Optimization of calcium chloride concentration for removal of polysaccharide contamination during plant DNA isolation
Frnčová, Ekaterina; Šlosárová, Katarína; Fialová, Lenka
2024 - Czech The greatest difficulty in isolating DNA is the presence of contaminants that cause side effects. Polysaccharides are the most common contaminants in fruits. They can distort the results in spectrophotometric determination of purity or act as inhibitors in PCR analysis together with other substances (for example, proteins or phenolic substances). The aim of this work was to investigate the influence of different concentrations of calcium chloride on the process of DNA isolation. In the experimental part, DNA from the apple was isolated using different concentrations of calcium chloride. The isolation was carried out four times, and each time the sample was adjusted in different ways. It was found that the isolation method used works only with a sample that has been lyophilized. Isolation of DNA from fresh fruit provided very low yields. Probably, this was due to the large water content in the sample, and the proportion of the solid component was smaller. Subsequently, PCR analysis and electrophoresis were performed to determine the amplifiability of the isolated DNA. Two sets of primers with different specificity were used for this analysis. Amplifiability was confirmed only when using primers specific to apple DNA when using 100 mM solution of CaCl2. Other samples have been amplifiable using both types of primers. Probably, samples isolated using a 100 mM solution of CaCl2 had a larger amount of inhibitors that do not affect all PCR reactions equally, which may also indicate a small effectiveness of this amount of CaCl2. Největší potíž při izolaci DNA je přítomnost kontaminujících látek, které způsobují nežádoucí účinky. V ovoci nejrozšířenějšími kontaminanty jsou polysacharidy. Spolu s dalšími látkami (například proteiny nebo fenolické látky) můžou zkreslovat výsledky při spektrofotometrickém stanovení čistoty nebo působit jako inhibitory při PCR analýze. Cílem této práce bylo zkoumaní vlivu různých koncentrací chloridu vápenatého na proces izolace DNA. V experimentální části byla izolovaná DNA z jablka pomocí různě koncentrovaných roztoků chloridu vápenatého. Izolace byla provedena čtyřikrát a pokaždé byl vzorek upraven různými způsoby. Bylo zjištěno, že použitá izolační metoda funguje jenom na vzorku, který byl předem lyofilizován. Izolace DNA z čerstvého plodu poskytovala velmi nízké výtěžky. Pravděpodobně to bylo způsobeno velkým obsahem vody ve vzorku a podíl pevné složky byl menší. Následně byly provedeny PCR analýza a elektroforéza pro zjištění amplifikovatelnosti izolované DNA. Pro tyto analýzy byly použity dvě sady primerů s různou specifitou. Při použití 100 mM roztoku CaCl2 byla potvrzena amplifikovatelnost pouze při použití primerů specifických pro DNA jabloně. U ostatních vzorků byly prokázány amplifikovatelnost při použití obou typů primerů. Pravděpodobně, vzorky izolovány pomocí 100 mM roztoku CaCl2 měly větší množství inhibitorů, které neovlivňují všechny PCR reakce stejně, což také může ukazovat na malou účinnost tohoto množství CaCl2. Keywords: Ovoce; jablko; rostlinný vzorek; izolace DNA; polysacharidy; polysacharidová kontaminace; chlorid vápenatý; polymerázová řetězová reakce (PCR); elektroforéza; Fruit; apple; plant sample; DNA isolation; polysaccharides; polysaccharide contamination; calcium chloride; polymerase chain reaction (PCR); electrophoresis Available in a digital repository NRGL Optimization of calcium chloride concentration for removal of polysaccharide contamination during plant DNA isolation

z čerstvého plodu poskytovala velmi nízké výtěžky. Pravděpodobně to bylo způsobeno velkým obsahem vody ve vzorku a podíl pevné složky byl menší. Následně byly provedeny PCR analýza a ...

Frnčová, Ekaterina; Šlosárová, Katarína; Fialová, Lenka
Vysoké učení technické v Brně, 2024

Odstraňování kontaminací ropnými látkami
Dvořáková, Helena
2008 - Czech Keywords: hydrofóbní adsorbenty; ropné látky; zaolejované odpadní vody Available in digital repository of Mendel University. Odstraňování kontaminací ropnými látkami

Dvořáková, Helena
Mendelova univerzita v Brně, 2008

Odstraňování kontaminací ropnými látkami
Dvořáková, Helena
2008 - Czech Keywords: hydrofóbní adsorbenty; ropné látky; zaolejované odpadní vody Available in digital repository of Mendel University. Odstraňování kontaminací ropnými látkami

Dvořáková, Helena
Mendelova univerzita v Brně, 2008

Faktory ovplyvňujúce mikroflóru mäsa
Schlosserová, Nikola
2017 - Slovak Bechelor thesis involves theoretical parts focused on problematic area of changes in the microbiota of meat. To prevent this changes we have to know, how we can stop them in the begining. That contains knowledge of factors which affect them. These factors are part of prevention to provide healthy and safety food. Meat as an animal product, which contains plenty of water and that make it easily tainted. Contamination can be caused primary or secondary and also can affect chemical structure of meat. That´s mean qualtity degradation of stock and final product. To achieve quality and safety, it is needed to know and maintain qualitatv idicators of quality. Bakalářská práce je složená z teoretických častí zaobírajících se problematikou změn mikroflóry masa. Abychom mohli zabránit těmto změnám, je potřeba vědět, jak jim můžeme předchádzet a tedy musíme znát faktory, které mikroflóru ovlivňují. Tyto faktory jsou současně prevencí pro zabezpečení zdravotně bezpečných potravin. Maso jako živočíšný produkt, který obsahuje velké množství vody může velmi snadno podlehnout mikrobiálnímu kažení. Kontaminace může být způsobena primárně nebo sekundárně a může to mít za následek i změny chemické struktury a tím pádem zhoršení kvality suroviny a finálního výrobku. Pro dosažení bezpečnosti a požadované kvality potraviny, je potřeba znát a dbát na kvalitativní ukazatele jakosti. Keywords: kontaminace; maso; mikroflóra; mikroorganismus Available in digital repository of Mendel University. Faktory ovplyvňujúce mikroflóru mäsa

. Tyto faktory jsou současně prevencí pro zabezpečení zdravotně bezpečných potravin. Maso jako živočíšný produkt, který obsahuje velké množství vody může velmi snadno podlehnout ...

Schlosserová, Nikola
Mendelova univerzita v Brně, 2017

Carbamazepine - a study on the input to surface waters
Hromádková, Lucie; Fuksa, Josef; Cajthaml, Tomáš
2012 - Czech Antikonvulzivum karbamazepin je léčivo, které je nutné užívat dlouhodobě. Navíc je karbamazepin i jeho metabolity rezistentní vůči mikrobiálnímu rozkladu i sorpci na kal v současných čistírnách komunálních odpadních vod. Karbamazepin a jeho metabolity tak ČOV prochází a jsou kontinuálně vypouštěny do toků. Koncentrace karbamazepinu v tocích jsou příliš nízké na to, aby toto léčivo bylo schopné působit akutně toxicky, nelze ovšem vyloučit chronickou toxicitu karbamazepinu nebo synergické účinky s jinými rezidui léčiv. Karbamazepin je díky svým fyzikálně-chemickým vlastnostem odolný také k degradačním procesům probíhajícím v povrchových vodách a v půdě, a proto se přes horninové podloží infiltruje i do podzemních vod. O chování a působení jeho metabolitů v povrchových vodách zatím nejsou dostatečné informace. Nejen karbamazepin, ale i další farmaka jsou dnes často detekována v povrchových a podzemních vodách, a také v půdě. Navíc se zvyšujícím se počtem obyvatel neustále roste i spotřeba farmak a tedy i jejich přísun do životního prostředí. Avšak vzhledem k potenciálnímu riziku, které farmaka v životním prostředí znamenají, je nutné další přísun těchto mikropolutantů redukovat. Farmaka mohou do životního prostředí vstupovat několika cestami, a tak existuje i několik možných strategií jak tyto vstupy omezit.... Anticonvulsant carbamazepine is a pharmaceutical, which is necessary to be taken continuously. Moreover carbamazepine and its metabolites are resistant to microbial degradation and sorption onto sludge in present municipal wastewater treatment plants. Therefore carbamazepine and its metabolites pass through WWTP and are constantly discharged to surface waters. Concentrations of carbamazepine measured in surface waters are too low to cause acute toxicological effects, but chronic toxicological effects or synergic effects with other pharmaceuticals cannot be excluded. Due to its physico-chemical properties carbamazepine is recalcitrant to degradation in surface waters and in soil, thus it infiltrates through bedrock to ground water. So far there is not enough information on behaviour and effects of metabolites of carbamazepine in surface waters. Besides carbamazepine, also other pharmaceuticals are nowadays often detected in surface and ground water and in the soil. Furthermore, as the population grows the consumption of pharmaceuticals increases as does their input into environment. However, given the risks, which pharmaceuticals in the environment entail, it is necessary to reduce additional input of these micropolutants into environment. As pharmaceuticals can enter the environment by many pathways, there... Keywords: karbamazepin; farmaka; odpadní vody; povrchové vody; kontaminace; Karbamazepin; pharmaceuticals; sewage waters; surface waters; contamination Available in a digital repository NRGL Carbamazepine - a study on the input to surface waters

Antikonvulzivum karbamazepin je léčivo, které je nutné užívat dlouhodobě. Navíc je karbamazepin i jeho metabolity rezistentní vůči mikrobiálnímu rozkladu i sorpci na kal v současných čistírnách ...

Hromádková, Lucie; Fuksa, Josef; Cajthaml, Tomáš
Univerzita Karlova, 2012

The issue of drugs in surface and ground waters
Šrot, Martin; Hrkal, Zbyněk; Datel, Josef
2013 - Czech Předložená práce pojednává o stavu výzkumu přítomnosti převážně léčivých látek ve vodních útvarech České republiky a v menší míře se věnuje této problematice i v zahraničí. Uvádí přehled nejčastěji se vyskytujících léčivých látek a způsoby jejich zjišťování. Popisuje možné zdroje znečištění a dopad působení těchto látek na životní prostředí. Klíčová slova: podzemní vody, povrchové vody, léčiva, kontaminace The presented work deals with the state of research of medicinal substances in water formations of Czech Republic and in smaller ammount it deals with this issue abroad. It provides an overview of the most frequently occurring medicinal substances and methods for their detection and also describes the possible sources of pollution and impact of these substances on the environment. Keywords: ground water, surface water, drugs, contamination Keywords: podzemní vody; povrchové vody; léčiva; kontaminace; groundwater; surface water; drugs; contamination Available in a digital repository NRGL The issue of drugs in surface and ground waters

jejich zjišťování. Popisuje možné zdroje znečištění a dopad působení těchto látek na životní prostředí. Klíčová slova: podzemní vody, povrchové vody, léčiva, kontaminace

Šrot, Martin; Hrkal, Zbyněk; Datel, Josef
Univerzita Karlova, 2013

The issue of drugs in surface and ground waters
Šrot, Martin; Hrkal, Zbyněk; Datel, Josef
2013 - Czech Předložená práce pojednává o stavu výzkumu přítomnosti převážně léčivých látek ve vodních útvarech České republiky a v menší míře se věnuje této problematice i v zahraničí. Uvádí přehled nejčastěji se vyskytujících léčivých látek a způsoby jejich zjišťování. Popisuje možné zdroje znečištění a dopad působení těchto látek na životní prostředí. Klíčová slova: podzemní vody, povrchové vody, léčiva, kontaminace The presented work deals with the state of research of medicinal substances in water formations of Czech Republic and in smaller ammount it deals with this issue abroad. It provides an overview of the most frequently occurring medicinal substances and methods for their detection and also describes the possible sources of pollution and impact of these substances on the environment. Keywords: ground water, surface water, drugs, contamination Keywords: podzemní vody; povrchové vody; léčiva; kontaminace; groundwater; surface water; drugs; contamination Available in a digital repository NRGL The issue of drugs in surface and ground waters

jejich zjišťování. Popisuje možné zdroje znečištění a dopad působení těchto látek na životní prostředí. Klíčová slova: podzemní vody, povrchové vody, léčiva, kontaminace

Šrot, Martin; Hrkal, Zbyněk; Datel, Josef
Univerzita Karlova, 2013

Drinking Water in the Republic of South Africa, Eastern Cape Province, Amathole District
Hamža, Pavel
2014 - English The thesis focuses on the state of the water resources in the Republic of South Africa and the quality of drinking water in Amathole District. The writing deals with the contemporary state of South African water resources with regard to the aspects which potentially threaten the water resources and also explain the main challenges causing contamination. The work also shows the structure of the management of South African water resources. It is divided into the theoretical and the practical part. The theoretical part discuss the general issues concerning water resources while the practical part offers a proposal of the development project focusing on the introduction of sanitation facilities and water research. Tato práce je zaměřena na stav vodních zdrojů v Jihoafrické republice a kvalitu pitné vody v oblasti Amathole. Zabývá se současným stavem jihoafrických vodních zdrojů s ohledem na aspekty, které ohrožují tyto vodní zdroje, a také objasňuje hlavní problémy způsobující kontaminaci. Kromě toho je zde i představena struktura managementu jihoafrických vodních zdrojů. Text je rozdělen na teoretickou a praktickou část. Teoretická část pojednává o problematice vodních zdrojů všeobecně, zatímco praktická část předkládá návrh rozvojového projektu, který je zaměřen na zavedení sanitačních zařízení a výzkum vodních zdrojů. Keywords: Jihoafrická republika; kontaminace; Kvalita pitné vody; vodní zdroje Available in digital repository of Mendel University. Drinking Water in the Republic of South Africa, Eastern Cape Province, Amathole District

Tato práce je zaměřena na stav vodních zdrojů v Jihoafrické republice a kvalitu pitné vody v oblasti Amathole. Zabývá se současným stavem jihoafrických vodních zdrojů s ohledem na aspekty, ...

Hamža, Pavel
Mendelova univerzita v Brně, 2014

Drinking Water in the Republic of South Africa, Eastern Cape Province, Amathole District
Hamža, Pavel
2014 - English The thesis focuses on the state of the water resources in the Republic of South Africa and the quality of drinking water in Amathole District. The writing deals with the contemporary state of South African water resources with regard to the aspects which potentially threaten the water resources and also explain the main challenges causing contamination. The work also shows the structure of the management of South African water resources. It is divided into the theoretical and the practical part. The theoretical part discuss the general issues concerning water resources while the practical part offers a proposal of the development project focusing on the introduction of sanitation facilities and water research. Tato práce je zaměřena na stav vodních zdrojů v Jihoafrické republice a kvalitu pitné vody v oblasti Amathole. Zabývá se současným stavem jihoafrických vodních zdrojů s ohledem na aspekty, které ohrožují tyto vodní zdroje, a také objasňuje hlavní problémy způsobující kontaminaci. Kromě toho je zde i představena struktura managementu jihoafrických vodních zdrojů. Text je rozdělen na teoretickou a praktickou část. Teoretická část pojednává o problematice vodních zdrojů všeobecně, zatímco praktická část předkládá návrh rozvojového projektu, který je zaměřen na zavedení sanitačních zařízení a výzkum vodních zdrojů. Keywords: Jihoafrická republika; kontaminace; Kvalita pitné vody; vodní zdroje Available in digital repository of Mendel University. Drinking Water in the Republic of South Africa, Eastern Cape Province, Amathole District

Tato práce je zaměřena na stav vodních zdrojů v Jihoafrické republice a kvalitu pitné vody v oblasti Amathole. Zabývá se současným stavem jihoafrických vodních zdrojů s ohledem na aspekty, ...

Hamža, Pavel
Mendelova univerzita v Brně, 2014

Anomalous occurences of arsenic in natural waters in the Czech Republic
Rodovská, Zuzana; Drahota, Petr; Redlich, Aleš
2012 - Czech Bakalářská práce je rešerší, která se zaměřuje na distribuci arsenu v povrchových i podzemních přírodních vodách České republiky a zejména na výskyt jeho anomálních koncentrací v těchto prostředích včetně odhalení zdrojů kontaminace. Z výsledků práce vyplývá, že kvalita povrchových a podzemních vod v České republice, s ohledem na koncentraci arsenu, je celkově na dobré úrovni, v porovnání s kvalitou vod ve světě. Anomální koncentrace arsenu v přírodních vodách ČR (> 50 µg/l) byly dokumentovány jen vzácně v oblastech se zvýšenou antropogenní činností či oblastech postižených historickou důlní činností. Klíčová slova: Arsen, toxicita, kontaminace, povrchové vody, podzemní vody, Česká republika This bachelor thesis reviews the data on the distribution of arsenic in surface and underground natural waters of the Czech Republic. In addition the thesis focuses on the occurrence of anomalous arsenic concentrations and tries to detect sources of arsenic contamination. Results of the thesis suggest high quality of the surface and groundwater in the Czech Republic with respect to arsenic. Its anomalous concentrations in the natural waters in Czech Republic have been rarely documented only in areas with strong anthropogenic impact and in areas affected by historical mining operations. Keywords: Arsenic, toxicity, contamination, surface water, groundwater, Czech Republic Keywords: Arsen; toxicita; kontaminace; povrchové vody; podzemní vody; Česká republika; Arsenic; toxicity; contamination; surface water; groundwater; Czech Republic Available in a digital repository NRGL Anomalous occurences of arsenic in natural waters in the Czech Republic

Bakalářská práce je rešerší, která se zaměřuje na distribuci arsenu v povrchových i podzemních přírodních vodách České republiky a zejména na výskyt jeho anomálních koncentrací v těchto ...

Rodovská, Zuzana; Drahota, Petr; Redlich, Aleš
Univerzita Karlova, 2012