Mannan-BAM, TLR ligands, and anti-CD40 immunotherapy in established murine pancreatic adenocarcinoma: understanding therapeutic potentials and limitations
VENHAUEROVÁ, Anna
2023 - anglický The aim of this RNDr. Thesis is focused on understanding therapeutic potentials and limitations of the antitumor MBTA immunotherapy which is based on synergy of TLR agonists, anti-CD40, and phagocytosis stimulating ligands anchored into the tumor cell membranes. In this study, immunotherapy was tested in murine pancreatic adenocarcinoma Panc02 model. Firstly, the short-term and long-term efficacy of MBTA therapy was tested using established subcutaneous Panc02 tumors two times larger than in previous study. Secondly, the work is devoted to better understanding of the adaptive immunity involvement focusing on CD4+ and CD8+ T lymphocytes during the therapy and their effect on tumor volume reduction, long-term survival and resistance against tumor rechallenge. Subsequently, the ability of immunological memory to cross over the blood-brain barrier confirming its potential applicability in metastatic brain tumors was examined. Moreover, the antigen specificity of the immunological memory was evaluated. Finally, the potential of MBTA therapy to cure metastatic disease, represented by bilateral Panc02 mouse model, was studied. In this case, the MBTA therapy manifested a lower therapeutic response. Therefore, it was combined with diverse therapeutic approaches, such as intratumoral application of anti-CTLA-4 antibody, heat-killed Listeria monocytogenes, chemoablation using EtOH, targeting the tumor microenvironment by hyaluronidase, simultaneous injections of MBTA therapy in primary and secondary distant tumors, and its combination with RT. Despite all these combinations, our results showed that only simultaneous application of MBTA therapy into both tumors has potential for the treatment of the bilateral Panc02. The aim of this RNDr. Thesis is focused on understanding therapeutic potentials and limitations of the antitumor MBTA immunotherapy which is based on synergy of TLR agonists, anti-CD40, and phagocytosis stimulating ligands anchored into the tumor cell membranes. In this study, immunotherapy was tested in murine pancreatic adenocarcinoma Panc02 model. Firstly, the short-term and long-term efficacy of MBTA therapy was tested using established subcutaneous Panc02 tumors two times larger than in previous study. Secondly, the work is devoted to better understanding of the adaptive immunity involvement focusing on CD4+ and CD8+ T lymphocytes during the therapy and their effect on tumor volume reduction, long-term survival and resistance against tumor rechallenge. Subsequently, the ability of immunological memory to cross over the blood-brain barrier confirming its potential applicability in metastatic brain tumors was examined. Moreover, the antigen specificity of the immunological memory was evaluated. Finally, the potential of MBTA therapy to cure metastatic disease, represented by bilateral Panc02 mouse model, was studied. In this case, the MBTA therapy manifested a lower therapeutic response. Therefore, it was combined with diverse therapeutic approaches, such as intratumoral application of anti-CTLA-4 antibody, heat-killed Listeria monocytogenes, chemoablation using EtOH, targeting the tumor microenvironment by hyaluronidase, simultaneous injections of MBTA therapy in primary and secondary distant tumors, and its combination with RT. Despite all these combinations, our results showed that only simultaneous application of MBTA therapy into both tumors has potential for the treatment of the bilateral Panc02. Klíčová slova: cancer immunotherapy; immunology; cancer; pancreatic adenocarcinoma; TLR agonists; anti-CD40; phagocytosis Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Mannan-BAM, TLR ligands, and anti-CD40 immunotherapy in established murine pancreatic adenocarcinoma: understanding therapeutic potentials and limitations

The aim of this RNDr. Thesis is focused on understanding therapeutic potentials and limitations of the antitumor MBTA immunotherapy which is based on synergy of TLR agonists, anti-CD40, and ...

VENHAUEROVÁ, Anna
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2023

Predictive relevance of miR.34a, miR.224 and miR.342 in patients with advanced squamous cell carcinoma of the lung undergoing palliative chemotherapy
HOUFKOVÁ, Kateřina
2017 - anglický Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Predictive relevance of miR.34a, miR.224 and miR.342 in patients with advanced squamous cell carcinoma of the lung undergoing palliative chemotherapy

HOUFKOVÁ, Kateřina
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2017

Anti-tumour necrosis factor activity in saliva of various tick species and its appearance during the feeding period
REZKOVÁ, Markéta
2018 - anglický Tumour necrosis factor (TNF) is one of the most important pro-inflammatory cytokines of the innate immune system. We compared the presence of anti-TNF activity in saliva or salivary gland extract from 11 tick species from the family Ixodidae and demonstrated it in genera Ixodes and Haemaphysalis. We also tested dynamics of this specific activity in Ixodes ricinus saliva. The highest effect of saliva appears at the end of feeding period. Significance of anti-TNF activity for tick feeding and transmission of tick-borne pathogens is discussed. Tumour necrosis factor (TNF) is one of the most important pro-inflammatory cytokines of the innate immune system. We compared the presence of anti-TNF activity in saliva or salivary gland extract from 11 tick species from the family Ixodidae and demonstrated it in genera Ixodes and Haemaphysalis. We also tested dynamics of this specific activity in Ixodes ricinus saliva. The highest effect of saliva appears at the end of feeding period. Significance of anti-TNF activity for tick feeding and transmission of tick-borne pathogens is discussed. Klíčová slova: ixodid ticks; cytokine; immunomodulation Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Anti-tumour necrosis factor activity in saliva of various tick species and its appearance during the feeding period

Tumour necrosis factor (TNF) is one of the most important pro-inflammatory cytokines of the innate immune system. We compared the presence of anti-TNF activity in saliva or salivary gland extract ...

REZKOVÁ, Markéta
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2018

Genome stability of human induced pluripotent stem cells
ŘEHÁKOVÁ, Daniela
2018 - anglický Lidské indukované pluripotentní kmenové buňky (hiPSCs) nabízejí využití v regenerativní medicíně i modelování onemocnění. Je ovšem podstatné, aby jejich genom zůstal nezměněn a jejich mechanismy opravy DNA byly funkční. V této práci se soustředím na detekci dvouřetězcových zlomů DNA (DSBs) pomocí fosforylovaného histonu H2AX a proteinu 53BP1, a to v několika liniích hiPSCs, jejich zdrojových buňkách, lidských embryonálních kmenových buňkách a buňkách diferencovaných z hiPSCs. sledovala jsem spontánně vytvořené DSB během procesů reprogramace, dlouhodobé kultivace a diferenciace. Pro porovnání reparační kapacity jsem vyvolala poškození pomocí gamma záření a sledovala snížení množství zlomů v čase. Množství ohnisek tvořených sledovanými proteiny bylo sledováno pomocí fluorescenční mikroskopie odděleně pro G1 a S/G2 fázi buněčného cyklu. Zdrojové buňky obsahovaly nízké množství DSBs nesouvisejících s replikací, jejich počet se zvýšil po reprogramaci do hiPSCs a snížil s dlouhodobou kultivací či diferenciácí. Indukce zlomů odhalila, že replikační mechanismy fungují dobře ve zdrojových buňkách a hiPSCs o nízké pasáži, ovšem částečně selhává u hiPSCs ve vysoké pasáži. Tato pozorování naznačují, že buněčné přeprogramování zvýší množství DSBs, ovšem reparační mechanismy fungují. Dlouhodobou kultivací se však schopnost opravovat DSBs snižuje. Human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) play roles in both disease modeling and regenerative medicine. It is critical that the genomic integrity of the cells remains intact and that the DNA repair systems are fully functional. I focused on the detection of DNA double-strand breaks (DSBs) by phosphorylated histone H2AX (known as H2AX) and p53-binding protein 1 (53BP1) in multiple lines of hiPSCs, their source cells, human embryonic stem cells (hESCs) and cells differentiated from hiPSCs. I measured spontaneously occurring DSBs throughout the process of reprogramming and during long-term in vitro culture and differentiation process. To assess the variations in the functionality of the DNA repair system among the samples, the number of DSBs induced by gamma irradiation and the decrease over time was analyzed. The foci number was detected by fluorescence microscopy separately for the G1 and S/G2 cell cycle phases. Source cells contained a low number of non-replication-related foci, while this number increased after reprogramming into hiPSCs and then decreased again after long-term in vitro passaging or differentiation. The artificial induction of DSBs revealed that the repair mechanisms function well in the source cells and hiPSCs at low passages but fail to recognize a substantial proportion of DSBs at high passages. Observations suggest that cellular reprogramming increases the DSB number but that the repair mechanism functions well. However, with long-term hipSCs culture reparation capacity decreases. Klíčová slova: iPSCs; kmenové buňky; dvouřetězové zlomy; dlouhodobá kultivace; H2AX Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Genome stability of human induced pluripotent stem cells

Lidské indukované pluripotentní kmenové buňky (hiPSCs) nabízejí využití v regenerativní medicíně i modelování onemocnění. Je ovšem podstatné, aby jejich genom zůstal nezměněn a jejich mechanismy ...

ŘEHÁKOVÁ, Daniela
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2018

Telomeric DNA sequences in beetle taxa vary with species richness
PRUŠÁKOVÁ, Daniela
2022 - anglický (TTAGG)n je běžnou telomerickou sekvencí u hmyzu, ale není univerzální, což platí zejména u brouků. Tato studie ukazuje, že tato sekvence byla opakovaně ztracena a nahrazena buďto dvěma známými alternativními telomerickými sekvencemi, (TCAGG)n a (TTAGGG)n, nebo zcela jinými neznámými alternativami. Sekvence (TTGGG)n nalezená v jednom taxonu brouků byla navržena jako nová kandidátní sekvence. Telomerické motivy u mnoha dalších druhů brouků však zůstávají neobjevené. Celkově naše rozsáhlé mapování telomerických motivů ukázalo, že diverzita pozitivně koreluje s druhovou bohatostí taxonů bez ohledu na stáří taxonů. (TTAGG)n sequence is an ancestral common telomere motif in insects, yet not ubiquitous, especially in beetle lineage. This study indicates that this sequence has been repeatedly lost and replaced by two known alternative telomeric motifs, the (TCAGG)n and (TTAGGG)n, or other unknown alternatives. (TTGGG)n found in one taxa has been proposed as a novel candidate sequence. However, telomeric motifs in many other beetle species remain still undiscovered. Taken together, our extensive mapping of telomeric motifs showed that the diversity is positively related to the species richness of taxa, regardless of the age of the taxa. Klíčová slova: coleoptera; beetles; telomeres; diversity Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Telomeric DNA sequences in beetle taxa vary with species richness

(TTAGG)n je běžnou telomerickou sekvencí u hmyzu, ale není univerzální, což platí zejména u brouků. Tato studie ukazuje, že tato sekvence byla opakovaně ztracena a nahrazena buďto dvěma známými ...

PRUŠÁKOVÁ, Daniela
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2022

Fylogeografické zhodnocení hraboše východoevropské s ohledem k východokazašskému výskytu
VOLFOVÁ, Tereza
2019 - anglický The Eastern European vole (Microtus mystacinus) is an arvicoline rodent distributed across northern and eastern Europe, the Balkans, Turkey, Armenia, NW and N Iran, Russia as far east as the Tobol River in W Siberia, and W and N Kazakhstan. We present a novel records from eastern Kazakhstan (the village of Dzhambul - 49 14 21.3N, 86 18 29.9E and the village of Sekisovka - 50 21 9.18N, 82 35 46.5E) based on mtDNA and we discuss implications of this findings on biogeography of eastern Kazakhstanpopulations. Marine Isotope Stage 11 is considered an important period for the diversification of the arvalis species group. In the context of our study, it is important to analyse genetically discontinuous Siberian populations, and the current distribution of M. mystacinus in new localities in eastern Kazakhstan. Klíčová slova: Microtus mystacinus; Kazakhstan Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Fylogeografické zhodnocení hraboše východoevropské s ohledem k východokazašskému výskytu

The Eastern European vole (Microtus mystacinus) is an arvicoline rodent distributed across northern and eastern Europe, the Balkans, Turkey, Armenia, NW and N Iran, Russia as far east as the Tobol ...

VOLFOVÁ, Tereza
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2019

Water content components, desiccation and recovery in \kur{Sphagnum} mosses
HÁJEK, Tomáš
2008 - anglický Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Water content components, desiccation and recovery in \kur{Sphagnum} mosses

HÁJEK, Tomáš
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2008

Direct detection of digestive enzymes in planktonic rotifers using enzyme-labelled fluorescence (ELF)
ŠTROJSOVÁ, Martina
2008 - anglický Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Direct detection of digestive enzymes in planktonic rotifers using enzyme-labelled fluorescence (ELF)

ŠTROJSOVÁ, Martina
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2008

Cytoskelet vazebné velké RNP komplexy u samčího gametofytu tabáku (EPPs) jsou asociované s ribosomy a účastní se syntézy proteinů, jejich zpracování a lokalizaci
REŇÁK, David
2011 - anglický Předkládaná práce se zabývá studiem složení a funkce skladovaných ribonukleoproteinových částic (EPPs) u samčího gametofytu tabáku. EPP částice slouží jako dlouhodobá zásoba mnoha druhů mRNA molekul, ribosomů, cytoskeletálních proteinů a dalších komponent. Ty jsou syntetizovány během zrání pylu, udržovány v netranslatovaném stavu a postupně využívány v proteosyntéze v progamické fázi k podpoře rychlého růstu pylových láček. In the presented work the composition and function of stored ribonucleo-protein particles (EPPs) in tobacco male gametophyte was studied. EPP particles serve as a long-term store of various mRNA molecules, ribosomal and cytoskeletal proteins and other components. They are synthesized during the pollen maturation, kept untranlated and gradually used in proteosynthesis in progamic phase to support the rapid pollen tube growth. Klíčová slova: Ribonukleoproteinové částice; translační regulace; pyl; samčí gametofyt; ribosomy; mRNA; cytoskelet Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. Cytoskelet vazebné velké RNP komplexy u samčího gametofytu tabáku (EPPs) jsou asociované s ribosomy a účastní se syntézy proteinů, jejich zpracování a lokalizaci

Předkládaná práce se zabývá studiem složení a funkce skladovaných ribonukleoproteinových částic (EPPs) u samčího gametofytu tabáku. EPP částice slouží jako dlouhodobá zásoba mnoha druhů mRNA molekul, ...

REŇÁK, David
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2011

\kur{Daphnia galeata} in the deep hypolimnion: spatial differentiation of a "typical epilimnetic" species
KOLÁŘOVÁ, Kateřina
2008 - anglický Plné texty jsou dostupné v digitálním repozitáři JČU. \kur{Daphnia galeata} in the deep hypolimnion: spatial differentiation of a "typical epilimnetic" species

KOLÁŘOVÁ, Kateřina
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2008