Metody studia společenstev půdních hub - aplikace na půdy zatížené volně paseným skotem
Jirout, Jiří; Elhottová, Dana
2007 - český Houbové organismy představují fyziologicky a geneticky různorodou skupinu organismů, která hraje klíčovou roli v půdním ekosystému. Nicméně o dynamice, struktuře, diverzitě a biomase populací půdních hub existuje stále poměrně málo informací. Tradiční mikrobiologické metody umožňují pouze zběžný pohled na diverzitu hub. Posledních 15 let však přineslo mnoho technologických pokroků v získávání profilů společenstev a v kultivačně nezávislých přístupech pro studium půdních mikroorganismů. Změny diverzity hub spojené se zemědělskými postupy mohou ovlivnit úrodnost a stabilitu půdy, přesto ale vliv zemědělských postupů na komplexní společenstva hub zůstává nejasný. Tradiční i moderní metody v mikrobiální ekologii půdy byly použity pro studium mikrobiálních společenstev na pastvině využívané jako zimoviště skotu. Půdní prostředí zimoviště je významně narušeno vlivem paseného skotu. Fungal organisms comprise a physiologically and genetically diverse group of organisms with the key role in soil ecosystems. However, dynamics, structure, diversity and biomass of populations of soil fungi remain unclear and unknown. Conventional methods in microbiology provide only a glimpse view on the fungal diversity, but the last 15 years have brought many technological advances in community profiling and cultivation independent approaches to studying soil microorganisms. Changes in fungal diversity associated with agricultural management may affect the soil fertility and stability, but the effect of the agricultural practices on fungal complex community is still unclear. Conventional and modern methods in soil microbial ecology were used for study of microbial communities at the pasture used as a cattle overwintering area. Soil environment at this site is relevantly disturbed by cattle impact. Klíčová slova: soil fungal communities; disturbed soils; outdoor cattle husbandry Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Metody studia společenstev půdních hub - aplikace na půdy zatížené volně paseným skotem

Houbové organismy představují fyziologicky a geneticky různorodou skupinu organismů, která hraje klíčovou roli v půdním ekosystému. Nicméně o dynamice, struktuře, diverzitě a biomase populací půdních ...

Jirout, Jiří; Elhottová, Dana
Biologické centrum, 2007

Dlouhodobý vliv různého lesního managementu na biodiverzitu půdní mesofauny (Oribatida, Collembola) ve smrkových porostech NP Šumava
Farská, Jitka; Jínová, Kristýna
2007 - český Cíl našeho výzkumu je srovnat společenstva pancířníků a chvostoskoků v klimaxových smrkových lesích a ve smrkových monokulturách. Půdní vzorky byly odebírány na pěti lokalitách v NP Šumava (5 v klimaxovém smrkovém lese a 5 ve smrkové monokultuře) a půdní mesofauna byla extrahována. Pancířníci a chvostoskoci byli určeni do druhů. Předběžné výsledky ukazují kvalitativní a kvantitativní změny ve struktuře společenstev. Některé euedafické druhy se nevyskytují ve smrkových monokulturách pokud je porovnáme s klimaxovými smrkovými lesy. Je známo, že lesnické hospodaření ovlivňuje společenstva půdní fauny, která jsou velmi citlivá na kolísání půdní vlhkosti a teploty. The aim of our research is to compare Oribatid and Collembolan communities in climax spruce forest and spruce plantations. Soil samples were collected in five study sites in the Šumava National Park (5 in climax spruce forest and 5 in spruce plantation) and soil microarthropods were extracted. Oribatida and Collembola were determined to species level. Preliminary results show quantitative and qualitative changes in the community structure. Some euedaphic species do not occur in the samples from spruce plantations in comparison to the climax forests. Silvicultural practices are well known to affect microarthropod communities that are very sensitive to fluctuations in soil humidity and temperature. Klíčová slova: forestry management; soil mesofauna; biodiversity in spruce forests Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Dlouhodobý vliv různého lesního managementu na biodiverzitu půdní mesofauny (Oribatida, Collembola) ve smrkových porostech NP Šumava

Cíl našeho výzkumu je srovnat společenstva pancířníků a chvostoskoků v klimaxových smrkových lesích a ve smrkových monokulturách. Půdní vzorky byly odebírány na pěti lokalitách v NP Šumava (5 v ...

Farská, Jitka; Jínová, Kristýna
Biologické centrum, 2007

Experimentální hodnocení biomasy vybraných druhů vodních makrofyt horizontální echolokací
Hohausová, Eva; Kubečka, Jan; Frouzová, Jaroslava; Husák, Štěpán; Balk, H.
2007 - český Klíčová slova: sonar; shallow water; plants; frequency 120 kHz Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Experimentální hodnocení biomasy vybraných druhů vodních makrofyt horizontální echolokací

Hohausová, Eva; Kubečka, Jan; Frouzová, Jaroslava; Husák, Štěpán; Balk, H.
Biologické centrum, 2007

Kvantifikace klíčových genů v procesech nitrifikace a denitrifikace
Chroňáková, Alica; Čuhel, Jiří; Radl, V.; Elhottová, Dana; Šimek, Miloslav
2007 - český Cílem této studie bylo prozkoumání efektu dlouhodobé pastvy skotu na abundanci nitrifikátorů a denitrifikátorů na zimovišti. Abundance studovaných společenstev byly určeny pomocí qPCR metody a byly vypočteny počty kopií genů .i.amoA, nirS./i. a .i.nirK./i. na jaře a na podzim. Vysoký vstup moči a exkrementů skotu společně s jejich dalšími aktivitami mělo významný vliv na abundanci nitrifikačních a denitrifikačních bakterií, přičemž byly vyšší na půdách zatížených pastvou skotu v porovnání s kontrolou. Naše výsledky ukázaly, že abundance studovaných společenstev odrážely sezónní vlivy. The objective of the study was to explore the long-term effect of cattle grazing activities on abundance of nitrifying and denitrifying communities on overwintering area. The abundances of studied populations were determined using qPCR method and copy numbers of .i.amoA, nirS,./i. and .i.nirK./i. genes were quantified in spring and fall. High input of cattle urine and excrements with other animal activities had a significant impact on abundance of nitrifying and denitrifying bacteria, being higher in cattle impacted soils in comparison to control. Our data also showed that abundance of both bacterial communities reflected seasonal changes. Klíčová slova: key genes; nitrification; denitrification Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Kvantifikace klíčových genů v procesech nitrifikace a denitrifikace

Cílem této studie bylo prozkoumání efektu dlouhodobé pastvy skotu na abundanci nitrifikátorů a denitrifikátorů na zimovišti. Abundance studovaných společenstev byly určeny pomocí qPCR metody a byly ...

Chroňáková, Alica; Čuhel, Jiří; Radl, V.; Elhottová, Dana; Šimek, Miloslav
Biologické centrum, 2007

Fauna mnohonožek (Diplopoda) a stonožek (Chilopoda) smrkových porostů vrcholových částí Šumavy postižených kůrovcovou kalamitou
Tajovský, Karel
2007 - český Výzkumy smrkových porostů vrcholové části Šumavy postižené od devadesátých let minulého století kůrovcovou kalamitou ukázaly, že pro klimaxové smrčiny jsou charakteristická druhově chudá společenstva se specifickou kombinací druhů mnohonožek i stonožek. Paseky se vyznačovaly poklesem jejich abundancí. Odumírající porosty bez zásahu vykazovaly nárůst populací mnohonožek, počty stonožek však poklesly, aniž by došlo ke změně v jejich druhovém zastoupení. Ponechání odumírajících porostů spontánnímu vývoji představuje šetrnější variantu managementu respektující specifické půdní poměry. Zoological research in the spruce forests of the Bohemian Forest affected since the nineties of the past century by bark beetle outbreak showed that the climax spruce growths are characterised by specific species composition of millipedes and centipedes. Clear cuttings expressed a decrease of their densities. Dead forests without any management showed increase of millipede populations; centipede numbers decreased but no changes in their species spectrum was observed. Spontaneous succession of dead forest growths represents more considerate variant of management towards the specific soil conditions. Klíčová slova: millipedes; centipedes; Bohemian spruce forests Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Fauna mnohonožek (Diplopoda) a stonožek (Chilopoda) smrkových porostů vrcholových částí Šumavy postižených kůrovcovou kalamitou

Výzkumy smrkových porostů vrcholové části Šumavy postižené od devadesátých let minulého století kůrovcovou kalamitou ukázaly, že pro klimaxové smrčiny jsou charakteristická druhově chudá společenstva ...

Tajovský, Karel
Biologické centrum, 2007

Vyskytuje se .i.Histoplasma capsulatum./i. v jeskyních střední Evropy?
Nováková, Alena; Chroňáková, Alica
2007 - český V průběhu studia mikromycetů v jeskyních NP Slovenský kras byly pozorovány žluté kolonie mikroskopických hub na netopýřím guanu. Tuberkulátní konidie této houby připomínají makrokonidie patogenního druhu .i.Histoplasma capsulatum./i.. Testy patogenity i pokus o prokázání teplotního dimorfismu byly negativní. Analýza DNA neprokázala příbuznost s .i.H. capsulatum./i.. During studies of micromycetes in several caves (Slovakia - NP Slovak Karst, Czech Republic), white-yellow to yellow coloured microfungal colonies on bat droppings are observed. Tuberculate conidia were estimated in microscopic slides prepared from these colonies. These conidia reminded with their size, shape, surface structures and type of conidiogenesis pathogenous micromycete fungus .i.Histoplasma capsulatum./i.. This micromycete species occurs on bat guano in warmer regions of the world. In Europe, this fungus was recorded from Italian caves and soils and it was also reported from Romania, but without the evidence of thermal dimorphism. After repeteadly isolations, two strains of this fungus were isolated from Slovak caves (Domica Cave and Jasovská Cave). Tests of pathogenity (intranasal and intraperitoneal application to SCID mouses) and of the evidence of thermal dimorphism were negative. Klíčová slova: bat guano; caves; Czech and Slovak Republics Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Vyskytuje se .i.Histoplasma capsulatum./i. v jeskyních střední Evropy?

V průběhu studia mikromycetů v jeskyních NP Slovenský kras byly pozorovány žluté kolonie mikroskopických hub na netopýřím guanu. Tuberkulátní konidie této houby připomínají makrokonidie patogenního ...

Nováková, Alena; Chroňáková, Alica
Biologické centrum, 2007

Genetická transformace okrasných rostlin
Pavingerová, Daniela
2007 - český Klíčová slova: ornamental plants; Genetic transformation Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Genetická transformace okrasných rostlin

Pavingerová, Daniela
Biologické centrum, 2007

Procesy přeměn dusíku a uhlíku v půdě trvalých pastvin - výzkum na zimovišti skotu
Šimek, Miloslav; Hynšt, Jaroslav; Čuhel, Jiří; Elhottová, Dana; Chroňáková, Alica; Němcová, Anna; Jirout, Jiří; Krištůfek, Václav
2007 - český Zemědělské půdy jsou významným zdrojem tzv. skleníkových plynů (oxidu uhličitého, oxidu dusného a methanu). Pastevní půdy a zvláště zimoviště skotu se vyznačují velkými vstupy živin ve formě exkrementů. To spolu s dalšími vlivy chovaných zvířat vytváří předpoklady pro intenzivní přeměny dusíku a uhlíku a také pro jejich relativně velké ztráty ve formě plynných metabolitů. Příspěvek seznamuje s výzkumem modelového ekosystému zimoviště skotu. Pozornost je zaměřena jak na strukturu mikrobiálního společenstva pastevní půdy, tak na jeho aktivity včetně tvorby plynů a jejich emise z půdy do atmosféry. Agricultural soils represent a significant source of greenhouse gases (carbon dioxide, nitrous oxide and methane). Pasture soils and especially overwintering areas receive large amounts of nutrients as animal excrements. Together with other effects, this creates good conditions for high rates of nitrogen and carbon transformations, and also for substantial losses in the form of gaseous metabolites. This paper informs on research of a specific model ecosystem – the cattle overwintering area. Research is focused either on the structure of soil microbial community and on its activities including the formation of gases in, and their emission from the soil to atmosphere. Klíčová slova: nitrogen and carbon transformation; permanent grasslands; cattle overwintering area Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Procesy přeměn dusíku a uhlíku v půdě trvalých pastvin - výzkum na zimovišti skotu

Zemědělské půdy jsou významným zdrojem tzv. skleníkových plynů (oxidu uhličitého, oxidu dusného a methanu). Pastevní půdy a zvláště zimoviště skotu se vyznačují velkými vstupy živin ve formě ...

Šimek, Miloslav; Hynšt, Jaroslav; Čuhel, Jiří; Elhottová, Dana; Chroňáková, Alica; Němcová, Anna; Jirout, Jiří; Krištůfek, Václav
Biologické centrum, 2007

Zajímavé nálezy hub z České a Slovenské republiky
Nováková, Alena
2007 - český Z různých substrátů z České republiky a Slovenska byly izolovány některé zajímavé druhy mikroskopických hub - .i.Goidanichiella barronii, Truncatella angustata, Myxotrichum deflexum, M. chartarum, Penicillium vulpinum, Pidoplitchkoviella terricola, Zygosporium mycophilum, Coemansia./i. cf. .i.aciculifera, Gymnoascus reesii, Penicillium./i. cf. .i.glandicola./i.. Some microfungi (.i.Goidanichiella barronii, Truncatella angustata, Myxotrichum deflexum, M. chartarum, Penicillium vulpinum, P../i. cf. .i.glandicola, Pidoplitchkoviella terricola, Zygosporium mycophilum, Coemansia./i. cf. .i.aciculifera, Gymnoascus reesii./i.) isolated from various substrates from Czech and Slovak Republics are presented. These microfungi are interesting in the point of view of their morphological character and of a substrate from which they were isolated, too. Klíčová slova: microfungi; Czech Republic; Slovak Republic Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Zajímavé nálezy hub z České a Slovenské republiky

Z různých substrátů z České republiky a Slovenska byly izolovány některé zajímavé druhy mikroskopických hub - .i.Goidanichiella barronii, Truncatella angustata, Myxotrichum deflexum, M. chartarum, ...

Nováková, Alena
Biologické centrum, 2007

Jak vlastně studovat rybí obsádky našich velkých nádrží?
Kubečka, Jan; Matěna, Josef; Čech, Martin; Draštík, Vladislav; Frouzová, Jaroslava; Hohausová, Eva; Jarolím, Oldřich; Jůza, Tomáš; Kratochvíl, Michal; Muška, Milan; Peterka, Jiří; Prchalová, Marie; Říha, Milan; Tušer, Michal; Vašek, Mojmír
2007 - český Kvantitativní průzkumy ryb údolních nádrží doznaly u nás v poslední době rychlý vývoj. Zejména pro studium ryb habitatů volné vody má zásadní význam zavádění vědeckých echolotů, tralů, tzv. nordických mnohoočkových tenatních sítí, košelkových nevodů a hlubinného agregátu. Jednodušší z uvedených metod tvoří základ metodiky doporučené pro průzkum větších stojatých vod v rámci rámcové směrnice EU o vodách. Kombinace všech uvedených metod s klasickými přístupy (zátahové sítě, bentická tenata) se pak používá pro tzv. komplexní odhad rybí obsádky, který zjistí abundanci, biomasu, druhové a věkové složení všech důležitých druhů ve všech důležitých habitatech nádrží. Největší potenciál pro další zdokonalování průzkumů představuje nasazení mnohokuželových akustických kamer a dořešení problémů s účinností tralových sítí pro odlov dospělých ryb. Quantitative fish stock assessment recently advanced significantly in the Czech Republic. Sampling of open water was facilitated by application of scientific echosounders, trawls, Nordic multimesh gillnets, purse seines and booming electoshockers. Simplified combination of the above methods was recommended for the monitoring of larger stagnant water the Water Framework Directive of EU. Combination of all above approaches with more classic ones (beach seining, benthic gillnets) is being used for „complex fish stock assessment“ providing the assessment of abundance, biomass, species and age composition of all important species in all important habitats of the reservoirs. Further improvements of results is likely to be achieved by the application of multibeam acoustic cameras and by mitigation of the problems connected with quantitative trawling of large fish Klíčová slova: fish stock assessment; open water; reservoir fish Plné texty jsou dostupné na jednotlivých ústavech Akademie věd ČR. Jak vlastně studovat rybí obsádky našich velkých nádrží?

Kvantitativní průzkumy ryb údolních nádrží doznaly u nás v poslední době rychlý vývoj. Zejména pro studium ryb habitatů volné vody má zásadní význam zavádění vědeckých echolotů, tralů, tzv. nordických ...

Kubečka, Jan; Matěna, Josef; Čech, Martin; Draštík, Vladislav; Frouzová, Jaroslava; Hohausová, Eva; Jarolím, Oldřich; Jůza, Tomáš; Kratochvíl, Michal; Muška, Milan; Peterka, Jiří; Prchalová, Marie; Říha, Milan; Tušer, Michal; Vašek, Mojmír
Biologické centrum, 2007