Druhá část analyzuje indexy nejistoty hospodář- ské politiky (EPU) z Německa, Francie, Itálie, Španělska a Spojeného království a zjišťuje, že dlouhodobé trendy v těchto indexech pramení spíše z metodologických rozhodnutí při tvorbě indexu než ze skutečné ekonomické nejistotě. Použitím al- ternativních normalizačních technik tato studie ukazuje, jak takové metodologické nuance mohou vést k výrazně odlišným interpretacím ekonomických jevů, jako je Brexit nebo pandemie COVID-19. Poslední část... Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL Eseje o reprodukovatelnosti výzkumu v ekonomii

Tato disertační práce přispívá k pokračující debatě o důvěryhodnosti empiric- kého výzkumu v ekonomii, která začala kritikou selektivních postupů při výběru modelů Edwardem Leamerem na počátku 80. ...

Buliskeria, Nino; Baxa, Jaromír; Furukawa, Chishio; Reed, William Robert; Brodeur, Abel
Univerzita Karlova, 2024

Specifika pracovněprávních sporů
Stonjek, Patrik; Pichrt, Jan; Morávek, Jakub; Bognárová, Věra
2024 - český 1 The Specifics of Labour Law Disputes Abstract The aim of this dissertation was to provide a comprehensive interpretation of the topic of the specifics of labour law disputes, both from a theoretical point of view, i.e. substantive law, and from a practical point of view, i.e. the projection of substantive law into real life. In fulfilling the statutory objective, the main subject of investigation was civil procedural law and its deviations applicable to labour law disputes. However, substantive labour law was also mentioned, because without its existence the mentioned procedural deviations would not have any meaning. Within the framework of the analysis of the Czech legal regulation of the specifics of labour law disputes, the greatest emphasis was placed on the institute of non-legal members. This function was discussed in great detail, from the meaning and purpose of this function, through the prerequisites for its performance, appointment to the position of non-legal member, his rights and duties to the termination of the function of non-legal member. A similar procedure in the analysis of the specifics of labour law disputes was also chosen in the case of a comparison of the Czech legislation with the English, German and Austrian legislation. However, it is natural that in the case of foreign topics... 1 Specifika pracovněprávních sporů Abstrakt Cílem této disertační práce bylo podat komplexní výklad tématu specifik pracovněprávních sporů, a to jak z pohledu teoretického, tedy objektivního práva, tak z pohledu praktického, tedy promítnutí objektivního práva do reálného života. Při plnění stanového cíle bylo hlavním předmětem zkoumání civilní právo procesní a jeho odchylky platné pro pracovněprávní spory. Zmíněno však bylo i pracovní právo hmotné, protože bez jeho existence by uvedené procesní odchylky neměly jakýkoliv význam. V rámci analýzy české právní úpravy specifik pracovněprávních sporů byl největší důraz kladen na institut přísedících. Tato funkce byla diskutována velice zevrubně, a to od smyslu a účelu této funkce, přes předpoklady jejího výkonu, ustanovení do funkce přísedícího, jeho práv a povinností až po zánik funkce přísedícího. Obdobný postup při analýze specifik pracovněprávních sporů byl zvolen i v případě komparace české právní úpravy s anglickou, německou a rakouskou právní úpravou. Je však přirozené, že v případě zahraničních témat nebyla analýza tak detailní. V některých ohledech se však dotkla i některých specifik pracovněprávních sporů, která česká právní úprava nezná. Z toho pohledu se jednalo o zajímavý zahraniční exkurz. Po vzájemném porovnání zjištěných informací ze zkoumaných... Klíčová slova: pracovní právo; přísedící; spory; labour law; non-legal member; disputes Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL Specifika pracovněprávních sporů

1 The Specifics of Labour Law Disputes Abstract The aim of this dissertation was to provide a comprehensive interpretation of the topic of the specifics of labour law disputes, both from a theoretical ...

Stonjek, Patrik; Pichrt, Jan; Morávek, Jakub; Bognárová, Věra
Univerzita Karlova, 2024

Interakce mezi antikodonovým ramenem tRNA a malými ribozomálními proteiny tvořícími dekódovací místo při pročtení stop kodonu
Čapková, Zuzana; Valášek, Leoš; Eliáš, Marek; Macíčková Cahová, Hana
2024 - anglický Transfer RNAs (tRNAs) represent an indispensable part of protein synthesis by delivering amino acids into ribosomal A site during elongation. The rules that govern the correct match between the tRNA anticodon and the A-site mRNA codon are set by the genetic code. Specifically, the code defines that 61 sense codons are recognized by tRNAs and 3 stop codons marking translation termination are recognized by the release factor. In certain circumstances, a near-cognate (or a cognate) tRNA can be incorporated at the stop codon and translation elongation proceeds further. This process, called stop codon readthrough, may be beneficial as a therapy for inherited genetic diseases caused by premature termination codons (PTCs), and importantly, it is crucial for organisms with stop codon reassignment(s). Here I show that apart from the anticodon itself, the peculiar anticodon stem of two different near-cognate tRNAs, namely yeast S. cerevisiae tRNAGln CUG and Blastocrithidia nonstop tRNATrp CCA, is critical for their readthrough promoting potential. In particular, yeast tRNAGln CUG relies on the specific pyrimidine 28 : purine 42 base pair forming the 4th pair of its anticodon stem, whereas tRNATrp CCA of B. nonstop acquired a mutation that shortened its anticodon stem from the canonical 5 to the 4 base pairs,... Transferové RNA (tRNA) představují nepostradatelnou součást tvorby proteinů, které během elongace přivádějí aminokyseliny na A-místo ribozomu. Pravidla, kterými se řídí správná shoda mezi antikodonem tRNA a kodonem mRNA v A-místě, jsou stanovena genetickým kódem. Konkrétně kód definuje, že 61 kodonů je rozpoznáváno tRNA a 3 stop kodony označující ukončení translace jsou rozpoznávány uvolňovacím faktorem. Za určitých okolností však může být stop kodon rozeznán tzv. near-cognate (nebo cognate) tRNA a translace pokračuje dále. Tento proces, nazývaný pročítání stop kodonu, může být přínosný pro terapii dědičných genetických onemocnění způsobených předčasnými terminačními kodony (PTC) a také je klíčový pro organismy s přeřazováním identity stop kodonu na kodon kódující aminokyselinu. V této práci ukazuji, že kromě samotného antikodonu, antikodonové rameno dvou různých near-cognate tRNA, jmenovitě kvasinkové tRNAGln CUG a tRNATrp CCA Blastocrithidie nonstop, je rozhodující pro jejich potenciál pročíst stop kodony. Konkrétně demonstruji, že kvasinková tRNAGln CUG spoléhá na specifický pár bází pyrimidin 28 : purin 42, představující čtvrtý pár v jeho antikodonovém rameni (přesněji řečeno, ve stopce), zatímco tRNATrp CCA B. nonstop získala mutaci, která způsobila zkrácení jeho antikodonové stopky z... Klíčová slova: tRNA; terminace translace; readthrough; tRNA; termination of translation; readthrough Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL Interakce mezi antikodonovým ramenem tRNA a malými ribozomálními proteiny tvořícími dekódovací místo při pročtení stop kodonu

Transfer RNAs (tRNAs) represent an indispensable part of protein synthesis by delivering amino acids into ribosomal A site during elongation. The rules that govern the correct match between the tRNA ...

Čapková, Zuzana; Valášek, Leoš; Eliáš, Marek; Macíčková Cahová, Hana
Univerzita Karlova, 2024

Úloha telomer / DNA reparací v solidních tumorech
Tomášová, Kristýna; Vodička, Pavel; Dušinská, Mária; Campa, Daniele
2024 - anglický Loss of telomere function and unrepaired DNA damage contribute to chromosome integrity disruption and genomic instability development, which can initiate malignant transformation of the cells. This dissertation focused on telomeres and their maintenance and regulation mechanisms in sporadic colorectal, breast, and ovarian tumors. In colorectal cancer (CRC), a place was also dedicated to research on base excision repair glycosylases. The findings of the Thesis are elaborated in detail in seven attached Manuscripts. The main results of each of the articles are as follows: I) Mitochondrial DNA copy number changes and telomere length (TL) shortening already occur in precancerous lesions of CRC, but in early carcinomas, the association between their mitochondrial DNA content and TL diminishes; II) TL of leukocytes in peripheral blood of patients with CRC can be affected by postoperative cytostatic treatment based on 5-fluorouracil; III) CRC liver metastases maintain the same TL as primary tumors. In addition, neoadjuvant treatment with (chemo)radiotherapy applied to patients with rectal cancer probably causes telomere shortening in the primary tumor and the surrounding rectal cells in addition to DNA damage; IV) TL of ovarian cancer cells can be influenced by epigenetic regulations and expressions of... Ztráta funkce telomer a neopravená poškození DNA přispívají k narušení integrity chromozomů a rozvoji genomové nestability, která může iniciovat maligní zvrat buněk. Tato disertační práce je zaměřena na studium telomer a mechanismů jejich údržby a regulace u sporadických nádorů tlustého střeva a konečníku, prsu a ovárií. U rakoviny tlustého střeva a konečníku (kolorektální karcinom; KRK) byl prostor věnován i výzkumu DNA glykosyláz zapojených do bázové excizní opravy. Výsledky této disertační práce jsou detailně rozvedeny v sedmi přiložených rukopisech. Stěžejní výsledky každého z článků jsou následující: I) Ke změnám počtu kopií mitochondriální DNA a zkracování telomerové délky (TL) dochází již u prekancerózních lézí KRK, avšak u časných karcinomů souvislost mezi obsahem jejich mitochondriální DNA a TL zaniká; II) TL leukocytů v periferní krvi u pacientů s KRK může být ovlivněna postoperační cytostatickou léčbou na bázi 5-fluorouracilu; III) Metastázy KRK v játrech si udržují stejnou TL jako primární nádory. Dále bylo zjištěno, že neoadjuvatní léčba (chemo)radioterapií nasazovaná pacientům s rakovinou rekta pravděpodobně primárnímu nádoru i okolním buňkám rekta způsobuje mimo poškození DNA i krácení telomer; IV) TL buněk karcinomů ovárií můžou ovlivňovat epigenetické regulace a exprese genů... Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL Úloha telomer / DNA reparací v solidních tumorech

Loss of telomere function and unrepaired DNA damage contribute to chromosome integrity disruption and genomic instability development, which can initiate malignant transformation of the cells. This ...

Tomášová, Kristýna; Vodička, Pavel; Dušinská, Mária; Campa, Daniele
Univerzita Karlova, 2024