Ne (6942)
Počet nalezených dokumentů:
6942
Publikováno od
do
Využití fluorescenčních technik k analýze průmyslově významných mikroorganismů
Müllerová, Lucie; Kráčmar, Stanislav; Krčma, František; Obruča, Stanislav
2023 - anglický
Techniky analýzy jednotlivých buněk neboli single-cell analýzy, jsou velmi důležité v kontextu studia důležitých biotechnologických mikroorganismů. V biotechnologických procesech je optimální mít rychlé, efektivní a real-time analýzy, které lze provést s minimální přípravou vzorku. Proto jsme v rámci předložené disertační práce využili autofluorescenci jako marker fyziologického stavu mikrobiální kultury, který je možné analyzovat pomocí fluorescenční mikroskopie a/nebo průtokové cytometrie. Nejdříve bylo potvrzeno, na základně emisních spekter, že zelená autofluorescence emitovaná bakteriemi Cupriavidus necator H16 a jejím polyhydroxyalkanoáty (PHA) neprodukujícím mutantem Cupriavidus necator PHB-4, pochází skutečně z flavinů. Emisní maximum bylo naměřeno v rozmezí 510–550 nm pro FAD, FMN a riboflavin – bohužel jednotlivá spektra od sebe nebylo možné rozeznat, a 515 nm pro oba bakteriální kmeny Cupriavidus necator. Byly nalezeny dvě maxima excitačních spekter, jedno v rozmezí 360–370 nm a druhé okolo 440 nm. Z těchto poznatků byl sestaven nový protokol pro fluorescenční mikroskopii – laser byl nastaven na hodnotu 467 nm a emisní filtr pro detekci byl vybrán 520/35 nm. Flaviny a jejich autofluorescence může být take použita v kombinaci s jinými fluorofory, když jsou použity multiparametrické analýzy, ale je důrazně doporučeno, aby vybrané fluorescenční sondy buď emitovaly v jiném rozmezí, než je 500–550 nm anebo byla jejich doba života excitovaného stavu jiná, než je interval 3,2–3,7 a 4,2 – 4,9 ns. Tyto doby života navíc zůstaly konstantní, i když byly buňky vystaveny kultivačním a stresovým podmínkám. To z nich dělá velmi stabilní marker v porovnání s dynamickým charakterem intenzit fluorescence. Dále byl optimalizován protokol pro značení bakterie C. necator s využitím PHA specifické sondy BODIPY 493/503. Optimální koncentrace této lipofilní sondy byla stanovena na 2,5 µg ml-1 a sondu je možné dle našich dat aplikovat společně s viabilitní sondou propidium iodidem. Tento protokol byl také využit pro studium morfologie PHA-syntetizující halofilní bakterie Halomonas halophila. Pro stanovení UV-protektivních vlastností PHA obsaženého v bakterii Cupriavidus necator, byl optimalizován další protokol, tentokrát pro ROS citlivou sondu CM-H2DCFDA, která byla stanovená jako citlivější v porovnání s její nemethylovanou formou. V této studii byly navíc potvrzeny UV-protektivní vlastnosti PHA na bakterii Cupriavidus necator H16 v porovnání s PHA nesyntetizujícím kmenem Cupriavidus necator PHB-4. Single-cell analysis techniques are very important when studying relevant biotechnological microorganisms. In biotechnological processes, the optimum is to have fast, efficient and real-time analyses that can be done with minimal preparations. Therefore, we looked at autofluorescence as a possible and natural marker when employing fluorescence microscopy and flow cytometry. First, it has been established, based on the emission spectra, that the green autofluorescence of the bacteria used – Cupriavidus necator H16 and its non polyhydroxyalkanoates (PHA) producing mutant Cupriavidus necator PHB-4, is caused predominantly by flavins. The maxima of emission spectra were 510 – 550 nm for FAD, FMN and riboflavin whose spectra could not be distinguished, and 515 nm for both strains of Cupriavidus necator. Two maxima of excitation spectra of the bacteria were found – one in the range 360 – 370 nm and another around 440 nm, and so a new protocol for fluorescence microscopy has been established - the laser used was 467 nm and the emission filter chosen for the detection was 520/35 nm. Flavins and their autofluorescence can also be used in combination with other fluorophores when the need for multi-parametrical analyses arises, but it’s highly recommended the other dyes emit other than green fluorescence in the band of 500 – 550 nm or/and have an average fluorescence lifetime other than 3.2 – 3.7 and 4.2 - 4.9 ns. These values stayed constant even when the cells were exposed to various cultivation and even stress conditions. That makes them a very stable marker compared to the dynamic marker of fluorescence intensity that changes immediately after a change in the environment. A new staining protocol for C. necator using PHA-specific hydrophobic probe BODIPY 493/503 was optimised. The optimal staining concentration of the lipophilic dye BODIPY 493/503 was determined to be 2.5 µg ml-1 and it can be used in combination with propidium iodide. The BODIPY 493/503 staining protocol has been used when analysing the morphology of the PHA-synthesising bacteria Halomonas halophila. Further, to study the UV-protective properties of PHA in Cupriavidus necator, another staining essay has been optimised. It has been established that the ROS sensitive dye CM-H2DCFDA gives better performance than its non-methylated form. Also, the UV-protective characteristics of the PHA-synthesising strain Cupriavidus necator H16 were confirmed when compared to its non-PHA synthesising strain C. necator PHB-4.
Klíčová slova:
Bacterial autofluorescence; Cupriavidus necator; Sporomusa ovata; Halomonas halophila; single cell analysis; average fluorescence lifetime; oxidative stress; ROS; biotechnological processes quality control; PHB protective characteristics; flow cytometry; fluorescence microscopy; fluorescence stain optimisation; Bakteriální autofluorescence; Cupriavidus necator; Sporomusa ovata; Halomonas halophila; analýzy jedné buňky; doba života excitovaného stavu; oxidativní stress; ROS; kvalita kontroly biotechnologických procesů; protektivní charakteristiky PHB; průtoková cytometrie; fluorescenční mikroskopie; optimalizace fluorescenčního barvení
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Využití fluorescenčních technik k analýze průmyslově významných mikroorganismů
Techniky analýzy jednotlivých buněk neboli single-cell analýzy, jsou velmi důležité v kontextu studia důležitých biotechnologických mikroorganismů. V biotechnologických procesech je optimální mít ...
Biblioverse - Multifunkční objekt s knihovnou
Frait, Marek; Stejskal, Ivo; Bykov, Oleksii
2023 - anglický
Projekt decentralizované multifunkční knihovny se nachází v bloku mezi ulicemi Sladová a Pekařská. Za účelem dosažení maximální flexibility a adaptability, byl celý návrh rozdělen na moduly.Tento způsob rozdělení prostoru nabízí různé úrovně prostupnosti, což podněcuje komunikaci a spolupráci mezi uživateli. Objekty tak vytváří hranici mezi intimními a veřejnými prostory, které spolu komunikují skrze ocelové rámové konstrukce. The decentralized multifunctional library project is located in the block between Sladová and Pekařská streets. In order to achieve maximum flexibility and adaptability, the entire design has been divided into modules.This way of dividing the space offers different levels of permeability, which encourages communication and collaboration between users. The buildings thus create a boundary between intimate and public spaces that communicate with each other through the steel frame structures.
Klíčová slova:
library; architecture; steel; glass; community; decentralization; knihovna; architektura; ocel; sklo; komunita; decentralizace
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Biblioverse - Multifunkční objekt s knihovnou
Projekt decentralizované multifunkční knihovny se nachází v bloku mezi ulicemi Sladová a Pekařská. Za účelem dosažení maximální flexibility a adaptability, byl celý návrh rozdělen na moduly.Tento ...
Evoluce vesmírných dalekohledů
Bátorová, Silvia; Sučková, Magda; Froehling, Kenneth
2023 - anglický
Tato bakalářská práce se zaměřuje na popis historie dalekohledu, počínaje refrakčními a reflexními verzemi optického dalekohledu a pokračuje stručným nástinem historie radioteleskopu a vesmírných dalekohledů obecně. Poté jsou specifikovány základní vlastnosti kosmických dalekohledů a jejich pozitivní a negativní vlastnosti jsou porovnány. Na závěr jsou popsány tři nejdůležitější vesmírné dalekohledy a jejich přínosy pro vědu jsou objasněny. This thesis focuses on the description of the history of the telescope, starting with the refracting and reflecting versions of the optical telescope and following with a brief outline of the history of the radio telescope and space telescopes in general. Then, basic features of space telescopes are specified and their positive and negative features are compared. Finally, the three most influential space telescopes are described and their contributions to science are discussed.
Klíčová slova:
telescope; space telescope; electromagnetic spectrum; mirror; Hubble; Kepler; Webb; dalekohled; vesmírní dalekohled; elektromagnetické spektrum; zrcadlo; Hubble; Kepler; Webb
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Evoluce vesmírných dalekohledů
Tato bakalářská práce se zaměřuje na popis historie dalekohledu, počínaje refrakčními a reflexními verzemi optického dalekohledu a pokračuje stručným nástinem historie radioteleskopu a vesmírných ...
Charakteristika žánrů písemného stylu odborného anglického jazyka
Kučera, Ondřej; Walek, Agata; Baumgartnerová, Alena
2023 - anglický
Cílem této bakalářské práce je definovat, co je to angličtina pro specifické účely, vymezit její styly a žánry. Tato práce je rozdělena do tří hlavních částí. V první části je stručně představen anglický jazyk pro specifické účely a jeho historie. Jsou zde přiblíženy styly tohoto jazyka a je vysvětleno jejich použití. Ve druhé části jsem definoval žánry tohoto jazyka, vysvětlil účel každého z nich a ukázal, jak se dále dělí. Ve třetí části jsou prezentovány části textů, jež jsou analyzovány a porovnány: dva texty z elektrotechniky a dva texty z medicíny. V obou oblastech je porovnáván úryvek z populárně vědeckého článku a učebnice. Analýza je provedena ve čtyřech kategoriích: koheze, deixe, signposting a hedge. Tyto výsledky jsou porovnány nejdříve ve stejném oboru mezi rozlišnými styly a následně mezi odlišnými obory – elektrotechnika a medicína. Všechny výsledky jsou komentovány. The goal of this bachelor thesis is to define what the English for Specific Purposes is, its styles and genres. This thesis is divided into three main parts. In the first part, ESP and its history briefly presented. The styles of ESP are brought up and their uses explained. In the second part I defined the genres of ESP, explained purpose of each and further division. In the third part, examples of the textbook and popular scientific article are extracted, presented, analyzed, and compared. The texts chosen for analysis are from the field of electrical engineering and medicine. The analysis and comparison are carried out in four categories: cohesion, deixis, signposting and hedging. Firstly, the styles in the same field are compared, and secondly the similarities and differences between the fields are presented. All the results are commented on.
Klíčová slova:
English; ESP; styles; genre; style; hedging; signposting; deixis; cohesion; textbook; abstract; article; thesis; medicine; electrical engineering; Anglický jazyk; styl; žánr; hedging; odkazy; deixe; koheze; učebnice; abstrakt; článek; teze; medicína; elektrotechnika
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Charakteristika žánrů písemného stylu odborného anglického jazyka
Cílem této bakalářské práce je definovat, co je to angličtina pro specifické účely, vymezit její styly a žánry. Tato práce je rozdělena do tří hlavních částí. V první části je stručně představen ...
Analogově-digitální modul pro elektrickou impedanční tomografii
Zimniok, David; Hejtmánek, Tomáš; Mikulka, Jan
2023 - anglický
Tato bakalářská práce se zabývá elektrickou impedanční tomografií a jejími problémy. Prvním problémem je měření napětí v širokém rozsahu od milivoltů po desítky voltů. Druhým problémem je měření fáze impedance pomocí mikroprocesoru bez lidské pomoci. Také bylo třeba vyřešit problém s návrhem elektrod a s přenosem malého napětí na velké vzdálenosti mezi měřeným objektem a navrženým zařízením pro zpracování signálů. Ke zpracování signálů a komunikaci byl zvolen mikroprocesor ARM doplněný o zesilovač, který má nastavitelné zesílení a také lineární optočlen pro ochranu mikroprocesoru. Pro zajištění přenosu měřeného napětí na velké vzdálenosti bez ztráty dat je navržena aktivní sonda. Data jsou přenášena prostřednictvím proudové smyčky. The presented bachelor thesis examines electrical impedance tomography and related issues. The primary challenge is measuring voltage over a wide range from millivolts to tens of volts. The second problem is measuring the imaginary part of impedance with a microprocessor without human help. Furthermore, the difficulty with circuit design of electrodes and transmitting such a small voltage over long distances between the measurement phantom and the microprocessor. For this purpose, it was necessary to choose an ARM microprocessor in combination with an programmable gain amplifier and a linear optocoupler for protecting the microprocessor. An active probe has been designed to ensure the measured voltage transition over long distances without data loss; the data is transmitted via a current loop.
Klíčová slova:
Electrical impedance tomography; control unit; active measuring probe; automatic measurements; phase shift voltage and current measurements; STM32; PGA202; IL300; Elektrická impedanční tomografie; řidící jednotka; aktivní měřící sonda; automatické měření; měření fázového posunu napětí a proudu; STM32; PGA202; IL300
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Analogově-digitální modul pro elektrickou impedanční tomografii
Tato bakalářská práce se zabývá elektrickou impedanční tomografií a jejími problémy. Prvním problémem je měření napětí v širokém rozsahu od milivoltů po desítky voltů. Druhým problémem je měření fáze ...
Apache modul pro mitigaci DoS útoků
Ruman, Róbert; Sikora, Marek; Jurek, Michael
2023 - anglický
Táto práca sa venuje mitigácii viacerých typov útokov DoS. Naším cieľom bolo vytvoriť vlastný modul apache, ktorý dokáže zmierniť útoky typu flood, ako aj logické útoky. Modul bol vytvorený v jazyku C pomocou programu VS Code. Po vytvorení modulu sme vykonali viacero testov na získanie údajov, aby sme mohli náš modul porovnať s už existujúcimi modulmi apache. Porovnaním výsledkov testov sme dospeli k záveru, že náš modul dokáže zmierniť oba typy útokov. Výsledky testov sú vizualizované pomocou grafov v prílohe. This thesis is devoted to the mitigation of multiple types of DoS attacks. Our aim was to create a custom apache module that is able to mitigate flood attacks as well as logical attacks. The module was created in C language using VS Code. After creating the module we ran multiple tests to gather data in order to be able to compare our module to already existing apache modules. Comparing the test result we concluded that our module is able to mitigate both types of attacks. The results of the tests are visualized using graphs in the appendix.
Klíčová slova:
DoS; UDP flood; ICMP flood; SYN flood; Slowloris; HTTP flood; attacker; RUDY; Apache; module; server; DoS; UDP flood; ICMP flood; SYN flood; Slowloris; HTTP flood; útočník; RUDY; Apache; modul; server
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Apache modul pro mitigaci DoS útoků
Táto práca sa venuje mitigácii viacerých typov útokov DoS. Naším cieľom bolo vytvoriť vlastný modul apache, ktorý dokáže zmierniť útoky typu flood, ako aj logické útoky. Modul bol vytvorený v jazyku C ...
Integrace SIP hlasového volání do IRC klienta či brány
Kocman, David; Očenášek, Pavel; Rychlý, Marek
2023 - anglický
Tato práce popisuje návrh, implementaci a testování Session Initiation Protocol uživatelského agenta, který používá Internet Relay Chat klienta či bránu jako jeho grafické rozhraní. Pro implementaci volání je použita open-source knihovna třetí strany, nazývána liblinphone, a samotný program je napsán v jazyce C/C++. Program je schopen jak volání, tak i zákládních SIP vlastností, jako je registrace u ústředny, překlad čísel na adresy pomocí ENUM a přímé zprávy. Také je k dispozici adresář pro ukládání kontaktů a identit, napsán pomocí knihovny SQLite3 pro C/C++. Výsledek této práce zavádí možnost volání z IRC. This thesis describes the design, implementation and testing of a Session Initiation Protocol user agent, using an Internet Relay Chat client or gate as its graphical interface. A third-party open-source library, called liblinphone, is used for call related implementation and the application itself is written in the C/C++ language. The program can make calls and other basic SIP-related features, which include proxy registration, ENUM lookup, and instant messaging. An address book is also available for storing contacts and identities, and is implemented with the SQLite3 C/C++ library. The result of this thesis is an ability to make calls with IRC.
Klíčová slova:
SIP; RTP; IRC; VoIP; C; C++; SIP user agent; calls; SQLite3; database; integration; SIP; RTP; IRC; VoIP; C; C++; SIP user agent; volání; SQLite3; databáze; integrace
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Integrace SIP hlasového volání do IRC klienta či brány
Tato práce popisuje návrh, implementaci a testování Session Initiation Protocol uživatelského agenta, který používá Internet Relay Chat klienta či bránu jako jeho grafické rozhraní. Pro implementaci ...
Hodnocení výkonnosti podniku
Chochula, Filip; Doležal, Petr; Pavláková Dočekalová, Marie
2023 - anglický
Bakalárska práca hodnotí výkonnosť podniku centra zdieľaných služieb na základe vybraných skúmaných globálnych trendov relevantných pre dané odvetvie, kľúčových ukazovateľov výkonnosti a metódy Balanced Scorecard, čím správu o výkonnosti podniku rozširuje o nefinančné ukazovatele. V závere uvádza návrhy na zlepšenie, podporujúc budúcu výkonnosť spoločnosti. The bachelor thesis evaluates a shared services center corporate performance based on selected researched global trends relevant to its sector, key performance measurements and the Balanced Scorecard method, expanding the company's performance report with non-financial indicators. It concludes with suggestions for improvement that support future company performance.
Klíčová slova:
company performance; financial performance measures; balanced scorecard; strategic management; key performance indicators; performance report; shared service center; výkonnosť podniku; ukazovatele finančnej výkonnosti; balanced scorecard; strategický manažment; kľúčové ukazovatele výkonnosti; správa o výkonnosti; centrum zdieľaných služieb
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Hodnocení výkonnosti podniku
Bakalárska práca hodnotí výkonnosť podniku centra zdieľaných služieb na základe vybraných skúmaných globálnych trendov relevantných pre dané odvetvie, kľúčových ukazovateľov výkonnosti a metódy ...
Vizualizace automatových algoritmů
Kuchyňka, Jiří; Češka, Milan; Holík, Lukáš
2023 - anglický
Tato práce se zabývá návrhem a implementací generického systému k vizualizaci algoritmů, které pracují nad automaty. Výsledný systém zcela odděluje část, která se věnuje generování dat k vizualizaci a část, která se věnuje vizualizování. Systém pouze určuje jejich komunikační rozhraní. Práce se zaměřuje na integraci takovéhoto systému do existujících knihoven takovým způsobem, aby byly minimalizovány požadavky na programátora, k tomu aby mohl vizualizovat stav svého algoritmu. Práce se také zkráceně věnuje možnostem využití tohoto systému k vizualizaci stavu algoritmu při krokování programem během ledění. Navržený systém může být použit pro výuku, výzkum a praktické aplikace v oblasti teorie automatů. V budoucnu by mohl být systém rozšířen o nástroje k vizualizaci turingových strojů a algoritmů pracujících nad nimi. The goal of this thesis is to design and implement a generic system to visualize algorithms that operate over automata. The resulting system completely separates the part that is dedicated to generating data for visualization and the part that is dedicated to visualizing it. The system only specifies their communication interface. This thesis focuses on integrating such system into existing libraries in a way to minimize the requirements on the programmer to start visualizing the state of their algorithm. The thesis also briefly discusses the possibilities of using such a system to visualize the state of an algorithm while stepping through the program during debugging. The proposed system can be used for teaching, research, and practical applications in automata theory. In the future, the system could be extended with tools to visualize Turing machines and algorithms operating on them.
Klíčová slova:
automata; automaton; NFA; DFA; visualization; debugging; algorithms; automata algorithms; automata visualization; graphs; GraphViz; data streaming; Jupyter Notebook; real-time visualization; automata algorithm debugging; automaty; NFA; DFA; vizualizace; ladění programu; algoritmy; automatové algoritmy; vizualizace automatů; grafy; GraphViz; streamování dat; Jupyter Notebook; vizualizace v reálném čase; debuggování automatových algoritmů
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Vizualizace automatových algoritmů
Tato práce se zabývá návrhem a implementací generického systému k vizualizaci algoritmů, které pracují nad automaty. Výsledný systém zcela odděluje část, která se věnuje generování dat k vizualizaci a ...
Automatická kategorizace a extrakce dat z webových stránek
Rein, Michal; Koutenský, Michal; Dolejška, Daniel
2023 - anglický
Tato práce popisuje vývoj flexibilního systému pro automatickou kategorizaci a extrakci obsahu z webových stránek, se zaměřením na prostředí darknetu. Navrhli jsme vysoce přizpůsobitelný a škálovatelný systém, který dokáže zpracovávat různorodý typ obsahu, přičemž jsme dbali na kvalitu návrhu celkové architektury, struktury databáze a samotného algoritmu pro zpracování dat. Použitím nejmodernějšího jazykového modelu trénovaného na úkolu inference přirozeného jazyka demonstrujeme potenciál modelu efektivně kategorizovat obsah v zcela neznámém prostředí, přičemž jsme provedli analýzu výkonu daného modelu za použití různých hypotetických šablon. Dále jsme do systému integrovali model pro rozpoznávání pojmenovaných entit a metodologii šablonování pro extrakci obsahu, přičemž jsme navrhli automatizovaný přístup k segmentaci obsahu webových stránek za pomocí modelu ChatGPT od společnosti OpenAI. V neposlední řadě jsme vyvinuli uživatelsky přívětivou webovou aplikaci pro zlepšení dostupnosti a snadné použití systému, zhodnotili dosažené výsledky a navrhli možnosti pro další výzkum a vývoj v dané oblasti. This thesis describes the development of a flexible system for automatically categorising and extracting content from web pages, with a focus on the darknet environment. We have designed a highly adaptable and scalable system capable of handling any type of content, while taking great care in considering the overall architecture, database structure, and processing pipeline. Using the state-of-the-art language model trained on the natural language inference task, we demonstrate the model's potential to categorise content effectively in a zero-shot environment. We also conduct an analysis of the performance of various hypothesis templates. To further enhance the data extraction process, we have integrated a named entity recognition model and templating methodology for content extraction and proposed an automated segmentation approach using OpenAI's ChatGPT model. In addition, we have developed a user-friendly web client application to enhance the system's accessibility and ease-of-use, evaluated the achieved results, and identified areas for further research and development in this field.
Klíčová slova:
content categorisation; natural language processing; natural language inference; named entity recognition; templating; microservice architecture; darknet; kategorizace obsahu; zpracování přirozeného jazyka; inference přirozeného jazyka; rozpoznávání pojmenovaných entit; šablonování; architektura mikroslužeb; darknet
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři NUŠL
Automatická kategorizace a extrakce dat z webových stránek
Tato práce popisuje vývoj flexibilního systému pro automatickou kategorizaci a extrakci obsahu z webových stránek, se zaměřením na prostředí darknetu. Navrhli jsme vysoce přizpůsobitelný a ...
NUŠL poskytuje centrální přístup k informacím o šedé literatuře vznikající v ČR v oblastech vědy, výzkumu a vzdělávání. Více informací o šedé literatuře a NUŠL najdete na webu služby.
Vaše náměty a připomínky posílejte na email nusl@techlib.cz
Provozovatel
Zahraniční báze