Interaction of sperm surface proteins in the reproduction process
Jonáková, Věra; Kraus, Marek; Maňásková, Pavla; Liberda, J.; Tichá, M.
2004 - Czech Mammalian fertilization includes highly regulated biochemical interactions between complementary molecules located on the surfaces of both gametes as well as those present in the natural environment of the gametes. Boar seminal plasma proteins AQN, AWN spermadhesins and DQH protein that are bound to the sperm at ejaculation play important role in the reproduction process. Binding of sperm to epithelial cells, recognition of gametes and binding of sperm to glycoprotein of zona pellucida are mediated by protein-saccharide interaction, lektin-type interaction. Another type of interaction (protein-protein) participates in the formation of aggregated forms, which seem to be the natural functional forms of seminal plasma proteins. Protein aggregates form the sperm coating layers and their re-modeling in the female reproductive tract is imporatnt for the sperm capacitation and for the primary binding of spermto the ovum. Savčí reprodukce zahrnuje vysoce regulované biochemické interakce mezi komplementárními molekulami lokalizovanými na povrchu spermie a vajíčka a rovněž s látkami přítomnými v přirozeném okolí obou gamet. Proteiny kančí semenné plasmy AQN, AWN spermadhesiny a DQH protein, které jsou vázány na spermii během ejakulace, hrají důležitou roli v procesech reprodukce. Vazba spermie k buňkám oviduktu, rozpoznávání gamet a vazba spermie ke glykoproteinové síti zony pellucidy je zprostředkována protein-sacharidovou interakcí, lektinovou vazbou. Přirozenou funkční formou proteinů kančí semenné plasmy se zdají být jejich agregované formy, při kterých se uplatňuje další typ interakce (protein-protein). Proteinové agregáty tvoří povrchovou vrstvu spermie a její remodelování v samičím reprodukčním traktu je důležité během kapacitace spermie a pro primární vazbu spermie na vajíčko. Keywords: sperm surface proteins; lectin-like interaction; mammalian reproduction; bílkoviny; polygrafie Available at various institutes of the ASCR Interaction of sperm surface proteins in the reproduction process

Mammalian fertilization includes highly regulated biochemical interactions between complementary molecules located on the surfaces of both gametes as well as those present in the natural environment ...

Jonáková, Věra; Kraus, Marek; Maňásková, Pavla; Liberda, J.; Tichá, M.
Ústav molekulární genetiky, 2004

Antibodies against receptors coupled with G-proteins
Hýblová, D.; Veselský, Leopold; Velek, Jiří; Železná, Blanka
2004 - Czech Two antibodies against angiotensin receptor AT2 prepared against two short sequences recognized the receptor on Western blots of several rat and mouse tissues where AT2 is expressed. Both antibodies recognized the identical proteins; they lost this property after immunoabsorption with their antigen peptides. With one antibody, we were able to immunoprecipitate the receptor. Dvě protilátky proti angiotensinovému receptoru AT2 připravené proti dvěma krátkým sekvencím rozeznávaly receptor na Western blotech membrán různých tkání potkana a myši, v nichž se AT2 exprimuje. Obě protilátky rozeznávaly tytéž bílkoviny a po vysycení příslušným antigenním peptidem tuto schopnost ztratily. Jedna protilátka se osvědčila při imunoprecipitaci receptoru. Keywords: angiotensin receptor antibody; protilátky; bílkoviny Available at various institutes of the ASCR Antibodies against receptors coupled with G-proteins

Two antibodies against angiotensin receptor AT2 prepared against two short sequences recognized the receptor on Western blots of several rat and mouse tissues where AT2 is expressed. Both antibodies ...

Hýblová, D.; Veselský, Leopold; Velek, Jiří; Železná, Blanka
Ústav molekulární genetiky, 2004

Different expression of house-keeping genes by quantitative real time RT-PCR
Ullmannová, V.; Truksa, Jaroslav; Haškovec, C.; Kovář, Jan
2003 - Czech Keywords: quantitative real time RT-PCR; house-keeping genes expression Available at various institutes of the ASCR Different expression of house-keeping genes by quantitative real time RT-PCR

Ullmannová, V.; Truksa, Jaroslav; Haškovec, C.; Kovář, Jan
Ústav molekulární genetiky, 2003

The regulation of antiinflammatory immune reactions in the frontal segment of the eye
Vítová, A.; Filipec, M.; Pindjáková, Jana; Krulová, Magdalena; Zajícová, Alena; Holáň, Vladimír
2003 - Czech Corneal stroma was identified as a source of a novel molecule rosponsible for selective ingibitor of production of anti-inflammatory cytokines. Rohovkové stroma bylo identifikováno jako zdroj nové molekuly zodpovědné za selektivní inhibici produkce protizánětlivých cytokinů. Keywords: Rohovkové stroma; selektivní inhibice Available at various institutes of the ASCR The regulation of antiinflammatory immune reactions in the frontal segment of the eye

Corneal stroma was identified as a source of a novel molecule rosponsible for selective ingibitor of production of anti-inflammatory cytokines.

Vítová, A.; Filipec, M.; Pindjáková, Jana; Krulová, Magdalena; Zajícová, Alena; Holáň, Vladimír
Ústav molekulární genetiky, 2003

Experimental methods for phase determination /MIR,MAD,SAD/ in crystallography of biological macromolecules
Brynda, Jiří
2003 - Czech Importance of unbiased phases in post genomic era is emphasized. Article describes the classical methods of phase determination: 1) Multiple Isomorphous replacement, heavy-atom derivative (MIR) 2) Multiple Anomalous Dispersion (MAD) Phasing 3) Single Anomalous Dispersion (SAD) Phasing The better your initial, experimental map is, the more model you will be able to build confidently into this unbiased map before proceeding to phase combination. MAD phases result from perfectly isomorphous data, and do not deteriorate at low resolution as do MIR phases. MIR phases, on the other hand, provide superior phasing power at low resolution resulting in better connectivity. Not surprising, the best maps are either MAD or combined MIR-MAD maps. Důležitost metod poskytujících nepředpojaté řešení fázového problému se stává vstupem molekulární biologie a biochemie do tzv. post-genomické éry stále významnější. V článku jsou popsány klasické metody experimentálního určení fází:1) Metoda isomorfních derivátů s těžkými atomy 2) Metoda Anomálního rozptylu při různých vlnových délkách 3) Metoda Anomálního rozptylu při jedné vlnové délce Čím lepší jsou vaše první, experimentální mapy, tím více modelu můžete spolehlivě vystavět do nepředpojaté (modelem nezatížené) mapy před sečtením fází (původní + model). MAD fáze pocházejí z perfektně izomorfních dat a tak netrpí disordrem jako je to běžné u MIR map na malém rozlišení. MIR fáze zase na druhou stranu poskytují výtečnou fázovací sílu na nízkém rozlišení a výsledkem je lepší propojení mapy v prostoru. Není proto překvapivé, že nejlepší mapy jsou buď MAD mapy nebo kombinované MIR-MAD mapy. Keywords: phase problem; MIR,MAD,SAD Available at various institutes of the ASCR Experimental methods for phase determination /MIR,MAD,SAD/ in crystallography of biological macromolecules

Importance of unbiased phases in post genomic era is emphasized. Article describes the classical methods of phase determination: 1) Multiple Isomorphous replacement, heavy-atom derivative (MIR) 2) ...

Brynda, Jiří
Ústav molekulární genetiky, 2003

Validation of macromolecular crystal structures
Řezáčová, Pavlína
2003 - Czech X-ray crystallography is the main technique of macromolecular structure determination. Typical problems of protein crystallography diffraction data measured at limited resolution and inaccurate phase informacion adversely affect the quality of electron density maps and consequently the quality of the final model. Currently, there are many methods of protein quality validation. These can be subdivided into two main groups The first group assesses the model quality by evaluating the agreement of the model with the diffraction data. The second group of structure validation methods is based on comparison of the macromolecular model geometrical parameters with standards values derived from the crystal structures of small molecules or high-resolution macromolecular structures. This work is focused on introduction to widely used macromolecular structure-validation software. The main global quality criteria and reliable indicators for detecting local errors are summarized. Rentgenová krystalografie je hlavní technikou získání detailní informace o atomové struktuře makromolekul. Typické problémy makromolekulární krystalografie: difrakční data získaná na omezeném rozlišení a nepřesná fázová informace, nevyhnutelně ovlivňují kvalitu map elektronových hustot a následně se odrazí i v kvalitě konečného modelu.Dnes existuje mnoho metod pro ověření kvality modelu, které lze rozdělit do dvou základních skupin. První skupina hodnotí kvalitu modelu podle jeho shody s experimentálními daty. Druhá skupina ověřovacích metod hodnotí geometrické parametry modelu srovnáním se standardními hodnotami odvozenými z krystalových struktur malých molekul nebo struktur makromolekul určených na vysokém rozlišení. Tato práce je věnována představení běžně používaných počítačových programů využívajících obou výše zmíněných metod hodnocení kvality a ověřování struktur makromolekul. Jsou zde shrnuty ukazatele a měřítka kvality užívaná při hodnocení krystalových struktur makromolekul. Keywords: protein crystallography; validation; stereochemistry Available at various institutes of the ASCR Validation of macromolecular crystal structures

X-ray crystallography is the main technique of macromolecular structure determination. Typical problems of protein crystallography diffraction data measured at limited resolution and inaccurate phase ...

Řezáčová, Pavlína
Ústav molekulární genetiky, 2003

Processing of Diffraction Data Obtained by Oscillation Method on Crystals of Biological Macromolecules
Brynda, Jiří
2003 - Czech The components of monochromatic diffractometer suitable for data collection on crystals of biological macromolecules are described, as well as basics of rotation method. The optimal strategy for collecting X-ray diffraction data from macromolecular crystals is discussed. The geometric factors influencing the completeness of data are arising from the symmetry of the reciprocal lattice and from the experimental setup; they affect quantitatively the completeness of the measured set of reflections. Příspěvek popisuje jednotlivé komponenty monochromatického difraktometru vhodného pro měření krystalů biologických makromolekul a také základní principy rotační metody. Optimální strategie pro měření difrakčních dat na krystalech makromolekul je diskutována. Geometrické faktory ovlivňující kompletnost dat jsou symetrie reciproké mřížky a geometrické uspořádání jednotlivých komponent monochromatického difraktometru, které ovlivňují kvantitativně kompletnost měřených dat. Keywords: X-ray data collection, rotation method, X-ray diffractometer Available at various institutes of the ASCR Processing of Diffraction Data Obtained by Oscillation Method on Crystals of Biological Macromolecules

The components of monochromatic diffractometer suitable for data collection on crystals of biological macromolecules are described, as well as basics of rotation method. The optimal strategy for ...

Brynda, Jiří
Ústav molekulární genetiky, 2003

Sperm surface proteins of spermatozoa and proteins of seminal plasma in fertilization
Jonáková, Věra; Maňásková, Pavla; Jelínková, Petra; Balínová, P.; Tichá, M.
2002 - Czech Mammalian fertilization involves highly regulated biochemical events. We aimed at study of interaction of seminal plasma proteins with sperm and at mutual interactions of proteins from seminal plasma. Savčí fertilizace zahrnuje vysoce regulované biochemické děje. My jsme se zaměřili na studium interakce proteinů semenné plasmy se spermií a na vzájemné interakce proteinů ze semenné plasmy. Keywords: fertilization; proteins of seminal plasma; spermatozoa; hnojení Available at various institutes of the ASCR Sperm surface proteins of spermatozoa and proteins of seminal plasma in fertilization

Mammalian fertilization involves highly regulated biochemical events. We aimed at study of interaction of seminal plasma proteins with sperm and at mutual interactions of proteins from seminal ...

Jonáková, Věra; Maňásková, Pavla; Jelínková, Petra; Balínová, P.; Tichá, M.
Ústav molekulární genetiky, 2002

The significance of genomics for biomedicine
Pačes, Václav
2000 - Czech Available at various institutes of the ASCR The significance of genomics for biomedicine

Pačes, Václav
Ústav molekulární genetiky, 2000

Genomics - Science for the 21st Century
Pačes, Václav
2000 - Czech Available at various institutes of the ASCR Genomics - Science for the 21st Century

Pačes, Václav
Ústav molekulární genetiky, 2000