Used filters (2)  Zrušit všechna omezení
Number of found documents: 432872
Published from to

Role of tissue-specific expression of the ISWI protein Smarca5/Snf2h in murine hematopoiesis.
Turková, Tereza; Stopka, Tomáš; Forejt, Jiří; Mráz, Marek
2024 - Czech
Proces diferenciace krvetvorných buněk je závislý na chromatin-remodelační aktivitě ISWI ATPázy SMARCA5 (SNF2H) a jejích komplexů. Pro studium funkcí této ATPázy jsme v naší laboratoři vyvinuli řadu myších modelů, počínaje modelem s konstitutivní delecí genu Smarca5 a na něj navazujícími modely s kondicionální delecí tohoto genu v závislosti na tkáňově specificky exprimované Cre rekombináze (zejména v různých stádiích krvetvorby). Závažnost fenotypových projevů u myších modelů se různí od brzké embryonální letality konstitutivního delečního modelu, přes fetální letalitu spojenou se selháním erytropoézy (Vav1iCre model - delece v definitivním hematopoetickém progenitoru) až po poruchy lymfopoézy neomezující přežití zvířat (hCD2iCre model - delece v T a B lymfocytech) u kondicionálně delečních modelů. Tato práce navazuje na pozorování získaná při studiu delečních modelů genu Smarca5, tedy že delece vede k zástavě dělení buněk a jejich vstupu do apoptózy. Defekty byly pozorovány už ve stádiu kmenových buněk a hematopoetických progenitorů, které nebyly schopné vstoupit do procesu diferenciace v nepřítomnosti SMARCA5 proteinu. V těchto modelech kvůli tomu nebylo možné studovat průběh diferenciace. Proto jsme se rozhodli vytvořit nový myší model s hypomorfní (exprimující nižší množství proteinu)... The process of cell differentiation is dependent on the chromatin-remodeling activity of the ISWI ATPase SMARCA5 (SNF2H) and its complexes. A series of mouse models have been used to study the functions of this ATPase, starting with a model with constitutive deletion of the Smarca5 gene and followed by models with tissue-specific deletion of Smarca5 gene (especially at different stages of hematopoiesis). The severity of phenotypic manifestations in mouse models varies from early embryonic lethality in the constitutive deletion model, through fetal lethality associated with erythropoiesis failure (Vav1iCre model - deletion in the definitive hematopoietic progenitor) to lymphopoiesis defects that do not limit animal survival (hCD2iCre model - deletion in T and B lymphocytes) in conditional deletion models. This work builds on the observations obtained in the study of deletion models of this Smarca5 gene, i.e. that deletion leads to arrest of cell proliferation and their entry into apoptosis. Defects were observed already at the stem cell and hematopoietic progenitor stages, which were unable to enter the differentiation process in the absence of the SMARCA5 protein. In these models, it was not possible to study the progression of differentiation because of this reason. Therefore, we decided to create... Keywords: chromatin; Snf2h; Smarca5; ATPáza; myší model; krvetvorba; kmenové buňky; multipotentní progenitory; chromatin; Snf2h; Smarca5; ATPase; mouse model; hematopoiesis; stem cells; multipotent progenitors Available in a digital repository NRGL
Role of tissue-specific expression of the ISWI protein Smarca5/Snf2h in murine hematopoiesis.

Proces diferenciace krvetvorných buněk je závislý na chromatin-remodelační aktivitě ISWI ATPázy SMARCA5 (SNF2H) a jejích komplexů. Pro studium funkcí této ATPázy jsme v naší laboratoři vyvinuli řadu ...

Turková, Tereza; Stopka, Tomáš; Forejt, Jiří; Mráz, Marek
Univerzita Karlova, 2024

Efficacy of the unimodal physiotherapy intervention Running Gait Retraining in the treatment of runners' iliotibial band syndrome - a systematic review
Stehlíková, Alžběta; Pavlů, Dagmar; Reckziegelová, Petra
2024 - Czech
Název: Efektivita unimodální fyzioterapeutické intervence Running Gait Retraining v léčbě syndromu iliotibiálního traktu u běžců - systematický přehled Cíle: Cílem této práce je vyhodnotit, zda je unimodální fyzioterapeutická intervence running gait retraining efektivní v léčbě syndromu iliotibiálního traktu u běžců. Metody: Tato diplomová práce byla realizovaná formou systematického přehledu. Studie byly vyhledávány v období od prosince 2023 do ledna 2024 v následujících elektronických databázích: PubMed, SCOPUS, SPORTDiscus, Web of Science. Vyhledané studie splňující stanovená kritéria byly následně analyzovány za účelem zodpovězení výzkumné otázky, zda je možné využít running gait retraining v léčbě syndromu iliotibiálního traktu u běžců jako samostatnou modalitu. Výsledky: Na základě stanovených kritérií byla k analýze zařazena 1 studie (experimentální případová studie), jejíž výsledky naznačují, že running gait retraining jako unimodální fyzioterapeutická intervence v léčbě syndromu iliotibiálního traktu může představovat efektivní terapeutický přístup. S ohledem na nízkou úroveň evidence zahrnuté studie však výsledky nelze generalizovat. Efektivitu tohoto přístupu je v budoucnu potřeba hodnotit na podkladě experimentálních studií většího rozsahu a vyšší metodologické kvality. Do té doby... Title: Efficacy of the unimodal physiotherapy intervention Running Gait Retraining in the treatment of runners' iliotibial band syndrome - a systematic review Objectives: The aim of the thesis is to evaluate whether the unimodal physiotherapy intervention running gait retraining is an efficacious treatment of the iliotibial band syndrome in runners. Methods: The thesis was carried out in the form of a systematic review. Eligible studies were searched for in the following electronic databases from December 2023 to January 2024: PubMed, SCOPUS, SPORTDiscus, Web of Science. Selected studies which met the specified inclusion criteria were then analysed to answer the research question, i.e. whether it is efficacious to use running gait retraining only to treat runners with iliotibial band syndrome. Results: Only 1 study met the inclusion criteria (an experimental case study), the results of which suggest that running gait retraining used as a unimodal physiotherapy intervention in the treatment of the runners' iliotibial band syndrome might be an efficacious therapeutic approach. Considering the low-level evidence of the included study, however, the results cannot be generalized. In the future, the efficacy of this treatment approach needs to be evaluated on the basis of a larger scale research of a... Keywords: syndrom iliotibiálního traktu; běžecká zranění z přetížení; running gait retraining; fyzioterapie; biomechanika; iliotibial band syndrome; running gait retraining; running related injury; physiotherapy; biomechanics Available in a digital repository NRGL
Efficacy of the unimodal physiotherapy intervention Running Gait Retraining in the treatment of runners' iliotibial band syndrome - a systematic review

Název: Efektivita unimodální fyzioterapeutické intervence Running Gait Retraining v léčbě syndromu iliotibiálního traktu u běžců - systematický přehled Cíle: Cílem této práce je vyhodnotit, zda je ...

Stehlíková, Alžběta; Pavlů, Dagmar; Reckziegelová, Petra
Univerzita Karlova, 2024

Neenzymatické role kináz a fosfatáz na příkladu MTMR9 a AAK1
Knop, Filip; Macůrková, Marie; Harnoš, Jakub; Soukup, Vladimír
2024 - English
Enzymatické role kináz a fosfatáz v regulaci buněčných procesů byly popsány na mnoha příkladech. V posledních letech se objevuje rostoucí počet případů postradatelnosti katalytické aktivity těchto enzymů. Tato práce se soustředí na dva konkrétní proteiny, savčí MTMR9 a SEL-5/AAK1 v háďátku obecném. MTMR9 z rodiny lipidových fosfatáz příbuzných myotubularinu (MTMR) patří do skupiny pseudofosfatáz, které jsou charakteristické nepřítomností enzymatické aktivity. Na druhou stranu, SEL-5/AAK1 je typickou aktivní kinázou s nejméně dvěma známými substráty. Podařilo se nám zjistit důležitost MTMR9 v časné sekretorní dráze buňky, kde kolokalizuje s markery intermediálního kompartmentu mezi endosomálním retikulem a Golgiho aparátem (ERGIC). Dále jsme identifikovali několik možných interakčních partnerů, například RAB1 a MTMR6, jejíchž lokalizaci a/nebo aktivitu by mohla vazba na MTMR9 regulovat. Změna úrovně MTMR9 způsobila narušení WNT3A sekrece a následně vedla k redukci aktivity Wntové signální dráhy. Pro SEL-5/AAK1 se nám podařilo identifikovat dva procesy, oba taktéž regulované Wntovou signální dráhou, které jsou důležité ve vývoji háďátka obecného. Jednak je SEL-5 společně s několika členy retromerového komplexu zodpovědný za regulaci správné QL.d migrace, a jednak SEL-5 reguluje růst exkretorních... Enzymatic roles of kinases and phosphatases in almost every aspect of cellular life are well described in a wide variety of examples. Lately the role of the same proteins independent of their catalytic activity is being increasingly appreciated. In this work, we focus on two proteins, mammalian MTMR9, and Caenorhabditis elegans SEL-5/AAK1. MTMR9 belongs to the myotubularin-related family of lipid phosphatases (MTMR) and is known to be a pseudophosphatase, a catalytically inactive member of the MTMR group. SEL-5/AAK1, on the other hand, is characterized by its kinase activity with at least two putative substrates identified so far. We described the localization of MTMR9 to early secretory pathway and its colocalization with known ER-to-GA compartment (ERGIC) markers. We also identified several possible MTMR9-interacting partners, such as RAB1 and MTMR6, whose localization and/or activity could be potentially regulated by MTMR9 binding. Disruption of proper MTMR9 levels led to an alteration in WNT3A secretion and subsequently to a reduced activity of the Wnt signaling pathway. Similarly, we identified SEL-5/AAK1 role in two separate Wnt-regulated developmental processes in C. elegans. Firstly, SEL-5 along with other members of the retromer complex regulate a proper QL.d migration. Secondly, excretory... Keywords: kináza; fosfatáza; MTMR9; AAK1; SEL-5; Wnt signální dráha; Caenorhabditis elegans; kinase; phosphatase; MTMR9; AAK1; SEL-5; Wnt signalling; Caenorhabditis elegans Available in a digital repository NRGL
Neenzymatické role kináz a fosfatáz na příkladu MTMR9 a AAK1

Enzymatické role kináz a fosfatáz v regulaci buněčných procesů byly popsány na mnoha příkladech. V posledních letech se objevuje rostoucí počet případů postradatelnosti katalytické aktivity těchto ...

Knop, Filip; Macůrková, Marie; Harnoš, Jakub; Soukup, Vladimír
Univerzita Karlova, 2024

Invasive zooplankton species in Europe and factors influencing their occurence
Klečková, Barbora; Sacherová, Veronika; Šorf, Michal
2024 - Czech
V Evropě se nachází přinejmenším 8 invazních druhů sladkovodního zooplanktonu: vířníci Kellicottia bostoniensis (Rousselet, 1908) a Lecane decipiens (Murray, 1913), klanonožci Acanthocyclops americanus (Marsh, 1892), Boeckella triarticulata (Thomson, 1883) a Skistodiaptomus pallidus (Herrick, 1879) a perloočky Pleuroxus denticulatus Birge, 1879, Daphnia ambigua Scourfield, 1946 a Daphnia parvula Fordyce, 1901. Tyto invazní druhy musejí v nepůvodním prostředí čelit různým kombinacím faktorů které mohou ovlivňovat jejich výskyt a jejich přítomnost má v některých případech negativní dopady na nativní společenstva. Pro Evropu se zdá nejvýznamnější invaze druhů ze Severní Ameriky. První část práce shrnuje poznatky o těchto 8 druzích a faktorech, které se zdají být limitující v jejich výskytu. Mezi nejlépe prozkoumané invazní druhy v Evropě se řadí Daphnia ambigua a Daphnia parvula, jejichž výskyt byl v České republice hojně zkoumánna přelomu21. století.Druhá část této práce proto také podrobně zkoumá poznatky o faktorech, které mohou hrát výraznou roli při osidlování vod těmito druhy ve střední Evropě. Klíčová slova: evropské invazní druhy zooplanktonu, biotické faktory, abiotické faktory, sladkovodní zooplankton, invaze In Europe, there are at least 8 invasive species of freshwater zooplankton: rotifers Kellicottia bostoniensis (Rousselet, 1908) and Lecane decipiens (Murray, 1913), copepods Acanthocyclops americanus (Marsh, 1892), Boeckella triarticulata (Thomson, 1883) and Skistodiaptomus pallidus (Herrick,1879), and cladocerans Pleuroxus denticulatus Birge, 1879, Daphnia ambigua Scourfield, 1946 and Daphnia parvula Fordyce, 1901. These invasive species must face various combinations of factors in non-native environments, which can influence their occurrence,andtheir presence canhave negative impacts onnative communities in some cases. The most significant invasions seem to be those of species from North America. The first part of this work summarizes knowledge about these 8 species, mainly about the factors that appear to be limiting their occurrence. Among the best-studied invasive species in Europe are cladocerans Daphnia ambigua and Daphnia parvula, whose presence has been extensively studied in the Czech Republic at the turn of the 21st century. Therefore, the second part of this work also thoroughly examines the factors that may play a significant role in the colonization of waters by these species in Central Europe. Key words: European invasive zooplankton species, biotic factors, abiotic factors,... Keywords: evropské invazní druhy zooplanktonu; biotické faktory; abiotické faktory; sladkovodní zooplankton; invaze; European invasive zooplankton species; biotic factors; abiotic factors; freshwater zooplankton; invasion Available in a digital repository NRGL
Invasive zooplankton species in Europe and factors influencing their occurence

V Evropě se nachází přinejmenším 8 invazních druhů sladkovodního zooplanktonu: vířníci Kellicottia bostoniensis (Rousselet, 1908) a Lecane decipiens (Murray, 1913), klanonožci Acanthocyclops ...

Klečková, Barbora; Sacherová, Veronika; Šorf, Michal
Univerzita Karlova, 2024

Adaptace vodního hmyzu vůči rybí predaci
Chawner, Adam Mark; Černý, Martin; Jor, Tomáš
2024 - English
v češtině Tato bakalářská práce je rešerší dostupných zdrojů o adaptacích vodního hmyzu vůči rybí predaci během všech fází jejich vývoje. Vzhledem k tomu, že je vodní hmyz velká skupina často si nepodobných druhů, je vodní hmyz jako takový na úvod této práce představen, včetně prostředí, ve kterém žije. Ryby jsou jedny z nejdůležitějších a nejčastějších predátorů vodního hmyzu a mají velký dopad na jejich život, proto si vodní hmyz během své evoluce vyvinul mechanismy sloužící k obraně. Tato práce identifikuje širokou škálu obranných mechanismů vodního hmyzu jako jsou úpravy vzorců chování vlivem predátorů, vývin pokročilých morfologických obranných struktur, syntéza obranných chemických látek nebo změny v časování důležitých momentů vývoje určených k zmenšení vlivu rybí predace. Vliv rybích predátorů na vodní hmyz je nejčastěji v larválním stádiu, ale u několika řádů podléhají predaci i ve vodě žijící dospělci. Jedná se zejména o vodní zástupce Coleoptera, u kterých jsou popsány velmi sofistikované způsoby, kterými se chrání před rybami. Ovipozice je v této práci zmíněna jako možná strategie, jak zmírnit vliv rybí predace ještě před vylíhnutím larev. Jak využít rybí predace k přirozené kontrole populací larev komárů ve světe je popsáno, shrnuto a zhodnoceno. Klíčová slova: vodní hmyz, rybí... in English In this thesis, I review how aquatic insects have adapted to fish predation in various habitats during all phases of their life cycles. Aquatic insects are a large group of heterogeneous species and this review introduces these orders and species, including the environments they inhabit. Fish are some of the most common and most impactful predators of aquatic insects and this thesis identifies a wide range of behavioural, morphological, chemical and life history defence mechanisms of various complexity and uniqueness aquatic insect orders have developed to counter fish predation. Most aquatic insects are subject to predation during their aquatic larval stage. A few orders also inhabit the water as adults, as is the case most notably for aquatic Coleoptera. More complex adaptations to fish predation are presented in this order. Oviposition is noted as a strategy used to negate fish predation even before individuals hatch. The use of fish predation as means to control mosquito larvae communities is presented and reviewed. Keywords: aquatic insects, fish predation, defence mechanisms, adaptation to predation Keywords: vodní hmyz; rybí predace; obranné mechanismy; adaptace vůči predaci; aquatic insects; fish predation; defence mechanisms; adaptation to predation Available in a digital repository NRGL
Adaptace vodního hmyzu vůči rybí predaci

v češtině Tato bakalářská práce je rešerší dostupných zdrojů o adaptacích vodního hmyzu vůči rybí predaci během všech fází jejich vývoje. Vzhledem k tomu, že je vodní hmyz velká skupina často si ...

Chawner, Adam Mark; Černý, Martin; Jor, Tomáš
Univerzita Karlova, 2024

Influence of ants on soil chemistry across biomes
Kostečka, Luboš; Frouz, Jan; Jílková, Veronika
2024 - Czech
Mravenci patří mezi významné ekosystémové inženýry. Jejich aktivita má přímý i nepřímý vliv na půdní chemismus uvnitř jejich hnízd skrze různé procesy, například bioturbaci nebo akumulaci potravy a její rozklad mikrobiální komunitou. Tyto procesy závisí na podmínkách prostředí, například na půdních vlastnostech nebo klimatu na daném stanovišti. Přesto zatím nebyl vliv mravenců porovnán mezi různými biomy. Cílem této práce je proto (1) popsat procesy, jimiž mravenci ovlivňují půdní chemismus, (2) shrnout výsledný vliv na chemické půdní vlastnosti jako koncentrace živin a úroveň pH v mraveništích a okolní půdě, (3) zjistit, zdali existuje trend společný všem biomům, či zdali se od sebe vlivy v různých biomech liší. Závěrem této práce je, že společný trend sice existuje, ale velmi závisí na podmínkách jako je struktura mraveniště, potravní strategie konkrétního druhu a klima daného ekosystému. Klíčová slova: mravenci, půda, půdní chemismus, biomy, hnízda, bioturbace, potravní strategie, makroprvky, pH, podmínky prostředí, klima Ants are important ecosystem engineers. Their activity has direct and indirect influence on soil chemistry inside their nest through processes such as bioturbation or accumulation of organic matter and its decomposition by the microbial community. These processes depend on environmental conditions such as soil properties and climate. However, there has not yet been a comparison of this influence on soil chemistry across different biomes. The aim of this thesis is therefore (1) describe the processes through which ants influence soil chemistry (2) summarize the resulting influence on soil properties such as the concentration of nutrients and the pH level in the ant nests and the surrounding soil (3) find out whether there is a common trend to these influences across biomes, or if every biome has its own specific trend. The findings of this thesis point to the conclusion that while there is a common trend across biomes, it heavily depends on conditions such as nest structure, feeding strategy of a particular species and the climatic conditions of the given ecosystem. Key words: ants, soil, soil chemistry, biomes, nests, bioturbation, feeding strategy, macronutrients, pH, environmental conditions, climate Keywords: mravenci; půda; půdní chemismus; biomy; hnízda; bioturbace; potravní strategie; makroprvky; pH; podmínky prostředí; klima; ants; soil; soil chemistry; biomes; nests; bioturbation; feeding strategy; macronutrients; pH; environmental conditions; climate Available in a digital repository NRGL
Influence of ants on soil chemistry across biomes

Mravenci patří mezi významné ekosystémové inženýry. Jejich aktivita má přímý i nepřímý vliv na půdní chemismus uvnitř jejich hnízd skrze různé procesy, například bioturbaci nebo akumulaci potravy a ...

Kostečka, Luboš; Frouz, Jan; Jílková, Veronika
Univerzita Karlova, 2024

3D models of rock relief based on various data
Pecáková, Kateřina; Hartvich, Filip; Jelének, Jan
2024 - Czech
Tvorba digitálních modelů terénu, respektive povrchu je metoda, která se stává díky rozvoji technologií a možnostem zpracování velkých objemů dat, čím dál častěji využívanou. Metodou, která výrazně usnadňuje sběr dat je UAV mapování a následná tvorba digitálního modelu metodou structure from motion (SfM). Druhou využívanou metodou je Laserové skenování pomocí pozemního LiDARu (TLS). Zmíněné metody nachází své uplatnění zejména v oblasti geomorfologie a fyzické geografie. Práce si klade za cíl vytvořit digitální modely z těchto metod, vzájemně je porovnat a zhodnotit. Zpracování probíhalo v prostředí programu Agisoft Metashape pro a CloudCompare. Dále byl zkoumán vliv využití georeferenčních bodů na kvalitu a přesnost modelů. Na závěr bylo provedeno porovnání jednotlivých metod z hlediska parametrů časových, cenových, flexibility dat, vlivu prostředí a další. Součástí práce bylo rovněž zkoumat možnosti podrobného digitálního modelu na získávání sekundárních informací, jako jsou sklony a směry strukturních ploch a puklin, využívané mimo jiné kvůli prevenci potenciálního skalního řícení. Výsledky práce naznačují, že využití UAV je pro geomorfologické úkazy vhodné, ne-li nejlepší možností s ohledem na rychlost, ekonomické hledisko a přesnost dat. Využití georeferenčních bodů sice zlepšuje výslednou... The use of digital elevation models is becoming increasingly used as a scientific method, thanks to the advancement of technologies and public accessibility, particularly in the fields of geomorphology and physical geography. The use of UAV significantly facilitates data collection and subsequent creation of a digital model through the structure from motion (SfM) process. Another data collection method employed in the research is the laser scanning using terrestrial laser scanner (TLS). The aim of the study is to create digital models using these methods and to compare them using the software environment of Agisoft Metashape and CloudCompare software. Additionally, it investigates the influence of georeferencing points on the quality and accuracy of the models. Furthermore, a comparison of the individual methods is conducted based on such parameters as time, costs, data flexibility, environmental impact, and others. The study also seeks to determine the influence of the digital model parameters on obtaining secondary information from the DEMs, such as slope azimuth and geometry of structural planes and joints, used for example in the research of the prevention of potential rockfalls. The results indicate that the use of UAVs is suitable, if not the best option, for geomorphological features in... Keywords: 3D model; skalní reliéf; skalní řícení; SfM; UAV; pozemní LiDAR; 3D model; rock relief; rockfall; SfM; UAV; TLS Available in a digital repository NRGL
3D models of rock relief based on various data

Tvorba digitálních modelů terénu, respektive povrchu je metoda, která se stává díky rozvoji technologií a možnostem zpracování velkých objemů dat, čím dál častěji využívanou. Metodou, která výrazně ...

Pecáková, Kateřina; Hartvich, Filip; Jelének, Jan
Univerzita Karlova, 2024

Development of neural crest cells in zebrafish Danio rerio
Psutková, Viktorie; Machoň, Ondřej; Fabian, Peter; Svoboda, Ondřej
2024 - Czech
Neurální lišta je populace volně migrujících buněk, kterou najdeme pouze u obratlovců. Buňky neurální lišty migrují do hlavové, srdeční a trupové oblasti těla, kde se přeměňují v různé buněčné typy. V případě hlavové neurální lišty se buňky diferencují mimo jiné i do chondrocytů a tenocytů. Právě tato unikátní vlastnost hlavové neurální lišty přinesla obratlovců evoluční novinku, lebku. V této práci se zaměřuje na vývoj hlavové neurální lišty a derivátů z ní odvozených u dánia pruhovaného (Danio rerio). Proudy hlavové neurální lišty se během migrace řídí antero-posteriorním nastavením těla daným hox geny. Samotný vývoj neurální lišty je řízen navzájem se ovlivňující sítí genů. Zde jsme se zaměřili na geny meis v rámci kraniofaciálního vývoje dánia. Ke studiu této problematiky jsme použili linie knock out (KO) mutantů pro každý paralog meis genu. Ze čtyř mutantů, meis1a, meis1b, meis2a, meis2b, pouze u meis1b KO a double meis1a1b KO mutantů dochází k deformaci hlavových chrupavek, derivátů neurální lišty. Tyto změny jsme identifikovali už během růstu chrupavek, avšak nikoliv na začátku vývoje během migrace neurální lišty do žaberních oblouků a následné kondenzace chondrocytů. Utváření obličejové části lebky tzv. viscerokrania je výsledkem provázanosti vývoje několika tkání. Jednou z těchto tkání... The neural crest is a population of migrating cells found only in vertebrates. Neural crest cells migrate to the head, heart and trunk regions of the body where they transform into different cell types. The cranial neural crest cells differentiate into chondrocytes and tenocytes, among others. The chondrogenic property of the cranial neural crest has given the vertebrates an advantage during evolution. In this paper, we focus on specific functions of the cranial neural crest and its derivatives in zebrafish (Danio rerio). The migration streams of the cranial neural crest follow the antero-posterior axis which is set up by hox genes. The development of the neural crest is controlled by a vast gene regulatory network. Here, we focus on the meis genes within the craniofacial development of zebrafish. For analysis, we used knock out (KO) mutant lines for each paralog of the meis gene (meis1a, meis1b, meis2a, meis2b). Only the meis1b KO and double meis1a1b KO mutants exhibit malformatins of the cranial cartilages, derivatives of the neural crest. We identified changes during cartilage formation. However, the migration of the neural crest into the pharyngeal arches and subsequent chondrocyte condensation remained unchanged. The formation of the facial part of the skull, so-called viscerocranium, is the... Keywords: buňky neurální lišty; CRISPR; Cas9; buněčná diferenciace; kraniofaciální vývoj; Danio rerio; neural crest cells; CRISPR; Cas9; cell differentiation; craniofacial development; Danio rerio Available in a digital repository NRGL
Development of neural crest cells in zebrafish Danio rerio

Neurální lišta je populace volně migrujících buněk, kterou najdeme pouze u obratlovců. Buňky neurální lišty migrují do hlavové, srdeční a trupové oblasti těla, kde se přeměňují v různé buněčné typy. V ...

Psutková, Viktorie; Machoň, Ondřej; Fabian, Peter; Svoboda, Ondřej
Univerzita Karlova, 2024

Složitost klasifikačních problémů v topologii
Dudák, Jan; Vejnar, Benjamin; Krupski, Pawel; Zelený, Miroslav
2024 - English
Tato práce sestává ze tří článků. V prvním z nich se zabýváme kompaktními metri- zovatelnými prostory homeomorfními se svými čtverci, přičemž hlavním výsledkem je, že existuje systém mohutnosti kontinua po dvou nehomeomorfních kompaktních metrizo- vatelných nuldimenzionálních prostorů homeomorfních se svými čtverci. Tímto výsled- kem je zodpovězena otázka W. J. Charatonika. Ve druhém článku je dokázáno, že existuje borelovsky měřitelné zobrazení přiřazující každému Peanovu kontinuu X spojitou funkci z [0, 1] na X. Také je ukázáno, že existuje borelovsky měřitelné zobrazení přiřazující každé trojici (X, x, y), kde X je Peanovo kontinuum a x, y jsou dva různé body v X, oblouk v X s koncovými body x, y. Ve třetím článku je dokázáno, že relace homeomorfismu mezi absolutními retrakty v R2 je borelovsky bireducibilní s relací isomorfismu mezi spočet- nými grafy. Dále je ukázáno, že relace homeomorfismu mezi Peanovými kontinuy v R2 ani relace homeomorfismu mezi absolutními retrakty v R3 nejsou klasifikovatelné spočetnými strukturami. Rovněž je ukázáno, že relace homeomorfismu (a také relace vnějšího home- omorfismu) mezi kompakty v [0, 1]n je borelovsky reducibilní do relace homeomorfismu mezi kontinuy v [0, 1]n+1 . 1 This thesis consists of three articles. The first article focuses on compact metrizable spaces homeomorphic to their respective squares, the main result being that there ex- ists a family of size continuum of pairwise non-homeomorphic compact metrizable zero- dimensional spaces homeomorphic to their respective squares. This result answers a question of W. J. Charatonik. In the second article we prove that there exists a Borel measurable mapping assigning to each Peano continuum X a continuous function from [0, 1] onto X. We also show that there exists a Borel measurable mapping assigning to each triple (X, x, y), where X is a Peano continuum and x, y are distinct points in X, an arc in X with endpoints x, y. In the third article we prove that the homeomorphism relation for absolute retracts in R2 is Borel bireducible with the isomorphism relation for countable graphs. Moreover, we prove that neither the homeomorphism relation for Peano continua in R2 nor the homeomorphism relation for absolute retracts in R3 is clas- sifiable by countable structures. We also show that the homeomorphism relation (as well as the ambient homeomorphism relation) for compacta in [0, 1]n is Borel reducible to the homeomorphism relation for continua in [0, 1]n+1 . 1 Keywords: borelovská redukce|relace homeomorfismu|metrizovatelný kompaktní prostor|Peanovo kontinuum; Borel reduction|homeomorphism relation|metrizable compact space|Peano continuum Available in a digital repository NRGL
Složitost klasifikačních problémů v topologii

Tato práce sestává ze tří článků. V prvním z nich se zabýváme kompaktními metri- zovatelnými prostory homeomorfními se svými čtverci, přičemž hlavním výsledkem je, že existuje systém mohutnosti ...

Dudák, Jan; Vejnar, Benjamin; Krupski, Pawel; Zelený, Miroslav
Univerzita Karlova, 2024

Potravní sítě ledovcových toků.
Komárková, Julie; Kopalová, Kateřina; Fuksa, Josef
2024 - English
Tématem této práce jsou ekosystémy ledovcem napájených toků se zaměřením na společenstva toků, spolu s identifikací struktur potravních sítích. Ledovcové toky představují drsné prostředí z hlediska fyzikálně-chemických vlastností, s proměnlivými vodními režimy, s největším průtokem v letních měsících, a specifickými světelnými a nutričními podmínkami. Základem potravních sítí jsou fotoautotrofní producenti, jako jsou rozsivky, Chrysophyceae a sinice, spolu s chemolithotrofními bakteriemi. V ledovcová voda hostí také některé taxony hub, které jsou s heterotrofními bakteriemi hlavními rozkladači. Ze skupiny bezobratlých jsou v ledovcových tocích vodní larvy druhů Diamesa a Pseudodiamesa, dále ze skupin Ephemeroptera či Plecoptera. Tyto všežravé druhy jsou charakterizovány vysokou potravní plasticitou. Larvy filtrují nebo spásají především epilitické biofilmy, v některých případech se však mohou uchylovat k predaci. Mimo bezobratlé, v ledovcových tocích obvykle nežijí zástupci s většími tělesnými rozměry, kteří by tvořili vyšší stupně trofických úrovní. Změna klimatu s ústupem ledovců ovlivňuje vlastnosti ledovcových toků, a to například v průtoku vody a teplotě, která se neustále zvyšuje. Posuny ve stanovištních podmínkách a struktuře společenstva v tocích povede ke složitějším potravním sítím, s... This work focuses on glacier-fed stream ecosystems, with the centre of attention being on the community composition and characterization of their food web structure. Glacier-fed streams are harsh environments in terms of their physicochemical characteristics. These streams exhibit low temperatures and specific flow regimes, with the peak of meltwater generation, and thus discharge, in the summer. In turn, streamwater nutrient concentrations, light availability, and turbidity all vary seasonally according to the flow regime. Compositionally, glacier-fed stream habitats host chemolithotrophic bacteria along with photoautotrophic producers, such as diatoms, Chrysophyceae, and Cyanobacteria, which together serve at the bottom of food webs as primary producers. These streams also host some fungal taxa, that together with heterotrophic bacteria, represent the primary decomposers. Macroinvertebrates, including the water larvae of species Diamesa and Pseudodiamesa, or from the Ephemeroptera or Plecoptera groups, are important secondary producers with high feeding plasticity; that is, they are mainly grazing biofilm or collecting/filtering organic matter, with the possibility of predation. Other than that, in glacier-fed streams, there is usually no presence of higher trophic levels with large- bodied... Keywords: ekologie; ledovcové toky; potravní sítě; struktura společenstva; změna klimatu; ecology; glacier-fed streams; food webs; community structure; climate change Available in a digital repository NRGL
Potravní sítě ledovcových toků.

Tématem této práce jsou ekosystémy ledovcem napájených toků se zaměřením na společenstva toků, spolu s identifikací struktur potravních sítích. Ledovcové toky představují drsné prostředí z hlediska ...

Komárková, Julie; Kopalová, Kateřina; Fuksa, Josef
Univerzita Karlova, 2024

About project

NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web

Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz

Provider

http://www.techlib.cz

Facebook

Other bases