Calcium signalling and gene regulation by carcinogenic Orai mutants
LITVIŇUKOVÁ, Monika
2016 - anglický The main objective of this work is to define and characterize point mutations of the calcium channel Orai isolated form the large scale cancer genomic dataset. Those mutats were examined in the means of sub-cellular localization as well as functionality. Out of 17 investigated mutations, 5 were found to alter protein gating and switch the channel to partially or fully open state. Altered gating then leads to impaired signalling and uncontroled transcription. Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Calcium signalling and gene regulation by carcinogenic Orai mutants

The main objective of this work is to define and characterize point mutations of the calcium channel Orai isolated form the large scale cancer genomic dataset. Those mutats were examined in the means ...

LITVIŇUKOVÁ, Monika
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Infant handling in male Barbary macaques
KUBĚNOVÁ, Barbora
2017 - anglický Nemateřská manipulace s mláďaty u samců makaka magota přitahuje vědeckou pozornosti svou intenzitou v kombinaci s promiskuitou druhu, která by měla působit proti otcovské péči. Tato disertační práce se skládá ze čtyř studií, které zkoumají samčí manipulaci s mláďaty v skupině divoce žijících makaků v Maroku. Tyto studie jsou založeny na původních datech a výsledky poskytují nové informace o chování, a tím významně přispívají k jeho vysvětlení. Zaprvé nabízíme nový pohled na vztah mezi distribucí páření a manipulací, a ptáme se, zda jej lze vysvětlit jako otcovskou investici nebo snahou samců zvýšit šance na budoucí páření s matkami mláďat. Zadruhé poskytujeme nové detaily k vysvětlení triadických interakcí, při nichž dva samci společně manipulují s jedním mládětem. Zatřetí řešíme otázku, zda samci využívají znalosti o vztahu třetí strany při výběru partnerů pro triadické interakce. Začtvrté, práce ukazuje, že zájem samců manipulovat dokonce i s mláďaty pocházejícími z jiné skupiny může přispět k re-introdukci mláďat konfiskovaných z nelegálního obchodu. Non-maternal manipulation of infants also called infant handling in male Barbary macaques attracts scientific attention due to its intensity in combination with promiscuity of the species that should select against paternal care. This PhD thesis consists of four studies that investigate male infant handling in wild group of Barbary macaques in Morocco. The studies are based on original data and the results provide new information about the behaviour and thus significantly contribute to its explanation. First, we offer new insights into the relationship between distribution of mating and infant handling, and ask whether it can be better explained by paternal effort or future mating success with infants' mothers. Second, we broaden the range of explanations beyond the original hypothesis of relationship management for male-infant-male interactions. Third, we focus on the question whether males use knowledge of third party relationship when distributing infant handling interactions. Fourth, we demonstrate how care of infants can surprisingly contribute to the reintroduction of an infant who is not native in its group. Klíčová slova: Makak magot; manipulace s mláďaty; nemateřská péče; otcovská investice; pářicí úsilí; sociální vztahy; triadické interakce; znalost vztahů třetí strany; sociální inteligence Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Infant handling in male Barbary macaques

Nemateřská manipulace s mláďaty u samců makaka magota přitahuje vědeckou pozornosti svou intenzitou v kombinaci s promiskuitou druhu, která by měla působit proti otcovské péči. Tato disertační práce ...

KUBĚNOVÁ, Barbora
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2017

Nature and Naturalism in the Works of John Steinbeck/Příroda a naturalismus v dílech Johna Steinbecka
BENEŠOVÁ, Lucie
2013 - anglický Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Nature and Naturalism in the Works of John Steinbeck/Příroda a naturalismus v dílech Johna Steinbecka

BENEŠOVÁ, Lucie
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013

Assessment of water mutagenicity
ECKER, Jacqueline
2013 - anglický Vzhledem k některým vážným zdravotním a environmentálním problémům způsobeným mutagenními organickými polutanty je žádoucí stanovovat mutagenitu povrchových vod. Tato práce shrnuje literaturu zabývající se výskytem a technikami stanovení organických polutantů s mutagenním potenciálem. Navíc byly nalezeny vybrané organické polutanty v environmentálních vodách. Pro zakoncentrování bylo použito modré hedvábí, což je sorbent na bázi ftalocyaninu mědi vhodný pro zakoncentrování polycyklických aromatických sloučenin s mutagenním potenciálem. Since severe health and environmental problems are caused by mutagenic organic pollutants there are urgent needs for the determination of the mutagenicity of surface waters. This work summarizes the literature regarding the occurrence and determination techniques of organic pollutants with mutagenic potential. Additionally, some selected organic pollutants were quantified in surface waters. For pre-concentration Blue Rayon, a sorbent based on a copper phthalocyanine dye suitable for the concentration of polycyclic aromatic compounds with mutagenic potential, was used. Klíčová slova: mutagenicity; Blue Cotton; Blue Rayon; river water; genotoxicity; polycyclic aromatic hydrocarbons; nitrogen containing aromatic compounds Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Assessment of water mutagenicity

Vzhledem k některým vážným zdravotním a environmentálním problémům způsobeným mutagenními organickými polutanty je žádoucí stanovovat mutagenitu povrchových vod. Tato práce shrnuje literaturu ...

ECKER, Jacqueline
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013

Orientace ryb v podélném profilu nádrže Římov během dne: Následky pro horizontální akustické průzkumy
TUŠER, Michal
2013 - anglický Orientace ryb má důležité následky pro odhadování jejich skutečné velikosti z horizontálních akustických záznamů. Cílem této studie bylo ověřit předpoklad o náhodné orientaci ryb v jezerních částech nádrže Římov během dne a porovnat distibuce orientace ryb mezi jezerní a přítokovou částí. The orientation of fish has important consequences for estimating their true size from horizontal acoustic records. The aim of this study was to verify the assumption of randomly orientated fish in the lacustrine zone of the canyon-shaped Římov reservoir during daytime and to compare distributions of fish orientation between the lacustrine and tributary (riverine) zones. Klíčová slova: hydroakustika; orientace ryb; rybí poloha; sladkovodní; korytovitá údolní nádrž; denní doba Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Orientace ryb v podélném profilu nádrže Římov během dne: Následky pro horizontální akustické průzkumy

Orientace ryb má důležité následky pro odhadování jejich skutečné velikosti z horizontálních akustických záznamů. Cílem této studie bylo ověřit předpoklad o náhodné orientaci ryb v jezerních částech ...

TUŠER, Michal
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013

New potential antivirals against tick-borne encephalitis virus infection
VESELKOVÁ, Barbora
2013 - anglický The experimental work of the thesis was concentrated on studying of the inhibition effect of twenty-six chemical substances on tick-borne encephalitis virus. The substances showing inhibition effect in High Throughput Screening assay were processed to Cytotoxicity assay, where their toxic effect on tissue cell cultures was determined. Subsequently, substances with inhibition effect and no cytotoxic effect were incubated with cell culture and virus in two different incubation time periods and the supernatant containing virions was examined using plaque assay. Klíčová slova: tick-borne encephalitis virus; inhibition effect; HTS assay; Cytotoxicity assay; Plaque assay Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. New potential antivirals against tick-borne encephalitis virus infection

The experimental work of the thesis was concentrated on studying of the inhibition effect of twenty-six chemical substances on tick-borne encephalitis virus. The substances showing inhibition effect ...

VESELKOVÁ, Barbora
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013

Raman Microspectroscopy of Individual Algal Cells: Sensing Unsaturation of Storage Lipids in vivo
KOTAS, Petr
2013 - anglický We have demonstrated the potential of Raman microspectroscopy for the fast and spatially resolved characterization of the composition of selected intracellular regions in individual living cells of three algal species. In particular, we have focused on lipid storage bodies and quantified the degree of unsaturation of algal lipids (iodine value). To verify our results, we developed a method for extraction of storage lipids from highly resistant Trachidiscus minutus cells and determined the fatty acid composition using GC/MS. We have found Raman microspectroscopy to be a fast, versatile, and virtually non-invasive tool for evaluating the potential of different algal species for algal lipid engineering and industry. We have demonstrated the potential of Raman microspectroscopy for the fast and spatially resolved characterization of the composition of selected intracellular regions in individual living cells of three algal species. In particular, we have focused on lipid storage bodies and quantified the degree of unsaturation of algal lipids (iodine value). To verify our results, we developed a method for extraction of storage lipids from highly resistant Trachidiscus minutus cells and determined the fatty acid composition using GC/MS. We have found Raman microspectroscopy to be a fast, versatile, and virtually non-invasive tool for evaluating the potential of different algal species for algal lipid engineering and industry. Klíčová slova: Raman spectroscopy; algal cells; lipids; iodine value Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Raman Microspectroscopy of Individual Algal Cells: Sensing Unsaturation of Storage Lipids in vivo

We have demonstrated the potential of Raman microspectroscopy for the fast and spatially resolved characterization of the composition of selected intracellular regions in individual living cells of ...

KOTAS, Petr
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013

Populačně genetická struktura pstruha obecného jako základ úspěšného obhospodařování lososových vod ve střední Evropě
KOHOUT, Jan
2013 - anglický Za účelem vyhodnocení dopadu rybářského hospodaření na populace pstruha ve střední Evropě byla analyzována genetická struktura 25 divokých populací a pěti populací odebraných na líhních v České republice a na Slovensku. K tomu byly použity markery mitochondriální (kontrolní oblast) a jaderné (mikrosatelity, LDH-C1*) DNA. Z výsledků je patrné, že vysazování ryb různého původu způsobilo rozsáhlé křížení populací atlantického a dunajského původu a vedlo ke ztrátě variability mezi populacemi v povodí středního Dunaje na Moravě a na Slovensku. Změny genetické variability v důsledku vysazování byly zaznamenány také v populacích povodí horního Dunaje, Visly, Odry a Labe. Nicméně, populace v povodí Labe mají zachovaný určitý stupeň genetické odlišnosti a zdají se být mnohem méně ovlivněny rybářským obhospodařováním než populace dunajské. Dále byly analyzovány populace z dolních částí dunajského povodí za použití stejných mitochondriálních a mikrosatelitových markerů. Zahrnuty byly také populace z egejského úmoří, aby bylo možné vyhodnotit dopad rybářského hospodaření a porovnat jej s výsledky ze střední Evropy. Byla zjištěna pouze nízká úroveň introgrese z atlantických a jiných populací pstruha. Genetická diferenciace mezi populacemi východního Balkánu byla v porovnání s populacemi ze střední Evropy značně vyšší. Na základě mikrosatelitů byly analyzovány také populace z horních přítoků řeky Otavy a populace z líhně Borová Lada s cílem ověřit původ divokých populací v oblasti Národního parku a chráněné krajinné oblasti Šumava. Analyzované populace byly geneticky odlišitelné od dříve analyzovaných populací z povodí Labe a byly také vzájemně diferencované v důsledku geografické vzdálenosti a přítomnosti migračních bariér. Vysazování pstruha z líhně v Borových Ladech však mohlo také ovlivnit genetickou variabilitu analyzovaných populací. Populace z této líhně se vyznačuje vyšší genetickou proměnlivostí a je geneticky odlišná od populací z horních přítoků Otavy, což by mohlo být způsobeno jejím nejednotným původem. Porovnání analyzovaných populací s výsledky z jiných oblastí naznačuje, že mitochondriální haplotypy nalezené v populacích dolní části Dunajského povodí a jižní části úmoří Černého moře jsou značně odlišné od statisticky podpořené skupiny haplotypů z horního a středního Dunaje, povodí Kaspického moře a Aralského jezera. To dokazuje složitou evoluční historii pstruha v jižní a západní části úmoří Černého moře. The genetic structure of 25 wild populations and five hatchery stocks from Czech Republic and Slovakia were analysed using mitochondrial (control region) and nuclear DNA (microsatellites, LDH-C1*) markers to elucidate the impact of stocking on central European populations of brown trout and to outline further management strategies. It seems that stocking practices have caused massive hybridisation between the Atlantic and Danube brown trout populations in the middle Danube basin and have led to a loss of among-population genetic variability in Slovakia and Moravia. Certain effect of stocking was detected also in the upper Danube, Vistula, Oder and Elbe River basins. However, the populations from the Elbe River basin keep certain level of among-population variability and seem to be less affected by stocking in comparison with the Danube River basin populations. There are some indications of late or post-Pleistocene penetration of the Atlantic basin trout to the Danube River basin. However, it is not clear to which extent the natural contact participated to the present distribution of Atlantic haplotypes and alleles in the Danube River basin. Samples from lower parts of the Danube River basin were therefore analysed using the same mitochondrial and microsatellite markers. Samples from Aegean Sea basin were included in order to reveal genetic variability of eastern Balkan populations and to estimate an impact of stocking in this area. Very low levels of introgression from Atlantic and other non-indigenous trout were found in the eastern Balkan populations. The genetic differentiation among the populations is substantially higher in this area compared to the central European populations. The populations in headwaters of the Otava River (Elbe River basin) were analysed using microsatellites in order to reveal origin of these populations and evaluate the current management strategies of brown trout in Šumava National Park and Protected Landscape Area. The analysed populations were substantially differentiated from the remaining Elbe River basin populations and there was also certain level of genetic structure within trout from the headwaters of the Otava River associated with isolation by a migration barrier and geographic distance. However, stocking with hatchery trout also contributed to the pattern of genetic variability. The population of Borová Lada hatchery, which is used for stocking in Šumava exhibited higher genetic variability compared to the wild populations and it seems to be of heterogeneous origin. Comparisons of the analysed populations with populations from other areas and results from other studies indicated that mtDNA haplotypes from the lower Danube River and southern Black Sea basins differ considerably from a subclade of the Danubian lineage consisting of haplotypes found so far in the most of the Danube River basin and in the Caspian and Aral Sea basins. The results thus evidence a complex evolutionary history of brown trout in the southern and western parts of the Black Sea basin. Klíčová slova: pstruh obecný; populační genetika; mitochondriální DNA; mikrosatelity; LDH-C1* fylogeografie; introgrese Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Populačně genetická struktura pstruha obecného jako základ úspěšného obhospodařování lososových vod ve střední Evropě

Za účelem vyhodnocení dopadu rybářského hospodaření na populace pstruha ve střední Evropě byla analyzována genetická struktura 25 divokých populací a pěti populací odebraných na líhních v České ...

KOHOUT, Jan
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013

The Localization of the Mitochondrial Proteins MRP1, KREL2 and LSU1 of Trypanosoma brucei
KALTENBRUNNER, Sabine
2013 - anglický The aim of this thesis was to investigate the localization of the mitochondrial proteins MRP1, KREL2 and LSU1 of Trypanosoma brucei. Furthermore, the proper functioning of the eYFP-tagged protein MRP1 was investigated. The aim of this thesis was to investigate the localization of the mitochondrial proteins MRP1, KREL2 and LSU1 of Trypanosoma brucei. Furthermore, the proper functioning of the eYFP-tagged protein MRP1 was investigated. Klíčová slova: Trypanosoma brucei; mitochondria; MRP1; KREL2; LSU1 Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. The Localization of the Mitochondrial Proteins MRP1, KREL2 and LSU1 of Trypanosoma brucei

The aim of this thesis was to investigate the localization of the mitochondrial proteins MRP1, KREL2 and LSU1 of Trypanosoma brucei. Furthermore, the proper functioning of the eYFP-tagged protein MRP1 ...

KALTENBRUNNER, Sabine
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013

Individual features in vocalization of the Mashona mole-rat (\kur{Fukomys darlingi})
DVOŘÁKOVÁ, Veronika
2013 - anglický The significance of vocal communication in subterranean rodents was confirmed. In this study I tested whether vocalization of the Mashona mole-rats (Fukomys darlingi) differs individually and what information about signaller are these mole-rats able to obtain using only acoustic cues. The significance of vocal communication in subterranean rodents was confirmed. In this study I tested whether vocalization of the Mashona mole-rats (Fukomys darlingi) differs individually and what information about signaller are these mole-rats able to obtain using only acoustic cues. Klíčová slova: Mashona mole-rat; Fukomys darlingi; vocalization; individuality Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Individual features in vocalization of the Mashona mole-rat (\kur{Fukomys darlingi})

The significance of vocal communication in subterranean rodents was confirmed. In this study I tested whether vocalization of the Mashona mole-rats (Fukomys darlingi) differs individually and what ...

DVOŘÁKOVÁ, Veronika
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013