Check heredity performance test of Warmblooded horses
CIVIŠOVÁ, Hana
2016 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Check heredity performance test of Warmblooded horses

CIVIŠOVÁ, Hana
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Phylogeography and conservation genetics of endangered saproxylic beetles in Europe
DRAG, Lukáš
2016 - Czech This thesis introduces the use of molecular methods for the conservation of several species of endangered saproxylic beetles in Europe. It focuses on the questions related to the DNA preservation and microsatellites development, as well as the evolutionary history and conservation of threatened species. Using the combination of mitochondrial and nuclear markers, the genetic diversity and reintroduction history of Cerambyx cerdo was assessed and the phylogeography of Rosalia alpina from the whole range of its distribution was studied. This information is valuable for designing more efficient conservation strategies. This thesis introduces the use of molecular methods for the conservation of several species of endangered saproxylic beetles in Europe. It focuses on the questions related to the DNA preservation and microsatellites development, as well as the evolutionary history and conservation of threatened species. Using the combination of mitochondrial and nuclear markers, the genetic diversity and reintroduction history of Cerambyx cerdo was assessed and the phylogeography of Rosalia alpina from the whole range of its distribution was studied. This information is valuable for designing more efficient conservation strategies. Keywords: insect ecology; Natura 2000; Coleoptera; Osmoderma barnabita; Europe; mtDNA; cytochrom c oxidase; beech forest; Fagus sylvatica; population genetics; insect ecology; Natura 2000; Coleoptera; Osmoderma barnabita; Europe; mtDNA; cytochrom c oxidase; beech forest; Fagus sylvatica; population genetics Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Phylogeography and conservation genetics of endangered saproxylic beetles in Europe

This thesis introduces the use of molecular methods for the conservation of several species of endangered saproxylic beetles in Europe. It focuses on the questions related to the DNA preservation and ...

DRAG, Lukáš
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Monitoring of nest parameters and a eggs predation of Reed Warbler (\kur{Acrocephalus scirpaceus}) at selected localities in PLA Třeboňsko
ZÁRUBOVÁ, Marie
2016 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Monitoring of nest parameters and a eggs predation of Reed Warbler (\kur{Acrocephalus scirpaceus}) at selected localities in PLA Třeboňsko

ZÁRUBOVÁ, Marie
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Schopnost šíření a uchycování rostlin a jejich vliv na druhové složení lučních společenstev
VÍTOVÁ, Alena
2016 - Czech Mechanisms maintaining species diversity in managed meadows are not still well understood. To assess the effect of several important factors on species composition of meadow communities, species regeneration abilities were studied in the course of several years. The research was based on manipulative experiments, where species establishment and survival in seed addition experiments as well as during natural regeneration was observed. By comparison of species establishment in intact and disturbed vegetation, effect of dispersal limitation, abiotic conditions and competition was assessed as well as regeneration ability of different functional groups. Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Schopnost šíření a uchycování rostlin a jejich vliv na druhové složení lučních společenstev

Mechanisms maintaining species diversity in managed meadows are not still well understood. To assess the effect of several important factors on species composition of meadow communities, species ...

VÍTOVÁ, Alena
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Infant handling in male Barbary macaques
KUBĚNOVÁ, Barbora
2017 - English Non-maternal manipulation of infants also called infant handling in male Barbary macaques attracts scientific attention due to its intensity in combination with promiscuity of the species that should select against paternal care. This PhD thesis consists of four studies that investigate male infant handling in wild group of Barbary macaques in Morocco. The studies are based on original data and the results provide new information about the behaviour and thus significantly contribute to its explanation. First, we offer new insights into the relationship between distribution of mating and infant handling, and ask whether it can be better explained by paternal effort or future mating success with infants' mothers. Second, we broaden the range of explanations beyond the original hypothesis of relationship management for male-infant-male interactions. Third, we focus on the question whether males use knowledge of third party relationship when distributing infant handling interactions. Fourth, we demonstrate how care of infants can surprisingly contribute to the reintroduction of an infant who is not native in its group. Nemateřská manipulace s mláďaty u samců makaka magota přitahuje vědeckou pozornosti svou intenzitou v kombinaci s promiskuitou druhu, která by měla působit proti otcovské péči. Tato disertační práce se skládá ze čtyř studií, které zkoumají samčí manipulaci s mláďaty v skupině divoce žijících makaků v Maroku. Tyto studie jsou založeny na původních datech a výsledky poskytují nové informace o chování, a tím významně přispívají k jeho vysvětlení. Zaprvé nabízíme nový pohled na vztah mezi distribucí páření a manipulací, a ptáme se, zda jej lze vysvětlit jako otcovskou investici nebo snahou samců zvýšit šance na budoucí páření s matkami mláďat. Zadruhé poskytujeme nové detaily k vysvětlení triadických interakcí, při nichž dva samci společně manipulují s jedním mládětem. Zatřetí řešíme otázku, zda samci využívají znalosti o vztahu třetí strany při výběru partnerů pro triadické interakce. Začtvrté, práce ukazuje, že zájem samců manipulovat dokonce i s mláďaty pocházejícími z jiné skupiny může přispět k re-introdukci mláďat konfiskovaných z nelegálního obchodu. Keywords: Makak magot; manipulace s mláďaty; nemateřská péče; otcovská investice; pářicí úsilí; sociální vztahy; triadické interakce; znalost vztahů třetí strany; sociální inteligence Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Infant handling in male Barbary macaques

Non-maternal manipulation of infants also called infant handling in male Barbary macaques attracts scientific attention due to its intensity in combination with promiscuity of the species that should ...

KUBĚNOVÁ, Barbora
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2017

Biosystematic revision of the Spergularia echinosperma complex
KÚR, Pavel
2017 - Czech This thesis is focused on the biosystematic study of the Central-European endemic Spergularia echinosperma. With the combined use of morphometric analyses, genome size measurements and molecular tools, the taxonomic issues associated with this species have been clarified. The existence of S. kurkae, a stable allotetraploid hybrid between diploid S. echinosperma and tetraploid S. rubra, has been proven. Based on several lines of evidence, including distinct morphological separation and frequent occurrence in the absence of the parental species, treating S. kurkae as a separate species is proposed. In addition, two infraspecific taxa within S. echinospermaS. echinosperma subsp. echinosperma and S. echinosperma subsp. albensisdiffering in distributions and ecology have been described. A complete revision of the localities of S. echinosperma, S. kurkae and S. rubra in the Czech Republic is also presented. Furthermore, the development of 16 polymorphic microsatellite loci for S. echinosperma is reported. Práce se zabývá biosystematickou studií středoevropského endemita Spergularia echinosperma. S použitím morfometrických analýz, měření velikosti genomu a molekulárních nástrojů byla osvětlena taxonomická problematika tohoto druhu. Byla potvrzena existence taxonu S. kurkae, což je stabilní allotetraploidní hybrid mezi diploidním druhem S. echinosperma a tetraploidním druhem S. rubra. Na základě vícero důkazů, včetně jednoznačné morfologické odlišitelnosti a častého výskytu bez přítomnosti rodičovských druhů, je navrženo uznání S. kurkae jako samostatného druhu. Navíc byly popsány dva vnitrodruhové taxony uvnitř druhu S. echinosperma - S. echinosperma subsp. echinosperma a S. echinosperma subsp. albensis - lišící se rozšířením a ekologií. Rovněž je předložena kompletní revize lokalit druhů S. echinosperma, S. kurkae a S. rubra v České republice. Nadto práce obsahuje příspěvek zabývající se vývojem 16 mikrosatelitních markerů pro druh S. echinosperma. Keywords: allopolyploidie; endemit; hybridizace; morfometrika; průtoková cytometrie; Spergularia; taxonomie; allopolyploidy; endemism; hybridization; morphometrics; flow cytometry; Spergularia; taxonomy Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Biosystematic revision of the Spergularia echinosperma complex

This thesis is focused on the biosystematic study of the Central-European endemic Spergularia echinosperma. With the combined use of morphometric analyses, genome size measurements and molecular ...

KÚR, Pavel
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2017

Study of antimicrobial activities of tuber proteins and peptides from selected potato genotypes (\kur{Solanum} spp.)
VLAČIHOVÁ, Andrea
2017 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Study of antimicrobial activities of tuber proteins and peptides from selected potato genotypes (\kur{Solanum} spp.)

VLAČIHOVÁ, Andrea
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2017

Molecular markers as a tool for assessing genetic resources of rapeseed oil and selecting autoincompatible plants
JOZOVÁ, Eva
2017 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Molecular markers as a tool for assessing genetic resources of rapeseed oil and selecting autoincompatible plants

JOZOVÁ, Eva
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2017

CIRCADIAN GENES AND REGULATION OF DIAPAUSE IN INSECT
BAJGAR, Adam
2013 - Czech This thesis considers various roles of circadian clock genes in insect physiology. Application of molecular-biology methods in Pyrrhocoris apterus, non-model insect species, enable us to investigate involvement of circadian clock genes in photoperiod induced physiological responses. We discover involvement of neuroendocrine cells, and a role of Juvenile hormone (JH) signalization in transduction of photoperiodic signalization to peripheral tissues. We found new principles of JH signal diversification in tissue specific manner, and in addition described molecular mechanism of photoperiod induced changes in gut physiology. Comparison of gut and fat body tissue reveals that mechanism observed in the gut is tissue specific, and that circadian clock genes exhibit tissue specific functional pleiotropic effect. Keywords: Circadian clock genes; cry; Pdp; diapause induction; JH signalization; ovary development; Photoperiod Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. CIRCADIAN GENES AND REGULATION OF DIAPAUSE IN INSECT

This thesis considers various roles of circadian clock genes in insect physiology. Application of molecular-biology methods in Pyrrhocoris apterus, non-model insect species, enable us to investigate ...

BAJGAR, Adam
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013

Populačně genetická struktura pstruha obecného jako základ úspěšného obhospodařování lososových vod ve střední Evropě
KOHOUT, Jan
2013 - English The genetic structure of 25 wild populations and five hatchery stocks from Czech Republic and Slovakia were analysed using mitochondrial (control region) and nuclear DNA (microsatellites, LDH-C1*) markers to elucidate the impact of stocking on central European populations of brown trout and to outline further management strategies. It seems that stocking practices have caused massive hybridisation between the Atlantic and Danube brown trout populations in the middle Danube basin and have led to a loss of among-population genetic variability in Slovakia and Moravia. Certain effect of stocking was detected also in the upper Danube, Vistula, Oder and Elbe River basins. However, the populations from the Elbe River basin keep certain level of among-population variability and seem to be less affected by stocking in comparison with the Danube River basin populations. There are some indications of late or post-Pleistocene penetration of the Atlantic basin trout to the Danube River basin. However, it is not clear to which extent the natural contact participated to the present distribution of Atlantic haplotypes and alleles in the Danube River basin. Samples from lower parts of the Danube River basin were therefore analysed using the same mitochondrial and microsatellite markers. Samples from Aegean Sea basin were included in order to reveal genetic variability of eastern Balkan populations and to estimate an impact of stocking in this area. Very low levels of introgression from Atlantic and other non-indigenous trout were found in the eastern Balkan populations. The genetic differentiation among the populations is substantially higher in this area compared to the central European populations. The populations in headwaters of the Otava River (Elbe River basin) were analysed using microsatellites in order to reveal origin of these populations and evaluate the current management strategies of brown trout in Šumava National Park and Protected Landscape Area. The analysed populations were substantially differentiated from the remaining Elbe River basin populations and there was also certain level of genetic structure within trout from the headwaters of the Otava River associated with isolation by a migration barrier and geographic distance. However, stocking with hatchery trout also contributed to the pattern of genetic variability. The population of Borová Lada hatchery, which is used for stocking in Šumava exhibited higher genetic variability compared to the wild populations and it seems to be of heterogeneous origin. Comparisons of the analysed populations with populations from other areas and results from other studies indicated that mtDNA haplotypes from the lower Danube River and southern Black Sea basins differ considerably from a subclade of the Danubian lineage consisting of haplotypes found so far in the most of the Danube River basin and in the Caspian and Aral Sea basins. The results thus evidence a complex evolutionary history of brown trout in the southern and western parts of the Black Sea basin. Za účelem vyhodnocení dopadu rybářského hospodaření na populace pstruha ve střední Evropě byla analyzována genetická struktura 25 divokých populací a pěti populací odebraných na líhních v České republice a na Slovensku. K tomu byly použity markery mitochondriální (kontrolní oblast) a jaderné (mikrosatelity, LDH-C1*) DNA. Z výsledků je patrné, že vysazování ryb různého původu způsobilo rozsáhlé křížení populací atlantického a dunajského původu a vedlo ke ztrátě variability mezi populacemi v povodí středního Dunaje na Moravě a na Slovensku. Změny genetické variability v důsledku vysazování byly zaznamenány také v populacích povodí horního Dunaje, Visly, Odry a Labe. Nicméně, populace v povodí Labe mají zachovaný určitý stupeň genetické odlišnosti a zdají se být mnohem méně ovlivněny rybářským obhospodařováním než populace dunajské. Dále byly analyzovány populace z dolních částí dunajského povodí za použití stejných mitochondriálních a mikrosatelitových markerů. Zahrnuty byly také populace z egejského úmoří, aby bylo možné vyhodnotit dopad rybářského hospodaření a porovnat jej s výsledky ze střední Evropy. Byla zjištěna pouze nízká úroveň introgrese z atlantických a jiných populací pstruha. Genetická diferenciace mezi populacemi východního Balkánu byla v porovnání s populacemi ze střední Evropy značně vyšší. Na základě mikrosatelitů byly analyzovány také populace z horních přítoků řeky Otavy a populace z líhně Borová Lada s cílem ověřit původ divokých populací v oblasti Národního parku a chráněné krajinné oblasti Šumava. Analyzované populace byly geneticky odlišitelné od dříve analyzovaných populací z povodí Labe a byly také vzájemně diferencované v důsledku geografické vzdálenosti a přítomnosti migračních bariér. Vysazování pstruha z líhně v Borových Ladech však mohlo také ovlivnit genetickou variabilitu analyzovaných populací. Populace z této líhně se vyznačuje vyšší genetickou proměnlivostí a je geneticky odlišná od populací z horních přítoků Otavy, což by mohlo být způsobeno jejím nejednotným původem. Porovnání analyzovaných populací s výsledky z jiných oblastí naznačuje, že mitochondriální haplotypy nalezené v populacích dolní části Dunajského povodí a jižní části úmoří Černého moře jsou značně odlišné od statisticky podpořené skupiny haplotypů z horního a středního Dunaje, povodí Kaspického moře a Aralského jezera. To dokazuje složitou evoluční historii pstruha v jižní a západní části úmoří Černého moře. Keywords: pstruh obecný; populační genetika; mitochondriální DNA; mikrosatelity; LDH-C1* fylogeografie; introgrese Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Populačně genetická struktura pstruha obecného jako základ úspěšného obhospodařování lososových vod ve střední Evropě

The genetic structure of 25 wild populations and five hatchery stocks from Czech Republic and Slovakia were analysed using mitochondrial (control region) and nuclear DNA (microsatellites, LDH-C1*) ...

KOHOUT, Jan
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013