Thinking and Inference
Hanzal, Tomáš; Kolman, Vojtěch; Švec, Ondřej; Peregrin, Jaroslav
2024 - Czech Tématem této disertační práce je myšlení ve vztazích k inferenci, resp. k usuzování, a k řeči. Hlavním teoretickým východiskem je inferencialismus Roberta Brandoma a hlavním cílem je na pozadí inferencialistické teorie, chápané zde primárně jako model řečových praktik, vyložit myšlení, chápané primárně jako činnost či proces. Inference je tak tématem jak ve smyslu činnosti usuzování, tak ve smyslu inferencialistického výkladu jazykového významu a řečových praktik. Vztah myšlení k řeči je zde od počátku chápan jako zásadní, což se ukazuje už na záměru zkoumat myšlení právě v rámci teorie řečových praktik. Cílem tedy je explikovat tyto naznačené souvislosti. Inferencialismus lze chápat v první řadě jako druh teorií významu, které vycházejí od inference, a nikoli, jako četné jiné teorie, od reprezentace. Ta tak podle inferencialismu není něco, co lze použít pro výklad významu, ale naopak něco, co samo potřebuje netriviální vysvětlení. Dalším podstatným rysem Brandomova inferencialismu je přednost vět před jednotlivými výrazy, neboť věty jsou nejmenšími jednotkami, kterými lze něco tvrdit, tedy za které lze být odpovědný (proto také jde o normativní inferencialismus), a které mají přímou inferenční roli, tj. jsou v inferenčních vztazích s dalšími větami, resp. tvrzeními. Zaměření této práce na myšlení... The topic of this dissertation is thinking in relation to inference, or reasoning, and to language. The main theoretical starting point is the inferentialism of Robert Brandom, and the main goal is, against the background of the inferentialist theory, understood here primarily as a model of linguistic practices, to explain thinking, understood primarily as an activity or process. Inference is thus the topic both in the sense of the activity of reasoning and in the sense of inferentialist interpretation of linguistic meaning and practices. The connection between thinking and language is understood here to be essential from the beginning, which is evident already in the plan to examine thinking within the framework of a theory of linguistic practices. The goal is thus to explicate the outlined connections. Inferentialism can be understood firstly as a kind of theory of meaning that starts from inference and not, like many other theories, from representation. Thus, according to inferentialism, representation is not something that can be used to explain meaning, but rather something that itself needs a non-trivial explanation. Another essential feature of Brandom's inferentialism is the priority of propositions over singular expressions, since propositions are the smallest units using which something... Keywords: myšlení|usuzování|inferencialismus|Robert Brandom|činění explicitním|abdukce|racionální rekonstrukce; thinking|reasoning|inferentialism|Robert Brandom|making explicit|abduction|rational reconstruction Available in a digital repository NRGL Thinking and Inference

Tématem této disertační práce je myšlení ve vztazích k inferenci, resp. k usuzování, a k řeči. Hlavním teoretickým východiskem je inferencialismus Roberta Brandoma a hlavním cílem je na pozadí ...

Hanzal, Tomáš; Kolman, Vojtěch; Švec, Ondřej; Peregrin, Jaroslav
Univerzita Karlova, 2024

Pokrok ve zlepšování sanitačních podmínek: poznatky z Indie
Ficek, František; Novotný, Josef; Roubík, Hynek; Chakraborty, Saurav
2024 - English Nedostatečná sanitace je významnou globální výzvou s dalekosáhlými následky na životy miliard lidí. Má závažné implikace pro zdraví lidí a brzdí pokrok k rozvojovým cílům. Mezi nejvíce zasaženými zeměmi je Indie speciálním případem, kde až do nedávna pouze velmi malá část populace využívala hygienickou sanitaci. Po předchozích neúspěších na to Indická vláda reagovala spuštěním Swachh Bharat Mission (Mise čistá Indie) v roce 2014. Jedná se o nejrozsáhlejší sanitační program na světě a měl do roku 2019 kompletně zamezit defekaci ve volném prostoru (open defecation). Tato disertační práce započatá v roce 2016 má za cíl porozumět sanitační změně v Indii skrze kontextuálně-citlivé případové studie zaměřené na národní sanitační politiky a trendy v sanitačních intervencích. Tento výzkum zahrnuje analýzu situace v rurálních oblastech státu Džhárkhand skrze opakované dotazníkové šetření doplněné o kvalitativní rozhovory. Data byla sbírána v letech 2016 a 2019. Dále tento výzkum obsahuje kvalitativní studii specifické sanitační intervence a komparativní studii národních politik Indie a Etiopie. Závěry výzkumu jsou, že ačkoliv Swachh Bharat Mission uspěla ve zvýšení přístupu k záchodům skrze poskytování dotací na jejich výstavbu, nezdařilo se během ní zamezit defekaci ve volném prostoru, a také nadále... Inadequate sanitation is a significant global challenge, impacting the lives of billions of people. It has serious implications for human health and impedes progress towards development targets. Among the countries most affected, India stands out, having until recently recorded an especially low percentage of the population practicing hygienic sanitation. In response to previous underperformances of national-level campaigns, the Indian government launched the Swachh Bharat (Clean India) Mission in 2014, as the largest sanitation program worldwide, with the goal of eliminating open defecation by 2019. This dissertation project, initiated in 2016, aims to examine sanitation change in India. Through contextually sensitive case studies it analyzes national sanitation policies and trends in sanitation interventions. The research involved analyzing the situation in rural Jharkhand through repeated cross-sectional household surveys supplemented by qualitative interviews with the data collection conducted in 2016 and 2019. Additionally, the research included a qualitative study examining the perspectives of practitioners on a specific sanitation intervention and a comparative study of national sanitation policies implemented in India and Ethiopia. The research revealed that the Swachh Bharat Mission... Keywords: Sanitace; Záchod; Indie; Swachh Bharat Mission; SDG 6; Změna chování; Sanitation; Toilet; India; Swachh Bharat Mission; SDG 6; Behavior change Available in a digital repository NRGL Pokrok ve zlepšování sanitačních podmínek: poznatky z Indie

Nedostatečná sanitace je významnou globální výzvou s dalekosáhlými následky na životy miliard lidí. Má závažné implikace pro zdraví lidí a brzdí pokrok k rozvojovým cílům. Mezi nejvíce zasaženými ...

Ficek, František; Novotný, Josef; Roubík, Hynek; Chakraborty, Saurav
Univerzita Karlova, 2024

Využití iontových kapalin pro přípravu epoxidů
Rebei, Marwa; Beneš, Hynek; Machotová, Jana; Polášková, Martina
2024 - English Epoxidové pryskyřice představují důležitou skupinu reaktoplastů, široce používaných jako nátěrové hmoty, licí pryskyřice v elektronice, matrice strukturních kompozitů atd., a to díky svým výhodným vlastnostem, jako je silná adheze, vysoká chemická a elektrická odolnost a dobrá zpracovatelnost. Nevýhodou jsou jejich nároky na vytvrzování, související s dlouhými vytvrzovacími cykly a potřebou specifických katalyzátorů (například organokovové sloučeniny a komplexy či využití tzv. metal-organic framework, MOF, struktur), které jsou dostatečně aktivní až při vysokých reakčních teplotách. Ve většině případů jsou tyto katalyzátory toxické či vyžadují použití organických rozpouštědel. V důsledku toho jsou zkoumány alternativní netoxické katalyzátory/iniciátory, které podporují dobře kontrolovatelné a rychlé vytvrzování za mírných podmínek, a přitom vedou k vytvoření kovalentních sítí s vynikajícími termomechanické vlastnosti. V této práci byly studovány tři různé reakce otevření epoxidového kruhu vyvolané různými typy imidazoliových iontových kapalin. První kapitola (4.1) pojednává o stupňovité polymeraci mezi epoxidovou pryskyřicí a dikarboxylovou kyselinou v přítomnosti imidazoliových iontových kapalin, která se prováděla za mírných podmínek (T = 80-120 řC). Bylo prokázáno, že iontová kapalina působí... Epoxy resins represent an important category of thermosets widely as coatings, electronic encapsulants, matrices for composites, etc., due to their beneficial properties, such as strong adhesion, high chemical and electrical resistance, and good processability. However, their curing reactions present some limitations, such as using catalysts (for example, organometallics, complexes and MOFs) which are active at high reaction temperatures. In most cases, these catalysts are toxic and require organic solvents. Consequently, alternative non-toxic catalysts/initiators that can promote well-controlled fast curing under mild conditions have been explored while maintaining sufficient thermomechanical properties of the formed epoxy networks. In this thesis, three different epoxy ring opening reactions induced by various imidazolium ionic liquids (ILs) were studied. The first subsection (4.1) discusses the step-growth epoxy-dicarboxylic acid polymerization in an imidazolium IL medium conducted under mild conditions (T = 80-120 řC). The IL was shown to act as both a solvent and an initiator/catalyst for the reaction. In addition, IL-anions (chloride, bis(trifluoromethylsulfonyl) imide, or methanesulfonate) strongly affect the progress of the reaction. It was found that the Cl- anion is the most effective... Keywords: Ionic liquid; metal ionic liquids; Epoxy resin; Copolymerization; Anhydride; Cross-linking; Kinetics; mechanism; carbon dioxide Available in a digital repository NRGL Využití iontových kapalin pro přípravu epoxidů

Epoxidové pryskyřice představují důležitou skupinu reaktoplastů, široce používaných jako nátěrové hmoty, licí pryskyřice v elektronice, matrice strukturních kompozitů atd., a to díky svým výhodným ...

Rebei, Marwa; Beneš, Hynek; Machotová, Jana; Polášková, Martina
Univerzita Karlova, 2024

Students in Post-Stalinist Czechoslovakia: Universities and Students' Participation (1956 - 1969)
Polák, Michael; Pullmann, Michal; Mervart, Jan; Holečková, Marta Edith
2024 - Czech Michael POLÁK Studentstvo v období poststalinismu: vysokoškolské instituce a proměny studentské participace v Československu (1956-1969) Abstrakt: Tato dizertační práce zkoumá studentské sociální hnutí v poststalinském Československu (1956 - 1969). Jedním z hlavních cílů sociálních hnutí je prosadit své kulturní představy o společenských vztazích do sociální reality. Tato práce se tak ptá, jak se povedlo původně poměrně malé skupině lidí, která si vytkla za cíl vznik nezávislých studentských samospráv, prosadit svůj cíl. Dále práce analyzuje zejména dynamiku studentského hnutí, pro jejíž pochopení je potřeba rozumět problémům, které chtějí konkrétní aktéři a aktérky řešit. Proto tato práce zkoumá také každodenní zkušenost studentů a studentek. Text tak není přínosem pouze pro výzkum konkrétního sociálního hnutí, nýbrž má vypovídající hodnotu také o povaze poststalinismu jako specifické historické době. Práce je rozdělena do čtyř fází podle vývoje sociálního hnutí. První fáze zkoumá vznik nespokojenosti studentstva. Ta vzniká zejména tehdy, když dochází k rozporům mezi očekáváními, která jsou utvářena dobovými mocenskými přísliby, a žitou realitou. V této fázi tak práce analyzuje čtyři klíčové přísliby a jejich konkrétní nenaplňování ve studentském životě. Jedná se o 1) očekávání spojená s přísliby... Michael POLÁK Students in the Post-Stalinist Czechoslovakia: Universities and Students` Participation in Czechoslovakia (1956-1969) This dissertation examines the student social movement in post-Stalin Czechoslovakia (1956- 1969). One of the main goals of social movements is to impose their cultural ideas about social relations on social reality. This thesis asks how an initially relatively small group of people who set out to establish independent student governments succeeded in achieving their goal. This thesis thus analyses primarily the dynamics of the student movement. Because understanding the dynamics of social movements requires an understanding of the problems that particular actors want to address, this thesis also examines the everyday experience of students. Thus, the text not only adds to the research on this particular social movement but also enriches the existing knowledge about the nature of post-Stalinism as a specific historical period. The work is divided chronologically into four phases according to the development of the social movement. The first phase examines the emergence of student discontent. This discontent arises particularly when there are contradictions between expectations shaped by the promises of the official structures and lived realities. Thus, in this phase, the thesis... Keywords: studentstvo|Československý svaz mládeže|sociální hnutí|studentské hnutí|poststalinismus|státní socialismus|rozpory|emoce; Students|Czechoslovak Youth Union|Social Movements|Student Movement|Post-Stalinism|State-Socialism|Contradictions|Emotion Available in a digital repository NRGL Students in Post-Stalinist Czechoslovakia: Universities and Students' Participation (1956 - 1969)

Michael POLÁK Studentstvo v období poststalinismu: vysokoškolské instituce a proměny studentské participace v Československu (1956-1969) Abstrakt: Tato dizertační práce zkoumá studentské sociální ...

Polák, Michael; Pullmann, Michal; Mervart, Jan; Holečková, Marta Edith
Univerzita Karlova, 2024

The Apostolic Nuncios in Prague during the first years of the reign of Rudolf II. and their importance for the society of the Lands of the Bohemian Crown (1578-1594)
Banďouch, Pavel; Mikulec, Jiří; Knoz, Tomáš; Černušák, Tomáš
2024 - Czech Disertační práce se zabývá působením apoštolských nunciů na dvoře Rudolfa II. v letech 1578- 1594. Zaměřuje se především na to, jaký měli nunciové v tomto kontextu reálný vliv, jaké byly jejich požadavky a jejich mentalita. Poté, co je představen dosavadní stav bádání a motivace volby tématu, jsou nejprve uvedeny životopisy jednotlivých nunciů, se zvláštním zřetelem právě k jejich misi na rudolfinském dvoře. Hlavním pramenem pro jejich zpracování byla korespondence mezi Římem a jednotlivými nuncii. Tato činnost nunciů je následně představena v kontextu vývoje katolické církve, především s ohledem na rozvíjející se chápání papežského úřadu a pojetí křesťanství coby náboženství. Země Koruny české měly v tomto ohledu specifické postavení, neboť po husitských válkách v nich spoluexistovaly dvě náboženské strany/konfese: pod obojí a pod jednou. Oproti zbytku Evropy se zde po období konfliktů proto rozvinula někdy více, někdy méně mírumilovná náboženský koexistence. Na základě studia textů dvou z nunciů, kteří ve sledovaném období vykonávali svůj úřad (Germanika Malaspiny a Cesare Speciana), se poté disertace zabývá otázkou tolerance a pojetí "pravého a falešného" ragion di stato. Klíčová slova katolická církev; raný novověk; papežství; nunciové; ragion di stato; náboženská tolerance The dissertation deals with the work of apostolic nuncios at the court of Rudolf II in the years 1578-1594. It focuses mainly on the real influence of the nuncios in this context, their demands and their mentality. After presenting the state of research to date and the motivation for the choice of the topic, the biographies of the individual nuncios are first presented, with particular reference specifically to their mission at Rudolph's court. The main source for the treatment was the correspondence between Rome and the individual nuncios. These activities of the nuncios are then presented in the context of the development of the Catholic Church, especially with regard to the evolving understanding of the papal office and the concept of Christianity as a religion. The countries of the Bohemian Crown had a specific position in this respect, since after the Hussite Wars, two religious parties/confessions coexisted in them: under both and under one. Compared to the rest of Europe, therefore, a sometimes more, sometimes less peaceful religious coexistence developed there after a period of conflict. Based on a study of the texts of two of the nuncios who held office during the period under review (Germanico Malaspina and Cesare Speciano), the dissertation then addresses the question of tolerance and... Keywords: katolická církev|raný novověk|papežství|nunciové|ragion di stato|náboženská tolerance; Catholic Church|early modern period|papacy|nuncios|ragion di stato|religious tolerance Available in a digital repository NRGL The Apostolic Nuncios in Prague during the first years of the reign of Rudolf II. and their importance for the society of the Lands of the Bohemian Crown (1578-1594)

Disertační práce se zabývá působením apoštolských nunciů na dvoře Rudolfa II. v letech 1578- 1594. Zaměřuje se především na to, jaký měli nunciové v tomto kontextu reálný vliv, jaké byly jejich ...

Banďouch, Pavel; Mikulec, Jiří; Knoz, Tomáš; Černušák, Tomáš
Univerzita Karlova, 2024

The Lands of Bohemian Crown in the political conception of Wenceslaus IV. Bohemia
Dufková, Tereza; Bobková, Lenka; Čapský, Martin; Holá, Mlada
2024 - Czech Předkládaná disertační práce se zaměřuje na jeden z dílčích aspektů vlády českého krále Václava IV., a to na jeho panování nad tzv. vedlejšími zeměmi České koruny. Tato perspektiva doposud stála stranou zájmu historiků. Práce si klade za cíl zhodnotit, jak se král dokázal vyrovnat s rozsáhlým dědictvím po svých předcích, jaké vládní strategie k tomu mohl využít a jaké problémy musel v korunních zemích řešit. Takto zvolená perspektiva umožnila přinést ucelený pohled na jeden z dílčích segmentů Václavovy vlády, což může v budoucnu významně přispět k jejímu celkovému zhodnocení. Z analýzy vyplynulo několik obecných kategorií (mocenská politika, majetkové a lenní záležitosti, finanční politika, hospodaření a obchod, církevní politika, královská správa a panovnická reprezentace), které doložily široký záběr panovníkových povinností a vladařských možností. Na základě provedeného výzkumu je patrné, že Václavova politika a výkon vlády ve vedlejších zemích byly v souladu s politikou jeho předchůdců a král svým způsobem vlády v podstatě nevybočoval ze zažitých zvyklostí, což narušuje tradiční obraz jeho panování v českých zemích. Součástí práce je také katalog písemností, které král vydal pro jednotlivé korunní země, kde se podařilo nashromáždit celkem 611 položek. Jedná se o jeden z prvních pokusů o... The PhD. thesis focuses on one of the partial aspects of the reign of the Bohemian king Wenceslaus IV, namely his rule over the so-called Crown lands of the Bohemian Crown. This perspective has so far remained outside the interest of historians. This thesis aims to assess how the king was able to cope with the extensive inheritance from his ancestors, what governmental strategies he could use to do so, and what problems he had to solve in the crown lands. This perspective has made it possible to provide a comprehensive view of one of the sub-segments of Wenceslaus' reign, which may contribute significantly to its overall evaluation in the future. Several general categories emerged from the analysis (power politics, property and fief affairs, financial policy, economy and trade, ecclesiastical policy, royal administration, and monarchical representation), demonstrating the wide range of the monarch's duties and monarchical possibilities. Based on the research conducted, it is evident that Wenceslaus' policies and exercise of government in the crown lands were in line with those of his predecessors, and the king's manner of rule did not substantially deviate from established practices, which contradicts the traditional image of his reign in the Bohemian lands. The thesis also includes a catalogue of... Keywords: Václav IV.|Lucemburkové|14. století|15. století|Česká koruna|vedlejší země České koruny|korunní země|panovnická reprezentace|konflikty|koexistence|kooperace|církevní politika|hospodářská politika|finanční politika|vláda středověkého panovníka|adventus regis|holdovací cesta; Wenceslaus IV|the Luxembourgs|14th century|15th century|Bohemian Crown|lands of the Bohemian Crown|crown lands|monarchical representation|conflicts|coexistence|cooperation|ecclesiasticial policy|economic policy|financial policy|rule of a medieval monarch|adventus regis|homage journey Available in a digital repository NRGL The Lands of Bohemian Crown in the political conception of Wenceslaus IV. Bohemia

Předkládaná disertační práce se zaměřuje na jeden z dílčích aspektů vlády českého krále Václava IV., a to na jeho panování nad tzv. vedlejšími zeměmi České koruny. Tato perspektiva doposud stála ...

Dufková, Tereza; Bobková, Lenka; Čapský, Martin; Holá, Mlada
Univerzita Karlova, 2024

Kombinovaný výpočet přesnosti v numerické lineární algebře
Oktay, Eda; Carson, Erin Claire; Buttari, Alfredo; Šístek, Jakub
2024 - English Keywords: mixed-precision|sparse solvers|stability|finite precision|multiprecision|numerical linear algebra; mixed-precision|sparse solvers|stability|finite precision|multiprecision|numerical linear algebra Available in a digital repository NRGL Kombinovaný výpočet přesnosti v numerické lineární algebře

Oktay, Eda; Carson, Erin Claire; Buttari, Alfredo; Šístek, Jakub
Univerzita Karlova, 2024

Peripheral (somatic and autonomic) nervous system and its dysfunction in patients with Crohn's disease
Wasserbauer, Martin; Keil, Radan; Zádorová, Zdeňka; Dolina, Jiří
2024 - Czech Periferní (somatický i autonomní) nervový systém a jeho dysfunkce u pacientů s Crohnovou chorobou Abstrakt Hlavním cílem naší práce bylo prokázat přítomnost periferní somatické a autonomní neuropatie u pacientů s těžkou Crohnovou chorobou na biologické léčbě anti-TNFα a nalézt rizikové faktory mající patofyziologickou souvislost s jejím rozvojem. Vyšetřovali jsme 30 neurologicky asymptomatických pacientů s těžkou Crohnovou chorobou na biologické léčbě preparáty anti-TNFα. U všech probandů jsme provedli zhodnocení anamnestických dat, laboratorní odběry, klinické vyšetření zaměřené na detekci periferní senzo-motorické nervové dysfunkce a autonomní nervové dysfunkce (pomocí Ewingovy baterie testů a spektrální analýzy variability srdeční frekvence), Sudoscan a dotazníkové šetření (dotazník kvality života, dotazník periferní senzo-motorické neuropatie a dotazník autonomní neuropatie). Periferní senzo-motorická neuropatie byla přítomna u 36,7 % pacientů. Byly prokázány statisticky významné asociace mezi testem vibračního čití a věkem, délkou trvání Crohnovy choroby, délkou podávání biologické léčby, indexem tělesné hmotnosti a indexem aktivity Crohnovy choroby. Statisticky významné asociace byly prokázány i mezi testem percepce teploty a věkem a BMI. Patologický výsledek Sudoscan testu byl přítomný u 33,3 %... Peripheral (somatic and autonomic) nervous system and its dysfunction in patients with Crohn's disease Abstract The main aim of our study was to demonstrate the presence of peripheral somatic and autonomic neuropathy in patients with severe Crohn's disease on anti-TNFα biological therapy and to find risk factors pathophysiologically related to its development. We investigated 30 neurologically asymptomatic outpatients with severe Crohn's disease on biological treatment with anti-TNFα agents. In all probands, we performed an evaluation of anamnestic data, laboratory sampling, clinical examination aimed at detecting peripheral sensory-motor nerve dysfunction and autonomic nerve dysfunction (using the Ewing battery tests and spectral analysis of heart rate variability), Sudoscan and questionnaire investigation (quality of life questionnaire, peripheral sensory-motor neuropathy questionnaire and autonomic neuropathy questionnaire). Peripheral sensory-motor neuropathy was present in 36.7 % patients. There were statistically significant associations between vibration perception test and age, duration of Crohn's disease and biologic therapy, body mass index, and Crohn's disease activity index. Statistically significant associations between temperature perception test and age and BMI were proved as well.... Keywords: Idiopatický střevní zánět; Crohnova choroba; Periferní somatická neuropatie; Periferní autonomní neuropatie; Biologická léčba; Inflammatory Bowel disease; Crohn's disease; Peripheral somatic neuropathy; Peripheral autonomic neuropathy; Biological therapy Available in a digital repository NRGL Peripheral (somatic and autonomic) nervous system and its dysfunction in patients with Crohn's disease

Periferní (somatický i autonomní) nervový systém a jeho dysfunkce u pacientů s Crohnovou chorobou Abstrakt Hlavním cílem naší práce bylo prokázat přítomnost periferní somatické a autonomní neuropatie ...

Wasserbauer, Martin; Keil, Radan; Zádorová, Zdeňka; Dolina, Jiří
Univerzita Karlova, 2024

Charakterizace biofilmu Pseudomonas syringae a jeho interakcí s antibakteriálními látkami - biofyzikální přístupy
Budil, Jakub; Lišková, Petra; Mackuľak, Tomáš; Viktorová, Jitka
2024 - English 3 Abstrakt Cílem této práce je využití techniky zeslabeného úplného odrazu (Attenuated Total Reflectance, ATR) u infračervené spektroskopie s Fourierovou transformací (FT-IR) k analýze tvorby in vitro biofilmu Pseudomonas syringae v průtokové komoře a jeho následné interakce s antibakteriálními látkami. Na základě naměřených ATR spekter v kombinaci s analýzou struktury biofilmu prostřednictvím světelné a fluorescenční mikroskopie jsem navrhl model vývoje biofilmu Pseudomonas syringae patovar morsprunorum CCM 2534 v průtokové komoře s 2% Luria-Bertani (LB) komplexním médiem. V tomto modelu je rozlišena počáteční kolonizace ZnSe hranolu (adheze) a následný oplach volně uchycených bakterií v důsledku výměny inokulační suspenze za čerstvé 2% LB médium, na který navazuje krátká perioda znovuosídlení uvolněného prostoru na substrátu. Následuje restrukturace biofilmu, kdy pohyblivá část populace Pseudomonas syringae migruje na vršek raných mikrokolonií, kde je vyšší dostupnost živin včetně kyslíku. Poslední fází je maturace biofilmu Pseudomonas syringae, která již probíhá převážně mimo dosah ATR FT-IR techniky a vede ke tvorbě mohutných mikrokolonií ve tvaru houbiček. V této práci jsem také zkoumal změny ve vývoji biofilmu Pseudomonas syringae za modelových podmínek (inokulace usmrcenými bakteriemi, inokulace... 4 Abstract The objectives of this thesis are the application of Attenuated Total Reflectance Fourier Transform Infrared (ATR FT-IR) spectroscopy for the analysis of Pseudomonas syringae biofilms grown in a flow cell and its subsequent interaction with antibacterial agents. Based on the combination of the recorded ATR spectra with the biofilm morphology analysis via light and fluorescent microscopy, I suggested a model for the development of Pseudomonas syringae pathovar morsprunorum CCM 2534 biofilm in a flow cell with 2% Luria-Bertani (LB) complex medium. This model consists of the initial colonization of the ZnSe prism (adhesion), subsequent washing of weakly attached cells due to the replacement of the inoculation suspension with the fresh 2% LB medium, which is followed by a brief substrate recolonization phase. Subsequently, the biofilm undergoes a restructuration with a motile subpopulation of Pseudomonas syringae migrating on top of already existing early microcolonies, where the availability of nutrients including oxygen is higher. The last developmental stage, a maturation of Pseudomonas syringae biofilms, is occurring predominantly outside the ATR FT-IR detection range and leads to a formation of large mushroom-shaped microcolonies. I also investigated the changes to the development of Pseudomonas... Keywords: Biofilm; Pseudomonas syringae; FT-IR spektroskopie; antibakteriální látky; Biofilm; Pseudomonas syringae; FT-IR spectroscopy; antibacterial agents Available in a digital repository NRGL Charakterizace biofilmu Pseudomonas syringae a jeho interakcí s antibakteriálními látkami - biofyzikální přístupy

3 Abstrakt Cílem této práce je využití techniky zeslabeného úplného odrazu (Attenuated Total Reflectance, ATR) u infračervené spektroskopie s Fourierovou transformací (FT-IR) k analýze tvorby in vitro ...

Budil, Jakub; Lišková, Petra; Mackuľak, Tomáš; Viktorová, Jitka
Univerzita Karlova, 2024

Epitranskriptomika a kardioprotektivní intervence
Benák, Daniel; Hlaváčková, Markéta; Štengl, Milan; Bohuslavová, Romana
2024 - English 1 Ischemická choroba srdeční je celosvětově nejčastější příčinou úmrtí. Ischemie myokardu vede k poškození kardiomyocytů, což může vést k poruše srdeční funkce. Rozsah ischemického poškození však závisí nejen na intenzitě a délce trvání ischemického podnětu, ale také na toleranci srdce vůči ischemii. Objasnění molekulárního pozadí kardioprotektivních intervencí, jako je adaptace na chronickou hypoxii nebo hladovění, tak nabývá zásadního významu. Proto jsme se zaměřili na nové epitranskriptomické regulace dvou rozšířených modifikací RNA - N6 -methyladenosinu (m6 A) a N6 ,2'- O-dimethyladenosinu (m6 Am). Zjistili jsme, že většina epitranskriptomických regulátorů v srdci reaguje na hypoxickou adaptaci a na hladovění odlišným způsobem, demetylázy (ALKBH5 a FTO) byly ale v obou případech zvýšeny. Po hladovění bylo navíc v srdci patrné znatelné snížení hladin celkové metylace RNA. Hladina metylace v transkriptech Nox4 a Hdac1, které se účastní cytoprotektivních drah spouštěných ketolátkami, ale byla naopak zvýšena. V neposlední řadě, inhibice epitranskriptomických demetyláz ALKBH5 a FTO vedla ke snížení hypoxické tolerance kardiomyocytů izolovaných z hladovějících potkanů. Celkově naše zjištění ukazují na regulaci epitranskriptomických modifikací m6 A a m6 Am při kardioprotektivních intervencích, jako je adaptace... 1 Ischemic heart disease stands as the foremost global cause of mortality. Myocardial ischemia results in damage to cardiomyocytes which can further lead to impaired heart function. However, the extent of ischemic injury hinges not only on the intensity and duration of the ischemic stimulus but also on cardiac tolerance to ischemia. Therefore, it is extremely important to unravel the molecular basis of cardioprotective interventions such as adaptation to chronic hypoxia or fasting. We focused on the novel epitranscriptomic mechanisms around RNA modifications - N6 -methyladenosine (m6 A) and N6 ,2'-O-dimethyladenosine (m6 Am). Our findings revealed that while most epitranscriptomic modifiers displayed differential regulation in the heart following hypoxic adaptation and fasting, demethylases (ALKBH5 and FTO) were consistently upregulated after these cardioprotective interventions. Furthermore, we detected a discernible reduction in cardiac total RNA methylation levels after fasting. On the contrary, transcripts Nox4 and Hdac1, both of which play a role in the cytoprotective action of ketone bodies, exhibited increased methylation in hearts of fasting rats. Finally, inhibition of epitranscriptomic demethylases ALKBH5 and FTO decreased the hypoxic tolerance of adult rat primary cardiomyocytes isolated from... Keywords: epitranskriptomika; m6A; m6Am; FTO; ALKBH5; kardioprotektivní intervence; srdce; epitranscriptomics; m6A; m6Am; FTO; ALKBH5; cardioprotective interventions; heart Available in a digital repository NRGL Epitranskriptomika a kardioprotektivní intervence

1 Ischemická choroba srdeční je celosvětově nejčastější příčinou úmrtí. Ischemie myokardu vede k poškození kardiomyocytů, což může vést k poruše srdeční funkce. Rozsah ischemického poškození však ...

Benák, Daniel; Hlaváčková, Markéta; Štengl, Milan; Bohuslavová, Romana
Univerzita Karlova, 2024