No (77)
Number of found documents:
77
Published from
to
Development of radiometric methods for determination of enzyme activities of iodothyronine deiodinases: The influence of antidepressant drug fluoxetine on the types 1, 2 and 3 deiodinase activities in the rat brain
Pavelka, Stanislav
2010 - Czech
The objectives of the present study were to establish valid assay conditions for measurement of the types 1, 2 and 3 iodothyronine deiodinases activities, and to use the radiometric enzyme assays especially to follow the effects of antidepressant drug fluoxetine (Prozac) on the metabolism of thyroid hormones in the rat Účelem předkládané práce bylo zjištění experimentálních podmínek a vypracování korektních metod pro radiometrická měření enzymových aktivit jodothyronin dejodas typu 1, 2 a 3. Specielně pak použití těchto vypracovaných metod pro sledování účinků antidepresiva fluoxetinu (Prozac) na metabolismus tyreoidálních hormonů u laboratorního potkana
Keywords:
antidepressant drug; deiodinase; radiometric assay
Available at various institutes of the ASCR
Development of radiometric methods for determination of enzyme activities of iodothyronine deiodinases: The influence of antidepressant drug fluoxetine on the types 1, 2 and 3 deiodinase activities in the rat brain
The objectives of the present study were to establish valid assay conditions for measurement of the types 1, 2 and 3 iodothyronine deiodinases activities, and to use the radiometric enzyme assays ...
Fitting geometrical models to 3D confocal microscopy images using graph cuts iteratively
Janáček, Jiří
2010 - English
A new iterative method for fitting triangulated surfaces and geometric graphs to surfaces and fibre-like structures is based on the calculation of the minimal graph cut in every iteration. The method was used for improvement of the geometric model of muscle fibres surfaces and capillaries in skeletal muscle from 3D confocal image
Keywords:
graph cut; skeletal muscle; confocal microscopy
Available at various institutes of the ASCR
Fitting geometrical models to 3D confocal microscopy images using graph cuts iteratively
A new iterative method for fitting triangulated surfaces and geometric graphs to surfaces and fibre-like structures is based on the calculation of the minimal graph cut in every iteration. The method ...
Elastic registration of biomedical images on CUDA-Supported graphics procesor units
Michálek, Jan; Čapek, Martin; Janáček, Jiří; Kubínová, Lucie
2010 - English
Elastic registration is a task of finding the matching of two images, using geometric and elastic transformations, so that objects in images have the same size, position and orientation. We apply elastic registration in the framework of volume reconstruction, where an object acquired from parallel physical sections is composed and mutual positions of the sections including deformations caused by their cutting have to be found. The method lies in optimizing a functional consisting of two parts: first, discrete total variation as a measure of roughness and, second, L1 norm as a measure of dissimilarity of images. As a parallelizable optimization strategy we apply a potential-based equivalent transformation of a (max,+)-labelling problem. CUDA-based implementation of the described elastic registration algorithm is reasonably fast, requires seconds to minutes of calculations, provides good results and, thus, can be used for practical tasks dealing with alignment of biomedical images
Keywords:
volume reconstruction; elastic alignment; CUDA
Available at various institutes of the ASCR
Elastic registration of biomedical images on CUDA-Supported graphics procesor units
Elastic registration is a task of finding the matching of two images, using geometric and elastic transformations, so that objects in images have the same size, position and orientation. We apply ...
Genotype and locality effect on growth and development of the root system of winter oilseed rape
Bláha, L.; Vyvadilová, M.; Janáček, Jiří
2009 - Czech
The basic aim of presented work was analysis of root development of different oilseed rape cultivars at two localities. Obtained results show large influence of localities on the root development. The genotypes with good germination under unfavourable conditions (lack of water, drought, high temperature) develop stronger root system i.e. volume and length of the roots after sowing and during following vegetation period at studying localities Z dosud získaných výsledků vyplývá, že kromě lokality má na růst a vývoj kořenové soustavy vliv také odolnost odrůd vůči abiotickým stresorům v době klíčení.Genotypy, které jsou klasifikované jako odolnější vůči stresorům již při klíčení za nepříznivých podmínek ( nedostatek vody, sucho, vysoká teplota), mají i kvalitnější kořenový systém po vysetí a během následujícího vegetačního období na testovaných lokalitách
Keywords:
winter oilseed rape; root system; stress tolerance
Available at various institutes of the ASCR
Genotype and locality effect on growth and development of the root system of winter oilseed rape
The basic aim of presented work was analysis of root development of different oilseed rape cultivars at two localities. Obtained results show large influence of localities on the root development. The ...
Solving image analysis problems by minimization of total variation
Janáček, Jiří
2009 - Czech
A solution of various problems in image analysis using concurrent minimization of total variation and Lp loss function is presented. The minimization is achieved by a steepest descend method using graph cut minimization in each step. Regularization of noisy image and registration of microscopic images of physical sections are demonstrated Práce je věnována řešení úloh analýzy obrazu minimalizací funkce složené z totální variace obrazu a Lp ztrátové funkce. Minimalizaci lze provést iterační metodou největšího spádu s výpočtem kroku založeným na nalezení minimálního řezu v grafu obrazových prvkù. Jako příklad je uvedena regularizace zašuměného obrazu a registrace mikroskopických obrazů fyzických řezů
Keywords:
total variation; minimal graph cut
Available at various institutes of the ASCR
Solving image analysis problems by minimization of total variation
A solution of various problems in image analysis using concurrent minimization of total variation and Lp loss function is presented. The minimization is achieved by a steepest descend method using ...
Multi-photon excitation microscopy
Chernyavskiy, Oleksandr; Kubínová, Lucie
2008 - English
Multifotonová excitační mikroskopie se z exotické techniky postupně stává stále více používaným nástrojem díky pokroku v laserové technice. Tato slibná i když náročná technika poskytuje výhody, jako je průnik do větší hloubky, nižší fotopoškození, jež jsou zvláště užitečné při dlouhodobém zobrazování buněk Multiphoton excitation microscopy (MPM), being some time ago rather exotic than an easy-to-handle tool, becomes now more widely used due to advances in laser technique. This promising, yet expensive technique provides such advantages, as deeper penetration depth, lower photodamage, especially important in live cells imaging for extended periods of time
Keywords:
two-photon excitation; multiphoton excitation; second-harmonic generation
Available at various institutes of the ASCR
Multi-photon excitation microscopy
Multifotonová excitační mikroskopie se z exotické techniky postupně stává stále více používaným nástrojem díky pokroku v laserové technice. Tato slibná i když náročná technika poskytuje výhody, jako ...
Effects of dietary polyunsaturated fatty acids on myocardial and serum lipids in normoxic and chronically hypoxic rat heart
Balková, P.; Ježková, J.; Hlaváčková, M.; Neckář, Jan; Staňková, B.; Kolář, František; Novák, F.; Nováková, O.
2008 - English
Cílem práce bylo sledovat změny srdečních a sérových lipidů potkana po dlouhodobé dietě obohacené o n-3 a n-6 polynenasycené mastné kyseliny (PUFA) a adaptaci na chronickou intermitentní hypoxii (CIH). Studie ukázala, že jak dieta obohacená o PUFA tak CIH zásadně modifikují složení mastných kyselin v sledovaných lipidech a mohou souviset s potenciálními kardioprotektivními účinky obou intervencí The goal of this study was to fellow up the effect of n-3 and n-6 polyunsaturated fatty acids (PUFA) and the adaptation to chronic intermittent hypoxic (CIH) on fatty acid (FA) composition of serum and heart lipids in rats. The results of this study showed that PUFA diets and CIH distinctly modified FA profile in serum and heart lipids; both interventions considered to be cardioprotective
Keywords:
heart; chronic hypoxia; lipid diet
Available at various institutes of the ASCR
Effects of dietary polyunsaturated fatty acids on myocardial and serum lipids in normoxic and chronically hypoxic rat heart
Cílem práce bylo sledovat změny srdečních a sérových lipidů potkana po dlouhodobé dietě obohacené o n-3 a n-6 polynenasycené mastné kyseliny (PUFA) a adaptaci na chronickou intermitentní hypoxii ...
Quantification of Osteocyte Lacunar Density and Anisotropy of Vascular Canals in Compact Bone
Maštálková, K.; Tonar, Z.; Fiala, P.; Janáček, Jiří
2008 - English
Numerická hustota osteocytů v dřeni a kůře střední části lidské holenní kosti byla odhadnuta z tlustých řezů metodou disektoru. Anizotropie v rozmístění osteocytů byla prokázána metodou založenou na Deloneho triangulaci Numerical density of osteocyte lacunes in cortex and medula of diaphysis of tibia was estimated using thick sections and disector method. Anisotropy in lacunes localization was proved by a method based on Delaunay triangulation
Keywords:
osteocyte; disector
Available at various institutes of the ASCR
Quantification of Osteocyte Lacunar Density and Anisotropy of Vascular Canals in Compact Bone
Numerická hustota osteocytů v dřeni a kůře střední části lidské holenní kosti byla odhadnuta z tlustých řezů metodou disektoru. Anizotropie v rozmístění osteocytů byla prokázána metodou založenou na ...
Study of cognitive functions in animals and place avoidance tasks
Stuchlík, Aleš; Petrásek, Tomáš; Rambousek, Lukáš; Valeš, Karel
2008 - Czech
The paper describes basic methods and concepts in the studies of animal cognitive functions. It also summarizes recent assets and findings obtained with place avoidance tasks Článek pojednává o základních metodách studia kognitivních schopností zvířat. Rovněž shrnuje dosavadní přínosy úloh vyhýbání se místu u laboratorních potkanů
Keywords:
memory; cognition; place avoidance
Available at various institutes of the ASCR
Study of cognitive functions in animals and place avoidance tasks
The paper describes basic methods and concepts in the studies of animal cognitive functions. It also summarizes recent assets and findings obtained with place avoidance tasks
Error Assesment of Volume Reconstruction of Biological Specimen from Confocal Microscopy Images
Čapek, Martin; Janáček, Jiří; Kubínová, Lucie; Smrčka, P.; Hána, K.
2008 - English
Objemovou rekonstrukci využíváme pro vizualizaci biologických preparátů, které jsou větší, než je velikost zorného pole a/nebo silnější v tloušťce než je hloubka průniku laserového paprsku konfokálního mikroskopu. Tlusté preparáty je nutno nakrájet na fyzické řezy mikrotomem, avšak krájení způsobuje deformaci a ztrátu části informace prořezem, které vedou k chybám následné objemové rekonstrukce. Pro získání informace o deformaci jsme USB mikroskopem Dino-Lite zaznamenali řezné plochy preparátu zalitého v parafinu před jeho nakrájením, tj. bez deformací. Po nasnímání fyzických řezů vyhodnocujeme chybu deformace pomocí Prokrustovy vzdálenosti, která kvantifikuje střední kvadratickou vzdálenost tvarů vyjádřených pomocí bodů We performed both volume reconstructions using images captured by the USB microscope and images captured by the confocal microscope. We manually marked important corresponding structures in both reconstructed data sets, and computed distances between corresponding structures, assuming that structures in the reconstruction from USB microscope data are without deformations. According to our expectations, the main errors of high-resolution volume reconstruction (from confocal data) are in the direction of physical cutting (vary in units of millimeters) and in the direction perpendicular to cutting due to off-cut (vary in tenths of millimeters)
Keywords:
error assessment; volume reconstruction
Available at various institutes of the ASCR
Error Assesment of Volume Reconstruction of Biological Specimen from Confocal Microscopy Images
Objemovou rekonstrukci využíváme pro vizualizaci biologických preparátů, které jsou větší, než je velikost zorného pole a/nebo silnější v tloušťce než je hloubka průniku laserového paprsku ...
NRGL provides central access to information on grey literature produced in the Czech Republic in the fields of science, research and education. You can find more information about grey literature and NRGL at service web
Send your suggestions and comments to nusl@techlib.cz
Provider
Other bases