Vztahy mezi úrovní ploidie, velikostí genomu a velikostí buňky v sérii modelů ryb ploidní úrovně od 2n do 14n
BYTYUTSKYY, Dmytro
2014 - English The ploidy level of diploid and induced triploid tench, Tinca tinca, was verified using flow cytometry to determine relative DNA content of 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI)-stained erythrocyte nuclei. The C-value (haploid nuclear DNA content; pgDNA.nucleus-1) of these same individuals was determined by means of Feulgen image analysis densitometry, in comparison to the chicken standard (Gallus gallus domesticus; 1.25 pgDNA.nucleus-1, P < 0.05), using three different approaches. Highly similar mean C-values were obtained, thus confirming the possibility of using tench blood as standard in European pond aquaculture for ploidy and DNA content determination in fishes. Feulgen image analysis densitometry (FIAD), flow cytometry (FC) and confocal laser scanning microscopy (CLSM) were used to study the relationship between the DNA content (pgDNA.nucleus-1), nuclear area (?m2), nuclear volume (?m3) and 3-D structure of erythrocyte nuclei in a series of fish ploidy level models: diploid tench (Tinca tinca) (2n), Cuban gar (Atractosteus tristoechus) (2n), triploid tench (3n), evolutionary tetraploid sterlet (Acipenser ruthenus) and stellate sturgeons (A. stellatus) (4n), evolutionary octaploid Siberian sturgeon (A. baerii) and Russian sturgeon (A. gueldenstaedtii) (8n), spontaneous triploid Siberian and Russian sturgeons exhibiting dodecaploidy (12n), evolutionary 12n shortnose sturgeon (A. brevirostrum), and experimentally obtained sturgeon hybrids that were tetraploid, hexaploid (6n), heptaploid (7n), octaploid (8n), decaploid (10n), dodecaploid (12n) and/or tetradecaploid (14n). Standards used for FIA were blood smears of chicken (2.5 pgDNA.nucleus-1), diploid and induced triploid tench (2.04 and 3.1 pgDNA.nucleus-1, respectively). All ploidy levels were first verified by means of FC. Increase in ploidy was accompanied by growth of the nucleus and an increase in the number of flattened ellipsoid nuclei with increased transverse diameter. The volume (Vvoxel) of erythrocyte nuclei, as the sum of voxels calculated from live cells, seems more accurate than volume (Vaxis) calculated from measuring the major and minor axis, especially at higher and odd ploidy levels. Data of absolute and relative DNA content were in agreement with previously published reports. Species of the same ploidy level, however differing in their DNA content, exhibited a similar mean erythrocyte nuclear area, as could be demonstrated on A. ruthenusand and A. stellatus (19.27 and 19.79 ?m2 with a respective mean DNA content of 3.72 and 4.68 pgDNA.nucleus-1) and volume as could be demonstrated on a A. ruthenus and hybrid of A. ruthenus and H. huso(48.3 and 48.9 ?m3 with a respective mean DNA content of 3.74 and 3.10 pg DNA.nucleus-1). Similar relationship was found for the ploidy 6n, 8n, 10n, 12n. The 0.46-1.58 pgDNA increments in DNA content of erythrocytes thus had no effect on their nuclear area/volume. With increasing ploidy level, the DNA concent ration (pgDNA per 1 ?m3 of erythrocyte nuclear volume) as well as surface-to-volume ratio was found not to increase linearly. Nuclear DNA content appeared to be more condensed with an increase of the ploidy level. Observed results deduce properties of whole cell and particularly of the nuclei in series of ploidy levels fishes, adding conformations of nucleotypic hypothesis in context of cell/nuclear size and genome size relationships, as well as taxonomic position of sturgeons. Ploidní úroveň diploidního a indukovaně triploidního lína obecného, Tinca tinca, byla ověřena průtokovou cytometrií s určením relativního obsahu DNA v jádrech erytrocytů barvených 4',6-diamidin-2-fenylindolem (DAPI). C-hodnota (haploidní obsah jaderné DNA; pgDNA.jádro-1) týchž jedinců byla stanovena analýzou obrazu pro denzitometrická měření buněčných jader v preparátech barevných Feulgenovou reakcí (FIAD) ve srovnání se standardem kura domácího (Gallus gallus domesticus; 1,25 pgDNA.jádro-1, P < 0,05) třemi postupy. Získány byly vysoce podobné průměrné C-hodnoty, potvrzující možnost využít krev lína jako standard v evropské rybniční akvakultuře pro určení ploidie a obsahu DNA u ryb. Obrazová cytometrie FIAD, průtoková cytometrie (FC) a konfokální laserová skenovací mikroskopie (CLSM) byly využity ke studiu vztahů mezi obsahem DNA (pgDNA.jádro-1), plochou jádra (?m2), objemem jádra (?m3) a 3-D strukturou jader erytrocytů v sérii ploidních modelů ryb: diploidů lína obecného (Tinca tinca) (2n), kostlína kubánského (Atractosteus tristoechus) (2n), triploidního lína obecného (3n), evolučně tetraploidního jesetera malého (Acipenser ruthenus) a j. hvězdnatého (A. stellatus) (4n), evolučně oktaploidního j. sibiřského (A. baerii) a j. ruského (A. gueldenstaedtii) (8n), spontánních triploidů j. sibiřského a j. ruského vykazujjících evoluční dodekaploidii (12n), evolučně dodekaploidního j. krátkorypého (A. brevirostrum), a experimentálně získaných jeseteřích hybridů, kteří byli tetraploidní, hexaploidní (6n), heptaploidní (7n), oktaploidní, dekaploidní (10n), dodekaploidní a/nebo tetradekaploidní (14n). Standardy použitýmí pro FIAD byly krevní nátěry kura domácího (obsah 2,5 pgDNA.jádro-1), diploidní a indukovaně triploidní lín obecný (2,04 a 3,1 pgDNA.jádro-1). Všechny ploidní úrovně byly nejprve ověřeny pomocí FCM. Nárůst ploidní úrovně byl doprovázen zvětšením jádra a zvýšením počtu zploštělých eliptických jader se zvětšeným příčným průměrem. Objem (Vvoxel) jádra erytrocytu jako suma voxelů počítaná u živých buněk se jeví jako přesnější hodnota než objem (Vaxis) vypočtený z měření dlouhé a krátké osy jádra, zvláště u vyšších a lichých ploidních úrovní. Údaje o absolutním a relativním obsahu DNA byly v souladu s dříve publikovanými zprávami. Druhy téže ploidní úrovně, jakkoli se lišící obsahem DNA, vykazovaly podobnou plochu jádra erytrocytu, jak lze ukázat na A. ruthenus a A. stellatus (19,27 a 19,79 ?m2 při průměrném absolutním obsahu 3,72 a 4,68 pgDNA.jádro-1) a podobný objem jádra erytrocytu, jak lze ukázat na A. ruthenus a hybridu A. ruthenus x H. huso (48,3 a 48,9 ?m3 při průměrném absolutním obsahu 3,74 a 3,10 pg DNA. jádro -1). Podobné vztahy byly shledány u ploidních úrovní 6n, 8n, 10n, 12n. Nárůst 0,46 - 1,58 pgDNA v obsahu DNA jader erytrocytů neměl vliv na změnu plochy jádra. Se zvyšující se ploidní úrovní bylo shledáno, že koncentrace DNA (pgDNA na 1 ?m3 objemu jádra erytrocytu) a poměr povrchu jádra k jeho objemu se nezvětšují lineárně. Jaderná DNA je s nárůstem ploidní úrovně stále více kondenzována. Získané výsledky odvozují vlastnosti celých buněk a částečně i jader buněk řady různých ploidních druhů ryb a potvrzují hypotézy o nukleotipickém vztahu velikosti buněk a jejich jader ve vztahu k velikosti genomu a stejně tak taxonomické pozici jeseterů. Keywords: jeseter; lín; erytrocyt; obsah DNA; ploidie; objem jádra; DNA cytometrie; 3D konfokální analýza Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Vztahy mezi úrovní ploidie, velikostí genomu a velikostí buňky v sérii modelů ryb ploidní úrovně od 2n do 14n

The ploidy level of diploid and induced triploid tench, Tinca tinca, was verified using flow cytometry to determine relative DNA content of 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI)-stained erythrocyte ...

BYTYUTSKYY, Dmytro
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2014

Produkční účinnost technologicky upravených obilovin v chovu tržních kaprů
MÁSÍLKO, Jan
2014 - English Common carp (Cyprinus carpio L.) is one of the most important cultivated fish species over the world. In the Czech Republic, the production of carps by pond aquaculture farming has a long tradition and a non-interchangeable appearance in the cultural landscape. The production is mainly executed in semi-intensive systems, were a combination of natural feed with additional feeding of cereals is applied. Mostly all available cereals are used for supplemental feeding. Due to that cereals represent one of the most important economic factors in the business. It is estimated that these cost can be around 30 35% of total costs within the carp farming. A possibility to reduce these costs is to increase the production efficiency of the cereals, using a suitable technological pre-treatment. The chosen technological treatment should be simple, cheap and easy available for the common practice in fishery. This thesis examined technological treatments of cereals. The main management and production data were examined in respective to the economy. Also the possible impact on the environment of different treatmented cereals in pond aquaculture, especially balance of total phosphorus was evaluated as well as the impact of on flesh quality and the textural properties of carp, respectively. Kapr obecný (Cyprinus carpio L.) je jednou z nejdůležitějších sladkovodních ryb chovaných na světě. Na našem území resp. v České republice má chov kapra dlouholetou tradici a nezaměnitelnou tvář v rybniční akvakultuře. Tato produkce je dosahována při použití převážně polo-intenzivního způsobu chovu tzn. kombinací přirozené potravy a přikrmování doplňkovými krmivy, především obilovinami. A právě spotřeba krmiv, v našem případě obiloviny, tvoří jednu z nejvýznamnějších nákladových položek v chovu kaprů. Odhaduje se, že tyto náklady mohou být kolem 30 35% z celkových nákladů. Cílem každého rybářského podniku je tyto náklady co nejvíce snížit. Jednou z možností, jak snížit tyto náklady, je zvýšení produkční účinnosti obilovin jejich vhodnou technologickou úpravou, která není ekonomicky náročná a pro rybníkářskou praxi lehce dostupná popřípadě nenáročná na technologii a obsluhu. Tyto technologické úpravy obilovin jsou sumarizovány v této disertační práci. Studovány byly hlavní produkční ukazatele technologicky upravených obilovin v chovu tržních kaprů s dopady nejen na ekonomiku chovu, ale také s dopady na životní prostředí v rybniční akvakultuře, především pak na bilanci celkového fosforu a dále byl studován vliv způsobu hospodaření na kvalitu masa kapra, resp. byly zkoumány texturní vlastnosti. Keywords: Cyprinus carpio; obiloviny; polointenzivní chov; rybniční aquakultura; fosfor; texturní vlastnosti Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Produkční účinnost technologicky upravených obilovin v chovu tržních kaprů

Common carp (Cyprinus carpio L.) is one of the most important cultivated fish species over the world. In the Czech Republic, the production of carps by pond aquaculture farming has a long tradition ...

MÁSÍLKO, Jan
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2014

Contrasting patterns of karyotype and sex chromosome evolution in Lepidoptera
ŠÍCHOVÁ, Jindra
2016 - Czech It is known that chromosomal rearrangements play an important role in speciation by limiting gene flow within and between species. Furthermore, this effect may be enhanced by involvement of sex chromosomes that are known to undergo fast evolution compared to autosomes and play a special role in speciation due to their engagement in postzygotic reproductive isolation. The work presented in this study uses various molecular-genetic and cytogenetic techniques to describe karyotype and sex chromosome evolution of two groups of Lepidoptera, namely selected representatives of the family Tortricidae and Leptidea wood white butterflies of the family Pieridae. The acquired knowledge points to unexpected evolutionary dynamics of lepidopteran karyotypes including the presence of derived neo-sex chromosome systems that originated as a result of chromosomal rearrangements. We discuss the significance of these findings for radiation and subsequent speciation of both lepidopteran groups. Keywords: Comparative genomics; evolution of sex chromosomes; karyotype evolution; Leptidea butterflies; tortricid moths Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Contrasting patterns of karyotype and sex chromosome evolution in Lepidoptera

It is known that chromosomal rearrangements play an important role in speciation by limiting gene flow within and between species. Furthermore, this effect may be enhanced by involvement of sex ...

ŠÍCHOVÁ, Jindra
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2016

Potential of chlorophyll fluorescence imaging in plant stress detection
CSÉFALVAY, Ladislav
2010 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Potential of chlorophyll fluorescence imaging in plant stress detection

CSÉFALVAY, Ladislav
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2010

The effects confrontation of the aerobic and yoga activities upon the cardiovascular system of the college students with the emphasison the preventive health programs and life style optimalization
KOKEŠ, Radim
2013 - Czech The aim of this thesis is to find and compare the physical fitness level of the college students in relation to the aerobic and yoga activities. I also aimed to explore the effects of these activities on the cardiovascular system of women, and to determine the physical load improvement which could influence the health condition and lifestyle in a positive way. 237 students of the University of South Bohemia in ČeskéBudějovice participated in the research. They were 20 up to 23 years old and they were divided into two groups according to their hobbies. They underwent the two-term long physical programs - the aerobic one and the yoga one. To compare the results of these programs I used the anthropometric and motometric methods and a questionnaire as well - BMI, Ruffier´s test, T-test, Spearman´s correlation coefficient and the circadian rhythm, lifestyle, emotional state and self-image based questionnaire. The statistic analysis of gained data shows a considerable change as for the Ruffier index of physical fitness, and this is just a result of the intervention physical program use within both of the experimental groups as for the level of importance p<0,001. These results confirm the hypothesis H1 and H3 and a contributive effect on the physical fitness of the college students either. BMI of the experimental aerobic group also shows an important change as for the level of importance p<0,01. This result confirms the hypothesis H2 and the fact that the aerobic program has a contributive effect on the BMI as for the ES. As for the experimental yoga group, there were not seen any changes and therefore the hypothesis H4 was not confirmed either.The circadian rhythm questionnaire analysis shows that due to the physical stress, these students often face depressions. The gained data show a low level of cardiovascular indicators as for the entrance measurement, and a significant improvement during a regular intentional use of proper physical exercises - both aerobic and yoga ones. This is very important for the preventive health programs and the active lifestyle of women during their college studies. Cílem práce je zjištění a komparace úrovně tělesné zdatnosti u vysokoškolských studentek ve vztahu k aerobikovým a jógovým aktivitám a jejich účinků na kardiovaskulární systém organismu žen aoptimalizace adekvátního pohybového zatížení pozitivně ovlivňující zdravotní aspekty životního stylu a zdraví. Výzkumné šetření bylo provedeno celkem u 237 studentekJihočeské univerzity v Českých Budějovicích ve věkovém rozpětí 20-23 let, které byly podle svých zájmů rozděleny do dvou souborů s aplikací dvousemestrálních intervenčních pohybových programů - Intervenční pohybový program aerobikový a jógový. Ke komparaci výsledků intervenčních pohybových programů byly použity antropometrické a motometrické metody a dotazníkové šetření - BMI, Ruffierova zkouška, T-test, Spearmanův korelační koeficient, dotazník cirkadiánních rytmů a životního stylu, emočního stavu a sebepojetí. Statistická analýza získaných dat obou sledovaných souborů poukazuje na signifikantní pozitivní změny v Ruffierově indexu tělesné zdatnosti vlivem aplikace intervenčních pohybových programů u obou sledovaných experimentálních souborů na hladině významnosti p<0,001. Tyto výsledky potvrzují hypotézy H1, H3 a skutečnost, že aerobikový a jógový intervenční pohybový program má pozitivní vliv na tělesnou zdatnost vysokoškolských studentek. Signifikantní změny byly taktéž prokázány u hodnot BMI experimentálního souboru aerobik na hladině významnosti p<0,01. Tento výsledek potvrzuje hypotézu H2 azjištění, že aerobikový intervenční pohybový program má pozitivní vliv na hodnotu BMI u ESa.Uexperimentálního souboru jóga změny prokázány nebyly a tím hypotéza H4 nebyla potvrzena. Z analýzy výsledků dotazníkového šetření v oblasti cirkadiánních rytmů je zřejmé, že díky psychické zátěži jsou studentky vystaveny četnějším depresivním stavům. Získané výsledky poukazují na nízkou úroveň kardiovaskulárních ukazatelů ve vstupních měřeních a signifikantní zlepšení při pravidelné intencionální aplikaci adekvátního pohybového režimu, a to jak u aerobikových, tak u jógových cvičení, což je významné pro prevenci zdraví a aktivní životní styl žen v období vysokoškolského studia. Keywords: Zdraví; tělesná zdatnost; adekvátní pohybový režim; cvičení jógy; aerobikové cvičení; Health; physical fitness; lifestyle; adequate movement regime; yoga exercises; areobics exercise Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. The effects confrontation of the aerobic and yoga activities upon the cardiovascular system of the college students with the emphasison the preventive health programs and life style optimalization

ovlivňující zdravotní aspekty životního stylu a zdraví. Výzkumné šetření bylo provedeno celkem u 237 studentekJihočeské univerzity v Českých Budějovicích ve věkovém rozpětí 20-23 let, které ...

KOKEŠ, Radim
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2013

Vliv endokrinních disruptorů na funkčnost spermií a změny ve steroidogenezi transkriptomik u ryb
HATEF, Azadeh
2012 - English In the present study, both in vitro and in vivo experiments were performed to investigate modes of action of selected EDCs including mercury chloride (HgCl2), bisphenol A (BPA), vinclozolin (VZ) and Di-(2-ethylhexyl)-phthalate (DEHP) on male reproductive physiology in fish. Results obtained from in vitro studies showed that EDCs decrease sperm motility via disruption in energetics and damage to spermatozoa; however the effective doses are higher than reported in the environmentally relevant concentrations. In contrast, in vivo studies showed adverse effects of BPA, VZ, and DEHP on sperm quality at environmentally relevant concentrations. Decrease in sperm quality is associated with disruption in testicular steroidogenesis, particularly inhibition of androgens. Only BPA induced vitellogenin production, associated with increase in transcripts of estrogen receptor, androgen receptor and cytochrome P450 mRNA at the high dose approaching environmental level. Inhibition of androgen production is due to disruption in transfer of cholesterol into the steroidogenesis pathway, because transcript of steroidogenic acute regulatory protein mRNA was decreased. In addition, BPA acts through sex steroid-mediated mechanism while DEHP mode of action is sex-steroid independent mechanism. In the present study, both in vitro and in vivo experiments were performed to investigate modes of action of selected EDCs including mercury chloride (HgCl2), bisphenol A (BPA), vinclozolin (VZ) and Di-(2-ethylhexyl)-phthalate (DEHP) on male reproductive physiology in fish. Results obtained from in vitro studies showed that EDCs decrease sperm motility via disruption in energetics and damage to spermatozoa; however the effective doses are higher than reported in the environmentally relevant concentrations. In contrast, in vivo studies showed adverse effects of BPA, VZ, and DEHP on sperm quality at environmentally relevant concentrations. Decrease in sperm quality is associated with disruption in testicular steroidogenesis, particularly inhibition of androgens. Only BPA induced vitellogenin production, associated with increase in transcripts of estrogen receptor, androgen receptor and cytochrome P450 mRNA at the high dose approaching environmental level. Inhibition of androgen production is due to disruption in transfer of cholesterol into the steroidogenesis pathway, because transcript of steroidogenic acute regulatory protein mRNA was decreased. In addition, BPA acts through sex steroid-mediated mechanism while DEHP mode of action is sex-steroid independent mechanism. Keywords: bisphenol A; Di-(2-ethylhexyl)-phthalate; mercury chloride; sperm quality; steroids; vinclozolin; vitellogenin Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Vliv endokrinních disruptorů na funkčnost spermií a změny ve steroidogenezi transkriptomik u ryb

In the present study, both in vitro and in vivo experiments were performed to investigate modes of action of selected EDCs including mercury chloride (HgCl2), bisphenol A (BPA), vinclozolin (VZ) and ...

HATEF, Azadeh
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2012

Electron microscopy in structural studies of photosynthetic membrane proteins
BUMBA, Ladislav
2003 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Electron microscopy in structural studies of photosynthetic membrane proteins

BUMBA, Ladislav
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2003

Primary succession of ants on the dumps after brown coal mining and its effect on soil development
HOLEC, Michal
2005 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Primary succession of ants on the dumps after brown coal mining and its effect on soil development

HOLEC, Michal
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2005

Molecular analysis of genetic and pathogenic variability in population of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus
FOUSEK, Jan
2005 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Molecular analysis of genetic and pathogenic variability in population of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus

FOUSEK, Jan
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2005

Analýza nezaměstnanosti a možnosti zvyšování zaměstnanosti v Ústeckém kraji
ZÁBRANSKÁ, Alena
2006 - Czech Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Analýza nezaměstnanosti a možnosti zvyšování zaměstnanosti v Ústeckém kraji

ZÁBRANSKÁ, Alena
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2006