Počet nalezených dokumentů: 281
Publikováno od do

Fungi, Herbivores and Predators as Determinants of Secondary Succession in Tropical Rainforest
SZEFER, Piotr
2021 - anglický
Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Fungi, Herbivores and Predators as Determinants of Secondary Succession in Tropical Rainforest

SZEFER, Piotr
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2021

Low-temperature injury in insect tissues and mechanisms of its repair
ŠTĚTINA, Tomáš
2020 - anglický
Zatímco problematika fyziologických změn, která doprovází chladovou aklimaci hmyzu, byla relativně dobře prozkoumána v periodě před vystavením následnému chladovému stresu, procesům zotavení po vystavení chladovému stresu bylo věnováno mnohem méně pozornosti. K zachycení procesů probíhajících po vystavení chladovému stresu jsem použil širokého spektra technik fyziologických, molekulárně biologických a mikroskopických v larvách dvou druhů drosophilid - mrazově odolné Chymomyza costata a k mrazu náchylné Drosophila melanogaster. Několik útržků důkazů směřuje k narušené funkci mitochondrie v letálně mražených larvách. Mrazuvzdorný fenotyp C. costata si zachovává celistvost mitochondrie i po hlubokém zamražení. While physiological adjustments accompanying insect cold acclimation prior to cold stress have been relatively well explored, processes of recovery after cold stress received much less attention. Using a broad array of physiological, molecular biological and microscopic techniques, I aimed to capture the complexity of processes occurring after the exposure to cold stress in the larvae of two drosophilid species - freeze tolerant Chymomyza costata and freeze sensitive Drosophila melanogaster. Several lines of evidence pointed toward impaired mitochondrial functions in lethally frozen larvae. The freeze-tolerant phenotypes of C. costata retain integrity of mitochondria even after deep freezing. Klíčová slova: Drosophila melanogaster; Chymomyza costata; diapauza; chladová tolerance; mrazová tolerance; metabolomika; genová exprese; mitochondrie Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Low-temperature injury in insect tissues and mechanisms of its repair

Zatímco problematika fyziologických změn, která doprovází chladovou aklimaci hmyzu, byla relativně dobře prozkoumána v periodě před vystavením následnému chladovému stresu, procesům zotavení po ...

ŠTĚTINA, Tomáš
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2020

Dynamika rybničního ekosystému z hlediska produckční ekologie
RUTEGWA, Marcellin
2020 - anglický
S rostoucím zájmem o stav životního prostředí čelí chovatelé ryb výzvě spojující v sobě maximalizaci produkce ryb při současném zachování integrity ekosystému rybníků. V polointenzivně obhospodařovaných rybnících je produkce ryb založena na využití přírodního produkčního potenciálu ekosystému rybníka a doplňkového krmiva. Porozumění zdrojům a osudu vstupů v rybnících je zásadní pro posouzení účinnosti využití těchto vstupů, a tím ke snížení ztrát živin a organických látek. V České republice není ekologická integrita rybníků pravidelně posuzována, i když rybniční akvakultura zde představuje významnou ekonomickou činnost. Proto byla v letech 2014 až 2018 v rybníku Dehtář sledována kvalita vody na jeho přítoku, odtoku i ve vlastním tělese rybníku. Pro kvantifikaci zdrojů a osudů vstupů živin a organické hmoty v Dehtáři byly použity bilance živin a organického uhlíku. Posouzení metabolických rychlostí ekosystému, složení společenstva planktonu, efektivita využití vstupů živin a organického uhlíku a retence živin byly použity k posouzení vlivu rybářských praktik na strukturu a fungování ekosystému rybníka. Pro stanovení a porovnání hladin rozpuštěného a difuzního metanu (CH4) ze dvou typů rybníků (hlavní a plůdkové) lišících se ve velikosti chovaných jedinců (velikostních kohort) kapra obecného byl použit model přeshraniční vrstvy. Výsledky ukázaly, že rybník Dehtář se stal hypertrofním v důsledku praktikovaného rybářského managementu, konkrétně díky vysokým rybím obsádkám (včetně "plevelných" druhů ryb), aplikaci hnojení a doplňkového krmení. Ve společenstvech fytoplanktonu dominovaly druhy tolerantní k eutrofizaci, včetně toxických sinic. Větší druhy zooplanktonu z rybníka zmizely z důvodu vysokého vyžíracího tlaku ryb již během jara. Hlavními zdroji vstupů fosforu, dusíku a organického uhlíku do rybníka představovalo krmivo, přítok vody a primární produkce. Hlavním osudem dusíku a fosforu byla akumulace ve vodě a sedimentech, zatímco respirace byla hlavním osudem organického uhlíku. Účinnost využití vstupů živin byla srovnatelná s výsledky z jiných studií, ale efektivita využití vstupů organického uhlíku byla poněkud nižší. Obecně byla tato účinnost nízká kvůli špatné kvalitě a nízké stravitelnosti obilovin použitých jako krmivo pro ryby a také díky neschopnosti přenést primární produkci do biomasy ryb. Potenciál rybníka Dehtář udržet živiny je srovnatelný s jinými jezery a nádržemi mírného pásma. To lze vysvětlit vysokým množstvím do rybníka vstupujících živin, jejich asimilací rybami a fytoplanktonem, sedimentací a denitrifikací. Avšak během výlovu rybníka je část zadržených živin uvolněna a vypuštěna z rybníka do povodí. Dále bylo zjištěno, že nevyužitá organická hmota částečně podporuje i produkci metanu, který se pak uvolňuje do atmosféry. Koncentrace metanu byla v plůdkových rybnících vyšší než v hlavních rybnících, ale difuzní emise metanu se mezi těmito dvěma typy rybníků příliš nelišily. Na základě našich současných zjištění tak doporučujeme provádět více výzkumných činností směřujících k lepším (udržitelnějším) postupům při řízení rybničního hospodaření, které pomohou maximalizovat produkci ryb a současně minimalizovat rizika znečištění rybníků a jejich povodí. With the rise of environmental concerns, fish farmers are facing the challenge of maximizing fish production while maintaining the ecosystem integrity of fishponds. In semi-intensive ponds, fish production is based on the utilisation of the natural production potential of the pond ecosystem and supplementary feed. Understanding the sources and the fate of inputs in fishponds is crucial to assess the utilisation efficiency of these inputs and hence reduce nutrients and organic matter losses. Ecological integrity of ponds is not regularly assessed in the Czech Republic, where pond aquaculture is an important economic activity. Therefore, the quality of inflow, pond water and effluent were monitored in the Dehtář pond from 2014 to 2018. Nutrient and organic carbon budgets were used to quantify the sources and fates of nutrients and organic matter inputs in Dehtář. Assessment of ecosystem metabolic rates, plankton community composition, utilisation efficiency of nutrient and organic carbon inputs and nutrient retention were used to indicate the effect of fishery practices on the structure and functioning of the pond ecosystem. The transboundary layer model was used to determine and compare the levels of dissolved and diffusive methane (CH4) from two types of fishponds (main and nursery) differing in individual fish size of cultured common carp. The results showed that the Dehtář pond became hypereutrophic due to fishery management, namely high fish stock, associated weed fish, manuring and supplementary feeding. The phytoplankton assemblage was dominated by eutrophication tolerant species, including toxic cyanobacteria. Larger sized zooplankton disappeared from the pond due to the high grazing pressure of fish stock already in the spring. The major sources of phosphorus, nitrogen and organic carbon inputs to the pond were feed, water inflow and primary production, respectively. Accumulation in water and sediments were the main fate of nitrogen and phosphorus whereas respiration was the main fate of organic carbon. The utilisation efficiency of nutrient inputs was comparable to results from other studies but the utilisation efficiency of organic carbon inputs was rather lower. In general, this efficiency was low due to the poor quality and low digestibility of cereals used as fish feed and the inability to transfer the primary production to fish. The potential of the Dehtář pond to retain nutrients is comparable with other temperate lakes and reservoirs. This may be explained by a high load of nutrients, their assimilation by fish and phytoplankton, sedimentation and denitrification. However, during the fish harvest, part of the retained nutrients is released and discharged. Furthermore, it was found that unused organic matter partly fuels the production of methane, which is then released into the atmosphere. The methane concentration was higher in nursery ponds than in main ponds, but the diffusive methane emission did not differ much between the two types of ponds. Based on our present findings we highly recommend to conduct more research activities heading to more sustainable pond management practices that can maximize fish production while minimizing pollution risks in the fishponds and their catchments. Klíčová slova: dusík; efektivita využití vstupů; fosfor; metan; organický uhlík; potenciál znečištění; produkce ryb; produkce skleníkových plynů retence živin; rybníky Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Dynamika rybničního ekosystému z hlediska produckční ekologie

S rostoucím zájmem o stav životního prostředí čelí chovatelé ryb výzvě spojující v sobě maximalizaci produkce ryb při současném zachování integrity ekosystému rybníků. V polointenzivně ...

RUTEGWA, Marcellin
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2020

Excited state processes in linear conjugated systems
ŠEBELÍK, Václav
2020 - anglický
The main topics of this thesis are the excited states of carotenoids in solvents and in light-harvesting antennas. The first two chapters provide an introduction into the topic, while the later ones are the research chapters, based on published papers. In the research section, the different methods of ultrafast spectroscopy were used. Transient absorption spectroscopy, two-photon excitation, and pump-dump-probe experiments were used to explore the so-called dark states of carotenoids in solvents. The femtosecond dynamics of long polyenes was also studied by the transient absorption spectroscopy. In addition to the exploration of the nature of carotenoids and polyenes in solvents, the energy transfer in the CAC antenna of Rhodomonas salina was studied by transient absorption spectroscopy. The main topics of this thesis are the excited states of carotenoids in solvents and in light-harvesting antennas. The first two chapters provide an introduction into the topic, while the later ones are the research chapters, based on published papers. In the research section, the different methods of ultrafast spectroscopy were used. Transient absorption spectroscopy, two-photon excitation, and pump-dump-probe experiments were used to explore the so-called dark states of carotenoids in solvents. The femtosecond dynamics of long polyenes was also studied by the transient absorption spectroscopy. In addition to the exploration of the nature of carotenoids and polyenes in solvents, the energy transfer in the CAC antenna of Rhodomonas salina was studied by transient absorption spectroscopy. Klíčová slova: carotenoids; transient absorption spectroscopy; two-photon excitation; pump-dump-probe; polyenes; dark states Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Excited state processes in linear conjugated systems

The main topics of this thesis are the excited states of carotenoids in solvents and in light-harvesting antennas. The first two chapters provide an introduction into the topic, while the later ones ...

ŠEBELÍK, Václav
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2020

In vitro kultivace zárodečných kmenových buněk jesetera
XIE, Xuan
2020 - anglický
Tato studie se zabývá výzkumem biologie zárodečných buněk jesetera, včetně jejich charakterizace, purifikace a in vitro kultivace. Výzkumné cíle jsou: popis vlastností spermatogoniálních kmenových buněk a regulace spermatogeneze; hodnocení stávajících metod purifikace a in vitro kultivace zárodečných kmenových buněk ryb; výzkum in vitro množení zárodečných buněk jesetera; vývoj metody purifikace zárodečných buněk jesetera; identifikace spermatogonií typu A (ASG) u jesetera. Novost a vědecká originalita. Tato práce jako první vyvinula množení zárodečných buněk jesetera in vitro a zkombinovala buněčnou kultivaci a transplantaci. Aplikace monoklonálních protilátek a rozpoznání ASG jesetera representuje nový a v současné době jediný nástroj pro identifikaci zárodečných buněk. Důležitost řešení vědeckého problému v daném výzkumném oboru. Při práci kultivace zárodečných buněk byl pozorován efekt somatických buněk a růstových faktorů na proliferaci jeseteřích zárodečných buněk pomocí hodnocení mitotické aktivity zárodečných buněk během kultivace, která přispěla ke studiu regulačních mechanizmů sebeobnovy zárodečných buněk a jejich diferenciace. V této dizertační práci byly vyvinuty metody purifikace ASG jesetera pomocí průtokové cytometrie. Byla nalezena monoklonální protilátka umožňující specifickou identifikaci ASG jesetera. Teoretický význam a aplikační hodnota výsledků. Dizertační práce sumarizuje nahromaděné znalosti o spermatogoniálních kmenových buňkách a regulaci jejich sebeobnovení vs. diferenciace u ryb, porovnává dostupné protokoly a pokroky v izolaci spermatogonií a zhodnocuje vývoj podmínek in vitro kultivace zárodečných buněk. Efektivní izolace spermatogonií typu A bylo dosaženo na základě jejich fyzikálně-chemických vlastností, které jsou aplikovatelné pro komerční i ohrožené druhy ryb bez použití buněčných barvících systémů jako transgenoze nebo protilátky povrchu buňky. Monoklonální protilátky vytvořené pro tuňáka mohou rozpoznat také antigen ASG jesetera malého, naznačující, že epitopy pro ASG jsou mezi druhy konzervované. Tyto vědecké výsledky představují charakterizaci ASG na proteomické úrovni. Implementace vědeckých výsledků. Byly vyvinuté sérum prosté kultivační podmínky zárodečných buněk jesetera. Zárodečné buňky si v těchto in vitro podmínkách udržely růst, přežití a schopnost transplantace více než 40 dní. Předpokládá se, že tato metoda poskytne dlouhodobé zásobování zárodečných buněk k transplantacím a reprodukcí pomocí náhradních rodičů. Navíc, purifikované populace ASG byly izolovány na základě analýzy vlastností rozptylu světla zárodečných buněk. Pro sortování nebylo použito žádné barvivo ani transgenoze, což je výhodné pro další charakterizaci buněk a následné aplikace. Aplikace monoklonálních protilátek na ASG jesetera můžeme docílit přesné identifikace ASG v in vitro kulturách. The study in this thesis concerns a research area related to sturgeon germ cell biology including identification, purification and in vitro culture. The research objectives are: expounding fish spermatogonial stem cell characteristic and regulation of spermatogenesis; evaluation of the existent methods in fish germ cell purification and in vitro culture; investigation of in vitro amplification of sturgeon germ cells; development of an approach to purify germ cells in sturgeon; identification of type A spermatogonia (ASG) in sturgeon. Novelty and scientific originality. This work first time developed sturgeon germ cell growth in vitro and combined cell culture with transplantation. The application of monoclonal antibodies on recognition of sturgeon ASG represents a new, and currently only tool of germ cell identification. Important scientific problem solved in the field of research. This work of germ cell culture observed the effect of somatic cells and growth factors on the proliferation of sturgeon germ cells through evaluation of germ cell mitotic activity during culture, which contributed to the study on the regulation mechanism of germ cell self-renewal and differentiation. This thesis also developed a method using flow cytometry to purify sturgeon ASGs. A monoclonal antibody was also found that enable to identify ASGs of sturgeon specifically. Theoretical significance and applied value of the thesis. The thesis summarized the accumulated knowledge of spermatogonial stem cell and regulation of its self-renewal vs. differentiation in fish, compared available protocols and advances in enriching spermatogonia and reviewed development of in vitro germ cell culture conditions. The work of efficient enrichment of type A spermatogonia was achieved based on its physicochemical properties, which is applicable for commercial and endangered fishes without cell-labeling systems such as transgenes and cell antibodies. Monoclonal antibodies generated from Pacific blue fin tuna can also recognize antigens from sterlet ASGs, indicating some epitopes for ASGs are conserved between species. The research results present interest for characterization of ASGs in proteomics level. Implementation of scientific results. A serum-free culture condition for sturgeon germ cells was established. The germ cells under this in vitro condition can remain growth, survival and maintain their transplantability for more than 40 days. Therefore, this method is expected to provide a long term supply for germ cell transplantation and surrogate production. Moreover, based on the analysis of germ cell light scatter properties, a purified ASG population was isolated. No dye and transgenes are introduced during sorting, which is helpful for characterization of germ cell populations and downstream germ cell manipulation. The application of monoclonal antibody on sturgeon ASG can achieve the accuracy of the ASGs identification on in vitro culture. Klíčová slova: zárodečné buňky; spermatogonie; kultura zárodečných buněk; fluorescenčně aktivované sortování buněk; monoklonální protilátka; jeseter Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
In vitro kultivace zárodečných kmenových buněk jesetera

Tato studie se zabývá výzkumem biologie zárodečných buněk jesetera, včetně jejich charakterizace, purifikace a in vitro kultivace. Výzkumné cíle jsou: popis vlastností spermatogoniálních kmenových ...

XIE, Xuan
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2020

Hlubší náhled do genetických a fenotypových korelací mezi kvantitativními znaky se vztahem k produkci u kapra obecného
ZHAO, Jinfeng
2021 - anglický
Selekce má velký potenciál pro genetické zlepšování produkčních znaků v akvakultuře. Úspěšný rozvoj programů zaměřených na selekční šlechtění v chovu kapra obecného čelí řadě výzev. V mnoha případech stále chybí základní informace o fenotypových a genetických parametrech ekonomicky významných znaků. Proto se tato práce hlouběji zaměřuje na genetické a fenotypové korelace mezi produkčními kvantitativními znaky u amurského lysce (AL), plemene kapra obecného, chovaného v rybničních podmínkách. Zvýšení rychlosti růstu je obvykle hlavním cílem ve šlechtitelských programech většiny druhů zvířat. U AL bylo zjištěno, že selekcí na rychlejší růst můžeme ovlivnit i) obsah svalového tuku, ale skutečná změna obsahu tuku bude záviset na určitých podmínkách a dále ii) výtěžnosti (podíly) jedlých částí těla. Naopak selekcí na rychlejší růst pravděpodobně neovlivníme přežívání ryb a jejich odolnost vůči koi herpes viróze (KHV). Doporučuje se, aby dosažená hmotnost byla zahrnuta jako váha do selekčního indexu v případě realizace selekce na zvýšení podílu jateční výtěžnosti. Obsah svalového tuku je další produkční znak, který hraje důležitou roli v biologických a fyziologických procesech kapra obecného. U AL bylo zjištěno, že svalový tuk kapra obecného by se nepřímo zvýšil ve všech následujících obdobích při selekci ryb na vyšší hmotnost po druhém roce odchovu. Zajímavé bylo, že výše obsahu tuku ve svalovině není úměrná schopnosti přezimování kaprů, neboť byla nalezena negativní genetická korelace mezi obsahem svalového tuku a přežitím během druhého a třetího vegetačního období. Selekce na nižší obsah tuku by paradoxně mohla zvýšit přežití ryb bez ovlivnění rychlosti jejich růstu. Přežití je dalším důležitým užitkovým znakem u kapra obecného. Podpora zvyšování množství tuku ve svalovině, a s tím související zvyšování obsahu tuku a bílkovin v hepatopankreatu (HP) může být pro přežití kapra nevýhodné, a to přinejmenším za podmínek, kdy je výhodnější udržovat si v HP vyšší hladinu glykogenu a s tím související vyšší hodnoty hepatosomatického indexu (HSI). Přežívání AL bychom mohli nepatrně zlepšit selekcí ryb na vyšší Fultonův kondiční koeficient (FK) po druhém zimním období. KHV je v současné době asi nejzávažnější virové onemocnění v chovu kaprů. Odolnost ryb vůči KHV lze zvýšit i selekcí. Bylo zjištěno, že většina genetických korelací mezi odolností ryb vůči KHV a dalšími produkčními znaky (růst, obsah tuku, zimní přežití a energetické zásoby) byla zanedbatelná. Selekce na důležité produkční znaky by tedy neměla zhoršit odolnost AL vůči KHV. Naopak při selekci na nižší FK, relativní délku hlavy, relativní výšku těla a relativní šířku těla nebo naopak na vyšší podíly jedlých částí těla bychom mohli odolnost vůči KHV ovlivnit v pozitivním směru. Z tohoto pohledu je zajímavý ukazatel FK. Při selekci na vyšší FK u AL bychom mohli zlepšit celkovou vitalitu a užitkovost růstu ryb. Odolnosti AL vůči KHV bychom ale spíše snížily. Ukazatele jateční výtěžnosti jsou znaky zajímavé u druhů ryb, které se prodávají ve zpracovaném stavu (opracovaný trup či filety). Bylo zjištěno, že pro selekci na vyšší podíly jedlých částí lze kromě odhadu těchto podílů s využitím 2D a 3D dokumentačních a zobrazovacích metod a ultrazvuku využít i poměrně jednoduché ukazatele měřitelné jen ultrazvukem a měrnou deskou. Vzhledem k dobrým genetickým korelacím mezi těmito jednoduchými prediktory ve věku ryb dvou a tří let je možné provádět selekci na vyšší podíly jedlých částí těla u AL u ryb ve dvou letech. To by snížilo potřebu krátkodobých skladovacích kapacit a usnadnilo vlastní selekci (čas a potřeba lidských zdrojů). Je však třeba mít na paměti, že při selekci na vyšší podíly jedlých částí těla můžeme ovlivnit tvar těla a obsah svalového tuku. Selective breeding has large potential for genetic improvement of production traits in the aquaculture. However, basic knowledge is lacking about phenotypic and genetic parameters for economically important traits for development of selective breeding programs of common carp. Thus, genetic and phenotypic relationships of production-related quantitative traits were investigated in Amur mirror breed of common carp under the pond management condition. Growth is usually the first goal in breeding programs of different species. Selection for faster growth, may affect muscle fat content but the real change will depend on conditions and slaughter yields and it would not affect survival, susceptibility of fish to koi herpesvirus disease (KHVD). In addition, body weight should be integrated in a selection index to avoid a negative impact on growth when selecting for slaughter yields. Muscle fat content is a production trait playing an important role in biological functions of common carp. Muscle fat of common carp would indirectly increase in all subsequent periods by selection on higher body weight in all periods before the second winter. High muscle fat might not be the best for good overwintering in common carp due to negative genetic correlation between muscle fat content and survival during the second and third growing season and that selective breeding for restricted fat content may increase survival without affecting harvest weight. Survival is an important economic trait related to performance of common carp. Keeping excessive muscle fat, hepatopancreas (HP) fat and protein might be disadvantageous for carp survival, at least under conditions where ability of keeping higher level of HP glycogen and hepato-somatic index (HSI) is better. In addition, selection for higher Fulton's condition factor (FC) after the second overwintering should lead to slight increase of survival. KHVD is currently the most serious threat to global carp farming. Improvement of genetic resistance of carp strains through selection can be the most effective method. Most genetic correlations between KHVD resistance and important production traits (e.g., growth, muscle fat content, winter survival and energy reserves) were insignificant, showing that selective breeding program for important production traits would not affect the KHVD resistance of carp and vice versa. Selection for lower FC, relative head length, relative body height or relative body width, with a more prolonged body shape of Amur mirror carp being associated with higher KHVD resistance and selection for improved slaughter yields could positively affect resistance to KHVD and vice versa. Including FC into selection program of common carp could be advantageous for general fish vitality and performance but may have reverse effect on resistance of fish to KHVD. Slaughter yields are traits of high interest especially for fish species sold in processed form like headless carcass or fillet. Slaughter yields predicting models as well as some simple predictors in common carp recorded using combination of 3D landmarks and ultrasound imagery or ultrasound only were highly heritable and strongly genetically related to real yields and may be used in indirect selection program. Due to good genetic correlations between simple predictors in age of two and three years, selection of Amur mirror carp could be done at size of fish that requires less storage capacity and time. However, it should be remembered that selection for slaughter yields may affect body shape, muscle fat content and resistance of fish to KHVD. Klíčová slova: selekční programy; genetické parametry; růst; energetické zásoby; svalový tuk; přežití; KHV; jateční výtěžnost Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Hlubší náhled do genetických a fenotypových korelací mezi kvantitativními znaky se vztahem k produkci u kapra obecného

Selekce má velký potenciál pro genetické zlepšování produkčních znaků v akvakultuře. Úspěšný rozvoj programů zaměřených na selekční šlechtění v chovu kapra obecného čelí řadě výzev. V mnoha případech ...

ZHAO, Jinfeng
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2021

Functional analysis of cryoprotectant system in Chymomyza costata
GRGAC, Robert
2023 - anglický
In this study, employing an integrated approach that involves transcriptomics, metabolomics, and other techniques, we aimed to understand the mechanistic roles of the cryoprotective system underlying extreme freeze tolerance in the larvae of the drosophilid fly, Chymomyza costata. Metabolomics unveiled the complex composition of the seasonally accumulated larval innate mixture of putative cryoprotectants. This mixture was predominantly composed of proline and trehalose, supplemented by minor components (glutamine, asparagine, betaine, sarcosine, glycerophospho-choline, and ethanolamine). We identified food ingestion as a significant source for the direct assimilation of amino compounds, while glycogen and phospholipids served as the primary internal sources for the biosynthesis of other cryoprotectants. The utilization of MALDI-MSI to observe cryoprotectants revealed distinct behaviors of proline and trehalose during ecologically relevant, gradual inoculative extracellular freezing of larvae. Trehalose exhibited accumulation in partially dehydrated hemolymph, inducing a transition to the amorphous glass phase. On the other hand, proline migrated to the boundary between extracellular ice and dehydrated hemolymph and tissues, forming a layer of dense viscoelastic liquid. Finally, through a combination of in vivo and in vitro assays, we found that cell membranes are likely targets of freezing injury, while their integrity is sustained by accumulated small cryoprotective molecules and proteins in cold-acclimated C. costata larvae. Contrary to our expectations, our assays did not provide support for the hypothesis that proteins (soluble enzymes) require in vivo stabilization through the accumulation of cryoprotectants. In this study, employing an integrated approach that involves transcriptomics, metabolomics, and other techniques, we aimed to understand the mechanistic roles of the cryoprotective system underlying extreme freeze tolerance in the larvae of the drosophilid fly, Chymomyza costata. Metabolomics unveiled the complex composition of the seasonally accumulated larval innate mixture of putative cryoprotectants. This mixture was predominantly composed of proline and trehalose, supplemented by minor components (glutamine, asparagine, betaine, sarcosine, glycerophospho-choline, and ethanolamine). We identified food ingestion as a significant source for the direct assimilation of amino compounds, while glycogen and phospholipids served as the primary internal sources for the biosynthesis of other cryoprotectants. The utilization of MALDI-MSI to observe cryoprotectants revealed distinct behaviors of proline and trehalose during ecologically relevant, gradual inoculative extracellular freezing of larvae. Trehalose exhibited accumulation in partially dehydrated hemolymph, inducing a transition to the amorphous glass phase. On the other hand, proline migrated to the boundary between extracellular ice and dehydrated hemolymph and tissues, forming a layer of dense viscoelastic liquid. Finally, through a combination of in vivo and in vitro assays, we found that cell membranes are likely targets of freezing injury, while their integrity is sustained by accumulated small cryoprotective molecules and proteins in cold-acclimated C. costata larvae. Contrary to our expectations, our assays did not provide support for the hypothesis that proteins (soluble enzymes) require in vivo stabilization through the accumulation of cryoprotectants. Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Functional analysis of cryoprotectant system in Chymomyza costata

In this study, employing an integrated approach that involves transcriptomics, metabolomics, and other techniques, we aimed to understand the mechanistic roles of the cryoprotective system underlying ...

GRGAC, Robert
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2023

Evolúcia socio-kultúrnych adaptací člověka: Fylogenetická medzi-kultúrna perspektíva
ŠAFFA, Gabriel
2023 - anglický
This thesis investigates the adaptive significance of seemingly maladaptive human behaviors or cultural norms that are often viewed as responses to intra- and inter-sexual conflict. It combines behavioral ecological approach with phylogenetic comparative methods to study evolutionary origins and maintenance of these practices, using samples of ethnographically documented human societies. The thesis is divided into three sections. The first section is the introduction to evolutionary sciences of human behavior, including an overview of the theoretical perspectives and a critical evaluation of the methodological approaches to macro-evolutionary studies of human behavior and culture. The second section consists of three chapters - two published research papers and a manuscript that is currently under review. The first paper investigates female and male genital mutilation/cutting practices, their evolutionary history, and socio-ecological correlates; the second paper investigates restrictions on female premarital sex and evaluates the three hypotheses explaining them - male, female, and parental control hypothesis; the third paper investigates the causes of socially imposed monogamy and evaluates the competing hypotheses explaining its prevalence in stratified, agricultural societies. The last section summarizes the results of the three studies and concludes with perspectives of future research. Klíčová slova: adaptation; causal inference; cultural evolution; human behavioral ecology; phylogenetics; regression Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Evolúcia socio-kultúrnych adaptací člověka: Fylogenetická medzi-kultúrna perspektíva

This thesis investigates the adaptive significance of seemingly maladaptive human behaviors or cultural norms that are often viewed as responses to intra- and inter-sexual conflict. It combines ...

ŠAFFA, Gabriel
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2023

The study of the phylogeny and taxonomy of selected genera of Erebidae (Lepidoptera; Noctuoidea) as a tool for understanding of origin of the Afrotropical moth fauna
IGNATEV, Nikolai
2024 - anglický
In this thesis, I conducted the taxonomical and phylogenetical research of selected Afrotropical moth genera, especially an Old-World moth genus Amerila, Walker 1855. All the studied genera belong to the family Erebidae (Lepidoptera; Noctuoidea) and are well-presented in the state European entomological collections. In our research, we used mitochondrial, or mitochondrial and nuclear markers and different molecular analyses to resolve relationships within the studied genera (exclude Meganaclia, Aurivillius 1892). Comparative morphological analysis was used in all the studies. We aimed to update the classification of studied Lepidoptera genera, and to highlight the gaps in taxonomical study of Afrotropical moth fauna in general. Klíčová slova: arctiinae; ancestral state reconstruction; integrative taxonomy; morphological characters Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
The study of the phylogeny and taxonomy of selected genera of Erebidae (Lepidoptera; Noctuoidea) as a tool for understanding of origin of the Afrotropical moth fauna

In this thesis, I conducted the taxonomical and phylogenetical research of selected Afrotropical moth genera, especially an Old-World moth genus Amerila, Walker 1855. All the studied genera belong to ...

IGNATEV, Nikolai
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Optimalizace metod hormonální indukce ovulace u hospodářsky významných druhů ryb
ŠVINGER, Viktor William
2013 - anglický
Značná asynchronnost pohlavního dozrávání je pro lososovité ryby charakteristická a z různých důvodů může být výtěrová sezóna rozložená až do čtyřměsíčního období(většinou však 3 týdny až 2 měsíce, jako je tomu u sivena amerického či síha peledě). Pro dosažení vysoké oplozenosti a přežití jiker se důrazně doporučuje selektovat ovulující jikernačky z generačního hejna alespoň dvakrát týdně, což znamená při velkém počtu jikernaček a dlouhé výtěrové sezóně značnou spotřebu lidské práce, stresování a riziko poškození generačních ryb. Zajištění generačních ryb pro produkci dostatečného množství násadového materiálu sibiřského lipana arktického je prováděno odlovem generačních ryb z volných vod před nástupem výtěrové sezóny. Odlov a dlouhodobý odchov divokých ryb je značně problematický, stresující a spojený s vysokou předvýtěrovou mortalitou. Kromě vysokého synchronizačního efektu lze GnRHa rovněž využít k indukci ovulace 1?1,5 měsíce před přirozeným termínem výtěrového období. Cílem této práce bylo optimalizovat metody hormonálně řízené reprodukce pomocí GnRHa u sivena amerického, síha peledě a lipana arktického. Protože se jedná o první záznam o využití GnRHa u těchto druhů, důraz byl kladen na optimalizaci dávky hormonu, metody podání a posouzení vedlejšího účinku hormonálního zásahu na povýtěrovou mortalitu jikernaček, velikost a životaschopnost jiker. Podobně jako u ostatních salmonidů, aplikace GnRHa velmi účinně synchronizuje nástup ovulace u sivena amerického a síha peledě. To dává managementu líhní přesnou informaci, ve kterém dni jikernačky dosáhly ovulace a podle toho lze přesně naplánovat výtěrové práce. K těmto účelům je u obou druhů nejvhodnější použít dvojitou akutní injekci v dávce 25 ?g.kg-1 syntetického analogu ?-Arg6,Pro9-NHEt-sGnRHa aplikovanou 2?3 dny po sobě, nebo injikaci 25 ?g.kg-1 emulgovaného ?-Arg6,Pro9-NHEt-sGnRHa ve Freundově inkompletním adjuvanciu, což zaručuje jeho postupné uvolňování s efektivnější stimulací sekrece LH a injikaci není nutné opakovat. U lipana arktického účinně indukovala dvojitá akutní injekce 10 ?g.kg-1 ?-Tle6,Pro9-NHEtmGnRHa (Supergestran?) ovulaci 1?1,5 měsíce před přirozeným výtěrovým obdobím, což umožnilo rychlý výtěr a návrat divokých generačních ryb do volné vody. Použití jednorázové akutní (okamžité) dávky se ukázalo ve všech případech jako neúčinné nebo velmi nespolehlivé, a proto jej nelze doporučit. V žádném případě nebyl zjištěn negativní vliv GnRHa nebo GnRHa-FIA na povýtěrovou mortalitu generačních jikernaček. Nutno připomenout, že dle znění zákona č. 166/1999 Sb. ,o veterinární péči a o změně některých souvisejících zákonů (veterinární zákon), musí injekční procedury vykonávat pouze veterinární lekař, anebo ním pověřená osoba v jeho přítomnosti. Hormonální zásah s využitím GnRHa má vedlejší účinky a mění kvalitu jiker. Kromě sivena amerického bylo přežití jiker vždy signifikantně nižší (o 5?20 %) od injikovaných jikernaček. Zvyšující se dávka hormonu v námi použitých rozmezích neměla na přežití jiker žádný vliv. Bez ohledu na dávku a metodu podání hormonu byla velikost jiker, a tím i velikost váčkového plůdku od hormonálně ošetřených jikernaček salmonidů vždy redukována oproti těm, které pocházejí od jikernaček neošetřených. Snížená velikost jiker však není důvodem jejich horšího přežívání. Obecně naše výsledky jen zvyšují heterogenitu doposud známých výsledků prací, zabývajících se hodnocením vlivu hormonálních zásahů na kvalitu jiker. Na základě dosavadních experimentálních designů nelze s určitostí identifikovat a eliminovat skutečnou příčinu těchto vedlejších účinků. Vyřešení těchto problémů by mělo být prioritou pro další výzkum. Extensive asynchrony of sexual maturation is characteristic of salmonid females, and, for various reasons, the spawning season can be extended for 4 months, although it generally extends over a 3 week to 2 month period, as in brook trout and northern whitefish. In aquaculture, to ensure high fertilization and egg survival rates, it is recommended that identification of ovulating females be undertaken at least twice weekly. This is time-consuming when keeping large numbers of broodstock with an extended spawning season, and risk of stress damage to fish increases. Ensuring sufficient Arctic grayling broodstock relies on capture of wild animals from natural waters before onset of the spawning season. Capture and long-term holding of wild stocks is associated with high pre-spawning mortality. Due to the high ovulation synchronizing effect, GnRHa is practical for induction of ovulation 1?1.5 months prior to the natural spawning season. This work focused on optimization of methods of hormone-controlled reproduction using GnRHa in brook trout, northern whitefish, and Arctic grayling from Siberia. Because this is the first report of use of GnRHa in these species, emphasis was on optimization of the hormone dose and delivery method along with assessment of effects of GnRHa treatment on postspawning broodstock mortality, egg size, and egg viability. As in other salmonids, GnRHa treatment effectively synchronizes the onset of ovulation in brook trout and northern whitefish. This gives accurate information about ovulatory status of the broodstock and enables planning of the stripping schedule. The most convenient methods were the double acute injection at 25 ?g.kg-1 ?-Arg6,Pro9-NHEt-sGnRHa administered 3 days apart and injection of 25 ?g.kg-1 of emulsified ?-Arg6,Pro9-NHEt-sGnRHa in Freund´s incomplete adjuvant, which prolongs and more effectively stimulates LH secretion and requires only a single injection. Double acute injection at 10 ?g.kg-1 of ?-Tle6,Pro9-NHEt-mGnRHa (Supergestran) was sufficient to induce ovulation in Arctic grayling 1?1.5 months prior to natural spawning, and enabled accelerated stripping and return of wild broodstock to their natural habitat. Single acute injection proved to be ineffective or unreliable in most cases and therefore cannot be recommended. No negative effect of GnRHa or GnRHa-FIA treatments on post-spawning mortality of broodstock was observed. It has to be noted that that to the extent of law Nr. 166/1999 statute book (Czech veterinary law)injective procedures can be carried out just by the veterinarian or by a verinarian-authorized person in veterinarian presence. GnRHa treatment has side-effects and alters egg quality. Apart from in brook trout, egg survival was significantly lower (5?20%) in treated females. Increased hormone dose did not influence egg survival at the levels tested. Egg and hatchling size was lower in treated females compared to untreated specimens irrespective of dose or hormone delivery method. Reduced egg size is, however, not the likely source of reduced viability. In general, our results corroborate results of studies dealing with assessment of effects of hormone treatment on egg quality. Based on current experimental designs it is impossible to identify the cause of the side-effects with certainty. Solving this problem should be priority for future research. Klíčová slova: Salmonidé; GnRHa; ovulace; synchronizace; kvalita jiker Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU.
Optimalizace metod hormonální indukce ovulace u hospodářsky významných druhů ryb

Značná asynchronnost pohlavního dozrávání je pro lososovité ryby charakteristická a z různých důvodů může být výtěrová sezóna rozložená až do čtyřměsíčního období(většinou však 3 týdny až 2 měsíce, ...

ŠVINGER, Viktor William
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013

O službě

NUŠL poskytuje centrální přístup k informacím o šedé literatuře vznikající v ČR v oblastech vědy, výzkumu a vzdělávání. Více informací o šedé literatuře a NUŠL najdete na webu služby.

Vaše náměty a připomínky posílejte na email nusl@techlib.cz

Provozovatel

http://www.techlib.cz

Facebook

Zahraniční báze