Vliv zranění na psychické zdraví sportovců
Vighová, Kristýna
2024 - Czech The thesis deals with the issue of athletes returning to training and match process after injury, with focus on their mental health. The goal is to indentify negative psychological states that subsequently affect the performance of athletes, and their frequency in athletes returning to the training and match process after injury. A sub-goal is to find out the following possible variables involved in increasing/moderating these conditions. The work verifies the frequency of occurence of negative psychological states; investigates the influence of repeated injuries, differences between woman and man athletes, differences in individual and team athletes, and also verifies the frequency of use of coping strategies an their specific form. The work is devided into a theoretical and a research part. The theoretical part was prepared on the basis of Czech and foreign language professional literature. In the research part,we use the psychological questionnaire CSAI-2 to determine the occurrence of anxiety and its influence on the performance of individuals in sportsman, who have suffered injuries. We expected that the injury would increase the athletes's anxiety at the time of returning to the training and match process. KEYWORDS Mental states, Emotions, Injuries, Return to Sport, Stress, Anxiety, Fear,... Práce řeší problematiku návratů sportovců do tréninkového a zápasového procesu po zranění a to se zaměřením na jejich psychické zdraví. Cílem práce je identifikovat negativní psychické stavy, které následně ovlivňují výkonost sportovců, a jejich četnost u sportovců vracející se do tréninkového a zápasového procesu po zranění. Dílčím cílem je zjistit následující možné proměnné podílející se na zvyšování/umírnění těchto stavů. Práce ověřuje četnost výskytu negativních psychických stavů; zjišťuje vliv opakovaného zranění, rozdíly mezi sportovci a sportovkyněmi, rozdíly u individuálních a týmových sportovců a také ověřuje četnost využívání copingových strategií a zjišťuje jejich konkrétní podobu. Práce je rozdělena na teoretickou a výzkumnou část. Teoretická část byla zpracována na základě české a cizojazyčné odborné literatury. Ve výzkumné části zjišťujeme, pomocí psychologického dotazníku CSAI-2, u sportovců, kteří utrpěli zranění, výskyt úzkostí a jejich vliv na výkonnost jedinců. Od výzkumu jsme očekávali, že zranění bude zvyšovat anxiozitu sportovců v době návratu do tréninkového a zápasového procesu. KLÍČOVÁ SLOVA Psychické stavy, zranění, návrat ke sportu, stres, emoce, úzkost, strach, sebevědomí, Copingové strategie, individualita x tým Keywords: Psychické stavy; zranění; návrat ke sportu; stres; emoce; úzkost; strach; sebevědomí; Copingové strategie; individualita x tým; Mental states; Emotions; Injuries; Return to Sport; Stress; Anxiety; Fear; Coping Strategies; Self-Confidence Available in a digital repository NRGL Vliv zranění na psychické zdraví sportovců

The thesis deals with the issue of athletes returning to training and match process after injury, with focus on their mental health. The goal is to indentify negative psychological states that ...

Vighová, Kristýna
Univerzita Karlova, 2024

Interagující prostorové systémy částic
Zikmundová, Markéta; Beneš, Viktor
2024 - English Several kinds of random union of interacting particles is studied. We define line segment pro- cess of interacting particles in R2 and process of interacting surfaces in R3 as the models with density function p with respect to some Poisson point process. The formulas for moments of the geometrical characteristics of these models are derived and the limit behaviour when the intensity tends to infinity is investigated. For time extension of such models a simulation algorithm is developed. Various estimations of parameters of density p, among them those based on sequential Monte Carlo, are studied and compare in a simulation study. Práce se zabývá několika typy náhodných sjednocení interagujících částic. Jsou definovány procesy interagujících úseček v R2 a interagujících destiček v R3 jako modely s hustotou vzhledem k Poissonovu procesu. Jsou odvozeny vzorce pro geometrické charakteristiky těchto modelů a je zkoumáno limitní chování pro intenzitu jdoucí do nekonečna. Pro časové rozšíření modelu je uveden simulační algo- ritmus a v rámci simulační studie jsou porovnávány různé druhy odhadů parametrů hustoty p, zejména se zaměřením na sekvenční Monte Carlo metody. 1 Keywords: Boolovský model|proces interagujících částic|U−statistiky|exponenciální rodina rozdělení|germ-grain model|interakce|Markovská vlastnost|bodový process|náhodná uzavřená množina|Markov chain Monte Carlo; Boolean model|process with interacting particles|U−statistics|exponential family|germ-grain model|interaction|Markov properties|point process|random closed set|Markov chain Monte Carlo Available in a digital repository NRGL Interagující prostorové systémy částic

Several kinds of random union of interacting particles is studied. We define line segment pro- cess of interacting particles in R2 and process of interacting surfaces in R3 as the models with density ...

Zikmundová, Markéta; Beneš, Viktor
Univerzita Karlova, 2024

Optimalizace skladového systému ve vybraném podniku
SEKERA, Petr
2024 - Czech Práce se věnuje optimalizaci skladového systému ve vybraném podniku. Cílem je návrh pro optimalizaci skladového systému ve vybraném podniku se zaměřením na hmotné a informační toky, skladové procesy, logistické náklady a relevantní logistické ukazatele a dále stanovené kritických faktorů z hlediska řízení a provozu skladu. První částí práce je získání o podvědomí ohledně základních informací týkající se problematiky daného tématu. Výsledková část práce se zabývá detailním popisem zkoumaného subjektu a jeho současného skladového systému, informačním a materiálovým tokům a popisem a rozložením jednotlivých skladů. Informace byly získány řízenými rozhovory se zaměstnanci podniku. Dále se tato část práce věnuje výpočtem relevantních logistických ukazatelů, zhodnocením současného stavu a stanovení kritických faktorů. V závěru této části jsou stanoveny relevantní optimalizace na zefektivnění jednotlivých skladových operací. The thesis deals with the optimization of the warehouse system in a selected company. The aim is a proposal for the optimization of the warehouse system in a selected company with a focus on material and information flows, warehouse processes, logistics costs and relevant logistics indicators, as well as critical factors in terms of warehouse management and operation. The first part of the thesis is to gain an understanding of the basic information regarding the subject matter. The result part of the thesis deals with a detailed description of the researched entity and its current warehouse system, information and material flows and the description and layout of the individual warehouses. The information was obtained through guided interviews with employees of the company. Furthermore, this part of the thesis deals with the calculation of relevant logistics indicators, the assessment of the current situation and the determination of critical factors. In the conclusion of this section, relevant optimizations to streamline individual warehouse operations are identified. Keywords: skladový systém; sklady; moderní prvky; základy logistiky; řízené rozhovory; warehouse system; warehouses; modern elements; logistics basics; guided conversations Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Optimalizace skladového systému ve vybraném podniku

Práce se věnuje optimalizaci skladového systému ve vybraném podniku. Cílem je návrh pro optimalizaci skladového systému ve vybraném podniku se zaměřením na hmotné a informační toky, skladové procesy, ...

SEKERA, Petr
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Koordinační vlastnosti 2-(difenylfosfino)guandinového ligandu
Leitner, Zdeněk
2024 - Czech Title: Coordination properties of phosphinoguanidine ligand Author: Bc. Zdeněk Leitner Institution: Faculty of Science, Charles University in Prague, Department of Inorfanic Chemistry Supervisor: prof. RNDr. Petr Štěpnička, Ph.D., DSc. Polar phosphine ligands have found use in variety of homogenous and biphasic catalytic processes. In the past, extensive research has been performed also on cationic phosphines, namely phosphinoguanidinium salts. However, neutral phosphinoguanidines have been mostly neglected and their coordination chemistry has not been described to a satisfactory extent, even though the combination of soft phosphorous and harder nitrogen Lewis base could exhibit interesting properties, mainly hemilabile coordination, as well as protonation-controlled nitrogen coordination. These properties could have a positive impact on catalytical performance of this ligand in systems, which benefit from hydrogen bonding or the presence of basic guanidine group. The aim of this work was to study coordination properties of an earlier prepared ligand L and the corresponding phosphinoguanidine salt L·HCl in reactions with Group 11 metal precursors. New compounds were characterized, and their crystal structures were determined. In addition to conventional compounds, an uncommon dimeric complex... Shrnutí Název práce: Koordinační vlastnosti fosfinoguanidinového ligandu Autor: Bc. Zdeněk Leitner Instituce: Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy v Praze, Katedra anorganické chemie Vedoucí práce: prof. RNDr. Petr Štěpnička, Ph.D., DSc. Polární aniontové fosfinové ligandy nalezly uplatnění v široké škále homogenních i bifázových katalytických procesů. V minulosti tak byl proveden rozsáhlý výzkum i na poli kationtových fosfinových ligandů, konkrétně fosfinoguanidiniových solí. Od nich odvozené neutrální fosfinoguanidiny byly však dosud převážně opomíjeny a zejména jejich koordinační chování nebylo dosud uspokojivě prozkoumáno. Přitom kombinace měkkého fosfinového a tvrdšího dusíkatého donoru může přinášet zajímavé vlastnosti z hlediska hemilabilní koordinace, či protonací řiditelné koordinace guanidinové funkční skupiny. Tyto vlastnosti mohou mít pozitivní vliv na průběh katalytických dějů, v nichž se uplatňuje tvorba vodíkových můstků, nebo přítomnost bazické funkční skupiny. Obsahem této práce je studie koordinačních vlastností dříve připraveného fosfinoguanidinového ligandu L a od něj odvozené fosfinoguanidiniové soli L·HCl v reakcích s prekurzory kovů 11. přechodné skupiny. Připravené koordinační sloučeniny byly charakterizovány a byla určena jejich krystalová struktura metodou difrakce... Keywords: fosfinové ligandy; guanidin; koordinační vlastnosti; katalytické vlastnosti; komplexy 11. skupiny; phosphine ligands; guanidine; coordination properties; catalytic properties; Group 11 complexes Available in a digital repository NRGL Koordinační vlastnosti 2-(difenylfosfino)guandinového ligandu

Title: Coordination properties of phosphinoguanidine ligand Author: Bc. Zdeněk Leitner Institution: Faculty of Science, Charles University in Prague, Department of Inorfanic Chemistry Supervisor: ...

Leitner, Zdeněk
Univerzita Karlova, 2024

Kryokonzervace rybího spermatu: kvalita versus kvantita
SOTNIKOV, Anatolii
2024 - English Kryokonzervaci spermatu ryb můžeme považovat za slibně se vyvíjející technologii s velkým potenciálem pro rozšíření účinnosti programů zachování genetické rozmanitosti u ohrožených a ekonomicky významných ryb. Kryokonzervace spermatu ryb se vyvíjela v průběhu let a byla zkoušena řada přístupů. Dnes je zřejmé, že se protokoly kryokonzervace spermatu podstatně liší podle taxonu a specifických vlastností spermatu ryb. A aby byla aplikace kryokonzervovaného spermatu co nejúčinnější, měly by použité protokoly zohlednit i praktické aspekty. S ohledem k základním vlastnostem spermatu ryb jako kryobiologických objektů je zřejmé, že protokoly poskytující nejlepší výsledky nejsou vždy vhodné pro rybářskou praxi, kdy se objem a forma jednotlivých dávek kryokonzervovaného materiálu, stejně tak jako snadná manipulace s dávkami, stávají klíčovými parametry pro praxi. Proto bylo jedním z cílů této práce vyvinout spolehlivý protokol kryokonzervace spermatu kapra obecného vhodný pro rybářskou praxi. Tento cíl byl dosažen vyvinutím specifické metody orientované na akvakulturu pro kryokonzervaci spermatu kapra. Druhým cílem bylo určit optimální, druhově specifické podmínky kryokonzervace spermatu jeseterů s různými ploidními úrovněmi. Tento cíl byl zvolen proto, protože druhově specifické rozdíly ve velikosti spermií spojené s ploidní úrovní by mohly mít vliv např. na optimální koncentraci spermatu při kryokonzervaci. Tento aspekt by mohl být klíčový pro použití kryokonzervace spermatu jeseterů v rybářské praxi a pro programy uchování genofondu. Třetím cílem bylo ověřit možnost třídění spermií v rozmrazeném spermatu jako nástroje k odhalení a k eliminaci kryokonzervací poškozených spermií a tím v budoucnu zabránit negativnímu účinku kryokonzervace spermatu na potomstvo. Práce obsahuje následující kapitoly. První kapitola představuje úvod do problému. Druhá kapitola této práce diskutuje vhodnou koncentraci spermií a skutečnost, že při vysokých koncentracích spermií během kryokonzervace dosahujeme nišší pohyblivosti spermií v rozmražených vzorcích. I přes nižší dosahovanou pohyblivost snižuje kryokonzervace vysoce koncentrovaných vzorků spermatu potřebu skladovacího prostoru v kryobankách a objem vzorků potřebných pro pokusy o umělé oplodnění. Třetí kapitola této práce ukazuje, že použití 4,5 ml kryozkumavek ve spojení s konkrétním kryomédiem, rychlostmi zmrazování a rozmrazování poskytuje vhodnou metodu pro kryokonzervaci koncentrovaného spermatu kapra obecného, vhodnou pro rybářskou praxi. Čtvrtá kapitola této práce ukázala, že rozdíly ve velikostech spermií různých druhů jeseterů nejsou spojeny pouze s ploidní úrovní. Navíc ploidní úroveň není určujícím faktorem optimální koncentrace spermatu pro kryokonzervaci u zkoumaných druhů, a proto se různé druhy jeseterů vyznačují poměrně podobnou optimální koncentrací spermatu při zmrazení a mohou být zmrazeny podobným postupem kryokonzervace. Pátá kapitola popisuje použitelnost dvou technik frakcionace spermatu pro kryokonzervované sperma u taxonomicky vzdálených druhů ryb. Použití separace pomocí Percoll gradientu umožňuje oddělení populace spermatu s významně zvýšeným procentem pohyblivých buněk u kapra obecného, jeseterů malého a sibiřského a pstruha duhového. Použití mikrofluidní akustické separace spermatu bylo vhodné pro jesetery malého a sibiřského a pro pstruha duhového, ale bylo neúčinné pro kapra obecného. Důležité je, že obě tyto metody zlepšují kvalitu potomstva získaného z kryokonzervovaného spermatu z hlediska procenta abnormálně se vyvíjejících larev. Sperm cryopreservation is considered a well-developed technology with a big potential for expanding the effectiveness of conservation programs preserving genetic diversity in endangered and economically important fishes. Fish sperm cryopreservation has developed over the years, and numerous approaches have been explored. Nowadays, it is evident that sperm cryopreservation protocols vary essentially according to taxa-specific properties of fish sperm, and to make the application of cryopreserved sperm the most effective, these protocols should be oriented toward practical requests. Due to the basic properties of fish sperm as cryobiological objects, it is clear that the protocols providing the best outcomes are not always appropriate for fisheries practice when cryopreserved material volume and easy-to-use packaging become vital parameters for the practice. That is why developing a sperm cryopreservation protocol suitable for fisheries practice in common carp is one of the primary goals of the current thesis. This goal was accomplished by developing a specific, aquaculture-oriented method for carp sperm cryopreservation. The second goal was to determine the optimal species-specific conditions for cryopreservation sperm in sturgeon possessing different ploidy levels. This goal was set because, specific to sturgeons, differences in sperm size associated with ploidy level could influence the optimal sperm concentration at cryopreservation. This aspect could be crucial for applying sturgeon sperm cryopreservation in fisheries practice and conservation programs. The third goal was set based on the necessity of a basic understanding of sperm sorting after unfreezing, which could help to reveal sperm cryopreservation damages in future studies and to avoid the negative effect of sperm cryopreservation on offspring performance. The thesis contains the following chapters. The first chapter represents an introduction to the problem. The second chapter of this thesis discusses that high spermatozoa concentration during cryopreservation decreases thawed samples' motility. Nevertheless, even with decreased motility, the cryopreservation of highly concentrated sperm samples reduces storage space in cryobanks and the volume of samples needed for artificial fertilization trials. The third chapter of this thesis shows that using 4.5 ml cryotubes in combination with specific cryomedium, freezing, and thawing rates gives an appropriate for fisheries practice method for cryopreservation of concentrated common carp sperm. Chapter four of this thesis showed that differences in spermatozoa sizes of different sturgeon species are not solely connected with ploidy level. Moreover, ploidy level is not a determinant of optimal sperm concentration for sperm cryopreservation in investigated species, and therefore, different sturgeon species are characterized by quite similar optimal sperm concentration at freezing and could be frozen by a similar cryopreservation approach. Chapter five describes the applicability of two sperm fractionation techniques for cryopreserved sperm in taxonomically distant fishes. Using Percoll gradient separation allows the separation of the sperm population with a significantly increased percentage of motile cells in common carp, sturgeons, and rainbow trouts. The use of microfluidic acoustic sperm separation was appropriate for sterlet, Siberian sturgeon, and rainbow trout but was ineffective for common carp. Importantly, both of these methods improve the quality of offspring obtained from cryopreserved sperm in terms of the percentage of abnormally developing larvae. Keywords: pohyblivost spermií; počítačově asistovaná analýza spermatu; kryokonzervace; Cypriniformes; Acipenseridae; umělá reprodukce Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Kryokonzervace rybího spermatu: kvalita versus kvantita

Kryokonzervaci spermatu ryb můžeme považovat za slibně se vyvíjející technologii s velkým potenciálem pro rozšíření účinnosti programů zachování genetické rozmanitosti u ohrožených a ekonomicky ...

SOTNIKOV, Anatolii
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Potravní efektivita a kapacita nepůvodního hlaváče černoústého (Neogobius melanostomus) v různých biotických podmínkách
FRANTA, Pavel
2024 - English Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Potravní efektivita a kapacita nepůvodního hlaváče černoústého (Neogobius melanostomus) v různých biotických podmínkách

FRANTA, Pavel
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Studie kompatibility zárodečných buněk po transplantaci příjemci
NAYAK, Rigolin
2024 - English Náhradní produkce pomocí transplantace zárodečných kmenových buněk je novou biotechnologií, která má zefektivnit akvakulturu a základní výzkum týkající se reprodukční biologie ryb. Zárodečné kmenové buňky odebrané dárci v embryonálním nebo dospělém stadiu se transplantují geneticky kompatibilním sterilním příjemcům. U transplantovaných zárodečných buněk je méně pravděpodobné, že budou příjemcem odmítnuty, pokud je genetická příbuznost na úrovni druhu. Produkce zárodečných chimér se však snižuje v případě fylogeneticky vzdálených druhů. Xenogenní transplantace je často zaměřena na zlepšení určitých vlastností dárcovského druhu, jako je zrychlení doby pohlavního dozrávání, odbourání environmentálních překážek při chovu v zajetí, zachování genetických zdrojů ohrožených druhů a zvýšení produkce gamet prostřednictvím náhradního rodičovství. Transplantace zárodečných buněk mezi těmito vzdálenými druhy často selhávala kvůli menší genetické kompatibilitě a dalším faktorům, jako je stupeň sterility a kmenovost transplantovaných zárodečných buněk. Další ústřední otázka týkající se náhradní produkce se týká epigenetických změn v gametách a potomstvu pocházejícím od dárce, které dosud nebyly zkoumány. Je známo, že epimutace (ztráta nebo zisk metylace DNA) způsobují funkční změny, které jsou dědičné pro mnoho generací. Metylace DNA je nejlépe prozkoumanou epigenetickou značkou, která reguluje genovou expresi. Zárodečné buňky jsou během izolace podrobeny několika mechanickým a enzymatickým úpravám. Proliferace a diferenciace se řídí somatickými buňkami hostitelské gonády, které se nepochybně liší od mikroprostředí dárcovské gonády. Tyto změny mohou ovlivnit metylom dárcovské zárodečné linie, a tím způsobit buněčné a funkční změny, které mohou přetrvávat po generace. Byla provedena xenogenní transplantace mezi zebřičkami a daniem malabarským s cílem zvýšit množství gamet zebřiček prostřednictvím náhradních rodičů dania malabarského. Byl sekvenován dean end gen (dnd) dania malabarského a byly navrženy morfolinové sekvence, které účinně znemožňují vývoj zárodečných buněk. Transplantací spermatogonií vznikly zárodečné chiméry dania malabarského produkující spermie zebřičky, které byly desetkrát koncentrovanější než spermie dárce. Podobnou metodu lze v budoucnu použít i u jiných druhů ke zvýšení produkce gamet prostřednictvím většího náhradního rodiče. Pomocí dvou typů náhradních rodičů bylo provedeno podrobné zkoumání epimutací a jejich funkčních změn. Studie odhalila, že spermie a potomstvo obou náhradních rodičů jsou ve srovnání se spermiemi a potomstvem dárce hypermetylované v celém genomu. Porušená hypermetylace neměla vliv na změny genové exprese ani na fenotypové abnormality potvrzené analýzami genové exprese a fenotypovými vyšetřeními. Částečná gonadektomie u dvou malých druhů ryb, zebřiček a halančíků, poskytla účinnou metodu izolace zárodečných buněk bez nutnosti usmrcení dárce, která se může uplatnit i u jiných druhů pro náhradní reprodukci. Údaje z této studie poskytnou lepší vhled do budoucích studií transplantace zárodečných buněk a epigenetické srovnávací studie otevírají prostor pro podrobnou analýzu gamet odvozených od dárce z fylogeneticky vzdálených náhradních spermií a kryokonzervovaných zárodečných kmenových buněk. Surrogate production by germline stem cell transplantation is new-age biotechnology to improve aquaculture and basic research pertaining to reproductive biology in fishes. Germ stem cells harvested from the donor at the embryonic or adult stage are transplanted into genetically compatible sterile recipients. The transplanted germ cells are less likely to be rejected by the recipient when the genetic relationship is at the species level. However, the germline chimera production decreases in the case of the phylogenetically distant species. Xenogenic transplantation is often targeted to improve certain traits in the donor species, such as speeding up sexual maturation time, removing the environmental barriers to captive rearing, preserving the genetic resources of threatened species, and boosting gamete production via surrogacy. Germ cell transplantation between those distant species often failed due to less genetic compatibility and other factors, such as the degree of sterility and the stemness of the transplanted germ cell. Another central question about surrogate production concerns the epigenetic changes in donor-derived gametes and progeny, which remain to be unveiled. Epimutations (loss or gain of DNA methylation) are known to cause functional changes that are heritable to many generations. DNA methylation is the best-studied epigenetic mark that regulates gene expression. The germ cells undergo several mechanical and enzymatic treatments during their isolation. Proliferation and differentiation are guided by the host gonadal somatic cells that undoubtedly differ from the donor gonadal microenvironment. Those changes can influence the methylome of the donor germline and, thereby, cause cellular and functional changes that may persist over generations. Xenogenic transplantation was performed between zebrafish and giant danio to increase the amount of zebrafish gametes via giant danio surrogates. The giant danio dead end (dnd) gene was sequenced, and morpholino sequences were designed to deplete germ cell development in giant danio effectively. Spermatogonial transplantation was optimized to produce giant danio germline chimera with ten times more concentrated zebrafish donor-derived sperm than the donor. A similar method can be applied to other species in the future to increase gamete production via a bigger surrogate. A thorough investigation of epimutations and their functional changes was assessed using two kinds of surrogates. The study revealed that the sperm and progeny from both surrogates are genome-wide hypermethylated compared to the donor sperm and progeny. The perturbed hypermethylation did not influence gene expression changes or phenotypical abnormalities confirmed by gene expression analyses and phenotypical investigations. Partial gonadectomy in two small species, zebrafish and killifish, provided an effective method for germ cell isolation without sacrificing the donor, which may apply to other species for surrogate production. The data from the current study will provide greater insight into future germ cell transplantation studies, and the epigenetic comparative studies set the stage for in-depth analysis of donor-derived gametes from phylogenetically distant surrogates and the cryopreserved germ stem cells. Keywords: Náhradní reprodukce; Zárodečné buňky; DNA metylace; Epigenetická remodelace; Transplantace zárodečných buněk; Částečná gonadektomie Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Studie kompatibility zárodečných buněk po transplantaci příjemci

Náhradní produkce pomocí transplantace zárodečných kmenových buněk je novou biotechnologií, která má zefektivnit akvakulturu a základní výzkum týkající se reprodukční biologie ryb. Zárodečné kmenové ...

NAYAK, Rigolin
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Význam různých zdrojů a sekvenančních protokolů při zvyšování přesnosti NGS analýz v diagnostických aplikacích
Kvapilová, Kateřina
2024 - English 1 ABSTRACT Continued advances in next-generation sequencing (NGS) technology, such as capacity, speed, and reduced cost per sequenced base, revolutionize personalized medicine and bring genomics into routine clinical practice. Nevertheless, NGS is still under rapid development, and the variability of sequencing protocols and validation procedures is one of its current bottlenecks. This thesis aimed to study the influence of different sample sources and NGS protocols (NGS library construction-sequencing-data analysis) on the accuracy of NGS analysis in diagnostic applications. In the first study, performed during the COVID-19 pandemic outbreak, we developed NGS protocols suitable for a whole genome analysis of the SARS-CoV-2 virus. Subsequently, in the second study, we examined the suitability of human saliva-derived gDNA for genomic/genetic analysis of selected variant types compared to traditional blood-derived gDNAusing validated NGS protocol and statistical comparison of the obtained data. Whole genome analysis of the SARS-CoV-2 genome was performed using two captured- based approaches and one amplicon-based approach to study the quality and effectivity of the respective NGS protocols. Synthetic controls were employed to verify the accuracy and specificity of the developed NGS protocols. We proved that... 1 Souhrn Neustálé pokroky v technologii sekvenování nové generace (NGS), jakými jsou kapacita, rychlost a snížené náklady na sekvenovaní, vedou k revoluci v personalizované medicíně, tím, jak postupně přináší genomiku do rutinní klinické praxe. NGS se stále rychle vyvíjí, avšak variabilita sekvenačních protokolů a validačních postupů je jedním z jeho problematických rysů. Cílem této práce bylo zhodnotit význam různých zdrojů vzorků a sekvenačních protokolů (od přípravy sekvenační knihovny-sekvenování-analýzi dat) pro zvýšení přesnosti NGS analýzy v diagnostických aplikacích. V první studii, provedené během vypuknutí pandemie COVID-19, jsme vyvinuli NGS protokoly vhodné pro analýzu celého genomu viru SARS-CoV-2. Následně jsme ve druhé studii zkoumali vhodnost lidské genomické DNA (gDNA) pocházející ze slin pro genomickou/genetickou analýzu vybraných variantních k tradiční gDNApocházející z krve pomocí validovaného NGS protokolu a statistického srovnání získaných dat. K ověření účinnosti sekvenačních protokolů pro analýzu celého genomu SARS-CoV-2 byly použity dva sekvenační přístupy založené na zachycení části genomu a jeden sekvenanční přístup založený na amplifikaci částí genomů. K ověření přesnosti a specifičnosti vyvinutých NGS protokolů byly použity syntetické kontroly. Prokázali jsme, že kvantifikace... Keywords: NGS; WGS; WES; analýza variant; slinná gDNA; validace NGS protokolu; NGS; WGS; WES; genomics variant analysis; saliva-derived gDNA; validation guideline Available in a digital repository NRGL Význam různých zdrojů a sekvenančních protokolů při zvyšování přesnosti NGS analýz v diagnostických aplikacích

1 ABSTRACT Continued advances in next-generation sequencing (NGS) technology, such as capacity, speed, and reduced cost per sequenced base, revolutionize personalized medicine and bring genomics into ...

Kvapilová, Kateřina
Univerzita Karlova, 2024

Průmysl 4.0 v logistice
HOLUBOVÁ, Markéta
2024 - Czech Tato diplomová práce je zaměřena na téma Průmysl 4.0 se zvláštním zřetelem na logistiku. Jejím cílem je prozkoumat možnosti uplatnění vybraných metod a přístupů v logistice, které souvisí s koncepcí Průmyslu 4.0 se zaměřením na materiálový a informační tok. Dílčím cílem jsou pak analýzy faktorů potřebných pro úspěšnou implementaci nových přístupů. První část teoreticky popisuje Průmysl 4.0, jeho principy a prvky a zvláštní část je věnována teorii logistiky. Praktická část začíná popisem zkoumaného ekonomického subjektu. Dále jsou zde zobrazeny výsledky dotazníkové šetření, které mělo za úkol zjistit problematická místa logistiky. Následuje nápravné opatření v reakci na výsledky dotazníku. Práce pak pokračuje návrhem a zkoumáním možností produkce přepravek E2 pomocí 3D tisku jako reakce na problematické místo ve skladovací logistice. Výsledky veškerého výzkumu jsou pak shrnuty v závěru. This master's thesis is focused on the topic of Industry 4.0 with a special focus on logistics. Its aim is to explore the possibilities of applying selected methods and approaches in logistics, which are related to the concept of Industry 4.0 with a focus on material and information flow. The sub-goal is then the analysis of factors necessary for the successful implementation of new approaches. The first part theoretically describes Industry 4.0, its principles and elements, and a special part is devoted to the theory of logistics. The practical part begins with a description of the examined economic subject. Furthermore, the results of a questionnaire survey are displayed, which aimed to identify problematic areas of logistics. This is followed by corrective measures in response to the results of the questionnaire. The work then continues with a proposal and examination of the possibilities of producing E2 crates using 3D printing as a response to a problematic place in storage logistics. The results of all research are then summarized in the conclusion. Keywords: Průmysl 4.0; logistika; digitalizace; automatizace; 3D tisk; Industry 4.0; logistics; digitization; automation; 3D printing Available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Průmysl 4.0 v logistice

Tato diplomová práce je zaměřena na téma Průmysl 4.0 se zvláštním zřetelem na logistiku. Jejím cílem je prozkoumat možnosti uplatnění vybraných metod a přístupů v logistice, které souvisí s koncepcí ...

HOLUBOVÁ, Markéta
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, 2024

Vnímané archetypy týmů české hokejové extraligy
Kosková, Tamara; Opelík, Daniel; Voráček, Josef
2024 - Czech Title: Archetypes perception of Czech hockey extraleague teams Objectives: The aim of this thesis is to find out what archetypes Czech hockey fans assign to specific teams of the Czech Extraliga in the 2023/2024 season. Methods: The basic element of the bachelor thesis was marketing research focused on the perception of brands of teams that participated in the Czech Extraliga in the 2023/2024 season. This research was conducted through electronic interviewing. The theoretical part of the thesis is based mainly on the analysis of available literature on the theory of archetypes, their use in the marketing of organizations and the concepts needed for understanding the whole issue. Projective techniques were applied in the analytical part, specifically methods of personification and visualization. Results: Long-term successful teams have one main archetype, e.g. HC Oceláři Třinec. Other teams with average performances tend to one or more archetypes, e.g. HC Vítkovice Ridera. Keywords: Ice hockey, fans, branding, Extraliga Název: Vnímané archetypy týmů české hokejové extraligy Cíle: Cílem práce je zjistit, jaké archetypy přiřazují fanoušci českého hokeje konkrétním týmům české extraligy v sezóně 2023/2024. Metody: Základním prvkem bakalářské práce byl marketingový výzkum zaměřený na vnímání značek týmů, které se účastnily sezóně 2023/2024 české hokejové extraligy. Tento výzkum byl prováděn prostřednictvím elektronického dotazování. Teoretická část práce vychází především z rozboru dostupné literatury o teorii archetypů, jejich využití v marketingu organizací a pojmů potřebných pro pochopení celé problematiky. V rámci analytické části byly aplikovány projektivní techniky, konkrétně metody personifikace a vizualizace. Výsledky: Dlouhodobě úspěšné týmy mají jeden hlavní archetyp, např. HC Oceláři Třinec. Ostatní týmy s průměrnými výkony inklinují k jednomu či více archetypů, např. HC Vítkovice Ridera. Klíčová slova: lední hokej, fanoušci, branding, extraliga Keywords: lední hokej; fanoušci; branding; extraliga; Ice hockey; fans; branding; Extraliga Available in a digital repository NRGL Vnímané archetypy týmů české hokejové extraligy

Title: Archetypes perception of Czech hockey extraleague teams Objectives: The aim of this thesis is to find out what archetypes Czech hockey fans assign to specific teams of the Czech Extraliga in ...

Kosková, Tamara; Opelík, Daniel; Voráček, Josef
Univerzita Karlova, 2024