Ne (3862)
Počet nalezených dokumentů:
3862
Publikováno od
do
Bezpečnostní analýza vybraného Android TV Boxu
Švenk, Adam; Veigend, Petr; Tamaškovič, Marek
2024 - anglický
Popularita TV boxov so systémom Android v poslednom čase výrazne vzrástla. Okrem toho, že ponúkajú širokú škálu funkcií, je čoraz aktuálnejšia otázka, či sú dostatočne zabezpečené a chránené. Táto práca popisuje komplexnú bezpečnostnú analýzu vybraného Android TV boxu, ktorá zahŕňa hardvérové aj softvérové komponenty. Skúmaním zraniteľností prítomných v zariadení sa táto práca zameriava na identifikáciu potenciálnych rizík pre súkromie a bezpečnosť používateľov. Okrem toho navrhuje odporúčania na zmiernenie týchto zraniteľností. The popularity of Android TV boxes has increased significantly in recent times. In addition to offering a wide range of functionality, the question of whether they are adequately secured is becoming increasingly pertinent. This thesis performs a comprehensive security analysis of selected Android TV boxes, covering both the hardware and software components. By examining the vulnerabilities present in the device, this thesis aims to identify potential risks to user privacy and security. Additionally, it proposes recommendations to mitigate these vulnerabilities.
Klíčová slova:
security analysis; Android; Android TV; OWASP; vulnerability; firmware; reverse engineering; bezpečnostná analýza; Android; Android TV; OWASP; zraniteľnosť; firmvér; reverzné inžinierstvo
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Bezpečnostní analýza vybraného Android TV Boxu
Popularita TV boxov so systémom Android v poslednom čase výrazne vzrástla. Okrem toho, že ponúkajú širokú škálu funkcií, je čoraz aktuálnejšia otázka, či sú dostatočne zabezpečené a chránené. Táto ...
Benchmarking výpočetních nástrojů pro predikci vlivu mutací na stabilitu proteinů
Berezný, Matej; Martínek, Tomáš; Musil, Miloš
2024 - anglický
Návrh proteínov vyžaduje informáciu o tom ako mutácie ovplyvňujú celkovú stabilitu proteinu. Pre tento prípad existuje mnoho verejne dostupných nástrojov avšak ich kolektívne používanie či porovnávanie je veľmi pracné. Presne pre tento prípad som vyvinul BenchStab; konzolovú aplikáciu/Python knižnicu navrhnutú pre rýchlu a priamočiaru manipuláciu s 18 prediktormi, umožňujúc hromadné získavanie mutačných výsledkov. Zároveň som vytvoril novú unikátnu dátovú sadu, získanú z FireProtDB. Tento dataset som použil na porovnanie 24 rôznych predikčných metód pomocou rôznych metrík. Protein design necessitates understanding how mutations influence their stability. Numerous online predictors exist for this aim, but it is challenging to compare them or to use them collectively. For that purpose I developed BenchStab, a console application/Python package designed for the swift and straightforward operation of 18 predictors, gathering results from a series of mutants. Benchstab is freely available on GitHub and can be expanded to include more predictors. To avoid potential dataset bias towards some predictors, I have constructed a new unique dataset, sourced from FireProtDB. I utilized this dataset to assess 24 distinct prediction methods from the three different perspectives.
Klíčová slova:
protein stability; prediction; benchmark; predictor; protein stability predictor; stability; protein stability benchmark; software tool; stability querying; structure; sequence; protein; dataset; DDG; FoldX4; Foldx5; DDMut; PoPMuSiC; Maestro; mutations; web-tool client; stabilita proteínov; predikcia; stabilita; benchmark; prediktor; softvérový nástroj; benchmark stability proteínov; získavanie stability; štruktúra; sekvencia; proteín; dataset; DDG; FoldX4; Foldx5; DDMut; PoPMuSiC; Maestro; mutácie; webový klient
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Benchmarking výpočetních nástrojů pro predikci vlivu mutací na stabilitu proteinů
Návrh proteínov vyžaduje informáciu o tom ako mutácie ovplyvňujú celkovú stabilitu proteinu. Pre tento prípad existuje mnoho verejne dostupných nástrojov avšak ich kolektívne používanie či ...
Implementace strojového vidění ve výrobním systému UVSSR PORTABLE CELL
Gómez Rojas, José Luis; Kroupa, Jiří; Bražina, Jakub
2024 - anglický
This thesis investigates the integration of computer vision into Industry 4.0, utilizing the UVSSR CELL at Brno University of Technology. Focused on enhancing virtual commissioning, it introduces three innovative vision techniques linked via an OPC server to an IoT gateway. Object recognition, hand gesture control, and facial recognition are employed, improving robotic arm operations and security protocols. This integration resulted in high accuracy trained model for object detection with mAP50-90 close to 0.9, and control precision of the technologies and the virtual environment, contributing significantly to smart industry automation and setting a call for future work on top of it. The thesis covers methodology, technological implementation, and prospects for advanced, efficient machine vision systems within industry 4.0. This thesis investigates the integration of computer vision into Industry 4.0, utilizing the UVSSR CELL at Brno University of Technology. Focused on enhancing virtual commissioning, it introduces three innovative vision techniques linked via an OPC server to an IoT gateway. Object recognition, hand gesture control, and facial recognition are employed, improving robotic arm operations and security protocols. This integration resulted in high accuracy trained model for object detection with mAP50-90 close to 0.9, and control precision of the technologies and the virtual environment, contributing significantly to smart industry automation and setting a call for future work on top of it. The thesis covers methodology, technological implementation, and prospects for advanced, efficient machine vision systems within industry 4.0.
Klíčová slova:
Industry 4.0; Computer Vision; Virtual Commissioning; Cyber-Physical Systems; Object Detection; Face recognition; Hand gesture recognition; Smart Industry; Industry 4.0; Computer Vision; Virtual Commissioning; Cyber-Physical Systems; Object Detection; Face recognition; Hand gesture recognition; Smart Industry
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Implementace strojového vidění ve výrobním systému UVSSR PORTABLE CELL
This thesis investigates the integration of computer vision into Industry 4.0, utilizing the UVSSR CELL at Brno University of Technology. Focused on enhancing virtual commissioning, it introduces ...
Material Characterization and Modeling of Interband Cascade Light Emitting Diodes
Herzánová, Kristína; Bastard, Gérald; Detz, Hermann
2024 - anglický
Tato práce se zaměřuje na charakterizaci materiálů a ztrátových mechanismů heterostruktur používaných v mezipásových kaskádových zařízeních a na modelování mezi-pásových kaskádových elektroluminiscenčních diod (ICLED). Mezipásová kaskádová zařízení, zejména lasery a elektroluminiscenční diody, mají zásadní význam pro fotonické aplikace ve střední infračervené oblasti vzhledem k jejich efektivitě a možnosti integrace do fotonických obvodů. Studie zahrnuje extrakci materiálových parametrů ze spektroskopické elipsometrie a FTIR měření a rozšíření stávajícího transportního modelu o zářivé rekombinační procesy, konkrétně o spontánní emisi v ICLED. Z různých ztrátových mechanismů v těchto zařízeních byla zvláštní pozornost věnována valenční mezipásové absorpci, která zhoršuje výkon mezipámových kaskádových zařízení v oblasti středních infračervených vlnových délek nad 4 m. Výsledky získané na základě experimentální charakterizace vlnovodů tvořených mezipásovými kaskádovými lasery (ICL) zkoumající jejich přenosové ztráty prokázaly vliv valenční mezipásové absorpce za různých operativních podmínek. Tento výzkum přispívá k optimalizaci struktur mezi-pásových kaskádových struktur, která vede ke zvýšení výkonu a širší použitelnosti v oblasti detekce, monitorování životního prostředí a biomedicínské diagnostiky. This thesis focuses on the material and loss characterization of heterostructures used in interband cascade devices and the modeling of interband cascade light-emitting devices (ICLEDs). Interband cascade devices, particularly lasers and light-emitting diodes, are critical for mid-infrared photonic applications due to their efficient operation and potential for integration into photonic circuits. The study involves extracting material parameters from spectroscopic ellipsometry and FTIR measurements, and extending an existing transport model to account for radiative recombination processes, specifically the spontaneous emission in ICLEDs. Among the different loss mechanisms in these devices, particular attention was given to the valence intersubband absorption, which degrades the operation of interband cascade devices in the mid-infrared wavelength region above 4 m. The results, obtained through experimental characterization of interband cascade laser (ICL) waveguides examining their transmission losses, demonstrated the impact of valence intersubband absorption under various operating conditions. This research contributes to the optimization of interband cascade structures, leading to enhanced performance and broader applicability in sensing, environmental monitoring, and biomedical diagnostics.
Klíčová slova:
Interband Cascade Light Emitting Device (ICLED); Interband Cascade Laser (ICL); heterostructures; mid-infrared; material characterization; ellipsometry; spectroscopic techniques; waveguide characterization; valence intersubband absorption; recombination; spontaneous emission; Mezipásové kaskádové elektroluminiscenční zařízení; mezipásový kaskádový laser; heterostruktury; střední infračervená oblast; materiálová charakterizace; elipsometrie; spektroskopické techniky; charakterizace vlnovodu; valenční mezipásová absorpce; rekombinace; spontánní emise
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Material Characterization and Modeling of Interband Cascade Light Emitting Diodes
Tato práce se zaměřuje na charakterizaci materiálů a ztrátových mechanismů heterostruktur používaných v mezipásových kaskádových zařízeních a na modelování mezi-pásových kaskádových ...
Predikce malých RNA u vybraných bakteriálních producentů bioplastů
Heřmánková, Kristýna; Vítková, Helena; Sedlář, Karel
2024 - anglický
Využití bakterií v biotechnologii vyžaduje důkladné pochopení schopností použitých bakterií pro maximalizaci výtěžku. To platí například pro výrobu bioplastů, kde konkurenceschopnost s levnějšími plasty na bázi fosilních paliv závisí také na ceně procesu pro získání požadovaného výtěžku. Nahlédnutí do regulačních mechanismů bakterií, jako je regulace pomocí malých RNA, která zajišťuje rychlou reakci především na stresové podmínky, může pomoct odhalit jejich vlastnosti a posoudit tak jejich využitelnost v biotechnologiích. Tato diplomová práce se zabývá zpracováním bakteriálních transkriptomických dat, které byly sekvenovány pomocí RNA-Seq. Práce je zaměřena zejména na predikci malých RNA u poskytnuté bakterie, slibného kandidáta pro využití v biotechnologii. Cílem je získat přehled o malých RNA v této bakterii, zejména analyzovat potenciální regulaci syntézy PHA malými RNA, které by mohly rozšířit přehled o využitelnosti bakterie pro produkci PHA. The utilization of bacteria in biotechnology requires a thorough understanding of the capabilities of the bacteria used to maximise the yield. This is applicable, for example, in the production of bioplastics, where competitiveness with cheaper fossil fuel-based plastics depends also on the price of the process to obtain the desired yield. The insight into regulatory mechanisms of bacteria, such as regulation by small RNAs, which ensures a rapid response to stress conditions in particular, can reveal their characteristics and thus assess their use in biotechnology. This thesis deals with bacterial transcriptomic data sequenced with RNA-Seq. Especially, work is focused on the prediction of small RNAs in provided bacterium, a promising candidate for use in biotechnology. The aim is to gain insight into the regulation by sRNAs in this bacterium, in order to analyze the potential regulation of PHA synthesis by small RNAs, which could expand the insight into the utility of the bacterium for PHA production.
Klíčová slova:
small RNA; polyhydroxyalkanoates; RNA-Seq; co-expression analysis; differential expression analysis; malé RNA; polyhydroxyalkanoáty; RNA-Seq; ko-expresní analýza; analýza diferenciální exprese
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Predikce malých RNA u vybraných bakteriálních producentů bioplastů
Využití bakterií v biotechnologii vyžaduje důkladné pochopení schopností použitých bakterií pro maximalizaci výtěžku. To platí například pro výrobu bioplastů, kde konkurenceschopnost s levnějšími ...
Zobrazování exteriérů
Burkalo, Boris; Chlubna, Tomáš; Milet, Tomáš
2024 - anglický
Cílem této práce je navrhnout algoritmus, který zvládne efektivně vykreslovat rozsáhlé počítačové scény obsahující velký počet primitiv. Tato práce nejdřív představí nejpoužívanější techniky pro vykreslování počítačových scén a následně popíše přístup zvaný Image Based Rendering, který nepoužívá geometrii k vykreslování obrázků. Dále se zaměří na různé metody, které se zabývají efektivním vykreslováním složitých počítačových scén a představí algoritmus Exterior Mapping, který využívá Image Based Rendering a teorii 4D světelných polí pro vykreslení nového pohledu na scénu za použití množiny již předem vykreslených snímků scény. Dále představí aplikaci, která tento algoritmus implementuje a následně práce vyhodnotí a srovná implementovaný algoritmus s tradičním vykreslováním pomocí 3D geometrie. The goal of this thesis is to propose a new method for rendering computer scenes, that contain a large number of primitives. The thesis summarizes the current state of rendering approaches and introduces the approach of Image Based Rendering while describing various methods, that specialize in the optimization of the rendering process. Then it proposes a new solution for rendering large computer scenes with the name of Exterior Mapping. The proposed algorithm leverages the approaches of Image Based Rendering and uses the theory of light fields to create a novel view using a set of previously rendered images. This thesis then introduces an application, which implements the proposed algorithm. Finally, the proposed algorithm is evaluated and compared to conventional rendering using 3D geometry.
Klíčová slova:
Image Based Rendering; Light Fields; large computer scenes; Vulkan; Rendering; Ray; 3D scene; Exterior Mapping; Image Based Rendering; 4D světelná pole; rozsáhlé počítačové scény; Vulkan; Rendering; Paprsek; 3D scéna; Zobrazení exteriéru
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Zobrazování exteriérů
Cílem této práce je navrhnout algoritmus, který zvládne efektivně vykreslovat rozsáhlé počítačové scény obsahující velký počet primitiv. Tato práce nejdřív představí nejpoužívanější techniky pro ...
Predikce vlivu mutací na imunogenicitu proteinů založená na strojovém učení
Lacko, Dávid; Martínek, Tomáš; Musil, Miloš
2024 - anglický
Imunitný systém je dôležitou súčasťou prežitia človeka, pretože je zodpovedný za ochranu tela pred patogénmi. Táto schopnosť vyplýva z molekulárnych mechanizmov rozpoznávania cudzorodých bielkovín a molekúl. Hoci je imunitný systém rozhodujúci pre prežitie, bráni využívaniu proteínov pochádzajúcich z iných organizmov ako bioterapeutík, z ktorých mnohé už preukázali významný potenciál v zdravotníctve. Na využitie tohto potenciálu je nevyhnutné, aby imunitný systém tieto proteíny nenapadol a nedeaktivoval. Preto je často potrebné tieto proteíny upraviť tak, aby sa znížila ich imunogénnosť a zabránilo sa ich detekcii imunitným systémom. Na tento účel vedci zavádzajú mutácie do proteínu, ktorý je predmetom záujmu, aby znížili imunitnú odpoveď. Rozsiahle experimentálne overovanie takýchto mutácií je zvyčajne neuskutočniteľné vzhľadom na obrovskú veľkosť kombinatorického priestoru, ktorý treba preskúmať. Pomocou nástrojov strojového učenia možno tento proces urýchliť a výrazne znížiť celkové náklady na vývoj tým, že sa mutácie najprv vyhodnotia in silico a experimentálne sa overí len podmnožina sľubných návrhov z užšieho výberu. Oblasť nástrojov založených na strojovom učení na predpovedanie takýchto mutačných účinkov však ešte nie je preskúmaná. Na vyriešenie tejto výzvy predstavujeme nový súbor dát zameraný na vplyv mutácií na epitopy - oblasti bielkovín, ktoré spúšťajú reakciu imunitného systému. Novo zhromaždený súbor dát obsahuje epitopy, ich jednobodové a dvojbodové mutácie a vplyv týchto mutácií na imunogénnosť. Využitím tohto nového súboru a nedávnych pokrokov v oblasti veľkých jazykových modelov pre proteínové inžinierstvo sme natrénovali súbor modelov založených na strojovom učení, ktoré sú schopné klasifikovať mutácie na základe ich vplyvu na imunogenicitu, pričom vykazujú výrazné zlepšenie výkonu oproti existujúcim a základným modelom. Okrem toho prezentujeme spôsob rozdelenia súboru dát na rôzne tréningovo-testovacie rozdelenia s cieľom minimalizovať prienik údajov medzi týmito rozdeleniami. To vedie k spoľahlivejšiemu ohodnoteniu reálnej výkonnosti modelov natrénovaných na týchto údajoch. The immune system is a vital part in human survival since it is responsible for protecting the body against pathogens.This ability stems from molecular mechanisms for the recognition of non-human proteins and molecules. While this system is critical for survival, it hampers the use of non-human proteins as biotherapeutics, many of which have already demonstrated significant potential in healthcare. To exploit this potential, it is vital that the immune system does not attack and inactivate the proteins. Therefore, it is often necessary to engineer these proteins to reduce the immunogenicity and avoid early detection by the immune system. To this end, scientists introduce mutations to a protein of interest to lower the response. Large-scale experimental validation of such mutations is typically unfeasible due to the enormous size of combinatorial space to explore. With the help of machine learning tools, this process can be accelerated and total development cost significantly reduced by scoring the mutations in silico first and experimentally validating only a subset of short-listed viable designs. However, the field of machine-learning-based tools for predicting such mutational effects is yet to be explored. To address this challenge, we present a novel dataset focused on the effect of mutations on epitopes - protein regions that trigger the immune system response. The newly collected dataset contains epitopes, their single and double-point mutations, and the effect of these mutations on imunogenicity as labels. By leveraging this novel dataset and recent advances in large language models for protein engineering, we train a set of machine-learning-based models that are able to classify mutations based on their effect on immunogenicity, showing a significant improvement in performance over the baselines. Additionally, we investigate and present a way to separate the dataset into different train-test splits to minimize data leakage between these splits. This leads to a more robust real-world performance evaluation of the models trained on this data.
Klíčová slova:
machine learning; immunoinformatics; protein engineering; immunogenicity prediction; strojové učenie; imunoinformatika; proteínové inžinierstvo; predikcia imunogenicity
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Predikce vlivu mutací na imunogenicitu proteinů založená na strojovém učení
Imunitný systém je dôležitou súčasťou prežitia človeka, pretože je zodpovedný za ochranu tela pred patogénmi. Táto schopnosť vyplýva z molekulárnych mechanizmov rozpoznávania cudzorodých bielkovín a ...
Plán expanze společnosti B2B SaaS na nové anglicky mluvící trhy
Yesilkutuk, Emre; Zich, Robert; Šimberová, Iveta
2024 - anglický
Tato diplomová práce si klade za cíl zhodnotit proveditelnost expanze americké B2B SaaS společnosti, která nabízí systémy pro správu skladů, do anglicky mluvících trhů, se zvláštním zaměřením na kanadský trh. Studie posoudí, zda je společnost jak finančně, tak operativně připravena na tak komplexní expanzní úsilí. Práce na výzkumnou otázku odpoví vypracováním podrobné expanzní strategie, která zahrnuje způsoby vstupu na trh, marketingové přístupy, analýzu nákladů a plánování rozpočtu pro vstup na trh. This diploma thesis seeks to evaluate the viability of expanding a US-based B2B SaaS company that offers Warehouse Management Systems into English-speaking markets, with a particular focus on the Canadian market. The study will assess whether the company is ready, both financially and operationally, for such an intricate expansion effort. The thesis will address the research question by developing a detailed expansion strategy that includes market entry modes, marketing approaches, cost analysis, and budget planning for market entry.
Klíčová slova:
International Expansion; Warehouse Management System; Expansion Plan; Canada; Mezinárodní expanze; Systém pro správu skladu; Plán expanze; Kanada
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Plán expanze společnosti B2B SaaS na nové anglicky mluvící trhy
Tato diplomová práce si klade za cíl zhodnotit proveditelnost expanze americké B2B SaaS společnosti, která nabízí systémy pro správu skladů, do anglicky mluvících trhů, se zvláštním zaměřením na ...
Návrh superskalárního RISC-V procesoru
Salvet, Dominik; Šimek, Václav; Jaroš, Jiří
2024 - anglický
Tato práce se zabývá návrhem a implementací superskalární mikroarchitektury RISC-V procesoru zaměřené na prostředí s omezenými zdroji. Za tímto účelem mikroarchitektura definuje sedmistupňovou zřetězenou linku s dvojitým vydáváním instrukcí, které vykonává v pořadí. Je popsána v jazyce SystemVerilog a lze ji snadno simulovat na počítači. Pomocí připravených nástrojů pouští vytvořený model procesoru programy napsané v RISC-V jazyce symbolických adres zkompilované GCC. Na základě provedeného testování bez speciální asistence kompilátoru procesor provede v průměru 0,88 instrukcí za cyklus, čímž poskytuje o 22,6 % vyšší výkon než jeho skalární protějšek. Vzhledem k tomu, že se navržená mikroarchitektura také vyhýbá nadměrné specializaci, poskytuje dobrý základ, který lze dále rozšiřovat a optimalizovat na základě profilování očekávaných programů, což vede k optimálnímu výkonu a využití zdrojů. This thesis deals with designing and implementing a superscalar RISC-V processor microarchitecture focused on environments with constrained resources. For that, the microarchitecture exposes a dual-issue seven-stage pipeline with in-order instruction execution. It is described in SystemVerilog and can be easily simulated on a computer. Using prepared tools, the created processor model runs RISC-V assembly programs compiled by GCC. Based on conducted testing without special compiler assistance, the processor executes 0.88 instructions per cycle on average, providing 22.6 % higher performance than its scalar counterpart. Considering that the microarchitecture also avoids unnecessary specialization, it provides a good base that can be further extended and optimized based on the profiling of expected programs, leading to optimal performance and use of resources.
Klíčová slova:
Superscalar processor; RISC-V instruction set; instruction pipelining; in-order execution; dual-issue architecture; open-source hardware; SystemVerilog; simulation testbench; Superskalární procesor; instrukční sada RISC-V; zřetězené zpracování; vykonávání instrukcí v pořadí; dvojité vydávání instrukcí; otevřený hardware; SystemVerilog; simulační testbench
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Návrh superskalárního RISC-V procesoru
Tato práce se zabývá návrhem a implementací superskalární mikroarchitektury RISC-V procesoru zaměřené na prostředí s omezenými zdroji. Za tímto účelem mikroarchitektura definuje sedmistupňovou ...
Kryo-EM: Vliv EER formátu a super-rozlišení na výsledky SPA
Geršl, David; Dobrovský, Ladislav; Hůlka, Tomáš
2024 - anglický
Kryo-elektronová mikroskopie (cryo-EM) se stala zásadním nástrojem ve strukturální biologii, který umožňuje vizualizaci biologických makromolekul v atomovém rozlišení za kryogenních podmínek. Tato diplomová práce se věnuje zkoumání vlivu obrazového rozlišení a chyb lokalizace v rámci techniky cryo-EM, přičemž klade důraz na jejich dopad na analýzu jednotlivých částic (SPA). Práce je rozdělena do dvou hlavních experimentálních částí. První část zkoumá dopady různých obrazových rozlišení na procesy rekonstrukce v SPA. Zde bylo zjištěno, že zvýšení rozlišení obrazu vede k lepšímu detailu a strukturální jasnosti, avšak zároveň výrazně zvyšuje výpočetní nároky a komplexnost datového zpracování. Druhá experimentální část se zaměřuje na vliv uměle indukovaných chyb lokalizace, které jsou způsobeny použitím technik superrozlišení. Tyto chyby mají negativní vliv na přesnost korekce pohybu a odhady funkcí přenosu kontrastu (CTF), což jsou klíčové aspekty pro přesné 3D rekonstrukce v SPA. Zkoumání těchto dvou klíčových faktorů odhalilo, že i přes technologický pokrok v oblasti detektorů a zpracování obrazu, který umožnil dosáhnout rozlišení srovnatelného s X-ray krystalografií, stále existují výzvy spojené s potenciální optimalizací těchto procesů v praxi. Tyto výzvy zahrnují potřebu efektivnějšího využití výpočetních zdrojů a lepšího pochopení vlivu technických parametrů na kvalitu a přesnost výsledných rekonstrukcí. Výsledky této práce poskytují poznatky pro další vývoj v oblasti cryo-EM a otevírají možnosti pro zlepšení metod SPA, což může potenciálně vést k přesnějšímu a efektivnějšímu studiu komplexních biologických struktur. Tyto poznatky také naznačují směry pro budoucí výzkum a potenciál pro technologické inovace, které by mohly dále zlepšit schopnosti cryo-EM v oblasti strukturní biologie. Cryo-electron microscopy (cryo-EM) has emerged as a pivotal tool in structural biology, enabling the visualization of biological macromolecules at atomic resolutions under cryogenic conditions. This thesis explores the intricacies of image resolution and localization errors within cryo-EM, particularly focusing on their impact on Single Particle Analysis (SPA). The experimental sections delve into the effects of various image resolutions and the introduction of artificial localization errors through super-resolution imaging techniques. Key findings indicate that while higher resolutions enhance detail and structural clarity, they significantly increase computational demands. Additionally, localization errors introduced by super-resolution imaging can adversely affect the accuracy of motion correction and Contrast Transfer Function (CTF) estimations, critical for accurate 3D reconstructions. These insights highlight the delicate balance required in cryo-EM between achieving high resolution and maintaining image integrity, suggesting directions for future research and technological advancements in electron microscopy.
Klíčová slova:
transmission electron microscopy; electron event representation; super-resolution; single particle analysis; cryo-EM; transmisní elektronová mikroskopie; electron event representation; superrozlišení; analýza jednotlivých částic; kryogenní elekotronová mikroskopie
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Kryo-EM: Vliv EER formátu a super-rozlišení na výsledky SPA
Kryo-elektronová mikroskopie (cryo-EM) se stala zásadním nástrojem ve strukturální biologii, který umožňuje vizualizaci biologických makromolekul v atomovém rozlišení za kryogenních podmínek. Tato ...
NUŠL poskytuje centrální přístup k informacím o šedé literatuře vznikající v ČR v oblastech vědy, výzkumu a vzdělávání. Více informací o šedé literatuře a NUŠL najdete na webu služby.
Vaše náměty a připomínky posílejte na email nusl@techlib.cz
Provozovatel
Zahraniční báze